4L43A

Crystal structures of human p70s6k1-t389a (form i)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
337
structure length
316
Chain Sequence
RGPEKIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAMIVRNAKDTAHTKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQSEEDVSQFDSKFTRQTPVSANQVFLGFAYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of S6K1 provide insights into the regulation mechanism of S6K1 by the hydrophobic motif
pubmed doi rcsb
molecule keywords RPS6KB1 protein
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 316
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4l43A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4l43A01
1T45A 2H96A 2YAKA 3A60A 4MXOA 4G3DA 3E3PA 5DNRA 4C2VA 3RCDA 5IA0A 4C7TA 4R78A 2FVDA 4GT5A 1E1XA 1Z9XA 4WG5A 5C27A 1IASA 3EQHA 3NUPA 3ORZA 5FDPA 3LFSA 2ITVA 2B9FA 4RJ3A 4YP8A 4IM3A 4O27B 3CD8A 2VTRA 3UZPA 3SD0A 2GNGA 3KRRA 3KK8A 4GT4A 4DH3A 4NKAA 4D4VA 1TVOA 4JS8A 4IW0A 4LRMA 3COHA 3CTQA 5IQBA 1S9IA 3NYXA 3TDWA 3VF9A 4HCTA 4B7TA 2WQMA 5JZJA 3HMPA 3E92A 3HMIA 4MVFA 3UNKA 5CEQA 2EXEA 3W32A 5IDNA 3HRBA 5M4FA 4ZK5A 2CKEA 2R4BA 3HDNA 3PXKA 3D5VA 4IB3A 2E2BA 4U7ZA 3UBDA 3VS5A 3W55A 4C2WA 3HUCA 5KMNA 4V0GB 2CKOA 4FTNA 4O7WA 2B54A 2BRBA 5FP6A 4Y73A 2E9VA 2XK4A 3G0FA 3SX9A 2OXXA 2F7ZE 3EHAA 4D4SA 1MRUA 4EUTA 4R7IA 5J9LA 1Z57A 2GQSA 3H30A 4FT7A 1DAYA 2WOTA 3VRYA 4UMQA 1XR1A 4ITIA 4U8ZA 4UWBA 4XG6A 2WIPA 5FXSA 2F49A 3NYNA 4XP0A 3FI2A 4UZHA 5IDPA 3K3JA 1Q8TA 4OTQA 2ZAZA 3UE4A 3V8TA 5IEVA 4G5PA 2IVTA 3FKLA 4CNHA 4HPTE 5B2LA 4PMPA 1WBSA 2PVHA 2WGJA 2W1GA 3R1QA 4W4YA 5ANKA 4YBKA 4BDIA 2UW4A 2R64A 5L2TA 4GU6A 2GFCA 4XX9A 4YJVA 5J1WA 5T3QA 3CCNA 2GTNA 3BHUA 4XLIA 3R8UA 3QX2A 4RWIA 4AOIA 3QQLA 5LVPA 1SZMA 4TWNA 4UBAA 5EQPA 2WNTA 2CGUA 4XBRA 1F0QA 3DXNA 2W1EA 2J0MB 2HELA 4U81A 4ZZNA 5EOBA 3DS6A 3OOMA 3DCVA 2R3PA 1IEPA 4FKPA 3RM7A 2WMXA 3SOCA 3P79A 4O2PA 3RBWA 5A14A 1J1CA 3QTWA 3EQRA 4IB1A 4IWDA 3PVUA 5CXZA 3QQHA 3DAEA 5KUPA 4TT7A 5CU4A 4J98A 4YNOA 4AT5A 3BYMA 