4H3PA

Crystal structure of human erk2 complexed with a mapk docking peptide
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
349
structure length
342
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLAFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLAQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Protein-peptide complex crystallization: a case study on the ERK2 mitogen-activated protein kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 100
structure length 342
sequence length 349
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4h3pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4h3pA01
5LCJA 1YHWA 3KY2A 1MRUA 2BALA 3CKXA 3HMMA 4K0YA 4XH6A 3TG1A 2GPHA 4QQJA 1NA7A 3DQXA 4F9YA 3QGWA 3OXZA 5C27A 3ZZEA 3GCUA 4I24A 1YOJA 3UO4A 5TR6A 4IM0A 3C0HA 4ZZMA 3GFEA 2QOLA 2ITQA 3I0QA 2YLFA 3PPKA 4TWNA 4R6VA 5EKOA 3UPXA 5J5TA 5HE2A 1QPEA 2BZJA 4I41A 5DIAA 4H05A 4EKKA 3NW6A 5T6KA 5HCYA 2IW8A 1Q97A 3R8LA 5J79A 3JY0A 5DRBA 4BRXA 1ZRZA 4U43A 3QAME 3EOCA 3OXIA 1PMVA 2VO3A 4YTHA 1P4FA 4JIKA 4E6QA 2CNUA 2WTIA 1WCCA 3RWPA 4QP6A 2WQNA 4Q9SA 5HLWA 3E3BX 2EXEA 3ZRLA 2RFDA 2QO9A 4N70A 4X2GA 3RK7A 5ANIA 4DBXA 3GGFA 3LFFA 4KA3A 3DFAA 3FXZA 5CEMA 5AUUA 5K0XA 3I1AA 1YKRA 4WBOA 5EKNA 4I5PA 3EQFA 3L9MA 3ODZX 1ZYDA 4RIXA 3PP0A 4FUYA 1QPDA 4FKQA 2VV9A 4YPSA 3ZM4A 4C35A 4WOVA 4E3CA 5BMSA 5HVKA 2KTYA 4WIHA 1PRYA 3SRVB 4QP3A 2GFCA 3QBNA 1JQHA 4CMUA 3PPZA 4HCVA 4Z16A 3DDPA 5KMOA 3ZLYA 5KNJA 2ESMA 4FKPA 2PE2A 4UXLA 4RZWA 5AR3A 1HOWA 4IWOA 3DZQA 3KRJA 3MYGA 4IZYA 4YLKA 4IXPA 4ZSAA 3LVPA 4NIFB 4MHAA 3VBYA 3I60A 2LGCA 3PXFA 5IQFA 4AW0A 3TDWA 2PZYA 4DEGA 2R3RA 1YDSE 4HYIA 4E5AX 3EQDA 5K5NA 4O2PA 3ZXTA 3WIGA 5LWMA 2QLQA 3Q2MA 2PVNA 2YDJA 5L8KA 2WQMA 3R21A 1P5EA 3HLLA 4XG9A 4XNEA 1YQJA 2XRWA 1KV1A 1H00A 3GCQA 2WKMA 3PVWA 4O22A 5M57A 3SW7A 2X9EA 4RFMA 4TW9A 4ACMA 4UWBA 3FYJX 5EDQA 3G0FA 1OMWA 2OGVA 3A7FA 2X8IA 2CJMA 2FO0A 3V04A 4FZ6A 4WO5A 3FMMA 3SRVA 4DT8A 4FNWA 1S9IA 5L8JA 2YM7A 4O7NA 2GS7A 3KRRA 2YIQA 