4FC0A

Crystal structure of human kinase domain of b-raf with a dfg-out inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
275
structure length
254
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGGSILWMAPEVIRMNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Design and synthesis of novel DFG-out RAF/vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR2) inhibitors: 3. Evaluation of 5-amino-linked thiazolo[5,4-d]pyrimidine and thiazolo[5,4-b]pyridine derivatives.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 254
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fc0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fc0A01
2UW3A 3LW0A 4ZLOA 5EDQA 2VNWA 3SGCA 3H9OA 5HLWA 1BI7A 2CGVA 3U8WA 5HKMA 4FSNA 3PXZA 1PXMA 2QHMA 2JBOA 2OSCA 3L1SA 4I5MA 4W4WA 5J95A 3LM0A 4E4NA 5B2MA 2UW4A 5KMIA 2P3GX 2VV9A 4LL0A 5CVFA 3VW8A 4MKCA 3JVSA 3UC3A 4DLJA 2OBJA 5A6NA 4PDSA 1R78A 3RAIA 2QOFA 1JBPE 5CXHA 4KABA 2IZUA 5J1VA 2BRMA 3G0FA 4BDCA 4DEAA 4A9RA 4ZTLA 2VWWA 3VF9A 4CQEA 4USEA 2GNGA 4RJ7A 3FQEA 2O5KA 4EHGA 4UEUA 5JT2A 5L2WA 3HDNA 3IW4A 3EQIA 2G01A 4DH1A 5CANA 4YNEA 5K0XA 5LVNA 2OJFE 2WEVA 3RJCA 3S95A 4QMQA 2R3GA 3E63A 4O96A 4C4HA 2B4SB 4JLCA 2PZ5A 1CSNA 5B2LA 2WOTA 1GJOA 3VUGA 5I9VA 3PVWA 4O7WA 3FMMA 4AE9A 4DA5A 3SLSA 2ITTA 4HGSA 3K5VA 5HO8A 5CF5A 3CQUA 3GCSA 3ZCLA 2WMSA 4W8EA 3K3JA 3NUSA 4D2PA 5AAEA 1F3MC 3OHTA 3FYJX 5FQDC 4FT9A 2I1MA 1U54A 3PA5A 4LG4A 4F65A 3PJ8A 4AFEA 2WQOA 4BDFA 1CTPE 3LXKA 3TI1A 5EI2A 2YCRA 3BGQA 2OGVA 3CPBA 3HEGA 2UW7A 3R8LA 3V3VA 3ZFYA 4E5AX 3V6SA 4U41A 2QC6A 4HCUA 4YTIA 4A4XA 4F08A 1LP4A 2XCHA 2XEYA 3SQQA 1ZY5A 1J3HA 4MBIA 4H39A 4XG6A 2XP2A 5HE2A 5HVKA 3IECA 1YWNA 3GC8A 4I5CA 3COIA 3F5UA 2JIIA 2B1PA 2CKOA 3QKKA 5GNKA 3F5XA 4U40A 1XH9A 3MB7A 4J8MA 2BRGA 1H08A 3MFTA 4I92A 4GK4A 5EOBA 1NT2A 3GUBA 2UZDA 4GFGA 4CD0A 4FKVA 3N4TA 1CKJA 3LM5A 3E93A 4GIHA 2IW6A 4LGGA 4EH4A 4PF4A 3PE2A 1U54B 2R3KA 4TWCA 5CSHA 5L2QA 2GU8A 3P4KA 4QQ5A 4C7TA 1PYEA 2OJ9A 2VAGA 3DZQA 4IZ5A 3VS6A 3OP5A 