4IX3A

Crystal structure of a stt7 homolog from micromonas algae
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
LKARGGPKTLRRTPGVEPKDIRVLPGPLGSGNFGTVFRGVFKGDQDVVLKNAKADVMAAEELLECEMDVNYHVHANAKGTCARFMGCIELGAKDGGEIYNGTLTEGLWLMWANEGENTVEALMRRGTAPLATAMACADATELGVTKKAMRELLGSLARLHECGVVHRDVKPANLIAAEKDGGVLKLIDLGAAALCLPLPETLNYYPGDGPADPRYAKADELYLLPPGSPRPTKDNAAKLWEAHKPDRFDSWSAGCVMLQLAVVGLRTDAGLERFLADYKAVGYDVNAFRGEKSGEYGTMDFAALDANGGAGWDLCQRLMEAERDARASCEAALSHAFFDAAALEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the catalytic domain of a state transition kinase homolog from Micromonas algae
pubmed doi rcsb
molecule keywords MsStt7d protein
molecule tags Transferase
source organism Micromonas
total genus 104
structure length 346
sequence length 346
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ix3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ix3A01
1QL6A 3R71A 1YWRA 3CPBA 4X3FA 3QYZA 3QLFA 4QMVA 4K77A 4BDBA 5LJJA 5KO1A 3W8QA 3PVGA 5HICA 2OXYA 4ERWA 4BR3A 4Q5EA 4U42A 3LJ1A 2Y4IC 3OFMA 3ZMMA 3DB8A 3VBWA 5LVOA 2OJGA 3LJ0A 1JQHA 5IQAA 5L6PA 3QTXA 3P23A 2WHBA 1LR4A 3QC4A 4H3QA 5GZAA 3EZRA 2R64A 4LFIA 4E1ZA 4FV5A 4RG0A 2Z7QA 1L8TA 2O3PA 3IOPA 3IW8A 4LOOA 3ZLXA 4I22A 1PMUA 2G2IA 3L1SA 4ZLZA 5JH6A 4DT9A 1ERKA 1AD5A 2B9FA 1H1PA 3JXWA 3G5DA 4O0TA 5EDRA 4AFJA 3EHAA 2OBJA 3VJOA 3H0ZA 4M68A 2GNHA 2VTTA 2WMRA 2P55A 2YLEA 3BGZA 5E8WA 3BHHA 4NTTA 4XBRA 4A9SA 2JBOA 4NU1A 3O8UA 4XEYA 3W2SA 4I4FA 3LFAA 4R1YA 3PE2A 4HGLA 2WXVA 1IEPA 4MWHA 4GFOA 5M56A 2OLCA 4Y5QA 2DS1A 4BYJA 2B54A 4IMYA 3E8NA 3AQVA 4OGRA 4IIRA 1ZAOA 1Q8UA 5BUIA 2C3JA 3GQIA 4RC4A 4B8MA 4RC3A 2QHNA 1CDKA 4C2VA 3COKA 1XWSA 4FNXA 5EHOA 4KB8A 5B2LA 4LI5A 3VVHA 1IRKA 1R78A 4IDTA 3NYVA 3I5ZA 3DXNA 4FTMA 2YM7A 4W4VA 1PF8A 4BI2A 3ZRKA 4TYIA 3NUXA 3QTWA 4IC8A 2WMTA 3HV6A 3R7UA 1TVOA 5KBRA 3ORZA 4CLIA 2R3FA 2A19B 1XR1A 3OW4A 3GCPA 3PPKA 1Q41A 3DJ7A 2JDOA 5I3OA 2PMNX 5CEQA 3SA0A 1YXSA 3QRIA 3ZUVA 5LVPA 2E9UA 1OL6A 2XM8A 4Y95A 3PSCA 3R9OA 2HOGA 3Q52A 4ZLOA 4JQ7A 1XBCA 3MESA 4RMZA 4TWPA 3RTPA 3QX4A 5DN3A 3N51A 