4I6BA

Selective & brain-permeable polo-like kinase-2 (plk-2) inhibitors that reduce -synuclein phosphorylation in rat brain
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
RIIVDPTTGKRYSRGKTLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVSKPHQREKIDKEIELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEVRYYLRQIVSGLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINESMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICGTPNYLSPEVLNKQGHGAESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRSIREARYTMPSSLLAPAKHLIASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFTQGFTPDRLSSSCCHTVPDFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Selective and brain-permeable polo-like kinase-2 (Plk-2) inhibitors that reduce alpha-synuclein phosphorylation in rat brain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PLK2
total genus 84
structure length 285
sequence length 285
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2012-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4i6bA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4i6bA01
1H00A 3FY0A 4Z55A 3ORMA 2QG5A 3AXWA 2VTNA 1YI4A 2PZRA 3QRJA 2WFYA 3LCOA 3NW7A 3Q3BA 3F3VA 4RVLA 5IMEA 2ITQA 3C13A 5FBNC 4F63A 5BMSA 4YTFA 3IS5A 5ETAA 3VUDA 3EQBA 2W1HA 3CCNA 4W8EA 5ANDA 2QLUA 2VZ6A 3BGPA 2JDSA 1JSUA 3IO7A 3F2AA 3TM0A 4PDYA 1GIHA 4BKJA 4E4XA 2YM3A 4MQ2A 3R1YA 5I9VA 3RTPA 2HY81 4EHGA 4HZRA 3GGFA 4KSPA 2A27A 4KS7A 5HCYA 2CN5A 2J5EA 1LUFA 1W82A 2R3PA 3OWKA 4K11A 4L43A 5FEDA 5LCJA 5LVOA 3R7EA 2IN6A 4X2NA 4ACDA 4V05A 2E2BA 3PPKA 3QRUA 4B6LA 3EQDA 1JKLA 3LFSA 2QU5A 3DXPA 3F9NA 1FGIA 2BDJA 4AGCA 4AZWA 3DQWA 5I9XA 5HNBA 3RWPA 2VTRA 2GPHA 4PQNA 4DE4A 4JL9A 2ZVAA 3SVVA 3COKA 3MN3A 3V5WA 4ZTNA 2VO6A 4FOBA 4UN0C 3Q6UA 2X6EA 1H24A 5KKRB 1OECA 3EFKA 5AADA 4LUDA 5L4QA 2PMOX 3EFLA 4GSBA 5B2MA 1OPJA 4IMYA 4D55A 4TXCA 2UZNA 2GS7A 3EYHA 4FSNA 4WHZA 4UX9A 4I20A 2E9NA 2G2IA 4HVIA 1P5EA 4XLVA 4MHAA 3LMIA 4ASXA 4E4NA 4FV0A 4CD0A 4J99A 3R02A 5DLSA 4DFNA 2WMQA 4XRJA 2Z7LA 3F5UA 4U79A 2R3NA 3MTFA 1RQQA 3BKBA 2YABA 5T6KA 5E8ZA 4JBOA 3ZEPA 4W9XA 3SC1A 