3VUTA 4BVUA 3S4QA 3REPA 4C0TA 2QVSE 4CMUA 4DAWA 3KGAA 3D5XA 1IRKA 4MHAA 2OKRA 5LARA 3PPZA 1MQBA 5DRBA 4BGHA 2JAMA 3NIZA 3QQJA 4JOAA 3CC6A 1FVTA 1Y6AA 3ETAA 4PUZA 3CE3A 1KOAA 1P5EA 3QUPA 3FEGA 4G3DA 4RFYA 4K0YA 1Q41A 5EDRA 3FQHA 4I5HA 4JBPA 3QTQA 3VULA 2Q83A 4FEUA 3B2WA 1XH4A 3ALNA 4K77A 2W1DA 2O65A 4HGEA 4U97A 3WI6A 2W0JA 5GHVA 3GCQA 4FTOA 4QMSA 3FI4A 4FSUA 3VRYA 3LPBA 4C3FA 4EQMA 4G2FA 5JQ8A 2VO7A 2YERA 3GB2A 4CNHA 3O23A 4EOQA 4U3ZA 3KVXA 1XO2B 4BHZA 3FZTA 3IDCA 3QTUA 4HZSA 1W7HA 4A4LA 3R7VA 3LXLA 4NM5A 3LZBA 4NFNA 4UN0C 4YU2A 3QLFA 4FIIA 4BCPA 3GU8A 3ZM9A 5BVOA 3P86A 3KREA 2CLQA 3O0GA 4CZUA 1E1XA 2YJSA 4MNEA 4FTTA 1PHKA 2X81A 3OD6X 3O96A 2E9NA 3WF9A 5HTIA 3HV5A 1FGIA 4QMZA 2PUUA 3HGKA 5AA8A 3R22A 2J9MA 1KE6A 1CM8A 3EN6A 4MQ2A 4NT4A 1KSWA 3QRJA 1H1SA 3QKMA 3FLZA 4FGBA 3OCTA 3ORTA 5CEPA 2X4FA 5E8VA 5D11A 3G51A 1H28A 4MNFA 4TWOA 4X2KA 4ZP5A 3OT3A 3VBXA 3EQPA 2VX1A 3QQLA 3AGLA 5EW8A 3ZO3A 3CLYA 4FKQA 4MF0A 3OTUA 2V7AA 3TL8A 3SG8A 4KBCA 2CJMA 2YHVA 4GS6A 5BX0A 4DINA 3ENHA 4OGRA 1WMKA 4LGHA 3PTGA 2WTKC 2I40A 4QMYA 3KCFA 4GU6A 2DQ7X 4IM2A 4JG8A 4D28A 1OKVA 3ZC5A 2ETKA 3EWHA 5IDPA 4O27B 4F64A 4MNEB 4RFZA 1TKIA 3O8TA 2BAKA 3KQ7A 4W4YA 1G5SA 2R0IA 2X4ZA 3CY2A 4IAKA 4MBJA 2YM7A 2R3FA 3O71A 3H0ZA 5LVLA 3BHHA 3OZ6A 5C8KA 1SYKA 2WAJA 2Y8OA 2Y0AA 4A4OA 2QOKA 4EH9A 1Q8UA 2X8EA 4ASXA 3CR0A 4QT1A 1GIJA 1OPKA 2V55A 5IG1A 3QTSA 4BCGA 3F5PA 1WBVA 3Q96A 5L3AA 4KIPA 3OWPA 3W2CA 3HZTA 4TRLA 4HVIA 3V6RA 3ULZA 3I0OA 2QOBA 4CXAA 4PMMA 2JDOA 4DBXA 1R1WA 4EOKA 5J5SA 5IQGA 4J53A 4QP4A 4FT7A 5B2KA 2R3OA 1UNLA 5TF9A 3SOAA 2UW6A 4RSSA 2VTTA 5AR2A 3NW6A 4PDPA 2YCSA 3MA6A 3UE4A 4AGCA 5JMSA 3QQKA 5KMNA 4JRVA 3BELA 2VTJA 2WXVA 3UTOA 3QX4A 5IA2A 4XG9A 5LCJA 4B8MA 3R04A 5AM6A 2FGIA 2YM5A 3F7ZA 4KKHA 4NTSA 3QFVA 3PG3A 5AP4A 3ZDUA 4F9BA 5CSWA 5CAVA 4NSTA 5KMOA 2UZNA 2BRNA 1UKHA 2IJMA 3KEXA 4GJ2A 2QHNA 4GSBA 4IWQA 4EK6A 5IEYA 4DG2E 5CEMA 5EQPA 4IBMA 4BKJA 2WQEA 2UZBA 3LMHA 3IOPA 3LJ2A 2X2MA 4RVMA 3TZ7A 5L8KA 3I81A 1HOWA 4EH5A 4BY9E 3H9RA 