4I41A

Crystal structure of human ser/thr kinase pim1 in complex with mitoxantrone
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of human Ser/Thr kinase Pim1 in complex with mitoxantrone
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4i41A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4i41A01
4U44A 1CM8A 3LFEA 4B4LA 4X3FA 4NM3A 2JFMA 3R9DA 4IX3A 4P2KA 4C4JA 1ZMWA 4FV9A 2JDOA 1KE5A 5I9XA 1UU3A 4DG3E 2QQ7A 2WQBA 1O6YA 2C47A 3Q32A 3QQJA 4OTIA 3UGCA 5JZNA 4CLJA 2JC6A 2VO7A 4D5KA 5AR4A 3NW7A 5M06A 2A4LA 3H9RA 3QKLA 1WAKA 4ZZNA 3OROA 4U41A 4WSYA 2BROA 4IADA 3RTPA 2GCDA 3TEIA 4AP7A 2GMXA 5HCXA 4L46A 4LGDA 3QWKA 4R78A 2YIQA 3DXPA 4Q5HA 3F82A 3TJCA 5GJGA 4CFVA 4IM3A 4NFMA 4BI2A 5HLPA 2J0LA 2UZOA 4U45A 4DFLA 4E5BA 1PW2A 2H8HA 2QLQA 4AX8A 3R04A 2OXDA 4D4VA 5EQEA 3UIUA 4FGRA 3R2YA 2BTRA 3BGQA 1R3CA 2X8EA 3KK9A 3L9NA 4F65A 1BI7A 4DH5A 4H1JA 3UTOA 3SRVA 5FXRA 1O9UA 1KUTA 5IQAA 2OJ9A 3ETAA 2UZLA 5AJQA 4CYIA 1JOWB 2ZDTA 3ERKA 3FXWA 4DN5A 1IA9A 4PPCA 4FZ6A 2YFXA 4I6HA 5DA3A 1FQ1B 4MTAA 4DEHA 4QMVA 4WUNA 2C4GA 2VTRA 5A4QA 2R3PA 5LMAA 5EYDA 3F66A 3PJ2A 3I6UA 4FTMA 4OTFA 4AN3A 4J98A 2UZDA 5HU3A 1W98A 5HX8A 5F1ZA 3W32A 4FKLA 2VWUA 1ZARA 3MH3A 3FMHA 3QHRA 3AT4A 3QX2A 3SAYA 1YDTE 2GFCA 4QNYA 4YC6A 4EOKA 3KN5A 3LMGA 5ACBC 2BDFA 1YHSA 4JOAA 3A8XA 2G2IA 2FSTX 4Y83A 3ENHA 4NT4A 4FTOA 3V8TA 4CMUA 4W4VA 2CKEA 4XG3A 3R8UA 1FBNA 5HBHA 3EKNA 3QKKA 4B8MA 2XF0A 3RMFA 3SQQA 4DCEA 5M44A 3R9RA 2ETMA 3BU6A 4A4LA 5LMBA 5M55A 1ZOHA 2OZAB 4FIHA 4BKZA 3MI9A 2JAVA 4MCVA 3REPA 4ENYA 4ITJA 4GT3A 3MY5A 3ODYX 3QCSA 4I5CA 4JDKA 2A0CX 2W1DA 3PJ1A 4KIQA 4NKAA 3FXZA 5HG9A 4EH7A 2G2FA 1PKDA 4PX6A 4KB8A 2XM9A 4NM5A 5JEBA 3HMNA 3O0GA 5E8TA 5JQ8A 1VR2A 4IZYA 5FDXA 4M0ZA 5A9UA 4FZFB 4XP0A 1CKJA 2F7XE 3G5DA 5A54A 3NVMB 3SRVB 4G3DA 4FG8A 2OG8A 3TN8A 5IMEA 5HHWA 1H28A 4PV0A 2JKMA 3LFAA 1OGUA 2PZYA 4FSQA 4MAOA 3FPQA 4WG3A 3GUBA 1BL7A 2XK9A 1A06A 4FTRA 5DLSA 