4ASEA 4BR3A 4OLIA 1WVXA 3H0ZA 3FQHA 4RC3A 5AIKA 3M11A 3Q32A 5CAQA 2V22A 3GOPA 4BTKA 1ZMVA 3C13A 4CKJA 4I4EA 4ZSEA 2DS1A 4D1XA 3PE1A 3OTVA 2OBJA 2WTDA 3TJDA 4EZ5A 4FKRA 4MF0A 4F9YA 3L9LA 4WNMA 4D0WA 3FZPA 1LEZA 3QRTA 4A4XA 2PK9A 5A4TA 1P4FA 3LCSA 3DB8A 3QU0A 4QMNA 5A4QA 3CE3A 3HA8A 1TQIA 5HORA 3CEKA 1MRYA 4U9AA 3FMNA 5AM6A 4APPA 1JKSA 2G15A 2VGPA 3ANRA 3T8OA 2BDWA 1Q99A 4NCTC 4TNBA 1NVSA 4A9YA 5J95A 5LMAA 4QP4A 1UV5A 3AD6A 1YOMA 3DQWA 4TYJA 4FZDB 4RX7A 4DFLA 3O2MA 4FODA 5CF5A 4C4FA 2QR7A 3FV8A 4C34A 5KMMA 2RG6A 3TNWA 2VO0A 5CNNA 3FL5A 4KB8A 2OZAA 3L8VA 1KSWA 3RINA 3FMDA 3ZDIA 4OTWA 4JI9A 4X3FB 3HV4A 2X2LA 3JY9A 4DFNA 5HIDA 2X0GA 3K5UA 3DLSA 4MD9E 1MRVA 2JAMA 4I5CA 2JKQA 5EQEA 3OW4A 1BMKA 3EN7A 3CY3A 4JJRA 3HAVA 2PE2A 2WQOA 4BKJA 3VS1A 4F9CA 4DT9A 4QPAA 3K5VA 4CFUA 2E9UA 1YW2A 4QTDA 4FICA 5D7AA 3BU3A 4F6SA 2I0EA 5FTOA 4BTFA 2EB3A 4E93A 3RZFA 4QQCA 4BCKA 5CNOA 4GIHA 3L8SA 4CFFA 2VV9A 4NH1A 5HIBA 4HPUE 3PVBA 2PPQA 4OBPA 5HKMA 2IO6A 3OEFX 1FMKA 3LM5A 2C30A 1YHWA 3DY7A 3H0YA 4FTRA 5GHVA 4MXAA 4UWYA 4D2RA 5K4IA 4IAZA 4ACDA 5K9IA 5BNJA 3UVQA 4IWOA 2VRXA 4FEVA 3ATTA 3BLHA 1SNUA 2YDKA 4L44A 5ANIA 2Z7QA 4HYUA 5CVFA 2REIA 5DE2A 3TI1A 3G6GA 4BDHA 1H27A 2ESMA 4MXXA 3H3CA 4UV0A 3R8LA 3C50A 4FTLA 4X21A 5HI2A 4I6QA 4FMQA 4TWCA 2G9XA 3BCEA 5AA9A 4WO5A 5KHXA 2BZHB 2VTNA 4CRSA 3GC7A 4OT5A 5JMSA 5J79A 4LOQA 3LJ2A 1PRYA 1ZWSA 3TZ9A 4C33A 4LGDA 3FMJA 3NUNA 2UW9A 4BCIA 5FTGA 2R3KA 3HV7A 3UIMA 1GIJA 4M8TA 3AOXA 3BLQA 3W2SA 3A4PA 2JLDA 3O51A 3TACA 5HNBA 4RMZA 4IHPA 2A4LA 2ITZA 2QCSA 3PE2A 4QP3A 4CMUA 5AV4A 4BY9E 4R5YA 3MPTA 4UMUA 2FUMA 3SXRA 3VBQA 3RMFA 2WQEA 1WBNA 5H9BA 4CZUA 5KX8A 3F5UA 3RAWA 4AN2A 5KE0A 4D0XA 5C01A 1H1WA 4AZVA 3DDQA 4DFYA 4FIGA 4TWOA 2W99B 2GQRA 5EDRA 3TKHA 4LM5A 4GUBA 3WE8A 3AC1A 3KY2A 4V01A 4DEIA 2YA9A 4GMYA 4BC6A 4UMPA 3ORIA 4CTBA 4EORA 2XJ2A 2HK5A 4I0TA 2OFVA 4J8NA 3O96A 4DG2E 2YCSA 2PVKA 4L3LA 4B0GA 3LLTA 4IANA 5E8UA 3SW7A 5BVFA 1U59A 3LFEA 4NM7A 3ZZWA 4MXZA 5IA1A 3W2OA 3UYTA 3BBTB 5IEXA 4E1ZA 5I9VA 3UPZA 