4FIFA

Catalytic domain of human pak4 with rpkplvdp peptide
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
294
structure length
293
Chain Sequence
PQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/peptide
source organism Homo sapiens
publication title Type II p21-activated kinases (PAKs) are regulated by an autoinhibitory pseudosubstrate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 4
total genus 93
structure length 293
sequence length 294
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fifA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fifA01
3FBVA 4FK3A 3ORIA 1H0VA 3ROCA 2PL0A 5GHVA 2OJIA 2QO9A 2VWYA 3VQUA 5J7BA 3RBWA 4IZ5A 4EK4A 5IUGA 4K33A 2X8EA 4IM2A 4UMTA 3EQCA 4DGLC 3FPQA 4EORA 3A2CA 2R3IA 2QHMA 3BZ3A 2YCRA 3D14A 4O1PA 3TJCA 2W1IA 1U5RA 2WMTA 4J98A 2I7QA 4OTGA 4YC6A 4RT7A 4O7ZA 4ZEGA 3DBCA 4F64A 4UMRA 2VNWA 3EIDA 3B8QA 3EN7A 3HDMA 4GVAA 4KA3A 4PP9A 4F1TA 5K5XA 1OPLA 4MD7E 4GW8A 4R1VA 4I6QA 4YTCA 4IX6A 4O7SA 1OI9A 4CSVA 4OAUC 4RPVA 3IDPA 2LAVA 3SXSA 3VBWA 5AADA 4DG0E 4CEGA 5CEPA 5KMKA 3ODYX 2WTCA 4FOBA 3CXWA 4DCAA 4JAIA 2J0KA 4QPAA 2H9VA 4EHEA 2WEIA 3LXLA 4GV1A 4MEDA 4BCKA 3R1QA 4ZS4A 1RQQA 4U8ZA 1STCE 1ZZLA 4WT6A 3VIDA 5C26A 5IUHA 4KKHA 3DDQA 1Y8GA 2O8YA 3HMOA 4RLLA 3KVWA 4BWPA 3ZSIA 4FSNA 3MFRA 4JNWA 5IQFA 1DS5A 4RA5A 4ERKA 2G2FA 4EZ7A 2YCQA 5HLWA 2JLDA 4N0SA 3R7EA 4NH1A 3ZOSA 5LJJA 1REKA 2C5XA 1O9UA 2R2PA 5EG3A 3KXHA 4AXAA 5L2QA 4DHFA 5EKNA 3SLSA 4YSJA 1MRVA 1PJKA 4EC8A 4HYUA 3PP0A 3QRJA 4AFEA 1I09A 1OPKA 4FG9A 4M8TA 4O86A 2J6MA 4IW0A 3EQGA 3HV3A 3OMVA 1XBBA 4RZVA 4PDPA 5GJFA 2QLUA 4O7NA 3TDVA 4CCBA 3ZHPC 4II5A 3KXXA 4F70A 4LQMA 3R30A 2BVAA 2C6MA 4FIIA 3AC3A 3PPKA 5DT0A 4CZYB 4G34A 1M2RA 3HL7A 3ULZA 4G9RA 4WNOA 1Q8WA 1R0EA 4DG2E 2HOGA 3NUSA 5LMBA 1PMUA 2W17A 5AA8A 2PE1A 4EJ7A 3AT3A 4HYSA 2VTNA 2YCSA 1APME 3N4VA 3P7AA 1DAYA 3NRMA 2X2LA 3OCSA 3QBNA 4NL0A 2OH4A 3PRFA 1UA2A 4GFOA 4I5CA 3BPRA 4M7IA 3UIXA 2VTLA 5HD7A 4BGQA 1OL1A 4I93A 4IWOA 3ZRMA 