4JDJA

Crystal structure of serine/threonine-protein kinase pak 4 f461v mutant in complex with paktide t peptide substrate
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
290
structure length
288
Chain Sequence
SHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGVCAQVSKEVPRRKLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRAAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a major determinant for serine-threonine kinase phosphoacceptor specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 4
molecule tags Transferase/peptide
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 288
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jdjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jdjA01
3TNWA 5AUWA 3LZBA 5DPVA 5BVNA 4L6QA 4LL0A 4NWMA 2EXMA 2OJJA 4RGJA 3IECA 2CMWA 4CFVA 4XP3A 3ZFYA 4QT1A 4KIQA 2VAGA 4GL9A 1IA8A 4D1SA 2C47A 5ETAA 5A14A 4YGAA 4ZMFA 2QOLA 5FUTA 4CTBA 2WMQA 2OF2A 2FYSA 4RZVA 5CZIA 5FDPA 4WNMA 4IM3A 3VS6A 3FI8A 2CPKE 2O63A 5GZ9A 4FKLA 5EFQA 3UMXA 5AMNA 3I7CA 4YC8A 2UVXA 3LFQA 5AUUA 4LRJA 1JKKA 4V01A 5D11A 3KN6A 4FSMA 4FV7A 5FXQA 1Y6AA 3DV3A 5EM6A 2YCQA 4J8MA 3VJNA 2GU8A 1P5EA 4ZSAA 3REPA 2ZV9A 3A7GA 3U8WA 1PMVA 3EQRA 2BZJA 5KMKA 2PVHA 2QO9A 1L3RE 3DKOA 4WT6A 3UBDA 3Q9YA 3S2PA 2A27A 2BROA 4GW8A 4NZWB 3MTLA 4IWDA 4UWCA 3H9OA 4PWNA 4RIYB 3HV6A 5H2UA 3RI1A 4D2TA 4EYMA 2BZKB 4PY1A 2Z7SA 3TTJA 3E8DA 1LEWA 4U9AA 3W2QA 4FK6A 4LG4A 3QHRA 1R0EA 2X6DA 3OG7A 4HGTA 4U0IA 3VAPA 2OGVA 2ZB1A 5AEPA 2H34A 2ZV8A 2XYUA 3EFLA 2WIHA 3KFAA 3OBGA 5M4UA 4HYIA 5L2TA 4O7NA 1PXNA 4YO4A 1BLXA 4IEBA 3R8UA 3G6HA 1SYKA 3N4TA 3DB6A 5GZAA 3QQUA 4XP2A 3GGFA 2XKDA 4LMUA 2YZLA 4QPMA 3P5KA 1OIUA 3ENMA 3QF9A 1Q8WA 1H1WA 4TTHB 3EKNA 3UNKA 5AR2A 1FVVA 3N9XA 2HOGA 4JDJA 5LMBA 1YDSE 3RNIA 4F63A 4L01A 3MJ1A 3RPYA 1ZOGA 5HE1A 3GU8A 3TKIA 4TL0A 5K4IA 2C5NA 2FGIA 2PMLX 4AGWA 1UKHA 4H1MA 4ZSEA 2Y6OA 1OUKA 3A4PA 2E9OA 3VVHA 3KK8A 4IB0A 5A46A 3PP1A 4FEVA 3KULB 3UMWA 2ONLC 3BGQA 2XJ1A 3O51A 4RVTA 4YC6A 5AP2A 3FMNA 3R2BA 4X0MA 