4IVCA

Jak1 kinase (jh1 domain) in complex with the inhibitor (trans-4-{2-[(1r)-1-hydroxyethyl]imidazo[4,5-d]pyrrolo[2,3-b]pyridin-1(6h)-yl}cyclohexyl)acetonitrile
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
302
structure length
291
Chain Sequence
GDIVSEKKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of C-2 Hydroxyethyl Imidazopyrrolopyridines as Potent JAK1 Inhibitors with Favorable Physicochemical Properties and High Selectivity over JAK2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 291
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2013-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ivcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ivcA01
3WIKA 2BVAA 4XUFA 1DM2A 5LMKA 4G5JA 3QWJA 3EQGA 4FKPA 4X2JA 2VTTA 2WQNA 1M14A 2C5XA 4R6VA 4F1OA 3NIZA 3NZ0A 2ZAZA 3RPRA 5HX6A 2XVDA 2V22A 4DBNA 5CI6A 2WU6A 4YSJA 2ESMA 5IEXA 5L6WL 1PRYA 5AX3A 3UNJA 3PG3A 2WQEA 3D83A 3MW1A 3UVPA 3VF8A 5TR6A 4CRSA 2W9FB 4DFYA 3QKKA 5HTBA 4ITHA 3LKMA 2R3PA 2IVUA 1QPCA 4J95A 4EH8A 3D7TA 2YCQA 5HU9A 2X2MA 4DINA 2YZLA 2ITPA 4NEUA 1Q8UA 1PKGA 5AADA 5D7VA 4RIXA 4MTAA 3L1SA 4YHTA 4E73A 3LCKA 4EHZA 4E4NA 5BX0A 1FMOE 2CPKE 2OZOA 4FKVA 3KRLA 4RC4A 3HRFA 4FEQA 3V01A 4FTLA 2VTOA 1WFCA 3CIKA 4DTAA 3P7CA 1HCLA 3ZTXA 1MRUA 3QX4A 4V04A 1URCA 2C5OA 3UMWA 1W7HA 2JAMA 4JNWA 4P5ZA 2BTRA 4XG8A 4FT5A 2HY0A 2YZAA 3PP0A 1GIJA 3HDNA 3KXGA 3RK5A 4I93A 3PUPA 4DGMA 3QBNA 1BMKA 4X6QC 3DLZA 5EHYA 3WF6A 2OFVA 4M67A 1NY3A 2XKCA 4KRDA 4D0WA 5JKGA 5E8UA 4NW5A 3QC4A 4E5WA 3NUYA 4F4PA 4FOBA 4FSYA 5IQEA 2YABA 5A46A 3PXYA 3DK3A 4EL9A 3TJCA 3COKA 1TKIA 1Q24A 4P5QA 4W8DA 3JY0A 3VAPA 4FZFB 3L8XA 4J8MA 3ET7A 1R3CA 3ZLYA 1J7LA 4GRBA 5IDNA 4LGDA 4FK3A 5KHXA 4ASZA 2P3GX 4GUEA 4DLIA 3CE3A 4ZP5A 1PHKA 3MTFA 3OMVA 4UWYA 4O38A 4X2KA 4R3CA 3R9RA 3DNDA 5DNRA 4WNOA 5BVFA 4NL0A 3AQVA 3D5WA 4QP4A 2GS6A 1OL7A 3TNWA 2O8YA 1MP8A 4BI2A 5L8LA 4O21A 5I5ZA 1LR4A 2ITZA 3G6GA 3QUPA 2QR7A 3BLHA 4KIOA 3ZXTA 3C4CA 3UO6A 4ONAA 4D5KA 3VBXA 4IADA 2PE1A 3QCSA 1BI7A 