3ZO1A 4DGMA 4WD5A 1H1PA 4KB8A 4I22A 3ZFXA 1JKLA 3JXWA 4PMTA 2CCHA 4FV7A 4MXCA 4CV9A 2CLXA 2F7XE 3CR0A 3F3WA 4PRJA 4CVAA 3FXWA 3TTJA 3DXNA 3DZOA 4ZLYA 4EHZA 3C51A 3S2PA 3UQGA 4F0IA 4B9DA 3KN5A 4YZCA 5CY3A 3CTHA 3AD5A 3UVRA 2QOBA 4QMPA 5EM6A 3HMNA 3SW7A 4DLJA 1WMKA 2OJGA 2XNPA 5C03A 4MCVA 3TKIA 4L6QA 3NDMA 3C9WA 3DB8A 5AP4A 4IVDA 3PDTA 3FQEA 2QURA 4HNIA 2KTYA 1UKHA 2C0IA 1PF8A 4GU6A 2BROA 3A7IA 4ASEA 3SVVA 3QYZA 4MQ1A 3M1SA 3UGCA 3DK6A 5JFVA 1VR2A 2VX3A 5CZHA 2XB7A 5GIPE 2XYNA 4ENYA 4O0UA 3FZSA 4YPDA 4D4VA 3R9RA 3ZZWA 1NVRA 5KBRA 2IPXA 5E9EA 4EH7A 5IPJA 2PYWA 5M06A 3VRZA 5A6NA 2ZM3A 5JMSA 4RBLA 2QO7A 4XS2A 4BZOA 2WNTA 3ZLSA 2BR1A 2J0IA 3F6XA 4O6EA 3D94A 1M2PA 2R0UA 5AAEA 1M7NA 2ZJWA 4AGUA 3EQDA 5LXMA 4C2VA 2WU6A 1JOWB 4FIGA 3LMHA 4AFJA 4EEVA 1URWA 3DK3A 4QP7A 3RAIA 2JDTA 4BKJA 3BKBA 3NS9A 1SVGA 4CFWA 4CRSA 1JPAA 1O6LA 2IVUA 4D5HA 5AA9A 2B52A 4CT2A 4J52A 1U4DA 4QQCA 3BU3A 2XKFA 2VD5A 2OO8X 2R3RA 4CT1A 3EQRA 4FGRA 2XUUA 2WQMA 4GU9A 5IEVA 3TJDA 3O17A 4RVKA 4EWHA 3DAJA 2ERKA 2NPQA 2WEVA 3QGWA 5IDPA 4YNOA 3MVMA 1Z9XA 3ORXA 3R22A 4I5MA 1OITA 1UNHA 3ZCLA 5FTOA 1R1WA 2ZV8A 4CG9A 3R2YA 4ERWA 3C0HA 2BRHA 2ZV2A 3WF9A 1JBPE 4BI1A 3MIYA 4DN5A 3HA8A 2W4OA 4RMZA 4TKSA 4PTGA 3LPBA 4D9TA 1CMKE 3IQ7A 3MFTA 3C0GA 4KBKA 3V5TA 3VS1A 2QOIA 4YJVA 4RJ7A 4EOJA 4UWYA 1ZMVA 3Q3BA 4YZ9A 3F69A 5T3QA 4BTFA 2W99B 4DH5A 2OGVA 3ELJA 4IX5A 3HDNA 3WYYA 1FBNA 4DITA 3SDJA 4ZSAA 4WUNA 3OG7A 3TXOA 4IVAA 4V04A 3R9HA 4AW2A 2B9JA 3MB7A 5FEEA 1YOMA 3L9MA 2OFUA 3U4WA 3BE9A 2REIA 3F3TA 4QMOA 2IW9A 3EMGA 4U3ZA 5DYJA 2QQ7A 3CY2A 4NM0A 3G6HA 2W1CA 4I5HA 4L3JA 5AIRA 5BVWA 4GKIA 3PE2A 5EM5A 5IA2A 2XK3A 4FVRA 4QTCA 4YZNA 3Q04A 1W98A 3RAHA 2YIRA 2WTDA 4JRNA 3I4BA 1FMOE 4FZFB 4A9RA 3IS5A 5IA3A 3RM7A 3ZSHA 3PA3A 3VJOA 5AX9A 1PMEA 4HZRA 4JVGA 4YJPA 3EN6A 3JYAA 2YAKA 4QP1A 4L68A 5HE0A 4EK6A 4U44A 4ZY5A 5A6OA 3VBTA 4FI1A 3JPVA 4A7CA 5HX8A 4DEAA 3RK9A 3PUPA 4N6ZA 3W10A 3TT0A 2XBAA 3AC2A 3MI9A 1HOWA 4FKTA 3OOMA 4AW0A 4F7JA 2C69A 3QLFA 4FSMA 