4IAAA

Crystal structure of ser/thr kinase pim1 in complex with thioridazine
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Ser/Thr kinase Pim1 in complex with thioridazine
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iaaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iaaA01
2GMXA 4AGUA 4IACA 2YIYA 5FXQA 1EH4A 4WNPA 1R0PA 5DMZA 3HLLA 3CJFA 2WTIA 3Q4CA 4KNBA 4O0YA 4Q2AA 5CZHA 3GU7A 4C4JA 4AUAA 2HYYA 2XBAA 3TJDA 4C7TA 4TT7A 3QGWA 4EOMA 4QD6A 3VBYA 5KO1A 1YHWA 1LPUA 3EQHA 3QQHA 3KMUA 4FEVA 4BKYA 2UZOA 5M08A 1B39A 3OCTA 4FG7A 5LCJA 3F82A 3OW4A 4JRNA 4XV2A 4O0RA 3WF9A 4JDIA 1TVOA 4QPSA 4XYFA 3QYZA 4PMTA 3MTLA 1BLXA 3W16A 4ANBA 4QPAA 2W5AA 4L52A 4BCHA 1ZY5A 5J87A 3OW3A 3G2FA 4FOBA 4G2FA 4GFGA 2NNWB 3GCVA 3OP5A 4OT5A 3H9FA 2FGIA 3OHTA 4U40A 4BHNA 3CP9A 4RJ4A 3QTQA 3SW7A 4QMLA 3UNJA 3D7TA 5EHLA 1Q8UA 3AD6A 4CFNA 3SRVA 4XJ0A 3HA8A 1FMOE 4S31A 3HMPA 3VBWA 3VRZA 1MRUA 1XHAA 4ALUA 3RPYA 5AAEA 3E8CA 3CIKA 1JOWB 1FPUA 3I7CA 3LFEA 1L3RE 2VAGA 4JNWA 4M67A 5CX9A 1RE8A 4TYHA 3I79A 1U5RA 2WKMA 2C6LA 1SYKA 4HVIA 4FMQA 3KRXA 2QONA 5EYDA 2XNOA 5K3YA 3RP9A 4DT8A 4KIOA 3EYHA 4X2NA 4ACHA 2UVZA 2B54A 3QD3A 1FGKA 2OJJA 2WNTA 1K9AA 3EQFA 4KWPA 4BGGA 4JAIA 2B9IA 3LFBA 5CAPA 4EWQA 5EM5A 3PUPA 3R83A 4LGHA 1HCKA 4RRVA 1LUFA 3ULIA 5BX0A 2CLXA 4WBBB 5CSVA 3DXNA 4FT9A 4LQMA 4WG3A 3RCDA 3UVPA 4BCPA 2VN9A 1PMEA 4C62A 3SGCA 3C4CA 2XEYA 5B2MA 1OECA 4MKCA 5CEPA 5DHJA 2QO9A 3TACA 4TNBA 3A99A 3PPKA 4GU6A 4IZAA 5LCKA 4XG2A 4I0TA 4KD1A 5AP4A 5I3RA 5AM7A 4BDAA 2Z8CA 3F2AA 3C4FA 4L43A 2BVAA 4FVQA 3RAKA 4K8AA 3UP2A 3VHKA 4EKKA 2OI4X 1U46A 3D83A 4KA3A 5L8LA 4ZY4A 2WQOA 3ZM4A 2ZMCA 4O83A 2H9VA 5LARA 1IG1A 3O51A 3TUCA 3H3CA 1U5QA 3UVQA 2VTOA 3CSVA 3O8TA 3EN5A 4G3DA 4KIPA 4LOPA 4EUUA 1XBBA 5E8WA 3N4TA 1KE9A 4IZYA 3WOWA 2WMUA 4ALWA 3AG9A 2QHMA 5C01A 4ASDA 3ZUTA 2ETMA 4CYJA 3ORMA 4IH8A 2DQ7X 4OGRA 5H9BA 3VJNA 4Y8DA 2OLCA 3A7JA 1SNUA 4UZHA 3DPKA 