4FKLA

Crystal structure of the cdk2 in complex with thiazolylpyrimidine inhibitor
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
298
structure length
290
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the cdk2 in complex with thiazolylpyrimidine inhibitor
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 290
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fklA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fklA01
4PNIA 4BDGA 3E92A 1XR1A 3KXHA 4JR3A 4M15A 4R3RA 3ORXA 1WVYA 5IMXA 3FZTA 1FOTA 2O0UA 3NVMB 1TQIA 4QP6A 2Z2WA 4JG7A 4XLVA 2AUHA 1LEZA 2CN5A 2XMYA 5HCYA 3S00A 3ZFMA 5HE3A 3Q2JA 4DEEA 1H1PA 5TOZA 4G9RA 3L8VA 2G15A 4TYGA 4RFMA 3KKVA 4GK2A 3WYYA 5CSPA 1TKIA 2JDTA 3FC2A 4GFOA 4NT4A 5H8BA 4D1XA 4JQEA 4O7YA 4QYEA 5JQ8A 4WIHA 4J1RA 3DBDA 4XG3A 4EBVA 3NX8A 5FTOA 1AQ1A 3FKLA 4G3FA 1M2QA 1PXNA 2BRHA 3NW7A 4ENYA 3QGYA 4MTAA 4LGHA 2VD5A 3R7VA 3F3TA 2YCFA 3LXKA 4NKAA 1J91A 3FWQA 5ANIA 3GC7A 1QPCA 5DBXA 4BKZA 3M2WA 2QO7A 4FIHA 4EBWA 4AUAA 3OY3A 4A9TA 4KB8A 3GFEA 3QC4A 4QRCA 2FVDA 2B9FA 2R3HA 4KA3A 4JNWA 3R22A 4IFGA 5T3QA 4O0YA 3EMGA 2XKFA 4O7WA 4JRVA 3UVRA 3KXMA 3K3IA 2HWOA 2OIDA 4N70A 3OXZA 3BKBA 4OTHA 2WTKC 4OT5A 5DG5A 3TUDA 3QCSA 2QG7A 3R7YA 4Y5QA 3W33A 3R0TA 2QC6A 4DHFA 2H96A 4O0XA 3QTZA 4FTJA 3CJFA 5L2QA 1XBBA 2PHKA 3R8ZA 4I4EA 3EKNA 3OWJA 4G31A 3ENHA 2UZTA 4O86A 2VWZA 3DAEA 3H30A 2G2FA 3ORKA 4ZEGA 3ZFYA 1IA9A 1OGUA 3LAUA 3GB2A 4WA9A 2VTHA 4L8MA 3K2LA 3GCQA 3VUDA 5AAFA 2H34A 5CSWA 2WNTA 2A2AA 3FYKX 5FD2A 2XJ1A 2W06A 2YEXA 2YM6A 4LGGA 3ZUVA 3E3BX 3SDJA 4AE6A 5JMSA 4J52A 3QQJA 4ZZOA 2W5AA 3DNDA 3LM0A 2QCSA 2OG8A 1W0XC 4ZSEA 4EYMA 2OH4A 3JVRA 3TI1A 3DBQA 4JL9A 5BYYA 2OKRA 2X7GA 3LFBA 4FNXA 2ITYA 4CLIA 4F70A 4ZAUA 5E91A 5AM6A 2YM5A 2FUMA 5EFQA 5FXSA 3W2SA 2E9PA 2HWPA 1UNLA 4MXAA 3LFDA 1FPUA 3NUNA 5L3AA 4PDYA 4YUQA 2W7XA 5J9ZA 4QMZA 4ACCA 1REKA 3R1YA 1XKKA 3ACJA 3DXNA 1NW1A 2JD5A 4CYJA 5DVRA 2RFSA 3KL8A 3QRIA 3QZGA 3FEGA 5AP5A 