4JVGA

B-raf kinase in complex with birb796
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
275
structure length
262
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGLATVKSSILWMAPEVIRMQDSNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELARELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibitors that stabilize a closed RAF kinase domain conformation induce dimerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 262
sequence length 275
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jvgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jvgA01
3PVWA 4D1ZA 4X21A 1JKTA 5CNNA 4FKTA 5DIAA 4C2VA 4ORKA 2I0YA 3RM6A 3ZRMA 4UMUA 3TZMA 4AE6A 2FUMA 3VF9A 3LXPA 4PMPA 1WCCA 4E5WA 5IH4A 1Y6BA 2R3PA 5FXSA 2A19B 3FL4A 3UPZA 2CJMA 4D2RA 4IB5A 3LW0A 2XJ0A 4C35A 2R5TA 2VTAA 5HESA 4JDIA 2XYNA 2X7FA 2YIYA 3F3VA 4CYIA 3QC4A 2CSNA 1T45A 3TUDA 2NNWB 4FT3A 5HVJA 4O96A 4BHNA 3MVLA 4RIOA 5T6KA 1OPLA 1UV5A 2IWIA 1FPUA 3DK7A 4EH9A 2UZOA 3LFAA 1NW1A 3FSFA 4TN6A 2OXXA 5E1EA 2W5AA 4RVMA 4EC9A 5FGKA 3AT4A 4FNYA 2YLEA 5IF1A 3W2SA 4TWPA 2VTTA 4FTAA 2X9FA 2FA2A 2Y8OA 2Z2WA 4AW1A 4DG0E 3C5IA 1H27A 2W5BA 3RVGA 3VQUA 4AN3A 5JFXA 3KCKA 4PWNA 5AP4A 4AT3A 4ZSAA 2IVVA 1W84A 3PPZA 3BRBA 4TNBA 4DG2E 2VTHA 4ITIA 5I3OA 2OJIA 3PSBA 4QMWA 3P7CA 3E8CA 3WYXA 3KRLA 2BZIB 1U5RA 5GZ8A 4M7IA 3ZFXA 3AC3A 4QTCA 5KBQA 2A27A 4RLLA 2FSOX 3QX2A 1MQ4A 4O82A 5ACKA 4D1SA 3A7HA 2WKMA 3BBTB 3ETAA 4NTTA 3AD5A 3VBWA 4F99A 5L6OA 1OBDA 2IZSA 5LXMA 3QZHA 3FAAA 5JQ8A 3EIDA 1OITA 3OBGA 2JKQA 4JQEA 4QMZA 2DYLA 3DCVA 3VRYA 5HG7A 4L8MA 5J9YA 5EHYA 3CGFA 4Q9SA 1NVSA 1H07A 3NWWA 5J87A 2OBJA 3ZUTA 1ZAOA 4YO4A 3KFAA 4EHVA 4ANBA 4Y8DA 2IO6A 3DT1A 4UV0A 1JKSA 2Q0NA 1M14A 1BKXA 3MPTA 1NA7A 2XK4A 4UMTA 3N4UA 4MNEB 1OL6A 1YQJA 4XEYA 3SXFA 4RJ5A 4AW2A 3VUTA 4K8AA 