4IJ9A

Bovine pka c-alpha in complex with 2-[[5-(4-pyridyl)-1h-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]-1-(2-thiophenyl)ethanone
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Accounting for Conformational Variability in Protein-Ligand Docking with NMR-Guided Rescoring
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 104
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ij9A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ij9A02
1Q97A 5E1SA 4ZXTA 3VWAA 2R3GA 3R1NA 5IQHA 4FNWA 3KQ7A 4Q2AA 4QMSA 5HHWA 2O2UA 3RNIA 3DLSA 2ZV2A 4XLVA 4Y83A 4AAAA 3SOCA 3C4EA 4XLIA 2UW4A 4YTCA 3RK9A 4I5MA 4N57A 4BI2A 1T45A 2WIHA 3RPSA 1H1WA 4GKIA 4G2FA 3UQCA 2FSMX 1XBCA 2IVSA 1VYWA 2OJJA 5CWZA 3PUPA 5JFXA 3GBZA 3K54A 2NP8A 4CMUA 4O7SA 3MDYA 3G0EA 5KMOA 3FLNC 4QTCA 4IXPA 4KIPA 5LQFA 2W99B 3P7AA 3D5XA 4PDOA 2CNVA 3IOKA 1JSVA 4KB8A 3EB0A 2X4FA 3LFAA 5AAEA 2J0JA 3IDCA 3LZBA 3S3IA 4PMPA 2KTYA 4I93A 3WZDA 4EL9A 1YOMA 4I24A 2REIA 4O6LA 4B7TA 2WMBA 5ACKA 4ZTMA 3R0TA 4FTUA 3EOCA 3WF7A 2O64A 3F88A 3HVCA 3VJNA 3R1SA 5IDNA 2R3QA 4CG8A 3DZOA 4DEAA 3BU3A 4RX8A 5CSHA 2C3JA 2F4JA 2PVKA 4AE9A 3C4CA 3CEKA 3MA3A 4JAIA 4NCTC 1HCKA 3VBQA 2OZAB 3VUDA 4RX5A 4C2WA 4J97A 3DNDA 3F6XA 3NIZA 2EVAA 2RG6A 3HNGA 3DK6A 3IDPA 2CGXA 5IA1A 4CTCA 3PRFA 3SRVA 3FPQA 5DT4A 3KRRA 2OI4X 2VTIA 3CKWA 5JZNA 3QKLA 4FZAB 2AC3A 2W17A 4CZTA 3POZA 3S1HA 5HVYA 1XQZA 3I0QA 1UKHA 5DA3A 3RWQA 4DH3A 4TYEA 5CEMA 2WMUA 4FKJA 2Y6MA 2QODA 3R8LA 4HW7A 3UOJA 2JAMA 3RALA 4AFEA 3QQGA 5DIAA 2GTMA 4DEIA 3EQRA 2VZ6A 3W2PA 5CENA 4BBFA 5TO8A 4XBUA 3IW5A 4FV9A 4MXOA 3V04A 4F7SA 4H05A 4B6LA 2A19B 2IWIA 4L7SA 4AW2A 5DMZA 3G33A 4LL5A 5B2KA 1URWA 2QD9A 4H3QA 2X8DA 1KE6A 2JKKA 2Z02A 3VBYA 2IN6A 2WB8A 5FXRA 5A3XA 4R5YA 4FC0A 3TM0A 4CXAA 4YMJA 3TDVA 4IB3A 3RTPA 3RP9A 3Q4UA 4GK3A 4GU9A 2ZV9A 3GB2A 1IASA 2JDTA 4F1OA 2QLUA 2RFEA 2XK3A 4D1ZA 4M66A 1ZOGA 4O7YA 3ALNA 4ERWA 3VUGA 3C1XA 3E3BX 5BYLA 4YPDA 5K0KA 4TL0A 4FSWA 3GC8A 