4JBVA

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with inhibitor uw1268
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
463
structure length
458
Chain Sequence
AIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
publication title Development of potent and selective Plasmodium falciparum calcium-dependent protein kinase 4 (PfCDPK4) inhibitors that block the transmission of malaria to mosquitoes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
total genus 160
structure length 458
sequence length 463
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jbvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jbvA01
2Z7LA 5FM3A 2CNUA 4UWCA 2R9SA 3SVVA 3DU8A 4PQNA 3PRFA 4GK2A 3GQLA 3O2MA 4E4NA 4AUAA 1FGKA 3IW4A 3KRJA 4FIEA 4BBEA 2YM4A 5CXHA 5JEBA 4II5A 4KB8A 4IH8A 3L8VA 4E20A 5E90A 1NW1A 1GIHA 3CJGA 2YCQA 4X3FB 5CSVA 3QCYA 4O86A 5HQ0A 4N57A 1WBPA 1XQZA 2XP2A 2ZV2A 3R8LA 4M3QA 4I5MA 3TIYA 4XEYA 2XJ1A 4BCGA 3NUSA 1IG1A 2YM5A 5TF9A 5A14A 2C0OA 4F4PA 3O8PA 3PDTA 1ZXEA 3ZC6A 3QWJA 4B0GA 4UBAA 1PXIA 2W05A 2XCKA 4KIOA 3ID6C 2VTOA 1W0XC 1OITA 3MVMA 3PSCA 3QZHA 3FI2A 4I22A 4LOOA 4M13A 5D41A 2CN5A 3RAWA 1MQ4A 3V6RA 3EQCA 5HE2A 4NW6A 4Z3VA 2XK3A 4O81A 4L7FA 1Q3WA 4RRVA 4F1OA 4L44A 4OAUC 3RZFA 2J90A 5I9YA 3JY0A 4UXLA 4FUYA 5D7VA 3R9NA 2CNVA 3LLTA 4U42A 2SRCA 4AU8A 2CKOA 5L6PA 3BX5A 3R1SA 4QQ5A 4XG4A 3UBDA 5BNJA 5IPJA 4CFMA 4U5JA 4UYAA 3ZFYA 4JS8A 4I4EA 3FL5A 2ETKA 5JQ8A 5IEXA 3MY1A 5HZNA 5CEQA 3HA6A 4V05A 5HG9A 3KMWA 2ONLC 3PJ2A 4GT3A 4DE4A 3DZQA 5KO1A 4O2ZA 1KE8A 2B9JA 3KXXA 3ZH8A 4AOJA 3OVVA 2LGCA 5HNBA 4EJ7A 4PX6A 2C5VA 2YLEA 3OTUA 4BCMA 2VO3A 3R8MA 3UPZA 3RWQA 4CEGA 2WQEA 4FSUA 4RIYB 4BCPA 5JZNA 2CGVA 4GW8A 1H28A 2X6DA 4G17A 3JY9A 3HYHA 3ZLWA 3C4FA 3GQIA 1UU7A 2W1CA 3EFJA 4O91A 4ZMEA 3JYAA 3V5PA 1OKYA 4R5YA 5L2IA 4RA4A 2REIA 4OTDA 3E3BX 3DK7A 3LJ0A 4FE2A 5E4HA 3EN5A 4YBKA 3MIAA 4KS7A 4Y5QA 3I1AA 4GFGA 3FY2A 2F4JA 5L4QA 3UTOA 4TT7A 3W16A 4BBMA 4CV8A 3BI6A 5FEQA 3R9HA 4FV2A 1E1XA 4XCUA 