3RI1A 3LCTA 2X2LA 4JJRA 4MD8E 4W4YA 3QUPA 2QOIA 4MHAA 4CGAA 3QUDA 4LL5A 4MQ2A 2R3MA 3DLZA 5HIBA 5FEEA 4I0SA 3BZ3A 2P33A 5GIPE 3GU5A 2XEYA 4FTJA 3QD4A 4MWHA 4C57A 4I24A 4L68A 3VQHA 3TJDA 5C8KA 3ZUVA 5DI1A 1CSNA 4IZYA 3W32A 5CAQA 3B8QA 4Q2AA 2ZVAA 3DK6A 1UU9A 4X2NA 2J6MA 3BKBA 4HYHA 3TXOA 2VTSA 4USDA 3C50A 4EZ5A 3UE4A 4GEOA 2J0JA 4C8BA 5HTBA 4G3DA 4BGQA 4EH2A 1K9AA 3NMUF 2EB3A 4DN5A 4HOKA 2E9PA 1VZOA 3OC1A 4G5PA 4L44A 4UMQA 2WMQA 4YLJA 5ETFA 2PVRA 4E93A 1YWRA 1FINA 3QYWA 5TO8A 5IU2A 1ZZLA 4ZJIA 3SC1A 3NYNA 3SAYA 4KKGA 3PJ8A 4J7BA 1JAMA 3AC5A 4IX5A 3UC4A 5D7VA 4OUCA 2V0DA 4RFMA 5HHWA 1E1VA 3Q4CA 4FYOA 4IAAA 3TNHA 5LVNA 3EL7A 4ITJA 4G6LA 4AN9A 1YHSA 4YBKA 1QMZA 4QTAA 4ZTNA 4DEHA 3G5DA 4AF3A 1G8AA 3W18A 4L9IA 4U7ZA 2JDOA 4M8TA 3ZO3A 4CRLA 2XB7A 3DB8A 4G16A 2E9VA 4R1VA 1MRUA 2XS0A 2ITYA 2P4IA 4DCEA 4JRVA 3UIBA 3ZUUA 3JS2A 1J7IA 5HE3A 3VJOA 3DBDA 5ANKA 3U87A 3RAKA 1J1CA 3FZPA 4UY9A 2YM4A 3CGOA 3CTHA 5L6WL 2WTVA 3DXQA 4GYGA 3ZONA 2CPKE 2OJ9A 3LAUA 5CU2A 5B7VA 1CMKE 4D58A 2BMCA 4HCVA 3GB2A 3G90X 2CKEA 4KIOA 3EQGA 1BUHA 4DH3A 3HKOA 2IW9A 2I7QA 3GFEA 3A4OX 3TDWA 3PWDA 2BFYA 4TL0A 4XOYA 2UV2A 3NUUA 4QTEA 1WBPA 2ETMA 1GIJA 3RAWA 1DI8A 2UVZA 3LFBA 5AV2A 4EYJA 5IMEA 3MIAA 4HCTA 3QRUA 5IISA 2RFNA 1PYEA 2VX0A 4HZSA 3H9FA 3MESA 3DTWA 5J79A 5BQ0A 1OKZA 3F2AA 3QQUA 4XNEA 2X0GA 1HOWA 3PY1A 3QGYA 4FV4A 4L00A 4YTCA 3OWPA 4HZRA 4LUEA 3BCEA 4I6FA 4FTKA 4E73A 4UYNA 2P2HA 4EUTA 3R30A 2F7EE 4XP0A 5TT7A 2A2AA 3FPMA 4YZCA 4TWOA 4MK0A 2W9FB 4RJ6A 4WOVA 5KMIA 5M09A 3FY0A 3K5UA 4DAWA 1WMKA 2PMLX 3EQPA 5B2KA 1M2RA 4DH1A 4JLCA 4UMPA 4MVFA 4OAVB 4NFMA 3AT3A 4A9UA 5IA0A 5HLPA 3VBYA 3CQEA 3ZDUA 4W9XA 4XLIA 5M53A 4IWQA 2VNYA 5DT0A 3VIDA 5BUJA 2YAKA 4DFNA 3VUDA 3QLFA 2ZOQA 5IUGA 1X8BA 4QYYA 5LQFA 3NVMB 4FT0A 4F64A 2OF4A 4YHFA 2VWWA 4B9DA 5M07A 2O63A 5L6PA 