3JYAA 4O1OA 2YERA 4A4OA 5JT2A 3I5NA 1U4DA 4O0YA 3L9LA 4Z7GA 4C4HA 2H8HA 2WIPA 1PHKA 4OTQA 5FEEA 3Q5IA 1UU9A 2IW9A 3NCZA 2LGCA 2GHGA 2OH4A 4QP4A 5IA4A 5J5TA 3O17A 3QX2A 4XG3A 4ANBA 4I3ZA 4E6QA 5A9UA 5IQHA 3TDWA 2J5EA 4O96A 5HESA 5BYZA 4XLIA 2XBAA 3BV3A 4J1RA 2JLDA 2QOIA 3QZHA 4BWKA 2GNJA 2W05A 4RIWA 4F7JA 3R7UA 2PVJA 5JMSA 2PVKA 2UZLA 5EH0A 3LXKA 4FL2A 3SRVB 4JVGA 3HMOA 5J5SA 4QQTA 4YR8A 4NTSA 1O6LA 2Q0NA 2UW7A 2QI8A 5GJDA 3RCJA 4AXAA 2JBPA 4DBNA 3CC6A 1JWHA 3F7WA 3KKVA 4IWOA 2PZRA 4HVHA 2GSFA 1CKJA 2J4ZA 2YZAA 3B2WA 5EOLA 5AV0A 2JKKA 4UY9A 4AW1A 4GU9A 2E9UA 4NFMA 3AGLA 2VGOA 4EH4A 4EQUA 4V04A 4YHJA 3V5JA 2YM3A 4K18A 3TKHA 1FQ1B 2WQEA 4DEGA 4LV8A 2QOFA 2UW5A 4ANMA 4QTBA 5HEZA 4DTBA 3KGAA 4ASEA 4L46A 3UZRA 4ZTNA 4A9YA 3CS9A 1WFCA 3ZMMA 4FTLA 5EYDA 1PF8A 1YXTA 1YRPA 2X6EA 3IW4A 3VS1A 3ZO4A 4UXLA 4APCA 4CYIA 2G2IA 4IFGA 2YDKA 4EK5A 4EWQA 2WAJA 3S95A 3G6GA 4CV8A 4Q5EA 3A4OX 2W9FB 3Q9ZA 1TQPA 2C3IB 4YPDA 2C5XA 1GIJA 3COHA 4JT3A 2BDFA 3OEZA 1H01A 1Y57A 2VTSA 3MSSA 4O0VA 2RFNA 5EW9A 3Q5ZA 3W2SA 2Z8CA 4GK3A 4R1YA 4L7FA 2ZMCA 3UG1A 3MGYA 4WIHA 3MTFA 2I0YA 2W4OA 1KV2A 2WTVA 3IOPA 2W7XA 4TWNA 4GG7A 2IVUA 4IMYA 4I94A 3FYJX 5L8LA 4G9CA 2VX1A 4RJ6A 4FKVA 4NYEA 3CQEA 2GFSA 3VRYA 1OIRA 4ORKA 3NNXA 1PMNA 1IEPA 3PLAE 4BTMA 2CJMA 3MVLA 3EL7A 3MH0A 3TG1A 3LCKA 4CXAA 4EH5A 3GENA 2F7XE 3PRFA 3KRWA 2X2MA 1Y91A 4OUCA 4B9DA 3ZUVA 1UVRA 2I7QA 4RC4A 4CMOA 4ZJJA 4JG7A 4I5HA 4KABA 4R1VA 3F5XA 4ITHA 5J1VA 3CEKA 1UKIA 1BMKA 4GIHA 2WTWA 4G3FA 4FKUA 3QTZA 5ANDA 4IHPA 3WIGA 3ZBXA 4C59A 4JG6A 4Z3VA 2R4BA 3MDYA 2C68A 3L9MA 3E8CA 4FSNA 3TNIA 3LQ3A 1V1KA 3FPQA 2VUWA 3U55A 3FZSA 4M7IA 3Q2JA 3DT1A 1PYEA 2Z7RA 5CLPA 4IWPA 4HGSA 5L3AA 4XP0A 3Q04A 4DH5A 4TNBA 1WVXA 1ZXEA 2QU6A 3V01A 3VW6A 4C3PA 3SKCA 1Q8YA 4B0GA 4QQCA 4KKGA 4O81A 3R9RA 3ZUTA 3NUSA 3QZGA 4WG4A 2YCSA 2OF4A 2WPAA 5I5ZA 3DXNA 5JQ5A 2B9JA 2H9VA 3HRFA 2HIWA 3HNGA 4GJ2A 3VQHA 2DWBA 4A9SA 1WZYA 4A07A 2YACA 5EM7A 4HCUA 4YJQA 4QP8A 1ZARA 4WRGA 4KS8A 2F49A 2XIZA 3E3PA 4YLLA 5FP5A 3HUCA 5JKGA 4UMQA 5CXZA 