3UPZA 4AFJA 4OR5A 1IG1A 4C62A 4DLJA 1E1VA 4AT5A 2WMUA 2VTJA 1M7QA 1NA7A 3FHRA 1YDRE 3M42A 4JDHA 3VUDA 2JFLA 5BUJA 3B8RA 4IHPA 2QKRA 2XRUA 2PK9A 3P9JA 4NH1A 5CYIA 4R7HA 3R9OA 1WVXA 4GYIA 3WF5A 4D9UA 2ACXA 3II5A 4MXOA 2QOBA 4LG4A 3TNIA 4D2SA 1ZY4A 4RMZA 4ZJVA 2PZPA 4O7TA 2VNWA 4FEUA 3HRFA 2B9HA 2Q0NA 3VBVA 5KHXA 3AOXA 5HG5A 3GCSA 3GNIB 3OY3A 4KIKA 5H8BA 4NYEA 1IAHA 3KRLA 5CXZA 3G9NA 2HZ4A 4E4NA 1GAGA 3QF9A 1Q8YA 1ERKA 3TNWA 4HVSA 2HY0A 1J91A 3E64A 3ZFYA 2ZV8A 4EH8A 4ZZMA 2YIXA 4EH2A 1CSNA 4CRLA 4LM5A 5CALA 1NVQA 1T46A 3Q04A 3Q53A 3QD3A 2ERZE 3LQ5A 4Y72A 3QQHA 4R8QA 4AZEA 4HYUA 1ZYLA 1PJKA 2BZHB 4E20A 3H9OA 4FIJA 4M69B 4F7SA 4UMUA 2X4ZA 1OL5A 2OI4X 3KC3A 4HW7A 4L42A 3R7OA 5KMLA 1Q3DA 3COIA 3QCXA 4GMYA 1DAWA 1OL7A 2X2KA 3AC3A 5EDQA 4PNKA 3BIZA 4DTBA 4LOPA 4C4GA 5EKNA 5IQEA 3KULB 1IRKA 4JR7A 2V7OA 1MQBA 2EB2A 4LI5A 4RWIA 3DQWA 3MIAA 3QTXA 4BBFA 3EN7A 1WFCA 2PVKA 3UVQA 5AFVA 4G3GA 4M8TA 4FEQA 5IA1A 3U6JA 3HZTA 5J9YA 3TV6A 1H0VA 3QUEA 3V5WA 3W2RA 3MW1A 4E4MA 3PA4A 3CP9A 5AP6A 3F5XA 3E92A 2VWXA 4USEA 4XJ0A 2PY3A 1JBPE 3GCQA 4U79A 1OL6A 5HKMA 2YAKA 3ET7A 4G6LA 3QD4A 4AGWA 1Z57A 5CTPA 3DOGA 4FKVA 4ALVA 3OEZA 4IAKA 5KNJA 3QZHA 4XS2A 2GNJA 3UZRA 2P2HA 1APME 2C0OA 2XH5A 3FKNA 3KXGA 2WU6A 3ZUUA 4CMTA 2IPXA 3IONA 3W8QA 4OLIA 3DKCA 1XH9A 4JQ8A 3K5VA 3LXLA 1YXXA 4RIYB 3EQPA 1XH8A 3JVSA 5I0BA 3PY3A 5ETFA 2X9FA 4DITA 5AM7A 1Q3WA 5IEVA 1ZLTA 2QOKA 4AFEA 3TZMA 3GU8A 5AADA 2ERKA 4RFMA 4EQCA 4QTBA 4YTFA 4DFUA 2XNGA 1OIQA 2QNJA 4KKHA 2WNTA 4CV8A 5JN2A 3FZRA 3DBDA 1WZYA 3ORNA 1GY3A 4WA9A 3EN6A 2Z7SA 4RQKA 4EZ3A 4FL2A 5BNJA 4FE2A 5HVYA 4NW5A 2I0EA 2ZAZA 4EI4A 4EUUA 4ZS4A 3AT2A 5CANA 3TL8A 1W83A 2KTYA 1QPEA 2BZJA 2ITZA 1GZNA 3H9FA 2QD9A 4RJ3A 4XG6A 4ID7A 5E7RA 4UWBA 4RIWB 2BRHA 2YA9A 2PMOX 4O0VA 4GV1A 2PE1A 4MWHA 5AV0A 4QTDA 5L2IA 5LVNA 5M08A 4ASZA 3MVLA 5LMKA 5DE2A 4BZOA 4QMTA 4OAVB 4F9BA 4YLLA 4BDFA 3EFLA 2R64A 3OXIA 4U8ZA 1BI8A 3ZLWA 4KBKA 