4FSYA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
267
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVPENIKKEIINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 81
structure length 267
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fsyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fsyA01
4EOQA 3QCXA 5DRBA 4MBJA 3TZ9A 5TE0A 1Q8UA 2BTSA 2Q0BA 4BCHA 2JLDA 4WIHA 5FG8A 2PUUA 4QYFA 3QC4A 5FUTA 4J1RA 4MK0A 3HNGA 4TKSA 3IK3A 2A19B 3OMVA 5IA5A 3OG7A 4IANA 4PPCA 2C1BA 4EK6A 4LFIA 2R2PA 2W1FA 1W83A 2VTOA 3TXOA 5EW9A 4DGGA 2R5TA 3W55A 4BRXA 1Q62A 3HP2A 3N4TA 4S32A 2YZLA 2CLXA 5BVFA 2OW3A 3PXQA 5FD2A 4ZXTA 2B9FA 1H4LA 2HIWA 3NEWA 4PMSA 5ACKA 4AG8A 4EH5A 4Q9ZA 3BZ3A 4HPUE 4QRCA 5A4EA 2XP2A 4DF3A 3NW7A 3KC3A 1CKJA 3FYJX 1R39A 4XG9A 2QODA 3COMA 3HUCA 1FPUA 4PPBA 4U42A 3TZ8A 4BTFA 4DEAA 2OZAA 3NUXA 4B7TA 3SW7A 4QNYA 3L1SA 4D1XA 3OCTA 3CD3A 4BZNA 3RGFA 4KBCA 2XBAA 3ORKA 3FZTA 4CQGA 5IH6A 2F57A 2W9FB 1FGIA 2W99B 3PSDA 3UIBA 2E9OA 3E3PA 4XRJA 2CN5A 3AC1A 1CKPA 1ZYJA 1XKKA 3KVWA 4CG9A 4FTJA 3NS9A 3Q4CA 5LMBA 4BGHA 4QMPA 4WG4A 3JY0A 5HX6A 5HE3A 2JKQA 2GHLA 2GNFA 3OY1A 2WAJA 3ALOA 1Y8GA 2AC3A 4RBLA 4HZRA 3VUKA 2J4ZA 3QC9A 4BI0A 5EI8A 4TTHB 1E1XA 3FMHA 4DH3A 3G5DA 3R0TA 1PXLA 4H3QA 4E3CA 2OJIA 2J9MA 4MXYA 5FTGA 1UWHA 3E7VA 3F2NA 4ZSEA 5L2SA 4FBXA 4WOVA 2X2KA 2R3OA 1YI4A 1H1QA 4G3DA 3TDWA 3G6HA 3GC7A 3SRVA 3DPKA 4UWCA 3ZSHA 4R5SA 2HXQA 4L7SA 4PL3A 2RSVA 4HNFA 4C36A 5GINE 4DN5A 5BMMA 1JAMA 4O27B 4KIKA 1OI9A 1OB3A 3HUBA 5LVMA 5A46A 3V6RA 5DT3A 4N0SA 5AIKA 2PL0A 3NYNA 5HICA 1JOWB 3HEGA 4WKQA 3L8SA 4AA4A 4BDFA 4FTAA 4F1MA 3THBA 4UMRA 3UYSA 4ZLYA 2CCIA 4W8EA 4BCQA 4R7BA 3FHRA 3OP5A 4IDTA 3U51A 2IZUA 3QALE 4DEGA 3RALA 3QZFA 3G33A 3UZTA 2UW8A 4DFLA 1IG1A 4IJPA 3ZYAA 5J5TA 5L8LA 4O91A 2XK7A 4RVTA 4CMOA 4O22A 5EM8A 2BRNA 4JOAA 4X6RA 3LKMA 4YGAA 3Q60A 3AOXA 5HLNA 2VWVA 3DJ6A 3I6WA 4I23A 2XNGA 2YN8A 4RC3A 3GI3A 5EHYA 3RPSA 