4FV3A

Crystal structure of the erk2 complexed with ek6
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
347
structure length
346
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the ERK2 complexed with EK6
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 346
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fv3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fv3A01
4E20A 1P14A 4UY9A 4JAJA 2QC6A 3BYSA 2UVYA 4EOKA 2PVRA 3TDVA 5AR5A 1FVRA 4FSYA 3ZDUA 2HY81 1Z9XA 2YAKA 4FV7A 4MNEB 4ANMA 4CLIA 1QMZA 3EQFA 5EHLA 4TYEA 4EH3A 2OLCA 3SXRA 4PRJA 4DH3A 3VBXA 2JITA 3RCJA 3WYXA 3R83A 4DH8A 4XRLA 4AE6A 4DA5A 3NMUF 4JR7A 3BWFA 2JFMA 3KULB 4M12A 4AACA 5H3QA 3OUKA 4OTHA 4GFGA 4JNWA 3W2PA 4F0FA 2UUEA 4B9DA 2XK8A 5ICPA 2YDJA 3ZH8A 4TN6A 4A7CA 4OTIA 5CALA 1STCE 5B2MA 4XP0A 3WZDA 3H10A 3I81A 4ZJIA 5M09A 1YXSA 1Y8GA 2X6EA 3D2IA 1JSTA 2VO6A 4TL0A 2JAMA 3G6GA 3C51A 4LGHA 5IUGA 3GENA 4E3CA 3OY3A 1CKIA 2ZOQA 4RC3A 4XOYA 5HNBA 5IMEA 5IA0A 3ZFXA 3LFDA 4DEDA 3R1YA 5CF4A 5A4CA 4TNBA 2XYUA 4NUSA 2ZM3A 1WVXA 3NNXA 3HVCA 4WUAA 3I5NA 3LM5A 2QLUA 2WTWA 5IQBA 4A07A 3PE1A 2OZAA 3PSDA 3RALA 5BPYA 3AD4A 5FRIA 3W2RA 3W32A 3CPBA 3SW4A 2BZJA 1YOMA 3KU2A 5ETCA 3QD2B 4YNOA 4R7IA 4FTAA 4X6RA 4E6AA 3WZUA 4N4SA 3JPVA 2XIXA 3CBLA 2IW6A 4IANA 2R3GA 3P78A 4NIFB 3ELJA 3TXOA 5M55A 5J95A 4BIEA 4JR3A 3MV5A 4DINA 3PLAE 4ALVA 3KCKA 2GSFA 3IW8A 1JKTA 1HOWA 4BCGA 3UNKA 1YOLA 3OD6X 4F0IA 3SVVA 2X1NA 1H8FA 1UVRA 2QOQA 2HW7A 4TW9A 4EUUA 2XJ1A 4D4VA 4MH7A 4U0IA 5AP6A 4GFMA 3RAHA 4M7IA 5DN3A 2OJGA 4QTEA 4Y8DA 1Q8YA 3IW6A 3EIDA 4OT5A 4CCUA 4WBOA 4O7LA 4I6BA 5IQFA 1R78A 4RIYB 4R6VA 3ZRLA 5DG5A 4ANNA 2B9HA 4IZ5A 5IUHA 4OAVB 3KRJA 2QR8A 3EFKA 4BGQA 1PXKA 4PP9A 3MIAA 4G2FA 2JIUA 4HVHA 4CVAA 3DU8A 2O3PA 3LMHA 