2C6EA 4UYAA 4XH6A 4ZZMA 4J98A 5K3YA 3UZPA 3I6UA 2G15A 5L8LA 1M52A 1GZNA 1PKDA 3VIDA 1UNHA 4UXQA 3I1AA 2OIQA 4NH1A 3OS3A 3CQEA 4FSMA 4XV1A 3GEQA 4YNOA 5E90A 3ZLWA 3ZO1A 3PRFA 4F9AA 3E8DA 4UZHA 2UZLA 5C03A 3ZONA 4C4IA 4R7BA 3VUIA 4D2TA 3QZGA 4S33A 5TT7A 3PIZA 4XS2A 3DK6A 3TTJA 2ZYBA 2Y7JA 4ITHA 4CFVA 2QOLA 1SVGA 5AUYA 4I94A 3Q4ZA 3E8EA 3NAXA 3ALOA 4JL9A 4HCVA 4PTGA 3JYAA 3PFQA 2BDJA 4FMQA 4LYNA 2F2UA 3W2QA 4MH7A 5H8GA 3R7IA 4F6SA 4TYJA 3TNWA 1AD5A 4I6QA 3DJ7A 4QTDA 1NVSA 5IQIA 1OI9A 1WZYA 4PNKA 4ZS4A 3MSSA 4EHZA 1ZXEA 3MWUA 2R9SA 5HO6A 2A1AB 5HG5A 4UMQA 2UW8A 3F82A 4G9CA 5BVKA 3EFJA 2SRCA 5HE0A 4EH6A 4IWOA 4A06A 3QAME 5CAUA 1KE9A 4OTPA 3MESA 5EQEA 5JGDA 5IA4A 4FV1A 5D9HA 5KO1A 3BCEA 3SW4A 3F2AA 3UIMA 4FEWA 5F1ZA 4HCTA 3GU5A 3RGFA 3ZOSA 3LKMA 2VO6A 3FXWA 4F9WA 4K18A 2QG7A 2XIRA 4KBKA 4GUEA 2ITZA 4G17A 2E9PA 4FBXA 4QP3A 4U9AA 3JPVA 3UO4A 2HELA 3P78A 3E92A 3E87A 2JFLA 4TZRA 4XRJA 5A4LA 3BEGA 2J0MB 3DFAA 4N6YA 3QCYA 5J9YA 2Z2WA 3EKKA 3LCDA 3L9NA 4XBUA 3UIBA 2XIKA 3NUPA 2VTMA 2VWYA 3POZA 5L8JA 1Q8ZA 3C5UA 4AWIA 3ANRA 2HZ0A 2RF9A 4YJTA 1H4LA 3LFQA 5DT4A 5HZNA 3KMWA 4UWBA 4AUAA 3I5NA 4JDIA 5BUJA 3MA3A 4XG4A 2VTSA 2B9FA 3PXQA 3ZXTA 1KV2A 2QURA 4XX9A 3LAUA 3PJ3A 1OL6A 5M53A 4GRBA 2WTKB 1ZYSA 2ITUA 3GC0A 4C33A 3BIZA 3FJQE 3VF8A 4FKSA 4FL3A 2C6DA 2FO0A 3ORIA 4I4FA 4JAIA 3L9MA 4AOTA 5C26A 2JKKA 4LV8A 4FSRA 3CEKA 4DFNA 3F3VA 3EN7A 1ZYCA 2XK9A 3O8UA 3SXFA 2H34A 4YUQA 1WBWA 1XBBA 2FSOX 1J7UA 4QMWA 3TM0A 2R3IA 4KBAA 5DT3A 4D0XA 4YZ9A 2PVHA 4BTFA 2C3IB 1KV1A 3NYOA 5E92A 5GZ9A 4WSQA 4WG4A 2WGJA 4NK9A 5LMAA 4JQEA 4CFWA 5EW9A 3DCVA 3HUBA 4BDDA 1P4FA 2VTAA 5FTGA 4O86A 3LJ0A 3GFEA 4X6RA 4FYNA 4GT3A 4JT3A 4QMNA 3OC1A 4NW6A 5EH0A 3TACA 2BKKA 4QMMA 3W2RA 4P2KA 3OY3A 3FPQA 1H1QA 3QXPA 4KD1A 3MJ1A 3Q2JA 1U59A 4RIYA 4LL5A 2P0CA 4QP8A 4RWLA 4JDHA 4FICA 4EZ5A 4LRJA 4L6QA 5CSXA 5DGZA 2GQRA 3JVRA 5HIBA 3PSBA 4M66A 5HVJA 4AN2A 3Q5IA 3BU6A 4AZFA 4D4SA 3R63A 4YBJA 3FUPA 3GT8A 1XJDA 1QCFA 4LRMA 3VS0A 3BYMA 4FKRA 3UODA 2JITA 1H27A 2JKQA 