4G9CA

Human b-raf kinase domain bound to a type ii pyrazolopyridine inhibitor
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
276
structure length
265
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Pyrazolopyridine inhibitors of B-Raf(V600E). Part 4: Rational design and kinase selectivity profile of cell potent type II inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 265
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g9cA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g9cA01
3RGFA 3OUKA 4IVDA 1YI6A 4YZ9A 3EHAA 1BI7A 2V7OA 3VF8A 4FV6A 2OBJA 4K77A 4EONA 4BHNA 4M68A 3PTGA 3W55A 5JMSA 1YDRE 2W05A 1XH8A 5HLNA 2UW3A 2BDJA 4DFNA 4JX3A 4E3CA 4ZSEA 3AT2A 2C3IB 5J7HA 1OGUA 3RHKA 3ORLA 1G8AA 4GKHA 4HGEA 4ZSGA 2ERKA 5HCZA 5M51A 2WKMA 4XBRA 5AIKA 2A2AA 4ZS4A 2JBOA 5KMKA 3KRLA 3LFDA 3R9NA 4CQEA 3N4UA 5E1SA 1OL6A 3ZO3A 2C5YA 2J0KA 3CPCA 3EZRA 4AZFA 5AR8A 3U54A 3GVUA 4V04A 4KAOA 1PXOA 4E73A 1XH5A 2BALA 3U51A 3CE3A 2WU6A 3OD6X 5G1XA 3W16A 3I81A 4M8TA 3DK7A 4FKOA 2YLEA 2VTJA 4TL0A 4FIFA 2CNVA 3DNEA 3GC0A 4O86A 3F88A 2YAAA 2HY81 4IH8A 4PMMA 1VZOA 3GP0A 2WXVA 4FIJA 4DFUA 4O7WA 4JG6A 1OIQA 2SRCA 2CHLA 2VWIA 3MJ1A 4QPMA 4RC3A 4ANNA 1GZNA 2FSTX 3F6XA 4FZDB 2QKRA 3BWJA 5EFQA 3SQQA 5IH5A 1IRKA 4R78A 2HWPA 4GT4A 2BDWA 2WMRA 3NX8A 3R71A 2PMIA 3KXMA 4QMSA 4ZLOA 3QTZA 3K2LA 4UZHA 5IDPA 2UZNA 3PZHA 5FWKK 1OITA 5DH3A 5C27A 3R8ZA 1NW1A 3FZRA 1B38A 3KULB 4LYNA 3O71A 4KINA 4PRJA 3ZDIA 3AC3A 2XRUA 3IQ7A 2Y6MA 4JNWA 5JGBA 2X8IA 2A27A 3IW7A 1Q3WA 1Q62A 1Q61A 2B52A 4X2JA 3R7VA 4BIEA 5IG1A 2PWLA 3ALOA 5JSMA 4K9YA 1YOLA 1LPUA 2QU6A 3QQUA 4KIQA 4LOPA 1PY5A 4H05A 4FKUA 5HU9A 4XV2A 4AACA 3KRRA 1ZYDA 3TNWA 2EXCX 2PVJA 3EQPA 3MY5A 1UWJA 5CASA 5IQGA 2E9OA 3OC1A 4BDIA 3U9CA 2ITZA 3FHRA 3OY3A 4ORKA 3T3UA 4GFOA 4O83A 4QQCA 2W1CA 3LHJA 5I9VA 2XA4A 4LGHA 4RFYA 1Z57A 3KXXA 5EQPA 4YLLA 3HA8A 3MPAA 2IVVA 3EIDA 4LRMA 4O27B 5BYZA 3TNPC 4EK3A 4EOLA 4U3YA 4J53A 3DAJA 2J7TA 3MTFA 2XB7A 5DEYA 