1XKKA 3CQEA 2JLDA 4RX7A 4K2RA 2XYNA 4IH8A 3PE2A 3RK7A 5C4LA 4YGAA 3NRMA 3PZEA 2QC6A 3UPXA 4QMNA 2AYPA 4RVTA 3U4UA 3WZJA 3ID6C 2QU6A 5EI6A 5DHJA 4BBMA 4QPMA 2IVUA 4QMWA 3V6RA 2GTMA 1KE8A 3C4FA 3E87A 3FZOA 5B2KA 3HP5A 5K9IA 2BRMA 5AAGA 2OJFE 3F61A 3VUMA 2E2BA 3OW4A 2PHKA 4P7EA 2UZNA 3IDCA 2CKQA 2CNUA 3S95A 4FTLA 4K9YA 3TT0A 4A9UA 3HYHA 4TL0A 5IQHA 1YI3A 4MH7A 3R1QA 3MY1A 4JQEA 4MNEA 4ZLOA 3U6HA 5BQ0A 4MYGA 4H36A 1JSVA 5ANGA 2IZTA 2R3GA 3MTLA 2QODA 2YEXA 4OTQA 4FMQA 4X2FA 3L9LA 3P0MA 1WBOA 2R3RA 1OKVA 5C01A 3IK3A 2YN8A 5D7VA 4W9WA 4IX6A 4UXQA 4CRSA 2F4JA 1F5QA 3I60A 3DBFA 5EK7A 3FY2A 5DGZA 5HO6A 4G5PA 4YURA 4DBNA 1V0BA 3OMVA 4JG8A 5CNOA 5M4FA 4IFCA 3IGOA 1H1QA 2VN9A 2C5NA 3GEQA 4BCNA 3UQFA 4E5WA 4TT7A 1QPJA 3FHIA 5J1VA 4WNMA 2B0QA 3HRBA 3TIZA 2XNBA 1Y6AA 3F3ZA 1M17A 3IW6A 3A60A 3KXNA 5CSPA 5J79A 3BU3A 1M2RA 3MVHA 3A8WA 5AIRA 1IEPA 3OZ6A 4GFGA 2ZV9A 4X21A 3OFMA 4PUZA 4TRLA 2H34A 5BVOA 3AC4A 2GPHA 4F7NA 5HVJA 5CU0A 5AP5A 3R9NA 4WNKA 4CEGA 5A6NA 5HIBA 4IAAA 4EOLA 2VUWA 5LARA 3V5QA 3IQ7A 4YHJA 3TTIA 2YM6A 1DAYA 4O6EA 4JLCA 4O91A 3SDJA 5IUHA 1UWHA 2BALA 2W5BA 4QMPA 4I4EA 4XNEA 2IZUA 4ZAUA 3MSSA 1W84A 4MBLA 4XRLA 4F6UA 1BKXA 4NWMA 4F7JA 4R5SA 3C51A 4QYEA 4YPSA 3UP7A 4E6DA 2RL5A 4E8AA 3N9XA 4IDTA 3C4EA 4RVMA 5D7AA 4U97A 4PP9A 5HCZA 3LCKA 3EB0A 5F95A 3E8DA 3PIYA 4PTEA 4UMPA 4C38A 3CGFA 3OBJA 5G1XA 3LXNA 3OTVA 2C6DA 4XHKB 4O7YA 1WBVA 2W9ZB 3EFKA 2I40A 3FI3A 3KL8A 3NWWA 5EH0A 4H3QA 3UC4A 5EHLA 4PDYA 4QQCA 2UZEA 2QURA 2PUNA 4FVPA 5K0XA 2OH4A 3BGPA 1R78A 1R1WA 3BYUA 2Z02A 3ZRKA 2Z60A 3DZOA 5EM8A 5IH6A 3FI4A 4FKOA 1KV1A 4ERKA 3AC8A 3QC9A 3EL7A 3EN4A 2UW8A 3E7OA 5IUGA 1Q5KA 4FTAA 4EJNA 4X3JA 1YW2A 3HMOA 3SC1A 4XLVA 5DR9A 3OS3A 3RGFA 2JEDA 4DAWA 4F9WA 5K5NA 4CFMA 3QALE 5JMSA 2ZB1A 4ZIMA 3TACA 3FQSA 5CQWA 5DT3A 1TKIA 3QLGA 1K3AA 2I0HA 4C35A 2BUJA 2GNIA 2GTNA 1JNKA 3LPBA 4C57A 5A4LA 4UMQA 2YIYA 4BCFA 2AC3A 3RI1A 3OCBA 5LWNA 3D9VA 4YNOA 