4IB5A

Structure of human protein kinase ck2 catalytic subunit in complex with a ck2beta-competitive cyclic peptide
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title First structure of protein kinase CK2 catalytic subunit with an effective CK2 beta-competitive ligand
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ib5A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ib5A02
4BR3A 3CY2A 3SW4A 3NNUA 1F5QA 2QR8A 4HOKA 5M4CA 3KULB 3BZ3A 3UGCA 1OVEA 3KGAA 3F6XA 1CKJA 3GI3A 4PNKA 2GTMA 2OBJA 3PPZA 5LVMA 2IVSA 4QMXA 4A9RA 5AAEA 2YIWA 5EM8A 4ZJJA 3KRXA 2PPQA 2J0IA 4XV2A 5HVYA 3HMMA 1H08A 4CZYB 2PVFA 2F57A 2C6OA 5IPJA 4AZTA 3ZRKA 1XQZA 4LRMA 3VS1A 3ZFYA 2H9VA 1OKYA 3UYTA 3ZLYA 4L45A 5AV0A 4WOVA 4IB3A 1OMWA 3UMWA 4S30A 2VTNA 5ETIA 4ZY6A 3FLZA 1PYXA 4NH1A 3KL8A 2HY0A 4RX9A 4FKIA 3RAWA 5GJFA 3FQEA 4G17A 2G2FA 3DLZA 3QZHA 2WTWA 4I0RA 1U5QA 4JG7A 4RSSA 3DPKA 3OY1A 3UZPA 5EDPA 4O0UA 3LAUA 4ZLZA 2HCKA 3P23A 3HRCA 2XK9A 4IWDA 5FM3A 4BCMA 1PXOA 3BE2A 4BI1A 2EVAA 2QVSE 4UALA 2PL0A 4CSVA 1I09A 4IX4A 4DGLC 3GOKA 4I41A 3VHKA 1JBPE 1Z57A 4I92A 2X8DA 2HXQA 2GQSA 2EU9A 3ZCLA 4IIRA 3ROCA 4EL9A 4FI1A 4U40A 5KZ0A 4M66A 5EHOA 4TYGA 5HG7A 4DTKA 3FXZA 4BY9E 1PY5A 4I6BA 3GCPA 3SHEA 5HNGA 1H8FA 4BCNA 4HNFA 4I0SA 4YUQA 5JFXA 3F2NA 1M2RA 3F5XA 5G1XA 3ORTA 3ZS5A 1PJKA 1TVOA 2FA2A 3EN4A 5F20A 1KOAA 5CAPA 5AAGA 4PNIA 4I1ZA 4RWKA 4UY9A 4X3FB 1TQIA 3MTLA 4HVDA 4KD1A 4U0IA 3ZLXA 1J7UA 2GQRA 3BEGA 5AR8A 3NVKI 1FVRA 5LVPA 2PZPA 1YDSE 3CEKA 4PPBA 3RWQA 4FYNA 3RZFA 4EORA 3R8UA 2FO0A 4O6LA 4N57A 4O91A 1NVSA 2WNTA 1OPJA 2VTRA 4L68A 3CLYA 3Q5IA 1ZYDA 4IADA 4O38A 5AP2A 3EN6A 4EC8A 1KE9A 3LQ5A 3HV7A 4HGTA 4E6CA 2UZBA 5CEKA 2UZTA 4XG9A 4IVCA 2VO3A 3Q4ZA 1H07A 3QUPA 1IG1A 3FSFA 1QPCA 1YXTA 2XIRA 3FWQA 2ZB0A 3DB8A 2ITQA 3C4FA 3QQKA 5FXRA 2BPMA 2OXXA 4R7BA 2V5QA 4AA5A 4EYJA 3IW5A 3R8MA 3V5PA 5E8XA 3R7EA 2BAKA 4IWPA 4ZTMA 3AOXA 2WMQA 4QPSA 2BUJA 4DF3A 3P86A 3FMEA 3DKCA 4FYOA 