4TXCA 4HVDA 2I6LA 1YDRE 4U80A 4CT1A 5JFWA 3P78A 2PE2A 1PYEA 4A9SA 4IAKA 1EH4A 3MESA 2W5BA 4I24A 4Y73A 2GNGA 2W5HA 2XCKA 3TTIA 3A7GA 4JIKA 3DGKA 3L8PA 4RLLA 4R5SA 3UOKA 2GFSA 4FZFB 4TN6A 4D4SA 3UZTA 2PVLA 3SVVA 4JJRA 4CTBA 4O0SA 3VS0A 1SVEA 4E7WA 2CKPA 2F2CB 2WMQA 2YERA 3SOAA 4BCNA 1K3AA 3LKMA 1JSTA 5K0XA 4UZDA 4RX9A 4Z9LA 2UVZA 3KK9A 3Q52A 1YOMA 4TL0A 1XJDA 3F3UA 4DFYA 2VN9A 4FE2A 1VEBA 2UW9A 5E8XA 4ZTSA 4O7TA 5M51A 4I0TA 2EB3A 4OTRA 5A14A 3AMAA 3F69A 2E9VA 4OTPA 4IBMA 3VBVA 2XK9A 3MWUA 5LVPA 4GYIA 3D94A 3TNHA 2B1PA 3NW6A 2QKRA 3Q4UA 4YR8A 3EQHA 1OL2A 4PDOA 4K2RA 1P14A 3C4EA 1B39A 4L44A 5ETIA 4O83A 1LP4A 4CV9A 5HTBA 3NAXA 4JOAA 4QYFA 3TNIA 3FZPA 4TNDA 4G9CA 5EM6A 2VO6A 4TNBA 2UW8A 5FEQA 2R3OA 4LUEA 4S30A 2YZLA 2CNVA 1XH7A 4ITJA 3SRVA 4CV8A 5FM3A 3ZMMA 3SV0A 4ZTNA 3UNJA 3NYOA 4ENXA 3AD4A 3WF6A 4X2FA 2ZVAA 3UIUA 4XNEA 3WILA 4DTKA 4EOJA 4OAUC 3UOHA 4I6FA 3UO6A 3OEZA 1PW2A 4NCTA 4LUDA 4B4LA 2XP2A 4J97A 3LLTA 1OIQA 1PHKA 3QWJA 3AGLA 3OMVA 3F7ZA 3AT4A 2R3KA 3C5UA 3VIDA 2UZLA 3WBLA 3D5VA 2UV2A 4FTLA 5FM2A 4YZMA 4FKPA 4EH7A 4BCMA 3I6WA 4RIXB 5K3YA 5F20A 3MH1A 4YJVA 3MY5A 4JT3A 4NJDA 1YDSE 3NNXA 4GH2A 4R5YA 4FEXA 3TL8A 5L2WA 4LYNA 3K5UA 5DNRA 5GJGA 3FMHA 3ZM4A 2WMRA 3GCVA 5HLNA 4BCGA 1M2PA 3I6UA 3QQKA 3A7FA 3QTXA 5A4LA 1PMVA 4DINA 3V8SA 4XBUA 4MK0A 4LL5A 4TW9A 5AP6A 4CRLA 5IQIA 1PXMA 4BDEA 4CG9A 3WZUA 3A8XA 4FYOA 4GT3A 3FMJA 3GI3A 3N4UA 4CTCA 3FHRA 4QTAA 1PXLA 3EYHA 1SVGA 3PVGA 4E5AX 3W2CA 1ZOEA 5B2LA 1P4FA 4L42A 1OPKA 4JQ7A 2IW8A 1CKPA 3IO7A 5HQ0A 4L9IA 2BRMA 3KXNA 4RA5A 4ZJJA 2FSTX 2GS2A 2SRCA 2H9VA 1M17A 4CKRA 3R7EA 3CD3A 2BZHB 2NP8A 3A4OX 4F6UA 3Q4TA 3W8QA 5E4HA 2JIIA 4OUCA 4A9RA 3F2NA 1OIYA 3DZQA 5BVDA 2I7QA 1BMKA 5AUTA 5CI6A 3ZTXA 2X81A 3PE1A 1B38A 1PXKA 2WMAA 4FZ7A 2J5FA 2XJ0A 1BL6A 4YBJA 4O7RA 1FINA 4FZDB 4XG6A 3FLSA 1U5RA 4FEWA 1ZYSA 3W18A 4AZEA 2BZIB 5F95A 1KV1A 2DWBA 4BR3A 4I5MA 5BMMA 2C5OA 3PZHA 3GC9A 4F4PA 4QMQA 5F9EA 4MBLA 3KXGA 4X3FB 4FK3A 5GIOE 