5HVKA 5E91A 2RFSA 4BI1A 3CQWA 1MRYA 4I0RA 4FR4A 2WOTA 4XV2A 3DTWA 3HV5A 3OC1A 4H39A 3RM7A 3M2WA 3VF9A 4Y95A 3FZ1A 5IQIA 3R73A 5M4IA 2CLXA 3LM5A 2HOGA 4EC8A 4C34A 4FEXA 4UN0C 2YWVA 3MESA 3PSDA 2JDRA 4J99A 1H01A 4FV2A 3ZC6A 1PRYA 4O1PA 4LRMA 4U0IA 3IECA 4GT5A 4YP8A 4GIHA 5AR8A 3KRJA 3C0IA 5BMMA 3RAHA 3U8WA 5CENA 2VTSA 3JY0A 2WTKB 3QUPA 5EYMA 3NX8A 5IA5A 2YCQA 3MN3A 4LRKA 4D5HA 5L3AA 1Q4LA 1CKPA 2P0CA 1KOBA 4FZAB 4C58A 4U3YA 5H8GA 2XNOA 2V22A 1E9HA 1PXKA 3BYMA 1CMKE 4L6QA 4XLIA 3TG1A 2WQNA 4U42A 3BLHA 2R3OA 4Z3VA 5TF9A 3UO5A 4FKWA 3C4XA 4BB4A 3FWQA 4ZSEA 5FLFA 2ZJWA 3CLYA 4PDPA 4XOYA 3CS9A 2I0YA 2DS1A 4S30A 1JAMA 3ACJA 4OT5A 4IDVA 3PWDA 2C3JA 3EQRA 4EHZA 4GRBA 4QO9A 2YDIA 2VAGA 5HLNA 4QQTA 2WELA 3BYSA 1XH7A 5AR7A 2GHLA 5IA0A 5CAVA 2OSCA 4ASEA 3R1YA 2VTIA 4EK4A 2OZOA 2Y0AA 2ZM3A 5BX0A 1PMUA 4OBOA 3F2NA 3UNZA 2G2HA 4ZSJA 3D14A 4DEDA 5A46A 1K2PA 3E8CA 5CEKA 1H27A 3BQCA 3EL8A 3RK5A 4DE4A 4F1TA 4JBOA 1PXMA 2YZLA 3EZRA 1FVRA 1OM1A 2IJMA 3CC6A 4EHGA 3IGGA 4FNXA 4ZY5A 3DKFA 3FLQA 3Q3BA 3DKOA 4ZS0A 3FLYA 3QQUA 4FL1A 5EDRA 1V0PA 3FQEA 4N6YA 1XH6A 3QBNA 4WBBB 2OW3A 3PXFA 3R01A 3FZPA 1ZXEA 4D1SA 4UWCA 4DGLC 1BX6A 2XEZA 3VS0A 4DLIA 4S32A 2R2PA 5IDPA 4I6QA 4HYSA 4P90A 2XCHA 1H1RA 4ZZOA 3LZBA 2JIIA 4BTMA 3GFWA 4I41A 4LL5A 5J95A 3G0EA 4EOPA 2CN5A 2WFYA 3LXKA 4HJOA 3WF7A 4GJ2A 4MXZA 4CFNA 1J7LA 4HPUE 3ZONA 4Y5QA 4IB1A 4LV8A 4RIOA 5CS6A 3W18A 4G6NA 4QOXA 2XKEA 4CQGA 3PVGA 4FBXA 1JSTA 2X2MA 5CLPA 4LOQA 5LVOA 3Q5ZA 4YSJA 2HK5A 3F6XA 4HGTA 1YRPA 1YDSE 4G9RA 2HELA 5IQGA 2QU5A 4F4PA 1PYXA 4XG7A 3FLNC 3PXKA 5BUEA 4PY1A 1Q41A 4RLKA 3V6SA 2QR7A 4C2VA 2NPQA 5ETCA 3R8MA 4FV6A 3F2AA 3A4PA 3UG2A 4L52A 4J8MA 3WARA 2G01A 5H3QA 3PPKA 3EIDA 5K0KA 4ALUA 4C37A 3I4BA 2QOOA 4MHAA 4RX5A 3C0HA 4E93A 2HENA 1G8SA 4M66A 1ZYCA 4C4HA 3MFSA 1G3NA 4JL9A 4M84A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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