4RQKA 1LR4A 4IWPA 4V04A 4EK4A 3QUPA 5AP1A 2GS7A 5EW9A 1AD5A 2CPKE 5K0KA 3VN9A 4BDFA 2PZRA 4IZ7A 3HMNA 4HCVA 4QP1A 4IX3A 4JNWA 4LG4A 5E8VA 1OBGA 1H1QA 4NL0A 4UYNA 1JWHA 1XWSA 2W96B 5ANOA 5I5ZA 4EK8A 4AACA 3T9IA 4G6LA 4ANSA 4EJNA 2X8EA 3KCFA 1H01A 3RPSA 3BHVA 3Q2MA 3ZLYA 4Y46A 2R3RA 3IW7A 4P90A 4M15A 2NP8A 4IX4A 4GYIA 3NGAA 3RK5A 3ORTA 4RJ6A 4NWMA 3R9OA 4AUAA 4RFZA 3GBZA 3U9CA 3CIKA 3VQHA 3HECA 1KV1A 4O7ZA 1DM2A 1PMNA 4EH2A 4S32A 4H39A 4G2FA 4D4RA 4HVSA 4M14A 4JDKA 2QI8A 5ANEA 2CKQA 3WOWA 3MJ1A 4U5JA 1FQ1B 4DTKA 3Q4UA 3AGMA 4HZRA 3VUIA 1YXXA 5M4IA 4E7WA 4FL3A 3QWKA 3K54A 1Y8GA 4ACGA 3G5DA 2XK6A 3TWJA 3EL7A 2YCQA 2BAKA 4PQNA 4RIYA 3MPMA 5LCJA 1Q8YA 5BQ0A 1IAJA 4BHNA 4BFMA 2VGOA 3EQPA 3KVWA 5CQUA 4LOOA 4U43A 4G1WA 4RA5A 1HCLA 3HNGA 4M0ZA 3R9NA 3NUYA 4DITA 4HVHA 4BZOA 4XMOA 2R3FA 5IA3A 5LWMA 3QQJA 4AT3A 5DH3A 2Y4IC 5EM7A 2ITUA 3D5WA 4FSWA 4YSMA 1W84A 5FEQA 4EZ3A 4WBBB 5A4EA 5BVOA 3ZONA 5AEPA 1OM1A 3VS3A 3LQ5A 2VWUA 4O2ZA 4G17A 3V3VA 4P7EA 1IR3A 4KD1A 1GZKA 3HA6A 5D1JA 3O50A 2PSQA 4OBQA 1JKLA 4OUCA 4WG4A 5DFPA 4BVUA 1OKWA 4HGSA 3F66A 4I41A 4IFCA 4MNFA 1ZYDA 2ZV2A 3LFAA 3DFAA 2XKEA 1U46A 3HMMA 5AUXA 3SQQA 4RC2A 4DGNA 4GIIA 3PY1A 5GJGA 2X7OA 3KU2A 3P7AA 3UJGA 4FZAB 1L3RE 4FV6A 5B2MA 2BZIB 4PL4A 5KMKA 3M42A 2X9FA 4PTCA 3PWDA 4FV5A 1XH6A 2HAKA 4GSBA 4IMYA 3EZRA 4QNYA 5CF4A 1J91A 4KBKA 4O7SA 4R3PA 1YKRA 3REPA 5HTBA 4FE2A 4NT4A 2C5VA 2VUWA 3MWUA 5DHJA 5HGIA 2QOKA 4FL1A 3TNQB 3SRVA 5CZIA 4BI1A 3QD3A 4FT3A 3ACJA 5I3OA 2XIKA 4C4GA 4O81A 2UW5A 1M7QA 1KOAA 2C5YA 3E7OA 1E1VA 1LEWA 3C0IA 3CR0A 4DGLC 4YLLA 4ANMA 1OL1A 3QWJA 4PTEA 3CS9A 4L67A 5AR4A 1VYWA 1HOWA 3RWQA 3UTOA 4G6OA 4FOCA 3WF9A 4PMMA 2ZV7A 4XS2A 4YLJA 1Q61A 3IONA 4TPTA 1UNHA 1NXKA 2ETRA 4J7BA 4OAUC 4IH8A 4BDJA 5F20A 3ZC5A 3R30A 2IW9A 4H3QA 5HNIX 4HNIA 4YU2A 1PXMA 3KGAA 4FTCA 4FT0A 4MNEB 3JVSA 5IA2A 2XNEA 1J7IA 2JDSA 3D14A 4U42A 3D5XA 3CQUA 3UIXA 4XP2A 2X7GA 5CF6A 4RWKA 4BI2A 4FTIA 3BV3A 3BLRA 2R3OA 3GI3A 3LFCA 3NIZA 3Q04A 4EOIA 1BLXA 5BVKA 2HW6A 4X3FC 4RLKA 5LQFA 