4FV7A

Crystal structure of the erk2 complexed with e94
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
348
structure length
342
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the ERK2 complexed with E94
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 342
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fv7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fv7A01
3UGCA 5HQ0A 2F4JA 4L8MA 2JIIA 2UW3A 4DF3A 3D7TA 5HNIX 3R8MA 3PLAE 1KWPA 3FPMA 5LVOA 2ETMA 3SGCA 3KVWA 4OTWA 2PVKA 3IW8A 4NM3A 2XUUA 4JIKA 2FA2A 1VZOA 5FTQA 4G6NA 4DEHA 1FGIA 4RX5A 4D4YA 3I79A 3FLQA 5EM5A 4MH7A 1YW2A 3A8WA 5FDPA 5F95A 2OW3A 4F1TA 2G2HA 2RIOA 3HV7A 2C1BA 1KOAA 4YNEA 3EQFA 2IZUA 3O51A 1KV2A 3D14A 2J50A 3DU8A 4LFIA 5LWMA 5K0KA 3I0QA 1NA7A 4PL5A 4YJPA 5FBOA 4BCOA 2OJ9A 4Q2AA 4ARKA 3R6XA 1OUKA 4RA4A 2UZWE 3FMMA 4R1YA 4CKJA 1UU9A 4IE9A 4Z9LA 2C5VA 2R3JA 4FF8A 3WARA 3HMOA 3MIAA 4X7QA 4YZMA 3LJ1A 1WFCA 5EM6A 3SLSA 3BYVA 5I9XA 4D1XA 2R3OA 3UC3A 4QP8A 5M4FA 1G3NA 4FTQA 4FX3A 2G15A 4ASEA 4XLVA 2GNGA 3R2BA 3BHUA 2RFEA 3R01A 3QUEA 4WBBB 3FPQA 4BDDA 5BQ0A 2WMTA 3ATTA 2GMXA 3UVRA 1Q61A 2BAQA 2C5NA 4RSSA 4X6QC 1I44A 3NUYA 4C57A 4FIFA 3WZUA 3FC2A 3R7OA 4DH1A 5A4TA 2OXDA 4FTUA 1YQJA 4JRNA 5GZAA 5EDPA 4S34A 2PY3A 4QMPA 2PMNX 2XVDA 4XBUA 4K11A 3TM0A 5JGDA 2UVZA 5M55A 3ZOSA 3QQGA 2BVAA 4EOOA 2BRMA 3IPHA 4UMUA 4L6QA 3H9FA 5GIOE 4XS2A 1BI8A 3FWQA 4AP7A 1GIJA 1KE6A 2FYSA 4U97A 4C35A 2CLQA 4MXXA 3KCFA 1OITA 3OWLA 5J79A 4KBCA 4DA5A 3AD5A 2O8YA 4EUTA 3G90X 3ZC5A 2NP8A 4M97A 1NVSA 4XOZA 2PVNA 2PWLA 5FG8A 4I0RA 2EVAA 1SYKA 2XM9A 2E9VA 3MIYA 4UYAA 5CEQA 5A9UA 3PXRA 4R5SA 4CEGA 3AC1A 3KA0A 3DAJA 4WUNA 5L8LA 4RT7A 5KHXA 3ORLA 4D5KA 5AAEA 5BVFA 3QKKA 4EK4A 3GOPA 3ZSHA 2WIHA 1H08A 3KRRA 2JKMA 4PDYA 4X2NA 2WIPA 1XBAA 3VUTA 2ZDTA 3VQUA 3II5A 4D0WA 3PZHA 4AF3A 4JR3A 2J51A 3D5XA 5JMSA 2W1DA 5HE2A 4PWNA 3R1NA 4CFWA 4TNDA 4C62A 4N6YA 2GFCA 2J0LA 4OLIA 3BU3A 2C0OA 2HYYA 3Q3BA 