3R01A 2ERKA 2WMWA 3AD4A 4GS6A 2NNWB 2C3KA 4KKHA 4U3ZA 1AD5A 5HESA 3AT4A 4NIFA 2ETRA 3HV7A 2GNFA 3EFKA 3F7ZA 3ZDIA 4E8AA 2XYNA 3SHEA 5LVNA 4AE9A 5KMLA 5HG8A 4WHZA 3UNZA 4CZTA 5CAUA 1FOTA 2UV2A 2VTQA 2C1AA 4V01A 2YHVA 4NFMA 2W4OA 3ETAA 3FLQA 4EEVA 2ITVA 3D94A 4U81A 5CF8A 2REIA 2UW6A 4BDFA 1GY3A 3G9NA 3H9FA 3A8WA 4YZMA 5A4CA 4RIOA 2CPKE 3OOMA 5J7BA 3ZO2A 2Y4PA 2ZMCA 3MFUA 3FWQA 5B7VA 4IADA 4DC2A 2W5BA 3BZ3A 1Q8YA 4FTNA 2CGXA 3L9PA 4FKLA 2X2LA 4GUBA 3O7LB 4HVHA 5GZ8A 4PRJA 4ZTRA 3VBTA 3KA0A 3ORPA 2G15A 5AP7A 2NP8A 3ORIA 5CZIA 3W18A 3S1HA 4V04A 1FMKA 4J95A 5EI6A 2ITNA 3UIUA 1MRYA 4DCEA 5AV2A 1OL5A 4BTFA 3LJ0A 1KOAA 3R7IA 4CKRA 5IF1A 4ITHA 3FMJA 4M7IA 4JX3A 4O0SA 3MPTA 3F5PA 3RAKA 4RC2A 5HG9A 2Z8CA 3NUNA 4PWNA 5FEEA 4E4MA 5EYCA 5KCVA 4I5MA 2Y8OA 4CTBA 2R0IA 3FMKA 4I5CA 2BMCA 4G6OA 4EK4A 5DI1A 2Y0AA 2XZSA 4EQMA 1H1SA 4KIQA 4YC8A 1RW8A 3F5XA 2YDKA 4CLJA 5HIEA 2YLEA 4QMYA 1QPJA 3VUTA 5E8VA 3VWAA 4FT5A 5AIKA 4X3FA 2OIBA 3HUBA 4MNFA 4D4SA 1Y6BA 4ZY4A 4DG3E 3C50A 4BKZA 2YJSA 4QNAA 4F6UA 4OTHA 2P55A 3FMEA 4XV3A 3TUBA 4FTUA 5HORA 3QHWA 5K4IA 1PXMA 4KNBA 1Q61A 3RPOA 5CYIA 1W7HA 4HVGA 1W84A 3CJFA 3PDTA 4J99A 2PZPA 5M08A 5T3QA 5C4LA 4MXXA 5FM3A 3PIZA 3UZTA 3HMIA 4UZHA 3R83A 4Z3VA 4Y83A 4TWPA 4PQNA 2Q83A 4XP0A 3LCDA 3OY1A 2WEIA 2R3NA 4C2VA 3CE3A 4L45A 5AP2A 3B8QA 3KXZA 4FEQA 4QTEA 1YRPA 3HYHA 1M7NA 4FBXA 2C6OA 2Y6OA 1YOLA 3NNUA 5EW3A 4BDIA 1U59A 4IH8A 4YJVA 2LAVA 3MFSA 2GFSA 2C6MA 4I21A 5FTGA 3FLYA 4TYIA 5JN2A 4G16A 1NVQA 2YN8A 4HYHA 1Q41A 5ITAA 4NW5A 2J0JA 1TKIA 1P4OA 2PE0A 3UC4A 5IDNA 4ZLYA 1LPUA 4NWMA 1LEZA 4WUNA 3WILA 4AA5A 3NRMA 4ENYA 2YAAA 1ZYLA 4FV1A 1PYEA 2UVZA 4TYGA 5K0KA 2GS6A 4FUXA 2F7ZE 3ZHPC 4XBUA 3EZRA 2E9UA 4D1SA 2Z60A 4DGOA 3RWQA 5AIRA 2JITA 5T68A 2A4LA 5FRIA 2RKUA 3QX2A 3C51A 3FV8A 3Q9YA 3R7YA 5E1SA 4XP3A 2OIQA 2OF4A 1E9HA 3NYNA 5GZAA 5JT2A 2YM5A 4WG3A 2G2IA 4YSMA 3P7AA 3TKHA 4OLIA 3CKWA 3ZXZA 3FKNA 3FE3A 4AWIA 1XBBA 3M42A 4YO4A 3BEGA 2FSMX 1O6KA 5CSXA 5FXRA 4FTMA 3W1FA 5L2TA 5HU3A 2PZ5A 2C4GA 