4FSQA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fsqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fsqA01
2QVSE 3QUPA 4TN6A 3LLAA 1ZOHA 1ZYSA 5IEYA 2H34A 4LL0A 3RK9A 2R3KA 3GVUA 2LAVA 3G0FA 5BMMA 4R1YA 3RCJA 4ANMA 3FWQA 2XVDA 3PSBA 1FQ1B 2BMCA 2VRXA 4QD6A 2BTSA 5FEEA 2WMQA 4EOOA 3FL5A 4I21A 2R7BA 5AUYA 2FA2A 3HP2A 4U9AA 5CEQA 3G33A 3PRIA 3R73A 5HBJA 3ULIA 1H0VA 3PUPA 2UZVA 2JLDA 5AUXA 4FKOA 3Q2JA 3F5GA 4O0UA 4EBVA 4MKCA 3BWJA 2CN5A 3COHA 3D7TB 3QYWA 2QHNA 4OR5A 5HCYA 5EYDA 2CGWA 3CTJA 4FKRA 3OT8A 3BE2A 4ZTQA 5M57A 2YM4A 4L7SA 3FHIA 4B0GA 3FI4A 4FT9A 4WHZA 4WRSA 2CGUA 3OWLA 2C6LA 4IX5A 5FWKK 5J95A 4EOJA 3QQFA 3A8WA 5EW3A 2ZM1A 3EZRA 2GQRA 4HYSA 3TKUA 3PXQA 2J7TA 2IVSA 3GOKA 2WHBA 4HCVA 5F95A 4YNOA 1TQIA 3B8QA 4DTBA 2OZOA 4GK4A 3UIUA 4A9UA 5BPYA 1YKRA 1OL2A 3WF8A 3ORKA 3QLGA 3RM6A 2RGPA 3ZXZA 4C62A 3U4WA 3ORNA 4EQMA 3PSCA 4JBQA 4EK3A 3A60A 3FMEA 4BFMA 5IUHA 1OL5A 1E9HA 3D5WA 5TR6A 2OWBA 1U54A 3EQDA 2OJIA 1JBPE 3HMIA 3LCSA 3R30A 4XX9A 5JRSA 3OVVA 4PX6A 2DYLA 3ZONA 4ZSEA 5JGDA 5JQ5A 3TV4A 3LQ3A 3VN9A 2JIUA 3KA0A 2PMOX 5BQ0A 3I7BA 4IX4A 4ASXA 3MIYA 5CEIA 4ZLZA 5GIOE 3ANQA 3JXWA 5ETCA 5AV3A 2C68A 4S34A 4QYEA 4DT8A 3TNWA 3I6UA 4RWKA 4N0SA 3E8DA 1NA7A 3FEGA 4S32A 4W4WA 2BAQA 1BMKA 5AV4A 2W17A 1ZMWA 5CY3A 4QTCA 3EL7A 3HGKA 3BRBA 4EI4A 3UE4A 5LJJA 2FVDA 2JDVA 2R3PA 5AR2A 2C1BA 3OCBA 5E8SA 2XZSA 1CSNA 3N51A 1H0WA 3LIJA 3ZEPA 1OMWA 2YIRA 3OEZA 4QMUA 4DGOA 3PVWA 4EH3A 3QXOA 3MA3A 3ZU7A 4CTCA 2PZRA 1BYGA 2BRMA 2OIBA 4RWJA 5H8BA 3EQCA 3H10A 2YAKA 3CLYA 5I5ZA 2DUVA 4XYFA 4FTIA 2GCDA 3P79A 2HWPA 2PL0A 3I79A 3KQ7A 3MW1A 2R7IA 3LCTA 1G3NA 4QMXA 3CPBA 5E8TA 4KD1A 4ZSLA 4BIBA 4CV9A 1XH7A 4EK8A 4QYHA 4F65A 3UZRA 4UN0C 3V04A 4GRBA 1ERKA 2ZB0A 5KMOA 4J97A 4R5YA 3VWAA 4C02A 4AW0A 1SZMA 3T3UA 1SMHA 3GXLA 5LVNA 2WU7A 2VX0A 2XM9A 4RFYA 5CEKA 1XWSA 4XG4A 3NMUF 2F2CB 3CKWA 4BDKA 3SGCA 