4FNXA

Crystal structure of the apo r1275q anaplastic lymphoma kinase catalytic domain
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
312
structure length
292
Chain Sequence
NPNYSFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLEVYEGQVSPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMAQDIYCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The R1275Q Neuroblastoma Mutant and Certain ATP-competitive Inhibitors Stabilize Alternative Activation Loop Conformations of Anaplastic Lymphoma Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 292
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fnxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fnxA01
2CCHA 2FSMX 2X81A 3ZO4A 3R8PA 4YGAA 3ZTXA 3QCXA 3AXWA 3MFRA 4ALUA 1Q8WA 2C69A 1WBTA 3CY3A 4X3JA 3A4OX 5BVWA 4Z16A 4J99A 3TZ9A 4ZSAA 2R3MA 4MBIA 2YCQA 3JVRA 2LGCA 3PP0A 4GMYA 4FNZA 4L44A 1FVTA 2CMWA 3NRMA 3PJ8A 3R71A 4LI5A 1O6YA 3UTOA 2GS6A 3QLGA 5HX6A 4L00A 1OKWA 4BI0A 3QXOA 4FIFA 3P1AA 1ZARA 3COMA 5DN3A 2V55A 3PJ2A 3SW4A 3PY1A 3A7FA 3UDBA 4G1WA 4NJDA 5HD4A 3FLQA 4FKPA 2ITQA 2E9OA 4DBNA 5CAOA 5EG3A 2WMRA 5M56A 4BL1A 4DHFA 5FLFA 5CAUA 1H25A 4NCTC 2VTRA 5FTQA 4Q9SA 3T3VA 5IH5A 1UU3A 3SAYA 5AAFA 2XIRA 5HNBA 3ZDUA 4MEDA 3PA4A 3TKUA 4D2TA 2YAAA 1TKIA 5J79A 1YDTE 5IMEA 3LCTA 4RLKA 3ACKA 2PMOX 4ZIMA 4MNFA 4A06A 4QNYA 4AGCA 5EK7A 5C26A 3HV5A 1UKHA 2A4LA 1ND4A 3EH9A 4JL9A 4HNFA 1OKYA 3UGCA 4F9BA 4ANLA 4D0XA 4DFLA 2O5KA 4EKLA 5F1ZA 3NEWA 4BWPA 4ZTLA 5E8ZA 2XA4A 2B54A 4G34A 4AS0A 2YIRA 2BIYA 3Q9YA 5CEPA 2FSOX 4RWIA 3PSBA 3COKA 2UZNA 2PL0A 4YUQA 3E8DA 5A4TA 3PVWA 2V22A 4OTDA 3WIGA 1U54B 3QYZA 5DRBA 3AQVA 3L9LA 4XCUA 1H8FA 2WQOA 4D2SA 2ITNA 4I5CA 4Y73A 1JAMA 4E5BA 3VUIA 2XIYA 2W5HA 4JQ7A 4ZJVA 3VIDA 5DT3A 2ITZA 4FSYA 3UQGA 4BTJA 3PG1A 4FKRA 4C59A 1Q61A 5AP2A 3PDTA 3GCUA 3KXZA 4C37A 2IZUA 3FWQA 2HZIA 3KF7A 4KKHA 3U9NA 3P5KA 2OH4A 4YR8A 4BBMA 4EZ5A 2OIQA 3OCSA 4EH3A 3FZTA 2BAJA 4FGBA 1XR1A 4YO6A 2RL5A 4QMXA 4M7IA 5A4EA 3Q5IA 3VUGA 1ZZ2A 2XNBA 3IK3A 5EW8A 