4EOOA

Thr 160 phosphorylated cdk2 q131e - human cyclin a3 complex with atp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
299
structure length
294
Chain Sequence
GSMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPENLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An integrated chemical biology approach provides insight into Cdk2 functional redundancy and inhibitor sensitivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase, cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 294
sequence length 299
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4eooA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4eooA01
3GU8A 3P4KA 5IQIA 3I79A 5EQPA 2E9PA 1YWVA 4U8ZA 3OY1A 4LV5A 5C4LA 3OTVA 2WHBA 1P14A 3MN3A 4RFMA 5HVJA 3ZXTA 4FT3A 5EFQA 3CQUA 4XMOA 2JKQA 4RJ3A 5AP3A 4ASXA 4AZVA 4YJVA 2QG5A 4J1RA 5IUHA 4I94A 5J79A 2DQ7X 4EUTA 4BCGA 3DKOA 3MBLA 3O51A 1PXLA 3ZOSA 4FKIA 5DA3A 3UMXA 5KNJA 3IPHA 4BDIA 4LQMA 3GXLA 3HEGA 5DR6A 4A07A 4AN9A 4YSJA 5B7VA 1ZMUA 2C0OA 4ACDA 3HV3A 2P0CA 4YTHA 5DI1A 1GJOA 3OG7A 4Q5HA 4CMTA 4XHKB 4ZZNA 5HNGA 5GZAA 2XYUA 3F82A 4RWJA 3KXNA 2GTMA 4HCUA 4HVIA 1E1VA 3ZEWA 3UC4A 3GBZA 2OJGA 2C3LA 5BQ0A 4GH2A 4EWQA 5L2SA 2HZIA 4BI0A 4UMRA 4WG5A 5AP7A 2BUJA 4LG4A 3WF8A 5KBRA 1CMKE 2WMAA 5FRIA 4KKGA 2WOTA 3AC1A 2BKZA 4FNYA 4O7ZA 3G90X 2PL0A 5TOZA 2O65A 3TIYA 3ZUVA 1OUKA 3QRJA 4HGLA 3IONA 1JVPP 1J7UA 4A4LA 3KKVA 4J8MA 2ITOA 4ITHA 1FVTA 4ERKA 2PU8A 4HOKA 3WOWA 5AEPA 3WILA 2QU5A 4OBOA 4EHVA 4BYJA 3LW0A 3ZBXA 2IG7A 4FSRA 3DNEA 2VV9A 2VTSA 4AA4A 3NMUF 3OMVA 3FHRA 2W1CA 5TKDA 4P90A 4A9SA 2VTLA 3H0YA 4FKPA 5CNOA 3BU5A 3HDNA 4OLIA 4TXCA 3R2YA 4UV0A 2R3NA 4RWIA 4X21A 4F1TA 1FGKA 1XKKA 3HKOA 3IW4A 3R00A 2RG5A 5H8GA 4N70A 5FTQA 4MNFA 1PXNA 4APPA 5LMBA 1CTPE 3EN6A 2UZBA 4R5YA 5CZIA 4NYEA 5AX9A 3R04A 