4HNFA

Crystal structure of ck1d in complex with pf4800567
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
292
structure length
289
Chain Sequence
LRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the potent and selective inhibition of casein kinase 1 epsilon.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 289
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4hnfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4hnfA01
2AC5A 4DGNA 1PXNA 3HRBA 4AW1A 2WIHA 2YACA 5CSPA 3FMJA 3FEGA 4DFUA 4I4EA 4RFYA 2VN9A 2OXXA 3Q9WA 5J9YA 4DH8A 3EN9A 5HO6A 2WOTA 3QTQA 3NRMA 2WD1A 4AOIA 2XK8A 3ZZEA 4IFCA 5M09A 4IB3A 5EM5A 5I9WA 2NO3A 1YXVA 1WBOA 4X2FA 4D1SA 1FMOE 4QQ5A 4EK4A 3UZTA 1BKXA 2VTSA 2X6DA 4PMPA 1KOAA 4QD6A 3U8WA 2I0EA 1RW8A 1V1KA 3TIZA 2V7AA 3A60A 2CCIA 2GHGA 3C4ZA 3REPA 4GT4A 5DG5A 5L4QA 5K3YA 1S9JA 2R3GA 2HK5A 1B6CB 4R1YA 4AA0A 3EQHA 3MVJA 3DBEA 2UZLA 1J91A 4Y73A 4EWQA 3KFAA 3QZGA 5GHVA 3ZUTA 2YM6A 2J6MA 5L8KA 4BCGA 2F7XE 1B39A 3R7EA 4EONA 4O7NA 4XLIA 3VBWA 4UMPA 1W82A 5A4CA 5IU2A 3KC3A 4FZ6A 3ODYX 3B2TA 4FKWA 4O0SA 3OP5A 4WA9A 3ALNA 4XYFA 5E1EA 3V04A 4K0YA 3LVPA 4ENXA 1UKHA 3SVVA 4IWPA 3UO5A 3PSCA 4DINA 2GNIA 4GJ2A 5EI8A 5K0KA 4IQ6A 3LCDA 2QLUA 4BCPA 4EHVA 5A54A 3U6JA 1Q3DA 2GDOA 1A9UA 2BHEA 2OXYA 1UU3A 2ONLC 2JDSA 3K3JA 4CKIA 1YRPA 4U9AA 4BDAA 1RJBA 3V01A 2JKMA 2R4BA 3CY2A 3QUDA 4ASDA 1QCFA 3DBFA 4XRJA 2PMLX 4F7JA 4KIPA 1T46A 5TO8A 1H28A 1H24A 1U5QA 4Y85A 3O17A 4TZRA 3CP9A 3QRTA 4UALA 5HD7A 3S00A 5AUXA 2KULA 5CSHA 3VO3A 2RKUA 3SDJA 4FEUA 2ZMCA 3VF9A 4FG7A 5GJFA 4IB1A 4JDJA 4AU8A 1V0PA 2GHLA 2P2HA 4BWXA 4Y95A 2XK9A 4YUQA 2X7FA 4MD8E 4RWJA 3PXFA 3QA0A 4R8QA 3ZHPC 3OMVA 4PP7A 4G3GA 3QZHA 5LOHA 1IA9A 2XK6A 3R7VA 5L8LA 4QMXA 5C27A 4KABA 5CF6A 1GZOA 1PYXA 4I92A 3NZ0A 1W8CA 3OBJA 4QP1A 4U80A 1PMVA 3EJ1A 1OI9A 5LMKC 5EM7A 2XMYA 3UIMA 4F7NA 3FXZA 3Q3BA 5M53A 4NIFA 3DB6A 3HDNA 4DGLC 5IH5A 5I4NA 2B52A 3UIUA 3HMMA 3A7FA 4NW5A 2ITVA 3GUBA 1Z9XA 