3F2RA 3DBFA 5CAVA 5FTGA 1S9IA 4KBCA 2NPQA 4IIRA 5C8MA 2BRNA 3NAXA 4JR3A 3A60A 3DJ7A 2WPAA 5CT0A 4YJQA 2X9FA 3F3VA 4KIQA 4UMUA 1GOLA 5DRDA 4KINA 4BWXA 3RCDA 5CU3A 2UVYA 5LQFA 5AFVA 3EQIA 4ACHA 5LCJA 5CF4A 2VO0A 4FV2A 3SHEA 3ZDIA 5JFXA 4ZY4A 1R3CA 1SNXA 4X3FC 2ZVAA 2WO6A 3A62A 3ZLWA 2WQEA 3W10A 2WOUA 2R3OA 3N4VA 3QRTA 2ITUA 3W2CA 3MA3A 3ATTA 2J7TA 3WOWA 3DKOA 4EHGA 3I6WA 3GFWA 3ZFMA 4QP3A 4OR5A 2XIXA 5HO7A 5HG8A 1XBCA 4MBLA 3EQGA 4L3PA 3RPSA 3FL5A 3V8SA 4AZFA 3DFCB 2GQGA 3C4XA 5D41A 2RFNA 4K1BA 2CKEA 3QRJA 4W4VA 5AEPA 4QMYA 5KZIA 4HZRA 1MRUA 5IQAA 2R0UA 4EI4A 4HZSA 1GIHA 4DLIA 4I0TA 5EI6A 1Q4LA 2CJMA 5KX8A 4KSPA 4GJ3A 3SOAA 4EOQA 4G3CA 5JT2A 1PF8A 3F69A 4IHPA 4NCTA 2R3RA 2DS1A 5HG7A 4UYNA 2C6EA 4TXCA 1WAKA 2X6EA 1JBPE 3FLWA 2VTNA 5I3RA 4YJRA 3AD6A 3WF8A 4BDIA 5CU4A 5KKRC 1NA7A 4CKRA 2BZHB 5LXMA 4IC8A 2JAMA 1BX6A 2WEIA 5HTIA 1TQIA 2HELA 1ZY5A 3FLYA 5BYZA 3V5PA 1A48A 4CVAA 5IQDA 2XYUA 3ZHPC 4R3PA 4ZP5A 3TNWA 2C3IB 4MXZA 4ZTRA 5AADA 2WXVA 3R83A 3R8LA 2GTNA 4RVMA 3HV3A 3QKMA 5CXZA 1M2QA 4XG4A 2C3JA 1H24A 2Q83A 4DH7A 3K2LA 2I0YA 4AA5A 2BCJA 3DLZA 4C2WA 4BTKA 4S30A 3ULZA 3UVQA 3QL8A 3MY1A 4IB1A 4F0FA 4IC7A 4YHFA 4GFMA 4FKWA 2G2IA 3PPKA 3R8MA 4A9SA 4FSRA 5CF6A 1PXJA 4JX3A 4JOAA 3HRBA 2PVFA 3NS9A 3CTJA 2C5XA 2BZIB 3C5UA 1U59A 3SX9A 4DH8A 5IF1A 4GT5A 4KIOA 3EB0A 5AV3A 2C6IA 3QC4A 5C1QB 4M69B 5EYKA 4Q5HA 5KUPA 4L01A 4E6QA 4OTIA 5CSVA 3ZOSA 5EQPA 3GCVA 4G17A 1TVOA 5AR5A 2QKRA 5IA5A 4CYIA 4DEBA 4R77A 2X39A 2YLFA 1P2AA 4RT7A 3ZH8A 3POZA 4IAKA 3Q9XA 4NKSA 4XV1A 3QC9A 3QTWA 3LXLA 4YZNA 5HHWA 2XVDA 4BCKA 5CVFA 3F7WA 1H1WA 3D5XA 2F7EE 2J6MA 4APCA 5GHVA 2W4KA 4JT3A 1Y8GA 2VU3A 2JITA 2VAGA 1QPCA 3G51A 2RKUA 3AT3A 2UW8A 3UIMA 2XH5A 4KABA 4AW0A 4I94A 1JSTA 2IW6A 5E8XA 3NGAA 3RKBA 2VNYA 4YNOA 5JQ8A 5ETIA 4O0WA 4RJ4A 3KF4A 3V8TA 5EOLA 4LG4A 3F3UA 1SZMA 3NUAA 4RFMA 5CEQA 4EZ7A 2PVMA 5FBOA 4HVHA 4RVLA 3IW4A 3A8WA 3OROA 4LRMA 2PUPA 3L9PA 3AGLA 3QCYA 2E9PA 5CVHA 4FT3A 5CXHA 3PY3A 2ZDTA 2QO9A 3VW8A 2B9JA 3EZVA 1WBNA 3BE2A 2UW0A 4QTDA 