4H3QA

Crystal structure of human erk2 complexed with a mapk docking peptide
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
AGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLAFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTSDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCGINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLAQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein-peptide complex crystallization: a case study on the ERK2 mitogen-activated protein kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 352
sequence length 352
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4h3qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4h3qA01
2YDJA 3KMWA 3FYJX 3OW4A 3EZRA 3QFVA 4FUXA 3II5A 3IONA 3U6IA 2JD5A 2R9SA 4D1SA 3BLQA 2ITUA 4L7SA 1X8BA 4HPTE 4L01A 4UWYA 3NW6A 4RC3A 3CGFA 3PVGA 5E8UA 3QCQA 3EL8A 3TT0A 4BZNA 4PP7A 5B2MA 5KX8A 2QG7A 1OB3A 3FEGA 4BCIA 2ITZA 1TQIA 2A1AB 2J4ZA 3W10A 4YZCA 4FZDB 3ZUUA 4KIKA 3QAME 3RGFA 5HLWA 4O6EA 4XRJA 1IA8A 2UZUE 4IX5A 4Z55A 2ITQA 2VWIA 3BU6A 4E93A 2YN8A 3OUNB 3KK9A 3ROYA 2YCFA 3NR9A 1RJBA 3HMNA 3MDYA 1Y91A 4P5ZA 5CX9A 4FIIA 3C0GA 4D2RA 4DEHA 3CE3A 1OPLA 3W18A 4CV9A 4FVRA 5ANGA 5HBJA 3CKWA 3I79A 2ZDTA 4FIHA 5A4TA 2YWPA 1W98A 1PHKA 4FA2A 4HVIA 3MJ1A 3QC4A 3G90X 4F09A 3P9JA 3G5DA 4K8AA 5M06A 3PDTA 3THBA 5HO7A 2X8DA 4O96A 5CAVA 2V7AA 5M56A 2O65A 4XNEA 4L52A 4YBJA 3QQFA 1ZYLA 4MF1A 4ZLYA 2QU5A 1PXMA 1S9JA 2W1ZA 3COHA 4O2ZA 3DS6A 3VWAA 4BCNA 3PIYA 4IMYA 4O7RA 4DFBA 3ORPA 4RJ5A 3TXOA 4F6WA 2BCJA 3NSZA 3REPA 3QLFA 1M14A 2W5AA 3TI1A 3W2OA 4MXZA 5H3QA 1Y6BA 4GJ2A 2W06A 3COKA 3E3BX 3H9FA 4ZAUA 3DLSA 5J8IA 3A4OX 2JDOA 1ZZ2A 1JKTA 2J5FA 4O6LA 3KKVA 2CLXA 5GJDA 3DKFA 3FXWA 3GB2A 4QP7A 1WBPA 5J5SA 4RFMA 2PVLA 3EQDA 4I5MA 2I0YA 5LMKC 3U9NA 3C4EA 4A07A 3K2LA 2NPQA 4DG0E 3QHRA 1O9UA 2VGPA 4LRJA 3RPRA 4CT2A 5A14A 2Y6OA 5AUUA 4LV5A 4EOLA 5J9YA 4CT1A 2B54A 3AGLA 2W1EA 4O7SA 1ERKA 4LOPA 1OVEA 5I5ZA 3CLYA 3C5UA 4RA5A 5AR7A 1MUOA 2X6DA 2BHEA 1DAYA 3LPBA 