4O7LA 4DBNA 2PTKA 3BWFA 5HCXA 3MYGA 1HCKA 1YXVA 3MY1A 3PPJA 3NUSA 4FV9A 4J99A 2YN8A 3NPCA 3EKKA 1GIIA 4EWQA 4YUQA 2QO7A 4NTTA 4Z7HA 4HVDA 4YR8A 3R6XA 4A4OA 2J0LA 3ULZA 4BI0A 3GVUA 3T3VA 3W2RA 4CFNA 5HG5A 1JSUA 2PMLX 2WTWA 2P2HA 4ZTHA 3S2PA 1KOBA 4D2VA 3C1XA 4R8QA 2UW3A 3ELJA 1OIUA 5JT2A 5K4JA 3OCBA 1ZZ2A 3TDVA 4DGMA 4IAFA 4FV4A 1OIRA 2I0HA 4AG8A 4ENXA 5JN2A 4ASZA 1RJBA 2OJJA 3VS4A 4DEHA 3WZJA 4FSNA 2UVYA 1GIHA 3LVPA 4YJSA 4C57A 4HZSA 1I44A 1LPUA 3Q96A 4Q2AA 3PXQA 5I3RA 3QTQA 3POZA 1M7NA 1OL6A 4ACHA 3BKBA 2ETKA 3V5PA 4L52A 4AZWA 4AFEA 4EC9A 1BUHA 2ITYA 3EFKA 5HESA 2PVJA 2X81A 3HZTA 3T3UA 4ASXA 3R01A 4P2KA 4PNKA 3C4XA 3HL7A 5DN3A 2VWYA 4CYJA 4FG9A 4I4FA 5E91A 4ACMA 3ZXTA 2Y0AA 3KN6A 3N4VA 4OTDA 2XNOA 4FKUA 3FZTA 4ENYA 2W4OA 4XJ0A 3FPQA 4JXFA 4O6EA 2XCHA 3AMBA 4JX7A 3TIZA 3NR9A 3S3IA 4O82A 4DN5A 3A61A 3QKLA 4AZFA 2ZOQA 3ORKA 3VS0A 4C59A 1Z5MA 5CEOA 3VBVA 1YHVA 2XP2A 3FHRA 3PDTA 4FEQA 2ACXA 2GMXA 4PL3A 4AW0A 2OIQA 4YZBA 3R1SA 3TKUA 2QONA 4ZSAA 3GCUA 4D28A 5IH6A 3F88A 2UV2A 1V0PA 5HOAA 3W10A 5A54A 3QCQA 3E3BX 4FYOA 5BYLA 1BI8A 4UALA 4G3EA 2YM6A 4X6RA 4GKIA 4F99A 4PDYA 2BTRA 4I6FA 3M2WA 4RG0A 5F1ZA 1WBTA 4AWIA 3O8PA 4YJPA 5HE1A 4J95A 5CEKA 3BHYA 3Q60A 5GNKA 1ZY4A 4BIEA 5AUZA 4DEAA 5E4HA 4FT9A 2BMCA 3TZ7A 2JKMA 2Z2WA 1U54B 4O6LA 2JGZA 3I7CA 4QMVA 5AR5A 5H8BA 4BF2A 5I9ZA 2JD5A 2XIXA 3DK3A 4CFVA 5AX9A 1PXLA 4MHAA 5E92A 3RAHA 4RA4A 4DCAA 3U87A 5IQGA 1JVPP 3G33A 4PDOA 5KKRC 4AN3A 4E4LA 3MPAA 4JBOA 4HYIA 4B6LA 4MXCA 4H05A 2G01A 1YXUA 2R9SA 3RPYA 4JT3A 4IB5A 2UZEA 3FDNA 1O6KA 3OXZA 5HVKA 2VNWA 5I9UA 3SAYA 4EOQA 4IAAA 3ULIA 3PIYA 5DI1A 4A07A 3FLZA 4ZZMA 1AQ1A 1G3NA 5DRBA 3F7WA 3LXPA 3MIYA 4ZTLA 5E8YA 2W1HA 5EM6A 3AT4A 4U6RA 3DNEA 3QD4A 4ZLOA 2JIVA 2VTTA 3MDYA 3L8PA 4FTUA 4QMYA 3TTIA 5A9UA 4DE4A 1CM8A 2O64A 3Q6UA 3DTCA 1YDTE 3EWHA 2WPAA 4FIEA 4F7NA 3CLYA 3MI9A 2VWBA 1TQPA 4JIAA 4Y5HA 4Z9LA 4CD0A 1ZYLA 5KBQA 4RX9A 1M17A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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