4IX4A

Crystal structure of a stt7 homolog from micromonas algae in complex with adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
LKARGGPKTLRRTPGVEPKDIRVLPGPLGSGNFGTVFRGVFKGDQDVVLKNAKADVMAAEELLECEMDVNYHVHANAKGTCARFMGCIELGAKDGGEIYNGTLTEGLWLMWANEGENTVEALMRRGTAPLATAMACADATELGVTKKAMRELLGSLARLHECGVVHRDVKPANLIAAEKDGGVLKLIDLGAAALCLPLPETLNYYPGDGPADPRYAKADELYLLPPGSPRPTKDNAAKLWEAHKPDRFDSWSAGCVMLQLAVVGLRTDAGLERFLADYKAVGYDVNAFRGEKSGEYGTMDFAALDANGGAGWDLCQRLMEAERDARASCEAALSHAFFDAAALEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the catalytic domain of a state transition kinase homolog from Micromonas algae
pubmed doi rcsb
molecule keywords MsStt7d protein
molecule tags Transferase
source organism Micromonas
total genus 105
structure length 346
sequence length 346
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ix4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ix4A01
2OFVA 2C6DA 3OG7A 3PE1A 4DBNA 3O17A 4EQUA 2RFEA 3QQFA 2XA4A 4FMQA 2QU5A 1AGWA 4NKAA 3R7UA 4BFMA 3VIDA 3IGOA 3A99A 4RLKA 3CEKA 5FGKA 3IW7A 2DS1A 3QQHA 2X81A 4KS8A 4JQ7A 4O0VA 2X39A 3UIBA 3PIYA 4ANOA 4UYNA 3RWPA 3KF7A 4EYJA 1E1VA 2WQBA 3VUKA 5CSHA 2ETKA 1WBSA 5HLWA 2C68A 2YLEA 3BV3A 4U3YA 4C4JA 2ETRA 2UZVA 3M11A 3FYKX 5KZ0A 1MRVA 4MD9E 2C6TA 4F08A 1WBNA 1KE8A 1OBDA 3LCKA 3QHWA 4FTUA 2X2LA 4CXAA 4E5AX 4JAJA 5IH6A 2YIRA 5TF9A 2XBAA 2GPHA 3EL8A 2IVTA 3NGAA 4IXPA 4BCGA 2W1EA 3TL8A 4E3CA 3EYHA 4TTHB 3D7ZA 4PL4A 1U54B 4IB3A 3VC4A 2QOHA 3SA0A 4QYHA 1OITA 2C0OA 2BRBA 1Z57A 3SXSA 2Y6OA 2HYYA 2Z60A 1TQPA 4D1SA 2ITWA 2ZVAA 3FEGA 2I1MA 4DG3E 2X6EA 3EQPA 1OGUA 3Q3BA 5GJGA 3EKKA 1STCE 4CMUA 5J9YA 4NFMA 3DBCA 3RKBA 3BEGA 2XNMA 3KRJA 1NT2A 5HE2A 4G16A 3FV8A 3RHXA 3W18A 3QTXA 4YBJA 4I22A 3F5XA 2XM9A 3MPTA 2XUUA 5AUXA 3ELJA 2GNJA 3L8PA 4FGRA 5JFXA 2X9EA 2XK4A 3ALOA 5HLPA 3HRCA 3DBDA 5CVGA 4CD0A 4DYMA 4F09A 1YXTA 2C4GA 4BCFA 3W32A 3CBLA 2O8YA 2JAVA 1SZMA 5KKRB 4W4YA 5C03A 4G9RA 3EFJA 4FC0A 4FUXA 2C5XA 4ZTNA 5HI2A 5JQ8A 4GKIA 3G6HA 3ULZA 2F2UA 3IDPA 4CSVA 5A14A 3CTHA 4IAZA 1XBCA 3T8OA 4NT4A 3DAKA 5KBRA 3FZSA 