1H01A 3ET7A 4GK3A 5DRDA 5JGDA 3Q4TA 3OROA 3Q4UA 4HCUA 4ZLZA 4U42A 5KMOA 3A60A 1FVVA 4GCJA 2X9EA 4CV9A 3FLSA 3MB7A 1R39A 5IQCA 3FMJA 4NL0A 5A6OA 4YJTA 2PUNA 4C4EA 1Q8WA 4XCUA 4D5HA 4YGAA 2C6DA 1S9JA 3BE2A 3NIEA 2R3IA 5HCYA 4CMOA 3C4EA 3EMGA 2Z7QA 4DFYA 4EOQA 3ITZA 4O81A 5ANDA 5CI7A 3LOKA 3R04A 1BL7A 3PTGA 4RRVA 3ERKA 3VBQA 3DJ5A 2WEVA 4RGJA 3S2PA 4CXAA 4F08A 4NEUA 4G6OA 4BF2A 2RFDA 2BTSA 5KX8A 3EL8A 4ITHA 3VBTA 5CEMA 5FLFA 4BDEA 2GS2A 2YM6A 2CN8A 4UALA 3UG2A 5IQBA 2V55A 4MBJA 1PF8A 3WE8A 1J91A 4QMPA 2WD1A 4M15A 5A3XA 2OSCA 2UZWE 4B99A 4M13A 5HLNA 5HORA 2WQBA 4AUAA 5AUUA 1ZOHA 4ZP5A 5ICPA 3R22A 3C51A 1TQPA 5KKRB 2P3GX 5AX9A 5CZHA 4IAYA 4KBKA 3R2BA 4IANA 4BDGA 3R7IA 3IGGA 4H1MA 1PXLA 1R1WA 4IFCA 4YSMA 4IB3A 2YIXA 4PPCA 2WTCA 4GG7A 1YW2A 4BKZA 2XK9A 3MA6A 1H25A 1DAWA 4MH7A 1DS5A 3H9RA 4WBBB 3QD0A 2RG5A 2VTLA 4KBAA 3NW7A 5KBRA 3C4XA 2QVSE 3GNIB 4DFUA 1H1QA 4AA0A 1ZMWA 2BRHA 3PY0A 4FTTA 3RHKA 1KV1A 2HZ4A 4BKJA 4BIDA 3KRJA 5HO6A 3HLLA 4IQ6A 4GW8A 2FYSA 4BY9E 4RJ8A 2VTNA 3R63A 4H58A 4QP4A 1MP8A 3D7TB 3Q2MA 1VYZA 4WRSA 5EDRA 3KXHA 2XA4A 1GJOA 3DOGA 3F3TA 1GOLA 1IG1A 5F94A 1APME 4C36A 2YJRA 2EUFB 4MXAA 3ZLXA 1MQBA 3QQKA 5HG5A 4JX3A 4QMTA 3P0MA 1XBCA 4UMRA 2C3JA 2WMWA 5H8EA 2R3QA 4DFZE 2BAQA 1XBBA 1O6YA 3IW6A 5EYKA 4J95A 3TIYA 5HD4A 4FVPA 3HP2A 4MNEA 3ZBXA 3QBNA 3W2QA 5CQWA 2W4OA 3VULA 3QQFA 3FQEA 5M55A 4XG2A 4O7ZA 4R5YA 3SXSA 3EN7A 1WVXA 3BYOA 4OAUC 3H9OA 2A4LA 2WGJA 4YHTA 3WE4A 2DQ7X 4XV1A 2XRUA 4C7TA 5HQ0A 3UMXA 4FSUA 4R7IA 3L8PA 3ORKA 2ITWA 3LXNA 3COIA 3IS5A 4I5MA 4BZOA 3LFQA 3OCBA 4GFGA 4F0GA 3MVMA 1QPJA 4XV9A 1FOTA 3HMPA 4CFNA 3NVKI 1KWPA 3M42A 1Q8YA 4G6NA 2IVTA 4Y73A 1W83A 3UVPA 3A62A 4MKCA 3C5UA 4BCQA 2P0CA 1YOMA 4F1MA 5AA8A 1ZYCA 3DBFA 4ACGA 4ZSJA 5DFPA 5CF5A 1JWHA 3BQRA 3ZTXA 3W16A 1PY5A 3FI3A 4CZYB 3K3JA 4DEGA 