4J95A 4FT7A 1YXVA 4YJOA 3O8UA 4UY9A 3A61A 5HIDA 3ZH8A 2R4BA 1YRPA 3OFMA 4PQNA 5E7RA 3RINA 3TZ7A 3FMHA 3KXHA 5D9HA 4WSQA 2QLQA 5FTQA 1R39A 4APPA 4OTDA 4IVCA 3ET7A 5HORA 3A7FA 2G1TA 5IQIA 3D4QA 2OG8A 3DKFA 4FVQA 3WIGA 3QRJA 4C4HA 1LPUA 1XO2B 5FP5A 5GZ9A 5FBNC 5E8ZA 1WVXA 5I9VA 2DQ7X 3ULIA 4UX9A 3LFCA 3EL7A 4P5QA 1RQQA 3IG7A 4MEDA 1PXLA 4V05A 1JQHA 3QCSA 4B0GA 5KMNA 4FEQA 4EH6A 2XF0A 1S9IA 3BYOA 5CI6A 4EJNA 1QPCA 4ACDA 3LVPA 3FC2A 3OVVA 4E3CA 4ERKA 2W9ZB 4BRXA 2HIWA 3ZBXA 3NUXA 1SM2A 3UE4A 2GFSA 5CAUA 4I4EA 4U79A 4G3FA 1UWHA 5HX8A 3TUDA 2Z7QA 1NVQA 5HNGA 2YM7A 4FIFA 2BHEA 4CD0A 5IEVA 4MXXA 4BR3A 5JFSA 3QD2B 3OY3A 4YC8A 2UZNA 3ZCLA 4D2PA 3D5UA 5AV0A 4AP7A 4PNIA 3MH2A 1J1CA 2QOIA 5E8UA 5HTIA 3PJ2A 3FZOA 3NYNA 2B9IA 4J71A 4JG8A 4CGAA 5DVRA 5AR4A 2UV2A 3A4OX 3PA3A 4AN9A 2YCQA 3REPA 4EOQA 3LPBA 1MQ4A 4MHAA 2BDJA 1U5RA 3O7LD 4FTOA 1LEWA 1P4OA 4CKIA 4S33A 4RIXA 2FVDA 1YI4A 5LJJA 4UWBA 4IM2A 1IR3A 4RVLA 5KHXA 1JVPP 3WYXA 3DJ7A 5IH4A 2XA4A 4EOKA 2OFVA 3LJ2A 3DTWA 4D4RA 3K5UA 5DRDA 4AWIA 5M4CA 3QCQA 3AGLA 2SRCA 2X6DA 3NW7A 2V5QA 4C35A 2V22A 1Q61A 3IKAA 4X3JA 4I20A 3V8SA 3LLAA 3MB7A 2E9VA 1PXOA 4DG3E 3FE3A 4N6YA 5E90A 4GT4A 4UMRA 5CT7A 4C4EA 2ZM1A 1KOBA 4MQ1A 4D55A 5A6OA 5BQ0A 5M57A 2VWZA 3GU6A 5BVKA 3OY1A 4HVHA 2GS2A 2P3GX 2PVHA 4D2SA 5CNNA 2PMLX 4GKHA 3G90X 4F08A 2IPXA 3SA0A 3UOHA 3FQHA 2XNGA 1K2PA 4HZRA 4UN0C 4R6VA 5HBHA 3MVHA 4A7CA 2YM3A 5JFVA 4XS2A 2JFMA 1QPJA 3OMVA 2ETMA 1YOJA 2PVNA 1Y91A 3SW4A 3LAUA 3QKMA 4G9RA 3H9RA 4D28A 4U0IA 2PZIA 5BVNA 5H8BA 5IH6A 5DOSA 4Y72A 4XG7A 3OT8A 4YZCA 4E5AX 4FK6A 1X8BA 2GMXA 5A54A 4FTTA 2W1FA 4B99A 2WMQA 4BTMA 3R7OA 3R7IA 2PZ5A 2C3KA 1YDSE 3G0FA 5AR3A 4C7TA 4I92A 2X2KA 4EOPA 3GP0A 4RSSA 3I7BA 3Q60A 1K9AA 4GCJA 2HW6A 3FY0A 3EN7A 5EYKA 4BGGA 4JBOA 3L9PA 4EBVA 4X2FA 2GNLA 2ITYA 2PVFA 4FKLA 4YNEA 4ITIA 4F0IA 2ONLC 5L2IA 3DT1A 2XBAA 2XP2A 3D14A 2WQEA 3MWUA 4DGGA 4F9YA 4JRVA 3GOKA 4TY1A 3ZBFA 4D0XA 1FVRA 5LVLA 4E4MA 4R3PA 3FYKX 4RVKA 