1PMUA 1YOJA 2J5EA 4Y5QA 4JOAA 3ANRA 2JDSA 1GIHA 2OIBA 3F3WA 4FYOA 4ZAUA 2XZSA 5EYMA 3S00A 3D14A 3AD4A 5H8BA 5AA9A 2VGOA 3N9XA 3LZBA 4XOZA 4Y5HA 3TJDA 2QO9A 3LMHA 2OXXA 3HMNA 2W4OA 2YDJA 4JR3A 1XHAA 4DAWA 2VU3A 2UW0A 3FI8A 3C51A 4JR7A 3LW0A 4OTFA 3U55A 3DAEA 2WOTA 3EB0A 3H9RA 4MKCA 2GPHA 3RK5A 4PTGA 4PY1A 4M15A 5CU0A 5CVFA 4RLLA 2XEZA 2PVMA 3VS7A 4CT2A 5CVHA 3LMIA 5DG5A 5F94A 3RM6A 2C0TA 2GS6A 3VHEA 4BDKA 1W98A 5LXMA 2NRUA 4FC0A 5HX6A 1U54A 3Q2MA 4AZTA 3ENMA 4U0IA 4FKLA 3P78A 3MW1A 3TKUA 4ENXA 3E8NA 2VO7A 4H3QA 5JGDA 4K2RA 3R9OA 5A46A 5CSPA 3RPSA 2UW6A 3VS3A 2PVKA 3OUNB 3ZO4A 4U81A 4QMTA 3TCPA 2PL0A 1Y6AA 4CQGA 4WSYA 2XNGA 4K33A 1DM2A 2VO3A 3BU5A 1URWA 1CKIA 2B9IA 2O3PA 3Q4TA 3F5GA 4CG8A 5HICA 3NW6A 4W4YA 4WIHA 4A7CA 2XNPA 2ERZE 1ZAOA 3MFTA 5EM7A 4DGOA 4RVLA 1OPJA 4IB5A 3EYGA 4DFZE 4AT4A 5IA2A 3OBGA 3JXWA 3WF7A 3FI3A 1OBDA 1QL6A 5IZFA 2O8YA 4YBKA 3OMVA 4I5MA 1YWVA 3QAME 1B39A 1J7LA 4BI0A 3DOGA 4WD5A 5AJQA 5DBXA 5AV0A 3R8MA 4FEWA 1I09A 3NRMA 4PNIA 2UZTA 3EQGA 3C0IA 4JAJA 1YXXA 4PF4A 5JT2A 2C69A 3NCZA 3R8VA 3V5QA 3A7GA 3LFEA 3NUXA 4UXLA 4GK4A 3NUAA 5HE1A 4K18A 3FMHA 3KF4A 4HYUA 4MEDA 4G2FA 1M14A 3H4JA 1Z9XA 3I7CA 5LCJA 1XBAA 3ZMMA 1PF8A 4C38A 4NJDA 5J9LA 1FQ1B 1BLXA 1PXJA 4HYIA 5IA5A 5J87A 3V01A 4Z55A 2IG7A 2C6TA 4F9AA 3L8SA 5GJFA 2O0UA 4BTMA 2AC3A 4YR8A 3NUSA 3WILA 2W1DA 4MK0A 4ZEGA 3UOKA 2YFXA 3VBVA 3KMWA 4ANSA 1OUKA 2ITTA 1FMKA 3BCEA 2GS7A 4DC2A 3I1AA 3S2PA 1BKXA 3R7IA 3FBVA 2IW9A 1GIJA 4JIKA 2Z8CA 4X2GA 3V8SA 4O0XA 1GAGA 5AV4A 3QRUA 5C8KA 1ZLTA 2XK8A 4KIOA 1LUFA 4C7TA 4AOIA 4CNHA 3W8QA 1FBNA 3P5KA 2OK1A 3DJ5A 5HBEA 2R3JA 3FY2A 4BBFA 3WYYA 1JKKA 5I3OA 3Q32A 2UUEA 4B6LA 4C2WA 4HVSA 4FTLA 5K5NA 1IAHA 4BCJA 2ZMDA 3QKKA 5CAQA 1YXVA 4YBJA 4FV7A 2XK6A 4AUAA 3ATTA 3PLSA 4QMNA 2WOUA 3F9NA 3GCSA 3TEIA 3V5PA 2BMCA 1REJA 2J6MA 4RJ5A 2UZVA 1OL1A 4ASZA 4G6LA 4ALWA 3ZS5A 4FTIA 2XCHA 2XNEA 4MH7A 4O21A 4D9TA 3C0GA 3DCVA 4AW5A 5JQ8A 2QOLA 4GYGA 4LGGA 2FH9A 4ANMA 1ZYCA 3V6SA 4NEUA 