4M97A

Calcium-dependent protein kinase 1 from neospora caninum
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
STAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYYYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMKMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSSELATIFGVSDVDSETWKNVLAEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Neospora caninum Calcium-Dependent Protein Kinase 1 Is an Effective Drug Target for Neosporosis Therapy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-like domain protein kinase isoenzyme gamma, relat
molecule tags Transferase
source organism Neospora caninum
total genus 161
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13202 EF-hand_5 EF hand
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4m97A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4m97A01
5CSVA 1Q24A 2OGVA 4KSQA 1WBWA 2YITA 5LCJA 1NY3A 2Z7QA 2RG6A 5FEQA 1KE8A 2XBJA 5EYMA 1VEBA 3FPMA 4WUNA 3UIUA 5L4QA 5DR6A 2ITYA 1A48A 2ZOQA 3N4TA 4O1OA 2RG5A 3SRVB 3V5WA 3RZFA 4AF3A 3FMKA 3R04A 3RK9A 2XRUA 5GIOE 4CZYB 5LVPA 3MTLA 2GQSA 3QTRA 3FQEA 1ZYLA 2Z2WA 2FA2A 3FSKA 3JVRA 3KVWA 4YBKA 2JIIA 3EMGA 4EUUA 1IR3A 3OF0A 5ANDA 5JRQA 2B55A 2CGWA 3CPCA 5DEWA 3GGFA 4USFA 2ACXA 4BWXA 3C5IA 2JKMA 4QMTA 1BKXA 2XZSA 2YFXA 4FT9A 2WD1A 2BZIB 3E92A 4YZDA 5LVOA 4OT6A 2W5AA 4R3CA 3R71A 3DXQA 2BDFA 4FTAA 3ZFYA 3A7FA 3R1QA 4ZMFA 3OS3A 5HLPA 1YXSA 2C5XA 4E6CA 4DEEA 4U9AA 3ZBXA 4BCPA 1NVSA 1YI4A 1BL7A 5DR9A 3RPRA 4C37A 2J0MB 4YC3A 2FVDA 1IA9A 2VWWA 5M06A 3R7EA 4DFLA 4FUXA 4MEDA 1SMHA 5KUPA 2QO2A 4AAAA 4IDTA 4FNWA 4KKHA 4PWNA 4EC8A 3KMMA 2ITUA 3KK9A 3B2WA 3H10A 3D4QA 4CLIA 4CFUA 5F1ZA 2B9IA 4ZTMA 1OGUA 4GG7A 3LXKA 3RNIA 2IZSA 3D7TB 4AE9A 3Q32A 3ZEPA 3MA6A 4KBKA 5E9EA 5ETIA 3QRTA 2LGCA 4F7SA 1U4DA 1B6CB 1SVEA 3PJ3A 5GNKA 3AT2A 3GU4A 2F2UA 3NCGA 1KE9A 5BX0A 4F6WA 4JG7A 2C3IB 3ZEWA 2ETRA 4XP3A 1YWVA 2PSQA 3FPQA 4TYGA 2HZ4A 2BHHA 