4EH2A 4HYSA 1A9UA 4G17A 5BPYA 1O6YA 3A62A 4IADA 3A8XA 4M13A 3ZSGA 4CG8A 3ZH8A 3O8TA 5AP3A 4EH7A 1GZKA 2FB8A 2QOIA 3RNIA 4FVQA 1OMWA 2C3KA 2OBJA 2R4BA 2WD1A 4TRLA 4DA5A 2V7OA 5KZ0A 3EHAA 3SV0A 3UO5A 4UX9A 3NMUF 4RJ5A 4QQTA 3MVMA 2VTMA 3A8WA 4IX3A 5F95A 5HIBA 3RM7A 2Y4IC 3FSFA 4IWOA 2W1EA 3DBEA 4NTSA 3DTWA 3EWHA 2PVYA 3KXZA 4HYUA 4AGDA 4AWIA 4ZS4A 1FVRA 1Q4LA 1KE9A 3HMPA 4FT9A 2YM6A 4IC7A 4DC2A 1UNGA 2V5QA 4WUNA 5LJJA 1I09A 1M17A 1IASA 3IPHA 5I0BA 4U97A 4AN9A 4DYMA 3RM6A 3FL4A 3GCVA 2C5NA 5A4TA 5IA1A 3BBTB 4U6RA 4CD0A 1U4DA 2P2IA 1NT2A 4FTKA 5G1XA 4E6QA 5M53A 4ZSGA 4YTCA 3MH1A 5EQYA 4L3PA 3U4UA 3IG7A 5D7VA 2GNLA 3QX4A 3FMNA 3ORIA 5LCKA 1P5EA 4NT4A 4H3PA 3ZHPC 4ALUA 3VBWA 3PE1A 4I93A 4YO6A 2O5KA 4DT9A 4FKTA 2ONLA 3OXTA 3DDQA 1SVGA 3LJ2A 4CCUA 5AR7A 4D1ZA 4BBFA 2KULA 1PXIA 3Q4ZA 3SOAA 2PK9A 3VW6A 2JDOA 5C27A 3UPZA 5EM5A 5IISA 5E9EA 4C35A 4QQCA 4BTMA 4K6ZA 2WTCA 3UO6A 3R21A 4IW0A 1S9JA 3L9MA 4BR3A 2XNEA 4O7RA 2R3QA 2CHLA 1WVWA 4MF1A 4MYGA 4WT6A 1YOMA 5L2TA 2WMVA 2BRBA 4V01A 5KBRA 1K3AA 2X7GA 1M2RA 2WTIA 3VBXA 3LM0A 3F69A 4TYEA 4BWKA 3HZTA 5CU4A 4DH8A 3DTCA 4JAIA 2ERZE 3ANQA 1GIJA 4FKIA 5EDQA 1B38A 3EB0A 4G6OA 5L2IA 3KU2A 3UDBA 3M1SA 4ALWA 2PZYA 4UWYA 4FV3A 4W4YA 4XP2A 3ZLYA 3TTIA 3ZM9A 1WBTA 1WBWA 3MN3A 4EH6A 2BIYA 4D2RA 5HI2A 3F7ZA 5FBNC 1GZOA 4AUAA 2GNJA 3JS2A 3OBJA 1TVOA 4O2ZA 2OIBA 3ZLSA 4M14A 3F3TA 3R28A 1PXNA 5D7AA 4M15A 3IDBA 4ANMA 4EWQA 4F70A 5M4CA 2PU8A 3TG1A 2JC6A 3DT1A 2JDTA 3QD0A 5HESA 4AOIA 3ZM4A 5ICPA 4U0IA 3SXSA 3RPYA 3K2LA 1YRPA 3ZFMA 4IZYA 3LFDA 2QNJA 3AD4A 4X0MA 3D7TA 3U8WA 2QD9A 1VZOA 3PZEA 3QRKA 5I9XA 3CTHA 3EIDA 3GVUA 4E26A 2W1CA 2R3JA 1HCLA 4PL5A 1URCA 5J8IA 3LM5A 1Q41A 3CBLA 5C8MA 1E1VA 4BWXA 3G9LX 2BPMA 1FBNA 3VRYA 3FI3A 4PWNA 2C3LA 4PRJA 3C5IA 5J5SA 5HD4A 3QWJA 4RX8A 4J71A 1PXKA 5AP5A 4EYJA 3K3IA 4FTUA 1YI6A 1REKA 2I6LA 3IQ7A 4Y8DA 3FY2A 2FYSA 3CJFA 1XQZA 3SG9A 4HGEA 3GCPA 4QP6A 2FSLX 3C4CA 2QVSE 