4FT5A 5CAUA 4QTEA 3NAXA 2I40A 2WQBA 5E7RA 4KUJA 3IDBA 2YEXA 5KBQA 3OOMA 3NMUF 3FLWA 5GINE 3HDNA 1JKLA 1PXNA 2VNWA 1OPKA 3R7YA 2C4GA 2UZEA 2ESMA 3ZLSA 2H8HA 4R3CA 4XP0A 1H0VA 4JVGA 5C1QB 4MD7E 4C4FA 4J7BA 4O84A 1JSVA 3ZUVA 1A06A 3LCOA 4OTWA 3S3IA 5I9ZA 4WG5A 3OXIA 4MF1A 2VTIA 5E8YA 4UV0A 2UW5A 3PRIA 4E4MA 1J3HA 5F95A 2JAMA 4CV8A 2JDOA 2RG5A 3R02A 4KIPA 2X8EA 2YCFA 4MBJA 4E6CA 5JFWA 4UX9A 3C4EA 4U6RA 3A60A 2RGPA 4FT7A 4GIHA 4QMWA 4WT6A 3BV2A 3SG9A 5K4IA 3THBA 3QQJA 1FGIA 5DFPA 3UJGA 4ZZNA 5AP3A 4WO5A 1H01A 4YNEA 2X7GA 2OXYA 5AIRA 4BFMA 2ZV9A 3QX2A 5A4TA 2Y6OA 3NNXA 4YPDA 2VTPA 2YM8A 4G34A 5CYIA 3D7TA 3T9TA 4WBBB 4YSMA 4LV5A 2BZKB 5HIEA 1MP8A 2G2IA 2H6DA 1CMKE 2F7ZE 4EOQA 4YJVA 2VNYA 4FG9A 3D7TB 3E92A 4NM7A 4W8EA 4U3ZA 1PXMA 2GTNA 1H26A 3F7ZA 3I4BA 3DTCA 4IBMA 4XH6A 5IUIA 4ZJJA 3SXRA 3O50A 1R78A 2YIWA 5CF4A 3VS5A 4MXAA 5M4UA 5I4NA 4E93A 2BHHA 1ERKA 1U46A 4YJTA 3VUHA 4N0SA 2DYLA 3MBLA 2W7XA 3BYVA 3DBCA 3H0ZA 4L45A 4L67A 2VTHA 3BU6A 3ZEWA 4AT3A 5KE0A 4BN1A 4D2TA 2R3PA 3P7AA 3AXWA 1OKYA 4BTFA 2PTKA 3QC4A 2PMOX 2VV9A 2WU7A 3Q4CA 4BCMA 4F70A 3DXPA 4U5JA 2RL5A 3EQIA 3G9NA 4GEOA 4FYNA 4I0RA 2CMWA 4QYEA 2XNMA 3PG1A 3RPVA 5GJDA 3ROCA 2HAKA 5CTPA 4OR5A 3BGQA 3SRVB 3L8PA 2GTMA 5H3QA 4I20A 4RQKA 3RJCA 4DG0E 2C6LA 5ICPA 5C03A 3F2RA 2ZYBA 3MB6A 4FG8A 4TWNA 4BDHA 5E1EA 3KXHA 3R00A 4RWKA 4R7IA 1WBNA 5A14A 1P2AA 3D9VA 3ET7A 2VTNA 2PVRA 3HDMA 3QYWA 4EOJA 5A54A 2C5NA 5HU3A 1AD5A 4G3CA 2C0IA 5ANJA 3REPA 3E88A 4A9SA 2OH4A 4UYNA 4IX3A 3U6IA 3LAUA 4HYSA 3ZEPA 5E8VA 3Q5IA 3S0OA 3PY1A 4ZSJA 4PMPA 2OJIA 2VWVA 1SM2A 3GU7A 5IQAA 3R8PA 4FEVA 5AUVA 2WPAA 1YWRA 4EYMA 2YIXA 4ZZMA 2FVDA 4TPTA 2F49A 4IM2A 3HAVA 1MRUA 4R3RA 4RGJA 4NK9A 3VQUA 4CFXA 3FDNA 4CGAA 4YTIA 3QF9A 4MXYA 4W4XA 3TZMA 2HXQA 2VTLA 3BV3A 3DKGA 3R7OA 3TTJA 2B9JA 2WELA 3HMIA 4RIWA 3PXZA 4EKKA 4E26A 1HCKA 2YABA 4F9CA 4QYHA 2ITOA 3BZ3A 4I4FA 4RIWB 5TO8A 3AOXA 2X7OA 2A4LA 5IF1A 4CTBA 3G6HA 3NCGA 3FEGA 3TNHA 3CTQA 2HW6A 2XYUA 4KWPA 4XRLA 