4FTQ | Genus

Total Genus 79

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	268
structure length	254
Chain Sequence	VPFVEDWDLVQTLGEGGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__2708290776455877__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__2708290776455877__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4FTQ/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__2708290776455877__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"2708290776455877","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4FTQ/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__2708290776455877__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Crystal Structure of the CHK1 rcsb
molecule keywords	Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus	79
structure length	254
sequence length	268
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2012-06-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ftqA02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4ftqA01

2FB8A 2XVDA 5AP7A 2FSTX 3LFEA 5CS6A 4PL5A 5LWNA 1P4OA 4HYIA 3V5QA 3OVVA 4FKOA 4R7HA 3RZFA 4KSQA 1V0OA 4TWNA 3HDMA 3MN3A 5ANIA 4PDOA 2QOOA 2OLCA 2BZIB 4O38A 1R78A 4S33A 4E3CA 4TY1A 1WBVA 2I0YA 2UW4A 2XEYA 3PSCA 2B9HA 5DRBA 4CLJA 2BAQA 5HGIA 4C8BA 4O2PA 4E7WA 5CSPA 2F57A 2WTJA 4DEGA 3JS2A 1YOMA 3LQ8A 4NSTA 5AUYA 3W18A 3NW7A 4AGWA 5KX8A 4PMSA 4DGGA 4S31A 4A4LA 4F1MA 5JRSA 5C03A 1WVWA 2C5YA 2B52A 3GOKA 4WIHA 2ETMA 5J1WA 2V7AA 3SRVB 1BL7A 1CKPA 4O83A 5GJFA 4D4RA 5CXZA 5DI1A 4Z16A 4U3YA 3OW3A 3ENHA 4YJSA 5E1SA 3D2IA 3MTFA 3F5PA 3PPZA 3WYXA 3G2FA 3W16A 5BVWA 4ASDA 4GSBA 2YZLA 2HZNA 3QQKA 1T46A 3EKKA 3BU6A 4QMNA 3COHA 5IZFA 4IEBA 4BDIA 2C6EA 3BQRA 4NCTA 1Q8TA 4IBMA 4J99A 3BBTB 4RVTA 4DAWA 3UNKA 4HZSA 5J7BA 4W4WA 4AT4A 5EYMA 2QD9A 3G0EA 2GQSA 3BYUA 1GIIA 1YW2A 1GIHA 3ERKA 5FD2A 4ZTMA 5JGBA 4BDGA 2I0VA 3HMOA 3BPRA 4K33A 2YWVA 3QAME 4JX7A 4F0FA 4RJ7A 1XR1A 1JSUA 3E93A 5IUIA 2H34A 5F4NA 4M67A 3SX9A 4XRJA 3ROYA 3MFUA 4XV3A 4UMRA 2R3QA 3QQGA 1ND4A 5TF9A 2W5BA 2G2FA 4HNIA 4CMUA 2W1FA 4XG9A 5CF6A 3LQ5A 3JUHA 4UMUA 4FK3A 2ZM4A 3MA6A 2X7OA 4GK2A 1IG1A 2HZ4A 5FM3A 4D5HA 3FAAA 4H39A 5IUHA 4KNBA 3NYVA 4XV1A 4AXAA 2DQ7X 3H10A 4WNOA 3HKOA 3IK3A 4D9TA 3DXQA 4ZXTA 1XBAA 4DTAA 5E8TA 1YWRA 4J8NA 3AMYA 4H3BA 1G8SA 3VQHA 4DYMA 4X3FC 4MNEB 5AJQA 3FMHA 1WFCA 3HUCA 4GFGA 3PJ8A 4X2GA 3QTUA 3GCUA 4O81A 3KU2A 1Q61A 3LCDA 1M7QA 3EQGA 2HENA 4MQ1A 1OUYA 2W4OA 3P79A 3RPVA 3WYYA 4TWPA 5JRQA 