1R39A 3SXFA 5B2LA 4IVDA 4YC6A 3V5TA 3CPCA 2XIRA 3FMKA 4FT5A 4DH8A 3PVGA 4BWKA 1R0EA 1PMEA 4MYGA 3QTZA 5CAQA 5GZ9A 4MH7A 5M09A 4DFXE 2WGJA 4Y85A 3PY1A 3DBCA 4C33A 1WMKA 4X3FB 4DBXA 2XKFA 3FYKX 3FZRA 4KD1A 3D14A 2XNPA 4MHAA 2IZUA 2VWWA 2VAGA 3OTUA 4BVUA 5KHXA 3GC7A 5CU3A 2OJJA 3CQWA 5EYCA 5IG1A 4FV0A 2V62A 4EOSA 2YIRA 4NM7A 1IAJA 3UQCA 1J3HA 2GQGA 3Q32A 3DFAA 4IEBA 3QD0A 3RPVA 3VBXA 4RVKA 3SOCA 4JOAA 4CFFA 2WKMA 4YZCA 3LCTA 4JBQA 5D1JA 5B2MA 4MD9E 5F20A 2GQRA 4USEA 3V5WA 2X0GA 4WRGA 4XBUA 3RINA 5HG7A 2KTYA 4PDOA 2X8DA 2CCIA 2HY0A 4RQVA 2OZOA 4GFGA 1OZ1A 4QTCA 2GHLA 1QPDA 5AUXA 3VBQA 1JKKA 1RQQA 1XH6A 4OW8A 3NSZA 3R7YA 3TNPC 4AA5A 3KXHA 3FLSA 4BZNA 4JX7A 3BE2A 4TYIA 3MH3A 2CGUA 2OIQA 3E93A 3Q2MA 5BX0A 4CGAA 1OVEA 4Z7GA 3RKBA 4FUXA 2Z60A 3TG1A 3QUDA 4NH1A 4F99A 4ZS4A 4HVGA 5I9XA 1WBPA 1U59A 1A06A 5FWKK 1O6LA 3IG7A 4MXAA 4EORA 3KREA 1NA7A 2XNBA 3BE9A 4AW1A 4IJ9A 2OW3A 3NIEA 4RWLA 4EK5A 3R6XA 4V0GA 5AR5A 5LOHA 3OWKA 2CKQA 3QF9A 4B7TA 4AE9A 5HE1A 2F2CB 4C4IA 2JBOA 3BBWA 4FKOA 2DS1A 3IW5A 5FXQA 1OKVA 3EYGA 4C57A 3HAVA 1PXJA 4C59A 3RHXA 3R9DA 3QC9A 2R3KA 5A4TA 5KMMA 1ATPE 3G15A 5DT3A 5EM7A 4HVDA 4C0TA 3ROCA 4MKCA 3CPBA 4YJPA 3ZONA 4UMTA 4W9WA 1BX6A 1OIRA 2VTIA 2NPQA 4LGDA 5JFWA 2XCKA 4YHJA 5HO7A 4C4JA 4CFXA 2UZUE 3IW8A 4PMSA 4ZLYA 4YLKA 4BC6A 2UVXA 2UZLA 3R9HA 4ANBA 2OWBA 2PMLX 5M4CA 3OT3A 2O64A 2IZTA 3PSCA 1OM1A 2WB8A 5DLSA 3PIXA 4PMMA 5M4FA 5HU9A 2XKEA 1PMUA 2YM3A 4FTIA 3HRFA 2R3RA 3H3CA 2JIIA 5JFVA 1VYZA 4C35A 3LCDA 4U40A 5CQWA 3CQEA 3NW5A 4MNEA 4DFLA 3KRRA 2VWYA 5CAUA 3GU7A 2QOKA 3FLQA 2Y4IC 2HXLA 4BDCA 1Z57A 2UZEA 3Q60A 4JBOA 5FD2A 3QRTA 2YDKA 1QPEA 4ASEA 4EYJA 4DT8A 4TY1A 3K54A 3REPA 5JGBA 3ZSHA 5A6NA 2EXMA 3JYAA 2RF9A 1J1CA 4AG8A 2HELA 4ANNA 2ZYBA 4GIHA 2GFSA 3DQWA 4CEGA 3HYHA 3S4QA 4M0YA 4TWNA 1YDTE 4IX3A 3ZHPC 4YNOA 