4H1MA

Crystal structure of pyk2 with the indole 10c
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
271
structure length
256
Chain Sequence
IAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of novel series of pyrazole and indole-urea based DFG-out PYK2 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein-tyrosine kinase 2-beta
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 256
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4h1mA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4h1mA01
2IW6A 3LHJA 4O2ZA 4YZDA 3HX4A 2ONLC 3AMYA 3JY9A 4CV9A 4F0GA 1YXXA 4QP2A 4TYHA 5CT0A 4R3CA 5JRQA 3HRFA 3MFSA 4GYIA 4IADA 2UZVA 4EC9A 3A61A 4AP7A 2CMWA 3Q6WA 3L9NA 3MJ1A 3IOPA 4FVPA 4QD6A 2XK4A 5LOHA 3I6UA 1Z57A 4AX8A 3LVPA 3QA0A 4NEUA 2ETRA 1UWHA 1W98A 3UMXA 4KKEA 1H8FA 3S3IA 1P2AA 5AIRA 3AT4A 4F7JA 1P5EA 3TXOA 2YHVA 2XK7A 4BBEA 3EJ1A 1H08A 1IAHA 2HXLA 2RF9A 5L2SA 2R3RA 3S00A 2C5NA 3EZVA 2QLQA 2YM3A 3CS9A 3DB6A 3QBNA 4OT6A 5JRSA 3RALA 3W8QA 2GDOA 4IJ9A 4EOSA 4UMQA 3C4EA 4QMPA 4O6EA 5DMZA 4RLKA 2WMSA 1YXTA 4XBRA 4N57A 4O21A 4II5A 3V5QA 5IA0A 5AP4A 3O8PA 3D94A 5IH4A 2V62A 3QCYA 4QMVA 3IDBA 4CRSA 4E4LA 2Z7QA 2ITYA 2EXCX 1WBVA 2CLXA 2O63A 4JBPA 4F9BA 3S1HA 3DNEA 5DOSA 5KHXA 1DI8A 2HIWA 3Q6UA 4YJTA 3UQFA 3R9HA 1H28A 2X0GA 4Y73A 4DITA 2V55A 4LGDA 2YDIA 3O7LB 4N70A 4PY1A 3E7VA 4AZVA 4CQGA 3NCGA 4I0SA 2BIYA 3QD3A 1VEBA 5GZ9A 2QLUA 5ANJA 5C8KA 1PXKA 4N4SA 2A0CX 5DI1A 3R7YA 3KREA 4ID7A 2WMRA 3EFKA 4BDGA 4DH5A 4YJSA 4F08A 5ANDA 3LXKA 4EH4A 3I1AA 5FM3A 4LL0A 3ROYA 2GQGA 5IUGA 4GKHA 3UGCA 5FTGA 2YWPA 2JFMA 4I0RA 4ZSEA 3QYZA 4D58A 3SGCA 4I5MA 5HCXA 4FYOA 4AE6A 4IVDA 5DFPA 3HMIA 2I1MA 2R7BA 3MTFA 2H6DA 1TQMA 4EWQA 4PTCA 4EQCA 4FEVA 1PYXA 3FXZA 3C4CA 3UPZA 3R9RA 4X21A 3RCDA 4E8AA 4ALUA 4RFMA 2WTVA 5AR5A 3ZXZA 5JKGA 2VTSA 4BVUA 4G3CA 4D28A 2VWYA 4K8AA 5LWMA 4DA5A 4FSTA 3DJ6A 1B38A 4D1ZA 3HV3A 4GT4A 3U51A 3WZEA 3EFWA 4M8TA 2WAJA 4GSBA 4BCQA 4X3JA 4D1SA 4XG6A 4M0ZA 3HKOA 3QTQA 