4F99A

Human cdc7 kinase in complex with dbf4 and nucleotide
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
354
structure length
312
Chain Sequence
KKDIEKLYEAVPQLSNVFKIEDKIGEGTFSSVYLATAQLQVGPEEKIALKHLIPTSHPIRIAAELQCLTVAGGQDNVMGVKYCFRKNDHVVIAMPYLEHESFLDILNSLSFQEVREYMLNLFKALKRIHQFGIVHRDVKPSNFLYNRRLKKYALVDFGLAQGTHDTKIELLKFVQSEAQQRAGTPGFRAPEVLTKCPNQTTAIDMWSAGVIFLSLLSGRYPFYKASDDLTALAQIMTIRGSRETIQAAKTFGKSILCSKEVPAQDLRKLCERLRWNEVPDEAYDLLDKLLDLNPASRITAEEALLHPFFKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human CDC7 kinase in complex with its activator DBF4.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division cycle 7-related protein kinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 312
sequence length 354
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f99A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f99A01
3NMUF 3WYXA 2YEXA 4E6QA 1WBPA 3F88A 4KBCA 1JWHA 4OTQA 4ACCA 1NY3A 3UP7A 4F7LA 4MHAA 5C8MA 5HD4A 3HUCA 2OU7A 4EHEA 5KMJA 2BFYA 2FSLX 4K18A 4D2SA 2R3NA 5JGAA 3ZFMA 3TEIA 2UZBA 4Y46A 2IN6A 3I4BA 4YO6A 3WF8A 1YHSA 1XBBA 2BDJA 2R3OA 2RSVA 3B8QA 4HVHA 1WBWA 2GNJA 3ORPA 5TR6A 4PMMA 4BDEA 3BIZA 4I5MA 3GT8A 4IWQA 4P5QA 3A62A 3JYAA 4U8ZA 4WT6A 5EW9A 4DFXE 4R3CA 1KE5A 4EH3A 5HG9A 2IJMA 4FNXA 5J87A 1KWPA 3VS0A 4ALWA 2WMBA 1M2PA 4LOQA 3PJ2A 1UKHA 3POOA 5DN3A 5HGIA 5IQDA 3FQEA 2XNPA 4TWPA 2O64A 3IONA 4L68A 2ZVAA 4DEGA 2QO9A 4CZTA 2EU9A 2X8IA 4XV9A 3VUMA 5BMMA 2CNVA 2C69A 4ANLA 3SW7A 3VUDA 4TL0A 4FT9A 2JITA 3PE2A 4RIYA 3U4WA 2W4KA 3LAUA 4F08A 5J5SA 3R2YA 5IEVA 4EWHA 1OL5A 1YVJA 2C1BA 3NYXA 2ITYA 3U54A 3DB6A 3IGOA 4H1MA 5TF9A 2EB2A 4IX4A 1J1BA 4CFVA 3R7VA 3S1HA 5AP4A 5KNJA 3W2OA 3UVPA 1XHAA 1PHKA 2VGPA 3GFWA 4FIIA 4AP7A 4B8MA 3VJOA 1P5EA 4TNBA 4GCJA 4BCFA 1I44A 3CLYA 4NM3A 1GIIA 1Y91A 1NVRA 3OWKA 1U5QA 4FKWA 2O2UA 5ANGA 2WMUA 3RNYA 5CEOA 4TRLA 2JIVA 3G6HA 2VTQA 4IWPA 3W2RA 4A07A 3DK7A 5FD2A 4C3FA 4OT6A 4B99A 3O8TA 4WSYA 5HBEA 2PUIA 1H0WA 1G5SA 2GNGA 2KULA 3CS9A 5A4TA 3R1QA 5E8XA 3CEKA 4FTKA 2NRYA 2OJJA 4UWBA 1YI4A 4X0MA 5K0KA 