4FTUA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
278
structure length
270
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 83
structure length 270
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftuA01
4LM5A 5DPVA 4TYGA 3ZSHA 3OHTA 4RFMA 3V51A 4FTQA 4WT6A 2ETKA 1KV2A 3FQHA 4JBQA 3DK3A 2DS1A 4ENXA 5HE1A 5JQ5A 5DMZA 4ZSJA 3T9TA 1NW1A 3HMMA 2RIOA 5E8ZA 4BDKA 3FUPA 1UVRA 3WYYA 5I9WA 1IRKA 3F9NA 1SVGA 5FXRA 1OGUA 4FKLA 2EU9A 3UE4A 5LCJA 3E63A 4BTKA 5BVDA 2BAQA 2C68A 2UZEA 4AG8A 1OB3A 4H3QA 1ZYDA 5FEQA 4ZTNA 5ITAA 3LKMA 4YBJA 3MY5A 5KBRA 5HIBA 2PUNA 2WTDA 2J90A 4Z3VA 4K2RA 2XA4A 3G6HA 3DB8A 2Q0NA 4G3EA 4QMQA 2VTOA 3TNIA 4DBXA 2QU6A 4DEDA 4Z16A 2IVSA 4EC8A 2WIPA 4FG7A 5K5NA 2V7OA 5CU0A 3IW4A 3PWYA 2RFNA 5C27A 4FZDB 5KMIA 4BWXA 1OPJA 3M2WA 4IX6A 4R1VA 3EFLA 2I0HA 2OF4A 2WNTA 1OIUA 4YZMA 3DBQA 2C6DA 4W9XA 4OBOA 4U7ZA 4ITHA 1SNUA 2JITA 4IM0A 5AUUA 4QMWA 3TACA 2F2CB 4FV4A 4RVKA 5ICPA 4PMTA 2XK6A 2Y0AA 3NLBA 4X2FA 1Q62A 4EQUA 4F6SA 4U5JA 3IOPA 2FSTX 4A07A 4WRGA 4OGRA 2ACXA 5BYYA 4O7VA 5IQEA 2E9VA 4I1ZA 2XK3A 4G3GA 4PTEA 3IW7A 4YPSA 1PW2A 1XO2B 3DJ6A 2YCSA 2J50A 4UWBA 2YM4A 3LCSA 3QL8A 4YC6A 1OPLA 3C9WA 1DI9A 3MB7A 3C1XA 3I4BA 1YOLA 4FV9A 3TT0A 1PHKA 3R28A 4BIEA 3HZTA 3NWWA 2VNWA 1OKWA 4AF3A 4EOSA 5L6OA 2XIRA 4JBPA 3V5PA 1QPCA 3VHEA 4E7WA 3R1QA 5HNBA 3GOPA 4MK0A 3R7YA 4FL3A 4HVIA 4CZUA 4F0GA 5I9UA 1M17A 4O7NA 4CKRA 4IWQA 3HL7A 4XOZA 1Z5MA 1UKHA 3RK5A 4CLJA 5KHWA 5FXSA 2X4FA 5IH6A 2X39A 3EQCA 4KD1A 5C1QB 2ZV2A 3P86A 4XYFA 4RX8A 4GVAA 2BPMA 5EW8A 3HUBA 3KF7A 4CZTA 3MGYA 4M97A 2BMCA 4TYEA 3ZYAA 4IDTA 4TRLA 4CYJA 4ZIMA 4JXFA 2H6DA 4WNOA 2O63A 1Y6AA 3OTVA 3LM5A 3OFMA 1YQJA 3CY3A 3D15A 3R73A 4YJPA 4F7LA 1KE6A 2GS2A 2CN5A 2B9HA 4FTOA 4NTSA 2OJFE 2ZM3A 2IW6A 1WBVA 4X3JA 4A9YA 4D4SA 4FOBA 5GINE 1OITA 3ET7A 4YU2A 4R5SA 4U0IA 4OTPA 1XBAA 2RF9A 2J51A 3ZO2A 5CNOA 3KVWA 4FTMA 4GG7A 4GL9A 4LMNA 4APCA 