4JG8A

Structure of rsk2 t493m ctd mutant bound to 2-cyano-n-(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)-3-(3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1h-indazol-5-yl)acrylamide
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SIQFTDGYEVKEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKYVYVVMELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLERQGYDAACDIWSLGVLLYTMLTGYTPFANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVSKMLHVDPHQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Electrophilic fragment-based design of reversible covalent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase alpha-3
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jg8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jg8A01
4WSYA 5AX3A 1KOAA 3B8RA 3PA4A 4ITHA 3WYXA 4D4SA 3SV0A 4QPMA 2PE1A 3BLQA 3W2CA 3VW8A 1M52A 4F0FA 3PG1A 3Q4CA 2BRGA 1TVOA 4D1SA 4U81A 5A4CA 2C5OA 5HVJA 2GS6A 4L3PA 4R5SA 2WTIA 4OLIA 5AR5A 4RWIA 2IW9A 1U4DA 5DRDA 3ORZA 1LR4A 2B9JA 4FG9A 3ORXA 4M66A 2OICA 3FSKA 4B8LA 3MVMA 3P23A 4PRJA 4BTJA 2PZPA 1YXSA 4B9DA 3FQSA 3QWKA 3GFWA 5FXRA 4JIAA 1TQMA 1VJYA 2QOFA 4GKHA 2ERZE 3ET7A 4ZLOA 2IVTA 5HE2A 5EQEA 3C51A 3LJ2A 3U55A 1W84A 4V04A 4FK6A 3WI6A 5D7AA 4QRCA 5DR2A 4YTHA 5EDRA 3C4FA 3RINA 4OT6A 1H08A 3TWJA 3EYHA 4QYEA 4CFWA 2VO7A 3E8CA 4DA5A 4DBXA 4YHFA 4QP8A 4CD0A 1BMKA 4MF1A 3CGFA 3W33A 4O7LA 4D9UA 1XWSA 4FC0A 4N57A 5IQIA 3K2LA 2UZNA 2XNBA 4IJ9A 2IWIA 2CJMA 2PVMA 4ORKA 5C1QB 5A46A 4L45A 1LUFA 4Y72A 4JIKA 2C69A 3QA0A 3ZFYA 4F09A 4JAJA 2R3PA 3QUPA 4O91A 3HV5A 3MB7A 5CEOA 4PL3A 4J8NA 5M57A 4GRBA 4KWPA 3PPJA 3TG1A 4D55A 4PQNA 1FQ1B 1VR2A 4YZDA 1E1VA 2W4KA 3FHIA 3D94A 5TR6A 2PUUA 3QTQA 2XKDA 3DQXA 4JBPA 4OTDA 4C4JA 3FEGA 3ZZWA 5IQCA 2W9FB 5AUTA 1ZXEA 3NNUA 4UZHA 3AD6A 3L8SA 1YXVA 3QQLA 4FGBA 1WBNA 4R1YA 