2ZV9A 3KK8A 4F08A 3IGGA 2VO0A 2XRWA 4LG4A 3PRIA 4I6FA 2OIBA 5BMSA 3D94A 2OFVA 4C8BA 1IAJA 2PU8A 4U43A 4D4SA 3H30A 2GU8A 4IFCA 2WIHA 4GW8A 4U97A 3RALA 3U9CA 2OH0E 3ZEWA 3LFAA 5AP0A 3R8UA 3OUNB 5T6KA 5CZIA 3OZ6A 1QPDA 1UV5A 4GV1A 4M15A 5B7VA 2FH9A 3UPZA 4LV5A 5E90A 4RPVA 3WARA 3BHHA 1PMVA 4GL9A 5FTQA 4FTTA 1FVVA 4IZ5A 4XHKB 2HZ0A 2CGXA 3KMMA 4RFMA 4EQUA 5DRBA 1KWPA 2GHMA 2IJMA 3BBWA 2B9FA 1S9IA 3MH2A 4ASZA 4EK6A 4I5PA 4C36A 4GT3A 2GDOA 2XRUA 4FKPA 3CGFA 3Q6WA 5CSHA 3VBQA 3ZLWA 2WQBA 4ZS4A 4B9DA 4H05A 2ETRA 3ENHA 2OJ9A 5I9YA 3F2NA 3VS5A 3VHEA 3ZC5A 3GFWA 2GNLA 2B53A 5AR7A 1ZOEA 2WQEA 2YIRA 4G3FA 1H1RA 1XR1A 1STCE 4EKLA 2F2UA 5CU3A 1DM2A 4BDIA 5LVOA 3U6JA 4R77A 3U51A 3MH1A 4C2WA 2OJGA 1H1SA 1ZLTA 3TKHA 3VUIA 3VRYA 4FZ7A 4G6OA 2G9XA 4WRGA 5AA8A 2VWWA 2YCQA 1OL6A 4YLKA 3KVXA 4ID7A 4K2RA 5ANDA 4RWIA 4AAAA 5K4JA 2BAKA 3CCNA 4FT7A 1A9UA 1GIHA 3MW1A 1OUKA 5T3QA 5KUPA 3C13A 2YM8A 5E8VA 3KXZA 5CI7A 4WA9A 3T9IA 4AZWA 4BDJA 3R7YA 5EHOA 5T68A 1BL6A 2WO6A 2YA9A 2FVDA 4FK6A 3VS0A 2QQ7A 2YZAA 4DF3A 1OBDA 4EOJA 4OTWA 3H4JA 3Q9WA 4PMMA 4BDDA 4QMNA 3ZM9A 4DFLA 2CNUA 2UW9A 3GQIA 5HZNA 1M17A 5AMNA 4CKRA 3NLBA 5E8UA 4KKGA 3FLNC 4RSSA 4D4VA 3MBLA 3SRVB 4R5YA 1TQPA 2JFMA 2IW9A 2UZTA 1WCCA 3R6XA 4L9IA 4YJUA 3VVHA 5IUHA 2R3JA 2Z7SA 2C6OA 3NGAA 4RA4A 1BMKA 3QZIA 4JQ8A 3OCGA 4FKVA 2QO7A 5GHVA 4EOSA 2PVKA 4NUSA 1XH8A 4G17A 4PDOA 4QMUA 4TYHB 1UWJA 2R4BA 2HZIA 3BEGA 5EI6A 1WBPA 2VTMA 3T3VA 3HRFA 3F7WA 2GNHA 2RKUA 2JDOA 5DR6A 3FLSA 2CDZA 4FKTA 4IX6A 2J0LA 4BBFA 1VZOA 3R7OA 4AN2A 2C4GA 4FIIA 3LMGA 4NKSA 2B55A 4FKWA 4AGDA 5BVEA 4YZ9A 3ZH8A 1BX6A 3S3IA 2WMAA 2VUWA 4RIXB 3VNTA 3IK3A 2UZUE 1I09A 4S2ZA 3POOA 3MDYA 4QP7A 3JVRA 3MS9A 5IH6A 3KKVA 3P7AA 5IUIA 4X3FC 2C6EA 2EXCX 2BKKA 3ZMMA 3K3IA 4UWBA 4NZWB 1XO2B 1Q99A 5A4CA 3SVVA 5F94A 5GZ9A 4AW2A 3HZTA 1PRYA 4IAAA 3ZOSA 1CKJA 2HENA 2UZLA 4IB3A 3UBDA 4A4OA 2PE2A 4EQCA 2B9HA 4JDKA 1FINA 1M14A 2CPKE 4FC0A 