4J1RA

Crystal structure of gsk3b in complex with inhibitor 15r
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
348
structure length
343
Chain Sequence
KVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Fragment-based approach using diversity-oriented synthesis yields a GSK3b inhibitor
rcsb
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 343
sequence length 348
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4j1rA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4j1rA01
3E5AA 4BCOA 3RNYA 3SG8A 2QO7A 4D1ZA 2Z7SA 3AG9A 4DEDA 3BHHA 2VTSA 2W1EA 2ZOQA 3PPJA 4IH8A 4EQMA 4WUNA 3F3TA 5EH0A 4FV3A 4H58A 3LCTA 1STCE 5AP7A 2V0DA 3FPQA 1FVVA 3FMMA 3QUDA 3KXNA 2R3RA 4ID7A 3RP9A 3EQPA 1T46A 3D5WA 3VRYA 1LPUA 3G51A 4QPSA 2B9HA 1DAWA 1REJA 3E92A 4XNEA 4ZZMA 3TG1A 2UZOA 1H07A 2RFEA 3CY2A 4MH7A 4JT3A 4RJ3A 5AEPA 3WILA 3RGFA 3UBDA 2YM7A 5CNNA 2E9NA 3MPTA 3Q4ZA 4NM7A 5C8NA 3NX8A 4S30A 4N57A 2VX3A 2WU7A 4W4XA 3UIBA 2C5XA 5FWKK 4JR3A 4QPAA 4M84A 3HV3A 2C5VA 2CNVA 4G3CA 4LFIA 3G0FA 3QD2B 2QR7A 2X81A 5ETCA 4FV9A 2JAMA 3ATTA 4H3QA 4OAVB 2YN8A 3LIJA 3NUUA 1M2PA 4NM0A 3LFSA 3FI8A 3E87A 2W99B 3UP2A 3EFWA 3KMMA 2PULA 2VWZA 4YHJA 4W4WA 3NUXA 2ZV9A 4Y95A 3DB6A 2EB3A 3ACKA 3EFLA 4IX3A 1DS5A 5B2MA 4AGUA 4IAFA 4RLLA 4XV9A 4FICA 3OP5A 4ZTLA 3OS3A 4WT6A 4ANLA 3RWQA 3UOKA 4R7BA 3T9IA 4DH3A 3EKKA 2O5KA 5HG8A 2R4BA 2IZSA 1RE8A 3WYYA 5CU0A 2YZLA 4CCUA 4K18A 4XBUA 3LHJA 3C4FA 1DAYA 3F2NA 4FTJA 3HA6A 4F0FA 5AUTA 3O50A 1OBDA 4BDGA 2QD9A 2VWBA 1APME 3RHXA 2WZJA 4OTDA 1OPKA 3DQWA 3IQ7A 2F57A 3F3UA 3FV8A 3UYSA 3BEAA 5AMNA 4WNMA 5AAEA 4KS8A 1OECA 1ZMVA 3A7GA 4IDTA 4PMTA 4U6RA 5KKRB 3RK5A 5FEEA 1OKVA 3R1QA 4IJPA 4FEQA 4W9XA 4YHFA 1SNXA 1XH6A 4B9DA 2OJFE 3E8NA 3OEFX 2IWIA 4OBOA 4WNOA 2QNJA 3O23A 4HNIA 3CXWA 5FXQA 3L1SA 4RIXB 5EM8A 3PVUA 4GG5A 2OZAA 4C58A 1RJBA 5LMAA 4DFLA 2GS2A 3BU6A 4TTHB 5GIOE 4AE9A 5HVJA 2YISA 3CC6A 3TV7A 4AGDA 3IK3A 3V3VA 1XH4A 2EB2A 2UZVA 2HYYA 3DOGA 4WIHA 4C35A 