2GHLA 3DBDA 4QPAA 5FP6A 3BHHA 3PFQA 4CQGA 2UW8A 5CF5A 1WZYA 3OW3A 4UMQA 2WD1A 5K9IA 3C4EA 4DEBA 3Q4CA 5KMLA 2OH0E 3NPCA 4EH7A 4YURA 1WVWA 1F3MC 3Q6UA 3JXWA 5AV1A 5KBRA 4FKGA 3ZO2A 4XV3A 3UQFA 2JDOA 3QTRA 2JC6A 4UWBA 5AADA 4FEXA 4YTIA 4ZTLA 1H00A 3C0HA 1OKZA 2B54A 3F3VA 3T9IA 2B9FA 5CAUA 5CAOA 4CVAA 4P4CA 2DWBA 4ITJA 2YIXA 4IWOA 1OBDA 5HE1A 5IH4A 5HX8A 5K4IA 2RF9A 2V7OA 1JAMA 2J6MA 4FZ7A 2CGUA 1GZNA 4WG4A 3ZHPC 3QALE 4JIKA 4BDBA 2ZMCA 1H1PA 2IJMA 5T68A 5HU3A 2XKFA 3AC3A 1CKIA 4IW0A 2W1FA 4ZP5A 3ZYAA 4NTTA 4S31A 5HCXA 1U59A 3W2PA 2VTSA 5KZ0A 4KIQA 3ZONA 4D4SA 4EHGA 1XWSA 3OS3A 4FTJA 4JQ8A 4O0TA 2XK9A 4ANSA 2HWOA 4GVJA 3EN4A 3VS1A 4L46A 5A46A 2OJ9A 3F66A 3MJ1A 3CGFA 3FKNA 4ZTQA 3F2RA 3I4BA 4FKOA 4RIWB 5HNIX 4YTFA 2R0IA 1A06A 3VS5A 4IFCA 4DF3A 4UMPA 2WB8A 3V8TA 4E3CA 4CKRA 3DAEA 5IDPA 5IH5A 3IONA 4GG5A 4RIXA 1R0PA 2WEIA 3H9OA 4JG7A 3W32A 4A9RA 2ERKA 2GCDA 1MRUA 3F82A 1W7HA 2R3IA 2W1HA 3PJCA 3HA8A 4FV7A 2CHLA 4OGRA 5ANJA 4TYHA 3VHKA 2PVRA 2DQ7X 4AOTA 4EQCA 2WMTA 2GQRA 3DQXA 3L9PA 4MHAA 4NKAA 1XO2B 3MDYA 2Z60A 5JN2A 2ERZE 3I60A 4FNYA 3MPAA 2XM8A 4XV2A 4S33A 2UW9A 2YJRA 2BR1A 4BDEA 3L8SA 4LOPA 5AP4A 4AGUA 4JDJA 3LQ8A 3AMBA 3QTUA 2R4BA 4L45A 2VAGA 2BUJA 4IE9A 2X39A 3G2FA 2CKPA 5ETFA 3EOCA 3MESA 3OT8A 1YXSA 4IX6A 3UYSA 4DTAA 4IEBA 3FZTA 1SVHA 3IQ7A 5CVGA 3F5XA 3ZUTA 1UWJA 3V04A 3OF0A 4AA5A 3RPRA 4FBXA 4BCJA 2XNBA 4D2RA 5M53A 4EOPA 2UW6A 4ACDA 4G31A 5HTIA 2BALA 2GU8A 2ITTA 1KE9A 1REKA 2ITWA 2QOIA 2R3FA 3AGMA 4O7TA 4BF2A 3IW6A 5CNOA 1IA9A 5GJDA 4FV8A 3HMMA 5D9HA 4ANLA 2V62A 3MTFA 4HYUA 4FGBA 3QQJA 4BDDA 5CALA 3UVRA 1YKRA 4G3FA 4WG3A 3MV5A 4M0ZA 2IWIA 5E92A 4M69B 1Y57A 4XHKB 4BY9E 4IVCA 5D11A 3IKAA 3W10A 3VQHA 3B2WA 3O8UA 4FL2A 3ORNA 1UKHA 2GQGA 3SW4A 4DBNA 1IAJA 3MH0A 3R9OA 2QURA 1W82A 3IECA 3QRUA 4NCTA 4EH9A 4ZSJA 2ITPA 2VN9A 3AG9A 3QA0A 2F2UA 2GNFA 3R28A 5AR8A 3TTIA 3QRTA 3ZCLA 4BTFA 3CQWA 3OWPA 4QMTA 3D14A 5J95A 3I6UA 4E4XA 5L6WL 2PTKA 3NAXA 4FSMA 4I6FA 3A62A 3E8EA 4FL3A 5AP3A 5HG8A 4A4XA 2BPMA 4RJ4A 5I9WA 