4GT5A

Crystal structure of the inactive trka kinase domain
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
290
Chain Sequence
SDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPDKMLVAVKALKESESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Assessing the range of kinase autoinhibition mechanisms in the insulin receptor family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 290
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gt5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gt5A01
1GAGA 2UW9A 3L8PA 4D1ZA 4YJUA 4OTWA 5AEPA 4C4HA 4U44A 2ZYBA 5D7VA 2PZPA 2ZDTA 2QNJA 3EN7A 3MFSA 4H58A 4R5YA 3VF9A 1PMUA 3G9NA 4D4SA 2YM5A 4F7JA 3V8TA 3FL5A 3NNUA 5JT2A 1XH5A 3RNIA 2WHBA 3GC0A 5AJQA 4BIDA 4M0ZA 5DRBA 5J9ZA 2G2IA 3F3UA 2JGZA 3BYOA 1ZAOA 4P7EA 2CCHA 2JLDA 2WD1A 3OT8A 5EDQA 2OGVA 3Q4ZA 3ZUTA 4CFFA 4EBVA 5ETAA 1KE7A 3ACJA 4GU9A 4EOSA 5IQFA 1PXNA 1XHAA 3GUBA 4XV2A 3Q52A 4H3BA 4DFNA 4JAIA 1U54A 2J4ZA 2OSCA 3DAEA 4FEVA 3EKNA 2YDIA 4GVAA 1PY5A 3FMLA 4OBPA 3TJDA 2QODA 3FMEA 4O96A 4CFVA 2ERZE 4EWQA 4L44A 2UUEA 4OLIA 4CMOA 4IX3A 1E9HA 3FLZA 3UO6A 3UNJA 1BI8A 4AA0A 5JFSA 5KUPA 3TUCA 4DA5A 3R22A 2VTRA 3GT8A 3RALA 1Q3WA 5HZNA 4AN3A 1H24A 4QP6A 4WBOA 4XX9A 1YOJA 5EOLA 3HUCA 4NM0A 2VWBA 2QU5A 4PQNA 4X6RA 2QO2A 3O51A 3HMPA 3D5WA 2QO7A 2QURA 2WMSA 2XIXA 3PXKA 1JQHA 2F49A 2ITYA 3NX8A 4XG4A 2PY3A 4BCKA 5EW3A 4DYMA 4QD6A 3UVQA 4CFUA 5I9WA 4IX4A 3ZMMA 4IWOA 4M15A 4YZBA 4H3PA 3VJOA 2HOGA 4YUQA 3KXMA 4ZSAA 4A9TA 3CIKA 3UQCA 2IZRA 1P2AA 4I6FA 1ZOGA 2B9FA 2HIWA 2V22A 2VWXA 4YJPA 3WF6A 1JKSA 4AOIA 3CKWA 3UC4A 4N6YA 3I0QA 4RLKA 4TTHB 2R3QA 5AV2A 4U79A 3UQFA 4PPCA 3UP7A 4C61A 3GI3A 1B6CB 3QQHA 4JI9A 1UNGA 2VAGA 4AGWA 2GNJA 5HE0A 1KE5A 3UBDA 3KMMA 4I92A 1W0XC 3CEKA 1DAYA 4MNEB 2O0UA 3QQKA 2J2IB 