4EQMA

Structural analysis of staphylococcus aureus serine/threonine kinase pknb
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
282
structure length
269
Chain Sequence
MIGKIINERYKIVDKLGGGGMSTVYLAEDTILNIKVAIKAIFIPPREKEETLKRFEREVHNSSQLSHQNIVSMIDVDEEDDCYYLVMEYIEGPTLSEYIESHGPLSVDTAINFTNQILDGIKHAHDMRIVHRDIKPQNILIDSNKTLKIFDFGIAKALTVQYFSPEQAKGEATDECTDIYSIGIVLYEMLVGEPPFNGETAVSIAIKHIQDSVPNVTTDVRKDIPQSLSNVILRATEKDKANRYKTIQEMKDDLSSVLHENRANEDVYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Analysis of Staphylococcus aureus Serine/Threonine Kinase PknB.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords Protein kinase
total genus 65
structure length 269
sequence length 282
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4eqmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4eqmA01
5EDQA 2JFMA 3EHAA 4RA4A 5EQPA 2BALA 4RFZA 3PP1A 4IVDA 4Y73A 4QMQA 4TN6A 2OU7A 2C5XA 1YW2A 2V0DA 4WUNA 2BKZA 2VNYA 4C2VA 2BMCA 4WNKA 1WBTA 4G9RA 4DG2E 5CAPA 2QLQA 2WTDA 4EH2A 2BHEA 3PXYA 3PY1A 3OUNB 5FXQA 4O7LA 4E7WA 4FV2A 5HE3A 2E9PA 2JDRA 4X2JA 3TV7A 3HEGA 3QQKA 5HBHA 4QMYA 4DEAA 5GINE 4FKJA 5K3YA 1UKIA 4O2PA 2WFYA 4MKCA 2IW9A 3R30A 5M07A 4R77A 2QOHA 3FKOA 2W1CA 4JQ7A 4QP9A 1JSUA 4C7TA 3PRIA 2X1NA 5HVKA 3KRXA 2RSVA 4QTAA 3F88A 2E9NA 3PZHA 4D5HA 1V0OA 4GFOA 3R1NA 5AP4A 4XCUA 3ET7A 3OFMA 3GC7A 5CQUA 2PZ5A 4JS8A 2C6LA 4IZ7A 3P0MA 4M84A 3FEGA 1CM8A 3F3TA 5HQ0A 5BUJA 1YHSA 1Z9XA 5E91A 2Z7SA 1KE8A 3CIKA 4CMOA 1VYWA 4LGGA 5CZHA 4FV1A 1FMKA 1XH8A 4K77A 4N70A 3CC6A 5CEIA 3FJQE 4AX8A 4ZAUA 3LMIA 4FBXA 5J95A 3I81A 3DOGA 3HMPA 3CD3A 3UZRA 3R9DA 2WIPA 5KMMA 2VTIA 2UVZA 4JAJA 2OH4A 3FMKA 4FUYA 2AUHA 3P23A 4IXPA 3KRWA 4C4IA 4LM5A 3FXWA 2OLCA 3BBWA 4FK6A 3ZFMA 3ZRKA 2R3PA 3L9PA 4TKSA 4E4XA 3W10A 3SRVA 3U4WA 2O2UA 3DJ5A 4FSZA 4QP2A 3SXFA 1PYEA 4L9IA 4QYHA 3R00A 4RIYB 3DY7A 3BLQA 3ENHA 4RPVA 2GTMA 3LCOA 3F3VA 3Q5ZA 4R7IA 3RAKA 4A07A 2JGZA 3CP9A 4L43A 2JAVA 4I21A 1L8TA 5DIAA 5DRDA 3EN5A 3A4OX 3E88A 3VNTA 4A7CA 3TNWA 2CKQA 3NW5A 3PJ1A 1B6CB 1CTPE 3NLBA 4E4LA 4LL0A 