3BE9A 4QMXA 1H1QA 3ZLXA 1CKIA 3DK3A 5EG3A 3VS5A 3W55A 3VS7A 3KMUA 3C51A 4LV5A 1DS5A 4AN2A 4AU8A 5BUEA 2GU8A 1VYZA 1UWHA 4PPCA 5F94A 4HPUE 2Y9QA 3OCGA 3OW3A 3NNVA 4EOOA 4ZY5A 3D4QA 3EQRA 3NCZA 3LJ2A 3NR9A 3R28A 4OTDA 4C4FA 1F5QA 2YIWA 3KVXA 2YAKA 4EOPA 4GSBA 4DTBA 3VUMA 4M7IA 1UU9A 3UO4A 3W2PA 3BYOA 3H4JA 2C6OA 3QBNA 3E8EA 2C4GA 4N6ZA 4WKQA 3ZC6A 4AFEA 4C4JA 5DA3A 4EOLA 3OOGA 4QP2A 5DT0A 4OTWA 3CKWA 4WNOA 4IM3A 4M13A 1PXOA 3I5NA 5IH5A 3G0EA 5C27A 3GVUA 3BPRA 4LQMA 3GOPA 4JBPA 2IVSA 4G3EA 5DWRA 4O7ZA 2DYLA 1F3MC 3P79A 4AOIA 4HOKA 5AX9A 3TJCA 4YPDA 2JKQA 3H9OA 2X6EA 4X3JA 3NUYA 2Y6MA 3FI3A 1YOLA 5FUTA 2JKMA 5DHJA 5E1SA 4DYMA 5JSMA 4O7SA 4XG7A 3TDVA 2CLQA 3L8XA 3PJ1A 3PA5A 1H07A 3DA6A 3U55A 4HJOA 2R4BA 4IVBA 1KOAA 2QOKA 4C4EA 1JSUA 3C50A 1PJKA 3Q53A 4G6OA 2ONLC 3CKXA 5HLWA 4RGJA 3O0GA 4PTEA 5HG8A 3ETAA 3LQ3A 3RPOA 2OXDA 3ZO1A 2HK5A 5AAGA 5EHOA 2VTQA 3RHKA 2CLXA 1RQQA 2A27A 3Q5IA 2QLQA 3V5LA 3Q4ZA 4RIYB 2QOHA 5IG1A 4CMTA 3FI8A 4O0UA 3QWKA 3FPQA 4MAOA 2VTJA 5KZIA 3DK7A 3KMWA 2W1IA 3FLYA 3ODYX 2BTRA 3Q9WA 4PNKA 5A9UA 2WMSA 2B53A 3TEIA 5D7AA 5DLSA 3UTOA 3JPVA 3R8MA 4O6LA 4K18A 3ANQA 2WHBA 4GU6A 3O8UA 4ZP5A 2OF4A 5DRBA 1R78A 4IB5A 3RK7A 3TIYA 4BCHA 4FKOA 4D2RA 5A4TA 5CVHA 3U51A 4DF3A 2C3IB 4J99A 2XNMA 1JNKA 3LXNA 5HVYA 3UYSA 2OI4X 5CSHA 3HUBA 4IWPA 2JFMA 2NRUA 2X2LA 3GQLA 4M68A 2H8HA 4NFNA 3ZBFA 4EUTA 4CKJA 3U4UA 1MUOA 5DN3A 4BGHA 1Q3DA 3QU0A 5BMSA 4QO9A 4KBCA 5I9XA 2C69A 5JZJA 5GZ9A 1PXJA 4KAOA 1NVSA 3LFNA 2WU6A 2C0IA 5HU3A 3EH9A 3TV7A 3ZEPA 3KRRA 5LMAA 4AZWA 1MP8A 3OW4A 3ALNA 3QUEA 1XO2B 2XK3A 1WBWA 2P3GX 3EZRA 4L7FA 4LRMA 3KMMA 3VUIA 4BL1A 3CEKA 2KTYA 2VNWA 3LCKA 3PP0A 4D2SA 3T9IA 5EYMA 3PXRA 4MNEA 3W10A 4F63A 4R7BA 3E8DA 3LFEA 3A7JA 1G8AA 3QUDA 3P5KA 1ZY5A 2WIPA 2ZAZA 2OJGA 5HZNA 2GMXA 1R0EA 4XYFA 4WG3A 3TWJA 3UGCA 4C2VA 1J7LA 4BCQA 4G3CA 4YPSA 4NFMA 2UZEA 4TY1A 4FTMA 4F9AA 2XJ2A 1OBGA 3E7VA 4JX3A 5FDXA 5D9HA 4FV4A 1UU7A 4AF3A 3OTVA 3ZUTA 2W1HA 5CY3A 