1Q61A 4ONAA 5M4CA 1PKGA 2P33A 3V8SA 3ET7A 5CAPA 4JQEA 3KK8A 4G3CA 2X4FA 4PMSA 4BBFA 2P0CA 4D1ZA 1Q8UA 3CY3A 4IB0A 3OS3A 4OTPA 3EQRA 3E88A 2PHKA 5BMMA 3R7YA 2DWBA 3LOKA 3LQ5A 2UZDA 5EYCA 4D4YA 3CE3A 2GQRA 5EDPA 3OBJA 3LFBA 3G0EA 2PUUA 3KEXA 3NYXA 3OOGA 4LUEA 4F1TA 4WA9A 3RCDA 2V62A 2UVXA 3SA0A 4X3JA 5KNJA 2B52A 2WMSA 2Z7QA 1GIJA 3H9FA 5BNJA 3R7OA 4O27B 3UODA 4QYGA 2C6OA 4PY1A 4FTTA 3R22A 1NY3A 3R8ZA 4EOJA 2JKKA 4OR5A 3UQFA 1WMKA 2ITTA 2IZTA 1PRYA 3TV7A 4EYMA 4XUFA 2WTKC 4QMOA 5CAOA 4G6OA 4PDSA 2VWBA 5CWZA 2W99B 2VAGA 5CENA 3ZCLA 3FZTA 3R2YA 4NFNA 4BDJA 4J7BA 4EHEA 4AA0A 3NVKI 3LMHA 3VUKA 3GB2A 4RWIA 4DG0E 2O5KA 1YDTE 2JAVA 3FV8A 3TUDA 4MNFA 2XK4A 4B8LA 3LCKA 5E9EA 1WVWA 2B1PA 3AC4A 2H96A 2W1ZA 3RI1A 3MESA 4O7TA 2C5VA 2AYPA 1U5RA 3DBCA 4J53A 4GH2A 5AV3A 3CKXA 3I79A 5IH6A 2YHVA 4TYIA 3R8LA 2IVVA 3FMLA 5I9UA 1DS5A 4KIKA 4MF0A 1SM2A 4NW5A 4G5PA 4HCUA 2RFSA 1Q5KA 2Y4PA 1Y8GA 1ZARA 1YI3A 4UMUA 4DH8A 4O7NA 3ZBXA 4CMUA 4A9SA 5AR8A 4OTWA 2QOKA 3LJ2A 4WD5A 3RK7A 4ASEA 3Q5ZA 2NNWB 3BQCA 4RZVA 4Y85A 2BTRA 4O2PA 4QNYA 4DFYA 3MFSA 1FPUA 4QYYA 4P5QA 1OL1A 3FZRA 4MXZA 3WOWA 3AC5A 2Q0BA 2PUIA 4ZY4A 5ETFA 4AX8A 3NUUA 1NVSA 3CD3A 3CC6A 4EWQA 3D5VA 5J1WA 3CIKA 4BWKA 2VTMA 5I5ZA 2QQ7A 3W16A 3AG9A 3ZLXA 1MRVA 2RG5A 4NM0A 4C57A 2VV9A 4BZDA 3IQ7A 5EFQA 4CGAA 4O0TA 1P2AA 5AUZA 3KMMA 4O91A 5DIAA 2WIHA 2IZUA 3H9RA 4JBQA 4FNXA 3EQFA 5AAGA 1J7IA 1QCFA 4RJ7A 2J2IB 2ESMA 1NT2A 3AT2A 2GMXA 2W96B 4I92A 5I9WA 3EN7A 4ZSAA 3ACKA 4OUCA 3NR9A 3ZO2A 4X0MA 4D5KA 1RJBA 3Q9YA 1PXIA 3AT3A 5A4EA 2ITOA 4IZAA 4ITIA 2JD5A 3R8UA 3VS5A 5BVWA 4H1MA 5IPJA 3R7GA 4YLKA 3NSZA 2Z7SA 3PIZA 4ERWA 4MCVA 2HWPA 2IWIA 4EZ7A 3LJ0A 4QP1A 4QNAA 2RGPA 4RVTA 2YJRA 3NW6A 5D9HA 2FSLX 3IONA 3EKNA 4W9WA 4UWYA 3DTWA 3UNJA 3OEFX 4XOYA 2XZSA 3R7IA 3UOLA 4CFUA 5JGDA 3WYYA 3NNXA 1WBSA 3TXOA 2YDJA 4FIGA 4E26A 3ZYAA 4WO5A 4O83A 3DCVA 3GCPA 4IJ9A 4DTBA 2VNYA 1B6CB 3PP1A 4M14A 3EN9A 1CDKA 1P4OA 2BHHA 2C6TA 3KXMA 2BKZA 2AC3A 4ZTLA 4DH5A 3ROYA 4H36A 4I5PA 4EH3A 2OO8X 4ORKA 3KRWA 4JDHA 2CKPA 1R3CA 3GNIB 4I6FA 2YIYA 2CJMA 4S34A 5EM8A 4AFJA 4EUTA 1OITA 2XKFA 1PMNA 3FKNA 3DB8A 4R3PA 1UVRA 