5L8LA 1H0WA 3PXQA 1ZMVA 2QO2A 3C5UA 5EHLA 4AT3A 3EQPA 3PY0A 4XYFA 1WCCA 3W32A 2P2IA 4R7IA 4G3FA 5AR3A 5IQEA 2CLQA 2R3MA 3NCGA 3LPBA 2OK1A 2R7IA 3M42A 3PXFA 4M12A 4LOOA 4G17A 4RX7A 4RJ6A 5IEYA 5IQCA 2WU6A 5D12A 4QOXA 3CS9A 3POOA 4UMUA 3BV3A 4O7YA 4MAOA 3R7VA 3ZRLA 3R1NA 1XH4A 1M2RA 2J50A 3QD4A 3IO7A 5ACBC 3VF8A 5EQEA 4NIFA 2C6DA 4YPDA 4OTRA 5EKOA 4XG6A 1OL5A 3FDNA 1U4DA 4XP3A 4YSMA 5AUUA 4EH7A 4FTLA 3OF0A 4JBPA 5L6WL 3FPQA 2OSCA 3WF7A 3VUGA 4FKGA 4ASDA 4O0WA 3VS6A 3DDPA 2J0MB 3R1SA 2YZLA 4ZY5A 2BRMA 5D11A 5BVNA 3QX4A 3W8QA 5H2UA 4K18A 5LQFA 3WYYA 5AIRA 3NZ0A 3P79A 1TQPA 3DBDA 2WMQA 1JAMA 4FIJA 2R7BA 1YHVA 1ZYDA 4QPAA 5AUVA 2YERA 4FSTA 3R1YA 1ZZLA 4JX3A 4WUNA 4AZFA 2E2BA 3F3ZA 3UOJA 5E1EA 1Q3DA 4O7TA 3BI6A 3RP9A 2X4ZA 5DBXA 5FTGA 3KGAA 1BI7A 3DKGA 1WVXA 4NTTA 3NUXA 5KMLA 4FKSA 4HZRA 3D94A 2GCDA 4FSWA 2GNIA 2BFYA 4PP9A 1GOLA 4S2ZA 3NUUA 5ANOA 3QQLA 3ZYAA 3Q9ZA 4BB4A 4PPBA 4HVHA 3F2RA 5K4IA 2IJMA 4TN6A 3ZRMA 2VTAA 3R30A 2UZVA 4Y5HA 1YOMA 4YO4A 1ZOGA 3QQGA 2XA4A 3AMBA 1G8SA 3ENMA 4JIKA 2YABA 4ZSAA 3QQUA 2BZIB 3K5UA 4TNDA 4ZTRA 2FGIA 2YLFA 3Q53A 4BCNA 4EH8A 5KMOA 4IAAA 4E1ZA 4QP8A 4UBAA 3D7ZA 4ZJVA 4AZWA 2G01A 3EL8A 4O0VA 3FKOA 1KOAA 1I09A 4I6QA 2JITA 1M7NA 2B52A 5CNNA 5E8ZA 5JT2A 3D5VA 2BDFA 3Q5IA 3TUDA 4FR4A 4JDIA 4IQ6A 3PY3A 3QX2A 5E4HA 2W4OA 3NGAA 3KN6A 3GP0A 3KK9A 5E8XA 4UWBA 2AC5A 4ZK5A 2RGPA 4NEUA 2V5QA 3OZ6A 4FG9A 1W0XC 4R7HA 3LFEA 1Q41A 1XH9A 3UNKA 5CQUA 1WVWA 2ETMA 4TT7A 5AWMA 5JRSA 4BTKA 3SXRA 3MSSA 4QMUA 1JLUE 2UW9A 3DBFA 2OU7A 4I93A 4CNHA 5CU0A 3T3VA 2C5XA 2I0YA 4F09A 2YDJA 2BIYA 1WZYA 1WAKA 2P33A 3ORMA 4L7SA 4FTKA 5EW3A 4FV7A 3VUTA 4XP0A 4AXAA 4RVLA 3PIZA 5DFPA 3O96A 4EONA 3U4WA 4R5SA 1IAHA 3U54A 4QMZA 2BIKB 4BGHA 4RZWA 3EFWA 2DYLA 2OIBA 4KABA 2JKKA 4ONAA 2F7ZE 1GAGA 5FDXA 4EL9A 2F2UA 2C5VA 1XQZA 2VWUA 4IXPA 