4FSNA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
270
Chain Sequence
APFVEDWDLVQTLGEGAGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 270
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fsnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fsnA01
3TIZA 4YSJA 4QTCA 3EN4A 1VJYA 3RJCA 4IX3A 4RVTA 2UZUE 3VBQA 1REKA 2J50A 2VN9A 3OY3A 4H1JA 4PL4A 4ENYA 4RC2A 3QX4A 4YLKA 2W05A 2PL0A 2VD5A 3OZ6A 4PV0A 4BCMA 3TV7A 2Y9QA 2PVKA 4YHTA 4F9AA 4GU6A 5HIDA 3E7OA 5JT2A 3ANQA 2VTLA 4YJPA 2B9IA 5L3AA 3DBEA 4G16A 4KIKA 4J97A 4FVQA 2XIZA 4W4YA 2OSCA 4QTDA 4PDPA 3R21A 4GMYA 1NVRA 5DLSA 4W9WA 3OTVA 3ITZA 1XBCA 3VJNA 5CANA 3VUHA 3HKOA 2HXLA 2ZM4A 1WBVA 3NIZA 4GW8A 2A2AA 4ZTNA 4EJ7A 2O8YA 4GUEA 5CNOA 4NM3A 3E64A 2J0MB 2Q83A 2AYPA 4O91A 1MUOA 5IQGA 2XK8A 1M2RA 4U79A 4ZP5A 4QPSA 4APPA 4LGDA 3NNWA 2GNIA 5CSHA 4MF0A 4H36A 3SQQA 5D12A 4UYAA 3TEIA 4EUTA 5IPJA 4CMUA 5HNIX 4BTKA 2ONLA 2QR7A 2PY3A 1U5QA 5CF8A 2R3JA 4JAJA 5FXSA 1ND4A 3KKVA 2VWXA 3V8SA 2ZV7A 4IDTA 4FEQA 2W1GA 4Z7GA 2JDOA 3VJOA 5HORA 4FZ6A 3NW7A 2Z02A 3ZRLA 5K0XA 4ZTLA 3GCVA 1WBTA 2WTIA 2YAAA 4E6QA 1Y8YA 4XMOA 4GKIA 3EFWA 1JQHA 1Q8YA 1QPEA 2BRHA 2CNVA 1GY3A 1XH6A 1ZZLA 1FVVA 3BGQA 3LLTA 3PIXA 2ZV9A 3UGCA 3V5TA 3EN9A 3QC4A 1JKTA 3M1SA 1PXJA 3MVMA 3OCGA 2BRMA 3R1NA 4ZSJA 1S9IA 3K54A 4NT4A 3VQUA 4QTEA 3DFAA 1WBOA 3BZ3A 3PVWA 2BZJA 2V5QA 5FM2A 2R3KA 2J9MA 1GIIA 4BICA 4BGHA 5DIAA 2FA2A 2RSVA 4RIXA 3ACJA 4EK8A 4FKGA 3HRCA 4CRLA 4C4FA 3HNGA 3PY1A 2BHHA 4E93A 5DPVA 4CCBA 5EG3A 1TQMA 4WUAA 5HI2A 5E8TA 4DLJA 3UZPA 4U9AA 3QWKA 3UQFA 2O0UA 1BUHA 3GU4A 5IH6A 2Y4IB 4BHNA 1KE8A 3BQRA 2SRCA 3QLFA 3PJ1A 1OIQA 4GK4A 5J7HA 3ZRKA 1MQ4A 3E3PA 1Z57A 2F9GA 4RGJA 5ANOA 3RWPA 4JQEA 2BALA 4PRJA 2HZ0A 4OR5A 4KBAA 2VGOA 5LWMA 1BKXA 3S0OA 3OC1A 5JZNA 5JSMA 2B9FA 4I3ZA 4AW0A 4D5KA 3BLQA 2WELA 3NWWA 5AUZA 3ZO1A 1KE5A 2OIQA 3IOKA 3QXPA 4I21A 1LEZA 3GC7A 3RWQA 4AACA 4BCKA 3LCTA 3L8XA 