3W2RA 4MVFA 4YPDA 5AA9A 2VWZA 3RWPA 2X7OA 4G5JA 4O0RA 5K0XA 2P2IA 3QX4A 5I9UA 5IDPA 3UYSA 3KFAA 3BV3A 5M44A 3I5ZA 4GIHA 5M06A 2QHMA 5EM7A 2XBJA 3U8WA 4B8LA 4AW5A 4FTMA 4PX6A 1JKSA 4FZ6A 2JIUA 4QMVA 3UIMA 4R7BA 3R7IA 4DGMA 3CKWA 4ZY4A 4YUQA 3OT8A 5IUGA 4KRCA 3GOKA 1SYKA 4AZTA 2QC6A 3TV4A 4LRKA 2IW6A 3DJ6A 5FTQA 4FC0A 4XOZA 3EB0A 4GUEA 2C30A 4KSQA 3WE4A 4EHZA 5GJGA 3Q2JA 5AM7A 4C62A 3QTUA 3TG1A 4CZYB 1WZYA 3KEXA 3EFKA 3NW6A 3O7LB 5JK3A 3ZMMA 3V5QA 1OIQA 4FNZA 3RINA 4A4OA 2FGIA 2KULA 2OICA 3I6WA 4ZTRA 3M1SA 2HZ0A 3OWJA 3EL7A 4CKRA 1BI7A 3GC8A 3MY5A 2CKPA 1OGUA 3FMLA 5CEOA 1Y57A 4IC7A 4KAOA 3D14A 4CD0A 3A7JA 4I0RA 4RLKA 3BELA 2RFNA 4LV8A 2XJ2A 4GU9A 5I9XA 4O7ZA 4IW0A 2VTLA 4RFYA 4D4VA 3FI2A 5AR4A 4FSMA 2F7EE 4X2FA 5GHVA 3VW6A 3PPJA 5EYCA 4L3LA 2Z8CA 2YA9A 4IAAA 4AT3A 3T9TA 3LXKA 1Y8GA 4BZDA 1MQ4A 2J7TA 4EH6A 5HNIX 1WBNA 2XYNA 4IAFA 2Q83A 3IPHA 4O83A 4DG3E 3O0GA 1DAWA 4FKSA 5A9UA 2OF2A 2YDKA 3DDPA 2ZV2A 4BDBA 3ZDIA 4DFNA 4C2WA 4UBAA 2Z02A 2VTNA 3JXWA 4BGHA 3PE1A 4DG0E 2NO3A 3OXIA 4BDFA 1J1CA 5I3RA 4LV5A 4BIEA 4R3RA 2BDFA 1BYGA 3QRIA 4RIXB 4AN3A 2WMSA 3BYVA 3S3IA 2OXXA 4HPTE 1H27A 2P55A 3QXOA 3DZOA 4XV1A 3EQCA 2C4GA 4ZSGA 3AMBA 4KNBA 2GHMA 4H05A 1MRVA 4C4EA 1V0PA 5CALA 3IOPA 3LM5A 2QHNA 4GUBA 2BROA 5JFSA 4GG5A 3UGCA 2JDTA 3THBA 5AV4A 3QD3A 4MXCA 5ETCA 5CX9A 3R21A 2EXMA 4CFWA 5K5NA 2X4ZA 5AUWA 4BC6A 4CV8A 5F9EA 5M4UA 3SOAA 1PXMA 3E87A 3R71A 4PWNA 5H2UA 1QMZA 1FOTA 3R6XA 3D7TB 4Q9SA 3HA8A 3ALNA 1DI9A 2XIKA 4G17A 4H1JA 5TO8A 3W2SA 4G1WA 2C6OA 4FV5A 3E5AA 4GW8A 4B9DA 1OIRA 5B0XA 5L2WA 2JC6A 4WNMA 2WHBA 5K4IA 3NR9A 4KB8A 4BDKA 3COIA 3CPBA 4K0YA 3AQVA 1OBGA 5C8MA 3EOCA 4CXAA 2VWXA 4GFMA 2CKOA 3CE3A 4JRVA 2O65A 3CPCA 3P08A 3OWKA 2R0UA 5HTIA 1NW1A 4H3PA 5G1XA 4FKVA 2LAVA 4RJ6A 4F7LA 4RJ4A 5KKRC 3V5PA 1RJBA 4HVGA 5JGAA 5CEKA 5J7BA 2BDWA 3QKKA 4YLJA 2WU6A 3QYWA 3DDQA 3LAUA 3V5WA 4Q5HA 5GZ8A 4EC8A 2UW8A 3NNXA 1F3MC 4ASZA 4QRCA 5DRBA 4Y85A 5E8YA 3UIXA 2A1AB 1HCLA 4USEA 4I6HA 1OL1A 3ETAA 3LXPA 4TY1A 3IKAA 2PE2A 5LWMA 3KXXA 3SA0A 1H0WA 5DE2A 4OTWA 4FTIA 