4FZ6 | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	277
structure length	266
Chain Sequence	VYLDRKLLTLEDKELGSFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNEGHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Rational design of highly selective spleen tyrosine kinase inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	88
structure length	266
sequence length	277
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2012-07-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4fz6A02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4fz6A01

3GOPA 4FTIA 1J7LA 2H34A 4R8QA 4H3BA 1XH6A 4E5WA 5HLNA 4A4OA 4BWXA 2VWIA 1ZY4A 4KBKA 5CF6A 1U54B 2OK1A 4MD8E 5DT0A 4WOVA 4LFIA 5DFPA 3UQGA 2CGVA 5E90A 1UKHA 2GDOA 3VQHA 3KXHA 4JL9A 4U81A 4XV3A 2R3MA 4O0TA 4WNMA 3IPHA 3MH2A 3EH9A 4PQNA 3LM0A 5EK7A 3VO3A 4C0TA 2ERKA 2JFMA 5A4TA 4P4CA 2QC6A 2J5EA 4IADA 4L7SA 4HVIA 4AZEA 5IU2A 4E1ZA 4JG6A 2C1BA 2VTQA 5FRIA 4IAAA 4RVTA 1JBPE 4GK4A 4IVBA 3ALNA 2E9PA 2YDIA 4QMYA 4YC6A 1XH8A 1YXTA 2H8HA 2O0UA 4RIWA 3ZDUA 2PSQA 3CD8A 5KMKA 5EI6A 2QKRA 2W1IA 4YO6A 2V5QA 2W1EA 4RFZA 5BVKA 4NYEA 2ESMA 3PSBA 4U8ZA 3HV3A 3FMJA 2H6DA 4O38A 4RX5A 2A27A 1PXJA 2QU5A 3NW6A 2GNHA 3EQBA 3QALE 3PIYA 2Q83A 3RAKA 5HLPA 2QD9A 3FKOA 3BGPA 3QA0A 3AD4A 4I0SA 2OFUA 4G3FA 3C4FA 3L9LA 3F3WA 4YLJA 4FG7A 3R8ZA 3IDBA 3QTRA 5FBNC 3PFQA 2GFCA 2HXQA 3QLGA 1GAGA 3JXWA 5J7BA 4ZLOA 1LP4A 3AT4A 4BCQA 1OGUA 3DTCA 4KBCA 2UZNA 1BL6A 4EH6A 3BU6A 3FMNA 4ACHA 4CKIA 2CGXA 2CKQA 3QQJA 4EK3A 5CSVA 2GNGA 3C1XA 3W8LA 3MSSA 3A2CA 4ONAA 5CQWA 4G2FA 4ZJVA 4ACGA 4QTEA 4IW0A 3IONA 2X9EA 3Q2JA 4NCTA 1JSVA 3NYVA 5LVLA 5DGZA 5GZAA 5KX8A 4C35A 2F7EE 3D83A 2BRGA 3CTQA 2C3JA 4C4EA 1YDRE 5FM2A 2RFDA 2V0DA 3BHVA 2IZSA 4EBWA 4KIKB 4XS2A 1Q4LA 1ZARA 2XF0A 3TNIA 3W2RA 3UE4A 4E6CA 1M2PA 2C6LA 2E9OA 3LM5A 3ZMMA 3MESA 4C4HA 3TKIA 3ANQA 4H1JA 2X81A 2X8EA 3FBVA 3OCBA 2FUMA 3F3VA 3R71A 2XUUA 5IF1A 4YJVA 5EH0A 3HA8A 3HEGA 3GU5A 2W1HA 2YFXA 4N0SA 3PP1A 4BCFA 2C3IB 