5ANGA 3SQQA 3V5LA 4PUZA 1SNXA 1Q99A 2GTMA 4PWNA 4AE9A 4KIQA 5FD2A 4EH6A 5M08A 2E9VA 3MI9A 3U4WA 2NO3A 2WTDA 3LMHA 2ZM3A 2XIYA 3Q9YA 1VR2A 4BCKA 3IS5A 2YIQA 4IVDA 3V3VA 3V5WA 4A9YA 3ZDIA 4I41A 2ZM1A 2X7GA 2QOFA 3QUEA 5F4NA 3DJ5A 1BL7A 2GNIA 2I0EA 3KXHA 5EQEA 5IUGA 5KO1A 4Y83A 1MRUA 2QQ7A 2VWWA 2B55A 3BYOA 4YHTA 4FV8A 4D4SA 2WXVA 4TWPA 4XBRA 3WF6A 4DAWA 1Y8YA 4C2VA 3QA0A 2DYLA 1QCFA 4CTCA 4E1ZA 4F4PA 4UYAA 2OIQA 3CPCA 3DKFA 3FKLA 3NDMA 3C13A 3R7VA 3RNIA 3TDWA 5EHLA 3PXZA 4RVKA 2B52A 4AZTA 4NJDA 1KOBA 2JBOA 1KE5A 2GMXA 3C51A 1Q97A 3TCPA 4EOMA 3R1QA 2CSNA 5CLPA 2FSTX 4K33A 4F65A 2QCSA 2J5EA 5BYZA 4AGWA 3OBJA 2EVAA 4AZEA 2BRHA 5KX8A 4IB5A 3FMJA 2PMNX 4RIXA 4N70A 3HUCA 5K5NA 4RZWA 4O0WA 3VRZA 4DLIA 2WQNA 4FYOA 2WTKB 1REKA 2XVDA 2YN8A 2Z7QA 5AUZA 4PMMA 4I93A 2IW8A 4BBMA 4ZTMA 5IQEA 2IN6A 2CGWA 2J0JA 4YZCA 5DVRA 2OXYA 1CDKA 4YLJA 3VF9A 2X7OA 1OZ1A 3A8WA 1GZKA 4GT3A 4IACA 5CQUA 3AC8A 4PQNA 4DGNA 4M14A 4QMPA 3BI6A 4BCQA 2PVKA 3QKLA 4IWPA 4U8ZA 3JR1A 4IAFA 3V6SA 4AT4A 5ETIA 3R01A 3VBYA 5T6KA 3BLQA 3ZUTA 2A2AA 3BE2A 3O7LD 3ZSIA 5IQIA 3CY3A 4HYSA 2PUPA 1DS5A 1GJOA 3DGKA 4XP3A 4EEVA 4ITIA 5JZJA 4DBXA 3E8DA 3OF0A 4FK3A 1B38A 4KSQA 1LEWA 4UY9A 4ZS0A 2WD1A 4FT3A 5DGZA 5DT4A 4K77A 3TUCA 4DN5A 5L4QA 1DAYA 4F6UA 3ZBFA 4BWKA 1WFCA 4D9TA 3BHTA 3K2LA 1YKRA 3P7AA 4FR4A 4ZJJA 4EI4A 4RWJA 2VGPA 5HLNA 2BAKA 2PMLX 3Q2MA 4GUBA 3BHVA 3CPBA 4X0MA 5IH4A 5HBEA 1Q24A 3TDVA 5CF8A 4FNYA 2ITTA 2OH4A 4FOCA 2JLDA 3QTQA 2DUVA 5HBJA 3KXMA 1BI7A 2VO7A 5CVFA 4GFGA 4WSQA 4BDAA 2IWIA 1XH8A 5FBOA 2ESMA 2V55A 5DHJA 3BQCA 1XH7A 3E63A 4PDSA 5BVEA 4EOQA 5AIRA 3LPBA 4EHEA 4KUJA 4CFNA 1FMKA 4QT1A 4QTDA 4G6LA 3PY3A 3TTIA 2WMQA 3P86A 4FZ6A 3MFTA 4O0SA 2HWPA 5FM3A 5I9YA 2J5FA 1ZAOA 3UVPA 3D0EA 5M53A 5F9EA 5E7RA 4KD1A 4NCTA 3ORXA 3VQUA 1ND4A 1T45A 3T3VA 1Q5KA 1Y8GA 3LCDA 4YJNA 1GZNA 2PE0A 3OP5A 4HVHA 2WB8A 4A4OA 2YM4A 3O96A 4E8AA 2UZUE 5AUWA 4EHZA 5L3AA 1H07A 4QMVA 5AM6A 4X2KA 4O81A 3V51A 1FMOE 3FZRA 4BL1A 2G1TA 3EOCA 4G3GA 5H8GA 5AX3A 2W1CA 1QMZA 2IVVA 4FV7A 3F69A 5DFPA 3C4FA 4FKLA 1V0BA 3REPA 2RFNA 1O6LA 