2OZOA 4O0TA 1KV2A 3GCVA 4G3DA 4QP7A 4ALVA 1ZZ2A 2YIXA 1TQMA 4QPAA 4J71A 3DZQA 3ZH8A 5E90A 4QYGA 3QCSA 2E9UA 3QCYA 3F6XA 5ETFA 5F94A 5A14A 5BX0A 1V0BA 3LFSA 4ANSA 4BB4A 4IAZA 1L3RE 2C0TA 3FMNA 4I0TA 4IAAA 4Q5HA 5KCVA 2YM3A 3K54A 3LOKA 3WYXA 3FHIA 4CXAA 5AADA 3PZEA 3CC6A 2R3FA 4K77A 3VBWA 3GFEA 5AUWA 3V04A 4AOTA 3NIEA 2XNBA 3R21A 5GJDA 3QQJA 4F64A 4RIWA 2IW9A 4ZY4A 3A7JA 3HA6A 4MNEA 4S30A 5FP5A 5AMNA 2XK7A 3TI1A 3PSBA 5HCXA 1OI9A 3QRJA 3WI6A 2OZAB 2YN8A 3CY3A 1JLUE 4U9AA 4WIHA 3ODYX 1S9JA 3U9CA 4AOJA 2BDFA 5IQBA 2WMQA 4S34A 2PMOX 4U43A 2IVSA 4L3PA 5EDPA 3UZRA 4ZJJA 4CLIA 3AC5A 4J53A 3S2PA 3JPVA 5EK7A 5C26A 5IQGA 3KRRA 4IB1A 5IU2A 5HQ0A 3NS9A 4IZAA 4KSQA 3POOA 4PDSA 4A06A 2BAQA 3OZ6A 4C3RA 4RIYB 1BL7A 3DKOA 1G5SA 5ETIA 3RCJA 4DGMA 5ETCA 3JS2A 5AP1A 4RBLA 4K1BA 5I3OA 2B4SB 1E1XA 2ZMDA 3KQ7A 2OZAA 4FKTA 4UMQA 3TTJA 1U5RA 3PXYA 1Q8TA 1YI6A 3TZ8A 3KN6A 3QLFA 3C5UA 3IS5A 4RVLA 3G5DA 3FSFA 3OTVA 4W8EA 3ZRLA 4RVKA 5AA9A 4E4NA 2VWUA 5EHYA 4MNFA 4AZFA 4F65A 3R1QA 2GMXA 1FBNA 4FL2A 4HVDA 4JBQA 2PE2A 4AFJA 4QYHA 1RDQE 3BWJA 5LMBA 3GU7A 1TVOA 4MH7A 2H96A 5CU2A 4DTKA 4ZIMA 1J7LA 2W4JA 2WQBA 2VU3A 5FWKK 5T6KA 1J1BA 4M0YA 3R9NA 4EC8A 2WGJA 2XBJA 4RQVA 2VTSA 3OT3A 1YI4A 3ZZWA 5HTBA 3BV3A 4X2JA 3HL7A 4JJRA 4U3ZA 2R9SA 5IA2A 2W99B 4UX9A 4C62A 3SGCA 4D28A 5AUVA 1H1PA 2Y4IC 3WYYA 2GNLA 4AFEA 4ANLA 4EOJA 2RG6A 1GZKA 3AD6A 5EYCA 3FEGA 4IW0A 2WIHA 3TV6A 2EU9A 2JDTA 4PNKA 3NDMA 3ORPA 3RNYA 3KULB 1JBPE 1MUOA 3EN6A 3BE2A 4FTNA 3JY0A 5ANGA 1RE8A 2FSMX 4TYJA 4NZWB 4HVSA 2W4OA 4MX9A 3A2CA 5K5NA 4WNKA 1OIQA 3WBLA 4JG7A 4H39A 4QP8A 3P7AA 3FAAA 5L8KA 3VHKA 5GHVA 4LGHA 4YBKA 1WVYA 2BDWA 4YPDA 4YJNA 4HNIA 3RAWA 2H9VA 4BC6A 3L9LA 3R8PA 4UXQA 1CMKE 4OTIA 2VTTA 3KULA 1VZOA 3FKLA 3ZLSA 4ZTQA 2YA9A 4FZAB 4EQMA 5HU3A 4M69B 3ORXA 3TIYA 