4FT3A

Crystal structure of the chk1
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
269
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 269
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ft3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ft3A01
3DBFA 4CFFA 1J1BA 2R3OA 1H00A 4V0GB 4PV0A 5GIPE 4AOJA 3KVXA 3P7CA 4ZIMA 5KMIA 2P2IA 2R3QA 2GQGA 4EEVA 4EONA 3F2RA 3FXWA 3ORXA 4RX9A 3NUNA 4NSTA 4F7SA 4FZAB 4UEUA 4JRNA 5BVFA 4NM3A 3LXLA 2WQNA 3UVPA 5BVDA 4BZDA 4C57A 4L42A 2V7OA 3ACJA 4MD9E 2JKKA 4HYUA 5EI2A 4DAWA 4UWCA 3A7IA 3LCTA 3ZTXA 3O0GA 4E5BA 2YJRA 4RA4A 3P7BA 2PY3A 1YDRE 2QKRA 3ZU7A 4HGTA 4YO4A 3LCKA 4O7ZA 4ALVA 4OLIA 5ETFA 4Q2AA 4W4XA 4XG2A 2RFEA 3FXZA 3R7EA 1H07A 5AP4A 5J87A 4I0RA 4FZDB 2PYWA 2YA9A 4O96A 3TV4A 1SNXA 1ZZLA 1PYXA 3CKWA 1QPDA 3EYGA 3NUUA 3QLFA 1PXMA 3ZCLA 4F9AA 2C5XA 2W1HA 4D2SA 1OBGA 1LUFA 2W4JA 2B53A 3ROYA 2XNMA 4C4IA 1XKKA 3PJ1A 5AM7A 3BHUA 1MRVA 3VRZA 4YZMA 4J96A 4FTMA 2RKUA 2OJJA 3QD2B 4QTDA 4V01A 2UW3A 4IFGA 4Z16A 4FSWA 3VIDA 1JKKA 3RP9A 4YLJA 4ZJJA 4NJ3A 3EL7A 2VTOA 3BLQA 5IQIA 4HPUE 4XX9A 2X8DA 3HLLA 1GZ8A 3HV4A 4L01A 4RFYA 3DPKA 2O0UA 4FV9A 4XP3A 3RK5A 2R5TA 5HVYA 2RFSA 2UV2A 2QU6A 5L6PA 3EOCA 3F88A 4I4EA 4K33A 3DLZA 3VBVA 4DEIA 3DK7A 4QQJA 3VUDA 5HLWA 4CD0A 4BBEA 3ZYAA 3SC1A 1VYZA 3PSBA 4EL9A 3TJCA 4DLIA 2A2AA 2C6TA 4LRMA 4CLJA 4YP8A 3UIMA 3LXNA 5D7VA 3DGKA 4IM0A 1KE6A 2PVNA 4G6NA 2YIWA 4EH4A 2J5FA 3IW5A 5HCXA 5HKMA 3ZS5A 4E7WA 3F5PA 5CQUA 5E8YA 4Z3VA 3OMVA 4M97A 4EHGA 2ESMA 2EXCX 2JIVA 4E6AA 4BCKA 2XS0A 3R73A 3ZXTA 4FSTA 4GK2A 2ZVAA 4JG7A 2UW9A 3VHEA 4IIRA 3R1NA 3HV5A 4P7EA 3QCSA 3LFFA 3C4ZA 4EQCA 4FKWA 1H28A 4H36A 4GL9A 2C1AA 3FJQE 3GC8A 4P90A 4CZYB 1WBPA 3BELA 1ZAOA 3NEWA 5EQPA 5KO1A 4U8ZA 2C5NA 5FTQA 