4IAZA

Structure of camp dependent protein kinase a in complex with high ba2+ concentration, adp and phosphorylated peptide psp20
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Phosphoryl Transfer Catalyzed by cAMP-Dependent Protein Kinase: An X-ray Crystallographic Study of Complexes with Various Metals and Peptide Substrate SP20.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase/peptide
source organism Mus musculus
total genus 110
structure length 334
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iazA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iazA02
5F20A 2XJ2A 3DNEA 3E62A 3QHRA 3LFEA 3DKGA 4QMOA 1LUFA 2CLXA 3BKBA 5CSHA 5CVHA 2I6LA 1ZOHA 5L6WL 4NIFB 3SA0A 4N0SA 4PL4A 5FTQA 3Q2MA 4E4MA 4O7RA 3DS6A 2XEZA 2W5AA 4IWQA 4A9SA 2JIUA 3CS9A 3BX5A 1Q5KA 3LCSA 3U4WA 4FSRA 5HVYA 4BHZA 5CXZA 4RX7A 2RFDA 2QU5A 3FWQA 4IZ5A 4RWKA 2PL0A 4XRLA 2C0TA 1QPEA 3QA0A 3MJ2A 4Y72A 2LGCA 2Y4IB 4MWHA 4MCVA 3RCJA 1Y6AA 5ETFA 4ZXTA 5IUHA 1PY5A 4HCVA 4XG8A 4J8NA 4NKSA 4TN6A 2GTMA 2WQBA 3SRVA 4DGGA 1MQBA 3TNIA 5J7BA 5CZHA 4BDCA 3K5VA 5C26A 5CAVA 4WNMA 4AZVA 3UIXA 1ZZ2A 2ITWA 1OBDA 3EFWA 3RHXA 4Y5HA 5HX8A 4MAOA 4L68A 4QP2A 5FM3A 3F3VA 3HL7A 4A9YA 5KMMA 5AP6A 5D41A 2ITQA 2X8DA 2JITA 3Q4TA 3SG9A 3R9RA 5IQGA 2ITTA 2VX0A 4Y83A 3MIAA 4I5MA 4JG6A 3Q4UA 5A6NA 5HO8A 3ETAA 2XS0A 4BCQA 3PE2A 3R21A 4LOOA 3UPXA 3OWKA 4B7TA 5J1WA 3DAJA 3TDVA 1JNKA 4R6VA 3KULA 4IACA 3VVHA 4HOKA 2X4ZA 4XLVA 2W5BA 2X2LA 1OBGA 3EQHA 3QF9A 4I21A 1NVSA 3FZSA 4O0VA 3V8TA 4M7IA 2BRMA 4L67A 1FINA 4R7IA 4QMPA 2FO0A 3R1SA 4IANA 5DIAA 3RBWA 4ACCA 4HCUA 2QKWB 4RLKA 4Z7GA 4GK2A 1OIRA 5JK3A 4MXYA 5J9ZA 3QTRA 1B38A 4FKPA 1JKKA 2C5VA 3E92A 1YWVA 5CEKA 2JFMA 3PXQA 4M67A 4FV4A 2F7ZE 1H1QA 2BRHA 4EH7A 2H9VA 3DQXA 4ZTLA 3PG3A 3UO6A 2W4KA 5AM7A 5CZIA 3KRRA 4RC3A 3ATTA 4UXQA 2YAAA 5H8GA 4F0GA 4W8EA 5AR5A 5DYJA 2BDFA 5TKDA 5AUZA 4AOTA 4ITJA 3VS4A 2J6MA 2OG8A 4GRBA 4IAAA 4NIFA 4I22A 1MUOA 3SOAA 4KRDA 4YJUA 3OTUA 5HIDA 3I60A 3PUPA 2EXCX 3JVSA 3S1HA 3TG1A 4A9TA 