3I5ZA 1B6CB 3NPCA 4JAIA 4E7WA 4KAOA 2PHKA 1I44A 2BDJA 2OGVA 4QQJA 5AR3A 4AA0A 5IA4A 2C6KA 2WNTA 4XG9A 5FEDA 3HEGA 2JDSA 1P4OA 5AV1A 3UG2A 2RG5A 4JRNA 4YZ9A 3S4QA 2JAVA 4QYGA 2RSVA 3OROA 2F49A 5CXHA 2C3KA 3LMGA 3RWPA 3QQJA 3R28A 4BBMA 3RNYA 4EOIA 5GZAA 3BHUA 4FIIA 4IWDA 3TNPC 3CQUA 4PMMA 1WAKA 4UZDA 4M15A 5ETFA 3QBNA 1QPEA 3KRLA 2J9MA 3CE3A 3R71A 4ZTSA 1SNXA 4DEBA 4YURA 3EN7A 3HV3A 4BCGA 3R9DA 4YJRA 2UZDA 4F9WA 1P5EA 4ZZNA 4D9UA 5KHXA 2OICA 2WB8A 3EQRA 3PY0A 4KS7A 4ALWA 5K3YA 4D4YA 4JRVA 4EZ7A 4QPSA 5CNOA 3QFVA 4L45A 4Q2AA 3P23A 1PMNA 3R8LA 3G5DA 4GCJA 3ZFXA 4EK6A 5HG8A 4WG5A 2ZV2A 4E5AX 5EM7A 4FUXA 4YLJA 5CASA 2CDZA 1U46A 2RL5A 3HV7A 1XH4A 4MBLA 4A7CA 3FQEA 1W83A 5HE2A 1XO2B 3ZO1A 3CS9A 4D0WA 3PZHA 5EQYA 2CGVA 1WBOA 3FJQE 3UP7A 2HIWA 2Z7LA 2QONA 4C3FA 4MXYA 3NNWA 3G9LX 3U4UA 4F08A 3TZ8A 4FSRA 2G2HA 2VU3A 3ZC5A 2ESMA 5F1ZA 4HVDA 3H9RA 1WVYA 1YQJA 1RDQE 4AW5A 2GHGA 2XS0A 2WMVA 4LV8A 1QCFA 4Y8DA 2WEIA 2VTSA 4FL3A 1PXJA 2ITUA 3G2FA 4DEHA 3CTHA 4U3ZA 5E8UA 3ROYA 3WZKA 4AU8A 4MNEB 5IMXA 1LEWA 4CTBA 2ITQA 1XH6A 3VBWA 4XG3A 4DITA 4BI1A 3A7FA 4BCKA 3QD3A 4JIKA 4DG0E 4AS0A 3PE1A 3W2SA 1NT2A 2ZDUA 3UNZA 3RAWA 3REPA 3GU7A 5EQPA 3MY1A 1WBNA 4GUBA 3NX8A 4MXZA 2JDOA 3DLZA 4O1OA 1MUOA 3TACA 4YLLA 4EK5A 1IA8A 3CC6A 4ANBA 3O8TA 4DLJA 3GCUA 4EH4A 2XIKA 3BHVA 4KBAA 5E7RA 5EKNA 2Q83A 1W8CA 3EOCA 1DM2A 2W1ZA 5EOLA 5CSPA 4A06A 3QKKA 3IW5A 2VTQA 4ZMEA 5F20A 5HICA 1ZLTA 4FKJA 4JQEA 1J7IA 3AD4A 5AR8A 2IW6A 2OO8X 1M7NA 4TT7A 5HO6A 2W7XA 4X6QC 2FSTX 3D14A 4RC3A 5HHWA 4MD8E 3LFAA 3IG7A 3O7LB 4G5JA 5HQ0A 4F7SA 4V0GA 1YXXA 2E9UA 3G51A 2Y7JA 3DBFA 3QRIA 4L01A 5DPVA 4ZXTA 1JOWB 3UDBA 3W2OA 3KVWA 4E73A 5J5SA 3GCVA 3BQCA 3EWHA 1JQHA 3HDMA 4CG8A 5I9VA 3K3JA 4XP3A 3LQ5A 1MQ4A 1Y6AA 2HZNA 2XK4A 2OSCA 1XH8A 4ANNA 5AAEA 4XV2A 2PVRA 2EU9A 2I0VA 2GS6A 2IZRA 3RKBA 4UZHA 3EKKA 2RFNA 4I22A 3O23A 3C9WA 3NZ0A 2PVHA 