5M51A 4I92A 4OTRA 5J1WA 2Z02A 1CKPA 3QD2B 4IB3A 4ZAUA 3QWKA 5JRQA 2ITNA 2YM6A 3Q9XA 1ZLTA 3UC4A 1F5QA 4NM7A 5CNNA 4GIHA 3LCSA 3PP1A 1YXXA 4TWOA 5AR2A 3NIZA 5TO8A 2WU7A 1ND4A 4J53A 1OVEA 3DJ5A 3GBZA 3I4BA 5FWKK 3FHRA 5LMBA 4D4VA 4D5KA 4Q2AA 4BWPA 3MYGA 3PXKA 3U9CA 3OD6X 3QAME 4U5JA 3E5AA 4RIWA 3AC3A 4QMWA 3K54A 4N6YA 4A4XA 5H9BA 2YDJA 1CKJA 5BVNA 4XBUA 4NM3A 3QLGA 1U54A 1PXJA 1YW2A 2X4FA 3NUYA 4IQ6A 5JFXA 4IVBA 4OT5A 4M15A 5TR6A 3BV2A 3DKGA 3F3VA 3V04A 4UYNA 4F9BA 4CCBA 2FSLX 4IAKA 4R3RA 2ETRA 2CN8A 4D1SA 3NW7A 5CF8A 3VRYA 3FI3A 4FZ6A 3COIA 1U4DA 3P1AA 3VW6A 2JDSA 2OGVA 1MRYA 5DVRA 4O0UA 4BB4A 2VWUA 3DV3A 4TTHB 3H9OA 4MBIA 3B2TA 3NAXA 4BDFA 4O96A 4D1XA 4L9IA 3ZC5A 2VWIA 2W7XA 4CMUA 3GU5A 5JGDA 4RFZA 4IXPA 1V0PA 3DK3A 1VEBA 3IQ7A 2WIHA 3LPBA 5CVHA 5DPVA 4F6WA 4O81A 2VWYA 1BLXA 4KABA 4C4HA 2C47A 4R6VA 1UU9A 5FGKA 1XJDA 4X7QA 2XEYA 2V22A 4ZJJA 3TIYA 4IZAA 1FVVA 4NIFB 3MY1A 2OG8A 4EQMA 2G01A 5M53A 3OS3A 2HWPA 4IX6A 3QKMA 3A7JA 4J97A 4PDSA 4R7IA 5DI1A 4AS0A 1YXUA 1REKA 5GZ8A 5G6VA 4I6HA 3TJDA 5LCJA 2JKOA 4GMYA 4RIYA 5EI6A 4ZMFA 5EK7A 1RW8A 5AAEA 4HVGA 4E4NA 4HGSA 4QTAA 1VYWA 4G34A 4W4WA 5HNIX 3TUCA 4G2FA 2XCKA 2HAKA 4O86A 3BYSA 3PIXA 2VNYA 2W05A 2C5VA 3LFQA 5FD2A 1WBOA 3BHUA 4BDIA 2X8IA 4JQ8A 4RVMA 4Q9SA 4IHPA 4L42A 3R1SA 3U9NA 3PE1A 3NCGA 3CY3A 4L3LA 4O0VA 3R9HA 2OXDA 3ZO4A 3PJ2A 4OAVB 5HX8A 4IB0A 3HMNA 3HDNA 4ASEA 4ALVA 3VBXA 4QD6A 3BIZA 4AX8A 3IW6A 4CKRA 4IB1A 1UV5A 2G2FA 1PKGA 2VTIA 3TCPA 4WSYA 1NW1A 2EUFB 3UE4A 4FKQA 3FV8A 3PP0A 3SXRA 3TZ7A 1ZY4A 4JBPA 4G3FA 5GZ9A 2QVSE 5LQFA 3PVBA 2J4ZA 2HYYA 3FXZA 3GCQA 3NW5A 3BGPA 2ONLA 4F7NA 4E26A 4GS6A 5FBOA 5AUZA 2VO7A 3ZONA 3PA4A 1PW2A 5C4LA 4QQCA 4C4EA 1CMKE 2NNWB 3NMUF 4YZBA 3QYWA 4ITIA 2J0JA 2WTCA 5ANJA 4AN9A 2DUVA 3QRUA 4PNKA 4FIFA 3F82A 4O21A 3TIZA 2JC6A 3HUBA 3NZ0A 3F7WA 1FBNA 3ZSIA 3RJCA 2PMIA 3WZDA 1JLUE 2Z8CA 3SXFA 1XBAA 1PXOA 2YAKA 1XHAA 3POZA 3ET7A 4D0WA 2R3NA 4I4EA 4UMTA 3VS0A 4RJ6A 2R3HA 4CRSA 3P5KA 5A4TA 4Y46A 4QP2A 5AIRA 1MUOA 3VS2A 4ZEGA 4EOIA 2PZ5A 1K2PA 3SX9A 3OHTA 5F1ZA 1WVWA 4L68A 3W55A 4X2JA 