1PMNA 1ZLTA 3NLBA 4F99A 3JY9A 5CU4A 1L3RE 2Y7JA 3O71A 5HBHA 2QOKA 5JKGA 2RF9A 4PPCA 2R3NA 3OVVA 4FV5A 1VYWA 4ZOGA 4B7TA 3QKMA 3KQ7A 4ZJVA 5IA1A 2YM8A 3CTHA 4AW2A 5HOAA 4U44A 3LQ8A 2IG7A 4TYGA 3ORZA 5CVHA 2OH4A 3MSSA 3R8PA 2UW7A 4PTEA 4PNKA 4U42A 4NU1A 4O0YA 4M66A 4R7HA 3U6IA 2BRHA 2UZLA 2CNVA 4BIDA 2PU8A 3PIXA 4DH7A 4O84A 4FV6A 4BL1A 3Q32A 3LCSA 1J7UA 4GYGA 4EYJA 3LOKA 3DB8A 4FZ6A 4YJNA 3FMLA 3QLGA 4TWNA 4FTKA 3MS9A 4HYIA 4MCVA 5AWMA 4DHFA 3DAEA 5ITAA 5A4CA 3LFQA 4MNFA 2XNOA 4F9BA 4D0XA 1FQ1B 2E9UA 5BYYA 3R83A 3NUPA 4RFMA 5M53A 4FE2A 4HVHA 3QX4A 4QTEA 5DR9A 2OO8X 3DK7A 4EH5A 4TW9A 5IDPA 4O0TA 4S30A 5KUPA 3TNPC 1Q24A 5AR8A 3HRBA 3TNWA 3UOHA 5HTCA 4IDVA 2V7AA 5HTIA 5EKOA 4HYSA 4C7TA 4LUDA 1JSVA 3FQEA 4I4EA 5J9LA 3EN5A 4QMWA 2XYUA 4N4SA 4RIXB 4J53A 5EHYA 2CCHA 4PY1A 3OCTA 3GC0A 4QYEA 4NSTA 2VO0A 1KSWA 4IW0A 1Y8YA 2HZ0A 2I0VA 2WQEA 1CMKE 5L2SA 2BCJA 1UNGA 3PA4A 4I41A 5HI2A 3BLQA 4CNHA 3PP1A 3EMGA 2DUVA 4GIIA 4F70A 2I7QA 4DAWA 3P1AA 3LE6A 1PXMA 3P23A 4CYJA 2XNNA 4WSYA 3NSZA 3TJCA 3HAVA 2OF4A 5HIDA 1F3MC 5E8TA 3IQ7A 3VQHA 2C6MA 4F08A 2XS0A 5GIPE 3EZVA 2WB8A 4XBRA 5KMJA 3RINA 2B52A 4F9YA 3C0GA 4MYGA 3B2TA 2C6KA 2JKOA 4K1BA 4O7TA 1UWJA 4U3ZA 3MTLA 1XBBA 4KKGA 4RJ4A 3M42A 5HORA 4W4WA 2G01A 3D7ZA 2X81A 2BMCA 3JPVA 3R7VA 2XBAA 3G51A 5FRIA 3VS6A 2PPQA 4QMYA 3KCKA 5FXSA 1XJDA 3NZ0A 1LEZA 4L3JA 3GCQA 4A4OA 5ANDA 1U54B 4F1OA 3ZXZA 1H01A 3FXXA 3Q9YA 4FUXA 3UIMA 1GZOA 1APME 3A2CA 4DG2E 2Y4IB 1P14A 3DKOA 4RVMA 1M7NA 2BZKB 3EQIA 3LCKA 4GVJA 4W9WA 5CS6A 3NCGA 5DN3A 3SDJA 3VO3A 4DLJA 4XP2A 4AGCA 5IUHA 3HV4A 3LXKA 5EKNA 3IGOA 1A06A 1R1WA 2W99B 2P0CA 3LQ5A 2J0KA 3LJ0A 3QCXA 4U45A 3ZZWA 2H6DA 4RWLA 2QNJA 2YABA 4H3PA 3DBDA 5I9UA 4G34A 2WOUA 3F3VA 4QTBA 4AWIA 1G5SA 2X2LA 1ZOGA 3P7BA 4BF2A 4E6DA 4BDCA 3Q60A 1LEWA 2OJJA 1M2RA 4MK0A 3UNKA 1E1XA 2YAAA 2GHGA 3BBTB 5ETAA 5EYMA 4EQUA 5HLNA 2ITYA 3ZFYA 2OI4X 2WU7A 3ETAA 4Y73A 4ZTSA 3UG2A 3BU6A 2VWZA 3GNIB 5IA0A 4F6WA 