4QTDA 5L2SA 5G6VA 3T9IA 3DJ5A 1H25A 2X7FA 4K6ZA 5CAQA 4G2FA 1GIIA 5HG7A 2OJFE 4EOPA 4ZLYA 4FSZA 1MQBA 5J8IA 2V7OA 3ULIA 2HENA 2VTIA 3VRZA 4PL4A 4BYIA 4YO6A 2IN6A 4H3QA 3UIBA 4JDIA 5GINE 5KNJA 1UA2A 3K5VA 3VUKA 4O22A 4AGDA 3KRJA 2QONA 3DAJA 3VS1A 2KTYA 3BU3A 3EWHA 3W2OA 4DCEA 2W5HA 2QOFA 1NY3A 4Q9ZA 1G8AA 2YDKA 2JKOA 3ZEWA 4AACA 4M69A 4PP9A 5FBNC 4EK8A 1JPAA 3EYGA 4RWJA 3Q96A 4EH9A 4BCQA 3ZRMA 4AZEA 3LQ3A 3PY0A 4FF8A 5F4NA 1VYZA 4AWIA 5IISA 3SVVA 2OXDA 2RFEA 2V5QA 3GENA 4R3CA 4UMUA 5LVNA 1SVEA 4FTAA 5CVGA 3UMXA 3LXKA 3PP0A 4QP4A 3FMKA 1T46A 4PDOA 3HVCA 4C59A 3BYMA 4YJSA 4USEA 4FV5A 4FTJA 4JDJA 3R8UA 3M1SA 4HPUE 2IPXA 3S95A 3Q2MA 5J5TA 4JDKA 1PKDA 4RSSA 5I0BA 3O8PA 1G8SA 4FKWA 5DOSA 4F0IA 4GS6A 3C4CA 4EEVA 2WQEA 2G2HA 2ITVA 3ET7A 4QTCA 3E8NA 5JSMA 1XH9A 4QMNA 5AAEA 2RIOA 3DXNA 3F3ZA 2OBJA 3QYZA 5AAFA 4CKRA 3KXHA 1Z9XA 2WTJA 3NAXA 3O0GA 3OOMA 3Q4UA 3VUGA 3WARA 5CAUA 3DBEA 3NGAA 3QF9A 5CXHA 2X2LA 1H8FA 2WIPA 2YM7A 1F3MC 3PXQA 5I4NA 2GQRA 3BEGA 1PXMA 4RJ4A 4NK9A 2WMUA 4ANMA 3ZLXA 4DN5A 2XNMA 4DT9A 4TWCA 2XA4A 1K2PA 4E5AX 4IACA 1YHSA 5AP2A 5HNIX 3LCDA 3FXWA 2CDZA 3IPHA 4JBPA 2CNVA 5IPJA 4C4JA 4EYMA 1J1CA 2XKDA 1Z5MA 3ERKA 5BVKA 4GKHA 2ZM1A 3P08A 4AW5A 1SM2A 3C13A 4ITJA 3EZVA 3I6WA 4W4WA 3OY1A 5ANEA 4CEGA 3F5PA 5EHLA 4EOLA 5J5SA 4FV6A 5KMKA 2C47A 5LJJA 4O86A 4DT8A 2XK9A 3HP2A 3OW4A 3CGOA 1BX6A 4LMUA 1KOBA 4XP2A 3I6UA 2VTJA 3OUKA 2OIBA 4ID7A 3E5AA 1O6YA 4MVFA 3O71A 5ICPA 3IW6A 3CGFA 3TKUA 5DR2A 4DEHA 4QMTA 3D5UA 4A4LA 5A9UA 3VW6A 1LPUA 3LXNA 4E6CA 5CNOA 4U7ZA 4EH7A 2I40A 4HYHA 2W06A 2QU6A 4HYUA 1GIJA 3SXSA 4GYIA 2W1HA 1CKIA 2VNYA 3PXZA 3THBA 1GJOA 3D7ZA 3F2AA 3KY2A 4NKAA 3AC1A 2XF0A 4C35A 3HDNA 4KUJA 4DLJA 3ROCA 2JC6A 1Q3DA 4EH4A 5I3RA 3UPXA 4TPTA 2BCJA 3GOKA 3WE8A 5IA3A 4BWKA 3DKGA 3ATTA 3ZC6A 3LM5A 