4MQ1A 4YURA 4MH7A 4K11A 4C58A 4I21A 1LPUA 3A8WA 3LJ2A 3R01A 4WA9A 4JX3A 2BIKB 4G31A 4E4NA 2QO2A 3ODZX 3RK7A 3ORKA 3NS9A 4UXQA 3GCUA 4ZEGA 3QRKA 5AM7A 2PK9A 4JL9A 1JSTA 4NWMA 3PVUA 3PWDA 4OAUC 2X8IA 4FL1A 4A7CA 5AX3A 1R78A 4E20A 4FIIA 3MH2A 2UV2A 5AM6A 2WQNA 3TM0A 2OJJA 2JDOA 3E8EA 4R7HA 3ZUTA 4EOLA 1W0XC 2C5NA 1BI7A 2J0MB 2R3GA 3T9IA 4YC8A 3ALOA 2E2BA 3V01A 3PZHA 3ZBXA 3HA8A 4X3FC 5D7AA 2X7GA 5C8KA 3BRBA 4KBKA 2QI8A 3FI3A 3F5UA 5F20A 3EB0A 2EVAA 4IW0A 5AP7A 2XIXA 3RM6A 5DR9A 4FKPA 3UO5A 4BY9E 3NYOA 4WG5A 2DWBA 5KMNA 2C5XA 3ZZEA 4ANNA 2G9XA 4RQKA 2XKFA 2YIWA 5CS6A 1QL6A 4EQCA 3E8NA 3TDWA 2PVHA 2R3QA 4FKGA 5J9ZA 3G0EA 2FYSA 2WELA 2NO3A 1DM2A 3ENHA 5IQHA 2YDKA 4G6NA 4O83A 3KREA 3F2NA 3RP9A 3U6JA 2JC6A 4D5HA 4M7IA 4YBKA 1PXJA 4U79A 4ZZMA 5C01A 2ETMA 2HCKA 5HEZA 2JGZA 3ANQA 4GFMA 1YXUA 2VD5A 1JPAA 2QCSA 3SA0A 3EOCA 4D4RA 3NUSA 5IQDA 4MXZA 4PUZA 3WF9A 4C34A 4ZJVA 4AA4A 3WZDA 2W9ZB 2WO6A 3UODA 5HCXA 4ASZA 3ORPA 2YCRA 3KC3A 5IG1A 4A9UA 3O8UA 3RBWA 4FV3A 4GFGA 4O81A 1IAHA 4R78A 1Q5KA 2XH5A 3D7TB 2HZ4A 4J8MA 4K0YA 3AMBA 3NYVA 4LRMA 5CU4A 2PVNA 5EM5A 3FXZA 5CAQA 2XK7A 1BMKA 3TNPC 3NIZA 5DEWA 4YO6A 2PZPA 3CP9A 4BDEA 4HJOA 2FSLX 4RJ5A 4CT2A 2JAVA 4Y95A 2F7EE 4RIYA 4F0FA 3E7OA 2A4LA 2BDWA 4S2ZA 4UXLA 4HNFA 4FICA 1NVQA 5AR5A 1PKDA 2ITQA 2C47A 1P4OA 4PMPA 3Q6WA 3R8PA 4ALUA 1U54A 5BYLA 3MVHA 5GIPE 4O6EA 3E3PA 2YIRA 5AR3A 2YCQA 3OEZA 3Q2JA 4YHFA 1DAWA 3IS5A 4F9BA 4DTKA 5JK3A 3VUTA 2XYNA 4DCEA 1B38A 2X9FA 5AEPA 3HYHA 4WO5A 3KXGA 3IO7A 3V04A 4BCQA 3GC9A 3DKCA 4DEGA 4D0XA 2ITVA 1UA2A 1YOMA 2GU8A 3S3IA 4QO9A 3HA6A 2IW9A 3VBTA 3BYMA 2W1EA 2IO6A 4EHGA 3RALA 3ZDUA 2XIKA 4E3CA 4O7WA 4FKQA 3KMWA 3BHHA 2UZBA 4UB7A 2EXEA 2OXYA 1OBDA 4UMPA 2VWXA 1XBCA 4Y5QA 4K9YA 4FTCA 3FXXA 1TVOA 3GENA 3SDJA 2Y9QA 2CGUA 3HVCA 3QZHA 5E1SA 4DGMA 5CAVA 3BV3A 3F3WA 1PYXA 2ERZE 3NAXA 4FV2A 3A7FA 3LZBA 4PPBA 1YDRE 2J5EA 4XG6A 4E4MA 2OG8A 4I6QA 