4G34 | Genus

Total Genus 85

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	85
sequence length	285
structure length	248
Chain Sequence	GRYLTDFEPIQCLGRGGFGVVFEAKNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLEKNKVYLYIQMQLCRKENLKDWMNGRCTIEERERSVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKVGDFGLGTKLYMSPEQIHGNSYSHKVDIFSLGLILFELLYPFSTQMERVRTLTDVRNLKFPPLFTQKYPCEYVMVQDMLSPSPMERPEAINIIENAVFED

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Discovery of 7-Methyl-5-(1-{[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine (GSK2606414), a Potent and Selective First-in-Class Inhibitor of Protein Kinase R (PKR)-like Endoplasmic Reticulum Kinase (PERK). pubmed doi rcsb
molecule keywords	Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	85
structure length	248
sequence length	285
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2012-07-13

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4g34A02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4g34A01

4U7ZA 2CPKE 3SV0A 4FIJA 3TKIA 4E73A 1KV1A 2ZB1A 3LCSA 4CEGA 3W55A 3U9CA 5IA3A 3LFAA 3QRIA 1OI9A 2C47A 2IZTA 2ZM3A 4FUYA 4QYEA 3A7FA 5L8JA 4HGEA 3MPAA 1U46A 2R3PA 5AP6A 5CSHA 1KOAA 1X8BA 1YHSA 3ANQA 3OUNB 4L45A 4PL3A 3KVWA 4G6OA 2Z02A 3RNYA 5CU6A 4ZJIA 4H05A 4NM0A 4ZTNA 3PJ8A 3QKKA 2ETMA 1QCFA 2I0EA 4FEWA 4IE9A 3L8VA 5CXZA 4M8TA 3BV2A 3ZM4A 5CSVA 4BCMA 2VAGA 4EOMA 3NUUA 4O21A 2J51A 3KRLA 3VQUA 4B7TA 5C01A 2QNJA 2WTJA 1ZMUA 5JZJA 3Q6WA 4FV7A 4BI2A 2RFSA 2ZMCA 3D94A 1J7UA 1M17A 4KKGA 1UU3A 3HMOA 5EM8A 1WVXA 4AZSA 5EH0A 2P0CA 4EH9A 3UZTA 1YXSA 4C36A 4BR3A 2R3GA 2W1CA 4PUZA 4RA5A 4YZMA 2XIRA 4HYHA 3TJCA 4H58A 3TCPA 4ANLA 4NCTC 4YLJA 3UO6A 2B9FA 1GZNA 4IEBA 3HRBA 3CC6A 1PMVA 4QMWA 1NVSA 4GL9A 5DWRA 5DOSA 1OIQA 4CZTA 4ALVA 4EOJA 3QUEA 3ZLYA 2WTCA 3QC9A 3RWQA 5EOBA 4H3QA 4FTOA 4I4FA 4Y95A 3DB6A 4BGQA 2ITTA 5KHXA 3RK7A 3O51A 4I93A 3FV8A 3JPVA 3ZC6A 4HYIA 4O27B 2B52A 3LVPA 5JZNA 3D9VA 4PL5A 3R7YA 3NMUF 4X2GA 4KB8A 5F20A 2FYSA 2BFYA 4U45A 2VTOA 2XB7A 4I6QA 4J99A 5DNRA 4FI1A 4ZZMA 3RVGA 4RIXB 4BCHA 4G3DA 4KWPA 2E9NA 