3ROCA 4BFMA 3FI8A 2QOLA 1P2AA 3UE4A 4BIDA 5CAOA 2XJ2A 4GFOA 1ZMVA 4I23A 2BZIB 3ORLA 4ACHA 4AUAA 3P4KA 3QC4A 2PZRA 4U8ZA 3L1SA 3WIGA 4YMJA 2JGZA 4NIFB 4EH6A 2R4BA 4ZSEA 2YM5A 5JK3A 4JDJA 2QR8A 5ETIA 4QMZA 4XG9A 3R9NA 3T3UA 4BBEA 1T46A 2VNWA 2F7EE 1YI3A 3E63A 3FJQE 2VWIA 4M14A 3ZOSA 4E4NA 3EQDA 3AC3A 3C13A 4IWOA 3REPA 5CSPA 3HMMA 3UG2A 4CKJA 5EW3A 1P4OA 5FEQA 5B2MA 4U3YA 5LVNA 4FKTA 4O7TA 1XQZA 2BROA 4HGLA 4LRMA 5EKOA 3UBDA 3BLRA 3MB6A 4C62A 1UV5A 3GFEA 3OD6X 5IH4A 4RIXA 4FEVA 4RJ8A 5DWRA 1Q97A 1PXNA 1STCE 2HELA 4KNBA 2OXYA 5L8JA 5EM8A 4AGDA 4L3LA 4LMNA 3WZKA 4U6RA 4HVHA 3K54A 4CMUA 5C9CA 4QPSA 4G17A 1ZYJA 4RFZA 4NYEA 2HK5A 2O64A 1ZAOA 2I0EA 3G33A 4OTQA 4YJNA 3QXPA 1SVGA 2V0DA 4C4HA 2ITPA 3R1NA 3EQRA 2C6EA 2UZWE 4WG4A 5CVFA 5AV1A 4A4OA 5CT0A 3NUXA 2C6IA 3KULB 2UVZA 1PXJA 3PY0A 4II5A 4F9AA 2E9PA 3OVVA 2J4ZA 3DBDA 4GJ2A 3ZO3A 4ASEA 3DKCA 2XCKA 4BF2A 3E87A 2XK6A 5KHWA 4AN2A 2G2HA 3OWPA 3UP2A 4TNDA 2W4OA 3QBNA 4RX9A 4DEDA 5LMKA 5EQPA 1M2QA 3O96A 2QOQA 2C0TA 2F4JA 4QPAA 4I24A 1BX6A 5TKDA 2H9VA 1FVRA 3LCTA 3R63A 3VIDA 4FKVA 3CC6A 3M2WA 5HQ0A 2PWLA 2VAGA 1JSVA 2C6OA 4BDJA 1AD5A 2R3FA 2UW0A 4ZK5A 2H6DA 3AD4A 3H4JA 3LZBA 3Q9ZA 4TYGA 2I6LA 2JIVA 3R1QA 5IQBA 4FTRA 2J0MB 2WEIA 4TPTA 2ITZA 3VNTA 5KMLA 4CZYB 1H24A 2QOCA 4HCUA 4M97A 1XH9A 2YERA 4EWHA 4YJTA 2JFLA 2XYUA 2YIQA 3Q6UA 3QD3A 4OTFA 2XVDA 4FVRA 4WHZA 4GIIA 4PMMA 3UYSA 5EI8A 1PMVA 2PVRA 3BHTA 4K6ZA 4A9UA 1TKIA 4FTIA 5H9BA 3WF8A 1SYKA 2QI8A 4P7EA 2EB2A 5HCZA 3Q3BA 4LV8A 3BQRA 2IPXA 2FSMX 4BCOA 4F1MA 5LMKC 3RBWA 2YABA 3A60A 4ZTHA 1OL6A 4UWYA 4NUSA 2JFMA 3MFRA 5JMSA 1Q8ZA 3FL4A 5C8MA 3QD2B 4D2WA 5AADA 5E7RA 3ULZA 2VWWA 2NO3A 5BVWA 3V5JA 2PVHA 3U6IA 5AJQA 4DFYA 3BU5A 4P4CA 2C68A 4XHKB 3IG7A 4TWOA 2ZB1A 5ACKA 2X6DA 5CEKA 4D4RA 3NUUA 2OFVA 2XRUA 2Z7SA 2R7BA 2WMXA 2JAMA 3FL5A 5F95A 5FTGA 5TO8A 2C6KA 2YDIA 