1KE6A 3WYXA 1HOWA 4AW5A 4M69B 1YHWA 2C4GA 4R7IA 4QMYA 3HDMA 5M4IA 3R8VA 4PPCA 4FL3A 2PVFA 4XRLA 4TWCA 3T3VA 5FTGA 2WTDA 5JQ5A 2FSOX 3P08A 4HYIA 3LMHA 3F3VA 2WELA 3GFEA 2O65A 4I5PA 5ANOA 3FSFA 2YWPA 4OUCA 3RPVA 4EYMA 4HVDA 4BDIA 2QHMA 3U4WA 2ZV8A 1U5RA 3U87A 3QWJA 4IANA 5D7AA 5CVHA 2WMVA 2YABA 2BTSA 3QC4A 4FTAA 1H0VA 2YJSA 4M67A 4RQVA 5E8WA 4BI1A 1XWSA 4BKZA 4CTCA 5K0XA 3NVKI 2A0CX 3HECA 4YJOA 4DC2A 3WBLA 3D7TA 2E9UA 2YAAA 3Q9WA 4LG4A 4ZSLA 5KNJA 4IX5A 5AAFA 3PFQA 4EWQA 2YJRA 4UMPA 4XOZA 4CRSA 2XVDA 4MX9A 4I94A 4YTCA 2QG7A 4IVDA 5JK3A 4YLJA 1G5SA 5C9CA 4RSSA 4XP3A 4E6DA 2R7BA 4J8NA 3PIYA 2ITWA 4J96A 2HK5A 1ZYCA 2UZTA 3C13A 3LCKA 4K77A 4QP1A 4C37A 1M7QA 4O7VA 1YXUA 1PKDA 5IMEA 2HXQA 4QNAA 2OLCA 3UODA 4P4CA 3LMIA 3DNDA 2WPAA 3BBTB 3QKLA 3S2PA 3WF8A 1XH7A 3RMFA 1M2QA 4X3FC 3RAIA 4EOJA 3SQQA 1WBSA 2RFDA 4MQ2A 1NVQA 3MVHA 2Z7LA 3T3UA 1LP4A 3TZMA 1GZ8A 4ZTNA 2V55A 1ZXEA 5CZHA 3F9NA 4YJUA 3DTWA 4DBNA 5I9WA 4CRLA 3BHYA 4O7YA 2C6MA 2WMTA 3OUKA 4MQ1A 1YDTE 5K4JA 3BU3A 3GNIB 2QOOA 5HNIX 4FYNA 4YBJA 1FBNA 5JQ8A 4I24A 4AA0A 4BYIA 1AD5A 2PZ5A 2QOFA 3FLNC 4RIYA 1XH8A 4NKSA 2JIIA 4XYFA 4E93A 4B0GA 4DF3A 3CJGA 4MF1A 3DNEA 4RX9A 3PY1A 2I6LA 4RQKA 5E92A 5AR7A 2OXYA 3ZHPC 3QXPA 1J7UA 2OJIA 5BNJA 1NA7A 3MVMA 2VRXA 4DFBA 3RNIA 2YA9A 2O8YA 3H3CA 4Y83A 4YNOA 4ZSAA 5E91A 3NNVA 4ZTMA 2OICA 5CEKA 3UNKA 2CN5A 2F4JA 5DBXA 2G2HA 3A99A 2YITA 4ZIMA 3ZZEA 1G8AA 4NT4A 2ZMCA 3COMA 2R3LA 3ATSA 3QZHA 2B4SB 5EG3A 5FP6A 3QUEA 3SDJA 5A54A 4DA5A 4RGJA 3PPZA 4FK3A 3N4TA 1KE9A 2R64A 3LXNA 3FZOA 4K2RA 4L01A 4J52A 4RIOA 3QTIA 5TKDA 5BVDA 3ORXA 2UVXA 2YAKA 3KXXA 4F1MA 5IA1A 5DT4A 2ZDTA 4EJ7A 5IQGA 2C5NA 5FDPA 3N4UA 5HOAA 3ZM9A 5HG7A 3MI9A 5A46A 4JDIA 5CLPA 5CAOA 3R00A 5DWRA 1F3MC 1H27A 3G9LX 4ENXA 3Q4TA 2Q0NA 2R3KA 3EQIA 4DINA 4KSPA 3G2FA 5BMSA 4GRBA 5EI2A 5BPYA 4KIOA 1Z57A 2WMQA 2G15A 1GIHA 1ERKA 3EQDA 4L6QA 3C5UA 4LL0A 2ZYBA 4H05A 3R2YA 5IU2A 1M52A 2EWAA 4BBEA 5DVRA 5ITAA 4PQNA 3SKCA 4GG7A 3P1AA 4TXCA 2DYLA 