4G1WA

Crystal structure of jnk1 in complex with jip1 peptide and 7-fluoro-3-[4-(2-hydroxy-ethanesulfonyl)-benzyl]-4-oxo-1-phenyl-1,4-dihydro-quinoline-2-carboxylic acid methyl ester
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
354
structure length
322
Chain Sequence
NNFYSVEIGDSTFTVLKRYQNLKPIGSGAQGIVCAAYDAILERNVAIKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLMKCVNHKNIIGLLNVFTPQKSLEEFQDVYIVMELMDANLCQVIQMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLTRYYRAPEVILGMGYKENVDIWSVGCIMGEMIKGGVLFPGTDHIDQWNKVIEQLGTPCPEFMKKLQPTVRTYVENRPKYAGYSFEKLFPDVLFPLKASQARDLLSKMLVIDASKRISVDEALQHPYINVWYDPSEAEAPPREHTIEEWKELIYKEVM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of JNK1 in complex with JIP1 peptide and inhibitor
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 8
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 322
sequence length 354
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g1wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g1wA01
1NY3A 3ZXTA 3AG9A 3AMYA 3BIZA 5TKDA 3KL8A 2XJ0A 2QG7A 5EW8A 3PE1A 4D5KA 5IA3A 2OW3A 3AC5A 1YWVA 2OIDA 3L8XA 2CN8A 3P0MA 1XH5A 2Q0NA 3V01A 4AZWA 4LV8A 4QMUA 3FMKA 3NGAA 2WMVA 4GIIA 1P14A 3F7ZA 4FEQA 3KCFA 5HO6A 4YP8A 2I0VA 4RWJA 4DEIA 4Q2AA 4PNKA 3QX2A 3Q60A 3O17A 4QPSA 4R77A 3CGFA 4YJRA 4PL5A 4QMTA 3H9FA 3HMPA 4MXCA 2HK5A 5HKMA 3W18A 3UOJA 4L3LA 4O91A 5HG5A 4PPBA 3U9CA 4ZJIA 1TQMA 5HCZA 1H1PA 4LOPA 1KE8A 4L68A 2CNVA 1H1WA 3S1HA 4M69A 2PUUA 4G5JA 4KIKB 1U5RA 2J2IB 3DA6A 3FKOA 2PZYA 4FIHA 1OKYA 2C3IB 4FTKA 4MQ1A 5E8UA 3VF9A 4EOOA 5F9EA 4ANBA 2QO7A 2RL5A 3OY1A 2CCHA 4FE2A 4C59A 3BLHA 3C4EA 3DPKA 4DA5A 2C0IA 3QBNA 4CRLA 4ZP5A 4I23A 3KK9A 5AV4A 3VS5A 5BYLA 3VBWA 4TPTA 3KGAA 1Y8YA 3LOKA 3PXYA 3KVXA 4C61A 4D9TA 4QQ5A 4BTFA 2X8DA 3F3WA 5ANDA 5HESA 1M2PA 2OJ9A 4YTIA 2CNUA 3PXKA 2WTJA 3FMMA 1H8FA 4EUTA 5KUPA 2J51A 4DT9A 5C8KA 2ZYBA 1TQPA 2XNNA 1BMKA 4F1OA 1DI8A 3RAIA 2WB8A 5EM5A 4FKVA 5AM7A 3NW7A 4FTIA 2VWXA 3ZRKA 4FKLA 2O5KA 3WIGA 3PP1A 4L7SA 3HMMA 2NRYA 5AUVA 3ZONA 4KS8A 4CCBA 4FG7A 4BGGA 2E9OA 3HMNA 4FX3A 3MBLA 4I5PA 