3KQ7A 4ZTRA 4IADA 1K3AA 1Q8ZA 3V01A 3CSVA 1JKTA 3C4CA 3OBJA 1BMKA 3GU6A 1IAJA 5AUXA 3AT2A 5EHOA 4UV0A 1YI6A 5CXZA 4FI1A 3WZDA 3AGLA 3VBTA 4J71A 4NFNA 4YC3A 3UNJA 4PP7A 4FBXA 1SVGA 5LCJA 5AAEA 4AZVA 2GPHA 4BI2A 4QMOA 3I6WA 4UX9A 3L9LA 3V8TA 3QTZA 4ZMEA 3MGYA 1IA9A 5E8TA 3DKOA 2WEIA 1ZWSA 4RG0A 4PTCA 3POZA 3IW7A 4BDHA 4XV3A 3Q52A 4WNMA 1K2PA 1YOLA 3S4QA 4F0FA 3MV5A 4E4NA 3KXGA 3A99A 3DJ6A 4AE6A 2PE2A 2VX1A 5FEDA 5J79A 1GZ8A 2FUMA 2OLCA 4JNWA 3TUDA 3IGGA 2G2FA 3D83A 1B6CB 4LRMA 4FYOA 3QRIA 5AUUA 4IH8A 2YLFA 1H0VA 3LQ3A 3E8NA 4UZDA 5TKDA 2HZNA 4KABA 3ZDUA 3M1SA 2R3QA 3NUNA 3R7IA 3C51A 4S2ZA 5EM5A 3OEFX 2PPQA 1Y6BA 2W5AA 5D1JA 3KVXA 4V01A 1ZZLA 2VTLA 1DAYA 3VWAA 5A6OA 3SQQA 2X7FA 4RJ4A 5BUEA 4DFNA 5LXMA 3WF5A 5FXQA 4YTIA 2CN5A 4ZTHA 3W2CA 3SHEA 3R1YA 3JPVA 5AIKA 3ZC5A 5LQFA 4O83A 1MRUA 2PY3A 5IU2A 2W1CA 5EDRA 3QZHA 5L2QA 3DS6A 4FTIA 1JSVA 3DXQA 5DR6A 3LCSA 4AZFA 5GINE 4UWYA 5AX9A 3RP9A 4AOTA 4G5PA 5CU3A 5E8SA 4KUJA 3ZFYA 3R30A 3QX4A 3LJ1A 3MS9A 2VN9A 4IDVA 4HGSA 4TYEA 4JQEA 2I1MA 2HZ4A 3G6GA 3QZIA 1P4OA 4IZ5A 3JVSA 3WZUA 2WMXA 2BRBA 2B1PA 3WZKA 4OBPA 3W8LA 3E62A 2ZM4A 2IG7A 2C5VA 2ZDTA 3H4JA 3LW0A 3FMNA 3DB8A 2QOHA 4C4GA 5BVWA 5CI7A 4B4LA 4DFBA 5F94A 4ZZMA 2AYPA 4FA2A 3L9MA 3KULB 4NT4A 5GZAA 4N57A 1ZYLA 3TG1A 4N4SA 4AA0A 1UKIA 4Z3VA 5KKRB 3TKIA 3FMKA 3IOPA 5LVLA 1U46A 1WZYA 3D15A 4H05A 4EC8A 4J97A 5FBOA 3A8WA 3KN5A 3GENA 3VS1A 4FZDB 5FUTA 4U3ZA 5CZHA 5LJJA 4Q5HA 2E9UA 3ZFXA 2J5FA 5LWMA 3GC0A 4GT5A 3DDPA 3ZRKA 2GTNA 4F6UA 1Q41A 5CQWA 3FQSA 3U6JA 3NUPA 3R8MA 3IW6A 4F0IA 5HEZA 5CAQA 3HRCA 1P4FA 2OW3A 3GCPA 2C3IB 3GU8A 3BELA 3QAME 3TJCA 2X8DA 3CY2A 2I40A 3T9TA 4JAJA 3THBA 2J51A 1BL7A 3HA6A 4UWCA 4LQMA 3PIXA 4GS6A 1M7NA 3F61A 4E4XA 4F9YA 3KREA 2BRHA 3QXPA 4ALVA 4HCTA 4GYGA 4XOZA 1H1WA 4QMUA 1F0QA 4MBIA 2EXCX 4JBVA 2XRUA 4MEDA 3NUAA 2ZOQA 4MBLA 5AA8A 1Q5KA 2YABA 2XF0A 3LXNA 4EK3A 3KVWA 4MF1A 5IMXA 3CPBA 4RVTA 5BVEA 4IANA 5EQEA 2W9FB 4EBWA 3VF8A 1V1KA 1W0XC 4MNEB 3UQFA 5ITAA 2BRNA 4KBKA 4F70A 2XIZA 4PPAA 2YIRA 3ZCLA 3VJNA 4Z7GA 5T6KA 2JIIA 4TYGA 5C8NA 2UW8A 