4CZYB 4D1SA 5AA8A 3LZBA 2F2CB 4JDHA 2FGIA 3V5QA 3W55A 3O51A 3UOKA 4G3DA 2VWUA 2BVAA 2X9EA 3CGFA 3FQHA 2GHMA 3VF9A 3AGMA 4MVFA 3VQHA 2UZWE 4RJ6A 4AZSA 5ICPA 3ZXZA 3EN5A 4LFIA 4AXAA 3F2NA 4KSQA 4BIEA 3IW5A 3TI1A 1VYZA 3QKLA 3AG9A 2WQMA 4D5HA 3AC2A 3R04A 3EQHA 2BDFA 3PXQA 4MXCA 5KE0A 2QHNA 5HE0A 2PTKA 4DT9A 3BHTA 4K6ZA 4QP9A 1WBSA 3AMBA 5E8VA 5IEYA 1P4FA 4O7TA 4E4XA 2XRWA 5FP6A 4K9YA 3SG9A 3BBWA 3M1SA 4QQJA 2XNMA 1V1KA 3OWLA 3QZFA 4BDEA 1SVGA 4L53A 4N0SA 4AWIA 3FMKA 4E6DA 1E1XA 2VWWA 5J9LA 4FTAA 4BY9E 3QLFA 3VRZA 2EWAA 2XNNA 4F1OA 4E7WA 5L6WL 2QVSE 1OKVA 2X2LA 4XRJA 4ZJJA 3FC1X 3O23A 4IZ5A 4AQCA 4OTPA 3RCJA 4YTIA 4BZDA 3HRCA 3Q60A 4GVJA 4KBAA 4F9YA 4KBKA 4FEXA 4I92A 3KK9A 2XS0A 5ETCA 1GNGA 3BRBA 4G5JA 2YM5A 4K0YA 5HE1A 4C0TA 4BC6A 2YIWA 4ZJIA 3GQIA 3DBCA 5CNOA 4KRDA 5BVKA 1F5QA 5CTPA 2QO7A 4ZTSA 4HYSA 2QR7A 3ENHA 1R0EA 3PSDA 4D2PA 3HDNA 3PXZA 5H9BA 2NP8A 3FKOA 3QYWA 2XK8A 5DMZA 3IDCA 5JFWA 3PJ3A 3OOGA 3B8RA 3C0GA 4IB0A 2C0IA 5J9ZA 4M15A 4APPA 5D11A 3ORXA 4L6QA 2W17A 3R7GA 4CFXA 4DH5A 3LQ3A 2XF0A 3LFFA 2W99B 4NFMA 5CU0A 5HX8A 3NNWA 2V5QA 2GNJA 2BPMA 2YZAA 5AR8A 4XYFA 3L9NA 4OUCA 1Q3WA 2WMUA 4NT4A 5E1EA 4EYMA 4AW2A 3NZ0A 3U4WA 1NY3A 1BYGA 3EQFA 1HCLA 2JIUA 3IO7A 3VBYA 4IWQA 2WMBA 5IQEA 4QMUA 4FSMA 3GP0A 4LV5A 5DT4A 3ZM4A 4EOLA 5I9XA 4FSUA 3COHA 4B9DA 4GV1A 1FQ1B 3JUHA 2GNFA 4XH6A 4X0MA 2FB8A 2JGZA 4O6EA 5BVOA 4DEAA 3OTUA 3OZ6A 4ENXA 4Q2AA 3UOHA 2JDOA 4DEDA 1WZYA 4AGDA 5IMXA 5L8KA 1YHVA 3PIZA 4YZDA 4WG5A 4BHZA 3KQ7A 1W98A 4PPCA 1URWA 2EXMA 1LP4A 3ZSHA 3NX8A 2F9GA 4AFEA 3ODZX 2W9FB 3UJGA 3IS5A 5KBRA 5A4QA 4FIIA 4EKKA 2HWPA 3EFLA 2BAKA 3ZLSA 3HL7A 2JLDA 2WAJA 3N9XA 4RA5A 4BKZA 4PL5A 4QP6A 3WILA 4V05A 2YWVA 4L9IA 3NCZA 3ROYA 3GBZA 3DCVA 4FV3A 1NVRA 3HMNA 5K9IA 3ZU7A 4C58A 4PMTA 3Q4TA 4TYHB 2PULA 2E9VA 4FV6A 5TKDA 1S9JA 2YITA 4PDSA 3PVUA 1Q62A 2Y4PA 3T9TA 1GJOA 2VUWA 4F99A 1KWPA 4OAVB 3GC9A 3TZMA 5EI8A 4PTEA 1W0XC 4WO5A 5EHLA 1OMWA 4TN6A 4EL9A 3NAYA 3H4JA 2CGVA 2Y6MA 5F4NA 5ANJA 3NIZA 4AW5A 4ZTMA 4O0TA 3OBGA 1A9UA 