4N6ZA 3KVXA 5TKDA 1TQPA 2BKKA 2B9JA 3DFCB 2ZYBA 4FT0A 2ONLC 4EJNA 1UNHA 2XRWA 1M17A 1JAMA 1JOWB 5T3QA 3SGCA 4FG9A 3CLYA 1OZ1A 3QUDA 2X9EA 2R3FA 4EH9A 5JN2A 2QQ7A 4J99A 4PQNA 5DPVA 5FDXA 4QYFA 3IOKA 3JUHA 3VS0A 5B7VA 4CFNA 4BCMA 3PY0A 3TWJA 3R9OA 4QQTA 5LMKA 3GU6A 1XBCA 3EYHA 4NZWB 4DT9A 2YLFA 3PVBA 4D4YA 1UVRA 4MD7E 4MXZA 4CZTA 3FLNC 4F64A 4YPSA 3ZFXA 4FZFB 4AU8A 3EN6A 3HUCA 4O96A 3FE3A 1UNLA 3MPMA 4PNKA 1SVEA 5M4CA 5F94A 3SG8A 4V0GA 2Y4IB 4BHZA 1KE7A 4JR3A 2DS1A 2YEXA 4M0ZA 3TV6A 4MNFA 4PTCA 4I5PA 3P7CA 3FC2A 4EOKA 3PXFA 3FMNA 3NUSA 4YZDA 3R63A 4TYJA 2CNUA 3QTRA 3NIZA 3ORZA 4AE6A 4Z7HA 5A6OA 3FWQA 3A7IA 4AN2A 3QTIA 4I94A 2B9FA 4AZSA 3RPRA 1OBDA 2VTPA 2JBPA 4YZBA 3PWYA 4L45A 2X6EA 4HCVA 3VS6A 1UV5A 2F57A 2GQGA 4W9XA 3GT8A 2P2HA 4H39A 3VS3A 5LVMA 3OVVA 4R3CA 3UC4A 5HBJA 2PVMA 3PA5A 3QGWA 3UIBA 2UZNA 4FVPA 3KULB 3MIYA 3MH3A 5EW9A 3ZO2A 2BRMA 4NH1A 4RJ3A 5CTPA 1J1BA 2JKOA 4BF2A 5FP6A 5C1QB 4QO9A 4O27B 1VYZA 2OJ9A 3BGPA 3BBTB 2RFSA 4TXCA 3SC1A 3T9IA 4G3DA 2WQNA 2DQ7X 3LM0A 4AS0A 3TKIA 1P5EA 1KV1A 4MF1A 3SW4A 1H1SA 4QPMA 4KS7A 1YI3A 1ND4A 1YWRA 2QOKA 3VF9A 3DKCA 2G01A 3A99A 3F69A 2IZTA 5L2QA 3EFWA 3BKBA 3KK8A 2X2MA 1YRPA 5C27A 1ZMWA 2JBOA 4IB1A 4USDA 4LRMA 4BGQA 5J5TA 3DNEA 5LWNA 4ANLA 4D4SA 3PVUA 1XR1A 3BV2A 3AGLA 1ZLTA 3O51A 2Y6MA 1GIJA 5CVFA 3ORNA 2X2KA 4V0GB 3MN3A 3UVRA 3U9CA 3DPKA 4CZUA 4ACMA 4I3ZA 1Q3WA 1Y6BA 2VTSA 2ITPA 3DFAA 4AFEA 5CWZA 3F7ZA 3KA0A 5AP7A 5K0KA 5LXMA 4II5A 3QTQA 3CTJA 3E3BX 4QT1A 4HOKA 2V7AA 5HCYA 3EN9A 4NIFA 3W8LA 4FTNA 2FB8A 3K3JA 1OIYA 4E5WA 5IH6A 4FF8A 4DGOA 4ZLZA 5HTBA 2HK5A 3ZYAA 4DF3A 2B0QA 4K33A 2QCSA 4R3PA 4OUCA 4BDGA 4UZHA 5CS6A 2B4SB 2P33A 3R1SA 1HOWA 4DBNA 4OTDA 2RGPA 4M69B 3PSCA 3BU6A 3UJGA 4F1TA 1NVSA 5HTCA 4GT3A 1GJOA 5GIPE 2PVJA 4XS2A 5B2LA 4KRDA 5IQDA 5AV2A 4HGTA 2XNGA 2GQRA 3W33A 3F2AA 3NGAA 3Q6WA 4WNOA 4XBUA 5BVWA 5CAQA 4RLLA 4K8AA 4FV7A 3ZZEA 4H36A 4JDIA 5HG8A 5H9BA 4UWYA 1R1WA 1WFCA 2G2IA 5JQ5A 3HLLA 4FOCA 2JDVA 1B39A 4BTKA 3L8XA 5D1JA 5AV3A 2Z2WA 2E9VA 3TKHA 3D15A 5CASA 3KRRA 2PMNX 3LZBA 4CGAA 2WGJA 