4RIXA 3EN9A 3KN5A 2ITUA 3DA6A 4IBMA 4AGDA 1YWVA 1QPCA 3R1QA 2YCFA 2F49A 2JAVA 2XNPA 3AT2A 4P5QA 4IVDA 1WMKA 4A4OA 3VF9A 3FLZA 3C0HA 3OY1A 3OWKA 4XJ0A 4DGOA 2J9MA 2UVYA 3VC4A 2CMWA 1B39A 3EYGA 4FYNA 3HX4A 3OC1A 4IAKA 4IM2A 2XK3A 3LIJA 3QRTA 4A07A 4BZNA 4EOKA 3VS1A 2HXLA 5BMSA 2YFXA 2YDJA 4FL2A 3ACKA 1Q24A 1UWJA 3EZRA 3O23A 3UQGA 4FC0A 4OTQA 5K4IA 2WNTA 3FMLA 1GAGA 4C4JA 2HYYA 1H08A 2BRHA 2VTHA 3ZLXA 3C50A 4IB3A 3WYYA 3GC7A 2F2CB 1AD5A 4QQJA 3GC0A 1RJBA 2BRMA 4GK4A 2V7OA 1LUFA 4QRCA 5CEMA 1GJOA 4FGRA 3KXNA 2BRNA 4R3CA 1Q8ZA 2W1HA 2XA4A 3L1SA 4FKWA 4RC4A 1YXTA 2JFLA 2PSQA 3CJFA 2XMYA 4M3QA 4OTIA 5DFPA 1M7QA 5EYDA 3AC3A 4IM3A 4USEA 4E93A 3G9NA 5HLWA 4AG8A 1CM8A 1UU9A 1KWPA 5DIAA 2CLXA 3Q96A 3C13A 2J50A 5DT0A 4DLIA 5KX8A 3HL7A 3NYOA 4FNZA 2W17A 2JEDA 4YJRA 4CGAA 1H1QA 4LV8A 3W8QA 4E7WA 5D12A 4GT4A 1FBNA 4XG4A 2WMWA 4D55A 4JDJA 3IK3A 4ZLYA 2QOHA 5CU2A 4L42A 4JBQA 4CMOA 4D5HA 4L3JA 4KKHA 4RVMA 3D2KA 1AQ1A 5HEZA 4ONAA 3OS3A 1LPUA 4BN1A 3LFCA 2XBJA 2OLCA 2CJMA 5A9UA 3RKBA 3MDYA 3P1AA 4ZMEA 2XNBA 4FT9A 3NYVA 5AP4A 1OGUA 3MVLA 4CCBA 4CTBA 4ANNA 2X4FA 1Z9XA 4IAZA 1QMZA 4O7RA 2HZIA 4DH8A 2Y0AA 4P7EA 4W4YA 1BLXA 3RTPA 3NGAA 4K2RA 3TTIA 3U8WA 3BLQA 3OTUA 4A06A 3FXWA 2X39A 4QP3A 4TWPA 3QHWA 4V0GA 4V0GB 3F5UA 4YZNA 3RAKA 4AOIA 3GQLA 4CRLA 3B8RA 5HO7A 3U6JA 5LQFA 3OOGA 4FKQA 1MRVA 1KE5A 4QNAA 3TL8A 3SW4A 1IAJA 4ZIMA 1XBBA 4DYMA 2VTQA 3LLAA 2VO0A 3DKFA 5IA0A 3ZSIA 4JR7A 5CQUA 4EZ3A 1YXXA 2F7XE 5HCZA 5F95A 2WO6A 5AR3A 2G9XA 4TYJA 3UZPA 5A14A 4DCEA 3JXWA 4QP1A 4BI0A 3Q4ZA 2C6IA 5L6WL 5IQCA 4ANMA 3QFVA 4Y5QA 2OIQA 3P7CA 4RQVA 5L2QA 3BIZA 3F3UA 2XM9A 4FKUA 3PZHA 4O0SA 4EH5A 5CF5A 3KEXA 2WMXA 3D0EA 2ITOA 2W5AA 2AC5A 1UVRA 3PY0A 3BV3A 4QMPA 3NLBA 4JOAA 4QMSA 1SVEA 5C1QB 4WBBB 3LM0A 2QKRA 4IB1A 3HV5A 4CLIA 3IW8A 3QD2B 5L3AA 2FSMX 3R9NA 2EWAA 4P5ZA 4U79A 2QOLA 3E62A 2XKCA 3CP9A 2YCQA 3S3IA 3NIEA 4EK4A 5LVLA 3VNTA 4BL1A 4FICA 4N6ZA 2C5XA 4NU1A 3ACJA 3PPJA 4MXYA 5AP2A 2YCSA 4PDYA 4O84A 3GC8A 3HDNA 1H26A 4KRDA 3G51A 2UW7A 4NM5A 3V5WA 5J9YA 3MIAA 1YVJA 1JKKA 2OGVA 3C51A 4FG9A 4IIRA 4C33A 1NVRA 4M66A 1R39A 2YDIA 3BWJA 