2V7OA 3M1SA 4O7TA 4H3PA 3UTOA 3DV3A 4QPAA 1OMWA 4BCPA 3S2PA 4DH3A 4CZUA 1ZWSA 4E26A 4PPCA 3A7FA 2HELA 4M0YA 4RT7A 4WNPA 4ASZA 4BI2A 5CU2A 4KIOA 3GNIB 1K9AA 4M7IA 3FLZA 4BCJA 2BZKB 5IA1A 3R2BA 2YACA 4QTCA 4RJ5A 3ZBXA 3OEFX 3S4QA 2NRYA 4YC6A 2C0TA 3QQGA 1V0OA 3TZMA 3T9TA 2OJFE 3ZZWA 4E6AA 4QO9A 4XBUA 3VUMA 3SX9A 2F7ZE 4ZLYA 3DK7A 1PRYA 1OIYA 1P4FA 2VO3A 4NJ3A 3JY0A 3MN3A 4E5BA 2QHMA 2VN9A 4G6NA 3LLAA 2RFDA 4AGDA 3ZEPA 1JKTA 4NH1A 3DJ7A 4A07A 3ZXTA 3LKMA 1MRYA 1UNHA 2G2FA 4TYGA 4IX4A 3R8ZA 3R22A 4GU6A 4N6ZA 4W8EA 4YR8A 3DKGA 4BKJA 2OSCA 4BZOA 3TNPC 4GYGA 1BI8A 3R00A 5HE0A 4UZHA 2GS7A 5EW9A 4PTEA 3TXOA 4H39A 2BZJA 4BF2A 1WBWA 4D2PA 5EHOA 4IWDA 4EOIA 3SHEA 2PHKA 4TPTA 5EI6A 1NVRA 4PRJA 3HAMA 3PPKA 1ZY5A 4YPDA 3V5JA 3II5A 4QMWA 2ITPA 3DK3A 3BIZA 4EK5A 2IW9A 4XG9A 3M2WA 2OF2A 4GG5A 4M3QA 4TW9A 3V01A 4IB1A 3NIZA 3VO3A 4WG5A 3BV2A 3NUXA 1WVWA 4ENYA 4ZSLA 5AIKA 1BKXA 4PDOA 3WOWA 1PJKA 4II5A 5J95A 5GIPE 3FQHA 3FYJX 4CCUA 4O7NA 2F2CB 4I3ZA 5J1WA 3MPAA 5CZIA 4BYJA 2UW7A 4KKGA 2JKQA 3LVPA 4NZWB 4ZTLA 2R9SA 4FT5A 3UC3A 4CRSA 1YDSE 3GOPA 1H4LA 3I7BA 4WKQA 5ANJA 4ANSA 3HV5A 2OICA 3IW5A 3ETAA 3KY2A 4TYHB 2OJJA 4FZAB 2IW6A 4TWNA 2OXXA 5AUVA 3Q9ZA 4ZY6A 4AOTA 5C4LA 3F3ZA 4RBLA 5TR6A 4FKPA 3R21A 2ZV8A 3KVWA 4A9UA 3M42A 4LG4A 5ANDA 4WRSA 3UOHA 2WMWA 5L2WA 4O7WA 3W8QA 3IDBA 5ACKA 2X8DA 1J7UA 2JBPA 2VD5A 3ZO4A 4Y5QA 2JIIA 4KBKA 3WZEA 2JKOA 4YC3A 4IB0A 2VTOA 2RL5A 2WO6A 2BKKA 3ITZA 3V8TA 2QKWB 3N4TA 4YJVA 1ZZLA 2C3IB 2YM8A 1WBOA 3R0TA 5TOZA 3NVKI 4C3FA 1BYGA 4I20A 3UG2A 4YSMA 2BILB 2OJGA 4FSTA 4H3BA 4OTRA 4XJ0A 2CLXA 3F2NA 3NW7A 4F63A 4FV1A 4LV5A 3AC4A 3FLSA 4B6LA 3Q9XA 4B8LA 2XK3A 2CN5A 3A7JA 5HQ0A 4XH6A 5EYCA 2OF4A 4QMYA 3D14A 3E93A 3COHA 3Q52A 1M7QA 1PY5A 2PZRA 3RAIA 3LFDA 4FNZA 2R64A 4FTAA 4V0GB 5AP7A 5BVDA 3SW7A 3DNEA 4Y5HA 1OIQA 4L43A 3HECA 2HXLA 3BEAA 3C0GA 4Q2AA 2C6EA 4H58A 4QMLA 4EK8A 3QGYA 3UE4A 4G17A 4NW6A 3VUTA 5HIEA 5M09A 3Q32A 4XG2A 3SV0A 4ZS4A 1OPJA 2XNNA 1APME 4RIYA 3FMLA 4YTHA 4QOXA 1ZY4A 3BHHA 2PVRA 4I21A 4ACMA 4L8MA 3R83A 2WOTA 4NEUA 4FT9A 4CYIA 4NU1A 5IEYA 3QCQA 