3VBWA 4F7LA 3R8ZA 2PZPA 1WBWA 3NNXA 4N6ZA 4BGQA 4WA9A 3ZRMA 4MWIA 3C13A 4F65A 3K2LA 2CKPA 3ALOA 4PDYA 4F9YA 4CT2A 1K9AA 3Q4UA 3OHTA 5EH0A 3LQ3A 3LMGA 2PK9A 4XG3A 3RINA 4EC8A 3PSBA 5JQ5A 3NAXA 1TQPA 3UO6A 3UG1A 2JGZA 3HZTA 3KULA 4CV9A 3MWUA 4DGLC 4EH9A 5B7VA 4O1OA 2C3LA 3C4EA 3GOPA 5HCYA 3DNDA 4YTCA 4AW5A 2ZV2A 3E92A 2UW4A 3PYYA 3LFNA 4IIRA 3GQLA 2BFXA 1JVPP 2RF9A 4DH3A 2FYSA 3PSCA 1FQ1B 3AMYA 2H6DA 2WEVA 2YFXA 3FKLA 1Y91A 3H3CA 4EH4A 2BDFA 2YDIA 3EQHA 3WARA 4I5MA 5ETFA 4O0RA 3TV6A 4A7CA 5A6OA 5CEMA 3C0HA 2Y0AA 2BIYA 1ZYDA 2C68A 3DLSA 2Z7LA 3Q4CA 4FV1A 3H30A 3A7FA 3UYTA 1PXKA 2Z7RA 4X3FB 3KEXA 2A0CX 4IZ7A 5LJJA 2C69A 4GJ2A 4JX7A 3QKLA 3QD3A 1ZYJA 2DS1A 4DLIA 5EDRA 5LMKA 2F2CB 4E4NA 2R3OA 2X4FA 3BWJA 5CSXA 4CG9A 2RGPA 3ZUUA 3OXIA 2R3NA 4DGOA 2BDJA 2GS6A 1OM1A 4WNPA 3RAKA 3R9RA 4XBUA 2ETRA 2X81A 3LJ0A 3GCPA 3VUTA 3BYOA 4WBBB 3P5KA 4DYMA 4BTFA 3HV5A 3KF7A 4GG5A 2QU6A 4PP9A 5LVLA 4O7RA 2EB2A 3PXQA 3BHUA 3EHAA 3QAME 4Y46A 4F0IA 5AAEA 1YDSE 4GT4A 4AAAA 3HMNA 2BVAA 2VTNA 3GXLA 3QA8A 4YC8A 4AOIA 3I60A 2DQ7X 3UPXA 3QTUA 3CIKA 4II5A 3AMAA 3I0OA 4FKTA 4RX7A 5J5TA 5EQPA 3QX2A 4XHKB 5EDQA 3SX9A 5IU2A 2V7AA 3PVUA 3PIZA 4NM7A 5EM5A 4F0FA 1F3MC 2PVJA 4O27B 4QP4A 2IZTA 2JKMA 4F7JA 5JGAA 3DY7A 2CDZA 3CR0A 3W2QA 3G33A 4X7QA 4YTFA 2BUJA 3FE3A 3TACA 2XYUA 3GENA 4Y72A 4AFEA 5BUIA 4DEEA 2XJ0A 5CI7A 3MB6A 2PVFA 4BCHA 3Q60A 4FUXA 4R5YA 4TYEA 3REPA 4MXAA 2VTJA 2GFCA 2UUEA 3KB7A 2ZJWA 4S30A 4FSQA 1Z5MA 3V8TA 4CD0A 2YACA 3D0EA 3U87A 5M4FA 5FEQA 1J3HA 2GFSA 1OIUA 3UIXA 4BI2A 3IDBA 2CN8A 3BGZA 3NGAA 2XH5A 3AC3A 2JITA 3VQHA 1WVXA 2ZB0A 2OF4A 4FV9A 4PPBA 1JKLA 1OPKA 2C6OA 4QMUA 3BHHA 1RDQE 2VTRA 4IB3A 3TXOA 1W82A 3MW1A 4HZRA 3CJFA 2P4IA 4UMUA 3R8UA 3LE6A 2HW6A 2PMLX 4LV5A 3M42A 4TY1A 2F7EE 3MJ2A 4FT5A 4XG4A 4U43A 5DG5A 2XKCA 2WPAA 2CLXA 2QOOA 4GIIA 1STCE 5CU4A 5DFPA 3ZFYA 3POOA 4PNKA 3OWKA 4EL9A 4E20A 2GSFA 3UZRA 2R0UA 3I5ZA 3CGFA 3I6WA 