5CENA 4F9BA 2B9IA 3TNWA 3QTUA 3QRKA 3ET7A 1XH4A 4RT7A 4ERKA 4F9WA 4JL9A 5L2SA 1KV1A 3F66A 4C3PA 1OITA 2YIWA 4DGNA 3OXTA 5AMNA 5DLSA 3FI8A 3RZBA 4PWNA 4XLIA 4DEHA 4RLKA 4BDDA 4IAYA 1O6YA 2YM3A 5AR5A 5TOZA 4FTCA 1FMOE 2PMLX 2W99B 3BQRA 3PPZA 3QL8A 4I93A 2OF2A 4II5A 4LMUA 1UV5A 5M08A 4QP2A 3ZZWA 3NCGA 4TZRA 4F6WA 2Y4IC 3Q5ZA 3GCVA 5HIEA 4GH2A 3V5QA 1Q8YA 3GUBA 2YDJA 3D2KA 2QOIA 3IDBA 5HCZA 3COKA 5GIOE 5HG8A 3QRTA 1H28A 5IQGA 5FG8A 4ANNA 5DPVA 3DNEA 4FZ6A 3ORZA 2VRXA 3PE1A 5J7HA 1M17A 3ERKA 4G31A 4BCMA 5IA4A 2Q0BA 3UDBA 3PPKA 5CSVA 1LUFA 3JY0A 3NDMA 4G17A 5CF5A 5CU6A 5CU2A 3SRVA 2VNWA 1BYGA 3PXRA 2XIKA 4IW0A 1PKDA 4FV4A 4RFMA 5HE1A 1Q8UA 4W8EA 3UP2A 4A9SA 5CF6A 1OM1A 4E4MA 3KKVA 3R7GA 3DK3A 4ZSAA 4GT3A 4IEBA 4Y72A 2R7BA 3VAPA 3MA3A 4CV9A 3TUBA 1WBNA 4ANOA 3KXXA 3FZSA 3L9NA 4AACA 4WNPA 4JRNA 2PMIA 4AZEA 3FLSA 4PF4A 5DRBA 2WTVA 1UA2A 2XK3A 4UZHA 4AA4A 4YC8A 2X2LA 4EL9A 3ULIA 4S31A 5E8ZA 2QU5A 3MVHA 4FK3A 1Y57A 3FHIA 3CTJA 4FL1A 4NIFA 5HO6A 2X1NA 5IDNA 3L9PA 1URCA 3ZO3A 5M57A 2ZM3A 1Q3DA 2FSOX 4BDJA 1JSTA 5FRIA 4RIWA 3KRWA 3KF7A 5L4QA 4RJ8A 3GQIA 3PY3A 4MXOA 3ZLYA 1ATPE 4L45A 4WUAA 3DDQA 3EZRA 4N0SA 3Q4ZA 4B7TA 1WMKA 4W9WA 3R63A 4IAZA 3I0QA 4HGTA 2JGZA 3LMHA 2AUHA 2XM8A 1DAWA 3O2MA 4I0SA 4LI5A 2WMWA 4P5ZA 1FPUA 4YJNA 3Q53A 1OZ1A 4E7WA 2UW4A 2B4SB 3L8SA 2ETKA 5HLPA 5BYZA 3TCPA 4QNAA 2EXEA 4MD7E 5DWRA 3ALOA 3H3CA 1GZNA 4Q9SA 4DT8A 3FI3A 3AD4A 3SA0A 4BTKA 3JXWA 3C4XA 1YQJA 2GHMA 2P55A 1M14A 3BE2A 3EJ1A 3O17A 4FKVA 4J7BA 4Y8DA 5IKWA 4IHPA 4FEXA 2OGVA 2OO8X 4FIEA 1KE8A 5FTQA 4HPUE 1JOWB 4CKJA 2WMSA 3HMOA 2J50A 2VV9A 4MNFA 1GZOA 1M2QA 4FG8A 2VTIA 5A6NA 4BCIA 4A4OA 2VZ6A 3CD3A 1PJKA 2LAVA 3MW1A 4G34A 3Q3BA 4YJPA 4DH8A 2QKWB 3SW4A 3TTIA 2RFEA 3TNQB 4RIOA 3PVBA 2BPMA 3SGCA 2EUFB 3O23A 3QKMA 5HD7A 5ETAA 1LR4A 3DPKA 3FZOA 3EKKA 3KB7A 3PTGA 3QD3A 4FG9A 2WTJA 2QR7A 4M3QA 4M14A 3RK9A 1SVHA 4YO4A 3TDWA 3EWHA 4MTAA 4ALUA 4EI4A 5H3QA 3T3VA 4B8LA 5BQ0A 4AOJA 4K2RA 3RJCA 3C4ZA 4O7VA 4EH6A 3O8UA 4DINA 4TPTA 4KRDA 5K3YA 1LP4A 5HI2A 3VS5A 5KBRA 2OICA 5HVJA 2IPXA 3Q9WA 2X4ZA 3BBTB 