2CCIA 4IAFA 4C4FA 3BLQA 1W98A 1FQ1B 3EH9A 2WOUA 3RPYA 4Q9ZA 4L8MA 4QTEA 1UNGA 4X2GA 5JQ8A 2NRUA 3PZHA 3UIBA 5IQDA 4TKSA 4RWLA 4FEWA 4KWPA 5KMJA 4FBXA 4F64A 3DDQA 4DFYA 4BY9E 2B54A 3ORNA 3MH3A 2YACA 3RM6A 3DAJA 4XP0A 3ORKA 3O23A 1DI9A 5AX9A 1ZY4A 1OUYA 2VX0A 2XYUA 3L8VA 3CPBA 4CFFA 3QZGA 2J51A 2FSOX 4BYIA 4FV6A 3VS3A 4DH7A 3OT3A 2VTJA 5CSVA 2VAGA 4FG7A 5ANDA 5C8NA 4XV3A 4QMWA 5CY3A 3NIEA 4QP7A 3T9IA 1CKJA 2XCHA 1B39A 4L52A 3PP1A 5AP7A 3OCBA 4PTCA 5EFQA 3PJCA 4FX3A 2NNWB 3LM0A 3KC3A 4S2ZA 3RHKA 4KIKB 5K5XA 3HAMA 3CS9A 4JRNA 2F2UA 2R3NA 3LE6A 3RK5A 4AFJA 1XH8A 3EJ1A 3NW6A 4XOZA 4R1VA 5E1EA 2UZOA 1UKIA 5G6VA 3UOLA 4AF3A 2J4ZA 2O8YA 2OF2A 3KCKA 4EK5A 4EZ7A 3ZFXA 4BIBA 4XBRA 5CAQA 4TW9A 3R21A 1W0XC 4II5A 3F5XA 3CQWA 3QWKA 4X2NA 4O0SA 5I9UA 1A9UA 3C9WA 4D5HA 5C01A 5I9WA 5JT2A 3F2RA 1YVJA 1WBNA 3C5UA 4GK4A 2PZPA 3CLYA 3QCYA 5E91A 5ANIA 3IECA 3EQBA 3R28A 3DOGA 4KAOA 5CF8A 2CKPA 2W4JA 2WMWA 3E5AA 3V5QA 5AUVA 1YKRA 3C4XA 3L8PA 5E92A 4G31A 4C4GA 3G6HA 4F63A 3MW1A 1PXNA 3RHXA 4YC6A 4G3EA 1REJA 4NCTA 4QQJA 4HPUE 5M55A 5C4KA 5J1WA 4F1MA 3ZUVA 4EH7A 4IW0A 2V55A 4O0WA 2C0TA 2JDVA 4L46A 5LMAA 3SV0A 4M69A 2PSQA 2QU6A 3NS9A 2O0UA 3O51A 3NX8A 1BKXA 4TTHB 1GZOA 2UZLA 4U45A 2YDIA 2WEIA 3OBGA 3H9OA 1TKIA 2UZBA 3R22A 5ETAA 4DGOA 1OPJA 3DFAA 4EBWA 5GJGA 3D83A 1H07A 3MB6A 1H01A 4OTQA 4XV9A 4WA9A 4RJ6A 4MXAA 2HZ4A 3ORMA 2UW5A 5EI6A 3VULA 5LWMA 3ORLA 2ITVA 1V0OA 4BCOA 4RFZA 3Q04A 3OZ6A 5M44A 4OTPA 2Q0BA 4YLLA 2QOKA 4ZTHA 2BRHA 4JR3A 4WKQA 3SG9A 5HG8A 5ANJA 3WE4A 4YZ9A 3SXRA 2OIBA 1MRYA 3FLQA 2WMVA 4J53A 3GUBA 4FKTA 2IZSA 3KXXA 4BICA 1OI9A 4XRJA 5AR7A 3M1SA 1UU3A 2VNYA 5EDRA 3TG1A 4L9IA 5CSXA 3ZLSA 5HO7A 4G9CA 3THBA 3ZLYA 1Q24A 4KNBA 3SC1A 3UG2A 4PPCA 3UO6A 3PY3A 5ETFA 4USDA 3Q5IA 5D1JA 3ZS5A 2B9JA 3O8TA 5AX3A 3O50A 3COMA 5AM6A 3R8MA 2UZUE 3WI6A 5TKDA 5M4UA 5KO1A 4ORKA 3V8TA 4LUDA 4GJ3A 3R8UA 4DGMA 2Y4PA 5B2LA 5I4NA 3EQGA 2AYPA 4IZAA 4O0YA 3TZMA 5HNBA 4FYOA 3QFVA 1GIIA 2R0UA 4AZEA 