1MQBA 2BRBA 4JJRA 5AP1A 3Q4ZA 4W4VA 4FIIA 4CFNA 1ZYCA 4YGAA 4A9RA 5B7VA 2CNVA 4ZLOA 5K9IA 3KCFA 4ZIMA 3R8MA 3S2PA 3F3VA 3PJ8A 5CU2A 4CFXA 4CQGA 4CT1A 1QL6A 5AAEA 4IB1A 2QKRA 4O7RA 4I93A 3MIYA 2B7AA 3DY7A 5HLNA 1Y57A 2WXVA 4O7SA 3TIZA 4C4HA 3LPBA 2UW3A 5EM5A 4HOKA 3NNXA 5AV1A 4C57A 2B9FA 4H1JA 3HMPA 2QOKA 4U7ZA 4YMJA 2JEDA 1WBOA 4B0GA 3ORPA 2QOCA 4TTHB 2WTDA 2HY0A 4BZDA 2PMLX 4H05A 3OROA 5J79A 1O6LA 3HUBA 4IAKA 5DN3A 5LCKA 3R8ZA 1T45A 3ZU7A 3IW4A 4DGLC 3HUCA 2XEYA 5CX9A 5AWMA 3LLTA 3PIYA 3NPCA 3RZBA 3ZTXA 4FA2A 3HRBA 2IZTA 2PVRA 2X2MA 5E8WA 1SNUA 4EK3A 4AZWA 3HYHA 3KMWA 3MWUA 4L44A 3EKNA 1IASA 4JAJA 2JIVA 5EHYA 3B8QA 4F09A 4TZRA 2Z7RA 3BRBA 3BQCA 4D2VA 1WCCA 4I6FA 4ZS4A 1KWPA 2WPAA 5ETAA 4KUJA 3UMWA 3E88A 3NYXA 2JKOA 4TY1A 3VS4A 3PY1A 4C33A 3G6HA 3LE6A 4FTUA 4L9IA 2C1AA 2XK6A 4XMOA 1YDRE 3VUHA 5CF8A 3HKOA 3W2QA 1J91A 3PVBA 3OW3A 2XYUA 1R78A 3BU6A 4YO6A 3ZC6A 4UMUA 4UEUA 3A99A 5EDPA 3U4UA 4EL9A 3IGGA 4D0WA 4MXOA 3V5PA 3A4PA 4NM3A 4KNBA 4W4XA 3R7VA 4AOJA 4BDAA 3TACA 4NUSA 1XWSA 3DBDA 2VTHA 3KB7A 3QQFA 4FL1A 3A62A 4Y85A 5KBQA 1IAHA 2HAKA 2I6LA 3A4OX 4G9CA 2IPXA 3DXNA 3C51A 2OKRA 2VTRA 2O63A 4CZTA 1ZWSA 3Q2MA 3PJ2A 3ALOA 3SKCA 4ENXA 5J8IA 3HDNA 4XG9A 4OTHA 3IG7A 3UNZA 4XHKB 4BIEA 4ZOGA 2CNUA 5I9UA 1GY3A 4HJOA 4IEBA 2Q83A 4K6ZA 2V55A 2VTMA 4FTKA 3TT0A 3TNPC 4X3JA 1STCE 5E8YA 3RTPA 4DITA 2WKMA 4QMLA 3IDCA 2OZAB 1F0QA 3OY3A 2WQOA 3ACKA 4WSYA 4B8MA 4JDKA 3W32A 3OCSA 4ALWA 4PF4A 2E9OA 4GFGA 1TVOA 4K0YA 2PZYA 3I6UA 4X7QA 3ZUTA 3BYVA 3Q6WA 5DFPA 1M7QA 3DDQA 4A9SA 1U5RA 5AP0A 3JXWA 5LJJA 4IWDA 2RFNA 5C01A 4U44A 4ENYA 2OWBA 3D2IA 3I0QA 3TWJA 2W96B 4UBAA 4NTSA 1F3MC 3FI2A 5K3YA 3WF8A 3PXKA 5EHLA 4TYIA 2R4BA 2UV2A 2BDJA 3KCKA 2QODA 2BR1A 3MH0A 3W1FA 4ASXA 4QMOA 4F0IA 4H58A 4YTCA 3PFQA 4LL5A 3MH3A 4U41A 3DFCB 3VRZA 2R2PA 3BU3A 1PXOA 3HA6A 1M2QA 5CVGA 3CSVA 4JI9A 4NU1A 4KWPA 3H9RA 4TWNA 2XKCA 4IFCA 3ZLYA 4WSQA 4KIKB 5DT3A 3G15A 2PPQA 3D5UA 3TNQB 1Y6BA 