2PZRA 3G15A 1R78A 4AZWA 4YZCA 3KU2A 5DRDA 4EQCA 4XG2A 4FTJA 4NM7A 3DZOA 2RGPA 4FYNA 2VV9A 4QP4A 3EZRA 4RPVA 2F4JA 3QD2B 4D4RA 5IA4A 5HE3A 4PUZA 5D9HA 3OT8A 5CF5A 1FVRA 4DITA 1H1QA 3FZ1A 4I21A 3P1AA 4HPUE 3FEGA 3BLHA 5L2TA 2XK8A 3FMEA 4AAAA 5JZJA 2V62A 4QYYA 4K77A 3Q53A 5LQFA 3KB7A 2JIIA 2CJMA 2YIQA 3G0FA 2HOGA 5CNOA 2KULA 2R3NA 2WMSA 4II5A 3KULA 3QZGA 1OECA 5FDXA 5AX9A 3O96A 4HGEA 2FSLX 2VWXA 5IA0A 4QPSA 4NW5A 4YHJA 2EWAA 2HENA 2Q0NA 1RE8A 3D7TA 4I6QA 2B9FA 2C0IA 4RMZA 2XKEA 1Q8UA 3KRJA 3KF7A 3KRWA 4IB0A 5L8JA 2UZOA 2UZVA 2W5BA 2B4SB 4U42A 4F4PA 1KUTA 1H08A 3HV4A 2WO6A 2X6DA 2QVSE 3AC2A 3QRKA 4IZ7A 5AP1A 3EFKA 3DKOA 4LUEA 3F7ZA 3O8TA 1A06A 5DNRA 4I22A 2XMYA 3OOGA 5I3OA 3U54A 3B8RA 4M69B 5HG7A 1YI3A 2Y4PA 3PXRA 4TL0A 3G2FA 1YXXA 5AP5A 3U55A 2J9MA 4AOTA 1ND4A 4XV2A 4AZVA 2J4ZA 3WF7A 4EOLA 3RI1A 1TVOA 3A7IA 4RJ7A 3BWFA 3DTWA 4QMVA 5GJGA 4FSYA 4ZZMA 3SX9A 4F7SA 3IGOA 5M08A 1NVQA 3MPTA 5A4LA 2OF4A 5AV0A 4XYFA 3UPZA 5F95A 3E64A 3DFCB 3I60A 2WMXA 2XS0A 4UB7A 1Q62A 2ZAZA 5BVWA 3VBTA 5I3RA 1XH5A 3DJ5A 2H96A 3BGZA 1CMKE 3KCFA 3A7FA 3QTXA 1E9HA 3DQXA 2I40A 1NW1A 3EFLA 5AA9A 4ZJJA 2CGWA 4O6EA 4JXFA 3TNWA 5B2KA 4TYEA 3OXIA 2W05A 3TTIA 3VQUA 1RDQE 3NNXA 3A4PA 3MFSA 2ETRA 4JDIA 2HZNA 2X6EA 3JS2A 3NDMA 4OTQA 4W8DA 3R1QA 5T3QA 3EHAA 3CSVA 5FP5A 2EUFB 4LGHA 4I6HA 3PXFA 5KO1A 4WHZA 1KE8A 1MUOA 3UP2A 3FQEA 5FXRA 5IQFA 4FMQA 1OI9A 3HUBA 3DKCA 3BELA 4EOPA 2UW0A 2Z7QA 3SLSA 2ITWA 4X6RA 3JPVA 1YW2A 1YDTE 3B2WA 3VUKA 5KZ0A 5IA3A 3RGFA 2NNWB 4YTHA 3TDWA 3HX4A 2UZEA 3FXXA 5L8LA 3O7LD 2NRYA 2AYPA 3QYZA 1B38A 2ERZE 4FSMA 4DEDA 3JR1A 3Q60A 5H8EA 3VS5A 4ZAUA 5IDNA 2WU6A 3RVGA 2VAGA 4IHPA 3BHYA 4UX9A 4N6YA 4GEOA 3U8WA 4DFXE 5EKOA 2C0TA 4U43A 4FV7A 2CGUA 3FI2A 3C5UA 4LV5A 2PWLA 2GPHA 4FV4A 4XOZA 3PVUA 5CVHA 4ZOGA 4RLKA 5FQDC 1NA7A 3CBLA 5M51A 1Z57A 2R5TA 3C9WA 2PZIA 4L01A 4R7HA 2GNIA 4AW1A 5ICPA 5JKGA 2I0EA 4YGAA 3DCVA 4QMLA 1NY3A 2QCSA 3MGYA 4XHKB 1OMWA 4ANQA 4O7WA 4LGDA 5CEMA 1IG1A 3II5A 4C3RA 4D2WA 2VX1A 3QX2A 