1NVRA 2R7IA 3WF9A 5IMEA 4YMJA 2JKKA 5CF8A 4GT3A 1PY5A 5H8EA 2W17A 2HENA 4I0TA 3TZMA 4O7WA 2WPAA 5IU2A 4O1OA 4FSMA 5AA8A 3WILA 4B0GA 5B2LA 4QPSA 3D5XA 4D58A 4BZDA 3HV4A 3Q5ZA 4U81A 3BWFA 2QG5A 4CT1A 3OWJA 2XZSA 3TN8A 4DEBA 1ZZLA 2P4IA 2VNWA 4NM0A 2VTAA 2YM8A 3S4QA 3D5WA 3VQHA 2B9JA 5EOBA 4B8LA 4DITA 3JY9A 3LCDA 4QNAA 5BVEA 3RBWA 1J3HA 4M0ZA 3UODA 4Z16A 4Z55A 4JR7A 4YJPA 2QHMA 3E63A 3ID6C 4I4FA 1SZMA 4JXFA 4O83A 1UKHA 4K9YA 3R1QA 4M12A 2P2HA 4DE4A 1JKTA 4UN0C 3QAME 4L8MA 3OWKA 4WG5A 4YLKA 3AXWA 3OOGA 1PXJA 3Q3BA 3W2QA 3O71A 4DH1A 4IWPA 2HAKA 2PVJA 2ZM4A 2ZB0A 5JN2A 4OBPA 1M2QA 4FTCA 3GOKA 5KE0A 1UNLA 3T9TA 3V5LA 3V5PA 4YJUA 5M08A 5C9CA 5LVLA 4CFWA 3R7OA 3Q2MA 2R3MA 3MDYA 4AZWA 4B9DA 1JSUA 3U54A 2VWXA 3E8EA 3AC5A 4OTWA 1QMZA 2JAMA 2JBPA 3OW3A 1MRUA 1G3NA 3RAKA 4LRJA 5EKNA 2YAAA 4HGLA 5L3AA 4WBBB 4FT3A 3M11A 1OVEA 1W8CA 4QYGA 4K33A 1K9AA 2CGWA 3BHVA 3QQGA 2YIYA 3Q96A 4K18A 3TV7A 3BYSA 3MH3A 4FICA 1R78A 2C5YA 5BUIA 3UTOA 4QO9A 2GTNA 3DKCA 3FI2A 2YERA 4I22A 3CTJA 4BCGA 4O7LA 1OZ1A 4ZSJA 4IAFA 3LE6A 1Q99A 1LP4A 2UZWE 3NUNA 3QFVA 4G6NA 4ZSAA 3HL7A 2BRHA 4MQ2A 5CT7A 4IEBA 3NVKI 3A7IA 3N9XA 2CJMA 3IECA 4UYNA 5FEQA 4NFMA 3U87A 4RSSA 3QRJA 3R1YA 5GJGA 3AMYA 5T68A 3Q2JA 4MXZA 3ZXTA 2ITQA 3F3VA 3II5A 1ZY5A 2OWBA 4L00A 4DBNA 3QCYA 1UNHA 3UVQA 5CX9A 3QU0A 3DKGA 2G2HA 3FKLA 4G9RA 3H0YA 2G2IA 5CANA 3QTSA 2PUNA 5BYLA 4A9SA 5CU3A 3PY3A 2JDRA 4QMVA 4KIQA 2NP8A 3W2PA 3GXLA 4OUCA 2WTJA 4X3JA 1BI8A 3S00A 4BDCA 4AE9A 2R3FA 3WE4A 4BDBA 2W4KA 4LGDA 4Y72A 5L4QA 2C47A 4QP7A 1YXVA 4ANLA 2BKKA 2VRXA 2WXVA 4FKSA 4ZJJA 5AAGA 3OT8A 3NAXA 3VO3A 2PUIA 4YHTA 4P5ZA 3HAVA 1Q3WA 3GQLA 4H05A 2YLFA 5BX0A 5LOHA 1IEPA 3BPRA 4ZY5A 3PJ2A 5DYJA 4YURA 3E7OA 4QP2A 1CMKE 5AADA 4PTEA 4KBAA 4A7CA 2DWBA 2V0DA 4O6LA 1BL6A 2VU3A 4L42A 5DH3A 5AV0A 4LOQA 5CNNA 2OXXA 3MA6A 3O7LB 4R3PA 1XH6A 2XIZA 1KOBA 5EDRA 5IQBA 2PMIA 3PJ8A 3HA8A 4JBPA 3ORNA 5BVNA 2C1AA 3GB2A 4IB5A 4IZAA 