4IZ7A 4BTFA 2BKZA 4M7IA 4BDAA 3BZ3A 2V5QA 4D2PA 4EUUA 3CD8A 1XBCA 5JQ8A 2BFYA 2YERA 4I93A 1GNGA 2OFVA 4JBPA 5AWMA 3NIEA 1P14A 1OM1A 4NKSA 5EM7A 5TT7A 4JG6A 3UGCA 3E8DA 2VTNA 1JKSA 3TKUA 1P4FA 2Z7QA 3TDVA 3DKGA 4IAYA 3SXFA 4BRXA 5I0BA 2A1AB 4EH2A 2OBJA 4XOZA 3RCDA 4QYHA 5M55A 4O82A 3QALE 2CGXA 1IASA 1PYEA 5D10A 2C68A 2WTKB 4BTJA 2QLUA 3QX2A 3Q4TA 3SXSA 2B0QA 3NUAA 4BR3A 5EHLA 2XNPA 2QOOA 3Q3BA 4RIYB 4OTQA 5ANIA 3DCVA 3OWJA 4W4WA 5HIDA 4TWOA 4E3CA 2ETKA 3V6SA 3KMUA 4QMNA 4R5YA 4FT9A 5DR2A 4BCNA 3ZLXA 2Q0NA 2C5YA 2VUWA 5GINE 5KNJA 2CNUA 3NSZA 3EYHA 4Y73A 3DZOA 1M17A 1Q61A 4KBCA 3W18A 3WYXA 1Y6AA 2WMRA 5ICPA 2IVSA 4GU9A 2XIRA 3CQWA 4MX9A 5C03A 4C4EA 2IVUA 3TUCA 3TV7A 3MI9A 3TTIA 4ERKA 2EU9A 2HIWA 2Y0AA 3UZPA 2I0VA 5L6WL 3S95A 5AUUA 3JR1A 3DAJA 2VNWA 4FTIA 4L6QA 3DJ5A 1XWSA 3PVBA 3SDJA 4DFBA 3QQGA 2IPXA 4MQ2A 3Q6UA 5LJJA 4TNDA 4IX3A 3V51A 4JR7A 4C0TA 2XNNA 3DDQA 3KN5A 2CGWA 1YXUA 3FZOA 3LJ2A 4YJTA 1B39A 2XVDA 4DG2E 1G8SA 4DA5A 5K4JA 4FOCA 3AQVA 1Q97A 4AT5A 2XF0A 4LGHA 2VWVA 4BDJA 1UU3A 3R8PA 4FG8A 4IAKA 4J8MA 4AS0A 4MKCA 1JAMA 2R64A 4FE2A 4MNEB 2YABA 5HNIX 2E9NA 2V62A 5IQBA 1JLUE 2PWLA 3RCJA 4W4VA 4H1JA 3RI1A 5BVNA 1VYWA 3A7HA 1E1VA 3FV8A 4ZP5A 1OIYA 2WO6A 4RIYA 1RJBA 4GJ2A 4C62A 3ZFYA 4F6UA 3GCQA 5AP3A 2P2HA 4HCVA 5FG8A 1H25A 3HP2A 1DM2A 4GKHA 2H6DA 3BHYA 3DKFA 4K18A 4ID7A 4FK6A 1UKHA 3F2NA 5FGKA 4YC8A 4D1SA 3BYOA 5I9XA 4DN5A 3B2TA 5JGBA 4MXXA 4HNIA 2OFUA 3GCVA 4AGCA 4UWBA 3Q96A 4CTBA 3WZEA 4FSRA 4BFMA 2QOQA 1PW2A 2XYNA 5IU2A 2WMXA 1XO2B 3KRWA 4YJQA 1WBSA 3OOGA 3R0TA 4DFYA 3UOLA 4PP7A 2I6LA 3OOMA 3WBLA 2NPQA 4YHTA 5ACBC 2UW8A 4FVPA 2WD1A 2IZRA 4YZBA 3VUIA 3R8MA 5IEXA 3UE4A 4ALWA 5HCZA 3LCSA 3DQXA 4ZAUA 4UX9A 3RGFA 5ANDA 1NVQA 3FI8A 4Y46A 1PXPA 2J0KA 3F3VA 