4FTRA 3UC3A 4C02A 4RQVA 2WOUA 5CVGA 3QTSA 2AUHA 4FV7A 2UW8A 3WF6A 4CVAA 4U97A 4D2TA 2FSMX 3CJFA 1PHKA 4FGBA 4IHPA 5KKRC 3FWQA 3DKOA 1OKVA 4IVCA 4E7WA 4F0FA 2HY0A 1RE8A 3PXYA 4N0SA 4FUYA 2BILB 2G01A 1UKIA 5FM3A 2P2IA 3PXRA 3WZKA 3OUKA 4A06A 2EXEA 3L9MA 4H39A 4FODA 4FTCA 5F9EA 1LEWA 2RSVA 4QP1A 4B6LA 5CS6A 1KE9A 3I7BA 4JL9A 4C4IA 4CFXA 1JKLA 4XX9A 4ZTQA 1K2PA 4FIJA 4PTGA 2RIOA 3E5AA 3HYHA 5J8IA 1HCKA 2R0IA 4JNWA 4QMVA 1B38A 4XG3A 5CTPA 2IW8A 4ANMA 4CQGA 4EOJA 3HRBA 1LPUA 4N70A 4JDHA 2J51A 2W1EA 3QZFA 3SD0A 3F9NA 4ANNA 3MVHA 1JSUA 2QI8A 2FGIA 3JYAA 5AM6A 4HYIA 4FKRA 3WILA 4PUZA 5G1XA 4BCFA 2CNUA 3UO5A 1PXMA 3KF7A 4ID7A 4RVTA 3R9NA 3VUIA 3LFNA 5JZJA 2BZKB 2YJSA 2CCHA 4GS6A 4YUQA 3DKCA 3GEQA 5E8UA 3UTOA 1V0OA 4JR3A 3UOLA 3IQ7A 5L8KA 2WMUA 4L3JA 1OM1A 5AJQA 3NW5A 3MBLA 4TWNA 2O5KA 4CMUA 5M44A 2ZYBA 3QUEA 4EOMA 4O0WA 4X6RA 4UWYA 4PF4A 5CU6A 3FL5A 3KK9A 3F5GA 5HNBA 3QQGA 3H0ZA 5FBNC 4RT7A 4IJ9A 5M56A 2W05A 2CHLA 2WIHA 3IW8A 4AFJA 1YI3A 4QMSA 4NYEA 4D2PA 3G0FA 2JIVA 3D5WA 2JIIA 2X8EA 4KIPA 3IOPA 2I6LA 3PRFA 3PSDA 4L46A 5E8ZA 3U4WA 5KZ0A 4C33A 4CV8A 4FV9A 3U54A 1H1WA 1W8CA 3S95A 4DEBA 4YSJA 5KMJA 2X7GA 1M2PA 3O7LB 4WIHA 4EQCA 1A48A 4YBJA 3Q5IA 4DTAA 1Q8ZA 2UW6A 3ORNA 3QZGA 5JQ5A 3KRRA 4D4SA 1MRYA 4L7SA 5DBXA 2ZAZA 1OI9A 3DB6A 5HVYA 4YNOA 3F2RA 4AZEA 2ITUA 2OKRA 3NYOA 5KHWA 3BELA 3EN6A 3NUNA 4YNEA 4CKJA 5FBOA 4MTAA 4OTHA 2VO3A 3WARA 4NH1A 4PP7A 1XHAA 2XRWA 3HV4A 1PW2A 3S0OA 3HMOA 2J90A 3TUBA 4YURA 4EWHA 4FUXA 2GQSA 2PYWA 5HO7A 4EUUA 2YZLA 4M97A 3FKOA 4HYSA 1ZOGA 4A7CA 3FLYA 3LQ3A 3AC8A 1VJYA 3I0OA 4LOQA 4QP6A 4ASDA 4C38A 1H1RA 3ZSGA 3Q3BA 3BE9A 2JFMA 3TDVA 4CRSA 5BVEA 2C30A 4KNBA 3O8TA 1ZZ2A 2YM7A 3A61A 4FKUA 4K33A 3R9HA 4A4XA 3QRJA 2B52A 5CSWA 3QKLA 3HA6A 3FZOA 4RSSA 3L8SA 4C4FA 4Z16A 3UVQA 4PX6A 5EDQA 4AOIA 5J1WA 1OUYA 