4UEUA 5GIOE 1ZLTA 3V5PA 3H0YA 5AAEA 2WXVA 3A7GA 3E62A 4I6BA 2YM7A 4O82A 3QKMA 4ZTSA 2W1FA 3TI1A 4FZDB 5F1ZA 4XMOA 4BCKA 3TZ8A 3IW7A 4AP7A 4NCTC 4C37A 2Z02A 5EYCA 3FUPA 2G15A 3QGYA 3LFNA 3L9PA 4RA4A 1JNKA 4ANNA 3ATSA 3L8PA 4BDJA 5HIEA 2WGJA 3NUYA 4AOJA 3FZTA 4KSQA 4GVJA 5CWZA 2C5XA 4EUTA 1W7HA 4EH4A 4F1TA 5HLWA 5IMEA 2ZV7A 3QQGA 4K8AA 3UVPA 4FUYA 4NTSA 2QO9A 2XYNA 4JR7A 1SVHA 5C26A 1S9JA 2X7OA 3HV5A 1YWRA 2UZDA 5DA3A 5BVDA 4AW2A 4X0MA 2C3KA 3QCSA 4XBRA 4C58A 2O64A 4PV0A 3EL7A 3JVRA 3NPCA 4JX7A 3VBXA 2BUJA 3K5VA 2OXDA 4FE2A 1TKIA 4CLJA 5FEEA 3KXZA 1WCCA 4FEQA 1X8BA 1H27A 3UP7A 4AN9A 4FT9A 2DQ7X 2Z2WA 4UWBA 5CEKA 1PHKA 2ITNA 2RFEA 3IDCA 3JY0A 2C5VA 2JDOA 3KMWA 5L4QA 2BMCA 3Q32A 5JQ8A 2JC6A 4G16A 4GU9A 4AS0A 4AE9A 4CTBA 2B54A 3DU8A 2H9VA 4MXOA 4X2KA 3CEKA 3H0ZA 3RPSA 4JJRA 2NO3A 3D0EA 4L42A 3GVUA 4XBUA 4ITIA 5JGBA 4CG8A 3QQUA 4O84A 2VGPA 2XIYA 3PVBA 5HTIA 3ZRLA 2BILB 4M12A 3PUPA 5EHLA 3UG1A 3A62A 3VS7A 3F3ZA 4N6ZA 4QO9A 2P2HA 2X2KA 1YKRA 4CEGA 5AUWA 3KXGA 4RJ5A 3RPOA 4GJ2A 5FM3A 5K4IA 1OPLA 2E9UA 2WTDA 2YERA 2QOFA 4MYGA 2GMXA 2QLUA 3ORTA 4KS8A 2VUWA 4WNPA 5K5NA 4BICA 1P4FA 1A48A 2VRXA 3LKMA 5M09A 4IQ6A 4KA3A 2WEIA 4TZRA 3Q9WA 4HGLA 5LOHA 3E8NA 5AR5A 4P7EA 4PL3A 4GS6A 2XNPA 3PA5A 3N4TA 3R9HA 2A1AB 4FX3A 5GHVA 2J51A 4L44A 3QYWA 3A60A 5CX9A 3BZ3A 1CSNA 5M55A 3UIBA 2YISA 1QCFA 1T46A 2P0CA 2XM9A 3DT1A 4FKPA 4HGSA 4MEDA 4RJ8A 5HBHA 5I0BA 5IMXA 3QUDA 2PMNX 2W96B 5I9WA 4EHEA 2XK6A 4FZ6A 1BUHA 4W9XA 2FH9A 4J95A 1IEPA 1Q97A 2B9HA 3KK9A 5GIPE 3RKBA 4YZDA 1UNLA 4OTHA 4IX3A 3MI9A 3R8MA 3W2PA 3D14A 2VO6A 1BMKA 4BCOA 2XK9A 5KBQA 5DPVA 2QURA 1ZYJA 4F9YA 3EN4A 4E73A 3VF9A 5H9BA 5EOLA 4IAKA 3UTOA 2PVHA 2G2FA 2OU7A 3LMHA 4WSYA 4PNKA 1LR4A 4BTMA 4E6QA 3MPMA 3OP5A 5TE0A 3OXTA 3W2QA 4FV9A 3TZ7A 4IH8A 2OFVA 2HXLA 4FTRA 3D2IA 3MA6A 4MVFA 4Z55A 5IEVA 4FSWA 2ZM3A 5JT2A 2GCDA 3PY3A 3AD6A 4XLIA 1E1VA 5EFQA 4ZS0A 5CALA 3LLTA 4EK4A 4AG8A 1M17A 2EB2A 2XK4A 2C30A 2X1NA 3PXZA 4KIOA 2A2AA 3PLAE 4WKQA 4BVUA 1ATPE 2GNFA 