3OCGA 3Q3BA 3JVSA 3I4BA 4RFMA 3MS9A 4HOKA 3W33A 4A9UA 3MFSA 3F82A 2QG7A 3ZH8A 5D41A 3PSDA 5HD7A 3VO3A 1Q5KA 3ERKA 4Z9LA 5F4NA 4MXOA 3EN5A 4WG5A 2CNVA 5CSPA 2X2KA 3IW6A 5DI1A 2PE2A 4EI4A 3C5IA 5JZJA 2GFCA 3FXXA 4C4JA 1CSNA 1FPUA 3BLRA 2QOCA 3HP5A 3QYWA 1YI4A 2JITA 4F9WA 3G2FA 3FMMA 3OT8A 1REKA 2HZNA 4JAJA 4F1OA 4DF3A 3CJGA 3E87A 3D7ZA 4AX8A 3MPMA 4I6HA 3D7TB 1IRKA 4JX7A 3FXWA 5IEXA 3I81A 4P4CA 3QL8A 4H3PA 3B8QA 3PDTA 5CEOA 3Q4TA 3PY0A 3R02A 2R3KA 4E3CA 4DEBA 5AA8A 3UP7A 1IA9A 2CLQA 1TQIA 4C02A 3FMJA 4FTKA 4FNWA 5J1WA 4FSUA 4JQ7A 4RG0A 3IONA 3DCVA 3FDNA 4FTMA 4MVFA 5FQDC 1UNLA 1JSVA 4UMPA 5FP6A 4GIIA 1JOWB 3HECA 3BYUA 3C0IA 3CQUA 1XO2B 4DGLC 2RF9A 1H00A 1OBGA 4JBOA 3CPBA 2NRYA 4QTCA 3VUDA 3K5VA 4G3EA 4UWBA 3GCPA 4AT5A 4CNHA 2QO2A 3BBWA 4AN2A 4XH6A 3OY3A 3VBXA 3LFCA 3QD2B 4BI1A 4F9CA 3NUNA 3RBWA 3NEWA 2IVTA 3UC4A 2NNWB 5AP5A 2UZOA 4CQGA 2ZB0A 1YWNA 4N70A 3NAYA 3TIZA 4DH8A 3L8XA 4TXCA 4OAUC 5IMEA 5E8VA 2EB3A 4XV9A 4FV9A 3N4UA 3E3BX 4Z16A 4C4GA 1W82A 4R7IA 5BVEA 4TW9A 3FZ1A 4ZIMA 3D5VA 2F2UA 2VWBA 2X4FA 4BDHA 1W0XC 2I40A 3QLFA 4M8TA 4UMRA 3S1HA 4NM0A 4X21A 5H9BA 3P4KA 4GT5A 1LR4A 2O5KA 2XKCA 4DFXE 4XMOA 5AIKA 4FYOA 3P7CA 4YP8A 4L44A 4ZOGA 4PDYA 2OJGA 5HE2A 2WQNA 1NVQA 3OFMA 4TYHA 2JDSA 5FTQA 4HZRA 4MH7A 1AQ1A 3WBLA 3BIZA 3MH2A 2XBJA 2OIQA 3TEIA 3IDCA 5H8GA 2IW6A 4EOJA 4FEUA 1KE5A 1MRVA 4I5PA 5ANIA 1M2QA 1GIIA 5HU3A 1J7UA 3OOGA 2WEIA 5CT0A 3D5WA 2OFVA 2C30A 2W99B 4G17A 3ORPA 4YLJA 5EKOA 2ITQA 4YLKA 3FY0A 3QRKA 4J52A 3OCBA 4RJ5A 2R0IA 3KRJA 3F5PA 2LAVA 1ZRZA 3FI3A 3I60A 5AP4A 4RVLA 3VBVA 4I6FA 4D9TA 3NW6A 4L9IA 4E26A 4R7BA 2O64A 4XX9A 3MV5A 3HRCA 4UALA 1VZOA 4IB5A 4PMPA 4GFOA 5AP0A 4RJ3A 5CWZA 3UIMA 3TIYA 3NVMB 4RWKA 4EOMA 3EN9A 3BU6A 3HZTA 4GKHA 4BZOA 3NLBA 3QRJA 4KA3A 3RAIA 5HG9A 4FKJA 4PL4A 5BPYA 2XJ2A 3R8VA 3CLYA 1RQQA 3C4ZA 1R78A 5HX8A 4W4WA 4KUJA 3SX9A 2W1CA 3THBA 3ATTA 1IAHA 3ZO1A 5JRSA 3R22A 2GNLA 2KULA 4ZMEA 3NWWA 1SMHA 1Z57A 3RGFA 3OCSA 3T3VA 5DRBA 1MRUA 2QKRA 4JQ8A 3OF0A 4FV0A 3R1SA 5HTIA 4IJ9A 3R83A 3MFUA 1STCE 