2Z8CA 3WYYA 3WZKA 1YI3A 4IDTA 5IMXA 3LM5A 4FIHA 1YXVA 2VWIA 3VBQA 4DLIA 5JRQA 4IAFA 4EHEA 5LJJA 3R8PA 2FSLX 2GTNA 3PJ1A 4Y83A 1IA8A 3RCDA 4RVLA 4FICA 4J95A 3UQCA 4C58A 3SQQA 2JEDA 5L6OA 4UZHA 3Q32A 3LKMA 3FZ1A 3B8RA 3K2LA 5AAFA 3EN7A 3FLYA 5LCJA 4OBPA 2Y6OA 4EH2A 4QQTA 4O6LA 5EQPA 4R7IA 2XS0A 3GFEA 5A4TA 2C1AA 5IQAA 2YJSA 1ZYCA 5E7RA 2IO6A 4FIGA 2ZDUA 3BWFA 4DAWA 3LCDA 3G5DA 4FG7A 4QD6A 2ITZA 4U41A 3PUPA 5CNNA 5DIAA 1YRPA 5AEPA 5C26A 3CTJA 4YZMA 4I5CA 5TT7A 1NVSA 3OP5A 4RZVA 3NAYA 1VEBA 2FO0A 4AZFA 2OWBA 5KMNA 1PW2A 2W0JA 4WNMA 2GFCA 2JD5A 2QVSE 4RJ3A 1Y8GA 2UZVA 3D7TB 2CCHA 3R04A 4RFMA 4EC9A 4AG8A 2PE2A 3D5WA 2KTYA 3PVWA 5DFPA 4F1TA 5JKGA 5C01A 1YDSE 3NMUF 4KD1A 4AZEA 5DYJA 2VTHA 3O8TA 2XIRA 3G9LX 3BYUA 4XH6A 3OWLA 1Q8YA 3TUDA 5F1ZA 1Q61A 2C0IA 4D4YA 2JDTA 3BCEA 2XEYA 3C4XA 4W4YA 3ZLXA 2VWWA 1JLUE 3WILA 1Q5KA 5FUTA 2IZTA 5F4NA 1ATPE 3VNTA 4HYIA 1KV2A 3Q04A 1KV1A 2B4SB 5A6NA 2OG8A 5AUYA 4PY1A 2OW3A 4DEEA 5FXRA 5J9YA 1W98A 1SNUA 1M2PA 3SX9A 5LWNA 1RQQA 3W33A 5A4LA 1JPAA 3II5A 3LPBA 3NUPA 4QMOA 5ACBC 4AN2A 5CEMA 4BR3A 2XYUA 4HNFA 5TO8A 3OCGA 4ANNA 4O7VA 1VYWA 1G3NA 3OUKA 3EB0A 2PVKA 3HRCA 1ZRZA 4D1SA 4NK9A 4LGHA 4X3FA 2FA2A 1WBNA 4CYJA 3OWJA 4FTOA 1R39A 5CVHA 4PNKA 4CCBA 3I5ZA 5B2LA 4YPSA 2W4OA 3V5JA 4HCUA 4KNBA 5ANGA 2JDRA 2UZOA 4A9UA 4ACHA 2AC5A 2W17A 4B7TA 5I3RA 4FX3A 4O0YA 3ODZX 1Q8UA 3ZZEA 1O9UA 4MD9E 2C6EA 4RG0A 4FC0A 4GJ2A 5IDNA 2VUWA 4ERWA 4FKQA 4JBOA 4JL9A 4KWPA 4EBWA 4FKRA 4IB0A 5JFVA 2BAQA 4ZAUA 4QP2A 2R3LA 3Q52A 4EOQA 5FM2A 1OL5A 4QT1A 4Q9ZA 1ERKA 4FT5A 4BRXA 1PMNA 2ZM3A 3DK3A 5EDPA 2CNQA 1GZ8A 3D83A 1NVRA 2F57A 3FDNA 4QQCA 3KF4A 5LWMA 5A6OA 3W18A 3Q2JA 3QD0A 2VWZA 3ERKA 3VULA 4Y85A 2RL5A 3FBVA 3UOLA 4HGSA 1Q8ZA 2IN6A 4C2VA 2QOQA 3I5NA 4QYHA 5EHYA 5LOHA 2HAKA 3FEGA 4L3JA 2XNOA 1OKVA 5AM6A 4WHZA 5DVRA 4ZJJA 5E8ZA 4C3FA 4ZJIA 5A4CA 3OOGA 4G6NA 2JBOA 4RIYA 5J5SA 3SG9A 3KREA 4DG3E 5J1WA 3EFKA 4WOVA 1U54A 3B8QA 5AR5A 2I0HA 3MVJA 1TQPA 1ZYJA 2HXQA 3RAIA 3SKCA 4DFUA 3E87A 4BZDA 1VZOA 4TYIA 3CTQA 