4FSZA 1UU3A 3V3VA 3ZC6A 4TY1A 5IDPA 4FSQA 3ZH8A 4UN0C 2WQBA 3AT3A 3CJGA 4GUBA 1OKWA 3ZUUA 3HV6A 3C13A 3P0MA 5KZIA 4PL5A 3C9WA 4AACA 1YDTE 4M3QA 2JITA 3PY1A 5EHOA 1ZXEA 1J3HA 4O0YA 4QP8A 2ESMA 4C8BA 2EWAA 2P33A 3EB0A 4UWBA 3AMAA 3CLYA 4NU1A 3F82A 3BLQA 2OSCA 3FQEA 4IFCA 4GH2A 2YACA 4JDHA 4CMOA 4CGAA 3AT2A 2QOQA 4ERWA 4H3PA 4RIOA 3QRTA 4J53A 3KXHA 1YQJA 5AIKA 4IWDA 1QPJA 3GNIB 1J91A 2CN8A 3V6RA 1IA9A 1GY3A 2OLCA 1FVRA 2ACXA 4FKPA 3F2RA 4U40A 1F5QA 4ZTSA 5AP7A 2R3HA 3DK7A 5LMKA 4RQVA 4KD1A 4CMTA 3EQHA 3BLRA 4D5KA 4IBMA 2WNTA 5E8WA 5EDQA 4L42A 2ZJWA 3OHTA 3GT8A 4Q5EA 5H2UA 4R77A 3DAKA 3DJ5A 4QO9A 3RJCA 4DGGA 4J99A 2GNFA 3ZO2A 3VJNA 3FZSA 5IUIA 2WOUA 2PUNA 4FYNA 3PJCA 4Y72A 4AN3A 3QQFA 4WNOA 1STCE 2C3KA 2YCFA 1CKIA 3TIYA 1V0OA 3SA0A 4F7SA 4QMOA 3KU2A 4BWXA 2YITA 4EH6A 5EW8A 2F7XE 4BDCA 4CKRA 5M4FA 4H39A 4F1OA 3E93A 4G3FA 5E7RA 3T8OA 3R7GA 2C1AA 2FYSA 5DRDA 2YWVA 3NW7A 4KIQA 5D1JA 5IKWA 1Q4LA 3BU3A 4I24A 3QKMA 4BIEA 3NR9A 5F20A 3ENMA 1L3RE 1XO2B 3FZ1A 5M4IA 3AC4A 2W1HA 4RFYA 4YZ9A 5AX9A 5HIBA 3IGGA 4X2NA 4BCMA 4BTJA 3P23A 3TI1A 4AA0A 2PULA 3BBWA 4DG3E 5KCVA 5EM5A 2WTIA 2UVZA 5M08A 5HICA 3FUPA 5EDPA 4EYMA 1OBGA 4EC8A 3GEQA 4FE2A 3HGKA 3DXNA 1ZZLA 5AV0A 1OVEA 4U6RA 2GU8A 2X9EA 4JDIA 2OZAB 4F0IA 1PKDA 3FEGA 4Q2AA 2G2HA 4FZFB 2VGPA 2XUUA 3E8DA 4R1VA 3QLGA 3DT1A 4GVJA 3RM7A 2UZDA 4FMQA 3GOPA 3QC9A 3K3JA 2R3GA 4FKTA 3G2FA 2Z02A 2ERZE 4GT5A 4U79A 4RBLA 2ITPA 4FSWA 4IM0A 1PXOA 4KIKA 2CDZA 3LCOA 3LCTA 5J95A 2GFSA 5M4CA 3PG3A 1OZ1A 5DR6A 2VWZA 3F5GA 3KMMA 3ORKA 4MKCA 4EHGA 4ASZA 3DZQA 3DFAA 2Y4IC 3K2LA 5FWKK 4FIIA 4B4LA 4GL9A 4TYHB 4QTEA 3SVVA 4DHFA 2WKMA 2O2UA 2W9FB 4YJRA 3GGFA 4RVMA 3RWPA 2J51A 4G3GA 1OL6A 2VD5A 2YABA 1BKXA 3KEXA 2IJMA 4IX3A 5HD7A 3QZGA 4JR7A 2ZMCA 2QCSA 3EQRA 5J5SA 4RVTA 2WTJA 2OZOA 3DS6A 4C3RA 4ZSAA 4CTCA 4QP6A 5CQUA 4HZSA 4C34A 4BL1A 2GMXA 1KE8A 2VO7A 2Y9QA 3O71A 4IAFA 3O23A 3RPVA 3BU5A 3FKNA 3D2KA 5GJDA 4DT9A 4L3LA 4XEYA 2B54A 3W2CA 1LPUA 1MUOA 4DGNA 3U54A 