4F9CA 3LXNA 4YR8A 2WQNA 2BR1A 4R5YA 5A4CA 3FEGA 1A06A 3H10A 3CE3A 4OTQA 3WF6A 3B2WA 3WF7A 2HCKA 4EYMA 3WI6A 3PIXA 3GOPA 4AFJA 5A6OA 3GENA 3KL8A 3QKMA 4KKGA 4ZEGA 4FTOA 3R02A 5KX8A 5LMKC 4EOJA 3JUHA 2QI8A 1PHKA 1ERKA 1Y57A 3BYMA 3IDCA 4L45A 4Y83A 4BZOA 4PQNA 4FTTA 4ID7A 3DV3A 1H1RA 3V5WA 1JVPP 3P1AA 2SRCA 2VNYA 4YZ9A 5HEZA 5JH6A 4A06A 5LWMA 3N4VA 3POZA 4HNIA 5ANOA 2PVMA 4EC8A 2XNOA 4G3FA 3PJ3A 3QWKA 4FV6A 5HNBA 5E8VA 3TV4A 4JX3A 4TNDA 4OGRA 2AYPA 2C6DA 2UZUE 4YP8A 2EVAA 4G34A 5M4IA 5FEEA 3L9PA 2BRGA 1YQJA 2WMSA 3Q9WA 5EK7A 2WMWA 2VTIA 4L01A 4N6ZA 4S33A 3NWWA 3ZUUA 3GU7A 4E93A 3R8MA 2XF0A 4XNEA 2IW9A 3SAYA 2FSMX 4RJ7A 3TKUA 2GFCA 3U55A 3ZZEA 5TF9A 5F1ZA 3RCDA 3GFEA 3NCZA 4FKJA 5HKMA 3R7YA 1UWJA 1H07A 3LLAA 4Q9SA 1LEZA 4FMQA 4X3FB 3RK9A 3L9NA 4K77A 2VAGA 3NVMB 2VTNA 4C2WA 5K5XA 3HMOA 4MXCA 3E93A 2XIRA 4BGGA 1Z9XA 3TNPC 4PP9A 4G6LA 2ERKA 4CFMA 2XIKA 3LCSA 4XV9A 5AV3A 4KABA 4BCPA 4M66A 4BCKA 1TQPA 3C5UA 2H6DA 1GZNA 4AP7A 5AUVA 4XEYA 4L68A 5JFWA 3DKFA 4L52A 1JPAA 4DH7A 5IF1A 4D0WA 2CNQA 1ZMWA 5FTOA 2VV9A 2RG6A 4QYEA 3IW7A 4G1WA 4NM7A 4R77A 3V5TA 3HKOA 3ZEWA 5GJDA 5HBEA 5BUEA 3I0OA 3A7HA 4EUTA 5IEXA 2QOFA 1V0BA 4IWQA 3Q52A 4YTHA 2RIOA 4ENXA 1PMNA 4U9AA 3BHUA 5A3XA 1QPDA 4OTRA 4PTCA 4BN1A 5TO8A 1YOJA 3OTVA 2BZJA 5EI6A 4ACMA 1YXXA 2E9UA 3C1XA 5M4UA 3GCUA 1XH4A 3DLZA 5AUTA 4UWBA 5AUWA 2IG7A 2XK8A 4OTGA 4A9TA 3KULA 1YHVA 1OL6A 4F1TA 4YO4A 4R3RA 1TQMA 4MXOA 4FIHA 5KHWA 4C58A 3SGCA 1KE6A 2OJ9A 1W84A 2R3LA 4D2TA 3TUBA 2BFYA 3RI1A 3NGAA 4YTFA 2IPXA 4CLIA 1TKIA 3FLWA 2CGVA 4FKLA 3HRBA 1UU3A 2I40A 3V04A 3GCQA 4X2NA 2ZM3A 4WUAA 3CLYA 4I24A 3UVPA 5K0XA 3G9NA 2B1PA 2OJJA 2RL5A 2OU7A 4K0YA 2PVNA 3R63A 4C57A 2ITWA 5KMOA 4CRSA 4K8AA 2XJ2A 3WBLA 1OUYA 4L6QA 1M14A 3HVCA 3FQHA 3ZEPA 2GDOA 2X2LA 4EC9A 4OTIA 3PVGA 4X2KA 4MBIA 1IA9A 2REIA 3WYYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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