4DLJA 1PXIA 3E87A 1UNLA 2ZJWA 4G3FA 3KF4A 3F2RA 5LVPA 4F65A 3KGAA 3MSSA 4FUYA 3W55A 4EOKA 5L6OA 1W8CA 3QCXA 4G6LA 4MKCA 4BGGA 4OT5A 5C8KA 4ARKA 1JNKA 3HRBA 1H4LA 3P5KA 4F63A 1OGUA 3I60A 1PY5A 3KL8A 3LJ2A 5I5ZA 5F1ZA 2GCDA 2JKKA 4C57A 2BFXA 4BIDA 4D4VA 1YKRA 3W16A 3GBZA 4O7TA 3CJGA 3PJCA 4BCPA 2UZLA 4M0ZA 3EFLA 3TZ8A 5DH3A 2IO6A 4MXAA 5KMMA 4BICA 4W9XA 3PJ1A 3CCNA 2C0IA 3RK5A 3OCBA 4K9YA 3R8UA 3FPMA 2VTOA 3CIKA 3HUBA 4IMYA 5CTPA 1FINA 3I7BA 4HVGA 4N6YA 2R3HA 2PSQA 4O84A 3DKCA 2XJ2A 3HRFA 1H24A 2HK5A 4LV5A 4X21A 3CTQA 3HP2A 2YITA 4FKQA 3G0FA 2F7EE 3WI6A 4BRXA 2HXQA 4MX9A 3SXRA 2BHHA 2B9JA 2CCIA 4NJ3A 4R3PA 3ZTXA 1ZYDA 4PL5A 5BUIA 4FV3A 3KMUA 5AM7A 3F5GA 4MYGA 4D2RA 2PYWA 3UPXA 2WTKC 3ORIA 3QUDA 4FKLA 1WBSA 4X2FA 2R3MA 2C6LA 2RFNA 4O6EA 3QUEA 4GL9A 3KMMA 3S00A 3BHHA 4DEDA 2YM5A 4ZJIA 3S0OA 4JOAA 1XKKA 5DEWA 5HLNA 3O7LB 4YJRA 2VNYA 3NS9A 2V62A 2W96B 4O0WA 4OTFA 5AP6A 3Q6WA 3QA0A 3SD0A 2V22A 4FTUA 1YXTA 3OG7A 5AR7A 4K77A 4NK9A 3R8PA 4D1XA 5LMAA 5K4JA 2PK9A 3UTOA 5BVDA 4IVCA 3PWYA 3QQUA 2R3PA 4AZWA 3UIUA 2XYUA 2NNWB 3OTUA 4O0TA 4ZEGA 1G8AA 2F2UA 2PZPA 4NFMA 1OIRA 2P0CA 3P0MA 5EKOA 4DF3A 2WTDA 4MWIA 4JQ7A 3NVMB 4L43A 2WD1A 5FP6A 3BHVA 2F9GA 2X2KA 3C4WA 3HV3A 4ZTSA 2OH4A 4D1SA 1YDSE 5IUHA 2CLQA 4EQMA 1G3NA 2R9SA 2P2IA 4JAIA 3DJ7A 1OI9A 3DQXA 3LFQA 4AGDA 5IMEA 3HAVA 2YAKA 4G5JA 2ITOA 5ANOA 4BR3A 3EYHA 5C03A 3COMA 4O7LA 1W82A 4G3GA 5AUTA 3ROCA 4F0GA 3GCQA 4ACHA 4I6HA 3P23A 3UOJA 4XLVA 4I21A 3ORKA 4FEQA 4I6BA 5CNNA 4O82A 5JQ5A 4BBMA 5CXHA 3W2PA 4JG7A 4YJUA 4GV1A 2QKRA 4ANSA 1R78A 4U44A 2XKEA 3H9OA 5T68A 2PVHA 4FSRA 2HW6A 2ZMDA 2BKZA 1HOWA 3QCQA 5AJQA 4EHVA 4LL5A 4X3FA 5AV1A 4O7NA 5EI6A 5CEIA 4FSNA 4PDOA 1Q24A 4EK8A 5J1VA 3ORXA 3Q4UA 3EB0A 3FV8A 4BYIA 2BMCA 3DBFA 4EWQA 2VX0A 3EL7A 5DVRA 1QPEA 3MFUA 4DTKA 4ACMA 5HBJA 4AG8A 4O0XA 3E64A 3HEGA 5DR9A 4HVSA 1H1QA 3DV3A 4XX9A 3TNHA 3MVJA 5E90A 4LOOA 5CT0A 5CAUA 3T9IA 2X6DA 2ZMCA 4M84A 4RQKA 4U40A 5HE3A 4EJ7A 1MRYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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