4FKTA 3NS9A 4DTBA 4BDBA 4V0GB 3ZYAA 4UZHA 5J9ZA 4NM7A 4BDAA 4ZJJA 2H8HA 5CU4A 3UGCA 4BWKA 2OF4A 4KA3A 4ZS0A 3UNKA 5JSMA 3UP7A 3BQRA 1CKPA 3GCSA 5ICPA 5AA9A 2FVDA 5LVOA 4PP7A 3A60A 4MX9A 4KIQA 4F6UA 4LM5A 4CT1A 4DG2E 4FEXA 3CIKA 4W8DA 2UZBA 4XNEA 4C37A 3WIKA 2BDJA 2VNYA 4O82A 3DU8A 4U9AA 4K11A 3DQWA 1BYGA 3E92A 4FT0A 1VYZA 3IGGA 4XV9A 4BR3A 3OMVA 1QPEA 2B9FA 4L00A 1DS5A 2C6DA 1FMKA 4WKQA 3COMA 4AGWA 3BHVA 3ZEWA 4FKSA 5IH6A 3AT4A 4LMNA 2X2LA 2JDSA 3D7TB 4W4XA 4LGGA 1PKGA 4U5JA 5DLSA 2GQRA 3A4PA 3FV8A 3I0OA 3ZLSA 2A27A 4BKJA 4U40A 4RC3A 4FL2A 5IDNA 1YDRE 4IQ6A 3VJOA 2XJ2A 3SC1A 3KY2A 1PKDA 4UX9A 4J1RA 5L2SA 2OK1A 4M15A 3VUGA 3R02A 4ASXA 3FKNA 1XH6A 3DJ6A 4G5PA 5EI6A 5FD2A 1MQ4A 1CSNA 4KRCA 5HLPA 5M09A 3DKOA 1LR4A 1WFCA 3CQUA 4RC2A 5EKOA 3IG7A 1OIYA 4QP2A 3ZO3A 1FBNA 4YC3A 4S2ZA 3LQ5A 5C8NA 3GC0A 3CCNA 4X2NA 5L3AA 5DN3A 2GCDA 2XK7A 2XIKA 5BMMA 4UB7A 4E6CA 4FSNA 3CY2A 5B7VA 2WQEA 5HORA 2XBAA 5IMEA 3VBYA 4AE9A 3L8VA 1W8CA 2EUFB 3ATTA 5JRSA 5HOAA 3WBLA 2BKKA 3F5UA 2QOQA 4PMTA 4FV4A 5FXRA 1XJDA 2YLFA 4FTUA 5AP0A 3PPKA 4RFMA 4I6HA 2X4FA 3GT8A 4X2KA 4NW5A 4YR8A 3QKMA 4QP9A 5K3YA 4QTDA 5E8VA 3TN8A 2VTNA 4IAIA 2PZPA 3WARA 4CZYB 4H58A 2GHMA 2V7AA 2VWWA 4C3PA 3F69A 4AW5A 4BDFA 2QOOA 5EYDA 4JX3A 4G16A 5IQEA 4F6WA 4IIRA 4QP6A 3E7OA 2G2HA 3R2BA 3KREA 4XG7A 3LE6A 5FLFA 1UWHA 4LOOA 1WBPA 4TW9A 3FLSA 5J1VA 3W8LA 1H27A 2DQ7X 5HVYA 5JRQA 4JX7A 4L3PA 4CFUA 4OTWA 3BEAA 5J7HA 4YU2A 3QD4A 2RIOA 2CCIA 4W9WA 3F3ZA 4HGEA 4H3QA 2O3PA 4KIPA 3HEGA 2HZ0A 4R7HA 3ZFXA 4B8LA 5HTBA 3UZRA 4V01A 1PMVA 3D9VA 2XIXA 1B6CB 2EXCX 3NDMA 5IH4A 3TUCA 3A61A 1MRVA 3DK3A 4YO4A 5HG7A 2UW6A 4YPSA 2QKRA 2WOTA 4W4WA 4KSPA 4MQ2A 4BY9E 3F2NA 3LFSA 3AC3A 3MH1A 5J79A 4GL9A 4AFEA 5L4QA 1GIJA 2QURA 4IB0A 4CFXA 4IHPA 3V5PA 4BCKA 3R63A 4ZEGA 5EDQA 2R3HA 4O0UA 2VTMA 4MKCA 3QLGA 4TWNA 5D7VA 4TYGA 3V5JA 4I6FA 2WMWA 4HZSA 4I24A 5L6WL 3FZSA 3RPRA 2W1HA 4Y83A 2HZNA 3VS4A 5LMBA 2C5YA 3PLAE 3LCTA 3UBDA 3VUHA 1A9UA 1XQZA 2UZUE 3ZLWA 4CYIA 3SD0A 5DIAA 2I40A 3WYYA 4BKYA 5JFSA 3FMLA 4YHFA 4P4CA 2CSNA 4XP3A 2VWZA 5LVMA 4YZBA 4OAUC 2OH4A 3QGWA 3U6IA 3SDJA 