2OF2A 2Z7LA 2O63A 4FV3A 1SYKA 3W2QA 1H4LA 3VS3A 3QWKA 5HOAA 4WHZA 4CFNA 2PVHA 2J51A 3EQIA 5DVRA 5HTIA 2A1AB 3EQCA 2R3JA 4QP7A 5IQCA 2X4FA 4XG2A 5EM8A 3HV7A 1UU3A 3NYNA 4FG9A 3VRZA 2IVSA 3IG7A 2VNWA 1FGKA 5IU2A 2XIYA 5LVMA 2IWIA 4JDJA 3KREA 3VS0A 3REPA 2WEVA 5F94A 3FZTA 2IPXA 3G2FA 3MWUA 1FGIA 3NGAA 3TWJA 4PP7A 5KX8A 2XM9A 3EZVA 2BRGA 3LCSA 1H8FA 5DH3A 3SX9A 4AFEA 4CG8A 4ZXTA 2YDJA 3GQLA 4YU2A 2WMAA 3TUDA 3MJ1A 5HBJA 4IANA 2ZM3A 3TEIA 5M55A 2JEDA 4PV0A 3E93A 3U6HA 3HKOA 1G5SA 4WOVA 2C1AA 4KIKA 1CKIA 2B7AA 2UW7A 1P5EA 3ORLA 3QTSA 3A62A 4BBFA 1WBOA 4L3LA 5KO1A 5J1VA 4UN0C 5JGBA 1A9UA 3HDMA 2YM7A 2G01A 2ITVA 4K18A 4RIXB 3UIUA 4CMUA 4DH3A 3EHAA 4D55A 4O86A 4IVBA 3PFQA 3ZLXA 3BEGA 3TG1A 4MQ1A 4CTCA 1ZRZA 2OFUA 3FMMA 3FZPA 3PXZA 4MKCA 3R8UA 3JVRA 4O6EA 4F0IA 3C7QA 3BHHA 4NYEA 2VTIA 1PXPA 5JRSA 3PDTA 4AGCA 4CKIA 4GKHA 3SRVA 4DFLA 4HYIA 1UNHA 3E87A 5CU6A 3LXNA 3PG1A 1G8AA 2EXEA 2UZWE 4L00A 4ZZOA 2PMOX 3FYJX 3GOPA 4WIHA 3GGFA 3QRJA 3ZDUA 1ZOGA 2DS1A 4LMNA 5CVGA 4R77A 5L2QA 3K3JA 4IIRA 1XHAA 4C2VA 2VTJA 3DTCA 4WSQA 3FMJA 3WOWA 2P4IA 3IOKA 2ERZE 3FSKA 3R7GA 4M12A 3TNHA 2CKQA 2OJJA 3LJ1A 3KL8A 1YVJA 4I94A 5BVDA 5HO7A 4YJOA 1IASA 3BI6A 2Z2WA 5AA8A 5M09A 3AMBA 2OJ9A 3RHXA 2F2CB 4U7ZA 2I0VA 4BKJA 3MESA 3IW8A 5EOLA 2WMVA 4LRMA 3LM5A 3R02A 1KE9A 4J96A 3ULZA 4PRJA 2Z7SA 4C61A 4ACHA 3QCQA 5CLPA 5M51A 4KKGA 5L4QA 1WBVA 4MXAA 3R7EA 4FSMA 1JKTA 1NVSA 1VJYA 4RX8A 2YM3A 4X7QA 3ANRA 4XG4A 4C3RA 4DEHA 4ACCA 2BRMA 1Q97A 3VBQA 5HG7A 4JDHA 3HV6A 4PL3A 4MXYA 3F5XA 1KE6A 5HHWA 2JFLA 5EM6A 3UG2A 3LAUA 3UVQA 2YITA 2BZJA 3WZUA 3LFQA 4QQJA 2BDFA 2WMBA 2VTSA 5CNOA 4ANSA 2ZYBA 3AC8A 3F3TA 5HCXA 4EQMA 1H1RA 4RVLA 4AACA 2YIXA 3F5GA 3POOA 3CS9A 4FKTA 2VGPA 4IX3A 3MB6A 3OOGA 2WB8A 4X2FA 3ZC6A 4F6WA 1F0QA 4BCKA 4BCJA 4FTUA 4F7SA 2QCSA 2YERA 4C4HA 3NAXA 1EH4A 4Z7HA 3O51A 5A4CA 3QTIA 2XS0A 2WFYA 4OTIA 3WI6A 4UXQA 3U6JA 4R3PA 5C8KA 4FEXA 5CAOA 4JT3A 5LCJA 5EHOA 3DV3A 3Q9ZA 4OLIA 1DI9A 4TYJA 5LMBA 5TO8A 4KIKB 1V0OA 5HVJA 5ANIA 2QR8A 5D41A 4AT5A 5M4UA 1Q5KA 