4O0TA 3G9NA 3HAMA 4EJ7A 4H36A 4ZLZA 3G9LX 4FZ7A 4D2TA 3GC0A 4QYFA 2W1FA 1ZYLA 2XBAA 2VGPA 3P9JA 3TJDA 3VBVA 5EYKA 5CSXA 3VN9A 4OR5A 2CN5A 2CKEA 4QMNA 1WBWA 2E9OA 1GNGA 3IW6A 4WG4A 2OGVA 2I40A 5EYDA 4XBRA 3DKFA 5H8BA 2H9VA 4GG7A 3GENA 3QRIA 4FL3A 4IM0A 1NXKA 2QO7A 4GEOA 4FZAB 4ZSJA 3PDTA 1MRUA 2GMXA 4HNFA 3C7QA 5FEEA 3DAEA 2ZMDA 5CY3A 3BHUA 1Y6BA 2VTHA 3L8SA 4HVSA 2JLDA 4OTDA 3OOGA 3U8WA 3KRWA 2GDOA 2VTMA 2CGXA 2A19B 4RIWB 2QO9A 3UPZA 4N6YA 4FTQA 3NNUA 5BUEA 3DNDA 2XYNA 3A2CA 4EK6A 4RPVA 1PRYA 3PJ8A 3AD4A 5FLFA 4FSMA 5LMKC 4IWQA 4WSQA 5GJFA 1KWPA 3HNGA 4F7SA 4YC3A 3DK3A 4JDJA 4D5HA 2BRBA 3W2SA 4BRXA 3A7GA 4DEDA 3PE2A 2EB2A 3PSDA 4FTNA 3C4ZA 3GOPA 4G31A 4X2JA 5KHWA 5JEBA 4BFMA 5DN3A 1JSTA 3EB0A 2IZSA 3HUCA 3I7CA 4QMPA 3FWQA 3NCZA 4WKQA 5F1ZA 4AGDA 5L6PA 4DA5A 4DT9A 3IOPA 3UTOA 4NM5A 2B0QA 4X3FC 1YVJA 1Q8WA 3HV5A 5M44A 4EQUA 4C02A 4KINA 5E92A 5HTCA 4NT4A 4RWKA 3HMPA 4FKVA 4YTIA 3V8TA 5JRQA 4FV9A 5LVMA 4C61A 3O71A 4YU2A 3GCPA 4F6UA 3VO3A 4XOYA 2VNYA 3SD0A 5BYLA 4IAYA 4UY9A 2DUVA 2UV2A 1ZY5A 3COMA 3GI3A 4ARKA 4MXXA 5HLPA 2PVLA 3PXKA 2UW0A 4ZTQA 1KSWA 3Q4TA 4FEQA 2R3PA 2LAVA 1WBOA 2CHLA 5JKGA 4CLJA 4LMUA 3W33A 1Z9XA 5ANJA 4M8TA 3ZM9A 5GIOE 4BHZA 1H01A 4FL2A 5CF6A 4HYUA 2W9ZB 5CSHA 2HIWA 1Z5MA 3LOKA 3G5DA 3KY2A 3ODZX 4EBWA 5CF8A 5FM3A 4QQCA 2UW4A 2WTCA 4PRJA 2BMCA 4J95A 2PVRA 4LOQA 4M84A 5BYZA 3R7UA 2B9FA 5EK7A 4Q5EA 2XBJA 1PYEA 4M69A 1PXOA 2JKMA 2PMOX 4IVCA 4O1OA 4RQKA 4E4MA 1JQHA 5A3XA 4DF3A 4QMVA 4DN5A 3PXRA 4I92A 2OJ9A 1LR4A 5JMSA 1KOBA 3KL8A 3HMNA 3OVVA 4TYJA 2VTNA 4C3FA 3F61A 4F9CA 1R78A 2W5BA 3AT2A 3GCQA 5EI6A 1V0BA 2F57A 3R0TA 2F9GA 2UZNA 4YR8A 4L3JA 4FTCA 5HO8A 3RZFA 3QBNA 3F3TA 4AZEA 2QHNA 3FI2A 4ID7A 4JLCA 3TM0A 1AGWA 4U5JA 1SVGA 1U5QA 4J98A 5AV1A 5EI8A 4EBVA 3DOGA 5CENA 3NVMB 3MIAA 2VRXA 4FSNA 1UWHA 5I9UA 3DQXA 