3LJ0A 3AT2A 4RFZA 3NDMA 1Q99A 4BGHA 3ZZWA 2OH0E 2O8YA 2I1MA 5CENA 3N4VA 2PUNA 2DQ7X 5HESA 4FZDB 3FMNA 4PV0A 4YZMA 5IH5A 3DT1A 5BUIA 3DTCA 2WMTA 3NUUA 3ORTA 2ZV7A 4CFXA 3R1SA 4D1ZA 4HCUA 2W5BA 2UZTA 4G5PA 3LFSA 2FGIA 4KB8A 4ZZOA 5J1WA 4EHZA 4EZ5A 4D0XA 4AGCA 4DAWA 3E87A 4TYEA 4RX7A 2QOCA 2BTRA 3WF6A 2O63A 5AUVA 1F3MC 2V22A 2W0JA 3DTWA 4V05A 1DS5A 4XG8A 4QMNA 5M09A 4AZTA 4M0ZA 1ND4A 1M2RA 3M2WA 3FC2A 4KWPA 4NK9A 4BCMA 4ENYA 3U6HA 3C4XA 2VWUA 1GOLA 1W82A 4G2FA 4CNHA 4BCJA 2XNEA 1ZOGA 4K18A 5D7VA 4O0TA 5A46A 4FA2A 4D55A 1ATPE 4OW8A 2F7ZE 1REJA 4AT5A 4DEDA 2H6DA 2R2PA 2AYPA 4ZTRA 2ITWA 4I94A 3PWYA 1E1XA 3O96A 4IAAA 4QP4A 2OXXA 4TPTA 4GG7A 4YZNA 3VUTA 5A4EA 3ZC6A 5EHOA 4RIWA 4FSWA 3RZBA 4JJRA 2V55A 4PTCA 4QOXA 2XBAA 3ZUVA 1FMOE 2JKMA 2XRWA 3BYSA 3SW4A 3THBA 3Q32A 4JDHA 4TYGA 3UVPA 2IPXA 3LMHA 2UVYA 2X8IA 3EN9A 4E6AA 2WTIA 5EOBA 1NVQA 1R0EA 3DNEA 1KV1A 2YFXA 5LARA 2X81A 5HG5A 5BYLA 4OUCA 3SX9A 4WA9A 3NAYA 3W2RA 4B6LA 4OTQA 3KFAA 4IZYA 2X2KA 4PNKA 4XRLA 1Q97A 4P4CA 2O2UA 4GYGA 4HVSA 5HIDA 4D9TA 1H25A 4QTBA 3NUAA 3N4UA 4BDDA 2GNFA 4KBKA 2ZAZA 5H2UA 4JXFA 3HRBA 1H1QA 4H39A 3MYGA 3KRRA 4FV1A 3NR9A 3U9NA 4ERKA 4GEOA 4NUSA 2JBPA 3NIZA 4XOZA 5A4TA 4FK3A 4R3PA 5IG1A 4RA4A 2JDRA 3QZFA 3FKLA 4AACA 1OBGA 4PL3A 5AV2A 5HORA 1PXPA 4O6EA 3BHYA 4CD0A 3W8LA 3MY0A 4V04A 1YXTA 4DYMA 5I3RA 2V7AA 5AWMA 1XH5A 2R3QA 3DK6A 3IGGA 4EH8A 3UQCA 3S3IA 2WMAA 3HUCA 4EYMA 3QCXA 2Y9QA 4YU2A 5A4LA 1R1WA 3DBEA 2GNIA 1FPUA 4M66A 4AFJA 3RZFA 2C5YA 4UWCA 2OKRA 5D1JA 3TEIA 5BVEA 4G1WA 3RVGA 5JH6A 5M51A 3F66A 3QAME 3W8QA 3M11A 1UWJA 1HCLA 3MB6A 4U44A 3LXLA 3Q9YA 4J96A 1H01A 3OW3A 3RALA 1KE8A 2WTVA 4ACGA 3ZUTA 2E9VA 4MAOA 3UO6A 4LG4A 3WBLA 5EYMA 4LGGA 5AEPA 1WMKA 2G2FA 1ZYDA 2XJ2A 3LVPA 4GK2A 3QCQA 3ALNA 3QWKA 3R0TA 4RJ6A 5D10A 3NNXA 1KE7A 4EH9A 2OIDA 1YI4A 3WF5A 5J9YA 1ZY4A 1R0PA 2VWXA 3HRCA 3EN5A 5DNRA 5FLFA 