5JZNA 5HKMA 3FLYA 2JEDA 4R7HA 5EOLA 3CLYA 1IG1A 3EKKA 3LLAA 3DA6A 5I3OA 5FGKA 3NNWA 2WO6A 1L3RE 2A4LA 3EFWA 3EQIA 3R8MA 4EH7A 3KA0A 4HCVA 4CZUA 1QCFA 4D2SA 1Y57A 2R3KA 1QPDA 2REIA 3RCJA 4HGTA 3IGGA 3G15A 5GZ9A 4JQEA 4TN6A 2X81A 3KGAA 3R22A 4GW8A 3ZXTA 2W1DA 5A4TA 5GJFA 4ID7A 4QMXA 3W1FA 2WTJA 4ITJA 5T68A 4BB4A 5TOZA 4RGJA 5IISA 4GV1A 3K5UA 4FUXA 4ASDA 1Q41A 4NIFA 4EJNA 1J7IA 3OXZA 3Q5IA 4H3QA 3SOAA 5B2KA 3CQWA 3MTFA 1R0EA 3V51A 2Z02A 4DEAA 3KREA 4M12A 3LM5A 1VEBA 4JDIA 1JAMA 2G2IA 2WMWA 4RVLA 4F9CA 2V62A 5AWMA 3LMHA 3OW4A 1JPAA 2Q0BA 3D4QA 4BL1A 1H00A 4CFXA 3QKLA 2BKZA 1PJKA 2QLUA 4QTCA 2QKRA 3ZDIA 4BTFA 5BVNA 3ALOA 3R21A 4LOPA 4BGQA 2GNHA 3ZLWA 4YPDA 2GU8A 3DKGA 3LXPA 4XRLA 5JFWA 1WAKA 2VWBA 4ZSGA 5JGAA 5CEQA 3Q2JA 1FPUA 2VX0A 5CF6A 3ORMA 2PE0A 5HOAA 2XYNA 1M2RA 1SMHA 3LCOA 4X2NA 5DGZA 1G8AA 2CKOA 5I0BA 3LCSA 1WFCA 3U4UA 3BWJA 5EYMA 1A9UA 1B6CB 3NYOA 4D9TA 3D2KA 3DCVA 5CU0A 5EHYA 4LOOA 3DOGA 3W8QA 5CU3A 3KULA 5CEIA 2BRMA 1W83A 2R3JA 5EM6A 2BCJA 3FE3A 4FV9A 4RJ5A 4FNXA 4FTOA 3QD0A 5I3RA 4I21A 3O23A 4E4XA 4YURA 4LQMA 2B9IA 3EQPA 4J52A 4LFIA 2RGPA 1LPUA 2J0JA 1NVRA 4XCUA 2VTAA 1RW8A 2VX3A 4DFBA 1XH5A 2XH5A 2PYWA 4QP7A 2GNIA 4BCHA 5AP2A 4JQ8A 4PP9A 4K2RA 4X2FA 2VTLA 1JKLA 4KKHA 2ZB0A 3GBZA 3VF9A 1ZRZA 3WARA 4G9CA 3FI4A 3OY3A 4WKQA 4FV2A 3POOA 1PW2A 2HW6A 5AV3A 3RNIA 4O0XA 4EH9A 3JPVA 3ORIA 2AUHA 4XBUA 3UO5A 5J7BA 4S2ZA 3VS1A 3ZM9A 3ZLXA 3TNHA 3BV3A 3FKNA 4L52A 4X21A 3VBVA 3A7JA 3HMOA 3SVVA 1WBWA 3QRKA 4K1BA 2WU6A 4KIPA 3ZSGA 1Y91A 3OCTA 4RC4A 1NVQA 3GU5A 4O7SA 3POZA 3R7EA 3C1XA 3KMUA 4D2RA 5IQHA 3VUMA 4G5PA 3VUKA 3K5VA 5I4NA 3GT8A 5L2TA 1OM1A 5A3XA 3FY0A 4ANLA 4ZJIA 4XV3A 4M13A 5HZNA 5HLPA 4XX9A 3HV6A 1LP4A 5K3YA 2BZJA 5GZAA 1B39A 3SKCA 2J5FA 5DFPA 4EKKA 5ITAA 3HUBA 2BRNA 5HU3A 3H0ZA 4WSQA 2PL0A 4OTHA 2P4IA 1Q62A 3H9FA 5HX6A 4GSBA 4DTAA 5KHXA 