3AC2A 3NDMA 3P4KA 3IW8A 4OW8A 4TYGA 4U41A 5AIKA 1J7UA 4EOSA 4F08A 4FKGA 4IZ7A 4QQ5A 3RI1A 4FTAA 4BVUA 2YLEA 4C2WA 4RQKA 5D11A 5JFWA 5BUJA 4J95A 3L8XA 3R22A 3W2SA 5HNGA 2W9FB 3KL8A 4HYUA 3R7UA 4Z16A 4C3RA 3GFWA 3EQGA 1CKJA 4BBMA 3R9OA 4GU6A 2OJGA 3KXGA 4EYMA 3OVVA 2X7FA 3NIZA 2X2MA 5CAPA 4WNPA 2QOCA 4CKIA 3BQRA 5FXSA 4IAKA 3SRVB 3DFCB 3SAYA 1V0OA 4IB3A 4FZFB 4GT4A 3OXIA 4EH9A 1XHAA 2GDOA 4DFZE 5KMOA 2EU9A 3MTFA 3PWDA 4Y95A 3E5AA 3V8TA 5J9ZA 2XNGA 5EQPA 3QCYA 3Q53A 1NVQA 3QKLA 3RK7A 2WOUA 2ETMA 3OP5A 4C2VA 3VS7A 1OL7A 5HO6A 4QP1A 4U3ZA 2ITXA 4IXPA 3EYGA 4Y5QA 1J3HA 4BCJA 4CCUA 4IWQA 5HVJA 2YIXA 2J50A 3DJ7A 3GVUA 5HICA 3VUIA 1BI7A 4DTKA 3JY9A 3DK7A 4CFMA 4BY9E 2C5NA 1GIHA 3DKGA 3UOLA 5M44A 2CLQA 4C4EA 5CEKA 5J9LA 3UZPA 1YXVA 4IADA 4DCEA 2WFYA 3EQFA 4HOKA 1KE6A 1KV1A 1MP8A 3KXNA 2PVNA 3TV7A 3WBLA 2V62A 5M4IA 3AT2A 1ZYJA 4BIEA 4O22A 2ZM1A 3IW5A 4JOAA 4YZMA 3UP7A 3SG8A 2PVJA 4FTNA 2WMSA 2FVDA 4QMTA 4G6NA 3CP9A 4I3ZA 2A19B 4WNKA 4A7CA 3TUBA 2Q83A 3OHTA 4USDA 4R5YA 1RE8A 5AEPA 3BGPA 1SVEA 4DGGA 2J2IB 3TEIA 3T9IA 4QYHA 4S31A 2CN8A 3NUPA 4LUEA 2GPHA 3WYYA 3HV3A 5IA1A 2YM3A 3BBWA 3R7VA 4OTQA 3R0TA 4DCAA 3GC8A 3NLBA 2VO0A 3L1SA 4LOOA 2YM8A 3ORXA 3D5XA 4O0YA 2H34A 4DLIA 5DR2A 2VWZA 2VNYA 2GNLA 3F5UA 4HGSA 3NGAA 3SLSA 4RIOA 2HXQA 4NM3A 5BVDA 4RWLA 2X1NA 5LWMA 3O7LD 5FQDC 3N4VA 4NYEA 4WG3A 4CKJA 3C13A 4GYGA 3V04A 3WZJA 4CLJA 4FKSA 1G3NA 3AD4A 4RIYB 2BZIB 3F7ZA 5JFVA 3ZO4A 4BCPA 4FEUA 2GCDA 4C37A 1I09A 2HZNA 4B7TA 4DEGA 1YI4A 2XK8A 4X2KA 4EH8A 2WGJA 4HZRA 4MHAA 4S32A 5JQ8A 3S1HA 1SVGA 1JVPP 2C3KA 2WO6A 5D1JA 4CTBA 1KOAA 3NX8A 3Q04A 5DT4A 5IH5A 1ZY4A 4ALUA 5C26A 3MIAA 3Q9XA 1PMNA 3OCSA 4YU2A 5C03A 5IQCA 1DI8A 3QTRA 3MPMA 4IJ9A 1ZYDA 3V8SA 2CGWA 3LFEA 4MNFA 5HD7A 2WHBA 5CVHA 1YHSA 3BWJA 3DXNA 2WU7A 4EONA 2ACXA 2EXCX 3MSSA 3LM5A 4RC2A 5K5NA 3O50A 4FZ6A 5CI6A 5KMLA 2QKRA 1UU7A 1BI8A 2HWOA 3QQGA 4Z7GA 3UC4A 5M4FA 2Y4PA 3GOPA 1JSTA 5TR6A 5L2TA 4A4XA 2V7OA 3F3UA 5EH0A 5IUGA 4NFNA 5JFSA 2Y4IC 3KXHA 3OXZA 3O7LB 4G2FA 4L43A 4MQ2A 3DKOA 