3HEGA 2V0DA 4CV9A 3F66A 4I5HA 4MNFA 1RW8A 4W9WA 3QC4A 5ANKA 3DK3A 4I5CA 3HMNA 4QPSA 4ZEGA 2QNJA 3S95A 3QAME 3EQRA 1BI7A 4WRGA 1TQPA 2UW4A 5CU2A 1Q99A 2J9MA 5L6OA 4H36A 4YTHA 5EKNA 2NRUA 2PU8A 3JR1A 4IXPA 2Z7QA 3PY3A 4IQ6A 4OR5A 3FEGA 3PWYA 3ATSA 3VF8A 2WNTA 1E1VA 2R3JA 4QQ5A 3N51A 4QMQA 4O6EA 2OJJA 3ACJA 4PP7A 3DDPA 3HUBA 2X7FA 5M4UA 3RAIA 2WMQA 1M52A 1JSUA 2WQMA 4I4EA 5DRDA 3R04A 4O7TA 3HX4A 1J3HA 3AT4A 4NFNA 5AUTA 5FXSA 4RVMA 4FIIA 3T9TA 4UBAA 2WTVA 3TTIA 2CLQA 5HE1A 2UZBA 2OF4A 3GFEA 4E6AA 1Q61A 2BAJA 3DKOA 4XP2A 4C4IA 3NGAA 3V5WA 2FSTX 4ZZMA 2AC3A 1Z5MA 2YCFA 3AT3A 3CKXA 3OCSA 2J90A 3RPSA 3QTWA 4W9XA 4BI2A 3BLRA 3KRXA 5EHOA 5CEQA 1TQMA 3FMEA 3R7UA 3BE2A 4C35A 1W8CA 4OTDA 2ZV9A 3MDYA 1WAKA 2HWPA 4UXLA 4PX6A 3W2RA 3RNIA 5K5XA 4YLKA 1GAGA 3HECA 5E7RA 3CKWA 3C13A 2X8IA 3CXWA 4A4XA 4X2GA 2W99B 2OFVA 4DA5A 4HCTA 2CNUA 4LMUA 4RIWB 4S2ZA 4EEVA 3OMVA 4ITIA 3W33A 3KF4A 3RMFA 5JSMA 5KO1A 1WBVA 4WO5A 3LXKA 2RFSA 1VYZA 2XEYA 4J97A 2G15A 2C6EA 4RJ8A 3WE8A 5DH3A 3P23A 1OPKA 2W5HA 3ZSGA 1CM8A 2WTIA 3Q04A 1IEPA 2UW3A 4ANSA 4BBFA 2W1ZA 3KU2A 5BX0A 1R3CA 1A06A 3COMA 1L8TA 4RFYA 4ASXA 4GH2A 2AYPA 5AP3A 2PVLA 4DN5A 5CU6A 2W1HA 1Q8WA 3PA3A 5A46A 4FV5A 5DT0A 5CASA 1NW1A 2VTLA 4IC7A 4FL2A 3UP7A 4C4JA 4NEUA 4ACDA 2KULA 4ZJIA 4F0FA 4YJOA 1PJKA 3R7GA 4WBBB 5M56A 3R8PA 4NYEA 4FTRA 4L7FA 5E9EA 4H39A 2HZIA 4O21A 2SRCA 4CVAA 4RZVA 5CF5A 1RDQE 3EQPA 1P4FA 4G9CA 3NCZA 2XNPA 4YO4A 4RBLA 5BPYA 4WG4A 4JR3A 4DGMA 3DZQA 2OH0E 4C4EA 3VAPA 3HMIA 4WT6A 4ID7A 4USDA 4AX8A 1M2PA 1CMKE 2O8YA 5AIKA 3OW4A 5IA5A 3F9NA 1IA8A 3LFQA 3R9NA 4IM2A 3SQQA 2R9SA 3UOJA 3PJ2A 5CU3A 4KS7A 4YO6A 4DH1A 2WO6A 3HMPA 1SVHA 2C3JA 4ZY5A 5T3QA 2EXMA 3ALOA 3BELA 3BWFA 1OIQA 4YJTA 2J4ZA 3PJ8A 3C4EA 3A7IA 5DN3A 3G0EA 1M7NA 4K0YA 4BCKA 4TWNA 2H34A 3H0ZA 2ONLA 1UNGA 3PIYA 2P33A 1GZNA 3AG9A 5FTOA 4L3PA 5G1XA 3ID6C 4TYGA 1BKXA 1XO2B 2NP8A 2BPMA 4IJ9A 4QP9A 3L8PA 3NAXA 4MX9A 3TKUA 5CEIA 2O63A 4A7CA 3ZUTA 3DGKA 3AC4A 2QR8A 1HCKA 3TV6A 3LE6A 4FGRA 4QP7A 4AW1A 3KRJA 5DLSA 