3FQSA 1YOJA 3QKKA 1R39A 4W8EA 5CI6A 5H8EA 5CEOA 3E8EA 1VYWA 4LG4A 4OT5A 5ETCA 4ZIMA 4CFXA 4E6CA 5AAFA 1WBTA 2B53A 3A7HA 2UZLA 3KRJA 2W5BA 4KIKB 4O2PA 5K4JA 2RKUA 3P86A 3H30A 1ZMUA 4XCUA 4B8LA 3E88A 4MX9A 4YMJA 4LRJA 4LUEA 1ERKA 2ZAZA 4FIFA 4RFMA 4CMTA 1AQ1A 1ZYSA 3IK3A 2CPKE 4CYJA 5IQEA 3PLAE 5EHLA 4G6OA 2CGXA 2JFLA 1O6KA 4QMUA 5M4UA 2BRBA 4BYIA 4TTHB 4S31A 1E1VA 3O23A 4OBOA 3FXZA 5CU0A 5LOHA 1LPUA 4ASZA 2XEYA 3EQFA 2QOHA 5DIAA 1PHKA 2W4KA 5DI1A 3QWJA 2I0YA 4FKUA 3II5A 4MF1A 2VWIA 5CSHA 4PMPA 3O7LB 2X0GA 5D12A 4ACDA 4O7RA 3GNIB 3I60A 5FTQA 4FL2A 4XHKB 5AP6A 1QPJA 3C4CA 1QMZA 2OZOA 3PXRA 4FODA 1KWPA 2HIWA 3KVXA 4S32A 3E7VA 3I6WA 3ANRA 3EOCA 2YCFA 3L8SA 5HE2A 4BCNA 1W84A 2YIQA 3JR1A 3PTGA 4RX8A 4B7TA 3D9VA 1M14A 4EH4A 2BFXA 4FKPA 4W9XA 2PSQA 3FAAA 4FTMA 4XEYA 3RPOA 5CYIA 3TZ7A 3V51A 3KULB 4YC8A 5EI8A 2WMVA 4BDIA 2YDKA 3TV7A 2LGCA 3K2LA 3BHHA 4BDBA 4FEVA 5JKGA 3GI3A 3MIAA 4LGGA 5HO8A 5JT2A 4JXFA 4RJ8A 2WPAA 3CCNA 4FG7A 2W9ZB 2XM9A 4O0SA 4E26A 4LV8A 4EOKA 2C3KA 2C30A 5CAQA 1J1BA 4DG3E 1ZOGA 2C6OA 5CF5A 5BNJA 3L9NA 2ZM4A 3KRWA 4BDAA 4G5JA 3UZPA 2CGWA 2YM8A 3QA0A 3R21A 4GCJA 4O2ZA 5E1SA 4IZYA 3AGMA 2AYPA 3OROA 4TYGA 5J5SA 5JGAA 2OLCA 2YM4A 4H1JA 5M51A 2YACA 4ZTMA 4X3FC 4Z7GA 4G1WA 2Y6OA 5D7AA 1FOTA 5EDRA 3Q9ZA 5CNOA 4QMLA 4CXAA 2YEXA 3QQJA 3Q5ZA 3GCUA 2ERZE 4IVBA 3FLNC 4MYGA 3WF6A 3ZFMA 3GU8A 3PWYA 2XJ1A 4BN1A 2XYUA 1SVHA 3ALOA 4NM7A 4YJNA 3K5UA 1PKGA 4U97A 3RAWA 4CFMA 3DQWA 4LOOA 5EH0A 3FI3A 2IG7A 3LQ3A 2ETKA 4ZZNA 4FKVA 1IA8A 2QNJA 3UOHA 3WE4A 1Q8ZA 4IB3A 4E4XA 3R01A 4AWIA 2GHGA 2CJMA 3DS6A 4BCPA 5KKRB 3Q4CA 1A9UA 4QO9A 5FEQA 3EQBA 4F6SA 1H28A 4JDKA 2SRCA 1R0PA 2I6LA 3FLYA 3Q32A 5GJDA 3T8OA 4IWDA 4BR3A 1IEPA 5GINE 5H3QA 3U55A 5AP2A 3ZC6A 4C3FA 4M3QA 3UG2A 5JGBA 4CD0A 1J7LA 2QD9A 4FR4A 5HG9A 3ZEWA 5E8UA 1MQ4A 2J50A 4EK3A 2WELA 4BBMA 5ITAA 4JIAA 5FM2A 4O22A 5K3YA 3UC3A 3RKBA 3VS6A 3UNZA 5KNJA 2VWVA 2PVJA 4JX3A 4MKCA 4ZXTA 4I6BA 2P4IA 2WTKB 4I92A 4ZAUA 2UW9A 4BB4A 5C8KA 5T6KA 4JR3A 3LXKA 