5E8YA 3VN9A 5FGKA 3ZLYA 4HCTA 4DF3A 4JIAA 5TO8A 4CZYB 4FVQA 3GC7A 4IJPA 3PJ2A 1T45A 1FINA 2J50A 2J5EA 2NNWB 3OG7A 3QUEA 4FOCA 4C38A 3LCTA 4JOAA 2XNEA 3K5UA 4UN0C 4FSWA 4BZNA 4ZMFA 3UOKA 5AP7A 4LUEA 3WILA 1F0QA 1FMKA 1YDRE 3HMOA 5CALA 3VUHA 4D55A 3EKKA 5CVFA 1Q8WA 4FK6A 1JOWB 1YDSE 4NKSA 3AC4A 2LAVA 5CEIA 4F70A 4KNBA 1GZNA 3ZONA 4G9RA 3NNWA 2BPMA 2YCFA 4NCTC 4B6LA 4EI4A 3LQ8A 4FBXA 2IW6A 2B52A 5HBHA 2OIDA 4PX6A 1FGKA 4GIHA 1X8BA 2Z7RA 5HI2A 5T3QA 3SX9A 1JSUA 3V5WA 3W2CA 2BILB 3UPZA 2Z2WA 1XBAA 4FTKA 1E1VA 3OXIA 4QPMA 2NPQA 1GZOA 3HX4A 4CRLA 1GOLA 3KGAA 4C0TA 4X2KA 3KXNA 4YTFA 1J3HA 2PU8A 3C4EA 2W5AA 2XMYA 2XK3A 4LUDA 4CFMA 4E8AA 4O1PA 4BIBA 3N4UA 4L9IA 3UYTA 3PRIA 3EIDA 4RJ6A 4BCPA 3RPSA 5C8NA 3G0EA 3HV5A 4U41A 3CE3A 4ZK5A 4USFA 5T68A 4J8MA 4RFZA 4TKSA 3AT4A 4NM7A 4P5ZA 4WHZA 5AR5A 5IQEA 1L8TA 3PP1A 1U59A 3TCPA 3DBDA 4I21A 5J1WA 5AP5A 2JAMA 2PVNA 3IG7A 1KE8A 4EYJA 5FEQA 3VUDA 2VTAA 4OR5A 5HO6A 3W8QA 3MY0A 1UNLA 2R4BA 1WFCA 4MF0A 3UO4A 4BZOA 2QG5A 3DXPA 2GHGA 3MH1A 3C0HA 4X3FB 5AP4A 3BBTB 4YMJA 4PV0A 4M67A 5EM6A 1PJKA 2UZDA 3BPRA 5GJFA 5M56A 4O7ZA 2HY81 1RQQA 4EH5A 3LFFA 3MS9A 2ITZA 4I1ZA 4C36A 3TDWA 2UW8A 3IOKA 2ITPA 2UW4A 5HO8A 4HVIA 2HAKA 2NP8A 5AP6A 5E8TA 4AT3A 4O7YA 4EJ7A 1I09A 5HNGA 3EQBA 4FIFA 3FWQA 2FH9A 3SC1A 1FVVA 3D5XA 5D9HA 4J99A 3UC3A 4YURA 4FNWA 5B7VA 1WBOA 1UU3A 3QKKA 1NVRA 3B2TA 3AG9A 1YHWA 3QA0A 3QC9A 2C3JA 3R0TA 4ZTMA 2OLCA 4IX6A 1KWPA 5DR6A 4AZSA 3LPBA 3DTWA 3FE3A 3RHKA 1Y6BA 4I5HA 3A61A 2EXCX 3LVPA 3IONA 4C4EA 2YJSA 5ANDA 4X3FA 2XRUA 3MPTA 4H1MA 3IW8A 4J96A 5L8JA 3RMFA 5LARA 4O82A 1CKJA 3E88A 4XNEA 4BDBA 1FVRA 3EN5A 3C51A 3PPJA 4IFCA 4FZ7A 4QQ5A 4RZVA 3REPA 3T9TA 4EQCA 4FEWA 2J5FA 4RIXB 3PZHA 4XOZA 1PRYA 4CSVA 1S9IA 4D2SA 2XYNA 4UXLA 2Z7LA 3R28A 2P0CA 3MY1A 4K18A 4UMTA 