3QTZA 4RIWA 3FYKX 4I20A 1Q8YA 4JLCA 3TKIA 3ZYAA 4DFXE 5KMNA 1I44A 5I9VA 1PXOA 4IW0A 3CPBA 5FD2A 4AT3A 5A54A 4EHZA 3WZJA 1GZOA 4MXXA 2WU7A 3MFUA 3MA6A 4I6BA 4D2PA 5C8KA 5EI8A 3VRYA 4GFOA 5FQDC 4B8MA 4G3CA 4IB0A 3AD6A 4AZFA 1H1WA 1Q24A 1Q8ZA 3EHAA 4X6RA 3D14A 5LMAA 3W55A 4JVGA 3NX8A 2J5FA 2ITYA 3FI3A 4FKSA 2NO3A 5B2KA 3FLNC 4YZDA 4M0YA 3DOGA 3D15A 3PPJA 2ERZE 2C5NA 4JDJA 4F99A 5HBJA 5J79A 2CKQA 4O7LA 1YI6A 2PVRA 3FZPA 5FUTA 1H1PA 3DPKA 2PVFA 3TNHA 4QQTA 4KINA 3WF7A 1FQ1B 3VBXA 4FK3A 4ZSJA 3TUBA 1KWPA 5D12A 3MY1A 3VBTA 3K3IA 5HKMA 4U42A 4XOYA 4XV9A 5DOSA 4N6ZA 2XBJA 3BGZA 4IZ7A 3QRKA 4G9RA 4E5WA 3VUDA 5EFQA 3HNGA 2WMWA 1YDSE 4YLLA 4EBWA 1QCFA 4HVIA 5KMKA 3RPRA 4TPTA 4BCMA 4U5JA 2CGWA 2WQOA 2AUHA 2X81A 4XP3A 1H26A 4ZIMA 4WRSA 4IX3A 3R83A 3PP1A 2W4JA 3DDQA 4EH9A 4ZP5A 1JKLA 3M11A 2F7XE 4DFLA 3EH9A 5G6VA 4PDOA 4BC6A 4XBRA 1NY3A 5CF6A 2HENA 1MRUA 1Q8TA 1S9IA 1ZZLA 2PVKA 3F3ZA 5TE0A 5BVNA 4DCEA 3DCVA 2RL5A 2J0KA 5TF9A 5HI2A 3PLSA 5IQAA 4NH1A 4DGNA 4FR4A 3CR0A 3ORPA 3ZRLA 4EHEA 4M84A 4FKWA 4WG5A 5I3OA 4AUAA 2BCJA 4CRLA 3KRLA 3AC5A 3UNZA 5FXQA 3ZEPA 2G2IA 4FC0A 5D10A 5EOBA 3ZO2A 4B6LA 2OIDA 3LAUA 3MH0A 5HG9A 3IS5A 4FV2A 4O0UA 4KBCA 5M09A 4BFMA 5JQ5A 2F57A 4R3PA 1JBPE 3EL8A 1JKTA 4I24A 3A8XA 3R0TA 4HZSA 3UPZA 1JPAA 3QTQA 4FIHA 2UZEA 3UMXA 5EDPA 2J50A 5IPJA 2C5XA 3NWWA 4MBJA 2RGPA 4MXCA 3RWQA 2YDKA 4CRSA 5E8XA 4QP3A 4O6LA 3DNDA 3R73A 2CNVA 4WNPA 1O9UA 5A4CA 1LPUA 1XH9A 3UOHA 4EBVA 1FPUA 4FTUA 4BTKA 3ZXTA 3UIMA 1F5QA 2RG5A 4HPTE 5DR2A 5CF8A 3QQLA 1O6YA 2GNIA 1Y57A 3D5XA 3CQEA 3BHVA 4KA3A 4M15A 4O0SA 4U7ZA 5EH0A 2A2AA 3VUIA 2QLUA 3TNPC 4O1OA 3VN9A 3HV4A 3KFAA 3QGYA 1YQJA 2J7TA 4FZ7A 4QRCA 5E1EA 5EW3A 5KMLA 3KXHA 4A9RA 4FG8A 2XKEA 5H9BA 3QKMA 2WU6A 2QLQA 3D5WA 1Q62A 3F5UA 1YOJA 4GFGA 3FY0A 4FSZA 4GJ2A 3Q4ZA 4YNOA 4TWCA 1YHVA 3BBWA 5E92A 4EI4A 2G01A 4M66A 4RMZA 3OHTA 4FYOA 2BZHB 5HO6A 4RZWA 4IB5A 4BCOA 2CSNA 5CEPA 4YP8A 3BU5A 3M42A 3OY1A 4IADA 4ZSGA 4O0WA 4Q5EA 1UWJA 5CS6A 3E8NA 3F2NA 4FG7A 3LLAA 2QC6A 3PJ3A 4ANOA 2BVAA 