3G9LX 4QMLA 3WZEA 5H8EA 5EI6A 1LEWA 5FDXA 2ZDTA 2W0JA 4F63A 4LFIA 4J96A 1QMZA 5HBEA 3NZ0A 3BYVA 3FLWA 4P90A 4UB7A 1GAGA 3QRIA 3TT0A 4A9SA 4RWIA 3BWJA 1ZMUA 4YJRA 2PE2A 2ZM4A 3GCQA 3QTIA 5D7VA 2VO7A 4CV9A 3HP5A 5BUEA 1O6KA 2R3PA 5K4JA 4J99A 2Z02A 3O0GA 2UZOA 4FG9A 4C8BA 5EQPA 1JKSA 4USDA 2O0UA 1Q8TA 2VWYA 3F7ZA 4YJSA 3CQWA 5EW9A 3D83A 1FMKA 3F3ZA 4ZZOA 4JDHA 3CP9A 3UG1A 2GSFA 4BZOA 2B9IA 1YWRA 3R04A 3RPSA 5L2IA 1YKRA 3A99A 4WNKA 4I4FA 5HNBA 5LXMA 3OTVA 1W0XC 4NT4A 4O0YA 4D2PA 5FXSA 5CASA 1H01A 4XLVA 2W5HA 4DFLA 4Y73A 5EM7A 2RFDA 3BE9A 3DS6A 4O0RA 3E87A 4I93A 1JKLA 2BR1A 2C47A 4M68A 1ZMVA 2QO7A 5E90A 3V8WA 3FSKA 4WRGA 4FV8A 4O27B 3R0TA 4I5CA 5IA3A 2VTTA 1ZMWA 5J1VA 4UMQA 3MVJA 5CT0A 3VNTA 4DE4A 4FIFA 5AUZA 1T45A 3OCSA 4QTCA 2HZNA 3G33A 4LMUA 5HCXA 3VJOA 4ZSJA 5EI8A 2WMUA 2GQGA 3DQXA 2JKMA 3TNPC 1Y6BA 2WMWA 3BRBA 3LXKA 5HTIA 2Z60A 3NS9A 3EQFA 1X8BA 1RDQE 5BQ0A 4L44A 3RPRA 3MH1A 4JQEA 3NNVA 2A0CX 3SRVB 4BCKA 3K5UA 4JOAA 1UU9A 2BHHA 3FAAA 5EFQA 4FSTA 5C26A 3PZHA 4PQNA 3OW3A 2PZIA 4U3ZA 3UNZA 3H3CA 3C1XA 4OBQA 2IVUA 3VBXA 3VBVA 3WF8A 4AF3A 5IQCA 5F1ZA 2X9EA 3BQCA 5EI2A 2I0VA 1H24A 1V1KA 3KK8A 4OTIA 1QPDA 4AX8A 5A6OA 3EFKA 1KE8A 4LGDA 5AP1A 5CT7A 5A3XA 1GZKA 3OWPA 4QP8A 3Q4CA 2X7OA 4AP7A 4ZMFA 4DFBA 3CR0A 4LOQA 5FP5A 4Y5HA 4CCUA 2W4OA 3EMGA 1GZ8A 3RHXA 4FE2A 2CGVA 3DB6A 4J8NA 5F94A 3U55A 2YM5A 3HDMA 5J1WA 1AQ1A 3GU7A 3V8TA 5FLFA 4NTSA 1W84A 3DTWA 4CKIA 4AU8A 4MNFA 1YVJA 4E26A 2VTHA 2ACXA 1YXXA 3ODZX 4A07A 2OXYA 1FOTA 2EXCX 5HI2A 4BCJA 3IECA 3LVPA 2ZV7A 5KMNA 3L9LA 4EOOA 2QU6A 4F6SA 3T3UA 4B4LA 3PXQA 2B53A 3QD3A 4S2ZA 4TYHB 3BHYA 4W8EA 2YIQA 3FDNA 2QHMA 3P08A 5J5TA 5KHXA 4KBAA 4XG3A 5FD2A 3IW4A 3WF9A 3E8NA 4JQ7A 4ID7A 2ZMCA 4A4LA 2C5XA 4G5PA 3QZGA 1VZOA 3IOKA 4FZ7A 3AC1A 3PY3A 3VW8A 2BHEA 2JDTA 4GSBA 4AT4A 4CMUA 3L8XA 1XBBA 4X3FC 3EZVA 4E4NA 3D4QA 4QYHA 4FV0A 4ZP5A 4R77A 3O2MA 5JGAA 4FVRA 3VO3A 2C1AA 4OBOA 3VUGA 4QTEA 2AYPA 5IQDA 3R30A 4UN0C 