2IVUA 4MKCA 3ZONA 1Q3WA 2ITOA 1LEZA 4FV8A 5HORA 4A4LA 4M8TA 4WNKA 2IJMA 4OBPA 5TF9A 4IVDA 4FZAB 3ZC6A 2OZOA 5ETCA 1H8FA 4MH7A 3OUKA 5HD7A 3FLZA 5D41A 3VBXA 3VBQA 3OMVA 4D28A 3RCDA 4YZCA 2VTHA 2ITQA 1YXXA 2BZHB 2R3QA 4CG9A 4R77A 4IXPA 3RALA 3V04A 4G34A 3ZBXA 4N0SA 4O83A 2GSFA 2VV9A 4O22A 2UZOA 3S00A 3QRUA 1F0QA 3EZRA 5IG1A 2B54A 1OIYA 4YC8A 4FF8A 3DXPA 3P5KA 3VHEA 1AGWA 1MRVA 4YGAA 3V3VA 4OBOA 4KBKA 2ZOQA 3O8PA 4APCA 3OUNB 3PP1A 2FO0A 3CY2A 2YM6A 2QO9A 3ACJA 4KIOA 3GC8A 4FIIA 3A2CA 5AP3A 2X7FA 3OFMA 4Y5QA 1UNGA 3AD5A 4D2VA 2UZUE 1OUKA 3DB6A 5ANGA 3FMMA 4YBJA 2BDWA 3MBLA 1YWNA 5I9WA 3VULA 4IQ6A 3IO7A 4C3RA 3IDCA 3QCSA 3CQEA 3ORPA 4GCJA 3E3BX 4XG3A 5GZ8A 3AG9A 4BIEA 5EYDA 4RA4A 4Y73A 5M4IA 5CVHA 2HY0A 4QQCA 3ZYAA 2C0IA 5CY3A 5M4UA 2BPMA 5HG5A 2O3PA 3BLHA 1SNUA 2UZEA 4JS8A 5J1WA 3MN3A 4YZBA 4O84A 3QCYA 4GK2A 4JL9A 5BNJA 5GINE 1VYZA 3LIJA 4AFEA 4IWDA 1ATPE 3KXZA 4RA5A 4XP0A 4G3FA 3U6JA 3QQUA 5HLWA 3F2NA 4DFLA 4IANA 4FVPA 3COIA 3R7YA 5DHJA 4QMUA 3FMDA 4O96A 5IMEA 5E4HA 1Z57A 3FPMA 2YCSA 5HVYA 2C3KA 4WNMA 3CGOA 3W2SA 2ZYBA 4N70A 1J1BA 4FNYA 4FV3A 3SRVA 5ANDA 4FV1A 1REJA 3WF5A 4WT6A 1TQIA 4GYGA 4H1JA 5HO7A 3KMWA 3QC9A 3FZTA 4IZYA 1CKJA 3LFQA 4NCTC 2XF0A 2CN8A 4BI2A 5ICPA 3EN6A 5AIRA 1ZOEA 3PG3A 3TT0A 3FZSA 3D5UA 1OUYA 4UWBA 5BVEA 3KCFA 4F08A 2GHMA 2EWAA 3U87A 5BVFA 2VWYA 3DJ5A 1KV1A 2EVAA 2QC6A 4OTWA 1IRKA 4CLJA 4XV9A 3BEGA 1OB3A 2PZIA 3NUSA 4MEDA 3QL8A 2A27A 2C6LA 3T9TA 1Q8WA 5CSVA 5M09A 5AR7A 2CLXA 4FVQA 3FZRA 4DGLC 5F20A 2BR1A 3FMNA 4AW2A 2BFXA 4BKJA 1K3AA 3UZPA 2IZSA 3DY7A 3KFAA 2PVLA 3R04A 4FIFA 3EZVA 5CI7A 5IEYA 4L68A 3CTJA 3RNYA 5M56A 3BHHA 4IW0A 2YZAA 4HVDA 4EK5A 5L6PA 1WBVA 3VUGA 3NYXA 4YPSA 4YTCA 5H2UA 1BL6A 4BR3A 3ZRLA 3QQKA 5CZHA 5FUTA 3VBWA 4IDVA 3R8PA 3I6UA 3P0MA 4RC3A 4UB7A 3VUTA 2WTVA 4P2KA 4NU1A 4C0TA 2GTNA 4JDKA 1Q99A 4FKPA 4C3FA 