3VW8A 4R7BA 2VV9A 3LMGA 5CEQA 3BEAA 3LIJA 3LCOA 2YIWA 3MS9A 2WO6A 5C01A 3RINA 2F49A 2W17A 3CE3A 1M7QA 2PMNX 4O91A 4YJNA 4CLJA 3C13A 3R73A 2QD9A 3VNTA 2O0UA 4PDOA 4QQJA 3KF4A 3P5KA 4IE9A 1FVTA 2C0OA 3S4QA 2UZDA 2X2KA 4PMSA 4TY1A 5DGZA 4IC7A 4Z7HA 3OW4A 2XP2A 5IQHA 3F5UA 3RGFA 1ZWSA 3V3VA 1LP4A 3P7BA 3QQJA 3ENMA 4BDHA 5JRQA 5KE0A 5LVPA 2EWAA 3GCQA 1EH4A 1URCA 2PZYA 4DEDA 4O7LA 3R9RA 3SDJA 4JAJA 3NAXA 2BR1A 3R00A 1K3AA 4FSTA 2X4FA 3EN9A 3ZSHA 4BCMA 4O7VA 2PE2A 3H0YA 1XH4A 4L42A 4Q5HA 3KRWA 2GTMA 2IVUA 1P2AA 2YA9A 4USFA 5HCXA 1R0PA 4F9YA 5C1QB 2BVAA 1YDRE 2C6TA 3CCNA 4OR5A 5EM5A 2ZV2A 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5CAPA 3JY9A 4FEVA 1Z57A 2UW0A 3B2WA 4HGLA 2QOKA 4RA5A 5EI8A 1Z9XA 4CQEA 4LQMA 3ROYA 4BGGA 2I0HA 5BVWA 1GAGA 3ZC6A 4FSWA 4X2KA 4DC2A 5AR8A 3E7VA 2YERA 4ERKA 4ALVA 3SXRA 3UIXA 4LL0A 4MD7E 1G3NA 3R8UA 4QYHA 3OXIA 4FL3A 3QXOA 4MBIA 4AS0A 2B9JA 1YWVA 3GQIA 2PE0A 5CEKA 3QD2B 3MIYA 5KMNA 2R3NA 3GOPA 1OKYA 2B53A 2XEZA 3VHEA 4UN0C 5IQAA 3I5NA 2BRGA 3NUYA 4FKQA 3ID6C 5DR6A 2WQMA 4GV1A 5I9XA 3GT8A 2VO6A 5FTGA 3DAJA 3PXFA 3P86A 4MAOA 1XO2B 1UU8A 2YFXA 3C0HA 3AOXA 4HVGA 3ZOSA 3ZCLA 2Z7LA 3HRCA 3R1NA 3VF8A 5DYJA 2ITZA 4J8MA 2QHNA 2XH5A 3FXXA 3ATTA 3EFKA 3O2MA 4DT8A 3PP0A 4BI0A 4GK4A 3R7UA 2CGXA 3DXNA 4EZ3A 5IQIA 3KXGA 5BMSA 2YIRA 1SZMA 4NUSA 4JDKA 3OT8A 3G2FA 2PSQA 1J1BA 3H10A 1Q8UA 2YM8A 4Z9LA 3QGWA 4FKIA 2A1AB 1W82A 3BHTA 4L53A 4YTIA 3ZBFA 2XK3A 3OCGA 1YVJA 3UOKA 5A4TA 2OF2A 3FKNA 5J7HA 3BLRA 2W1GA 4S30A 3KREA 3N4TA 3S1HA 1QL6A 1JNKA 3FMEA 3KA0A 5EDPA 5HI2A 3DTCA 2C3IB 4FZAB 3D5UA 4RFYA 4KSPA 4EK5A 3NAYA 2GHLA 3KULB 5HVKA 5AUVA 2PVMA 3GC9A 5LMBA 4X3FC 2YEXA 5DWRA 4K0YA 2RL5A 4D5KA 2JKMA 2J9MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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