1BKXA 3UMWA 3C4EA 4B99A 4FIIA 4G6OA 3ZUUA 3V6SA 4WNKA 5AAGA 3KXMA 2VNWA 4MWHA 4C7TA 5L2IA 3GCUA 2C4GA 4L9IA 2NP8A 1WFCA 5GJGA 4ZAUA 3PVBA 2PZIA 4PY1A 1KV2A 2X4FA 4X6RA 3F5GA 2ETKA 2Y4IB 1ZOHA 2YITA 3E3BX 5HCXA 2PMIA 4TKSA 5H8EA 4BCKA 5CEMA 3BIZA 4QP9A 4GT3A 1SVHA 2YDIA 3I1AA 4G1WA 1LEZA 2PE2A 5HLNA 3ANRA 5IA3A 3QQFA 3EZVA 2CKPA 5I0BA 2AYPA 4OTWA 2R4BA 4ZY4A 1J7IA 5M53A 1DI9A 1PY5A 4L52A 5LXMA 3A8XA 5IQBA 4XH6A 3R8LA 3FSFA 2Z7LA 3BYUA 4FMQA 3KF4A 3PJCA 4FV8A 2PVYA 3TL8A 3JR1A 3E63A 3ZM4A 3SX9A 5IH5A 2R5TA 3W8LA 5A4QA 5BMSA 2EB3A 4IBMA 3MJ2A 4W4YA 4AWIA 2O8YA 4BYIA 2R0UA 4BGGA 2VX3A 2HZNA 1K2PA 5HNBA 3UVQA 5IMEA 5GJDA 3UP7A 4NL0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GU8 A;  3P4K A;  5IQI A;  3I79 A;  5EQP A;  2E9P A;  1YWV A;  4U8Z A;  3OY1 A;  4LV5 A;  5C4L A;  3OTV A;  2WHB A;  1P14 A;  3MN3 A;  4RFM A;  5HVJ A;  3ZXT A;  4FT3 A;  5EFQ A;  3CQU A;  4XMO A;  2JKQ A;  4RJ3 A;  5AP3 A;  4ASX A;  4AZV A;  4YJV A;  2QG5 A;  4J1R A;  5IUH A;  4I94 A;  5J79 A;  2DQ7 X;  4EUT A;  4BCG A;  3DKO A;  3MBL A;  3O51 A;  1PXL A;  3ZOS A;  4FKI A;  5DA3 A;  3UMX A;  5KNJ A;  3IPH A;  4BDI A;  4LQM A;  3GXL A;  3HEG A;  1OGY A;  5DR6 A;  4A07 A;  4AN9 A;  4YSJ A;  5B7V A;  1ZMU A;  2C0O A;  4ACD A;  3HV3 A;  2P0C A;  4YTH A;  5DI1 A;  4AXE A;  1GJO A;  3OG7 A;  4Q5H A;  4CMT A;  4XHK B;  4ZZN A;  5HNG A;  5GZA A;  2XYU A;  3F82 A;  4RWJ A;  3KXN A;  2GTM A;  4HCU A;  4HVI A;  1E1V A;  3ZEW A;  3UC4 A;  3GBZ A;  2OJG A;  2C3L A;  5BQ0 A;  4GH2 A;  4EWQ A;  5L2S A;  2HZI A;  4BI0 A;  4UMR A;  4WG5 A;  5AP7 A;  2BUJ A;  4LG4 A;  3WF8 A;  5KBR A;  1CMK E;  2WMA A;  5FRI A;  4KKG A;  2WOT A;  3AC1 A;  2BKZ A;  4FNY A;  4O7Z A;  3G90 X;  2PL0 A;  5TOZ A;  2O65 A;  3TIY A; 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