3RAWA 5K0KA 2VO3A 2WU7A 4BDKA 4QMPA 3SXSA 2XVDA 1NVSA 1JKSA 2X8DA 2Y4IC 3IW7A 1JAMA 3AC3A 2J0JA 1YXTA 1JBPE 4FV1A 3TJCA 4XRJA 4BWKA 1UA2A 3NNXA 3VUGA 4IB5A 4FICA 5KMLA 3PPJA 2JC6A 3D7ZA 3G6GA 4YJTA 4M66A 4RBLA 3MVHA 4RJ6A 4IM0A 3HMOA 5HGIA 5HTIA 3A4OX 4DEAA 1UKIA 4X2JA 1OIRA 4BFMA 2WAJA 5DR2A 2IW6A 2QHNA 4DTBA 4FG9A 2NRYA 2Q0BA 2YERA 2BUJA 4AT4A 3W55A 4DFXE 2PVJA 2W1HA 3CTJA 3V5LA 2OO8X 4EORA 3IECA 5M06A 2XJ0A 5BQ0A 4ASXA 2VWBA 4ZY5A 3QHRA 4HCUA 2J5EA 1V1KA 3O23A 1ZOHA 4BIEA 3VS6A 4D2RA 4L45A 4GKIA 2XIYA 2J6MA 3HX4A 5J7BA 4Y95A 4I4FA 3FSKA 3QTWA 1OGUA 4RJ3A 3V8SA 1JKKA 5CI6A 4A4XA 4F1TA 4WKQA 3QLGA 2ITXA 4E5BA 3R63A 2IVSA 5ETAA 1DI8A 1SVHA 3GC7A 2C5YA 3CE3A 4FZAB 5FRIA 2I0VA 3L8SA 2YITA 3LJ0A 4XG9A 5L8JA 1NVQA 1GZKA 3BELA 3C4ZA 5H8BA 3VQUA 4EEVA 3BGZA 4FODA 2ITNA 4O1PA 5KE0A 4A07A 5I4NA 1ZXEA 3LAUA 2YJRA 3QA8A 4C37A 1ZWSA 4GMYA 3V04A 5J79A 2ZDTA 4JG6A 4IE9A 3PTGA 1T46A 3DU8A 4S30A 4MEDA 4UALA 4D58A 4A06A 4OUCA 4KS7A 4BGQA 4X0MA 5IEYA 2QOFA 4TWOA 2R3LA 4RWJA 4F9WA 4NFNA 3R7UA 2VNWA 4CQGA 3QD0A 1JNKA 3D5VA 4ZSLA 3PJ3A 4NCTC 3BHVA 3FMDA 4HYIA 4J52A 5AAFA 3UZRA 5CEMA 5D11A 5IZFA 3HYHA 2F7XE 4TYJA 2FSOX 3H9OA 5B2KA 4F0IA 4FTAA 1Y57A 4L3LA 4L53A 5AP5A 4XP0A 5BVWA 4HPTE 4YZCA 3UNZA 3HAVA 3PIZA 4F6SA 4E4MA 3FY2A 3IKAA 4APCA 2VTAA 3R9NA 4GEOA 2NO3A 2BFYA 4DFNA 3HP5A 4KINA 4K6ZA 5HG9A 3DBEA 5JGAA 2QKWB 4L44A 5HIDA 5K5XA 4O7VA 3NCZA 4EQMA 3PZEA 4BWPA 4O7TA 4NTSA 3TNHA 3ORPA 5EHYA 4E5AX 5FBOA 4L00A 4PMSA 4U7ZA 2QR8A 4RJ7A 3K54A 4LM5A 4BCIA 3TWJA 5CVFA 2W06A 3F2RA 2BRHA 5F9EA 3ZSIA 3BHUA 2X0GA 3COIA 4LL0A 5HO8A 3MPAA 3PJ8A 4BI0A 4EHGA 4NU1A 3IOPA 2PHKA 4D1ZA 2J9MA 1H0WA 1Q8WA 3BYMA 1B6CB 2HCKA 3G9LX 2F9GA 3F9NA 1P5EA 4UMPA 3HV7A 4DYMA 3FQEA 3NUAA 3ENMA 3D15A 3VW8A 4GIIA 3GB2A 5EG3A 2YDKA 3OWKA 3W8LA 5AAGA 3ZZEA 4JR7A 3MPMA 3GUBA 3EQCA 3CR0A 3QFVA 1K3AA 1Q3WA 4M84A 3QWKA 4LV8A 3O8PA 4UBAA 4ZSGA 3MVLA 2XUUA 2ZB1A 4CFFA 3FI2A 