2ZB1A 3C50A 3AT3A 4RGJA 4U3YA 4ERWA 1W83A 2G1TA 3DGKA 4BWXA 4YC8A 4FKOA 1BKXA 2YIQA 3TG1A 3PIZA 2YZAA 3IDCA 3D5VA 3HP5A 3IW7A 3EB0A 4FA2A 5AFVA 1DAWA 2QOHA 3LLAA 4FUXA 5HESA 5M57A 3CQWA 3O23A 2Z7SA 1H01A 3LMHA 3KVWA 4JBVA 4RIXA 3RHXA 3ODZX 2CGUA 4DEIA 4BCFA 3RAIA 4V05A 2PULA 5FDPA 2J0JA 3EFKA 4FIHA 1ZMVA 2X8DA 4FT9A 2C3LA 4FV9A 4L00A 3LFNA 1ZZLA 3GCQA 4QO9A 3VS4A 1SNUA 3NUYA 5LMAA 4NYEA 1U46A 5IZFA 3RPVA 4R8QA 3BLHA 5ACKA 2XBAA 3BHYA 4DEBA 4GKIA 2JIIA 4MBJA 1Q8YA 2B1PA 2ITTA 3R30A 4AX8A 4DH1A 4IWQA 3TUBA 1IA8A 4EOQA 4B0GA 2OH0E 2PUIA 2C30A 4U81A 3MVJA 3NIZA 1IEPA 3NYVA 4TXCA 3VHEA 1ZMUA 4FTLA 2CCIA 2W1GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GAG A;  2UW9 A;  3L8P A;  4D1Z A;  4YJU A;  4OTW A;  5AEP A;  4C4H A;  4U44 A;  2ZYB A;  5D7V A;  2PZP A;  2ZDT A;  2QNJ A;  3EN7 A;  3MFS A;  4H58 A;  4R5Y A;  3VF9 A;  1PMU A;  3G9N A;  4D4S A;  2YM5 A;  4F7J A;  3V8T A;  3FL5 A;  3NNU A;  5JT2 A;  1XH5 A;  3RNI A;  2WHB A;  3GC0 A;  5AJQ A;  4BID A;  4M0Z A;  5DRB A;  5J9Z A;  2G2I A;  3F3U A;  2JGZ A;  3BYO A;  1ZAO A;  4P7E A;  2CCH A;  2JLD A;  2WD1 A;  3OT8 A;  5EDQ A;  2OGV A;  3Q4Z A;  3ZUT A;  4CFF A;  4EBV A;  5ETA A;  1KE7 A;  3ACJ A;  4GU9 A;  4EOS A;  5IQF A;  1PXN A;  1XHA A;  3GUB A;  4XV2 A;  3Q52 A;  4H3B A;  4DFN A;  4JAI A;  1U54 A;  2J4Z A;  2OSC A;  3DAE A;  4FEV A;  3EKN A;  2YDI A;  4GVA A;  1PY5 A;  3FML A;  4OBP A;  3TJD A;  2QOD A;  3FME A;  4O96 A;  4CFV A;  2ERZ E;  4EWQ A;  4L44 A;  2UUE A;  4OLI A;  4O4D A;  3W0Q A;  4CMO A;  4IX3 A;  1E9H A;  3FLZ A;  3UO6 A;  3UNJ A;  1BI8 A;  4AA0 A;  5JFS A;  5KUP A;  3TUC A;  4DA5 A;  3R22 A;  2VTR A;  3GT8 A;  3RAL A;  1Q3W A;  5HZN A;  4AN3 A;  1H24 A;  4QP6 A;  4WBO A; 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