2OG8A 3VBQA 3FLYA 3LFDA 2QHMA 4RLKA 3UMWA 3HNGA 3KULA 4UBAA 3VW8A 5CU2A 5FRIA 2WTDA 4QO9A 3VBYA 4WIHA 3BCEA 4Y5QA 2CKQA 3L1SA 1YWRA 3RGFA 4CCUA 5FM2A 4IEBA 4ORKA 3UVQA 2UW8A 1WBVA 4M69B 2JKQA 2BRGA 1W7HA 2J0IA 2UZLA 3BV2A 3A7HA 1BI8A 3D2IA 4QMLA 4WSQA 5H9BA 4CYJA 3VUGA 1OM1A 3OXZA 5FDPA 4PY1A 4R5SA 2GSFA 3ID6C 4ZS0A 2PTKA 3CJGA 3EL8A 3NNUA 4JR7A 3COIA 5HZNA 1PMUA 4NFMA 1SYKA 2OBJA 4A9RA 3VRYA 4RVKA 3OD6X 1PY5A 4H3PA 4FTTA 4MD7E 4HVGA 5FD2A 3ZM9A 1VJYA 4FTLA 1EH4A 3GFEA 4CT1A 4FEXA 2UW6A 4QQCA 1M7QA 5FUTA 3U55A 3II5A 3HA6A 2IWIA 4IZ5A 1YHVA 2DWBA 3NSZA 5BVNA 3DXNA 1YDRE 4O96A 3V6SA 4ZAUA 1NXKA 2C6MA 1YW2A 4GU6A 4CZTA 4DE4A 2UZWE 5CAPA 2HK5A 3PTGA 4I92A 2GTNA 3FKOA 3R8MA 4EEVA 2C3IB 5IU2A 4DGLC 2NPQA 3NUYA 1Z57A 1M52A 2BZIB 3BZ3A 4FG8A 3BGZA 2ACXA 3T3VA 3ZFYA 3ZCLA 2WQBA 4LRMA 2HWOA 2EXMA 3HMNA 2XK8A 3FMKA 5CSVA 5EDQA 4DH8A 2LGCA 2GQSA 4O27B 2QOIA 2W1DA 4GK3A 4RWLA 1H08A 4IWPA 4ACHA 3VUKA 3DAKA 3ENHA 2XH5A 4EC8A 1Q41A 4C34A 4G34A 4P5QA 5TT7A 2GHMA 3Q4UA 3LCDA 3PPZA 4QMOA 5TO8A 3SV0A 1XKKA 1Y8YA 3LFBA 3VQHA 3CP9A 3LM5A 2XEZA 4RWIA 4YBJA 3UOKA 3L9LA 3OBGA 4BZNA 4FV9A 2J0MB 3PJCA 1UNHA 5IDPA 1G5SA 4TW9A 3D83A 2R3JA 2PZPA 2QO2A 3C13A 3F2AA 4BKJA 4A4OA 4O0VA 2VTNA 3DGKA 3TL8A 2RG6A 3DFCB 4IJ9A 5CWZA 3UJGA 5C8MA 4P2KA 4IMYA 4R78A 1SVEA 1JSTA 5CVGA 3UOLA 4PDYA 4IW0A 4MEDA 4HYIA 2PVLA 1PKGA 1GZOA 4GFMA 5H8GA 4D5HA 4XH6A 4FZAB 2B54A 4EOSA 4WG3A 3PXFA 4KNBA 2YDKA 4NIFB 3DCVA 2IZTA 2YJSA 4MXCA 4W9WA 2PMNX 1YXVA 4BICA 4IAIA 3U6IA 2VV9A 5JGBA 4GS6A 2VTMA 2Y4IB 3LQ8A 1Q8TA 1CKPA 3OT3A 5CZHA 1P2AA 3WI6A 2B53A 4D4RA 4CYIA 2WTKB 5A6OA 2IZSA 4G16A 5AA9A 5E91A 1JSUA 4O0SA 1XHAA 2Z2WA 3W2QA 5M44A 3PIXA 2YIWA 3C0IA 2BVAA 5AR4A 4CQEA 3E8NA 2HY0A 3TG1A 2XP2A 5C8NA 2A27A 3KMMA 2XIYA 3ZLSA 2ZOQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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