5GZ9A 2IW6A 3R00A 4PMSA 4BIDA 3K3IA 4IADA 1XH9A 4FKLA 2ZAZA 2WMBA 4PMTA 2Z7SA 4L3PA 4FKJA 3ITZA 4EOPA 3ATTA 3R6XA 3CQUA 5JT2A 4RQVA 3QC4A 2WIHA 2WU7A 4JNWA 3R7VA 5DBXA 3UOHA 4AFJA 4ACGA 4J52A 5HIEA 4BI0A 5AA8A 5ETCA 1H0VA 2FSTX 3TI1A 4AZTA 4F08A 2QODA 3GENA 4JJRA 4X3FB 2W0JA 3NIZA 3P0MA 5EYKA 3LIJA 1W83A 2GNJA 4MXAA 5EM6A 2WXVA 4G3DA 4G9RA 4YTIA 5FRIA 2BUJA 3GU7A 3E5AA 4F1MA 2X39A 3MSSA 3QLGA 4NJDA 4IAFA 5LVNA 2ZDUA 3K3JA 3SW4A 2BKKA 3HAVA 2E9UA 4D5HA 2WU6A 4M0YA 4CG9A 4FNWA 4II5A 3DXNA 3NR9A 5AIRA 3MYGA 4ZLOA 2RFDA 4IFCA 4OW8A 2WGJA 3QUDA 1WBOA 2OXDA 1U5RA 5EH0A 4YJVA 1P2AA 3GC9A 3F61A 4AP7A 3FHRA 2WMTA 1SMHA 3OTUA 4ANQA 4BKYA 5ANKA 4E5WA 4UB7A 3OW4A 2FB8A 2PMNX 2QQ7A 4ANNA 2HZNA 3VUTA 4QNAA 1XJDA 4FKRA 5AR2A 4YLLA 3TNPC 4Y95A 3R30A 3JS2A 4BYJA 3L8SA 3GU4A 1BLXA 2ONLA 2VWZA 3O50A 5CQWA 3U51A 3WF8A 4DG0E 4JDHA 3JY9A 4BDGA 2Y4IC 2VN9A 1OL6A 3DBDA 3PIXA 3VBYA 4NEUA 3LXPA 4AW5A 2VU3A 3CE3A 4HVGA 2VO6A 3QD4A 1DAWA 2JKOA 3VS6A 3HDMA 1ZXEA 3C4CA 5EHYA 2VWWA 4BGHA 4O0VA 3IPHA 5FDXA 2XNOA 5DFPA 1M7NA 4O81A 2Z60A 5E8WA 4XG3A 2YWPA 5BYYA 3BU5A 3V5QA 4O7WA 3HMMA 1LPUA 4YHJA 1OKVA 4G3GA 4RFMA 4UBAA 5DR6A 2XB7A 4IJPA 3Q4CA 4PWNA 4RMZA 4I24A 4KBKA 3NNUA 4KBAA 3E87A 4PPBA 3ZO1A 2OJ9A 3OY3A 3QRKA 4AZSA 3UYTA 4J95A 4NUSA 4R78A 5GZ8A 3GB2A 4OBOA 5LVLA 4KKGA 1R3CA 3QYZA 1XHAA 4AGDA 4FIIA 1ZYJA 3ZUVA 3PXFA 3GC0A 3O71A 4C35A 4UMQA 3F66A 3IKAA 3II5A 3M1SA 4KD1A 1GIHA 1NXKA 1WBVA 3QAME 4KSQA 5EYCA 3V01A 5IH4A 4L43A 1J3HA 2ZM1A 4WUNA 4QYYA 5F9EA 3QCYA 3BGZA 2IN6A 2GFCA 2AC5A 4A7CA 4HGEA 2WTJA 4DTBA 2VGOA 4DF3A 1K9AA 2W05A 3HUBA 5K5NA 2VAGA 3H0YA 4U3ZA 3G33A 3OXTA 4AZVA 3PY0A 3JVSA 2YM5A 3R7GA 1X8BA 4P2KA 2CNQA 2QURA 3POZA 5D41A 4EK4A 4BDKA 3OROA 2OKRA 2QO2A 2ITZA 1JWHA 2Y6OA 