4CTCA 5CEMA 4KBAA 1WBTA 4MNFA 3MJ1A 3A7HA 4ZMEA 5HIBA 2OJFE 4QYHA 3LOKA 3LW0A 4LGHA 4UMRA 2R9SA 4IC7A 2FSTX 4F6SA 4BN1A 4BWKA 1JKTA 2J0LA 2VWVA 2JKOA 3C4ZA 4EOIA 2ZM4A 5HO6A 4J98A 3TJCA 3HDNA 4Q5EA 2VD5A 2O2UA 4FIEA 5DG5A 2WD1A 4X3FB 3M42A 5E8XA 4GT5A 4EH5A 2NP8A 3UOKA 4I5CA 4NM7A 1GIHA 3BYOA 4J71A 4GL9A 4X2KA 4BCGA 3ZBFA 1H07A 5EKNA 5CU2A 3QTUA 3BZ3A 3GQIA 1PF8A 3VS7A 3Q32A 3NX8A 4M3QA 1LEWA 3KXHA 4AZWA 3LFEA 2QO2A 3P79A 3CR0A 4I5PA 4OAVB 4LRKA 3OWLA 5EYKA 4CG8A 3ACKA 3AT2A 3CD8A 3RPYA 2OH0E 5AFVA 3HMIA 4USDA 3R9HA 4DG0E 4QOXA 3V8WA 2Z7LA 4UN0C 3ZEPA 3PWDA 3R73A 1BLXA 1HCLA 3UVRA 3KVWA 3OT3A 1H01A 4MXOA 4XG2A 4D2PA 5IF1A 2V5QA 4JR3A 3QZGA 4EUTA 4WRGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4K2R A;  4X2F A;  2VTL A;  1JKL A;  4KKH A;  2ZB0 A;  3GBZ A;  3VF9 A;  1ZRZ A;  3WAR A;  4G9C A;  3FI4 A;  3OY3 A;  4WKQ A;  4FV2 A;  3POO A;  1PW2 A;  2HW6 A;  5AV3 A;  3RNI A;  4O0X A;  4EH9 A;  3JPV A;  3ORI A;  2AUH A;  4XBU A;  3UO5 A;  5J7B A;  4S2Z A;  3VS1 A;  3ZM9 A;  3ZLX A;  3TNH A;  3BV3 A;  3FKN A;  4L52 A;  4X21 A;  3VBV A;  3A7J A;  3HMO A;  3SVV A;  1WBW A;  3QRK A;  4K1B A;  2WU6 A;  4KIP A;  3ZSG A;  1Y91 A;  3OCT A;  4RC4 A;  1NVQ A;  3GU5 A;  4O7S A;  3POZ A;  3R7E A;  3C1X A;  3KMU A;  4D2R A;  5IQH A;  3VUM A;  4G5P A;  3VUK A;  3K5V A;  5I4N A;  3GT8 A;  5L2T A;  1OM1 A;  5A3X A;  3FY0 A;  4ANL A;  4ZJI A;  4XV3 A;  4M13 A;  5HZN A;  5HLP A;  4XX9 A;  3HV6 A;  1LP4 A;  5K3Y A;  2BZJ A;  5GZA A;  1B39 A;  3SKC A;  2J5F A;  5DFP A;  4EKK A;  5ITA A;  3HUB A;  2BRN A;  5HU3 A;  3H0Z A;  4WSQ A;  2PL0 A;  4OTH A;  4AQK A;  2P4I A;  1Q62 A;  3H9F A;  5HX6 A;  4GSB A;  4DTA A;  5KHX A;  2IVU A;  4MKC A;  3ZON A;  1Q3W A;  2ITO A;  1LEZ A;  4FV8 A;  5HOR A;  4A4L A;  4M8T A; 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