5L8JA 4BVUA 3LFCA 4CQEA 2YLFA 1QMZA 4C3PA 4P7EA 4D2WA 4V04A 5EW9A 3TN8A 4FNWA 4OTWA 5J5SA 5LVOA 4MXYA 2GNLA 3NUUA 3FQEA 4E4MA 5BUEA 2XB7A 4XH6A 2HENA 3C1XA 2F49A 2WQBA 1UWJA 4OTIA 4ZTRA 3UC4A 3RCJA 3PA3A 3A99A 2KULA 4MQ2A 5AUTA 2YWVA 3BBTB 4GFGA 3VUMA 1WZYA 1QPJA 4C59A 4D5HA 2A1AB 4O21A 4CVAA 3PVBA 3F2AA 3KU2A 4U40A 4H1MA 4L01A 3KXXA 2C3JA 2I1MA 3QD4A 4AE6A 3IW6A 4F0GA 1OBGA 2PE2A 4JDJA 2QG7A 1YW2A 3HDMA 2QLUA 3FLYA 2GNHA 2HCKA 3IS5A 5HG7A 1ZOGA 4IBMA 1PXPA 4ZZOA 2OO8X 2IVVA 4KRDA 3GCSA 4GH2A 3RPSA 4RZWA 4MX9A 3VN9A 1WVYA 2R3GA 4CKIA 2IZUA 4ITIA 4TZRA 1CKJA 3P7AA 4BB4A 4M97A 2XVDA 1MRVA 4HYUA 3LCOA 3A4OX 3RPRA 1PYEA 3VRZA 4FKRA 1U59A 3W2OA 5HBHA 1RQQA 3FPMA 4IZ5A 1M17A 2CN5A 3DKGA 4C3RA 3VS3A 4JJRA 3WBLA 3R9HA 2VO6A 1H4LA 3EB0A 4FIEA 5T68A 4DC2A 1FVTA 5DT0A 4NZWB 5L2TA 4O84A 3DTCA 2IW6A 2WGJA 3OXZA 2GTMA 3E5AA 3R7EA 4RC3A 2FH9A 4YJNA 4F7SA 3BU3A 4QOXA 4EK6A 4I6BA 4ACHA 4E1ZA 3AG9A 3DTWA 3S1HA 1GOLA 1IRKA 4ZXTA 4E5WA 3VBVA 2XIKA 2YM3A 1DAYA 2HAKA 1PXNA 3QXOA 4MBLA 5FTQA 1ATPE 2YZAA 3HECA 5J8IA 4NK9A 4ASXA 4MXXA 4PNIA 3OROA 4EOSA 2ZV8A 4X6QC 4JIKA 2XMYA 3AD6A 4I5HA 1H8FA 4K1BA 2VUWA 5LVMA 2HW7A 4G34A 4GVJA 3KREA 2XIYA 4RIYA 3VF8A 4F6UA 4L44A 1F0QA 1F5QA 3Q52A 3RKBA 2CHLA 5HTIA 4FV3A 3ZU7A 4ACMA 3E88A 2J0JA 3QWJA 4BI0A 1W98A 4WSQA 4NTSA 1UU9A 2QR8A 3LXLA 5L6WL 4YJSA 3HV4A 3O96A 3HP5A 4K11A 4DFUA 3K5UA 4W8DA 4QMMA 4C8BA 4JNWA 3NMUF 4DE4A 1R39A 4CFUA 4UYNA 4EBVA 3W8LA 1JKSA 2XM9A 2R4BA 4ZLYA 2FB8A 2ZMCA 3OOMA 4CZTA 3BHVA 4M3QA 3TIYA 2QODA 4TYIA 3KXHA 4QNYA 3PXRA 3A62A 4TYHA 1XR1A 4GFOA 4BDDA 4CG8A 2XK3A 4EK5A 2FSLX 2Z8CA 3G2FA 3SAYA 4NJ3A 3M11A 4DF3A 4QYEA 4ZLOA 2R3PA 4LI5A 1UNHA 2OU7A 4FG8A 5DT4A 1YXTA 3FL4A 3LOKA 5ANEA 4OBOA 3EZRA 3VW8A 4DH5A 1OB3A 1KWPA 1ZY4A 1ZWSA 3F7WA 5KKRB 3F88A 3DBCA 4CQGA 2QONA 3AQVA 5HD4A 5LMAA 4CFNA 3KK8A 3LMIA 4PL5A 2PE0A 2UZBA 5I0BA 2WIHA 3CY3A 3KFAA 4J52A 3BHTA 4AZFA 4DFBA 5IISA 