2FH9A 3DXPA 4L67A 4RFZA 3NUAA 4QPAA 2BR1A 4CSVA 2OICA 4IW0A 3IGOA 1XBCA 5CSPA 4O0RA 3TWJA 3GC7A 3EL7A 2C69A 3DLSA 4QMUA 4DFXE 3NNUA 3HRCA 3QTUA 4PDSA 1QPCA 1QPEA 4ENYA 4IWPA 1OUYA 3GQIA 3I79A 4IC7A 3KXXA 3E3BX 2GQSA 1H27A 4UEUA 2OXXA 5FTOA 4BY9E 4J95A 4LG4A 4L53A 4YR8A 1JSTA 4GK3A 3HMPA 3ZONA 4FA2A 4TRLA 3A8WA 3OZ6A 4BF2A 2RFEA 1UWJA 4MCVA 4V01A 3DBDA 2GHMA 3QTZA 4WKQA 3EQCA 3VQHA 4FV2A 5EKNA 4IVAA 2ITXA 5LXMA 3VUGA 4EOMA 3FMLA 3UG1A 2QU6A 4QNAA 3V8TA 4EBVA 2W1EA 4YTIA 4UALA 2EU9A 2R3IA 3MVLA 4FTCA 4R8QA 1XR1A 1R3CA 3PJ2A 2FUMA 5E8YA 2QO9A 1R39A 3WBLA 2W4KA 3QZIA 3MH1A 4FTMA 4RMZA 3ACKA 3KA0A 4X3FA 4WHZA 2X2KA 3U55A 2WPAA 4A4OA 3CBLA 5AP2A 2VX1A 3FYJX 1Q41A 3NYXA 3TCPA 2IG7A 4F9CA 1H1WA 4RC4A 3SAYA 4MK0A 3TIZA 4PL4A 4OTIA 3TNHA 4MBLA 5JFVA 1SNUA 2J0IA 5GINE 3OG7A 2RSVA 3KMWA 4JBQA 2QU5A 5L8LA 3K5VA 3ORIA 3FYKX 4J8NA 4WA9A 1JPAA 3TZ8A 5HOAA 1Y91A 4MQ1A 5CSVA 4BCPA 4JOAA 3HL7A 4ZJIA 5IDNA 4QTBA 5KO1A 2BAJA 5HVYA 1GOLA 2QO7A 5AUXA 5HBEA 3EYGA 4M66A 3FMDA 5F95A 3D5UA 3FE3A 2WMVA 2A4LA 3GFWA 3QHWA 2WU7A 3UVPA 2VWBA 2X7GA 2QKRA 1LEWA 1E1VA 1BX6A 4M12A 3PP1A 4QP4A 2C6IA 1WBSA 4C4JA 4S30A 3DFCB 3G6HA 1OECA 5AR2A 4YO6A 2V7OA 4C4EA 4UX9A 3E87A 4I5HA 3CTJA 4ZJJA 4XRJA 3ANQA 5CEKA 3EN9A 3VQUA 4KS8A 2GNGA 3QQHA 3QA8A 3R1SA 3V04A 4Z16A 1B6CB 3N4TA 3QC4A 4ZAUA 3MI9A 4R5SA 3L8VA 3TNPC 3F6XA 3OXIA 4DGMA 5IA4A 5A3XA 4MH7A 3VUKA 1PMNA 2WO6A 3ZS5A 4EH8A 1FBNA 4Y83A 3COHA 1Q8TA 4HGEA 3V5TA 4GRBA 4EKLA 4LGHA 4RX9A 5LARA 1GIJA 2IWIA 2E9PA 3MY1A 4KSPA 1KSWA 4WOVA 3ALOA 1OIUA 4XMOA 3IW7A 3UZTA 1BUHA 4ACDA 1OI9A 5HVJA 1KE7A 4U41A 3POZA 3R04A 4I6BA 2WGJA 3LXNA 4PP9A 4XG2A 4E5AX 3SRVA 3I5ZA 5CSXA 5D41A 4AT4A 3MA6A 4CRLA 4D9UA 2VUWA 3PXRA 2X9FA 4DBNA 4JX7A 4FT3A 2O8YA 3LCDA 3UP2A 4ARKA 5BVDA 1NW1A 5C27A 1IG1A 3QCSA 2UVYA 3PIYA 4J98A 5CXHA 2HK5A 4ACGA 5AA9A 1H0VA 4XJ0A 2BZHB 4GG7A 4FV3A 3C5UA 4UB7A 3ZEWA 4H1JA 3UOHA 3UNJA 2IZTA 2PL0A 3UJGA 4ACMA 5CALA 3NUPA 4GKIA 1JOWB 2H8HA 2HOGA 3E3PA 4RIWA 3R9OA 