2FSMX 4CFWA 3NMUF 3HECA 4ZS4A 2C0OA 2UVYA 2X2KA 3L1SA 3BRBA 2HZ4A 3AMAA 2ITOA 5C4KA 5CEMA 2OZOA 4A4LA 3SW7A 2HXLA 3A7FA 5KMMA 3MH1A 3S0OA 5E8VA 3PDTA 3NRMA 4C3PA 4BDFA 3ACKA 4FKUA 3VJNA 4U43A 3ZRKA 4UMUA 2ITTA 4N70A 4LYNA 2X1NA 1ZYCA 3P86A 4GV1A 2UZNA 2UW7A 4RWIA 4XV3A 4B8LA 3E8EA 5IQAA 3LFBA 3EN7A 5IF1A 2WELA 2IZUA 3D5VA 3IDCA 2HELA 5D7AA 3EMGA 4XH6A 2BVAA 2CKPA 2XM8A 4U9AA 3GCSA 4AOTA 2YIQA 4AFEA 3ERKA 4E1ZA 4YBKA 1O6KA 5A6OA 4NW6A 5GNKA 3TCPA 4ZJIA 4IAZA 3FBVA 4ZXTA 4M3QA 5DHJA 4BDEA 5A9UA 3PA3A 5C9CA 4FODA 3KXMA 2KULA 1GOLA 2CPKE 4DGNA 2QG7A 3KXNA 3L9MA 1OKYA 5I3OA 4BBFA 5E9EA 1K2PA 2J2IB 3NZ0A 3VS0A 4RJ3A 2ZV2A 4AA5A 2RG5A 3LJ0A 5CI7A 3G9NA 4E6CA 2Z7LA 2YLEA 4L53A 3PXQA 4F7JA 5EG3A 2WAJA 2GU8A 2ZV7A 3O23A 2XBAA 5HO8A 4Y83A 2XIXA 2C3LA 4YUQA 2Z8CA 3C0HA 3MY1A 2ITQA 5AAGA 3EHAA 2UZWE 3M2WA 4KIOA 2WMWA 5K0KA 3FQEA 2CLQA 2J6MA 5CU6A 5IG1A 5DMZA 2OGVA 5E92A 5KHWA 5CU3A 4ANBA 5KCVA 4NT4A 5G6VA 1JPAA 4MYGA 2JGZA 2OF4A 4EZ5A 2WPAA 2YM7A 3UIBA 3ZC5A 4PDPA 2G9XA 4I3ZA 4NH1A 5FXQA 2F49A 3PJ2A 4FNXA 2QI8A 5HORA 1H24A 3VUMA 3RPOA 1NT2A 3ZO2A 5DRBA 4WA9A 2W99B 3ELJA 2WTDA 4MHAA 4A9RA 3HAMA 5A3XA 4NM7A 5ANGA 3CTJA 3MFRA 3OXIA 3DB8A 5JK3A 2JLDA 1J91A 4R3CA 2OXXA 4R1VA 4R6VA 4O91A 4GMYA 2BAQA 2ZV9A 5FP6A 4ZOGA 3E63A 5A4LA 1REKA 3QA0A 4KIKA 5FD2A 4APPA 4CMOA 5KMOA 2YWVA 3C51A 4F6WA 3N51A 4QYEA 2F9GA 3QKMA 1BKXA 4CQEA 2DS1A 3ZBXA 1JOWB 2OO8X 4JRVA 5IEVA 5HVJA 1J7UA 3R7UA 4FV6A 3WILA 5L8JA 3DTWA 5BVWA 4XV2A 4RWJA 4TWCA 4Y8DA 3TEIA 4XYFA 2QONA 5CAVA 3R83A 4S30A 4O6LA 4CFMA 1KWPA 4EJ7A 3D5XA 3F2AA 4D4SA 4EJNA 3ULZA 2X2MA 4MBIA 5C8MA 4OT6A 1GAGA 1WAKA 3HV3A 2CN8A 5L2IA 4CRLA 4YJRA 4FIFA 4EUTA 4HPTE 1Q99A 2W5HA 3I5NA 3L9LA 3PP1A 4GK3A 4ZS0A 5FBOA 3TNIA 3ZUUA 4AGUA 3IGGA 