5FBNC 2RF9A 4FYOA 4ACGA 1ZYSA 3ALOA 4N0SA 2UV2A 2C3JA 4O0VA 5DH3A 2HW6A 4L42A 3W18A 2HWPA 5HCZA 2C1AA 4CFFA 4ANMA 4ZEGA 5AP6A 3VRZA 3AC5A 4NTTA 3F61A 3BGZA 4RVLA 2ZDUA 4E8AA 4Y72A 4AN9A 3UODA 4EOOA 4XUFA 3CTQA 3VQUA 3RMFA 5CLPA 4QMPA 5IMXA 4EKKA 3KQ7A 4OBOA 3GC9A 3FQEA 3FQHA 1T45A 4X2NA 5E90A 3HRFA 4AWIA 4Q9ZA 2YM5A 3KRJA 5JFXA 4CNHA 2HZNA 2UZBA 4ALWA 4IZYA 5DA3A 3ZLXA 5AFVA 4EONA 2J5EA 3RKBA 3EKNA 2EB3A 4EEVA 3U55A 4EH4A 2XBAA 5L6OA 3KCFA 4KIQA 4U42A 3PJ8A 2R2PA 3QU0A 3EN4A 1A06A 4HGLA 3EQHA 3QRUA 3NRMA 1R39A 3A62A 4A9YA 4W4YA 5A6NA 1PMUA 3BZ3A 4RC4A 4HVHA 2GNHA 3F6XA 4GCJA 3V51A 4NU1A 4BKZA 4IJ9A 5HLPA 5BYLA 4GH2A 4AAAA 4AA5A 4ANOA 2EWAA 2YIRA 3JY9A 3QKLA 3OTVA 3LFEA 4LL5A 3RNYA 3UPXA 2YLEA 3IW7A 5BUIA 2GTNA 3A8XA 3FY0A 5IH4A 5L8LA 4YJRA 2OFVA 4LGHA 2YM6A 4G31A 4G3CA 3O71A 5E9EA 3UO5A 5A14A 1M52A 2YJRA 3VUIA 4NM5A 2YM4A 4RX7A 4QQCA 4YBKA 3S2PA 4FIHA 2W05A 4RC2A 2YHVA 1IR3A 1JKTA 5HO6A 3VUDA 4PV0A 3DBCA 4NKSA 2XA4A 4WRGA 3EQPA 2VO7A 3FSFA 3TTJA 3H10A 4G6LA 2AYPA 4HNFA 5BVEA 3U87A 4ASEA 3RAHA 4KBAA 3PPZA 1IAHA 3PIXA 4EH3A 2BDJA 2VRXA 4J8NA 2YWVA 5E92A 4J95A 3OOMA 4ALUA 4MX9A 1URCA 3UOHA 4DCAA 5E8XA 4CMUA 4JBOA 4NK9A 2IWIA 3QWKA 5CF8A 4BI1A 4QMXA 4RWLA 4YR8A 2O63A 5DEYA 4YSJA 1CKPA 3RP9A 4EK6A 3QYZA 1WCCA 3U54A 3Q4TA 3ZO1A 3LFDA 2YZLA 4EOLA 3FZRA 3D5WA 4NJDA 3O50A 4BY9E 2Z7QA 3FL4A 2B7AA 2R5TA 2QOOA 3EIDA 1BLXA 3OY1A 2EXCX 5HBEA 5HE0A 2QOBA 4JOAA 2CN5A 4QYYA 1ZYJA 4EHEA 4CKJA 5A46A 1M2QA 3W32A 5HE1A 2UZUE 4DFZE 4AP7A 4DBXA 4M0YA 4FTOA 4RIWA 3MI9A 5CT7A 5CU0A 1H28A 3ORXA 3NIEA 3EH9A 3OBJA 4QTEA 4CG9A 1Q8YA 3GCPA 4FKTA 4R5SA 3EQRA 2XEYA 4I6BA 4F7JA 2C3KA 1PHKA 4BTJA 3KF7A 3DKGA 3TNHA 4OTRA 2VO0A 1PYXA 1IA8A 4FTTA 3KN5A 2ONLA 5AP5A 3VJNA 4CRSA 4EQCA 3Q52A 2YABA 1ZMUA 3HECA 4EWQA 1OI9A 3FY2A 3TTIA 4QNAA 1P4FA 4GK3A 1UNGA 4PUZA 3KL8A 4GSBA 4H3BA 4QD6A 4D2RA 3FI3A 2OZOA 3FYJX 2BCJA 3IO7A 3FDNA 4FZAB 4TYHB 4BR3A 2W1EA 4QMMA 3LFBA 4JAIA 3BE9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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