3UOKA 5JZJA 4O2ZA 3HRCA 3MPMA 3H30A 4MVFA 5IQFA 3HMNA 2WIHA 4GIHA 4WBBB 4ACGA 1Q24A 3ZLSA 3F3ZA 5HE0A 4XV9A 3BKBA 3I5NA 3QKLA 5CSXA 4EKKA 1X8BA 3P7AA 3PE2A 2XCHA 4IC8A 4BN1A 4FTUA 1VJYA 5M07A 3TEIA 2R64A 3C4EA 3PXRA 3FY2A 4IAKA 3HECA 2XZSA 1YXXA 4QYGA 5HU9A 4DHFA 2Y6OA 4EH6A 2RKUA 5L3AA 3CQWA 4WNKA 5CVGA 4BBMA 4CQGA 4YJNA 3I60A 4EZ5A 3W2SA 4BI1A 2ETRA 3FMLA 2BROA 2XK9A 1O6KA 3EKKA 3A4OX 4GK3A 2V0DA 3SC1A 5I9YA 4FG8A 1URCA 3AT3A 3R8LA 4A9TA 3EMGA 3EQBA 4HYIA 2VTJA 3RNIA 1U4DA 2Z2WA 4FVRA 2WAJA 5FTQA 4JIKA 3UP7A 5LMKC 4FTLA 1G8SA 2DQ7X 4MWIA 4AT5A 4ZK5A 1Q8UA 4ACDA 2QG7A 2CPKE 4EBVA 2AYPA 4Y8DA 1Y6BA 4YTIA 4EK5A 3ZU7A 3IW8A 5E8XA 4NM3A 4B4LA 3IK3A 4FT0A 4FYNA 2ITWA 2XCKA 4L3PA 2I40A 2JDSA 3KMMA 3GNIB 3IDCA 4BDGA 5L6PA 1ZYLA 5GJGA 2HW7A 4X3FB 3W16A 3P08A 4QNYA 1OIRA 1JSVA 1U5QA 4QMPA 1OIQA 3DTCA 4PX6A 4K6ZA 4TL0A 5AAFA 5I5ZA 5CF5A 3DS6A 3RI1A 2Z7QA 2OO8X 2XBJA 4GJ3A 4BCIA 3PJ8A 4E26A 2WEVA 2PSQA 2XIZA 4MNEB 4CQEA 4P5ZA 3IKAA 5HGIA 4GFOA 3EQGA 4FEQA 3TKHA 4CSVA 5M06A 2PE2A 5IQBA 5CEKA 3O51A 4EOKA 4O7ZA 3T3UA 1BLXA 4AOJA 4EZ7A 2P55A 4U45A 4BIDA 4U97A 3O8TA 4AN2A 5AA8A 5BUEA 5J1VA 2WHBA 4H1JA 4QMTA 3KRXA 3QD4A 4IX4A 2QU5A 4K33A 3ZRLA 5LWNA 4DEIA 2FSOX 2VUWA 2W1ZA 3SQQA 1L8TA 2R3IA 3MH0A 4ZLOA 3LCDA 3U54A 2BFYA 4C61A 3K5UA 3PP0A 3UNKA 1XH9A 3VUMA 3F2RA 2X6EA 2HZ0A 4J8NA 2R4BA 1PF8A 5IA4A 3PVGA 3MH3A 3OROA 3AD4A 4NZWB 3BYVA 3CQUA 5J95A 4GMYA 4AUAA 3BU5A 1FVVA 5HIDA 3R7GA 1H01A 4QQJA 4L01A 5CTPA 3GC0A 4I0TA 5IZFA 2ZM1A 4O2PA 4KS8A 3UZPA 4YPDA 5BPYA 1R1WA 3AMAA 4ANBA 4X3FA 3BLQA 3MA6A 4IC7A 4BCHA 1K2PA 4EOOA 4NT4A 3UIUA 5HHWA 2QOFA 3GB2A 3WF5A 5M4CA 3BE9A 2R3RA 2VTAA 5H8EA 4F6UA 3VO3A 2PL0A 2J6MA 4RIXA 1XH4A 3A2CA 4BI2A 5JH6A 4FKTA 4LI5A 1WVWA 2FO0A 4FUYA 5FQDC 5IEYA 4FSMA 2XB7A 2PVRA 1YVJA 3NNXA 3C7QA 4RJ8A 5ETCA 4C4HA 1KE8A 2CKQA 4L45A 3L8XA 3BBTB 1VEBA 5LMAA 3VRZA 1R39A 5AUZA 5EG3A 4DN5A 1LP4A 2J0JA 