1KV2A 3O7LD 2W9ZB 3R0TA 4IX5A 1JSUA 2WPAA 3RAIA 3PLSA 2I1MA 3QCQA 1IR3A 4CT1A 3F69A 4M97A 4IWOA 4QMSA 5T3QA 4QMTA 3MB6A 4QMYA 4TWOA 2YLEA 3BBWA 2C0OA 4FV9A 3DLZA 3ZLSA 4R7BA 2YHVA 3HYHA 4WG5A 5LVLA 5F9EA 3FL5A 1REKA 3DGKA 5IF1A 4RJ5A 2RFNA 4XH6A 4AA0A 3DAJA 4RQKA 4DHFA 3PVGA 3HMPA 3PWDA 5EOBA 3RMFA 2YM6A 4LV8A 3HRBA 3ACKA 4ANSA 4G6LA 4RWLA 5IPJA 4YO6A 3MFSA 3PJ1A 3UIUA 2XMYA 4LV5A 4X3FA 2RFEA 5DRDA 2HWOA 1M2RA 2IZTA 4AW5A 4J53A 4JOAA 2PZYA 3PXFA 3CKXA 4U9AA 5M4FA 4YMJA 1UKIA 4FTLA 3PIYA 5JT2A 4CV8A 5HG8A 2HW6A 3JVSA 4RFMA 3C0IA 4AGWA 5L8JA 5C8NA 2JDSA 1Q41A 3QU0A 5CENA 3ZTXA 3GGFA 4A06A 3O0GA 1XJDA 3ZM9A 4HZSA 4KKEA 3AC3A 3VF9A 4F7NA 3IOKA 5HORA 1H1QA 3VBYA 4I4EA 2PSQA 4D2PA 4E4XA 3NLBA 2Z7RA 3PXRA 1XH9A 4FNZA 3WIGA 3CQEA 3LFEA 3A4PA 3MW1A 4AZWA 3F61A 4D0XA 3KREA 4M69A 4MX9A 4PPAA 3R8MA 4AFEA 3G6HA 5CAOA 3VS4A 3KEXA 4FC0A 3U6JA 3SD0A 4YZ9A 1KWPA 1PXIA 5M4IA 4H05A 1WAKA 4IB1A 4C4HA 3IW5A 4IC8A 1YHVA 3OFMA 2AC5A 4W4VA 3TNHA 3ZUUA 4I24A 3A2CA 4XNEA 4WG3A 4BDJA 5A46A 1YHSA 5AR8A 4FEWA 3R04A 2W1HA 2XNMA 3I0OA 2X8DA 1YQJA 5FDXA 4G6NA 4WA9A 4O7RA 4I1ZA 4JX7A 3NGAA 3U6HA 4FV8A 5EM6A 4U42A 4FICA 3A8XA 4PWNA 5FLFA 2VGPA 3NDMA 2XKCA 3SW7A 1Q62A 4R1YA 4E5BA 1M14A 1FVTA 3BWJA 3NSZA 4FT0A 1H01A 3VQHA 5FTOA 1H0VA 1QPDA 2VV9A 5BX0A 3NRMA 4CCBA 2QG7A 5JFXA 3EJ1A 1ZARA 2CCIA 2C3JA 4TYGA 1OIUA 4QMMA 4C3RA 1YXTA 2I6LA 2BZIB 3HA8A 5CZHA 3V04A 1E1VA 2VO3A 3ZRMA 4BHZA 4FTTA 2V22A 2UW9A 3ZC6A 4F4PA 3SOAA 3WYYA 5JK3A 4M13A 1SMHA 4LRMA 3KXHA 4YJSA 3LVPA 5BVWA 4IH8A 4XG9A 3UO6A 4ITHA 4MAOA 5CF5A 3I6WA 3D94A 2WEVA 3FMLA 5IQAA 3R1NA 4RX7A 3QHRA 4D2TA 2YM7A 2BR1A 4HGTA 2ETKA 3OXIA 2YIRA 4FTUA 4HCUA 1JWHA 4M66A 5F20A 5LQFA 1KE8A 2XK3A 4E93A 1XQZA 3FI2A 3MH3A 2HXQA 3BGPA 5FBOA 2UZLA 3W18A 1U54B 2JKKA 