5DRBA 5FBOA 4E5BA 2IW6A 5LVMA 1YI6A 3EFKA 4IDTA 5L8JA 2GHLA 3KN5A 4NW6A 3OY1A 3IW7A 4NW5A 4PDYA 4GIHA 3S2PA 5JZJA 2BFYA 3TWJA 4EH4A 4TRLA 2WD1A 3Q60A 4OAVB 3BE9A 5C27A 4EK5A 2R3JA 4B99A 4MEDA 4F7JA 3FYKX 4LFIA 3LMIA 5EW8A 3NVMB 4L6QA 2UZTA 4LM5A 4ASEA 4AZSA 3A60A 3R7GA 2ITOA 3MI9A 4I0RA 1Q41A 5EYDA 4OTFA 4J98A 3RVGA 4ACGA 4EK8A 5M57A 4AOIA 3FMMA 2XEZA 3BHVA 3TTJA 4I6FA 4U42A 3RZFA 4IIRA 3TV6A 4BI0A 4E7WA 4WHZA 5BX0A 2YM5A 4W4VA 4FV9A 5LOHA 4FTOA 1OUKA 2OFUA 5I9YA 3HGKA 3U6HA 3UO4A 2R0IA 3ZLYA 5HVYA 5IF1A 2W1FA 4AG8A 4G6OA 4FKJA 3UYTA 3ZEWA 3MPTA 4GT5A 4GL9A 2I0EA 1JWHA 5JQ5A 4V05A 4DEAA 4I0SA 4IHPA 3PVUA 4QMNA 5B2KA 1UNGA 2PVKA 2HZ0A 4YTHA 2JKQA 5JFXA 2BAJA 2WTIA 3MFUA 5CF4A 4YJNA 4X2NA 3BHYA 3F3TA 5AP6A 4UV0A 2FSTX 4DF3A 1G8SA 1ZMWA 3NNXA 3DQWA 5DN3A 2QOQA 4MXAA 5CEOA 3EB0A 3UIXA 3V5JA 3HAVA 1XBCA 2HK5A 3FKNA 4W9WA 1ZYSA 5DG5A 3BEGA 3CQWA 5M55A 2X81A 3VS4A 4YTCA 4YC8A 2DWBA 3LCDA 4AN2A 2BPMA 1OKWA 4ZLOA 2W5BA 4U97A 3ACJA 4AAAA 1KE8A 4Q9SA 1S9IA 3KQ7A 3R63A 3AMAA 1PXOA 2YHVA 5G1XA 4RVMA 1KUTA 3EFLA 4L9IA 4EH6A 2BDWA 4HCTA 1L8TA 1L3RE 5EQYA 4LL0A 3QGYA 5EHLA 1OL1A 3E7VA 3Q9YA 1Q3WA 3DBQA 3FHRA 4CNHA 3MN3A 2HAKA 2HY0A 4EWHA 3MPAA 4Y5HA 1JKKA 4YURA 5KMKA 4FVQA 3O0GA 3LLAA 4EZ3A 2XM8A 2F7ZE 5IG1A 2XMYA 5HGIA 1U54B 4HNFA 4IAIA 5CSWA 5ACBC 4PTCA 4HCUA 3L8VA 3BYVA 3Q4TA 2AC5A 1QL6A 5A4EA 4GIIA 4ZMEA 4S34A 1ZWSA 4N0SA 4PMSA 3OEZA 4J52A 4V0GA 1AD5A 4LUDA 3OOMA 4BL1A 4DH7A 5HTBA 2WEVA 3FLWA 1Z9XA 2NRYA 2J0JA 1ZXEA 5E8SA 3IW6A 5IUIA 4DEDA 1J7LA 4WSYA 4DBXA 3F3WA 4HYHA 2C68A 4P4CA 2ZDUA 3BEAA 3PXFA 4F7SA 4KWPA 5HOAA 3KULB 4U3YA 4D4YA 1REKA 4XG7A 4H36A 3I7BA 3UC3A 4BC6A 3TKIA 4FNWA 4QMWA 4ENXA 3A7HA 2WZJA 3B8QA 4FGBA 4WIHA 4XRLA 4FEWA 4I4FA 3MV5A 2I0VA 3FZTA 2XK9A 3E88A 4F65A 4EUTA 2XJ2A 4G3FA 3I60A 3PPZA 2UW9A 4UN0C 2PTKA 1NVSA 1OECA 3R8ZA 4BRXA 2WKMA 4RWIA 2BTRA 2VX3A 4JXFA 3MB7A 3C4FA 3FMDA 5H8BA 4D4SA 1ATPE 4EHGA 3PY1A 4Q5HA 4TT7A 4X6QC 4QNAA 4ZJVA 2Z7RA 4MX9A 2IW8A 4C7TA 5M09A 4UMRA 2RL5A 5GHVA 4E4MA 3NS9A 4HYIA 