4KSQA 5AM7A 3MGYA 3R1YA 1PMEA 2E9VA 2R3RA 4NW6A 5DT0A 4ANOA 2PY3A 3FJQE 5FTQA 3ALOA 4F6WA 2QOIA 5I9VA 1XJDA 5HTCA 1GOLA 1JKTA 4E20A 2ZVAA 2C6EA 2UVXA 3W33A 3G15A 3ZO1A 2WQNA 3MA6A 1M14A 4RA5A 1SVGA 3QCYA 2PVYA 3D2IA 4E93A 1BKXA 5LMAA 3UZRA 4IWOA 1APME 2GDOA 4QPMA 4MAOA 5HCYA 1H4LA 3L9NA 4Z55A 2Y7JA 2F7XE 4O7WA 4MNEB 3WIGA 2BZJA 3OT8A 3TWJA 4GYGA 2YWPA 3W2PA 3DAEA 3U6JA 3UIUA 3P5KA 4EOQA 3DTCA 4UMTA 4U79A 3BEAA 4RRVA 3RK7A 3ULZA 4ASZA 4E4LA 1GNGA 3ZSIA 2HWPA 2VWIA 1BLXA 2B1PA 3G90X 3JVRA 5IF1A 4F7JA 1FQ1B 5IH5A 2W1EA 3PLAE 3QCQA 4PMMA 4R3CA 2UW9A 3CD8A 4JIKA 4RC3A 2XJ2A 3SXFA 2YCQA 3DDPA 2J51A 2C6IA 3WZUA 3Q6UA 5D11A 4FSYA 1YRPA 4F7LA 5HIEA 3ORKA 2PVHA 2I0EA 2ZYBA 5E8SA 4EKKA 3FZSA 5E8VA 4AG8A 4BRXA 4WKQA 1Q24A 3PSDA 3M11A 1W7HA 4FV7A 4QYEA 3ZEPA 3R8LA 3BELA 1M2PA 1M7QA 4TT7A 3IONA 3DAJA 4ZZMA 3R63A 3FI3A 1MRYA 4CTBA 3NCZA 2BRNA 3QLGA 4KIQA 2GNLA 1MQ4A 2RF9A 2C3KA 3A60A 3VUKA 5AP3A 3KRLA 3CQUA 1UVRA 2NPQA 3HDNA 4AFEA 4EOMA 3FLSA 4ANSA 3SDJA 4RPVA 4IDVA 5DNRA 3V3VA 5IA1A 3C5IA 4LYNA 4FSMA 4AE6A 5CEPA 4GJ3A 5LVLA 3FHIA 3OG7A 3NSZA 1UU7A 4I5PA 2XNEA 3HECA 4U5JA 3R7OA 4L8MA 4RIOA 5BUJA 3HUBA 3QQFA 3FI4A 3RNYA 4ANQA 2XF0A 3G0EA 3W32A 3UOJA 4O7VA 4FKJA 5BVOA 3MBLA 3N4UA 4PTEA 3QCXA 2Q0BA 4EHEA 1QCFA 2AC5A 4FEUA 3FYKX 5HD4A 4IAZA 4PTCA 3ZOSA 1OIYA 2J0JA 3VS7A 3IDBA 2YACA 4BDDA 1OKWA 2RG5A 3Q4UA 5DOSA 5AEPA 5CZIA 2PHKA 2V0DA 3GVUA 4HYHA 4EUUA 3A7FA 3W18A 3IG7A 5HE3A 1WBSA 3EYGA 3TXOA 4PL3A 2E9PA 2VWXA 2FB8A 4L9IA 2QLQA 4XS2A 5F95A 3TUBA 3C5UA 2QO9A 2X1NA 1VR2A 4AXAA 4QMQA 3GNIB 2VWZA 2XM9A 3MFRA 1PHKA 4E8AA 4A06A 4P5ZA 5FTOA 2Y6OA 2BDJA 1RE8A 3R8PA 4WUAA 3W2OA 5CVFA 3C13A 4I21A 2AUHA 3F5PA 1FBNA 2OJGA 5FDPA 2W96B 2UZVA 4FT0A 3SD0A 3ZUVA 4FVPA 1DI8A 1YOLA 2X39A 1CMKE 3L8VA 3OWKA 4J95A 4MXCA 2VWVA 3OWJA 4PP9A 3R00A 4HJOA 3O8TA 2SRCA 2OIDA 3MV5A 4KSPA 1WBNA 4FTIA 5B2MA 2WXVA 4M0YA 2FUMA 3TTIA 4XP0A 2IZUA 2C6LA 2UV2A 4JNWA 4PF4A 3N51A 4GV1A 2VWBA 