2JEDA 4X3FC 2RG6A 3IONA 4CFXA 4D9TA 2PZRA 3GEQA 4FODA 2ZV2A 4IWOA 2YLFA 4NH1A 2C1AA 5HTCA 4O2ZA 5L2SA 2E9NA 4YURA 3EYHA 3BRBA 5IISA 3EQIA 3I0OA 3KXMA 3P79A 3TTJA 3LM0A 2HWOA 5FRIA 3GC8A 4D2WA 4FIEA 4EJ7A 3IGGA 3ZDUA 2GHMA 5M44A 4QNYA 5DEYA 5E8TA 3DAKA 3PVWA 2PVHA 4BCOA 1BX6A 2XMYA 3W2OA 3E87A 4AW0A 5CSPA 5CAOA 2Q0NA 2UZBA 2WNTA 3NDMA 3DCVA 3G6HA 2CGWA 4PMSA 3HP5A 5J5TA 4DH3A 3MIAA 3ORNA 4S34A 2QD9A 3V5JA 3ODYX 4TT7A 5J5SA 4FF8A 4OBQA 4ZTRA 4JBQA 2PUUA 5L2QA 2OFVA 5L8KA 3UVQA 2YABA 3JS2A 3EJ1A 3H9FA 4EHEA 3BEGA 3AMYA 4EEVA 3H9RA 4FTCA 4N6ZA 4GH2A 4F7LA 4LL0A 4RC2A 1QMZA 3ODZX 4BRXA 4C7TA 3F5XA 3VS3A 4EL9A 4P90A 4CYJA 2YEXA 4BIBA 4F9AA 2RIOA 2IG7A 2BDJA 5HGIA 4F6UA 1OECA 3IS5A 3FI8A 4EUTA 5JSMA 3UGCA 4I24A 5CT0A 2WAJA 5D9HA 4USEA 5JFWA 2BZKB 2YM4A 4EOSA 3VBQA 2XNOA 1RQQA 4HW7A 4LM5A 3ZFXA 3MWUA 3LFBA 3JVRA 1ZRZA 2JD5A 3L8XA 4XG8A 4AF3A 3NCZA 3WZUA 4BIEA 4EH3A 2CDZA 3SKCA 4YO6A 3OT3A 1PXPA 5LARA 3QUDA 3U55A 3PXRA 3SXSA 5CF5A 5M4FA 3HYHA 4WT6A 4ZZMA 4BZDA 2QR7A 4CG9A 5T68A 2Y9QA 3PIZA 3AXWA 3G33A 3FPMA 3BWJA 4MNEA 2CGUA 3IDCA 2WO6A 2G2HA 2R5TA 5GNKA 2OF2A 3Q6WA 3DLZA 4O22A 2YJSA 2C30A 3Q4ZA 3CGFA 4NIFA 2WOUA 4NZWB 4WG5A 4CV9A 4UN0C 5HCXA 5M55A 3CQUA 5CANA 3B8RA 5CEIA 2AUHA 3OUKA 2C6EA 4XG6A 3EOCA 4DEBA 2R3RA 3Q5ZA 4AP7A 3VC4A 4WOVA 2C69A 5FXQA 1GIIA 4S2ZA 3NS9A 4ZY6A 1H8FA 3E93A 5I9UA 5TOZA 4AT3A 1B39A 3EQRA 3P7BA 4MXXA 2YCRA 3GCUA 3TZ9A 2YCSA 5M09A 3LFCA 3D14A 4EBWA 2XA4A 4IADA 4NJ3A 4PMPA 2XK6A 2YCFA 4DFXE 5FLFA 2QODA 3HECA 3RWPA 3ANRA 2C4GA 5AX9A 4DLJA 3LXKA 5AR7A 5IA1A 3OCSA 5AR4A 2JIVA 3RHKA 4QMQA 5CF6A 2JBPA 3PWYA 4J8NA 2RG5A 3MI9A 3TDWA 2F7EE 1GJOA 3KVXA 4DGGA 5LXMA 5KHWA 3I6WA 3GC9A 4PL5A 2GQGA 5DEWA 3EH9A 2XBJA 1Q3DA 3R02A 3WF7A 4XMOA 3KXGA 4AU8A 3TUBA 5LMKA 4W8EA 4W9WA 4AXAA 3B2WA 4JOAA 5AM7A 3SQQA 4HVSA 4I23A 3R2BA 5IF1A 3D7ZA 4IDVA 3NVMB 3KRRA 3G9LX 4YP8A 4MQ1A 3UOKA 3G51A 3KN6A 3PTGA 4WG4A 2A0CX 1IAJA 2XYUA 2RSVA 1J7IA 3II5A 3IKAA 4EH8A 5EYKA 4DH5A 3VNTA 4F9YA 3MFSA 2GQRA 3C0GA 3DQWA 3QUPA 4IX5A 4H3PA 3R9DA 4PUZA 4H3BA 4C4IA 3IK3A 2QOQA 2QCSA 