5AX3A 3W55A 4YP8A 4ANSA 4ORKA 4GV1A 4QMSA 1PXPA 2Y4IC 3AMYA 1OL1A 4D9UA 5E7RA 5FEQA 4FSRA 3GC9A 5AR3A 3C5IA 4QMQA 4M14A 4U43A 3E8DA 1YKRA 4FTMA 3ORKA 5HGIA 5IKWA 3U9CA 3UP7A 2QLQA 4EONA 4TL0A 4DGMA 4EH8A 4MYGA 5KCVA 2W5BA 3UJGA 3V5PA 2OH0E 3WIKA 2C47A 3L8SA 2OZAB 4HYHA 5KBQA 4HYUA 1BUHA 1G3NA 3AC5A 3FZSA 4YPSA 5J1VA 2PYWA 2IW9A 3NUSA 1PY5A 3PXFA 4PL5A 5CVGA 5FTQA 5AIKA 3R8MA 4AW2A 4LRMA 4KIPA 1Y8YA 4BIBA 3EFKA 5IQIA 4S32A 4UWCA 2A19B 4FSQA 3H4JA 2C3LA 2QOCA 4L7FA 4EHGA 5KZIA 4FV2A 4GUBA 4ZS0A 4BBMA 2C69A 4O1PA 2FB8A 1KOAA 3TZ9A 1X8BA 3IKAA 4TYGA 2JGZA 4RMZA 4I0RA 1OL7A 2HW7A 4XS2A 1Q8YA 3GU8A 4R1YA 4UYNA 3R30A 3DB8A 2C6DA 2EU9A 3E3BX 3LCOA 4O21A 5AP4A 3VHKA 2WNTA 2XZSA 3TZ8A 5M08A 1KSWA 4RA5A 2QOBA 3NNUA 4WOVA 3D5UA 5JGBA 4Z16A 4FIJA 4IB5A 4JL9A 4PV0A 4EHZA 3ORPA 5DEWA 4A9RA 2W4JA 4H1JA 3FMLA 4CV9A 3R7YA 2OFVA 5C27A 3WI6A 2A1AB 2X6DA 3F61A 4PWNA 4WHZA 4EK4A 4NL0A 2GS7A 3GOPA 4CZYB 4D9TA 1JKTA 2IG7A 4YSMA 5AUYA 3GU4A 4FT3A 4FKUA 4FNYA 3TIYA 1SNUA 4FKRA 3VRZA 5DEYA 2X4ZA 4GFGA 4N70A 3UQFA 2ERZE 3AMAA 4CV8A 3GI3A 4IWQA 5IDPA 3D7TB 3V6RA 3D4QA 2QI8A 3SRVA 5EM6A 4ERKA 3R2BA 4LV8A 2BZHB 4LUEA 2WMAA 2R0IA 2X8DA 4MWHA 3UO4A 4QMMA 4RFMA 4YZ9A 4DG2E 1OGUA 2YM8A 4XOYA 3RM6A 1YW2A 2OW3A 2X2LA 3FC1X 3HV5A 3VWAA 5K5XA 3S00A 1BKXA 2WQNA 3ORTA 2XMYA 1ATPE 4ANNA 3BBWA 4F64A 2X8IA 2X8EA 3DJ7A 3PE1A 4KKGA 4WBOA 3QGYA 2RG5A 3RWPA 2Z8CA 3MFRA 1P2AA 2PE2A 5BVWA 4EC8A 1ND4A 1ZZ2A 2IVTA 3BLHA 3OWPA 4YTFA 4FEUA 4FIHA 2P3GX 4EH9A 1O6KA 2JKMA 2O3PA 3C7QA 3C1XA 3RCJA 2VUWA 2XCKA 2ZM1A 3ZEWA 3IW4A 4D58A 5E90A 2YIWA 4OTPA 4HCVA 4RJ6A 4DGLC 3VS0A 2ITXA 2O0UA 2VTTA 3RK9A 4A9TA 4BCGA 4CFUA 4FV1A 4IM2A 3GU7A 3LXLA 2IO6A 5KZ0A 3SXFA 3FDNA 1WBTA 1OM1A 2BAKA 4FIFA 4AOJA 4JR7A 1M17A 3VNTA 4NTSA 4LI5A 3UQGA 3V04A 1J91A 1JQHA 3R0TA 2HOGA 4S2ZA 3QU0A 5A6OA 3NEWA 4RIYB 3G15A 4S34A 2XYNA 3JR1A 3UYTA 1IR3A 4JQ7A 3JVRA 4OR5A 2GCDA 3CQWA 4E5AX 1Q62A 2ETMA 2PVJA 3QQFA 1YI4A 5EDPA 5C26A 3K2LA 1UVRA 1PYEA 2JIVA 