3RBWA 3ZZEA 1JNKA 3ALOA 4QMVA 5AM7A 4AN3A 2OJFE 4LGHA 3RZBA 4N4SA 3KRRA 1ZY4A 4RWIA 1RE8A 1W83A 4QRCA 3CR0A 5EW8A 5HG7A 5K0KA 3R1YA 3IOPA 2QU6A 3OOGA 1FINA 2BHHA 2WPAA 1OKZA 3FC2A 4HGLA 4YO6A 3OUNB 4RPVA 3ZO3A 4RQKA 3BKBA 4CSVA 5CF8A 4UEUA 1CTPE 1ZMUA 3SG9A 3P7BA 5CYIA 3FQHA 2X8IA 1Q99A 3CQWA 3FMEA 4IWOA 3V5JA 4RFZA 4RWLA 4EK6A 3IW5A 1FMOE 4FGBA 2BRBA 3ZFXA 3OTUA 2H6DA 4O22A 3EZVA 1U59A 2C30A 5G1XA 4MAOA 5AA8A 2OH4A 3M42A 3R71A 3NUAA 2QOLA 4LOQA 4F08A 3SG8A 4MXZA 4AT5A 2UZNA 3Q4CA 4RMZA 2JFMA 4E4MA 4GL9A 5LVNA 3BLRA 4QO9A 3K5UA 1ZYLA 3H30A 3U6HA 4YJTA 3R21A 3POOA 4FKSA 4IJ9A 1Z5MA 2XA4A 4FKVA 4FSWA 5AUUA 4UX9A 4GIHA 4DG2E 1IA8A 1ZXEA 3QLFA 3BBWA 4YJNA 3R83A 2UUEA 1O6YA 4M3QA 2XJ2A 3ZFYA 2X9EA 3MB7A 4FTNA 2VWVA 4JG7A 5JGAA 3DOGA 3FKNA 3FZOA 3CKWA 4W4YA 3A8WA 1H26A 4FKWA 3KMMA 4K6ZA 4C57A 5M56A 3FI2A 4C62A 2JDTA 2W1CA 2WNTA 4IM2A 2UW9A 3VVHA 2UZWE 4IB1A 2OICA 2R5TA 2YIWA 5EDQA 4IX3A 2JGZA 3C5IA 4C37A 1YXVA 3II5A 3VUMA 4FGRA 5K5NA 2WMRA 5E9EA 5FRIA 3OFMA 4Q5EA 1CM8A 2VGOA 5A4TA 5JFWA 4FX3A 4GG5A 4EZ3A 4XP2A 2H9VA 4HGEA 3LHJA 5DR6A 5T3QA 3OHTA 2OIDA 1QCFA 5TOZA 3JVRA 4RJ8A 3T9IA 5KMJA 2C6IA 3QTRA 5H3QA 3LFFA 3A60A 3CTQA 3TACA 2EB3A 5AP5A 2UVZA 5I9XA 3PYYA 4USEA 1GOLA 2BFYA 3IG7A 3FQEA 3IGOA 4AS0A 4FTUA 4APPA 4DG0E 1WBWA 2J2IB 3MA3A 4MBIA 1OIQA 5C9CA 2ZV2A 3QALE 3TZ9A 4DTKA 4IX6A 2O3PA 4WT6A 4XG8A 4Y83A 5EM6A 3FWQA 3BU5A 1Q24A 3KMUA 5D41A 1YXXA 3SA0A 4D9UA 2WQNA 4L3JA 2UW3A 4RA4A 4RC3A 2YAKA 3KF4A 4U79A 3VS1A 5IQBA 1ZRZA 2J7TA 4PNKA 3VIDA 2JAMA 4HZRA 3UOJA 3E5AA 4IACA 3QA0A 3AG9A 3VS4A 4I5HA 3UQCA 2WAJA 2W4JA 5HO6A 4I6HA 3DKCA 4ASXA 4U5JA 4EOSA 2PY3A 4KS8A 1VJYA 2RKUA 3MDYA 4KKEA 3ZSIA 4CFMA 4JXFA 5AM6A 4RFMA 4DCAA 3QTWA 2R0IA 4WNPA 3RM7A 2ZDTA 3I0QA 4G3EA 1DI8A 1ZMVA 2A27A 3IOKA 2IW8A 1U54A 4A9UA 2A19B 4IVCA 4FIJA 4KBAA 4TYGA 3AD5A 3AC4A 2YIYA 4DEBA 3OCTA 4MXOA 4C38A 2WMVA 3L9MA 4RIOA 3A7HA 3C0HA 3E63A 4J97A 3WE4A 3GB2A 2DYLA 4XV9A 5CI7A 4R7BA 2BZJA 4GUEA 2ITUA 2UZDA 2W9ZB 4BBMA 2VWIA 5F20A 2WMSA 1Q5KA 4JQEA 1PKGA 5EKNA 4EH9A 2GTMA 4FR4A 2O0UA 5FEDA 3WZDA 4EK5A 2HXQA 3D5UA 1ZOEA 2I0HA 3NW5A 4BCJA 4BDHA 3ZXZA 1OBDA 3LCSA 3V8TA 3GCPA 3TJDA 4AW1A 4KUJA 4R1VA 2B55A 3M2WA 4OTGA 4BIDA 3ZEPA 4YHFA 1WMKA 1WVXA 5FG8A 3P0MA 2BAJA 3F3ZA 5LARA 4MNFA 2OIBA 4BN1A 2AUHA 3P1AA 4TT7A 3PXFA 3EFLA 4PL4A 5IA2A 3ZSHA 2QNJA 4YNEA 4O2ZA 4DFLA 4Z3VA 3UOHA 3LAUA 4TW9A 3E8CA 2QO7A 2WMUA 3LLAA 1M52A 4BCQA 4CQEA 2Z8CA 4I41A 2RG6A 4O6EA 3FI4A 2C68A 4Y8DA 4FV2A 5DA3A 4HVSA 