4QMUA 3F5UA 3RTPA 2B55A 3N9XA 4S31A 4IXPA 5HTBA 3LPBA 3W16A 4F9CA 4UN0C 2B1PA 2PMLX 5JQ8A 4X3JA 2WELA 5CQWA 1QCFA 2LAVA 5ANGA 5JFVA 1ZXEA 4JBOA 3Q5ZA 1CKPA 5D1JA 3BGZA 1LPUA 3AD6A 3AT3A 3IK3A 3G0EA 4FIJA 4FKRA 4FZ7A 3C4EA 5K5XA 4FEXA 4UYNA 2ITOA 4EZ7A 5DH3A 3R7YA 3W2QA 5IF1A 1IAHA 4BDAA 4BYJA 4E73A 4OAVB 2UW6A 2ZYBA 2CCIA 2JC6A 3C4XA 3QBNA 3QLFA 4UMRA 1SVHA 3A61A 3DCVA 5A4EA 4GMYA 3I60A 3LFAA 2QKRA 2DS1A 5J5TA 3LLTA 3EQPA 4M84A 5ANJA 3KN6A 5I0BA 4F0IA 4FKGA 3WZJA 3F6XA 3POZA 4GK2A 4F65A 3KXGA 1PKDA 4K18A 3S1HA 2WTWA 2ZM3A 4RMZA 2FGIA 2BDFA 4YZCA 4R8QA 2X7OA 3KB7A 3FMNA 4G5PA 3Q2JA 3OC1A 2YIQA 4PUZA 4JJRA 4ACGA 3NVKI 3A99A 2VGOA 2DYLA 3PJ1A 5DT3A 5A14A 4F1MA 5BUEA 4JDJA 1OPKA 2BTSA 3DFCB 1MRYA 3FHRA 3KY2A 5IQBA 3OD6X 5T6KA 3TKUA 1YOJA 4XV3A 3UP7A 2W06A 3VUDA 3G33A 1UKIA 4R5YA 4AA4A 1DAWA 3RHKA 4HZRA 3ID6C 2J0MB 3LFCA 2VAGA 2WAJA 1UNHA 3QCYA 5HNBA 3E7VA 4AGDA 2FSTX 4BN1A 5TF9A 3P0MA 4FSNA 5I5ZA 1PF8A 1NY3A 4U8ZA 5IKWA 4I5CA 2OJFE 4XG2A 1E9HA 3AC3A 3R71A 4QMSA 3QQLA 4OW8A 1PXKA 2G2FA 1NVRA 3DZQA 4OTQA 3VF9A 2GS2A 4FTIA 3W8QA 5A6NA 3C5IA 4ASDA 3GBZA 3BHVA 1WBOA 3QD0A 4ORKA 2A1AB 1RQQA 1U59A 5AP6A 2B53A 4JRVA 5BVEA 5J1WA 3ZO2A 2OXYA 4IWDA 1Q3DA 5HD7A 2W4KA 3MY5A 2PE2A 5L2TA 2E9NA 1JKLA 4J8MA 4X0MA 5M56A 2HZNA 3MN3A 3BHHA 3MGYA 4IZYA 5HE3A 5E1EA 5C8MA 5CAVA 4R3PA 4DGNA 4CFMA 2PUUA 1PYEA 1QPJA 3ZC6A 2QR7A 3EWHA 4F7LA 4CCUA 2IVUA 2C4GA 1B6CB 4ZTQA 1YXSA 5F9EA 3MA6A 2ZOQA 4WG3A 5FD2A 1KUTA 4GEOA 4G2FA 3F9NA 4PL4A 1YXXA 3RKBA 4H3BA 4NZWB 1VEBA 4EOMA 2J9MA 2V7OA 3U6HA 2YLEA 5CTPA 5AP0A 2VWWA 3U87A 4ZTLA 2OSCA 2W4JA 5CENA 4C3FA 4RVKA 4FTNA 1KOBA 4Z55A 2YFXA 4FKQA 3U4WA 2VWUA 4XV1A 2XNPA 3EKKA 3BIZA 3FZRA 4O86A 5DI1A 2ZDUA 3L9PA 4PNIA 4XOYA 4EEVA 5HX8A 3Q4ZA 4F63A 1IA8A 4U3YA 4IM3A 4I24A 2VTRA 3CY3A 3PA5A 3QTSA 2F7XE 2UW5A 2XK6A 3RPSA 5AR4A 5BUJA 4MXCA 3QYWA 5ICPA 4FKOA 3DY7A 2HY0A 1KV1A 5EI8A 4XYFA 3OXTA 4YMJA 3ORPA 3OY1A 4CFNA 1Q8YA 4XEYA 3QGWA 