3KK8A 4MD7E 3QQKA 3CTJA 4WO5A 4J98A 4IADA 4NFMA 4RVTA 5E8UA 4BBFA 5CSWA 1FGIA 4XG6A 4CFXA 3LM5A 1SVGA 4MEDA 1Q8WA 2XK9A 2C6MA 4DA5A 3C9WA 1H27A 5LMKA 3ZFMA 1J7LA 3NVKI 4QP9A 4YBKA 2YWPA 1WFCA 4RWJA 4BTMA 2QC6A 2WMRA 2GDOA 2IZRA 3C4ZA 4IQ6A 4PMTA 4XG2A 4JT3A 4W4VA 4CFFA 3TWJA 3O0GA 3I4BA 4D4YA 5A54A 5GJGA 3DS6A 3VS2A 4AE9A 5CF6A 3FI2A 5E8WA 2HWPA 4X3FC 4F65A 2WMAA 3K3IA 5HE1A 1FQ1B 4WG5A 4IZAA 4I5CA 3FLYA 5ETFA 4FV9A 5E90A 3BHHA 2XEZA 4Q2AA 5B2LA 4BBMA 4M69B 1FOTA 4M69A 4JQEA 4RJ8A 4LL5A 3GU5A 3Q9WA 3ZCLA 4CFWA 3P0MA 4UN0C 4CLJA 5KBQA 3R6XA 3VS4A 1H28A 2P33A 4USDA 2XF0A 2GNHA 1OPLA 4DFUA 5EYKA 4CKRA 3TNPC 5I9ZA 2PZYA 5J9ZA 2LAVA 4AOJA 3T9TA 4YO4A 5JFWA 3MS9A 4L00A 4BDAA 5IH6A 4X2JA 4PQNA 1JSTA 4U42A 1W8CA 1M2QA 4IB5A 3IW7A 4I0SA 4I6HA 5AV3A 4CYJA 4MHAA 2UW5A 4TNDA 2JIVA 3UVPA 3PLSA 1PXIA 4BCNA 1JOWB 3FDNA 3VRZA 3ZO2A 4A9TA 4S32A 4BZDA 3A8XA 2YA9A 1CKIA 2JIUA 3WI6A 1ZWSA 2XBAA 2J90A 4IX6A 3ZSHA 4DH7A 4JRNA 4QP2A 3NCGA 4ZP5A 3NW7A 5BVNA 4ZJVA 3NUSA 2EVAA 4ERWA 5JMSA 4L9IA 3ZXZA 3ZH8A 2UW8A 3AT3A 4IMYA 2ITWA 3FEGA 1PJKA 4C4GA 1R0PA 4YSJA 2GFSA 4ZSEA 2IN6A 4V04A 3DXNA 5H3QA 1W83A 5EHYA 1Y57A 3QCSA 4D2WA 1O9UA 2Y6OA 1U4DA 2QVSE 3U51A 1ND4A 5J95A 3ZTXA 2IZUA 5JRQA 2IVTA 4UWYA 4UX9A 5EM7A 3FY0A 3EQFA 4U0IA 3DKCA 2BAQA 3DK3A 3UNKA 3WIGA 4N4SA 4O1PA 4YGAA 5L6OA 4WBOA 3HMIA 4CD0A 4QMXA 5IQGA 4ZMFA 4ZS4A 4BKYA 5HZNA 2YHVA 4DITA 5TF9A 4FE2A 3PDTA 3PRFA 1WVWA 1Z5MA 3C0GA 4FV6A 4MBLA 4OBPA 4DFNA 2WIPA 5IZFA 3BI6A 2C30A 4G2FA 3MPMA 1OKZA 3I0OA 3CGOA 3MV5A 1VR2A 4IANA 4BDBA 4GFOA 1H0VA 1GIHA 4E6CA 3PXFA 3OW4A 2PVRA 2Z2WA 4AAAA 4RLKA 1UKIA 4PY1A 3R21A 1IR3A 3S0OA 5JGBA 2BIKB 3UO4A 4RJ4A 2IO6A 3CPBA 2OZAB 2OZAA 3POZA 3O7LB 3HVCA 3MJ1A 2ZV8A 4FKTA 5J9LA 4IJ9A 5E8SA 2YDKA 3Q4UA 3R7IA 2R3FA 5BVEA 5HESA 1TKIA 3R7VA 3QUPA 5GIOE 3EQRA 5CI6A 3ENMA 3KMUA 4EBWA 3P86A 4EWHA 1Q62A 2PZRA 3EN7A 4YHFA 4HOKA 2GNIA 3BEGA 3OP5A 3K5VA 3F6XA 5CSXA 2YAAA 2BAKA 2R7BA 5HD4A 2OZOA 2XIZA 4L8MA 3EKKA 2WTVA 3RK9A 3O71A 4YNEA 4HPTE 3DU8A 3ORXA 3NUPA 2YIXA 3F66A 4M0ZA 5HLNA 1H07A 3H30A 4LGDA 4M68A 4NEUA 3GT8A 4WG3A 2GCDA 3LMHA 