5JT2A 3GU4A 4XEYA 4GG7A 4MVFA 3GC7A 4NIFA 3QA0A 3UQCA 3ACJA 1IAJA 4BKJA 2ZV8A 4RJ7A 2GNHA 4D5HA 2W1HA 4FBXA 3QRUA 4QQJA 3DBDA 1H0WA 3OZ6A 3C7QA 4FOCA 4C0TA 2RSVA 2PMNX 5CSXA 3WOWA 3WIKA 2BIKB 3BLRA 2C30A 2VV9A 2C4GA 5IA5A 3EQBA 3TEIA 4QP3A 3TV7A 3ZO4A 4ARKA 3W55A 4BDEA 4PP7A 5J7BA 1H25A 4RZWA 4IDTA 2ZV2A 3IW8A 1R78A 4EJ7A 2ZAZA 2VUWA 4BYIA 4WG5A 5JFSA 4PY1A 3NLBA 3HP2A 5L2QA 4AZEA 4YTFA 3ZZEA 1UWHA 4YZNA 4DLJA 4IVAA 5IEYA 4WUNA 3QQLA 4X6QC 2P55A 4JX3A 5EKOA 1DM2A 4D2VA 1Q8UA 4CYJA 5DVRA 4XP2A 3PIYA 4KKHA 4EK6A 3QYWA 5D1JA 4I5MA 2W1CA 5DE2A 2ITTA 5CTPA 3IO7A 3FLQA 3U8WA 3FMHA 5TKDA 2WMAA 1YHSA 3ZFMA 4QP4A 1OBGA 4WRSA 5AX9A 4CMOA 4FODA 3SOAA 2IG7A 4EK4A 2VWUA 3LCOA 4RIXA 5KHWA 3B8QA 2ITPA 4YLJA 2X8EA 3KXXA 4IE9A 4ZTQA 3FL5A 3R28A 3W2QA 3MY0A 5HQ0A 3S1HA 3JR1A 4EOSA 3QQHA 4WNOA 3ZRMA 2ETMA 4PV0A 2C5NA 2CKPA 4PPCA 3D5XA 4AOJA 2VWWA 2F7EE 2NP8A 1KSWA 1WMKA 2IW6A 2PK9A 3OOMA 4EOJA 3FEGA 5EKNA 3DJ7A 5I5ZA 3KCKA 1NVRA 2JDVA 3K3JA 5AR3A 4KINA 2QG7A 3FXWA 4O0XA 2JC6A 5A4TA 3FHRA 3FE3A 4PTGA 2JEDA 2YERA 4HPTE 1YI4A 3VS0A 4EZ5A 5BMSA 3WZJA 4UBAA 4RA4A 3BBWA 4L43A 4W4WA 2I40A 4O7SA 3FMMA 3TACA 3PTGA 4PDSA 2CCHA 3R9DA 4R7IA 1W98A 2IZTA 3DBFA 5AR7A 4YSJA 4G3DA 4HGSA 3I0QA 4IFCA 4JR3A 2G1TA 2CGXA 4C7TA 5L2SA 1UWJA 4F1MA 4NSTA 5ETAA 3A2CA 4BCFA 4N6ZA 1SVHA 3AC2A 3CKWA 3ZLWA 5L6OA 4K6ZA 1XWSA 3GQLA 2XP2A 1B38A 1WBVA 1XKKA 2W1GA 4PRJA 4QO9A 5HO8A 3VRYA 1UU3A 2QOFA 3I6UA 4D2RA 4RJ6A 3ZBFA 3NUXA 2NO3A 2VTPA 4GJ2A 4OT6A 5CU6A 3UOKA 4X21A 3W1FA 2BZKB 4D9UA 2ITWA 2VTAA 3A8WA 3QWJA 5EOBA 2W17A 4ZS0A 4IXPA 4ZK5A 2PTKA 4OTHA 5DEWA 1H00A 2G15A 2YFXA 3NW7A 2KULA 4NTTA 3LCDA 4DHFA 3KXGA 1UKHA 4WG3A 4IWQA 3R6XA 3R9OA 1YI6A 3MY5A 1U46A 2HIWA 2OICA 3BHUA 3GT8A 4U45A 3ZC6A 2WB8A 3PA4A 3U4UA 4DINA 4LI5A 3O7LD 3V8SA 3WI6A 4F0GA 2ZM3A 4CXAA 2QOBA 5HCZA 4DH8A 3EYHA 4WBOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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