3VAPA 2B9HA 4RZWA 2GHMA 3PPKA 3Q4CA 4FODA 2KTYA 4OBOA 4L3PA 3B8RA 3NR9A 1DS5A 2ESMA 3C0IA 2IW6A 4Q9ZA 4X3FA 3IKAA 3T9IA 1H0WA 4BCPA 3ROYA 4CZYB 2PK9A 2HELA 4CCBA 3SXFA 3CPBA 1JWHA 4IACA 3UQGA 3FQSA 2OZAB 4YGAA 5CSHA 5HESA 3EFJA 4AZEA 4EK3A 5BVNA 3GVUA 4I22A 4G1WA 1RJBA 2OJGA 3F2AA 3OZ6A 5JRSA 3U51A 4LGHA 4DC2A 4NW6A 1OKZA 2HW6A 4AZVA 3ORMA 4L9IA 2W4OA 2NO3A 2WEIA 2OLCA 1GJOA 3TL8A 4ACDA 3BELA 4U0IA 1H26A 1PKGA 5EHOA 3WYYA 4K9YA 4QP9A 4KBAA 3VUGA 2C6OA 1CTPE 2OGVA 4XNEA 3DXQA 4IQ6A 3OS3A 1OZ1A 4NTSA 2HK5A 4H3QA 4NWMA 4QQ5A 4YNOA 3MESA 3ZDIA 1V1KA 4JIAA 5KZIA 4O91A 3ANRA 2QI8A 4AXAA 4RIYB 3S95A 2XKDA 2Y4IC 5E92A 4ALWA 4I0SA 1Q8UA 3QL8A 3EKNA 3HECA 3W2CA 2XKCA 5CI6A 3VRZA 1W0XC 2BIYA 3QA8A 3W8LA 5HU3A 2C0TA 1U46A 1W84A 2UZOA 2X6DA 2WMVA 3H0ZA 5IUIA 3QX2A 5GINE 4FSZA 4FOBA 1QL6A 5J87A 4AA0A 5FM2A 3FYKX 4QMXA 4E6AA 3ZMMA 3F3UA 4WUAA 3EN7A 5FXRA 5AIRA 3E8EA 4L52A 3LMGA 5E90A 3PE1A 4ACMA 3DLZA 3PY0A 3TTIA 3G0FA 3QXOA 4JI9A 5E8VA 4C3PA 1U5QA 2JAVA 5DWRA 2G1TA 2REIA 2XIXA 4HNFA 4TY1A 1XBCA 1L8TA 2OK1A 1OB3A 5EQEA 3DLSA 3O7LB 3LMHA 2JBPA 1WVWA 2ONLA 2ETKA 4M68A 4QP1A 3O17A 4J1RA 4WRSA 5L6WL 4GV1A 4CT2A 3FI8A 1ZYLA 2R2PA 3CXWA 5EFQA 1EH4A 5CNNA 3NNXA 2GDOA 2R7IA 1E1VA 3BV2A 4OTFA 2BROA 2RL5A 4BYIA 4F4PA 4FTCA 5ACBC 1YOMA 4C02A 3CTJA 3HEGA 4KS7A 2VTSA 3IDPA 2QO2A 3A7HA 5AP1A 3FL5A 3L9LA 2VD5A 4GUBA 1TQPA 3QUPA 3DJ6A 5LVMA 3R1YA 3NIEA 4BZNA 4DG3E 2QG7A 4KIPA 4FKUA 2IN6A 3KULA 1K3AA 3VN9A 4TZRA 1UA2A 4O0XA 4GYIA 3AC5A 3PWDA 4XG7A 2BKZA 5EHLA 3FXWA 3R0TA 4U5JA 5EG3A 3KMMA 2AYPA 5HVJA 3RM6A 4AA5A 4ALUA 4BCNA 4BICA 4JDIA 5IUGA 4FK6A 1MRUA 5JSMA 3DS6A 4A9SA 2PZPA 2ONLC 3I7BA 2VO3A 5L4QA 3MY1A 1OKWA 3LW0A 4EORA 1OBDA 4HPUE 5GJGA 2GU8A 2ITNA 3C4ZA 2IZTA 4MX9A 2W7XA 3VBVA 1OVEA 5AP7A 3T8OA 5CAQA 5AR5A 5IQAA 3GCVA 2O2UA 2FSLX 5IG1A 3PA3A 4E93A 1PJKA 4IDTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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