5CEMA 4CXAA 4FKUA 3FQEA 4A4LA 3D7TB 4PDPA 3QBNA 3VRZA 5KMOA 2XKEA 3R04A 4ACGA 5DLSA 4MD7E 2GFCA 5CYIA 3MPTA 1Y57A 5IA0A 1MRVA 4FEXA 4D2PA 5CF4A 2VUWA 4GEOA 4WKQA 4EC9A 4NSTA 4G3CA 5KUPA 5CAUA 1J7UA 3KREA 4D58A 4RVTA 3U51A 3ZUUA 1HOWA 3GXLA 3SDJA 4O6LA 2HZIA 2QLQA 2RL5A 4E5BA 3OEZA 4ITHA 3LAUA 1A9UA 4FTRA 2EB2A 3BWFA 5CSXA 2FVDA 1W7HA 1PRYA 2IPXA 4HCVA 2YERA 3ZO3A 2C6TA 4DG2E 4NK9A 3PLAE 2X8DA 4JR3A 2XIXA 4Y5HA 4YR8A 4IAFA 2W1HA 5JT2A 3N4UA 3EL8A 4M14A 2FH9A 3GB2A 5L2TA 5IH6A 4E73A 4H58A 2GNIA 5J9YA 1GIJA 4D2VA 2UW5A 5K5XA 2XNGA 2VO3A 3ELJA 3OCGA 3BU3A 2C0TA 3QQKA 4UWYA 3KGAA 1Z5MA 2I0HA 1KV2A 2BVAA 1YOJA 2YFXA 3FLQA 5HHWA 4CFVA 2OH4A 4WNPA 5LOHA 1UNLA 2WOTA 4JRNA 4CMTA 3EN7A 3P4KA 4NUSA 5AIKA 4FL1A 4FA2A 5CXZA 2ZJWA 4BZNA 5AEPA 3GUBA 2JKMA 3GU6A 4FIIA 4O7RA 2YJRA 3HL7A 4HGEA 4KRDA 2IW9A 2ITVA 3RPOA 2BMCA 3TEIA 2XCHA 4RWIA 3KC3A 4F70A 4D4YA 3VAPA 2VU3A 4LGGA 3OROA 3HV3A 3ULZA 2V55A 4D2TA 4NTSA 4DGMA 3R7OA 3FY2A 3BHVA 3D2KA 4E6DA 4BBMA 5CY3A 3UODA 3C0HA 3NX8A 4PL3A 3LIJA 4EKKA 5CI7A 4AN2A 3KRJA 5JEBA 5C4KA 2YIYA 4NWMA 3FLSA 3MPAA 4N4SA 1V0OA 4PDYA 2EXCX 3O7LD 3S1HA 4PNIA 1KOAA 3HV4A 4WG3A 5ACBC 2OFUA 2CGVA 2YDKA 3P9JA 4O2PA 3QZGA 3D5WA 2Z7SA 5CALA 1OZ1A 4MTAA 3ORPA 2PVKA 3OWPA 3VO3A 2IN6A 2R3MA 3ETAA 4I5MA 4AQCA 4MNFA 4EH4A 4O82A 2ZAZA 4G3GA 4KRCA 1U5RA 5AA8A 5B2KA 4BIDA 2GMXA 5HTIA 4CFUA 3P78A 1JNKA 2VTSA 1JKSA 4JG8A 4FOCA 3TL8A 4AA0A 5IMXA 3FMEA 2BTSA 1Q8TA 3RBWA 4DLIA 5AR8A 2W1FA 3AMAA 2A2AA 4WNMA 4DTKA 2IZUA 4Y8DA 4OBPA 4HNFA 2XK3A 4D4SA 3UP7A 3DFCB 5BVWA 3VQHA 2XIRA 5ETIA 4CZYB 3OY3A 3ZM9A 3CC6A 4WUNA 2JLDA 4RZVA 4NEUA 3E3PA 2WU6A 5HIBA 3G15A 4BDJA 4IFGA 5H8GA 4JS8A 4TRLA 3C4XA 3DPKA 4P2KA 4ERKA 3EQDA 1Q3WA 1H25A 3ZO1A 3ZOSA 1UWJA 4IH8A 2UZUE 2YHVA 4IE9A 1JSTA 3EL7A 1HCLA 3H4JA 3D9VA 1M52A 2C3KA 4FSUA 3VUMA 4GKIA 4JG6A 1J3HA 2VTPA 2CKEA 3P08A 4JAJA 5IG1A 2ZYBA 5JKGA 2X39A 2PVJA 2FB8A 4BTFA 4ACCA 3QHRA 3RZBA 2HZNA 2PVLA 1M2QA 1E1XA 3D2IA 3QRKA 3VUKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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