3COMA 5HG5A 3VS6A 2CKEA 4AQCA 4PMSA 5AAGA 4J8MA 1WBSA 1DS5A 4CVAA 4N70A 1R0PA 3HNGA 4XG6A 3IONA 1A9UA 2BZIB 4B99A 2C3LA 2UW8A 5AUXA 4FT9A 1XKKA 4BL1A 2ITXA 4EBWA 4BKZA 5EKNA 2PZYA 4YNOA 4ZJVA 3SW4A 4HGLA 5KKRC 2WMUA 4I6QA 4DCAA 5IQDA 3QD0A 3EN5A 1FVRA 3O0GA 4O0UA 4X3FC 4YZDA 1O9UA 3C4FA 1IA8A 3FLZA 4EQUA 4HPUE 4FKQA 2JIVA 4RPVA 5GNKA 3SXSA 3CEKA 4FV8A 4FSWA 2PZPA 5DRBA 4HYHA 4A4OA 3AMYA 2PUIA 3QFVA 3RCDA 3PJ8A 4L46A 3UBDA 3VJNA 4D1ZA 2ZVAA 5CSWA 5L6OA 3UPXA 4JBOA 4ZK5A 5JRQA 4FTUA 4FMQA 4QYFA 3ORNA 4FL3A 5CNNA 3LKMA 4A4LA 1CM8A 4FSTA 5LMAA 3ETAA 3ZM4A 4CMTA 5HD4A 1CKJA 3ITZA 4BCPA 4HZSA 3SX9A 3ZRKA 3W2QA 3COIA 4H36A 1GZKA 3R01A 3V5TA 4YC3A 2OJ9A 4I22A 4KA3A 5IISA 4ZTQA 2YAKA 4G31A 2VWXA 4ZTNA 3PUPA 5JFVA 2BZJA 1U59A 1WZYA 3HUCA 2IWIA 3DTWA 3O7LB 3PG3A 4S34A 3RAWA 3IS5A 4UN0C 1M2RA 1GY3A 5HEZA 4E6QA 3CD8A 3R22A 2B54A 3O23A 4EC9A 3HV5A 4O1OA 2Z7QA 3DLZA 3UVRA 2WFYA 1NVSA 3DNDA 4YJQA 1UVRA 3OXZA 5A4EA 2FYSA 1ZZ2A 4JBPA 4R7HA 3ZC6A 3K3IA 2GHLA 3OTUA 4ZY4A 5IQFA 3NYOA 1M52A 4AGWA 5DHJA 3A8WA 1XH4A 3BIZA 3LXPA 4EJNA 4EOOA 2W06A 2ZAZA 4Y73A 5JH6A 1JPAA 1V0BA 1S9IA 3JPVA 3ZRMA 3UC4A 1P5EA 4ZTMA 4UMTA 1URCA 5HHWA 4C61A 3KN6A 2FB8A 4U41A 4AOTA 3IOKA 5EI8A 5AR2A 5CSHA 2YIRA 5AEPA 3QTUA 5HX8A 4APPA 5CAVA 2B1PA 5EOLA 1M2PA 4KS8A 3WZDA 4DFXE 3MTLA 1IAJA 3SG8A 3DGKA 1IG1A 4FV4A 1OI9A 2W9ZB 3V8WA 4D5KA 3HV4A 2YISA 2VD5A 5IQEA 3F5XA 4IVCA 2PUPA 1Q8TA 3MPTA 4D58A 4IADA 4C4HA 2BFYA 1O6KA 5I9XA 1IA9A 4DH1A 4ACHA 2ACXA 5I9WA 3W10A 3U6HA 3QYZA 2YHVA 3LFSA 3OCBA 1JBPE 2OFVA 4NU1A 4F64A 3QQLA 1WBPA 4RWJA 3UG2A 4L3PA 5L2QA 1OUYA 2F7EE 3DXQA 3MH0A 3U9NA 3Q9XA 1R1WA 5FQDC 3ULIA 3I5NA 4F1TA 5AMNA 1SNXA 5CSVA 3OS3A 4QPSA 3C50A 2CJMA 5TKDA 3CCNA 4TYJA 5FEDA 1ZRZA 1YDSE 1KOAA 2WQNA 3LJ2A 4JL9A 4L43A 3IKAA 4MXXA 4YTHA 4CFWA 3VC4A 5M56A 3CKWA 3FZPA 3QCSA 3QA8A 3MVMA 4Z7GA 3QX4A 5AP0A 3E3BX 2WTVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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