4MH7A 5DG5A 4ZZNA 3MTFA 4IWQA 4FTOA 4I41A 3DAEA 3HRBA 2KTYA 3L1SA 3QQKA 4G9RA 3RK9A 2FO0A 4CRLA 5B0XA 3BYUA 3W2RA 2B1PA 4JJRA 4LGDA 4MYGA 5HE0A 4C4HA 2XB7A 4TWPA 4QYYA 4D55A 4PV0A 5AADA 5GZ8A 5C26A 5JK3A 3LVPA 3DK3A 1G3NA 3HMMA 3ET7A 4I0RA 4Q5EA 4CMUA 1BI7A 4FV6A 3EQGA 5CQUA 1Q41A 5TR6A 1PXNA 1ZMWA 3ELJA 2R3GA 4Z7HA 5CF5A 4HCTA 1Y91A 3F88A 4RVMA 5CYIA 2H34A 2W5HA 4KAOA 1J3HA 4X3JA 3ZO1A 4CZUA 3LPBA 4L6QA 3BYSA 2WIPA 3PP1A 4N4SA 5HIBA 4BCFA 4CCUA 2PK9A 3DKOA 3SKCA 3HUCA 3ZDIA 4RQKA 5G6VA 4AP7A 3OY3A 5CAQA 5M57A 3UO5A 4QMXA 5H2UA 3LCKA 4FNZA 4XS2A 3B8QA 2W4OA 3FZ1A 4DEHA 1SNXA 4F70A 2JDSA 1RW8A 3G90X 5KZIA 5K4IA 3NYNA 4C4EA 4E26A 4PNKA 2OIDA 1JWHA 5A4LA 3VUMA 1R3CA 4X3FA 4AW0A 2W0JA 2WMRA 3JVSA 4C3FA 1PKGA 4JIKA 1OL2A 2JAMA 4ZTHA 2PTKA 3UZTA 2YLFA 2GFSA 3QRUA 4F1MA 4ZJVA 4M14A 2W4JA 1DS5A 2XCKA 1OVEA 3O71A 4ONAA 4RQVA 2WMSA 4D28A 3G6HA 4C4FA 3I6WA 4BKJA 4EHVA 5DT3A 4RC4A 3FUPA 4XG7A 4G6LA 5CSXA 3PWDA 4MNEB 1P14A 2E9NA 4IEBA 4DTAA 2PVYA 3DJ7A 4HGLA 1WBNA 3OWJA 4WRSA 2QC6A 4UMQA 4TNDA 5D7VA 3KGAA 3ERKA 3MFRA 4NM7A 5HX6A 5JT2A 2X8EA 3TI1A 3K5UA 1MRVA 3WZUA 4BDEA 4EH3A 1GZ8A 1W0XC 2BHHA 2VX1A 4DAWA 4YZDA 3DXPA 3FHRA 3VC4A 4I23A 4MK0A 4QMOA 4C0TA 4XP3A 1Q4LA 4FZDB 3IW8A 4B99A 2ZM4A 3F7ZA 4BL1A 4C02A 2BFXA 2O5KA 2QOOA 1E1VA 3IG7A 1M52A 4QMTA 4GVAA 4FI1A 1XJDA 4U8ZA 3A4PA 3PY1A 4MWHA 5ANIA 3ZUVA 4OBQA 4WSYA 5IA2A 4XUFA 3C0IA 3DB6A 3ZRKA 1XH5A 2X8IA 3V51A 4QQJA 4I93A 3FLWA 2CGUA 3QTUA 3QZFA 3W2SA 3DK7A 3QRKA 5L2TA 4G9CA 2G15A 3CC6A 4QP2A 3IONA 3PXRA 4S33A 5F4NA 2QU6A 1YVJA 5E92A 4MX9A 3GU4A 4L68A 3EKKA 5LVMA 2F57A 3CQWA 3AGMA 3IW5A 4BTMA 4MCVA 2W5BA 3LMIA 4GK2A 4GIHA 5K0XA 3OEZA 3R2YA 2GNIA 4RLKA 4K18A 5DA3A 4EH8A 3G9NA 2FSMX 5DWRA 4JVGA 4NM3A 5H3QA 3HKOA 2G1TA 3OXTA 1RQQA 2R0UA 5KMKA 5AR4A 4XOYA 1APME 4IFGA 4TPTA 3BU3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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