2GTNA 3MVJA 4I6QA 4OTWA 2BKZA 2UUEA 3IOKA 4PV0A 4N57A 4BDKA 4JNWA 4JIAA 4RSSA 5TOZA 2HWPA 3V04A 3FI4A 4JOAA 3RPOA 3VC4A 4BDIA 3QXOA 5I9WA 5IQAA 2YHVA 1B6CB 2YIQA 3EKKA 5F20A 1H28A 2CHLA 4BYJA 5GINE 3PVWA 1GZNA 4LOOA 4MQ2A 4M66A 3HMIA 4FVPA 4AQCA 5BUEA 4CG9A 1IASA 2HELA 1Q8TA 2RIOA 4HCVA 1PXIA 2YM8A 4NM7A 4IAZA 1FVTA 2CKOA 4BR3A 5M4FA 3A62A 5FGKA 3EN4A 4O27B 2CGWA 5F94A 3KULA 2R3LA 3TACA 3VBYA 3FBVA 3GC9A 3N4VA 5ANEA 5CENA 2B9HA 4RZWA 3HMNA 5EYCA 1ZWSA 4FNYA 2XNPA 2W1FA 4FOCA 3LOKA 4F99A 3NUXA 1IR3A 2WMSA 3JPVA 3SV0A 2XK3A 4JDIA 4QTEA 5HORA 3NNVA 3PUPA 4DGMA 1JSTA 3M42A 2UZDA 4M13A 4CFNA 3FPMA 4BDGA 2BUJA 4EYJA 1JLUE 3NUYA 4BL1A 5LVMA 4NIFB 4TNDA 3S4QA 3ZSIA 3G5DA 2X4ZA 3O0GA 4AF3A 2CGUA 4D4SA 4EORA 3DNDA 4QMQA 2NO3A 3S00A 5HI2A 4FKOA 3W8QA 5JH6A 5F1ZA 1OBDA 1EH4A 3BELA 3HMPA 4QOXA 4K0YA 3AD6A 4C36A 1A9UA 4O7RA 3VS7A 4K2RA 4QMTA 4QYFA 4NW5A 2JBOA 4GT4A 3TCPA 3POZA 5DT0A 2W4JA 4C33A 3EOCA 4BCOA 5GJGA 2J5FA 4WSYA 3ROCA 3VRZA 3MPTA 2AYPA 3EHAA 4JG8A 5IDNA 2F4JA 2HW7A 4DFLA 4E20A 4WSQA 3MN3A 1LEZA 2Y4IC 3EFWA 2WU7A 5A4LA 1GNGA 1H4LA 3R7EA 5CAOA 4BCIA 3KVWA 3OVVA 5ANGA 3QTSA 3U87A 4K11A 3JUHA 2EB2A 4ZTSA 4BHZA 1Q4LA 2WMWA 2OK1A 2QOBA 1JQHA 3E92A 4HCTA 3UOJA 3MFTA 3EYGA 1XH9A 5HNBA 4ANQA 3QWJA 3TV7A 5CVFA 2ZM1A 4NJDA 2W17A 4FT9A 4G3GA 1Q8UA 2O3PA 4PPAA 2VTOA 2P55A 4YURA 3LLTA 3G0FA 3OZ6A 5AR8A 3RZBA 5BVDA 5EM8A 3P08A 1JVPP 4H3BA 3ZSHA 4S34A 5CNOA 4C62A 3ZM4A 3D83A 4FK3A 2IO6A 3UTOA 4O0SA 2A19B 3O2MA 5E1EA 3CY3A 4LYNA 5B2MA 4GU6A 2V0DA 4LV5A 3ID6C 3C7QA 3QC4A 5LWMA 3T9IA 4ACMA 4JLCA 3ZSGA 3TTIA 2XMYA 1E1XA 1W7HA 3AMYA 3T8OA 2WMUA 3DFCB 3A7JA 3BX5A 4DHFA 3ETAA 4EOLA 5DHJA 4HNFA 1PXPA 4TPTA 3HUBA 2R3NA 1OL1A 4IX3A 1XKKA 4U81A 4Q9ZA 2IW8A 4XG7A 4EKKA 2VTMA 3V8TA 2C3LA 4DEAA 4AT3A 2ITPA 2Q0BA 3UIBA 3UC3A 3EYHA 5CZHA 2GNFA 4RX9A 3ZLWA 2XK8A 5CX9A 3BWFA 3F61A 2JD5A 3GFEA 4I5MA 1P4FA 2XIRA 3CQWA 2JDRA 4PL5A 4MXXA 4FEXA 5I9UA 3BYMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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