2QNJA 3MJ2A 5EKOA 3RP9A 1VR2A 2WAJA 4K2RA 4MXCA 3E7VA 4AW2A 4D5KA 4LOOA 3PWYA 1VYWA 4YJQA 1OKZA 3NW7A 5KMIA 2R5TA 4BRXA 4C62A 4MTAA 4LOPA 1KE6A 3FLQA 2YIXA 5KBQA 1H4LA 2C1AA 3G5DA 3KK8A 2YM3A 3MTLA 3OXZA 4XBRA 2BAQA 4FVRA 2QQ7A 4DEGA 4D1ZA 5HO7A 4QP6A 4RIOA 5HNGA 4IVBA 4BBEA 4IAFA 3KN5A 4EOPA 2Y4IB 2W5HA 2WD1A 5HLNA 1O6YA 3RZFA 4NZWB 2J90A 3AC8A 3H0YA 4M14A 5KMOA 3MA6A 5CI7A 1O6LA 2F9GA 4MVFA 4RA4A 4F70A 2JDRA 2WTDA 2OFUA 3AG9A 4KBAA 3H3CA 3K3IA 1OBGA 3MVMA 3P7AA 4E4LA 4ZS4A 5JN2A 4FIEA 4LGGA 5JQ8A 4BDCA 2YDIA 4EC9A 1LEWA 2A19B 4CTBA 3NCZA 3U4WA 2R3OA 4DEEA 4YHJA 1VJYA 4BDGA 1U5RA 4AA5A 4HOKA 4B0GA 2BROA 3A99A 1NXKA 1PXJA 1PW2A 2Y7JA 1QL6A 3O23A 3S0OA 3O7LB 5L6OA 4MWIA 3ROCA 3PY3A 3AQVA 3QZFA 3F66A 3FYJX 3VUGA 4ZJVA 4JQ7A 2QOLA 3GVUA 3MS9A 3FLWA 5K4IA 5LARA 5A4QA 4NU1A 4V0GB 4V04A 3UQGA 1ZYLA 3MY5A 4FYNA 4F7JA 4QQTA 5CSPA 3Q2MA 3BZ3A 4QMZA 3G33A 3GXLA 5CF8A 3MESA 3BI6A 3BU6A 4GFOA 3VBVA 3KRRA 3C50A 5A6NA 3FSFA 2W1CA 3IW7A 3B8RA 5LWNA 3KRXA 4RGJA 5M4CA 4G3GA 4E7WA 5ANDA 3R71A 4Q5EA 2X6DA 5CU6A 3ZBXA 2XKEA 3I1AA 5KE0A 5FXQA 4C2VA 3TKHA 3CS9A 3O8PA 4WO5A 3JS2A 4XCUA 5DBXA 1Z57A 2YABA 4N6YA 3RBWA 1WBSA 3RM7A 2SRCA 1OPKA 4JBOA 5CVGA 3OTVA 4FSRA 3EQBA 3RPSA 2ETRA 4G3DA 4MWHA 2CN5A 3BKBA 2JKOA 4CFWA 3TIZA 4AZEA 1WBTA 2W1GA 2Q0BA 1OMWA 5AV2A 4X3JA 4U97A 3L9NA 3CPCA 5HEZA 3L8SA 3F82A 3ZMMA 3ZO2A 4ANOA 4BCOA 3R7YA 2WELA 3HX4A 5HTCA 3KMWA 2X0GA 3C9WA 2B52A 3PA3A 2V7OA 4W8DA 1VEBA 3E3BX 2WOTA 5AV4A 5GJFA 2A4LA 4RC4A 2GNHA 4HVSA 1UU9A 1YWRA 4K11A 3LCOA 3VVHA 2O63A 3QC4A 3MYGA 2UZNA 2UZBA 4QP2A 2BFXA 5HBEA 2B7AA 3RNYA 3KB7A 3OWPA 2V0DA 5HCXA 4O7YA 3DZOA 4UXLA 3KCFA 4FIJA 5H8GA 3EB0A 4IVAA 4EQUA 4BZOA 3IQ7A 3GQIA 4MBIA 5DIAA 2H6DA 4BCHA 2QO7A 3RNIA 4BB4A 4RIXA 5HE3A 4AOTA 3L9LA 