1JOWB 3FZOA 3GQIA 3JVSA 5AEPA 2HAKA 3BKBA 5CI6A 4D5HA 1YOMA 2PMOX 3MPTA 2BAKA 4O7RA 4C33A 1ZY4A 3NWWA 3NYOA 5IEXA 2YISA 4YSJA 3ODYX 5M08A 5D10A 4GW8A 2XJ1A 3RBWA 3FXXA 3WZJA 5B2MA 3QC9A 1KE7A 1S9IA 3CQWA 3DBEA 5FEEA 4F70A 2JKKA 2R0IA 4KAOA 4D58A 4CKRA 3GU6A 4XMOA 1Q8WA 2RFDA 4NSTA 2X7GA 3PY1A 1M7NA 3QTWA 4PV0A 4Q9SA 4ZTHA 3TZ8A 1IG1A 1K9AA 4W9XA 4JBOA 4IAZA 4BCNA 4F6SA 2YHVA 3FZRA 4EOLA 4DBXA 4W4VA 4O7TA 2C30A 3NUPA 3OEFX 2F4JA 2VO0A 3ORTA 3Q6WA 4I5MA 4EC9A 3ITZA 3TG1A 5IA4A 4QO9A 5LOHA 3V5LA 2OSCA 4E26A 5DWRA 4O0WA 2VO6A 5IEVA 1ZMVA 3Q6UA 3IW4A 2GU8A 2R3FA 3V8SA 2AC3A 2OZAA 4ANOA 5AA8A 3VUMA 5C1QB 2VGPA 3D4QA 3LCSA 4O0RA 4O2PA 2GNHA 2QVSE 2UW9A 4RGJA 2C0OA 4ZTNA 2ZOQA 3EZVA 3QALE 3O50A 3VAPA 4ZOGA 3PIZA 2PVMA 1YOJA 1WVWA 4EK8A 1JNKA 2VTQA 3CTJA 2BHHA 3OXTA 4JVGA 3RALA 4FT9A 4QMWA 4F9AA 2QHNA 4FK3A 2JAVA 2UZVA 4XLVA 1PXJA 1OKZA 2HY0A 4OR5A 5C9CA 3FXZA 4AW2A 4Y72A 1RDQE 4FKPA 2ZMCA 4AN9A 4N70A 2QO9A 5GZ8A 4WBBB 3OW4A 5C4LA 2WTDA 4FSQA 5DGZA 2XMYA 1V0PA 3W2SA 1B39A 2X7OA 4BN1A 1FPUA 4ENXA 3LMIA 3DT1A 3UO4A 2G9XA 5FBNC 5EM7A 3I7CA 1XBAA 3TKHA 3FQHA 5IU2A 4L43A 5H8EA 4PL4A 4DH3A 4D0XA 5HLNA 4ITHA 3PTGA 3U55A 2ZM1A 1G8SA 3A62A 2WFYA 3QRTA 2ZV2A 4XLIA 3FI3A 3QGYA 2QOIA 3NUSA 2BDWA 3K54A 1PXOA 1ZZ2A 4AFJA 4C02A 3KRWA 3OCGA 2BZHB 4BDKA 3Q5ZA 4U79A 4DFYA 2RFEA 3V6SA 3P08A 5HNIX 3SA0A 3GCPA 1PXIA 3UG2A 3LXNA 5K0KA 5CSWA 1WBNA 4L6QA 2YITA 4FV0A 4GEOA 4YJSA 4TKSA 2LGCA 4F0GA 5BVFA 5IQBA 5IA0A 3SXFA 3QRKA 4ASEA 2XUUA 2WMUA 2QU5A 5HTIA 5IQDA 2CHLA 3VBVA 5FG8A 2FSLX 4D2TA 2GNIA 3ZO2A 4UMTA 3ORXA 3CJGA 4YGAA 4PDYA 2X0GA 5LMAA 1LEZA 1QPDA 4D1ZA 5HZNA 4YZNA 3KQ7A 1O9UA 3DS6A 3EQFA 5TT7A 2R9SA 4NCTC 1PXLA 4EHVA 3EQBA 4X2GA 1XH8A 3SW4A 5LVLA 3R6XA 3TV6A 4AZFA 3V6RA 5KBQA 2FB8A 5JFXA 4GRBA 3P9JA 3UOKA 4BGHA 4DFNA 3E8CA 4F9YA 2XNPA 4H3PA 3RK5A 4IAFA 4L9IA 5ANJA 4JBQA 5CEMA 4UBAA 4O81A 4JDHA 2AC5A 2PZIA 4E5BA 1Q5KA 2R3PA 3AT3A 3PA4A 4HVGA 4BDCA 3O23A 4IDVA 3VRZA 2WOUA 3QKLA 4OTIA 4YC6A 5B2LA 2OXXA 2W1GA 3WF6A 4BYIA 3IONA 3EZRA 4MYGA 3R7EA 4OLIA 4QYHA 4O7ZA 2QKWB 4I5HA 3W2RA 5JQ8A 3EHAA 3LFNA 2REIA 2W1DA 