2B9HA 3MWUA 3OCBA 2GNLA 5A6NA 2DQ7X 3VWAA 4D2RA 1YXXA 5EW9A 4K33A 1OPJA 3C5IA 1KE6A 3NLBA 2JFLA 3FI4A 4X2KA 4HVDA 4EOSA 5AX3A 4FIEA 4DEEA 3A7JA 1Z57A 1H1SA 5FWKK 3LCKA 1CM8A 5C8KA 3DZOA 4EK8A 4E26A 5FXQA 2BRHA 4OT5A 4I6BA 4NKAA 2WMVA 4Y5QA 4R5SA 3TXOA 5GZ9A 4ARKA 1U5QA 5HU3A 1A06A 4Z7HA 3RINA 1Q8YA 2I40A 1AD5A 3UIBA 3ID6C 4ZMFA 1O6LA 4AT4A 2R3KA 2GMXA 4RZWA 2Q0NA 5E8YA 3LFQA 3DDPA 2Y0AA 3RHKA 5AIKA 4NSTA 4ACMA 3S00A 1VEBA 4FKJA 4XV2A 5AR4A 3FMJA 1RE8A 3MIYA 1ZZLA 4F70A 3CCNA 5LOHA 4W4XA 5HTBA 2WQNA 1REKA 2HOGA 4X21A 5AWMA 5E4HA 3RTPA 2OGVA 5HIEA 1STCE 4PL4A 4YJTA 1OITA 2ITWA 3JXWA 1OL6A 5IUHA 1M17A 3MTFA 3BQRA 3PFQA 3U51A 1YI6A 5CZHA 4AAAA 4DFZE 3FEGA 4NYEA 2VO6A 4O21A 2ITOA 3R00A 4AG8A 3LHJA 4F09A 3NR9A 2OWBA 1PXNA 4JDKA 3MH0A 4C3FA 3KRLA 4GK3A 4J71A 3VVHA 3RNIA 4TYIA 3DXNA 4ASEA 4ORKA 4GG5A 4CYJA 2HY0A 4AU8A 3Q5ZA 4XV9A 2PVYA 2FA2A 3VS4A 2R5TA 5K0XA 5IU2A 4Y95A 5DG5A 2B55A 3QQUA 5EQYA 1IA8A 1YXSA 3R30A 4BVUA 4DCEA 5A9UA 3F9NA 1V0PA 3CQEA 2BHHA 3FKNA 4QMLA 4MTAA 4C3RA 3V01A 4BDHA 2JDRA 4I5MA 4GKIA 3RAWA 2E2BA 2BUJA 3V8WA 3OHTA 5KCVA 1U54A 3F88A 3KCKA 5ANKA 4BIDA 1LPUA 4FIJA 2EB3A 4EOPA 2JDVA 4QQ5A 3AC3A 4J1RA 3TUBA 1U4DA 5L2IA 4JBPA 5AP5A 5GJFA 3Q4CA 3RJCA 4WNMA 2WMXA 3QD4A 2FSLX 2R3LA 5IA3A 1BI8A 3UVRA 4CCBA 5KMMA 1FGIA 4CQGA 4PUZA 4L7FA 4RWJA 5B2MA 2SRCA 3LCOA 1P14A 2ESMA 5AUWA 5LVOA 2X8IA 3GB2A 4Z3VA 2GS2A 1QL6A 3OVVA 3DOGA 5HIDA 2FYSA 3AT2A 4D2VA 5AIRA 1OVEA 3H9RA 4FTLA 5IDPA 2VTQA 4IVBA 4MXAA 2BALA 2WELA 3TACA 5IQGA 4YP8A 3GXLA 3VAPA 4XOYA 4W8DA 1DI9A 2G2HA 2W06A 3FZPA 3NYVA 2ONLA 5J87A 5AV4A 4IJPA 3SXFA 4ZAUA 4GW8A 1ZYJA 3G9NA 1HOWA 3BPRA 4UWBA 5ETAA 3THBA 4FT7A 5EDRA 4AT5A 4AFJA 1PYEA 3NYXA 3ZC5A 3BWFA 4ZK5A 4FICA 4IADA 4ACGA 4B6LA 4RWLA 2C6DA 5KHXA 4QP8A 3MA6A 5M53A 2ZOQA 1PYXA 3CBLA 4R3RA 3TL8A 5AA9A 3SGCA 1I09A 3FI2A 1Q3DA 3OUNB 3S95A 5FDXA 4GUEA 4GUBA 4KAOA 3B2WA 2RG5A 3F61A 4RX5A 1W84A 5HNIX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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