4UXQA 3R7EA 5F94A 3FSFA 5CAQA 4FIJA 5L6PA 4APPA 3CJFA 4OAUC 3VULA 4D2TA 1CM8A 2YM4A 5FM3A 5KUPA 2VAGA 3VBQA 4PMPA 3F82A 5FDXA 2I7QA 4B8MA 4IB1A 4LGGA 3AQVA 1H07A 3TZ9A 5JRQA 3C0HA 4TYHB 2WMAA 5AV1A 3F7WA 4PP9A 3CBLA 4E8AA 3RNYA 3HVCA 1XQZA 4QMYA 4IAAA 5IA0A 5CWZA 2X8EA 4E73A 4F0IA 4RJ8A 3IG7A 2P0CA 4M8TA 4QMMA 4EZ7A 3NUSA 3IKAA 2R3MA 2NP8A 4NZWB 4WNMA 3NYXA 3P23A 4YR8A 5JH6A 4UYNA 1T46A 4IVAA 3BX5A 3OTUA 4NJDA 3Q4ZA 3GENA 4MVFA 5AA8A 5CT7A 3TNQB 1Q8YA 5K0XA 2W1DA 3LXPA 2E2BA 4MWHA 4W9XA 4A4OA 2O8YA 5C8KA 4AUAA 4EKKA 3ORLA 2FA2A 1PXJA 5FXQA 3ORIA 4NWMA 2BKZA 3PIXA 4OUCA 2HZIA 3HEGA 5ANIA 4ACHA 5C1QB 3VHEA 5A46A 4FEVA 4QMVA 1ZOGA 5FLFA 4JJRA 3R6XA 5AA9A 4DT9A 3G0FA 2WIPA 4BZDA 4U43A 2R3RA 4EOJA 3OZ6A 1K9AA 4NK9A 3QTSA 1G5SA 4O7NA 2O3PA 3M42A 3RZBA 3UJGA 1OMWA 5AR3A 1GIIA 2JKMA 4BWKA 4CFVA 5DHJA 4OTPA 2QR8A 4IB5A 3CY2A 2B1PA 1IAHA 2BAQA 5ANKA 3NYVA 3VQUA 4UMUA 4BBEA 3H0ZA 5HI2A 4YHFA 2R5TA 2IVTA 2VTSA 2WQOA 1JPAA 3UZRA 2PUNA 1MQ4A 4XP0A 5CYIA 3PE2A 5JRSA 4QYYA 1QPCA 2YDKA 4CZUA 3NAXA 3L9NA 3LFDA 5JEBA 4GUBA 4YBKA 3DXQA 5C4LA 3TKHA 2F2UA 3HZTA 1MRUA 4KBKA 4D9TA 2E9PA 2WXVA 4L3JA 3JPVA 3VS2A 5CI7A 1KSWA 5CXHA 3QTXA 1UWJA 4RFYA 2HOGA 4KIQA 2R3HA 3I0QA 4AS0A 3BGQA 5CNOA 5BMSA 3A99A 2ONLA 4FT9A 2JKOA 3OF0A 4BDCA 1FPUA 3HYHA 5L2SA 4KKEA 4BTMA 4GG5A 4ZZOA 4LMUA 4IM0A 2YLFA 3G9NA 1Q24A 3K54A 4DH1A 3DTCA 5JZNA 3FC2A 3OWLA 2FYSA 2PE0A 4FSNA 1T45A 2QO2A 1FQ1B 4RC4A 3DJ5A 3B2WA 4IZ5A 4D0XA 2XRWA 1OZ1A 4EQCA 2P3GX 3ET7A 1EH4A 2OXDA 4RIXA 2Z7QA 4JDKA 3VBYA 5BYYA 4FOCA 4TNDA 4RVLA 4BCMA 3QTQA 4QO9A 2REIA 4K33A 3RBWA 4FTRA 1E9HA 5A4CA 4FSWA 1OIYA 4U44A 5AIRA 5HHWA 4QMUA 3WILA 3FKOA 1ZY5A 3RHXA 5AR2A 4MBIA 3HMOA 2F7XE 2PVMA 4ZSJA 3H3CA 3QF9A 2C5XA 4R6VA 4RFZA 4CFXA 4ZY6A 3FC1X 3HDMA 2XEYA 1Y8GA 5IQFA 4R7IA 3BRBA 2A2AA 3MH2A 4TWNA 2ZB1A 4B6LA 2QO7A 4HPUE 3PY0A 4UMTA 1KE9A 5A3XA 2C1BA 3QRKA 2R7IA 2GTMA 4KSQA 5BVOA 1LEWA 3D7ZA 4I5PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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