5CEKA 2I0HA 4XRLA 5IUIA 3QRIA 5E8ZA 2X6DA 4AT4A 1R39A 2OGVA 3GC7A 3KXXA 3R28A 1APME 3LFAA 2ETMA 4I22A 2WEVA 1SMHA 3FL4A 3R8ZA 3FLQA 4ZXTA 3MSSA 1UNGA 4QNAA 4FZ7A 1M2QA 4V04A 4ERWA 2QQ7A 5ETIA 4YJNA 4CQGA 3RPOA 5DR2A 2HWPA 4FOCA 5ETFA 4H1MA 3DNDA 4RWKA 4YLLA 2B9HA 5M56A 2VAGA 2G2IA 2X4ZA 4M8TA 3RCDA 3R7IA 3HDNA 4QNYA 4FKOA 5B2KA 3MN3A 3TIYA 3BU3A 2C1BA 5HICA 4AA4A 5KMNA 2BR1A 3EFJA 2RKUA 4H39A 4ZSJA 4BDJA 4FV5A 3ZRLA 3KRRA 4S31A 3GU4A 1HOWA 3LQ3A 5HG9A 2I7QA 1YKRA 3I5NA 5E1EA 4EK6A 2Z60A 2W05A 2WXVA 4KBAA 4TY1A 3ZH8A 2BTRA 4FC0A 2ITQA 4CNHA 3O8TA 3OY3A 4QT1A 3LVPA 3OCSA 2R3MA 3E93A 4QMSA 5A14A 4WNKA 4GUBA 1OZ1A 3OXZA 2EB3A 1SYKA 3BHHA 2J50A 3IDCA 5GNKA 1OECA 2O64A 2VTPA 4I93A 4ZTMA 5CVGA 3RZBA 5AAFA 3TNQB 3RWPA 4QPAA 4CFMA 1S9JA 5C8MA 4AOIA 4R5YA 2DYLA 5AP2A 5HIBA 5ACBC 2B9JA 3UJGA 4C4FA 2EXEA 2GDOA 3SGCA 5BVDA 2PVKA 2YCQA 3IECA 1ZYLA 2BIYA 3A7HA 3ALNA 3ZTXA 2BRMA 2F2CB 4F09A 3O71A 5AR7A 3FZTA 3RKBA 4O7LA 3ZBFA 2C6LA 4NTTA 2C5NA 3G9NA 1E9HA 3NVKI 2Y4PA 5AIRA 5A54A 4EORA 3AMAA 5I5ZA 2IZRA 4FIIA 4ACHA 1UU3A 2JAMA 3FEGA 4B99A 3HV3A 4RA4A 1GZOA 4EJ7A 3NR9A 4F7NA 2QG5A 5L2IA 3K3IA 4LRKA 2IZUA 4GT5A 3V5WA 4EOPA 3FHIA 4FEWA 4J8MA 4DCAA 1OGUA 4XG2A 4PTGA 2OXDA 3NLBA 3PVBA 5DR9A 2PU8A 4YMJA 4O0SA 2WQMA 4K0YA 2JIVA 4X7QA 2JDVA 5FXSA 1GZKA 1ZXEA 2JITA 5JKGA 3O51A 4YJOA 3QCYA 3BRBA 2F7ZE 1Y8GA 2JLDA 5EYCA 4G6NA 5EQPA 2Y7JA 5D1JA 3OZ6A 4Y5QA 1YXSA 4ZIMA 2VWVA 3C4ZA 4C35A 4K6ZA 4C62A 4CFFA 3MY0A 5J87A 3E63A 1XH4A 3G0EA 2X81A 4ASDA 4CD0A 2PHKA 1OITA 3FYJX 3ACKA 4M14A 5CI7A 3DBQA 1W0XC 4K9YA 5A4QA 2WU7A 3S95A 4MXXA 4XV2A 2GQGA 3QD3A 4GS6A 4XG3A 1O6YA 4FZ6A 3EKNA 1RJBA 4HNFA 4JL9A 3T3UA 2ITNA 3ROCA 3R8LA 3F61A 4JLCA 4F99A 1XWSA 2IO6A 5IQGA 3E8EA 2QR7A 2R7IA 4FV1A 4I4FA 3REPA 4EH2A 4C4GA 4GKHA 3DTCA 4HCUA 4QQTA 3FUPA 3QA0A 4CZUA 1BKXA 3F5PA 3TV4A 3RPYA 4FV6A 3A7IA 1OIUA 2R4BA 3G6HA 3TUDA 1V1KA 4UZDA 2R3RA 2Y4IB 3MS9A 1KSWA 2BMCA 4FG8A 1R0EA 3EN7A 4GT4A 3UO6A 4MHAA 4NM0A 4DFZE 1H4LA 4HVHA 2BRHA 4WOVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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