5KMIA 2OH4A 4CGAA 4QQCA 4BDHA 3QF9A 3ZLSA 1CDKA 2R9SA 1XBBA 3HLLA 4IB3A 5IEXA 1CKIA 3A4OX 3V5QA 3IG7A 4EYJA 3A4PA 4O1OA 3WZJA 1OIUA 2XK3A 3PE2A 2YM6A 5A14A 5AV1A 2J9MA 3CJFA 3F3ZA 3PA5A 1XH5A 2YDKA 5TOZA 2XKCA 3HUCA 1CSNA 2IN6A 2CLXA 2WTIA 2XIYA 4G6LA 4FIIA 3DKOA 4PPAA 4OGRA 2GNLA 3CGFA 4FTOA 3UIXA 4O7ZA 4M97A 2XBJA 1CMKE 4F4PA 2WAJA 5M4CA 2BTRA 2OGVA 1UU7A 2PK9A 3R9HA 4EZ3A 3K5VA 4LGHA 4V01A 3SXRA 4AGCA 5AUVA 3UZTA 2ITPA 4LV5A 3B8RA 3KB7A 4QTBA 2BRHA 4U97A 2XB7A 2YIQA 3VS7A 4P5QA 2VGPA 2C6OA 2RGPA 3KL8A 1IRKA 4ZTRA 2C3JA 4FVRA 5D7VA 4GT4A 4LQMA 1YXXA 4Y85A 5EYKA 2UW5A 4G31A 4JOAA 4AZFA 2BCJA 3QQLA 5AR8A 3ZO3A 1V0BA 2ZB0A 3IDBA 3QCYA 1Q41A 1ZOEA 4Z9LA 5IEYA 3AMBA 4IZ7A 5T3QA 3AC8A 3TT0A 3VUKA 1XJDA 4YLLA 1PXIA 5BYYA 2W9ZB 2Z7QA 4PMSA 5EYMA 3PWDA 1JBPE 2GTMA 4QYEA 4LRJA 4X3JA 5IEVA 2C1BA 3EOCA 3C0HA 4DTBA 1BI7A 1CTPE 3CP9A 5DMZA 3UG2A 4YJVA 3EYHA 3QCSA 3A60A 4GIHA 4R77A 2OBJA 3KRJA 2WU6A 4FKIA 3VBTA 4OBPA 4HVIA 3W8QA 3QRUA 1XO2B 3FZPA 1R78A 3KFAA 4AXAA 4K1BA 5DG5A 2ETRA 2V7OA 3UO5A 2YZAA 3V6SA 3NMUF 4UXLA 2XIRA 3KC3A 4CG9A 3PJCA 5CEQA 3FMDA 4UZDA 3EZVA 4U7ZA 4NZWB 5L2IA 3VBVA 3QWKA 1W98A 4U41A 3D94A 4Y5QA 3ZSIA 1G8SA 3WE8A 2ONLA 2JC6A 4DGGA 4DFXE 5IQBA 5EM7A 5L6OA 3UQCA 2W5HA 1RDQE 3DDQA 4BB4A 4FF8A 3R1SA 4NEUA 3ZC6A 2UZBA 2BILB 5AP6A 4EK8A 3PG1A 3K3IA 4GYIA 4A9UA 5JFXA 3JY0A 3GVUA 4ZZOA 1E1XA 3Q5ZA 5FQDC 4RWJA 2CDZA 2WIHA 4YTIA 2XM9A 1PXNA 2I0EA 3UVQA 2RFSA 3AT4A 5DYJA 4MXOA 3F7WA 4PTCA 3SV0A 3NW5A 4FI1A 1GY3A 1Y8GA 2C6TA 4G3EA 3ZFXA 4XX9A 4EKLA 4JDHA 3OW4A 3SRVB 4AW1A 4UX9A 5IUHA 4ACDA 4KSQA 4IEBA 2C6IA 2PPQA 4JG6A 4FMQA 3BYMA 1XHAA 1Z9XA 1UU9A 4D28A 5G6VA 3S1HA 4GFOA 4XHKB 4E20A 1MQ4A 3P7AA 4OTRA 4O84A 3P79A 4R7HA 3BYOA 3BE2A 4Q5EA 4C34A 2OJGA 2PUUA 5JFSA 2XH5A 4DG3E 3DJ6A 2X4FA 2WTJA 1R1WA 3QQGA 3R71A 4K6ZA 2IZRA 3VQUA 1OBGA 1WBWA 5CZIA 3NGAA 4RVKA 3R22A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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