5IUGA 4EQUA 2IO6A 2UUEA 2YM4A 3ORZA 5I9XA 4O0XA 4GFGA 5CEOA 3PXFA 3TI1A 4A07A 2O0UA 3FE3A 3QAME 5KBRA 4NM5A 5HG9A 4AX8A 4TN6A 4EHEA 4NCTC 5EQYA 2HENA 2W5AA 4TNBA 3R01A 3KULA 4AT3A 4C38A 4G5PA 1GIIA 5BYYA 5IPJA 2F57A 4NT4A 4TPTA 1OITA 3R22A 2C0OA 4ZTRA 4QQCA 4O2PA 5AV0A 3EYHA 2WQBA 3F3UA 1J7UA 4GK3A 4JG7A 3ZEPA 1ZXEA 4IFGA 3JYAA 2XRWA 3BHTA 2VTPA 2XZSA 4O7WA 5AM7A 3P79A 2VTAA 2J0IA 3S4QA 4PDSA 3Q9WA 4OAUC 4Y83A 5CAPA 2XIZA 2KTYA 5LARA 3ZUVA 3KVWA 4EK4A 4CGAA 3GC7A 4B8LA 3DJ7A 3U8WA 4DH8A 5LWNA 5EW9A 5KKRB 2PE0A 4B99A 4HGEA 3A8XA 5M4CA 4O1PA 2WTIA 5LXMA 2RL5A 3UGCA 4MWIA 4OGRA 4PY1A 5IA2A 2BZHB 4KSPA 4HCUA 5KMNA 2Y8OA 2F49A 4L44A 2BRBA 1WBTA 2XP2A 1H26A 3CTJA 2HAKA 3Q96A 3CY3A 4MD8E 5H9BA 4H05A 4RFZA 4FL1A 4BDHA 5JZJA 4LOQA 4Y8DA 3DZOA 5AP5A 2XNBA 3UOHA 5CT0A 3M1SA 5HD7A 3L8PA 3UZTA 3T3UA 4MF1A 1OB3A 3OD6X 5CEQA 3UO5A 2ITQA 3BHUA 3CGFA 5J7HA 1WVXA 3VS5A 5FXSA 3WILA 1W98A 1B38A 3QHWA 3AC4A 3WZKA 5LOHA 1JSTA 3F6XA 4RFYA 3SW7A 5I9VA 2XB7A 3NEWA 3ACKA 3ALOA 4O0TA 5CZHA 4AZWA 4PMTA 4CFWA 3N4UA 3R2BA 1ZOHA 1O6YA 3FMEA 3T9IA 4BI1A 4O7VA 2OU7A 5CQUA 4ASEA 2PVYA 3FY2A 3FQSA 4G2FA 4MBIA 3E3PA 3FBVA 5DT4A 2BIYA 4BDEA 4GW8A 3ZSGA 2CNVA 3POZA 4MYGA 3RGFA 3A4PA 2JITA 3ZXZA 4CTBA 3U51A 3DNEA 4W9XA 1BI8A 5B2LA 4EQCA 5GZ9A 3P08A 1TQIA 2C0TA 4PDYA 3LXKA 5HE0A 4R7IA 5EYKA 4DE4A 4FG8A 2UZEA 3GCPA 3ZONA 2IZRA 3I60A 4BICA 3KXXA 4C7TA 2PL0A 2CLXA 1K9AA 1OKYA 4N4SA 4TT7A 4XYFA 4JQEA 3UYTA 4ZTLA 3FV8A 3VRYA 5AJQA 3BLRA 2HYYA 2QODA 1YI4A 4DF3A 3OWLA 2WHBA 1FOTA 4NM7A 3KULB 5D9HA 4MNEA 3UBDA 3OCTA 2PMLX 3DBQA 4A4LA 2UW4A 3QQJA 4RIOA 3UTOA 3MA3A 5M56A 4G6OA 3QD2B 5L6PA 1CMKE 3WBLA 1ZAOA 4IJPA 4NM3A 2PK9A 3HA8A 4RWJA 5HI2A 5DI1A 2XMYA 4QTBA 2P2HA 4QMMA 4IMYA 4D2TA 3KMMA 4EYJA 1UNGA 4C35A 4DG2E 1PXOA 4UWBA 4C58A 4AZEA 2X7GA 2ZVAA 4WG4A 4ZSGA 3RZBA 5JSMA 2JLDA 3Q2MA 3BV3A 4IX4A 4RZWA 4BTMA 2YACA 5IKWA 2W5HA 4D1ZA 1IAJA 3WYYA 4D28A 2YWVA 5FXQA 3KEXA 2HWPA 4UMUA 2YEXA 4C34A 4F1MA 3C1XA 2UZLA 5JGDA 2X7OA 2XYNA 4DT8A 4GG7A 3HAVA 5AV4A 2EB3A 2OJFE 