3Q9YA 4D1XA 4GUEA 2HIWA 4BWXA 4WBOA 3QALE 4GEOA 4DH5A 3R7OA 3W18A 4BZNA 3R7YA 2UZDA 3FE3A 4OTQA 4PMMA 5EM7A 2E9PA 4RC2A 3BPRA 5AMNA 1ZOGA 3TKHA 2OXYA 4DEGA 3C0GA 3DXNA 2C6OA 4XG7A 3A7GA 3KXNA 3RAKA 3C4FA 3THBA 2H8HA 5IISA 4IM0A 3WF6A 1PKDA 3Q6UA 1YKRA 4YZMA 4CKJA 4FV3A 3GCSA 4QMZA 3D7TB 4D58A 4A06A 4O82A 4G3FA 5D7VA 3R9HA 1ZLTA 3AXWA 5CVGA 5TR6A 3UZTA 3HP5A 1UU7A 3NR9A 1YDRE 3QL8A 5GIOE 4EHGA 5BUJA 3EFKA 3F3TA 3UIBA 4W8DA 3VUGA 3T9IA 4U8ZA 4QT1A 4IB3A 4XP0A 4DGOA 2CNQA 4BVUA 3SGCA 3BHUA 4XV3A 2ESMA 1H01A 3WILA 4L46A 2ZM1A 1DM2A 4YHTA 3BRBA 4ACMA 4C58A 4F08A 3Q6WA 3PE1A 5AP1A 2DS1A 3LZBA 3BQRA 4P7EA 3UZPA 2WMXA 3EN7A 5E1SA 3ZSIA 2EB2A 5JFSA 3U4UA 3RKBA 4MTAA 4F63A 4F9BA 3TZ7A 4JBVA 2XM8A 3EQIA 3GI3A 5AR8A 5IEVA 3LQ3A 4E26A 3SHEA 4BDFA 4JI9A 5GNKA 4Y73A 5B2MA 3U55A 2R3NA 4ALVA 3E93A 2W1IA 1SZMA 4ERWA 4RJ4A 5IA3A 4FTMA 1CTPE 2VGPA 3PXFA 4KD1A 4JT3A 4JS8A 5I4NA 4CG9A 4AS0A 2GFCA 3BHYA 3OCTA 3QUDA 4TKSA 2YWVA 1FVVA 4I4FA 2O65A 3QLFA 3POOA 4MKCA 4XYFA 4RQVA 3QKLA 1J1BA 3ORKA 3O71A 1I09A 2CMWA 1O6KA 3PP0A 5HEZA 2ITOA 5C4KA 3G2FA 4WSYA 3TV4A 4D28A 2FB8A 2YZAA 1P5EA 3RHKA 3I0OA 3I81A 3CTQA 4MF0A 2PVHA 2WTKC 2YIRA 2JDSA 4U80A 1ZARA 2REIA 5A4EA 1OI9A 3E88A 4I1ZA 4HVSA 3U6IA 3OXZA 2IVSA 3PA4A 1FBNA 5KKRC 4QD6A 4GSBA 3V5QA 3PIZA 3QCSA 1OPJA 2VTTA 5M08A 4FUYA 2OICA 4KKGA 3FI4A 1JSTA 2F7EE 3GNIB 4RJ3A 4DCAA 4R3RA 3C50A 4E5AX 4P90A 2XP2A 4H05A 4M69B 3P5KA 2HOGA 4FL1A 4ZTHA 4FKGA 4UALA 4QTEA 4K2RA 1UKHA 3PJCA 2R3MA 2IVUA 2VO0A 3QQKA 4O38A 5AP7A 1XR1A 3D2KA 2QODA 4K11A 3ZSHA 2QCSA 3U87A 1YDTE 1XKKA 4AP7A 3D7TA 3MH2A 2OIQA 3ZLXA 2F4JA 4LMNA 4QP1A 3COHA 2ZV8A 3DZOA 2JBPA 4O7VA 3N9XA 5J9YA 2Q0NA 2BDJA 3UVQA 1ZY5A 1JOWB 3WYXA 2OIBA 4L8MA 4YMJA 4FV1A 2GNJA 4QMLA 4WA9A 4EUUA 4WNOA 4QYGA 4QP8A 2GPHA 4E6DA 2JAVA 2C1AA 2J0IA 2QOBA 2Y8OA 2XVDA 1UKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5F20 A;  2XJ2 A;  3DNE A;  3E62 A;  3QHR A;  3LFE A;  3DKG A;  4QMO A;  1LUF A;  2CLX A;  3BKB A;  5CSH A;  5CVH A;  2I6L A;  1ZOH