2W1CA 4QPAA 2W4JA 3AC8A 1JPAA 5H8EA 3I79A 4Z55A 3R1YA 4JAJA 5A6OA 3R9RA 3CJFA 2XK8A 1O6KA 5FBNC 4J96A 5AV4A 2EXEA 3GENA 4FTLA 4R78A 3PIYA 2VTLA 2C6MA 2JIUA 4HYUA 2PVYA 4L45A 4CKIA 1EH4A 3CS9A 2WTDA 4CLIA 1U46A 1YDSE 3R21A 4E6QA 1H1PA 4GG7A 3DJ5A 3S00A 1PW2A 4A9UA 4GKIA 4B6LA 4FTJA 2BDFA 4H36A 3QWJA 2OIBA 4QQCA 2OJJA 4C4JA 1JWHA 3ENMA 4RIYB 3DK7A 4O2ZA 5GIOE 3HP5A 3ORLA 5A4TA 2OG8A 2JBPA 5I9ZA 5M4UA 4K9YA 2FVDA 3FY0A 4V04A 3P9JA 4RX8A 4CCUA 4EH3A 2VX0A 4PMTA 5CQUA 5A46A 2W1FA 3UJGA 4FV4A 5EYKA 5JRQA 5EYCA 5F4NA 4C35A 5JFVA 4YZCA 1OBDA 2Z8CA 1R0EA 5EHOA 1V0BA 3R9NA 5CYIA 2ZV7A 3UOLA 1YI6A 3RVGA 1GZ8A 1O9UA 2VO3A 2XA4A 5L4QA 1ZYDA 4WRGA 4YZMA 2ZB1A 2FUMA 1RE8A 2UZEA 5DA3A 3NRMA 1B38A 4G6NA 4D5KA 3BLHA 3GCVA 4ALVA 5JH6A 3QYWA 5DR2A 4ZK5A 4ASDA 1WVWA 4EKKA 4FTUA 4DGGA 3E8CA 3OCGA 2BIKB 1NW1A 4FG9A 1JSUA 3O7LD 1WVXA 4QP1A 5HOAA 3NUUA 5DYJA 2GHLA 3NW7A 1L8TA 4O7SA 4K6ZA 5EHYA 3DOGA 2VTQA 3A8WA 2YIYA 3HRBA 4DEIA 3T8OA 4YLLA 2IPXA 3JY9A 4WD5A 2YWVA 2WMRA 2C6IA 2XK7A 4AOIA 5BVFA 5LQFA 2FSLX 4YMJA 3LLTA 4MYGA 3PVUA 2UW0A 4FKWA 2EWAA 2PVMA 3E88A 3P1AA 1ZYJA 4DEHA 3ERKA 4DN5A 2XRUA 4IMYA 4QO9A 4NJ3A 4WHZA 5KUPA 5M57A 2Z7QA 2ZV2A 4IEBA 4FTNA 2VNYA 1REJA 2JC6A 3BYVA 3EIDA 4ID7A 4AN3A 1FMOE 1GZOA 3GP0A 3OT8A 3WE8A 3KXXA 5CU0A 4C62A 3TG1A 3G9LX 3DFCB 4ZZNA 3WBLA 1UU7A 1BLXA 3R9DA 4K33A 5A4EA 2WTVA 2X1NA 2Z60A 2A27A 4UYNA 3R30A 4KKEA 5IKWA 3M1SA 2F49A 5JQ5A 5LXMA 2I0HA 4CRSA 4C59A 3RK9A 2YABA 5TKDA 2WQBA 4FODA 3UZRA 4D1ZA 4JR7A 1M2RA 1YXTA 4WG5A 3GCPA 3UOKA 4FR4A 1LR4A 4W9WA 5GZ8A 5J9ZA 4ENYA 1YHSA 4RWIA 4DCEA 3RZBA 3KY2A 3EKNA 1YRPA 3QD3A 5AV0A 2YZAA 3R7YA 2CGUA 3RHKA 5FBOA 4CMOA 4BTKA 2C6LA 4NFMA 5CXZA 2ZM4A 3OUKA 2IZTA 1JSVA 3TZMA 2R7IA 1M2QA 3NYNA 3UVQA 2C69A 5HGIA 3TCPA 3UIUA 1U5QA 5CX9A 2PZYA 5AR4A 4I23A 1H25A 4LQMA 3KB7A 5ANGA 4HNIA 4BDKA 3A7JA 3EZRA 2A4LA 3AT3A 3A60A 3EOCA 4DHFA 3HV3A 4DFYA 5T68A 4ZLZA 5AUTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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