3QZHA 3VS4A 3MVJA 3KRJA 3QQHA 4UV0A 4E6QA 4D4RA 1U54A 4FF8A 4JR7A 3IGGA 5FWKK 4I3ZA 4S30A 1IRKA 3DBCA 3ODYX 2CSNA 3WE8A 2B9FA 5JFXA 2QOHA 4XP2A 3NCGA 4WNPA 3FEGA 5B7VA 4BIEA 3FMKA 3QTZA 3BRBA 4QP8A 4AU8A 2ZMCA 3FMHA 3K3IA 4PF4A 2NPQA 4L46A 5FP6A 3G9LX 3TV4A 1GZNA 3S3IA 2ZM1A 5BUEA 1OL2A 3AC1A 1U5RA 1OBDA 4ERKA 4XG9A 2EVAA 4A7CA 4F7NA 2C6KA 4G3DA 2W17A 4I20A 4U45A 3PSDA 2OWBA 3PY0A 2R3GA 3TV6A 4TNDA 2YN8A 4D2PA 4EOLA 3PLSA 2Z7RA 4WUNA 3CY2A 5HNBA 3LIJA 1ND4A 1G3NA 4YJVA 3RPVA 3BCEA 2B55A 3NVMB 4RQVA 3DXQA 4YLJA 5E90A 3V6SA 5D7AA 3PRFA 2OZAA 3E8CA 3DOGA 3PVGA 4DN5A 3DA6A 4AAAA 5KNJA 2QU5A 4L42A 3E63A 5DMZA 2HW7A 4ZLZA 3NRMA 4NTSA 5I9ZA 3AOXA 3ELJA 1OZ1A 2WZJA 3QYZA 3NUNA 5IA4A 1XH9A 3HNGA 4FZ7A 4JBQA 4BKYA 3QGYA 4EJNA 5A4LA 2RKUA 4YR8A 2QG5A 4UYNA 4O0RA 2BPMA 4QMSA 1MUOA 3GQIA 5IH4A 2ZMDA 3DAJA 5J8IA 2F7EE 5LQFA 4OBOA 5AWMA 3TKUA 5FLFA 5LVPA 4DCAA 4YC3A 1OL5A 1ZY4A 1GJOA 4HPUE 5DEYA 3HP2A 4BDGA 3A99A 4S32A 2C6TA 4BGQA 3ZZWA 2UZUE 3UMXA 3PXKA 3U6IA 2W1GA 1OL6A 2R3HA 3QF9A 4IC7A 2OXYA 4QTDA 3OWPA 2XYUA 3BBTB 2O5KA 4E7WA 4GYGA 5BYLA 2PMNX 2JGZA 4DA5A 2QO7A 2GPHA 3DB6A 3KMWA 1OIRA 4JAJA 3Q5IA 3A7FA 4WKQA 1UKIA 5E8YA 3MI9A 5DRBA 5HQ0A 3KXHA 4ZZMA 3D5UA 3FZRA 3P1AA 5DG5A 1ZZ2A 2Y0AA 2J5FA 5EI6A 4AN2A 5EOBA 2WMTA 2CNQA 2EU9A 2J2IB 2WEIA 1U46A 3LMGA 4ACGA 4A9TA 2A4LA 1W84A 4QNAA 3DJ6A 3NNUA 4AS0A 4F9BA 4I0SA 4BI0A 5L2SA 3C9WA 3I5ZA 4O91A 3L9LA 3UODA 3LM0A 2AUHA 1OPKA 1WAKA 4L43A 3OS3A 3CQWA 4LMUA 4S34A 2Q83A 4E93A 1QCFA 3O2MA 4FEUA 2HK5A 3QCXA 3F9NA 2GTMA 3FDNA 4HPTE 4WUAA 2PVJA 3ORPA 4FL2A 2V7OA 5FUTA 3MY5A 4MD9E 2FUMA 1UV5A 5F9EA 2EXMA 3NCZA 3FL5A 3DKOA 5TT7A 4XP0A 4YJUA 3K54A 4V05A 4HYUA 3ZH8A 3G6HA 3TNQB 3QXOA 4CFXA 4B8MA 2W1EA 4M0ZA 4FZ6A 4NJDA 4U3YA 5CTPA 4CT2A 4D2SA 4YURA 5IEYA 5IQAA 3LFCA 1SZMA 4FZAB 4ZOGA 2Y4IB 3QALE 4QNYA 5AUWA 3R9NA 4LGGA 3RTPA 4LOOA 5AUZA 4J8NA 4O84A 2UVYA 4CFVA 5FEEA 4EH6A 3C5UA 4K33A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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