4O2ZA 4EOLA 2EB3A 3P9JA 3GC9A 4LI5A 4QMZA 4RIWB 4RIWA 2JKKA 3CJGA 3UC3A 1F0QA 2W1IA 3R01A 5A4CA 2OF2A 5CX9A 3IW5A 2OH0E 3AXWA 5I9UA 1T46A 3DZQA 3BWFA 4HVIA 4O0UA 4E3CA 3WYXA 5IA1A 5A6OA 3CSVA 5DEWA 2F9GA 2J0KA 1I09A 3G90X 4TRLA 5IKWA 3T8OA 3D83A 4NTTA 5AAEA 2ZYBA 4ALUA 5CAVA 4RC3A 4R7HA 5C8NA 3GVUA 1VYWA 5CVGA 2PUNA 5LJJA 1OPJA 4DG3E 1JKSA 2ITYA 4GSBA 5HCXA 3OBGA 4RC2A 4U80A 4YO6A 2W1FA 2BZIB 4J1RA 4XMOA 3OXZA 1W98A 1T45A 3PUPA 2R64A 1VEBA 2GFCA 4QMVA 4QP4A 4FEXA 2YJRA 4GH2A 2G15A 5I9XA 2B0QA 4E20A 5AP0A 3CTHA 2GPHA 1E1XA 4FL1A 2CSNA 4TYIA 4U5JA 3VF8A 3COHA 2R0IA 3MY1A 2C3KA 4OT5A 2PVJA 2W4KA 3E88A 1ZYDA 5AA8A 4MF0A 4GVJA 5TO8A 4R6VA 1XQZA 2JGZA 2ITVA 3I1AA 3PIXA 4QPSA 3VBXA 3ZBXA 1W82A 1SYKA 4G3FA 3F2NA 4OBQA 3GU8A 4ZSGA 4FV1A 2E2BA 2WQEA 5HU9A 3NSZA 4V05A 4Y8DA 2FA2A 3W18A 3PP1A 5DGZA 3QKLA 2WXVA 4YTFA 3SX9A 2BDWA 2VWXA 3VAPA 5LMAA 3W2SA 4F1TA 2VWWA 2WTKB 3HLLA 4FZDB 3QXOA 3WILA 2YERA 4QT1A 3ZBFA 4DTBA 1H0WA 3TNHA 3AG9A 3UNJA 1A9UA 3UYSA 5CF4A 5T3QA 3U87A 4JX7A 5F4NA 4AF3A 1P4OA 4PDPA 4D4SA 3W2OA 1Y6BA 2OBJA 5D1JA 2BHEA 4I20A 2C1AA 3TN8A 2OFVA 4IJPA 4B0GA 3MW1A 3Q3BA 4RQKA 4U43A 2E9OA 4S2ZA 1JLUE 4H36A 2E9PA 5E8VA 5M4UA 3Q04A 4RIYA 2UZOA 3V5TA 3FZOA 5K5NA 2CDZA 4FGBA 3N4UA 4NWMA 3BU6A 4C3PA 4OTFA 1G8SA 3NWWA 4KIQA 1WAKA 4G9CA 5EM5A 3UIMA 1IA8A 1JBPE 3WOWA 1ZYLA 3WE4A 5GHVA 3F82A 4FZAB 4MD9E 4PMSA 4AZEA 4NK9A 4MVFA 3G6HA 3VULA 4PNKA 3HA8A 4F99A 4DHFA 3EZVA 5IQHA 2XK4A 1URWA 2GU8A 3DB8A 4O7LA 3LXKA 2PMNX 2W99B 1APME 4RWLA 1YWRA 5FEDA 5EI6A 5ETAA 3HZTA 3CIKA 2B1PA 3BHVA 3TJDA 3QTWA 2WMTA 4DEAA 2YEXA 3COKA 5FM2A 4NW6A 4CMTA 4TWCA 4UY9A 5HIBA 5G6VA 4ARKA 4F6SA 5M4CA 1Y8GA 3ETAA 5LOHA 3W2QA 3MB7A 3OCGA 2QOKA 4AA4A 4M13A 3ATTA 3D5UA 5KCVA 1OM1A 2JC6A 3MH2A 4F08A 5HIDA 2CHLA 5JQ8A 4N57A 1FVRA 5F94A 3NS9A 4F9BA 5BUJA 4DF3A 4JXFA 4XV9A 4RT7A 5EW8A 2GS6A 1PXLA 2R4BA 3EL7A 2VWYA 3S00A 3W1FA 3E63A 3KGAA 3LFNA 5LARA 3HA6A 2CCIA 4E4LA 5JFVA 2PULA 4RRVA 1YDSE 1PXMA 5BUEA 4OTRA 4W4XA 3MA6A 5HHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4G34A

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