3HA8A 2BDJA 3P1AA 5CU2A 1G3NA 3DKOA 4C59A 4X2NA 3ITZA 4K77A 4BGHA 4A4OA 1XBCA 2J0IA 4E5AX 3DXQA 1WBTA 3JVSA 3I1AA 4U42A 3R73A 4L8MA 3KF7A 4JR7A 5CASA 3S95A 3ZFMA 1JKTA 3NSZA 1UU9A 4JR3A 5FM2A 4BCOA 1M2QA 4C35A 4Z3VA 4OUCA 2IN6A 4L3JA 2PUPA 3PY1A 4FIHA 2WTIA 2ZV7A 4NT4A 3RMFA 2VWWA 4NCTA 4XG3A 4PTCA 2J5EA 4BZNA 4BYJA 1R78A 5IQEA 4C33A 1ZYDA 2BCJA 3B2WA 4D2SA 3U6IA 2BROA 2PUUA 5BVWA 3NNWA 4I4FA 5KKRB 4L44A 3A4OX 3PJ3A 3R7IA 3VUMA 1YDTE 5CANA 4AZEA 3HX4A 4U3ZA 3VUGA 2UW3A 5AV4A 2SRCA 4O7ZA 3DBCA 3QQFA 2X7OA 4I0SA 4ASEA 1GIHA 3D7TA 3EL7A 4AZVA 4DEAA 3RNIA 4H36A 4F09A 5JFXA 3S4QA 1YXTA 5JN2A 5IMEA 2UW4A 1PMUA 3G6HA 4FT5A 3BWJA 3OD6X 4PUZA 3KN5A 2C3IB 3NS9A 4LUEA 2PMOX 3C5IA 4MF1A 4BDIA 3ZO4A 5CAVA 4JBQA 1JSTA 2XIZA 4FC0A 5AV0A 5HESA 2WMBA 3ULIA 4ACMA 2FUMA 2Y6OA 2ZYBA 1APME 2JBPA 3BRBA 2XEYA 3NNVA 4XG9A 4BCHA 3MPAA 4NTSA 4UWCA 3ET7A 5LQFA 3TI1A 3MY0A 3NNUA 1K2PA 4D2TA 5EQEA 3TKHA 3OC1A 4CQGA 4FKIA 5LVOA 5IA5A 3OXIA 2DUVA 4A9RA 4BF2A 4TYHA 5AR4A 2PVLA 2P55A 3FMLA 3I0OA 4NJDA 4B7TA 3RK7A 3TKUA 4RJ7A 3QTXA 4UMQA 4ITHA 3Q53A 5CAUA 2X8IA 3R6XA 5HIDA 3DS6A 3LQ5A 4BCQA 5C1QB 2PE0A 3RM6A 4C36A 4EKLA 4APPA 4IM3A 1YQJA 5HLPA 4D0XA 2QKWB 3II5A 4EH4A 2XNPA 4Q5HA 3T3VA 2J0KA 3KCKA 3A8XA 4G6NA 1ZZLA 5CU3A 4H3PA 3HV3A 5H8GA 4AG8A 4RQVA 2R3JA 1XQZA 4CYJA 3PXKA 4O7SA 4KA3A 5JZJA 5M57A 3FY2A 4YJPA 3B8RA 5E8TA 4NKSA 5CSVA 3RAIA 4J71A 4KRCA 4S33A 1NVQA 2CNUA 3Q2JA 3BV3A 5KCVA 4YLJA 4EK3A 4L67A 3TNQB 4FK6A 1BYGA 3A62A 3ORPA 3ORMA 2YHVA 4YZMA 2X8EA 5ANJA 4HJOA 5J7BA 3QKMA 4PPBA 3MVHA 4F7SA 3NVKI 4L3PA 3UNZA 2YA9A 4HW7A 3NWWA 3GXLA 2X9EA 4BN1A 3UYSA 4KBCA 3ZBFA 3Q2MA 1BMKA 1LUFA 5ANEA 5A14A 3R8LA 1WMKA 4E3CA 3HEGA 2W5AA 4MWIA 2X6EA 3GQLA 5FXRA 3BBTB 3RP9A 2QU5A 3M11A 4PDOA 2PPQA 4EHZA 4TN6A 3QLGA 2CKOA 3QD2B 4V0GA 2EWAA 3QQKA 2WMTA 4OTWA 4L01A 4D28A 1O9UA 4IJ9A 5CU6A 4H39A 1OPJA 3UP7A 5CNNA 3KULA 2V0DA 3VQHA 1SNXA 1I44A 4X3FC 4WSYA 2HENA 2VTHA 3HDMA 4LQMA 2XP2A 4RWLA 3UOHA 