3FHIA 4IVDA 4I5MA 4GT4A 4C34A 3LCSA 3GCQA 4FNZA 4FV5A 2IVSA 3W2OA 4D1ZA 4B8MA 1VYZA 1REJA 1YHVA 4NM5A 1BYGA 4CXAA 4QMPA 5ANJA 2G1TA 3HVCA 4ANSA 5AV4A 3LFQA 3E8EA 5B0XA 2CNVA 3MIAA 1PW2A 5A3XA 4RGJA 3W1FA 3P7AA 4C4FA 4EOKA 5CAUA 3IW8A 4QNYA 4ANMA 4FVRA 5KHXA 2V22A 3RK7A 2FB8A 4MK0A 5TT7A 1B6CB 3BYMA 2AC5A 4O1OA 4BBEA 5C8NA 2ZV8A 4DC2A 3UZRA 3DKFA 3QQLA 4OBPA 2QQ7A 3R7UA 5AWMA 5EM7A 3C13A 4KIKA 3V3VA 2CN5A 4YJTA 4EH3A 4YR8A 2PVYA 2BPMA 4MXZA 3WYXA 3GGFA 5FP6A 4FEXA 4E5AX 4FI1A 3KK8A 4YLKA 5DVRA 5HCXA 3AC4A 4R5SA 5D12A 4PTCA 3MWUA 1JWHA 2PUUA 4DHFA 4YNEA 3PG3A 3TZ9A 4DFUA 5A4EA 3PZHA 3HL7A 4FOBA 2GQSA 5FEDA 3NUSA 5KMJA 4QMQA 3O7LB 5CASA 3LFSA 3V6SA 1SYKA 3N51A 1BKXA 3ZRMA 3AGMA 4BFMA 2EXEA 2PE2A 4CG9A 3PPZA 5AV2A 1V1KA 1SNUA 4H3PA 1ZZ2A 3ORXA 3E3PA 4I4FA 4BCGA 5KKRB 4I0RA 3VUIA 4GW8A 3COKA 3EKNA 4FT5A 2IWIA 1OBDA 4YSJA 4LUDA 3V8WA 4PMPA 4R7BA 2CMWA 5EYKA 4RRVA 4HYIA 5AUVA 2QOIA 3WARA 1FVVA 2XKDA 4FV8A 1YQJA 4BTKA 4KUJA 4NFNA 4V01A 4BCHA 4CGAA 4DEGA 1P14A 1R3CA 3E92A 2ZDTA 4I41A 2WU7A 3CQEA 4S33A 2BIKB 5ANEA 5J79A 1GZOA 4F64A 1W98A 3G90X 5FTGA 3IW5A 2GQGA 2UZLA 2VNWA 3ZH8A 4AGDA 4UN0C 4ZY6A 3DFAA 4AA0A 5AR7A 4PMMA 2PPQA 3IOPA 1EH4A 3DLZA 3UBDA 4CMTA 4UMQA 1R0PA 3UC3A 3QTIA 3A8XA 4B7TA 4TY1A 1WVYA 1H1RA 3ZO4A 3DXNA 4FKQA 4F99A 1Y6BA 2VZ6A 2CLXA 3FL5A 2I0YA 4CNHA 2ITQA 5JRQA 3RAWA 5LJJA 4O6LA 3P23A 4I6FA 4M0ZA 3RK9A 5IQDA 3RTPA 2QOLA 4DF3A 2XYUA 3ALOA 4M69A 3MTFA 2BHHA 2NRUA 4TTHB 3ORPA 5DE2A 5CU2A 3R7IA 3FLQA 4AFJA 2P55A 4QYFA 5F9EA 3QZIA 3TIYA 4IB1A 4FSNA 4C4IA 4XEYA 4YJOA 2B0QA 4LOQA 4ANLA 4E7WA 3BBTB 2X0GA 4I1ZA 1JKTA 4C4JA 3EQDA 2YCRA 2YN8A 3ET7A 2ITTA 2NP8A 5HO6A 5DI1A 2OZOA 3ERKA 2VTTA 3ODYX 1CDKA 1HOWA 5DOSA 2XK3A 2XIRA 2BZJA 3FMLA 4D0WA 4ALUA 5HTBA 1V0PA 4OTFA 4O7ZA 5KMMA 3VIDA 1FVTA 3MVHA 4FNYA 4ITHA 5CQUA 2BRMA 1XBCA 4EQMA 5HOAA 4DT8A 3AC8A 2J2IB 2CKPA 1W83A 4AGCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4FZ6A

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