4F9BA 5K4IA 4CFUA 4FEVA 3VRZA 4W8EA 3ZRKA 1WAKA 4BI0A 4F9AA 3R9HA 5K9IA 3OUKA 3E64A 4AOTA 4O7ZA 1Q8UA 3NCZA 5HVJA 3BE9A 1V0PA 3VQUA 4TZRA 3UYSA 2E9UA 3R7VA 4CFWA 5FXRA 2XMYA 3BIZA 1Q41A 4E6DA 3DGKA 3E7VA 2GS7A 4NIFA 3PDTA 2QOIA 3KL8A 3DLZA 1WCCA 2Z7QA 1Y57A 2C3IB 5LVLA 4E4NA 4XG4A 5JMSA 3FZ1A 3EQBA 4KD1A 4DGLC 2IVUA 2X7GA 4ITJA 4W9WA 1W82A 5CQUA 5AP2A 1P4FA 2VTLA 2ITQA 3IDPA 3QKLA 3Q9ZA 5IKWA 2C6OA 5CU4A 4MD7E 3N4UA 1UKHA 2HXLA 3EH9A 5EKOA 2VTJA 3OBGA 2UZOA 4NJDA 5F1ZA 4P5ZA 4EC9A 2EU9A 2YJRA 5EW3A 3UQFA 4PNIA 1GZKA 4IFGA 4FL2A 5LOHA 2HWOA 1Q97A 1Y6BA 2YDIA 4G31A 4JDKA 3G9LX 4PL3A 1H1RA 3DJ7A 5HG8A 3S3IA 2J51A 3BU3A 3UO4A 1U5QA 4YZBA 4FTCA 3KXGA 4FZ7A 2GHGA 4F6UA 2XIKA 4TYJA 4YLKA 2IPXA 5AR2A 2C5NA 2P33A 4JQ8A 4YC3A 1RDQE 2BRGA 4J7BA 2CNVA 4PPCA 1MUOA 1O6KA 2WQMA 5M09A 2NO3A 3I6UA 5C8NA 3UJGA 1YDRE 2CKPA 3O71A 3F66A 4FV8A 2YABA 3U9NA 3VW8A 2BMCA 1HCKA 2P55A 4FNZA 2ITZA 4RIWA 3H3CA 3LOKA 3D15A 4FT7A 3TWJA 5ICPA 5EQYA 2XM8A 4CFXA 3QD3A 2P0CA 3AD4A 4DC2A 3OWPA 4FSMA 3BWFA 2YLFA 3MIAA 4MBLA 1QPJA 2PVJA 2VTNA 4D58A 2XYUA 5IH5A 3HRFA 1PXMA 5C4KA 2RFNA 5FP5A 2G2IA 5E7RA 4OTIA 4EH8A 4BDDA 2GHMA 1MQ4A 3U6JA 4FKUA 2QONA 4W8DA 2ZMDA 3HZTA 4KIOA 3VBWA 1UNGA 5EHOA 4HGTA 2O63A 3FHIA 2VWWA 3FMNA 4QQTA 4YBKA 3OWLA 4OTFA 2X4ZA 4EJ7A 4O7RA 5AUZA 2WGJA 3M11A 3P7CA 4I5MA 4F0IA 5J5TA 1B6CB 1YXTA 3P9JA 3D0EA 5EI6A 4FVQA 2YM7A 3TIZA 3VULA 3PVUA 2GNGA 2BPMA 1X8BA 5AAEA 4AA0A 2OIQA 4AZTA 1MRVA 5B2KA 3FEGA 4NWMA 4BFMA 4MH7A 3QGWA 3RINA 4MBJA 2PMNX 3LJ2A 4FZDB 5K5XA 3A4PA 3E8NA 4JIKA 2XUUA 4PQNA 4DHFA 2WOTA 4FKIA 3Q4TA 4RJ5A 4N57A 4ZTNA 1XH8A 4PP7A 2X1NA 4CZYB 4J95A 4W9XA 3QQLA 2GS6A 4D55A 4EOMA 3ZO4A 5T68A 2PVFA 4RVKA 2V7OA 3MY5A 4JI9A 1E9HA 5B0XA 2HY81 2R3PA 2JKMA 1WVYA 2W4KA 1S9JA 1Q8ZA 2YCQA 2PMIA 4KABA 4RJ6A 5KZIA 4CTCA 3V5LA 5ETCA 4XEYA 4YPSA 3NUPA 3Q2JA 3U55A 4S32A 4KA3A 5C27A 1LUFA 3D2KA 3DK6A 2OU7A 4CT1A 4XX9A 4IVAA 3C50A 4R7IA 3H9FA 3LVPA 4WRSA 2G9XA 2Z60A 3R8LA 1JKSA 4E6QA 1PMUA 5HHWA 2R0UA 3VBXA 3MY0A 3VC4A 2X2MA 5I9YA 3L1SA 3DAJA 3QCQA 5LVPA 4NYEA 2BDJA 2GSFA 2YCFA 4JRNA 3RM6A 3DPKA 2BZKB 4ASZA 2GU8A 4JBVA 1Q8WA 1JLUE 4F9CA 3IW6A 3TKIA 5KZ0A 3GEQA 5A46A 4IANA 3FLNC 4OTPA 4DTBA 4FG9A 4Z7HA 3E87A 2Z02A 3DK3A 3D4QA 5BYZA 3LIJA 1H1QA 3I81A 3F3VA 4G17A 4ACMA 4HVHA 3IKAA 3FLWA 3GQIA 4UMTA 2G15A 1IASA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4FTQA

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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