4KSPA 4TXCA 2PVKA 3KK9A 3LLTA 3RZBA 2JLDA 3VJNA 4MEDA 3RVGA 5AM6A 2FVDA 2RFDA 5H2UA 3TIYA 4J71A 4FL1A 4K8AA 3IPHA 2YWVA 1WVWA 3BELA 4L52A 5CSWA 3V5WA 1XWSA 3TTJA 4C4JA 5KMMA 1Y8YA 3LLAA 4FSWA 4ZP5A 4ZS0A 2BCJA 3BGQA 4E4MA 4EOIA 5LMKC 4MXAA 4ENYA 3ZO3A 4K77A 3A7FA 4N0SA 1OBDA 4JG8A 3DDPA 1HCKA 5IQIA 1U59A 4DN5A 1M2QA 1YDSE 3FYKX 3NW5A 5CF6A 2FSOX 2ITVA 5IQGA 4TKSA 5B0XA 5FEEA 3NUYA 5KMJA 2JDOA 3QFVA 5EYDA 3ZHPC 4BZDA 4E6CA 4N57A 2R3JA 2CNQA 3UMXA 5CTPA 5FXRA 4E5AX 3DQXA 5BYYA 4FUYA 4FKOA 4HYIA 3RK9A 4JS8A 4L6QA 2OGVA 2VTRA 3D15A 3E3PA 4PMTA 4FL2A 2X4ZA 4C59A 4CV9A 4II5A 3HZTA 3VJOA 4I41A 3ORKA 5T6KA 3UOLA 4AX8A 2W5BA 4YNEA 5CEIA 3C0GA 1KE5A 4HGSA 2UVZA 3BU5A 3U54A 1UWHA 2PVFA 3U51A 4CFUA 3LKMA 2CKQA 4J52A 5AP0A 4FL3A 3ETAA 4A4OA 2VTNA 3PXZA 3RGFA 3FKOA 2B9IA 2O64A 2P3GX 3EN9A 4PL3A 4BDKA 4YC6A 4QMPA 2OWBA 3T3UA 4W4XA 5J8IA 4L46A 4FEVA 1YI4A 3SGCA 3TV4A 3QCXA 3ORTA 2W1ZA 3CLYA 1ZMVA 4K33A 3UGCA 4G9CA 2XM8A 3JYAA 2R0IA 4I20A 4BCFA 3FXXA 3DAKA 1GIJA 4ASXA 3AT2A 3FJQE 2CPKE 1J3HA 3CR0A 4C4FA 1BKXA 4V01A 3DXPA 1ZOHA 1DAWA 4QP7A 3SAYA 5KX8A 2FYSA 3L8PA 3RAWA 4NEUA 4U45A 3UYTA 2GQGA 3GI3A 3KXNA 3BYMA 3P86A 4RVTA 5HIDA 4ZK5A 2PULA 3R9RA 3C4FA 2C5VA 5K0KA 2XJ0A 4EHGA 1OPLA 3DLSA 4H1MA 1RQQA 4UWYA 3GU7A 3QAME 3UNJA 4LRKA 3UIBA 3UPXA 3UZTA 2XUUA 2P55A 2C6IA 2A2AA 2OXXA 4PF4A 4PPCA 2RG6A 3DT1A 5L6WL 2QOFA 5D7AA 3TNPC 4YLJA 2QD9A 3Q53A 1BUHA 3K5VA 3VS3A 1BI7A 2ETMA 4E26A 4IDTA 2V7AA 4FGBA 4PQNA 1ZXEA 1SZMA 4AW0A 4EH2A 5E1SA 3WARA 4DAWA 3FAAA 5EM8A 3C4CA 3GBZA 3KXGA 4O1PA 3ZEPA 3DFAA 3FXWA 4TZRA 2PMIA 1YKRA 3ZFMA 2H9VA 4YPDA 4G16A 4BWPA 3JUHA 4O84A 4QP4A 2PZPA 1VYZA 5DT3A 4D1XA 1UV5A 2R3MA 5HD4A 4I21A 3M2WA 4IQ6A 5IISA 2ZVAA 4MQ1A 5BVDA 2YDKA 4UV0A 2XS0A 3OF0A 5EOLA 2GQRA 2P2IA 