3B8RA 3MJ1A 5E8WA 2XA4A 3OCTA 2JC6A 2WQBA 2PL0A 3AMBA 4KWPA 3VF8A 4C4IA 2JIVA 4FL2A 4IHPA 4M3QA 4IVBA 1I44A 3D4QA 3BGZA 4AZVA 4F64A 4FTKA 4XV9A 3R8MA 4D9UA 3VN9A 1Q3DA 3PZHA 4A9YA 4BF2A 5AP2A 2ITNA 3RNIA 5BVFA 3Q9ZA 5BYZA 3D83A 4XG4A 3EQPA 4UXQA 1BI8A 1STCE 2VWZA 3PLAE 3G2FA 3OEZA 4AOIA 1IASA 3W2OA 3MY0A 3OCBA 4HCTA 5EH0A 1CMKE 5TT7A 1O6LA 5EHYA 3C0HA 4G3FA 2HIWA 4YBKA 4EK4A 2W5AA 3WZEA 4N6YA 4LM5A 3VULA 1OMWA 5ANJA 3ZFXA 3F6XA 4WOVA 3N4VA 3VHEA 4ZMFA 5IUGA 1ZOEA 4TY1A 4U0IA 5FDXA 4S2ZA 3GU6A 3LVPA 3O96A 2Z7RA 3HUBA 4CFMA 2I0VA 4WNOA 5M07A 3JUHA 4L44A 3TTIA 1R1WA 1W7HA 3KC3A 1PXPA 3ZBFA 5CU3A 3TWJA 2OJJA 4O7LA 3VHKA 2X7FA 2I7QA 3F3UA 4DINA 4IEBA 3PXRA 3RPYA 5CSHA 4I0RA 1XH4A 3IW6A 3MBLA 4FEQA 1OGUA 4ZEGA 3IGOA 4RQKA 3A2CA 5B7VA 4XMOA 3L8XA 4O7RA 3LAUA 5HG9A 3TI1A 2EB3A 4ZK5A 4D58A 4U7ZA 3N4UA 2X7OA 1H0VA 4RQVA 3FYKX 2QKWB 4K6ZA 2J9MA 4V01A 1BX6A 3KULB 5I9ZA 2ITZA 3DK6A 2JDOA 2OF4A 5L6PA 4RWJA 1MP8A 4HNIA 2OFVA 3BLRA 4JIAA 5CEPA 4FEVA 3G9NA 3GENA 5C4KA 3HGKA 3NUNA 4LL5A 4NW6A 4AW0A 2WOUA 4BDDA 3A8WA 5HQ0A 3DFAA 1REJA 4TNDA 2JKMA 1W98A 3NZ0A 4C61A 4D28A 2XS0A 5J87A 3KU2A 4ID7A 1KE9A 4I94A 4WNMA 5EDQA 4O0XA 4DLIA 5KX8A 5LVNA 1P4FA 4JQ8A 5E8XA 1ZRZA 3HVCA 3ZOSA 2OIDA 3Q60A 4Y5HA 4BTMA 2CNUA 3ELJA 4K33A 4WUNA 3SXFA 3QQHA 4RRVA 4ASDA 3TKIA 3CBLA 3E62A 4E73A 5CI6A 4IACA 1JSTA 2Y8OA 4FTMA 5ANKA 5J9YA 4FIEA 4X2JA 2IG7A 4NWMA 4CXAA 4CG8A 1J7LA 1Q8WA 5CEKA 3BLHA 4FSQA 3TIZA 1W83A 4BDEA 5KUPA 5KZ0A 4MF1A 4UB7A 1H28A 5AP6A 3LJ1A 3V5LA 4XG7A 2EB2A 4CVAA 4TWPA 4DHFA 1XR1A 3ZUUA 3EN5A 5HX6A 5HE2A 3E3BX 4OGRA 2HWOA 4I6BA 5EW8A 3NIZA 4DT8A 4I24A 4IANA 5AV4A 5IF1A 3DKGA 3L9PA 1H0WA 3M2WA 3QQKA 2WEVA 2OH4A 4BFMA 4U8ZA 4E3CA 2HZ0A 4NTTA 5TO8A 3BCEA 5IMXA 5HOAA 3Q4CA 2BAKA 2P3GX 3DY7A 3OZ6A 4AZTA 3QQUA 4AXAA 4BHNA 3AC1A 2OU7A 3K3JA 3EKKA 4IX6A 5LCKA 3KULA 2J50A 3U4UA 5FXQA 2WXVA 4QMZA 2B54A 3MIAA 4Q9SA 1CM8A 2PVNA 5IQBA 3HECA 4K0YA 3ETAA 4L9IA 3U87A 5J8IA 3ZONA 4FGRA 3FI2A 3F69A 2PVHA 4KBKA 4DTAA 4BCKA 3R1SA 2FUMA 4R8QA 4LRKA 3S2PA 4DEAA 2CGWA 3Q2MA 1H1QA 3TEIA 3NUYA 1G8SA 1FINA 2WO6A 4RC4A 5DGZA 1M52A 2YERA 2WHBA 5FEQA 3C4CA 