4RJ6A 4WIHA 5DBXA 1TKIA 3UZTA 1ZYSA 5ICPA 4FTNA 4QTBA 2PMLX 4ZLZA 3NNUA 4IAYA 2YA9A 3L9NA 4R7HA 4YLJA 3COHA 1WBVA 4Y95A 5AP1A 5F95A 3PY1A 3V01A 3Q60A 2FSTX 4IDVA 3ALOA 3OC1A 2WTVA 4FZ6A 4I93A 4YZ9A 4NW5A 3EQFA 3I79A 3L8XA 5CAQA 4R77A 2QKRA 3PJ8A 4X2GA 2X7OA 4YC8A 2W1DA 5L2SA 1Q99A 5M55A 4QP4A 4LMNA 3FMMA 3K5VA 2BZIB 2Z7SA 1S9IA 4TNDA 5M4UA 2CN8A 4JVGA 4IWPA 4EZ7A 3R1NA 4F7SA 3GEQA 1QMZA 2VX0A 5HCZA 4FIIA 2BRNA 4G9CA 4RVTA 4F08A 3KXGA 4FT0A 3WIGA 5EKOA 4BGHA 3PIXA 4F0GA 3UJGA 4M84A 2XKEA 5IA1A 4CNHA 4FSQA 3EWHA 2UVYA 3PVGA 4FYOA 4J71A 4OTHA 4XG2A 4KSQA 3WZDA 3TNIA 2W9ZB 2GS6A 4ANOA 5J1VA 5HIBA 5FGKA 4AT4A 3PE2A 4S34A 4BKYA 1VR2A 5CASA 5I9XA 2I0YA 3L9MA 3ZO1A 5E1EA 4YJPA 2P2HA 3HDMA 1O6KA 1F0QA 1TVOA 4JJRA 5BUIA 4HVGA 1OIRA 4RIWA 5AV2A 4JDHA 4GKHA 2BRBA 3PY0A 3FLSA 4FTKA 4ZIMA 5CU4A 3UP2A 5BUJA 2EB2A 3HGKA 2I0EA 2ITNA 2W1EA 3BBWA 2F7EE 4DGOA 4O82A 5HLWA 5L8KA 1U4DA 1QPDA 1XHAA 2J0MB 4HJOA 2VX1A 4B6LA 4X6QC 4LOQA 5FTGA 2BZJA 2BIYA 3NCZA 3O23A 2VTIA 3FZSA 4UX9A 5LXMA 1UA2A 4RQKA 3UYTA 3MI9A 4MVFA 3EL7A 3TV6A 4QYYA 3VUTA 4RIXB 1U5RA 3C51A 4IADA 4K6ZA 4NKSA 2V22A 3UNJA 2R3KA 4QYEA 3F7ZA 3ZO3A 4AZVA 4YMJA 5C1QB 3QRJA 4AZTA 3HMPA 3F3UA 4RWIA 5E8VA 4J8MA 2QI8A 4I23A 5EM6A 3TT0A 3Q4TA 2XRUA 4JDKA 4BGGA 3V51A 5DMZA 4QOXA 4G3DA 4RC2A 4I4FA 4ZMFA 4AE9A 4E5WA 2A0CX 4AOIA 3HECA 4CKJA 4K2RA 4EK5A 2XNMA 1ZZ2A 3HMOA 4U0IA 3LFSA 2R3RA 2BDWA 5IA3A 4O38A 2JKQA 5EM7A 2UW5A 3ACKA 5K0XA 5IMEA 2IZSA 3LW0A 4FUXA 4L52A 4N4SA 5CQUA 1M2RA 3LXKA 2R3OA 1PXJA 3O7LB 3LFBA 4AW5A 4N6ZA 1OIQA 5IEYA 5KKRC 4AA4A 1GY3A 3HX4A 4YJVA 3IGOA 2OICA 4BCNA 5KHXA 2OJJA 2HZ0A 4U3ZA 2J5FA 5ANOA 3ZSIA 1JKKA 4PWNA 3CKWA 5LARA 2FB8A 3MIYA 2PE1A 4H3PA 5AA9A 5DOSA 5CEPA 1BMKA 2CGXA 2WIPA 4FVPA 3ZM9A 4NIFB 4XV9A 4AW1A 2YACA 3LCSA 3OT3A 4XG3A 2C3IB 4FKPA 1OIYA 3RVGA 3U87A 3VUIA 4C4GA 1AD5A 4L3PA 4R7BA 1ZLTA 4MEDA 5HD7A 5LVMA 2R3QA 5CX9A 5K5NA 3POOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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