4OUCA 3ZDUA 3SKCA 4CT1A 2C5XA 2ACXA 3ZO4A 2XIRA 5KE0A 5FUTA 4BBFA 2RGPA 3DJ6A 2QU5A 5JGDA 4O86A 5ACKA 4GVJA 3R8ZA 4QQCA 5L6PA 3GU8A 2XCHA 4CQGA 2P33A 2PU8A 2ITOA 1BKXA 3G51A 5L8LA 3HP2A 1OB3A 2H34A 4IANA 4J52A 4FZFB 4ONAA 3BCEA 4PDPA 4XLIA 1OPKA 1ZY5A 4BN1A 5JFVA 3R7VA 4ANLA 3IECA 2I0HA 1V0BA 4MQ2A 3VUDA 3QRKA 1KE6A 2R2PA 4KS8A 4ZSEA 2GCDA 1KE5A 3KK8A 3RPVA 3TJCA 1ZXEA 4USEA 4FKWA 3IW4A 3QU0A 4C37A 2C1BA 4D5KA 2XVDA 3B8RA 5ETAA 3FQSA 3VHKA 3NVKI 3ZYAA 2YM3A 3IOPA 3EQRA 4ZY5A 5EDRA 4WG4A 2FYSA 4FNZA 2QHNA 3RALA 1WBPA 4WG5A 4IX4A 2PVKA 3W2QA 3WYXA 3JYAA 2VO0A 3N51A 2XKFA 3QQLA 2B1PA 2GNIA 4F7SA 4UMUA 4E5WA 2WTDA 4FV0A 2VNWA 1XH5A 3FI2A 4KIPA 4EI4A 3R1QA 1H28A 4FV5A 4CRSA 2B9HA 5IUHA 4DYMA 2XKCA 1W98A 3VF9A 5CXZA 3A8XA 4U5JA 3PIYA 5C8KA 3MH2A 3L1SA 2WPAA 3AD5A 4G5PA 4CFMA 3M2WA 5CU3A 4Q5HA 3QX4A 4LOOA 4CYIA 2BR1A 2RFSA 4MD7E 1OKZA 3R9NA 5KKRC 4PPCA 4ZSJA 3ZZWA 4NK9A 4FODA 4M97A 3FBVA 4IZ5A 3D2KA 3I4BA 3NLBA 5DT0A 2XKEA 3T9TA 3L8VA 3ZSGA 3MVLA 2DWBA 1XWSA 2IN6A 3C4WA 3P86A 4RVLA 4F4PA 3TKIA 4RJ5A 4FIJA 3ROYA 1DI8A 1GZKA 3GXLA 2J6MA 4BTMA 1Q3WA 4ZS4A 2CCIA 1CMKE 3EL8A 1RJBA 2YCFA 3V5TA 2HK5A 4ENXA 4GMYA 3RP9A 3TL8A 2CLQA 2VTTA 3PJ1A 5HG7A 3A60A 4QPMA 4LRMA 2OK1A 3DBFA 2FUMA 3FC2A 3OUNB 3I6UA 5D12A 2IZSA 2WTKC 3C1XA 3DTWA 4BZOA 4IHPA 3TV4A 4AACA 4CFNA 2C0IA 3LQ8A 3ZFXA 4YJNA 3UIXA 2O63A 2PVHA 2GDOA 4GG7A 1R0PA 2BTSA 5H3QA 3V01A 4IQ6A 3EZVA 3L8PA 4FE2A 3KF7A 1YXUA 3WF5A 4HGSA 1SVEA 2BAJA 3ACJA 3E8CA 2UZVA 4GCJA 3EN5A 3BHVA 3GU5A 4F0FA 1YHVA 4ALWA 1PXJA 3R22A 4NM5A 4ASZA 5DRDA 2PMOX 3QWJA 4CT2A 4CYJA 4QP2A 3LJ1A 3RM7A 3QHRA 2W1EA 2VWXA 3Q5ZA 5FGKA 2BKZA 4GEOA 1BX6A 3QTQA 4DGMA 2YIXA 4CLIA 4L42A 3IS5A 2UW7A 4OT5A 1Q99A 3NDMA 5FTOA 3UVPA 2WMBA 4Z55A 2OH0E 2OF2A 3WARA 3IGGA 3ZRKA 3SXRA 3VUGA 4BI0A 2IZTA 1CDKA 3AT2A 3MPMA 4O0TA 4MVFA 4WSYA 4JDKA 1URWA 4AA0A 2BFYA 4OTFA 5EQEA 3DKCA 5A3XA 3EWHA 5IA2A 4BF2A 3ROCA 4N0SA 3MH1A 1M2QA 2BIKB 4ZTHA 2ZB0A 3KCFA 3GENA 4K9YA 5IQCA 1BUHA 5BVOA 3UOKA 2BZHB 4UMTA 5C01A 