3FMNA 4I22A 4IBMA 5GHVA 5CVFA 4HGEA 1YXUA 3EFJA 3K3IA 1DS5A 4NT4A 4ZTRA 3O7LB 5IEXA 4ONAA 2YLEA 1QPDA 4QQTA 3LFFA 4FGBA 4X6QC 4NIFA 3NDMA 2AUHA 3K3JA 5IQBA 1PY5A 3DDPA 2UW7A 2V7AA 2W5AA 4RJ5A 2PU8A 4DT8A 3BYUA 4X3FA 3KKVA 4XJ0A 4ZY5A 5LVPA 3P08A 3CJFA 4C58A 3AD5A 4IZ7A 5HBEA 3UZRA 3FMJA 3UZPA 2XM8A 2XRUA 1ZMVA 3H0YA 3OEFX 3ENMA 4NJDA 4U44A 4EYMA 4YO4A 3VF8A 2WTKC 3CGOA 3LCTA 3PP0A 3QX4A 4N0SA 2DS1A 1AQ1A 2QO2A 2YM8A 3EN9A 4YJSA 3GQIA 4RJ8A 2V7OA 4QP6A 4TWOA 2OW3A 5AJQA 4JAJA 4ZS0A 5AIRA 1O6YA 4QQCA 4O7VA 1M7QA 4IAYA 3PLAE 2X2LA 2R3PA 4M8TA 4O7WA 1APME 3BV3A 2X7FA 3D0EA 4O7NA 2PYWA 3QF9A 1OIQA 1BI7A 3NNWA 1Q41A 4EOOA 4XP2A 4W8DA 2H9VA 5AIKA 1URCA 1S9JA 3HEGA 3TV7A 4CFXA 4IAAA 3JR1A 5M07A 2GPHA 3PWYA 5CQUA 5DEYA 2YA9A 3BHYA 4X6RA 2VTTA 4C3FA 4ZSEA 4E6AA 3R63A 2GFCA 3UP2A 2XEYA 4L42A 1H0WA 4ZTNA 4A06A 2PL0A 1KOAA 4GH2A 4JLCA 4M7IA 4A9SA 3W2RA 3BYVA 1H1RA 1OM1A 4L01A 5EHLA 3TACA 5D10A 4DFNA 1NW1A 3BHTA 1Z5MA 4AOIA 3RM7A 4Z7HA 3FAAA 3NUUA 5C9CA 4QT1A 5FP6A 5ACBC 3ZO4A 2J2IB 4AZTA 2YCSA 2Y7JA 5JGAA 3EHAA 3DPKA 2BTSA 3FXXA 2C47A 3OBJA 3PIXA 4RC2A 4U9AA 1P14A 1PW2A 2GQRA 2GHGA 5L8JA 5C4LA 4C62A 4CFNA 2G01A 4FV0A 4KABA 4PRJA 2BALA 5EQYA 4N6ZA 3VS0A 4GG5A 4PUZA 4ACGA 3ZDIA 4WNPA 4ITHA 4FV7A 4JG7A 4ZTQA 3U87A 4AW0A 3Q4CA 5AM7A 5EM7A 4H3BA 3OWLA 3UGCA 2OJGA 2YZAA 3FZRA 3GU7A 3DBQA 4KRCA 4UZDA 5K0XA 3TKHA 4HCTA 3ERKA 5K3YA 5ICPA 1SYKA 5AP2A 1CTPE 2CGWA 3BLRA 4OTGA 4GW8A 5EM8A 4X2JA 3VS7A 5LCJA 4AE6A 3KN5A 3MJ2A 5DPVA 4E26A 4L45A 4EONA 4F9CA 4HVSA 4Q9SA 1OKYA 5J87A 2QKWB 3VBWA 2BMCA 3KL8A 3HGKA 4IC8A 2R3FA 2ACXA 4QMTA 4QPSA 1IA9A 2WIPA 3FLZA 4DYMA 2XK4A 4DTAA 4AXAA 1W83A 3ZLWA 3R1YA 4RVMA 1M2PA 4FL1A 4RWKA 4L7FA 4U3YA 3A7IA 2UW0A 4FIIA 1T46A 3SRVB 5K4IA 3NNUA 4JJRA 4H1JA 4X2KA 4LRJA 3JY9A 3V5LA 5CQWA 2Y4IB 4BF2A 3KGAA 4O6EA 2PVLA 1Q8ZA 3BQCA 4C8BA 5A4TA 2QKRA 3NPCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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