4KNBA 4L53A 2W9FB 3HEGA 3JXWA 3QTUA 1UNLA 3COIA 4RZVA 3ZO1A 4BN1A 5JSMA 5CI6A 3HGKA 2B9FA 4FZAB 5AFVA 3OWJA 2ITXA 4DFZE 3V8SA 4I0SA 3JY9A 1MQBA 2EXCX 1ATPE 2C69A 3I0QA 3PXQA 5FG8A 2IG7A 2VTLA 2VWWA 3PIXA 2HY0A 4JBPA 4EK3A 1JNKA 2OXDA 4QP8A 3KGAA 4E6DA 3TG1A 5B2KA 4BDDA 5JFVA 3EFJA 1PKGA 3R8LA 4OTQA 4P5ZA 4ZY6A 4D28A 4ZTNA 3S00A 2PE1A 3OEFX 4DCEA 1PMEA 4TWPA 4GG7A 5J1WA 3NPCA 4MF0A 2WQEA 4QYYA 2HAKA 4L68A 3D7TA 1U4DA 4GUEA 4XJ0A 5D11A 4MXZA 4NM7A 4P90A 3VIDA 3QBNA 3HV6A 3LAUA 4G5PA 5EM5A 4RJ8A 4DFYA 2B54A 1I09A 4KIKA 4E8AA 3KY2A 4JDKA 3RHKA 3FZRA 2OG8A 4K1BA 4PMPA 3AC4A 4YURA 4GKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E20 A;  1P14 A;  4UY9 A;  4JAJ A;  2QC6 A;  3BYS A;  2UVY A;  4EOK A;  2PVR A;  3TDV A;  5AR5 A;  1FVR A;  4FSY A;  3ZDU A;  2HY8 1;  1Z9X A;  2YAK A;  4FV7 A;  4MNE B;  4ANM A;  4CLI A;  1QMZ A;  3EQF A;  5EHL A;  4TYE A;  4EH3 A;  2OLC A;  3SXR A;  4PRJ A;  4DH3 A;  3VBX A;  2JIT A;  3RCJ A;  3WYX A;  3R83 A;  4DH8 A;  4XRL A;  4AE6 A;  4DA5 A;  3NMU F;  4JR7 A;  3BWF A;  2JFM A;  3KUL B;  4M12 A;  4AAC A;  5H3Q A;  3OUK A;  4OTH A;  4GFG A;  4JNW A;  3W2P A;  4F0F A;  1G8J A;  4I6L A;  2UUE A;  4B9D A;  2XK8 A;  5ICP A;  2YDJ A;  3ZH8 A;  4TN6 A;  4A7C A;  4OTI A;  5CAL A;  1STC E;  5B2M A;  4XP0 A;  3WZD A;  3H10 A;  3I81 A;  4ZJI A;  5M09 A;  1YXS A;  1Y8G A;  2X6E A;  3D2I A;  1JST A;  2VO6 A;  4TL0 A;  2JAM A;  3G6G A;  3C51 A;  4LGH A;  5IUG A;  3GEN A;  4E3C A;  3OY3 A;  1CKI A;  2ZOQ A;  4RC3 A;  4XOY A;  5HNB A;  5IME A;  5IA0 A;  3ZFX A;  3LFD A;  4DED A;  3R1Y A;  5CF4 A;  5A4C A;  4TNB A;  2XYU A;  4NUS A;  2ZM3 A;  1WVX A;  3NNX A;  3HVC A;  4WUA A;  3I5N A;  3LM5 A;  2QLU A; 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