4A4OA 4LL5A 4GV1A 1FVRA 2UZNA 2C4GA 4W4YA 5IA2A 3ZLXA 5C8MA 3CC6A 4N70A 4EH3A 5L2IA 3C4XA 3GEQA 1UV5A 2GS7A 3OTUA 1MQBA 2RL5A 3BYUA 4E6CA 5CXZA 5JGDA 3D5UA 4M15A 5EM7A 3LJ1A 1OKZA 1ZYSA 2YM8A 3ZO3A 5CF4A 1RE8A 3DZQA 4KRDA 3QQFA 4EK3A 5CEQA 3RHXA 3BYSA 5JEBA 5JGBA 2WU6A 4S30A 4O1OA 4R7IA 4EOQA 4BL1A 2QOCA 5HTCA 4UX9A 3LVPA 4C0TA 3ID6C 1DI8A 1A06A 2ZYBA 2OZOA 3GCPA 2VO3A 1H27A 3PRIA 3FYKX 4RBLA 4BCFA 4YZBA 4XUFA 5DA3A 3PP1A 4BGHA 4RJ6A 4BC6A 5M08A 3ORMA 5B2MA 4V01A 4RSSA 4FT5A 4EWHA 3ZFYA 3CS9A 3Q53A 3BELA 3MIYA 4YJTA 3ZRKA 1AGWA 3D0EA 4O0TA 1UNHA 5LJJA 4L3JA 4A4LA 4IX3A 3Q32A 4CFUA 5AP2A 3MDYA 3HP5A 5DNRA 3NMUF 1PKGA 5AFVA 3A7HA 5FBNC 5JRQA 2CKPA 5KZIA 4I94A 2R3NA 3DKFA 4NTTA 3TZ8A 1UU9A 3VS6A 4RA4A 2QO9A 3L9LA 5CNNA 5HO6A 4FR4A 4FV7A 3ZM4A 4O84A 4D2TA 5DT3A 3KF4A 5HG7A 4OAVB 4JIAA 5HLWA 3R6XA 2YERA 2XNEA 3TJDA 3WZUA 1FMKA 3QLFA 3MYGA 4NKAA 5J7BA 3ULIA 4O38A 3S4QA 2PUIA 4X6QC 3OBJA 3Q4ZA 4BZNA 4KIKA 3PVBA 2X2LA 1KE9A 3SXSA 2I0VA 3L8PA 4FX3A 4D0WA 3R7OA 3DAKA 3FMEA 5DT4A 4C4GA 2QKRA 4HCTA 2B1PA 3POOA 4LGHA 4MD8E 4RG0A 1H0VA 2C3KA 3WBLA 4AA0A 1MRUA 2ERKA 5DVRA 3R1YA 5FG8A 4GW8A 3H3CA 3R8UA 4BDAA 3QRUA 3SW7A 5E92A 1H4LA 1IEPA 3LQ5A 3PFQA 4JRNA 5FDXA 4AOTA 3HMIA 2VWZA 3ZHPC 2ESMA 4RT7A 5DYJA 2P3GX 2LAVA 4FODA 3ZCLA 4DGNA 2YJSA 3GGFA 4BDCA 1ZY5A 4YUQA 3E92A 3DBDA 3MY0A 2JKOA 2ZM4A 4FI1A 4MD7E 2GFSA 2HK5A 4D28A 3V5LA 4NW5A 4CMOA 4HNIA 3DDQA 3FI4A 3IW6A 4DEHA 1J7LA 2CCHA 1Q61A 2ITOA 3FQSA 2R3KA 4G5JA 4JG8A 3COIA 1H24A 3R63A 3VF9A 2OKRA 4BRXA 4CNHA 2C6IA 2PVFA 3FHIA 5I9XA 4YHJA 2VWWA 3GQIA 2O8YA 3CLYA 2WQMA 4Y72A 3KULA 4IAZA 4ZTHA 3R9RA 3MWUA 3EN5A 4MXAA 1F0QA 4XMOA 4D9UA 3MJ1A 5K0XA 3R02A 3NUUA 5HVJA 4RRVA 4XP2A 2YM5A 5DR6A 4IZ7A 1GIHA 2YHVA 3I7CA 4ZP5A 3KA0A 2GTMA 2R5TA 4FSZA 4ANSA 2R7IA 4MXXA 4GKHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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