4BGGA 4O1OA 2C6EA 3QZHA 4R7BA 2VRXA 3PE1A 3VRYA 5FP6A 3VWAA 2R7BA 3LJ0A 3V5LA 3GUBA 4EOLA 4YTFA 2XZSA 3EFJA 4XG4A 5FD2A 2YERA 1Q4LA 2WGJA 4I41A 2VUWA 4BDHA 2Y7JA 1QPDA 2W5AA 2EVAA 2BFYA 1PXPA 3QRIA 2HWPA 2QLQA 2UUEA 3BQCA 3R1NA 1KUTA 1L3RE 3OXTA 2J4ZA 3C1XA 2O64A 3AC1A 4GS6A 2WIPA 5HBJA 4AN2A 2FO0A 4MXAA 4FSYA 4OTRA 3WOWA 3EWHA 3FI2A 2ITYA 1HCLA 2XKDA 3QTZA 5K0KA 2WTJA 5A46A 3BYOA 3F88A 2YITA 1P2AA 5CQUA 1XH9A 4C37A 3D5WA 5HX6A 3NNXA 4EUTA 5L3AA 4RJ5A 4EH2A 3O50A 5M56A 3SXRA 5EHYA 1OIQA 1SZMA 4NKSA 4DC2A 1VEBA 3SAYA 2VX0A 3HNGA 3QWKA 3VS0A 3KRRA 2XK9A 4X2KA 4DEEA 3MFSA 4FVQA 4AP7A 5C1QB 1AD5A 1XH8A 3FMLA 3PJ8A 4MVFA 4IANA 4GMYA 4RC2A 4XUFA 4FIEA 2X4ZA 4D55A 2IN6A 5K0XA 1M52A 3HX4A 3QQGA 4X21A 3SRVB 3FLSA 4AGWA 4TPTA 1YI6A 3HMPA 5AV4A 3VS3A 4CTCA 4DH1A 4FT3A 2YZAA 5I0BA 2C5OA 2W96B 3EN9A 3WI6A 2OG8A 2W05A 3GU7A 4BZNA 3W2OA 5JQ8A 3FC1X 3UDBA 4E8AA 5KMIA 1TQIA 3G6GA 2R3LA 4XP2A 3UYTA 3F5PA 4I23A 3PG1A 4C38A 5LVOA 4TNBA 3TI1A 1JSTA 4F7SA 1XR1A 3CD3A 4L7SA 3ZDUA 3JVSA 3GCSA 3R8PA 2C0TA 3S95A 4PV0A 3RHKA 2VWXA 3F5XA 3A7GA 4QPSA 5AV1A 2OF2A 3R28A 5CF6A 3U6HA 5JRSA 4KIKA 4UYNA 1CKIA 4XMOA 2QO2A 5F20A 3THBA 2W7XA 2RFDA 4DTAA 5CEKA 4FMQA 5ETIA 1BMKA 3NEWA 4ARKA 1YI4A 1FMKA 1OGUA 3DJ7A 4UZDA 3FKLA 2F57A 4YGAA 1W82A 2OZAB 1WBVA 2CKEA 2FA2A 4DFNA 5CX9A 4USEA 3IONA 3D5UA 2UW7A 2FVDA 2J0JA 2Y0AA 3FL4A 3DTCA 4X0MA 3LM5A 3KMMA 2QU5A 4QYYA 2GS2A 3TNPC 2CN8A 4PP7A 3KK8A 5CENA 5GZ8A 4J96A 1Q8YA 2EB3A 4IJ9A 4BDCA 3CTQA 5EYCA 4KS7A 4AGCA 4MWIA 5C4LA 4QQ5A 3F66A 5M4IA 5AP1A 4E5AX 4IIRA 4ENXA 1IRKA 1XH4A 1LEWA 4WKQA 3G9NA 1P4FA 3NSZA 3HP5A 5CWZA 2ETMA 2GNHA 5DH3A 3CQUA 3HMMA 3UQCA 3K3IA 3OXZA 2QU6A 4MD8E 4MXYA 5JRQA 3PA4A 3O8PA 3NCZA 1H26A 3E63A 3ZSGA 3FHRA 2XA4A 3VUKA 3OS3A 3KULA 3LFDA 2HAKA 5D10A 2BRMA 2HW7A 3R8VA 2DWBA 3A8XA 4TWPA 4IM0A 1KV2A 3KF7A 5AEPA 5BVNA 4O7VA 2CCIA 5J87A 3ZBFA 5IH4A 2R3MA 2CNVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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