1XKKA 2GNLA 4RSSA 5M4IA 1WBWA 3ZUUA 3D2IA 3HA6A 3SD0A 5KBRA 3FQHA 3GNIB 5AP6A 1FQ1B 4JG8A 2XS0A 4LI5A 4R7IA 1ZYSA 3EQIA 3UTOA 1ATPE 3VQHA 3FY2A 3EKKA 4RFZA 5F94A 1GZOA 2XH5A 4Q5EA 2IZUA 4D2PA 2J5EA 2O8YA 3TXOA 3DY7A 2WQOA 4YJRA 1VZOA 4G9CA 2VWVA 2BDFA 3VAPA 4DFNA 4PL3A 5HO7A 2C5YA 5DVRA 2B53A 3WF7A 1UU3A 2W4JA 4F9WA 1XH6A 4KBCA 5EHLA 4UX9A 3TNQB 2VZ6A 2CMWA 3DPKA 1PKGA 2C3LA 3M1SA 4IX5A 3TZ9A 2BROA 3E87A 4JI9A 4OTQA 2W7XA 3MY5A 2PPQA 5GJDA 3FLZA 3OS3A 4IDTA 4AA4A 3ZH8A 3OT8A 4OW8A 3TEIA 4FIFA 1DAWA 1G5SA 1KE9A 3KXMA 3UQGA 4CNHA 2W5AA 3F3ZA 4TL0A 3SQQA 2GHMA 4L00A 3VW8A 3S2PA 3MFRA 4O7TA 2BFXA 4HVDA 3D14A 3OHTA 3QUPA 5KO1A 4GFMA 3N4TA 2XNEA 3RPSA 4BCGA 4IM2A 2JBOA 4Y8DA 2ONLA 3BRBA 5FXQA 2PUIA 4FA2A 4JRVA 3U6HA 5HNGA 1U5QA 4B4LA 1OL1A 5CQUA 4C4JA 2ZV2A 3FSKA 4QMPA 4CRLA 3BHTA 3LCKA 3MESA 5CU4A 3VN9A 5IUGA 1UU8A 4KABA 2OKRA 1XR1A 3MIYA 4JR7A 4F0IA 4C4EA 1ZWSA 2W1GA 3I81A 4CQEA 2BZKB 4GJ2A 1Q8UA 2XIXA 3ZLWA 4FGBA 4QT1A 4LGGA 4L8MA 5B0XA 4F0GA 4RG0A 4IX3A 3R2YA 4H3QA 4FZAB 2YABA 5JK3A 5IZFA 3BELA 4OT6A 4QYGA 3WI6A 2Y9QA 3RPYA 4DINA 2PULA 3O7LD 2ITYA 4MBLA 5CANA 1UNGA 4WSQA 3R7OA 5AFVA 5IQGA 3NYXA 3MFTA 4EH9A 1PXLA 3UODA 3UG2A 4CKIA 4O7VA 4EK8A 5GIOE 4FV6A 2O5KA 5AP0A 5KX8A 4KAOA 4F6SA 3QD3A 2PMNX 3NW5A 3I6WA 4R7HA 3OROA 4O38A 2WTKB 5E8ZA 4O83A 1SZMA 2JDRA 4A9TA 4G6LA 4ZTMA 4M69B 3I79A 5D11A 5KHXA 3VS7A 4ZS0A 3H0ZA 5M4CA 4QQ5A 4UBAA 3CEKA 2W99B 4GJ3A 4NJ3A 4IIRA 4DA5A 3KXGA 4X3JA 4PTGA 4TTHB 1NXKA 2Z7SA 2ZV9A 3V8WA 2AC3A 1B6CB 2QO7A 2UW5A 4EOPA 3K54A 5IA0A 4CTCA 5F20A 1PMNA 4PMMA 2Q0NA 4AN2A 4UMPA 1YI3A 4XG4A 2YITA 4AUAA 3OF0A 2O2UA 3DCVA 5EDPA 3IONA 3JXWA 4C61A 2PMIA 4Z9LA 4A4XA 3MTFA 4IE9A 2VO7A 4LFIA 3UDBA 4AN3A 4O7SA 4BVUA 3R04A 3BLHA 4DG2E 3QC4A 4FV3A 3DQWA 2OZAA 3KQ7A 4FT0A 5FDPA 5HZNA 2Z2WA 3CQWA 3KMUA 4H1MA 3G90X 4NKSA 4AFJA 3BYUA 4AOIA 4BI1A 3NNVA 2H96A 4FV2A 5M53A 1YOMA 2IG7A 2QR7A 4F09A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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