2YJSA 4LOQA 4ASXA 5ICPA 5FDXA 3HMOA 2XK7A 2WMUA 5CANA 4UZDA 5DN3A 4ZZMA 2VTTA 2Z8CA 4KRDA 5CF5A 5EOLA 2CKOA 2UZNA 3PP0A 2OZAB 2E9OA 2YIYA 4E4MA 2YISA 4PL5A 4Y73A 2J50A 3K5UA 4H3QA 3NVMB 2YM6A 3ATTA 4FG8A 3WE8A 3UO4A 3ORMA 5IPJA 5J7BA 4QQJA 5IQAA 1R39A 3FMHA 5M4UA 3MA6A 3BGZA 4I6HA 2XNEA 3PPZA 5ACBC 4BHZA 1WVXA 2OWBA 5IA2A 3UZTA 3EQIA 2PMIA 3NWWA 5FXSA 4PTGA 2UW3A 3PA3A 3DBFA 3TZ8A 3R04A 4RWLA 2UW0A 3SG9A 1DI8A 5KZIA 3RNYA 1URCA 1X8BA 2F7XE 3QTIA 4TYEA 3QRTA 4I6BA 5BVNA 3AMAA 4IJPA 4B99A 3KREA 4FICA 2HAKA 4JOAA 4NTTA 2YEXA 1J7LA 1UU7A 4NCTC 2B53A 1AD5A 3Q9WA 4FODA 1JSTA 3QX4A 3DU8A 4FKSA 4C37A 1RQQA 1AQ1A 2E9PA 1NA7A 1V1KA 3CD8A 4HVSA 1OVEA 4FTKA 4OBPA 3B2TA 3UDBA 1R0PA 2QI8A 5EDRA 4S2ZA 5AP5A 4RIWB 4ZIMA 4JJRA 3H4JA 2OU7A 2VTQA 4WBBB 3I7CA 1O6KA 3COKA 5A4LA 5M07A 2BAQA 4ZJVA 4CNHA 2I40A 5AADA 4HPUE 3G0EA 4I5MA 2B9HA 2ITXA 3T3UA 4UMUA 5LOHA 3E7VA 4RJ8A 1M2QA 3LJ1A 2QOQA 1QPJA 2F49A 3MBLA 3ZYAA 3Q6WA 2AC5A 2OK1A 3G90X 3JUHA 5DR2A 3UOJA 4O6LA 5HO8A 5HESA 4AP7A 4D2WA 3TNQB 3UNJA 2BHEA 2ZV9A 1PYXA 3VS4A 4DGMA 3TNWA 2ZDTA 4L46A 1BX6A 1YOLA 5IA0A 3CXWA 1G3NA 4BZDA 4YUQA 1GNGA 4HGTA 5JGBA 4GK4A 5DLSA 3THBA 1MQBA 4GUEA 1Q8WA 3DFAA 2F9GA 3KU2A 5JRSA 3NYNA 5JK3A 4BGHA 2CKPA 3NNUA 3C5IA 4IWOA 4HCUA 5D41A 4FV2A 4XHKB 5BMMA 3HKOA 3RPVA 4CFXA 3QCXA 3IDCA 2J0IA 3W16A 4J8MA 2ETMA 2WFYA 4FVQA 2H8HA 1SVEA 5CTPA 2CHLA 2VU3A 3HRBA 1ZRZA 4BTMA 1BL6A 5IQGA 1KWPA 3BYSA 3OXIA 4K9YA 4AUAA 4YLKA 4WD5A 4TT7A 3ORZA 4KS7A 2W96B 2P2HA 3C5UA 1M7NA 2XCKA 3HUBA 4IIRA 1T46A 3N51A 2PE2A 4FKIA 4MBJA 4A7CA 5L2SA 4QMTA 1U59A 3OROA 3R9DA 4OT6A 4ZTHA 3FJQE 5L6WL 4O0YA 5AP4A 3LXNA 3MVHA 4WUAA 5E90A 3OUKA 5F95A 2H96A 4FI1A 4C0TA 2IPXA 3GU7A 4HGLA 4L7FA 2WQOA 3OXTA 3CKXA 1YHVA 1FVVA 3R7EA 3QALE 3RVGA 2J4ZA 2PVYA 4AGUA 4AW5A 4UV0A 2W0JA 1PXNA 5CAUA 2C5VA 2X8IA 3QYWA 5KMLA 1XH6A 2FVDA 3GGFA 2HK5A 5E8WA 3DOGA 2C6LA 4CFVA 1YXVA 4FUYA 1YWVA 3PFQA 5DR9A 4HZSA 4AT3A 3EKNA 3NUPA 3L1SA 4L3LA 2ITYA 4UEUA 3ULIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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