4BDJA 3DTCA 4RIYA 3ZRMA 3PSDA 1QPCA 4BRXA 4FMQA 3FZ1A 3G0FA 3ELJA 5HD4A 2HZ4A 5CT7A 3RCJA 3MESA 2O8YA 4FV7A 1J7UA 1PXMA 4M67A 3C5UA 3I5ZA 3PDTA 3VIDA 3NW7A 3VC4A 4JIKA 1SVGA 1OPKA 4X6QC 2Y6MA 5LVLA 4EH8A 3D4QA 1OUKA 3GENA 3FWQA 4L00A 2LAVA 4C4HA 4NUSA 4C4JA 4MXYA 3AT4A 4QMVA 3QU0A 2VX1A 4Y46A 2C1BA 2W4JA 2ERKA 5DVRA 1Y91A 1AD5A 1XH8A 2XNEA 4GRBA 2XF0A 3RI1A 3VULA 4JG6A 4F63A 4WG3A 1JVPP 5CNOA 2XRUA 5HIBA 3QD3A 4L3LA 5FEDA 3D83A 3V6SA 2QOIA 3CC6A 3MIYA 4M7IA 1P5EA 3SAYA 4BI0A 5AM7A 5ANGA 4ZTQA 2FO0A 5FP5A 3C4FA 4GT3A 4BB4A 2EXMA 3IDBA 2QHNA 3TKIA 5M44A 3OWJA 2PVRA 2WFYA 4ZOGA 1YHVA 4EK6A 3R2BA 3VQUA 2GNLA 2PU8A 4KINA 4IW0A 3NMUF 4DGOA 2JDVA 4QMZA 4U43A 5HE2A 4DTAA 3UBDA 4ZS0A 3ZCLA 2UZVA 1GNGA 2XIXA 4BZOA 1L3RE 4JT3A 4CMUA 2YCQA 4XG2A 5FTGA 4N57A 1AGWA 1F0QA 3KGAA 4BFMA 2ETMA 4YJQA 3PJ1A 3QTIA 4ENYA 2BDWA 3MGYA 4ZTLA 1OIYA 2ITZA 3WF6A 3I7BA 4GYGA 2E9PA 3VJOA 2I0HA 4CFWA 2ZDTA 4XX9A 5E8WA 5AR2A 5BMMA 4H3QA 2YCRA 4QTBA 4U6RA 5FM3A 3TNIA 5CLPA 2UW7A 3E62A 4FG9A 3KREA 4HPUE 4U79A 2CHLA 3FLNC 4C02A 2ZB0A 3HAVA 3FHIA 2VZ6A 1LR4A 5EM8A 4ZLYA 2A2AA 4UMTA 3RNYA 5H9BA 2CGVA 4OGRA 2O2UA 4AT5A 3F3UA 3PJ2A 3BYUA 4QQJA 4B0GA 3ZOSA 4B6LA 5CF5A 5DI1A 4DCEA 3HA6A 4AOJA 4M68A 3CLYA 5J1WA 4WHZA 1FPUA 1OECA 3FI2A 3PTGA 1PMNA 4WD5A 3EWHA 3PVGA 2JITA 2WTCA 1PF8A 2IVVA 2Q0NA 4FKVA 3R7YA 1BLXA 2B54A 2WKMA 5CEOA 1PY5A 2ZMDA 4FV3A 4BL1A 3QQHA 5E7RA 2IZTA 2Z7RA 3NCZA 4BHNA 3NUSA 5BYZA 1CKPA 4DEGA 2UW8A 4EJNA 2XNMA 2UVZA 4FNWA 2OH4A 4GG7A 3MFRA 4GT5A 4RX9A 3BI6A 1YDSE 4AX8A 4EQUA 4ACHA 3AD6A 4WSQA 1NXKA 5AX9A 3SKCA 2RL5A 3VS1A 2HCKA 5AFVA 4PPAA 3P4KA 4AW5A 5GZAA 2VTTA 3DNEA 1VYWA 4QYFA 3PUPA 1F5QA 3Q32A 4K9YA 4USFA 3O8UA 1PXJA 2WOUA 1LP4A 5AP6A 5C9CA 4EH3A 4E4LA 3BHVA 5IQHA 3R0TA 3SOCA 4RG0A 2XEZA 4XG8A 4O2PA 3P7AA 4NFNA 2I40A 1G8SA 2YISA 3SD0A 1SNUA 4MBLA 4F9AA 3CGFA 3PIXA 1H1RA 4EH6A 3Q04A 4MVFA 2YITA 4WO5A 4PX6A 5HVYA 4DFYA 3JYAA 2JD5A 2F2UA 3QC9A 2C6DA 3LFAA 3WZEA 1OBGA 4IH8A 