1Q8YA 5C9CA 5EM5A 4CZTA 2ZOQA 3FZOA 4KIKA 2AYPA 2C30A 3VS2A 5EQEA 5CVGA 2JFLA 3QQLA 4U44A 3KVWA 4JBOA 2IVUA 4FOBA 2ZYBA 3PVWA 3NCGA 4EOKA 5IH6A 3CD8A 4RZVA 4FF8A 3WZJA 4BF2A 4F7JA 1VJYA 1ZYLA 1BI7A 3MI9A 3RBWA 3RPVA 3BHUA 4J71A 4FTRA 3W1FA 4Q9ZA 4CVAA 3QD0A 1O6KA 2OO8X 3A99A 4GS6A 2UW6A 2E9UA 4HYUA 4PTCA 5JGBA 2ITOA 3HVCA 4DFUA 3ZRMA 5FDPA 5KNJA 5EDRA 3R30A 4ZIMA 5CASA 4FEQA 4MNFA 3FQHA 5AP4A 4EK4A 4XV1A 1GAGA 1P5EA 3RJCA 5KMMA 4YC6A 3WF8A 2OJFE 3ITZA 2JAMA 4XG4A 3JXWA 4D9TA 4ERKA 5K9IA 2HY81 5AV0A 3S1HA 4AW5A 4UX9A 2HCKA 4WBBB 2VX0A 3GFWA 3ZC5A 4EHGA 1OBDA 2UZOA 1E1VA 4ANQA 4DEHA 1OPJA 5E8TA 1S9IA 1H01A 3DBFA 5GJFA 4RSSA 2XH5A 5I3RA 5IEVA 2R3LA 4APPA 2YITA 3WE4A 4D0XA 4NH1A 3M1SA 4YLKA 2WQOA 4RG0A 4MBIA 2ITNA 5H8EA 2VO7A 4DH8A 4M67A 5AUUA 3SAYA 4XV3A 4C0TA 2BRGA 1XQZA 4JRNA 4DT8A 2JEDA 4II5A 4LOOA 4MD7E 5DEWA 3VUKA 4EOSA 1H27A 1WBPA 4FTUA 1SZMA 5T68A 2PZYA 3PXZA 1APME 5AIRA 3PA3A 3QCQA 2WTJA 5BYZA 1JBPE 1SNUA 3I0OA 1K2PA 3H10A 4BCIA 4YJNA 2WTWA 3ORTA 5EYDA 4U81A 3EN5A 3ODZX 2FA2A 4BDAA 3TG1A 3N4VA 4HVHA 2BRBA 5HG7A 3OXTA 2X4ZA 2BDJA 5HNBA 1ATPE 5IQDA 3PXYA 5IA0A 3QZIA 4IZAA 3HUCA 5A54A 3QYZA 3MVJA 1IASA 2A1AB 5CNNA 1SMHA 4XP2A 2B7AA 2JBOA 2P33A 4YC3A 5CU2A 5EDPA 4ASXA 3C0GA 4FV7A 4IC8A 5J87A 3VHKA 5L2TA 1NT2A 3RM6A 2PWLA 2VTOA 3PUPA 3HV6A 4BFMA 4BCPA 1IG1A 1WBOA 3DFAA 3MA3A 5AP3A 2JGZA 3AT2A 3E8NA 2PZRA 3ROYA 4NEUA 4FKVA 2VWBA 5AWMA 4RBLA 5JFVA 3U87A 2PVYA 1UNHA 3V8TA 1V0PA 5HD7A 3VUGA 2XIXA 2UUEA 4F1OA 3S0OA 3D7ZA 4FV9A 4XUFA 4IAAA 3I4BA 5C8NA 4O81A 3B8QA 3VRYA 2WZJA 3QA0A 4KWPA 4E4NA 2C6LA 3O8PA 5M55A 3M42A 3THBA 3EN6A 3CSVA 3NLBA 3O7LD 2HYYA 4P5ZA 2PUIA 2QHMA 4WHZA 3F88A 5J8IA 3FY2A 4D9UA 3NW5A 3EIDA 4Y85A 4CGAA 3LHJA 3VQHA 2XK4A 1U54B 1QPEA 3E7OA 4RMZA 3LFSA 4ACDA 4DCEA 4EK8A 3EFLA 4CXAA 5IDNA 4KD1A 4U3YA 1G8SA 4FG7A 2W17A 4GT4A 4QTBA 2CGUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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