5IA1A 3FZTA 4I6HA 2WTKC 3PPKA 4IC8A 4ERWA 1STCE 2ERZE 3RMFA 4HVHA 3UODA 5AA9A 1PRYA 3C50A 5DT4A 3RPYA 3GU6A 3NW5A 1FGIA 3QQHA 2JIIA 4IB3A 1CM8A 4OUCA 4AN9A 4YR8A 3FMKA 1JKLA 4G6OA 3NDMA 4R7IA 5J9YA 4CV8A 4FV2A 1CKPA 2GCDA 3SG9A 2PU8A 3PZHA 2Y6MA 4QPMA 4FIGA 3FXXA 5CAOA 3EN4A 5AJQA 2XH5A 2Y9QA 2GPHA 3P1AA 4BIEA 5CXZA 4OBPA 1I44A 5AP5A 4BVUA 3UDBA 3OVVA 4QYFA 3P08A 4NM0A 3VULA 3VBWA 4Y72A 1YI6A 5IH5A 3NVMB 2QR8A 3DZQA 3L9NA 3NX8A 4J71A 2XRWA 2GNFA 4RPVA 4IWDA 4WRSA 4XBUA 5CVFA 2PVFA 5AP1A 2ITUA 1BL7A 2BZIB 4IBMA 3N4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DBF A;  4CFF A;  1J1B A;  2R3O A;  1H00 A;  4V0G B;  4PV0 A;  5GIP E;  4AOJ A;  3KVX A;  3P7C A;  4ZIM A;  5KMI A;  2P2I A;  2R3Q A;  2GQG A;  4EEV A;  4EON A;  3F2R A;  3FXW A;  3ORX A;  4RX9 A;  3NUN A;  4NST A;  4F7S A;  4FZA B;  4UEU A;  4JRN A;  5BVF A;  4NM3 A;  3LXL A;  2WQN A;  3UVP A;  5BVD A;  4BZD A;  4C57 A;  4L42 A;  2V7O A;  3ACJ A;  2IF8 A;  4MD9 E;  2JKK A;  4HYU A;  5EI2 A;  4DAW A;  4UWC A;  3A7I A;  3LCT A;  3ZTX A;  3O0G A;  4E5B A;  2YJR A;  4RA4 A;  3P7B A;  2PY3 A;  1YDR E;  2QKR A;  3ZU7 A;  4HGT A;  4YO4 A;  3LCK A;  4O7Z A;  4ALV A;  4OLI A;  5ETF A;  4Q2A A;  4W4X A;  4XG2 A;  2RFE A;  3FXZ A;  3R7E A;  1H07 A;  5AP4 A;  4AXF A;  5J87 A;  4I0R A;  4FZD B;  2PYW A;  2YA9 A;  4O96 A;  3TV4 A;  1SNX A;  1ZZL A;  1PYX A;  3CKW A;  1QPD A;  3EYG A;  3NUU A;  3QLF A;  1PXM A;  3ZCL A;  4F9A A;  2C5X A;  2W1H A;  4D2S A;  1OBG A;  1LUF A;  2W4J A;  2B53 A;  3ROY A;  2XNM A;  4C4I A;  1XKK A;  3PJ1 A;  5AM7 A;  3BHU A;  1MRV A;  3VRZ A;  4YZM A;  4J96 A;  4FTM A;  2RKU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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