4HZRA 2QURA 2YM8A 3QBNA 3ATTA 5E8ZA 5IA3A 2B1PA 1HOWA 5FBOA 4ZMEA 1HCKA 3UZPA 4AN3A 2VWXA 3C4WA 4OTQA 4HGSA 5J95A 4BCFA 4D55A 2JIVA 2VGOA 2IJMA 3GU5A 5I9UA 4F1TA 4FKGA 2J50A 5HX8A 3QYZA 1Y57A 4G16A 1ZYLA 3MWUA 3DPKA 4UV0A 4XP0A 4O96A 4X2JA 4O7LA 5J5SA 3AT3A 4DGGA 1Q62A 4QP2A 3FL5A 4YU2A 4N70A 4DBXA 3O8TA 2O5KA 5E4HA 4CMTA 2O0UA 2E9UA 3QUPA 4J1RA 5AJQA 3EIDA 5H2UA 5D12A 2WQNA 3G2FA 5DT0A 4RIXA 2OFVA 2I7QA 2OIBA 2OBJA 3KK8A 4O2ZA 3DJ7A 2C6MA 4QP9A 3ROCA 3V5TA 1Q24A 4QMPA 4JDIA 5T68A 1XWSA 3UO6A 2CGWA 3IPHA 3QCQA 5AP7A 2XK4A 2JC6A 3C4XA 3E8DA 5CSXA 2WMUA 2G9XA 2V62A 4LUDA 3N51A 4EUUA 3GCSA 3OWKA 4PQNA 1IA8A 3OCBA 5HE1A 1YOLA 4CRSA 5HNGA 2RGPA 5DHJA 3NAXA 2XNOA 2V5QA 3AC8A 3SX9A 2BFXA 3DTWA 5HICA 3FMNA 3HRCA 2R9SA 1UV5A 4RZVA 3F2NA 1T45A 3HVCA 5K4IA 4G1WA 4IVDA 3B8QA 4P5QA 3VRZA 5IA1A 4IANA 5AUTA 2BFYA 2W17A 5IISA 1U4DA 5D41A 2OG8A 3BHYA 3KF4A 3WILA 3W2SA 1U54A 3GT8A 4U3YA 2VTRA 4A07A 4HYUA 3TM0A 1PXIA 4Y83A 5IH4A 4RRVA 4C37A 4EH5A 5KMNA 5KKRC 4NL0A 4HVSA 4TNBA 3COIA 1QPJA 1VR2A 4YZNA 5B2MA 2RG5A 3DDQA 2W1EA 3ORXA 3G6GA 4FODA 4QT1A 3LMIA 3OY1A 1UNLA 3RBWA 1JLUE 3MW1A 3W8QA 2XM8A 4EK5A 4GCJA 4YC8A 5BX0A 1H27A 2C5YA 3R00A 5CX9A 5FXSA 3DAJA 1URWA 4BYIA 4E4XA 4LRKA 1NY3A 4ORKA 5ITAA 2O65A 1LEWA 4DH1A 4KS7A 4O84A 4DEIA 3A7JA 4FE2A 2GMXA 2NRYA 3QLFA 2ZV9A 4V04A 2VWIA 4J97A 3ACJA 4O0VA 3K54A 3DLZA 3OS3A 2BTRA 3I0QA 1E1XA 4U45A 4U97A 4CEGA 3UOJA 4AW0A 3HMIA 3N4UA 4NEUA 1YXXA 2H96A 3KRRA 3KRXA 3UP2A 3SG9A 1JPAA 3H3CA 3KKVA 5DRBA 4ALVA 5FQDC 4CZYB 4EOMA 4IAZA 3VHKA 5HEZA 1P4FA 3QQLA 3RHKA 1YDRE 3QYWA 4E4NA 4C3PA 2ZDUA 4LG4A 4QQTA 3DFAA 3LCKA 3F3ZA 5GZ8A 3MV5A 4BY9E 4TTHB 3EKKA 2B9JA 3CTQA 3MH0A 3LLTA 5KMLA 5CZIA 1CDKA 5EKNA 4X3FB 5M4IA 3H10A 1IRKA 1QL6A 4DTKA 2G15A 4V01A 5H3QA 4EORA 1ZWSA 4FF8A 4RSSA 4YTIA 4G5JA 3ZDIA 3BE2A 1PRYA 4D0WA 1XBBA 4Y8DA 5JRQA 2GQRA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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