3MPMA 2QD9A 2FSMX 2J7TA 1H26A 3QQKA 5C4LA 5AP4A 4X3FA 1GAGA 1O6LA 5DR2A 1OL6A 4IWDA 5F95A 4XNEA 4AA0A 2WMSA 4KIKB 4GKHA 3KCKA 4HVDA 5ETAA 3CKWA 4DFYA 3H4JA 3D7TA 4C7TA 4YZNA 5E8VA 2W1HA 1OITA 1SYKA 2G2HA 2W9ZB 2IZSA 3FZSA 4GRBA 4RFZA 2EUFB 2C1BA 4ZZMA 5C1QB 3IG7A 2RG5A 3ORLA 2JDVA 2C3KA 5FG8A 1YWNA 3RMFA 3UPZA 5K4JA 1IA8A 3R7OA 5AMNA 2R3IA 4L53A 3UVPA 2W4KA 4MK0A 4MQ1A 4PF4A 2XNGA 4QO9A 3EN7A 1DI9A 4J53A 4D4YA 2B7AA 4FNYA 4J1RA 5AA9A 2VZ6A 5KMKA 3LCKA 3KRLA 3GBZA 1YHVA 3PE1A 5T3QA 2W99B 4FBXA 3G9LX 4ZZNA 3ACKA 1G8AA 2YJRA 4TN6A 3QALE 2UW6A 3DJ7A 4L68A 5FWKK 2JAMA 1GJOA 1PXIA 1URCA 1TKIA 3MV5A 5L6OA 4ITHA 3VRYA 3RAHA 2EXMA 3C0GA 1ZMUA 2YITA 3PJCA 4UZHA 4R1YA 1ZRZA 1YI4A 3D15A 3G5DA 2BMCA 3T9IA 2UW0A 3UMXA 1KE7A 3AT2A 4YNEA 2BTSA 2OKRA 4FG9A 4K33A 4RQVA 2VTIA 3R02A 5K0KA 3I81A 4FTLA 5BVNA 2C6EA 1J7UA 4IACA 4PTCA 5FM3A 2YLEA 5H9BA 3JVRA 2LAVA 4C02A 5BPYA 4CRSA 4NM0A 3KXGA 3QUDA 2QQ7A 2WB8A 2PWLA 4ALWA 5AUYA 2B0QA 5TOZA 2JIIA 5HX6A 5JN2A 3ZFXA 5HCXA 4U5JA 2FSOX 4RIXB 5F9EA 2WXVA 2ITQA 2QC6A 1IEPA 3R1QA 3SG8A 2EWAA 3EIDA 5HE1A 4FSNA 4DEIA 2GHLA 2PE1A 1YRPA 4UMRA 3Q4ZA 2ZM3A 4P5ZA 4O1PA 3LFSA 2YM5A 5A4QA 3ORNA 4IXPA 2FO0A 4QP7A 5KHWA 3HMMA 4OAUC 5DMZA 5EI2A 5D1JA 3VHKA 1E1VA 3OCSA 4I6HA 4LRMA 4QTAA 3FMLA 3CQWA 3OEZA 4P2KA 5ANKA 3UOHA 4RX9A 1J7IA 1UU8A 3MH3A 3RVGA 3VBTA 1FBNA 2J2IB 3A7HA 4KSQA 3U4UA 2AC3A 3ZO2A 4QQTA 1OL5A 3TTIA 3RI1A 4YMJA 4USFA 1DI8A 1PMNA 1YWVA 2X2KA 3IGOA 4HJOA 4ANLA 3GP0A 5E4HA 4EOQA 1XH7A 4ZJIA 3R7GA 4QMVA 4JG7A 3O8PA 4CYIA 1OKZA 3QTRA 3W2PA 1JNKA 4FV0A 3V04A 4M68A 1E1XA 4U7ZA 5BVEA 4PMPA 2OBJA 1UKIA 4PPCA 3ZBXA 2GQGA 3ZZEA 4BZDA 1ZMVA 3ZM9A 4FTCA 3G6GA 4RRVA 3AT3A 3VS5A 1U5RA 4IH8A 3WF9A 1URWA 2XA4A 2OJIA 2W1IA 3C9WA 3JPVA 4V01A 4RJ4A 3DU8A 4RVLA 3KULB 2BHEA 1NT2A 3HV6A 4O82A 2GQRA 3FV8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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