3CEKA 4BI2A 3NYNA 3R21A 4WSYA 2CN5A 4JR3A 2XBAA 4U7ZA 4Z9LA 4PMMA 2X6DA 3KB7A 3VBWA 4CFFA 3OCBA 3R02A 4YZNA 3VVHA 3EN7A 3ZXTA 2P2IA 3EOCA 3NAYA 3EN4A 4FODA 4J97A 2BPMA 3VUHA 4CZUA 4DINA 1KV2A 3DTCA 4KBAA 2A1AB 1J1BA 2GPHA 3R28A 4ZEGA 4F99A 1PYEA 2OXYA 4WG3A 5CI7A 1VZOA 5CF8A 4AFJA 5CTPA 2J0LA 4H3QA 4BGHA 1WVYA 3UNKA 1ND4A 3UC3A 1ZY4A 5DH3A 3SW7A 1H1QA 4GW8A 4CKJA 3NIEA 5KZ0A 5AADA 1JBPE 5BPYA 3I81A 4Y5HA 1YOMA 2GS6A 4U97A 4W8DA 3SC1A 5I9ZA 2CKQA 5F1ZA 3LXPA 3RM6A 3VUDA 4EZ3A 3TZ9A 4RJ6A 4IH8A 2QOHA 3ZRLA 4CLJA 4L44A 3C0HA 1WCCA 3NRMA 5HZNA 3KK8A 2XNGA 4YJVA 4XRLA 4BN1A 3A7GA 2JLDA 5CZIA 3N4VA 3QUPA 5KKRB 2YISA 3WF9A 2PHKA 4YTCA 3TTIA 3NGAA 4O7TA 4KIKB 3BYMA 3DAEA 2PVLA 3SD0A 2YM7A 4NCTA 2BRGA 4BFMA 4DH1A 2OK1A 4AXAA 3R6XA 1PMVA 4IFGA 2X7OA 4XP2A 1PMEA 3DPKA 3LFNA 2R3MA 5TO8A 1PXPA 3BCEA 4I4FA 1IR3A 2HZIA 1Q8YA 2PE2A 3FSFA 3IW6A 3VRZA 4EI4A 3P7BA 2ZM1A 3BWJA 5AAEA 3Q5ZA 3CP9A 4DEIA 3QYWA 2VTJA 3VF8A 2PZIA 4U44A 3W2SA 4A9SA 4ZTMA 3D0EA 4M97A 3QL8A 3AC1A 1U46A 1PXMA 2VTHA 1UNLA 3OWPA 4PF4A 4B99A 4F6WA 3O96A 2YM5A 1NVQA 3UG2A 3CY3A 3PPKA 4CXAA 3R01A 1SZMA 4M0YA 1JKKA 1XH8A 3AC2A 4ZS0A 4HYHA 2ITUA 4RC3A 1W7HA 4UXLA 2Y6OA 3F5UA 4KBCA 2KULA 4YJOA 2XK3A 2E9VA 4F7NA 2YCSA 4FKWA 1YXVA 4YJUA 2BKZA 1VYWA 5LVMA 3VW6A 2BCJA 2Z8CA 5E90A 5EQPA 5BMMA 5J9YA 5K0XA 3EFJA 3UBDA 2J0KA 5BVFA 2W5AA 4C02A 2R7IA 2CNQA 1O6LA 4CCUA 1SVHA 4KRCA 4EHZA 2ONLA 2YIRA 4EEVA 1OKZA 1MRYA 3UVQA 1SYKA 3PRIA 4FTAA 3P5KA 2C47A 4RGJA 4PX6A 2YM4A 4BKYA 3I7CA 3OTUA 5CNOA 3LXLA 2WOTA 3F7ZA 3R7EA 2JEDA 1UKHA 4M84A 1TQIA 3GFEA 3PXZA 3QWKA 4XG8A 2P3GX 5IQEA 3EQGA 3MBLA 3MGYA 3VNTA 4DEBA 4TNDA 5DT0A 5IEXA 1T45A 1Q5KA 3P7AA 4QYHA 3C4ZA 3PRFA 4X3FB 5AWMA 5DYJA 5L8JA 5HO7A 3UYSA 3QRIA 3QU0A 1OPJA 5HBJA 2IVTA 2WTKC 4JJRA 5JGDA 1BL6A 4QTDA 2W4OA 2PSQA 3QD0A 4C58A 5IQFA 2YZAA 3G9LX 3RZBA 2FA2A 4CVAA 5HE3A 2QD9A 4ONAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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