3KRLA 3JXWA 1OUYA 2R3GA 5CZHA 4CCBA 3HMNA 5CNOA 3BYUA 4ACHA 4F1OA 1WBPA 3LFFA 4IAYA 4GFMA 1OBDA 4IAAA 3MFUA 3ZTXA 4F9AA 2PMLX 4TN6A 3POOA 4IM2A 4M68A 5FD2A 3TZMA 3EYGA 5FWKK 1BLXA 1SYKA 5JGAA 4N0SA 4F9BA 1V0BA 3GFEA 2W1CA 3QZFA 5DI1A 2CNQA 4YZ9A 4DEGA 3RPSA 3DKCA 3V01A 3QZIA 3M11A 3BZ3A 4OW8A 4E20A 1UA2A 4HVDA 4FX3A 3EB0A 4YJSA 5F95A 2RL5A 1WZYA 4D0WA 2GU8A 3FMNA 4PNIA 3A60A 3O7LB 3PYYA 4QYFA 3UOKA 5AM6A 1U54A 5H8BA 3C4XA 3TT0A 2W1FA 1YHSA 3Q04A 2BCJA 2J90A 3A7FA 4GJ2A 4U9AA 2HCKA 5J1VA 1NW1A 4FKLA 3NYVA 4FOCA 4HVSA 3LXKA 3THBA 1RDQE 1V0OA 2F2CB 1ZYLA 4F1MA 4DTKA 1YW2A 3AOXA 4R6VA 4V0GB 4C38A 2PZ5A 1M2PA 3DK3A 3QRKA 2QD9A 4MH7A 3VUMA 4WRSA 4GYGA 5L3AA 3GC7A 3M1SA 1GJOA 2X7GA 2VTHA 3P7BA 4L3LA 3VBWA 2GQSA 3CGOA 2IVUA 2IZRA 3NAYA 3U54A 3H4JA 3QTIA 2VX3A 4FKIA 4ZMEA 3QQJA 4CLIA 2EXMA 3O51A 4ALWA 1XWSA 3K5UA 3WZKA 5IG1A 2XRUA 3QCSA 3L8PA 4UWCA 1F5QA 3COMA 5BVEA 5DPVA 2H9VA 2ZV8A 3QGWA 4BDFA 5ETIA 5HGIA 4LFIA 5B2KA 3KRRA 3ZXTA 4KBAA 4YZDA 2WTDA 4YJNA 2C6IA 4ACMA 2OH0E 4BVUA 4D1XA 4DITA 4X3FC 3QC4A 3RPOA 2V22A 5IZFA 1BL7A 5CU4A 3B2WA 4FTJA 1UKIA 3UQGA 4C34A 2OK1A 4NIFB 4MXOA 3W2QA 1YQJA 3FZ1A 4YPSA 3OG7A 3QKMA 4ZTRA 4EL9A 3QRTA 3CJGA 4M69B 1VYZA 2HW6A 3E8CA 1XKKA 4QMNA 3T8OA 5EHOA 1ZY5A 4AFEA 5CSPA 2V5QA 4KBCA 3ZFYA 4J71A 3ZS5A 1SMHA 4HPTE 2HXQA 4TZRA 5CVGA 2IJMA 4FK6A 5FP6A 4DEDA 4UALA 2W4JA 3DB6A 3CPBA 3D7ZA 5IA2A 1B38A 1G3NA 2VTOA 4M7IA 3QYZA 3LZBA 4O2ZA 4XV3A 2R3MA 3F7ZA 4WBBB 2R0UA 3UIBA 4EEVA 5KMKA 3QALE 4OTHA 5ANOA 4E6CA 3BEGA 4M66A 2WMTA 5ACKA 4JAJA 4FSWA 5FQDC 2PE0A 5D1JA 4MTAA 3HP5A 4EC8A 3E8EA 4J95A 3S95A 5DRDA 4AZSA 4IAFA 3T9IA 4IM0A 4L67A 4Y73A 4EH9A 3PXFA 3O8TA 3OOMA 4V0GA 3I1AA 4ZSJA 3O8PA 4BICA 4O82A 4Q2AA 2EVAA 5LJJA 2G9XA 2OXDA 4G31A 2C5NA 3ZC5A 3MA3A 3SHEA 1NVQA 1ZAOA 3IOKA 5A4QA 4G9RA 4YTIA 2W4OA 3R30A 4PTGA 2YISA 3RHKA 3RINA 4F08A 3UP2A 4BDKA 2QLQA 4IWPA 3AGMA 2OSCA 2IO6A 4NTSA 3RK5A 3O17A 5EI2A 3ULZA 5CEIA 4AT4A 2J6MA 4J52A 2X81A 4XS2A 4AAAA 3RM6A 2OG8A 5CX9A 4ZSEA 5AX3A 4RC2A 2ZM3A 4QMVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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