A;  5L6W L;  4NIF B;  3SA0 A;  4N0S A;  4PL4 A;  5FTQ A;  3Q2M A;  4E4M A;  4O7R A;  3DS6 A;  2XEZ A;  2W5A A;  4IWQ A;  4A9S A;  2JIU A;  3CS9 A;  3BX5 A;  1Q5K A;  3LCS A;  3U4W A;  4FSR A;  5HVY A;  4BHZ A;  5CXZ A;  4RX7 A;  2RFD A;  2QU5 A;  3FWQ A;  4IZ5 A;  4RWK A;  2PL0 A;  4XRL A;  2C0T A;  1QPE A;  3QA0 A;  3MJ2 A;  4Y72 A;  2LGC A;  2Y4I B;  4MWH A;  4MCV A;  3RCJ A;  1Y6A A;  5ETF A;  4ZXT A;  5IUH A;  1PY5 A;  4HCV A;  4XG8 A;  4J8N A;  4NKS A;  4TN6 A;  2GTM A;  2WQB A;  3SRV A;  4DGG A;  1MQB A;  3TNI A;  5J7B A;  2XAN A;  5CZH A;  4BDC A;  2XAR A;  4JMQ A;  3K5V A;  5C26 A;  5CAV A;  4WNM A;  4AZV A;  3UIX A;  1ZZ2 A;  2ITW A;  1OBD A;  3EFW A;  3RHX A;  4Y5H A;  5HX8 A;  4MAO A;  4L68 A;  4QP2 A;  5FM3 A;  3F3V A;  3HL7 A;  4A9Y A;  5KMM A;  5AP6 A;  5D41 A;  2ITQ A;  2X8D A;  2JIT A;  3Q4T A;  3SG9 A;  3R9R A;  5IQG A;  2ITT A;  2VX0 A;  4Y83 A;  3MIA A;  4I5M A;  4JG6 A;  3Q4U A;  5A6N A;  5HO8 A;  3ETA A;  2XS0 A;  4BCQ A;  3PE2 A;  3R21 A;  4LOO A;  3UPX A;  3OWK A;  4B7T A;  5J1W A;  3DAJ A;  3TDV A;  1JNK A;  4R6V A;  3KUL A;  4IAC A;  3VVH A;  4BJJ B;  4HOK A;  2X4Z A;  4XLV A;  2W5B A;  2X2L A;  1OBG A;  3EQH A;  3QF9 A;  4I21 A;  1NVS A;  3FZS A;  4O0V A;  3V8T A;  4M7I A;  2BRM A;  4L67 A;  1FIN A;  4R7I A;  4QMP A;  2FO0 A;  3R1S A;  4IAN A;  5DIA A;  3RBW A;  4ACC A;  4HCU A;  2QKW B;  4RLK A;  4Z7G A;  4GK2 A;  1OIR A;  5JK3 A;  4MXY A;  5J9Z A;  3QTR A;  1B38 A;  4FKP A;  1JKK A;  2C5V A;  3E92 A;  1YWV A;  5CEK A;  4DDG A;  2JFM A;  3PXQ A;  4M67 A;  4FV4 A;  2F7Z E;  1H1Q A;  2BRH A;  4EH7 A;  2H9V A;  3DQX A;  4ZTL A;  3PG3 A;  3UO6 A;  2W4K A;  5AM7 A;  5CZI A;  3KRR A;  4RC3 A;  3ATT A;  4UXQ A;  2YAA A;  5H8G A;  4F0G A;  4W8E A;  5AR5 A;  5DYJ A;  2BDF A;  5TKD A;  5AUZ A;  4AOT A;  4ITJ A;  3VS4 A;  2J6M A;  2OG8 A;  4GRB A;  4IAA A;  4NIF A;  3BL7 A;  4I22 A;  1MUO A;  3SOA A;  4KRD A;  4YJU A;  3OTU A;  5HID A; 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