4OBQA 5JGBA 2OI4X 5FEEA 1REJA 1Q41A 4QYYA 3JVSA 4BVUA 4XOZA 5IZFA 4FE2A 5EW8A 4YUQA 5HTIA 1BI7A 5JGDA 4V0GB 3W8QA 4ERWA 4NCTC 2QOHA 2FSMX 4GVJA 3GC8A 4QTAA 3KXHA 3UNKA 4O84A 4HYHA 4DGNA 2C5YA 2P0CA 5JFSA 4QMVA 3K5VA 3ZC5A 5AP6A 4MQ2A 5IQIA 4D4YA 4ANNA 3ZZWA 2BALA 4XP2A 2GS2A 4IZ5A 4RSSA 3SG8A 2QR8A 4IBMA 5AX9A 2XH5A 1NVQA 5DRDA 5FTGA 2UZLA 4D2SA 4R3RA 3POOA 5J7HA 4RIOA 4YLJA 1CSNA 5FTOA 3ROCA 3RPYA 2R3OA 4OTFA 4FV2A 1Q4LA 2XK4A 5AAFA 3AD4A 1YWNA 3HX4A 3PYYA 4FSYA 3GNIB 2BRHA 1WVWA 3UJGA 4DAWA 4X3FB 3QD3A 4PX6A 4O0VA 4C4GA 3C4FA 3G5DA 4I24A 5AUWA 1IAJA 4RC4A 2C3JA 2XIZA 4EQCA 3MN3A 3DV3A 4O6LA 3A8XA 4BYIA 2G01A 3KRWA 3V8SA 4FYOA 3ORIA 1JLUE 4QTDA 5AUVA 3VS5A 3D83A 4OAVB 3VHEA 5GJFA 5A54A 2FSOX 3MY1A 4R8QA 2WEVA 3W8LA 3H0YA 4E4MA 1J3HA 2V62A 3V5JA 4U80A 4EOOA 4IX5A 1P14A 3E8DA 1YXUA 4EBVA 3TUCA 4IJPA 3VUDA 4ZSGA 3R7YA 5HBEA 5HI2A 1NVRA 4O81A 1W98A 2A0CX 4K8AA 4TXCA 4AG8A 3LLAA 4EH6A 4RJ8A 2ITOA 5DNRA 3C1XA 5IQDA 3TJDA 5AR7A 1ZZ2A 3L9PA 4XBRA 4ZS0A 5JN2A 2PVFA 4MKCA 4G3DA 4QT1A 3JYAA 3PJCA 4WNPA 5KMKA 4O6EA 2WMWA 2X9EA 3CGOA 3Q52A 3SRVA 4QMSA 4TT7A 4Q5HA 4D4VA 5IPJA 5F95A 1JVPP 2OW3A 5FGKA 2UZVA 4QMWA 5I9ZA 3A2CA 3EFKA 3QUEA 3F2NA 4DEAA 3UPXA 4O7VA 3W2PA 2QOBA 3OTUA 4L8MA 3LJ0A 5LQFA 3CXWA 1DM2A 1YQJA 2I7QA 2VN9A 4XH6A 4FL2A 5HU9A 3JS2A 3FLZA 4MBLA 5AP4A 2VTQA 4PUZA 3WZJA 4WD5A 3BV2A 3LFBA 2B1PA 5HESA 2ITWA 3O8UA 4M69B 2GHLA 2GHGA 5AIRA 1R0EA 1I44A 2EXEA 4PMMA 1GJOA 5JQ5A 3DK6A 3DB8A 1DI8A 3PWYA 4O0TA 3RVGA 4TWPA 4BICA 4GUBA 4FV3A 4JIKA 3KRXA 1KE7A 4FV1A 2X9FA 2XP2A 3CPBA 4E6DA 1QCFA 1H0WA 3EL8A 5J9YA 1URCA 2HIWA 4LRMA 2XCKA 3P1AA 3PIZA 2W05A 2R3FA 3LJ2A 2BKKA 1W84A 4FKRA 4YTFA 5AV4A 3F3ZA 1IG1A 5I0BA 1H0VA 5ETCA 2PMNX 3OBGA 4BWKA 3FZSA 4FTJA 3S4QA 3O8TA 3QKLA 4I6QA 4CG9A 4XYFA 4DHFA 3QRUA 4C3RA 5JGAA 3PY0A 3H4JA 1V0PA 4C3PA 2JDTA 3OEFX 5CEOA 4BZNA 3IDPA 3D15A 4F0FA 3KRJA 5JT2A 2WQBA 2ZVAA 3IDBA 4MXAA 3TV7A 4GT3A 2Y0AA 5G6VA 3NRMA 3V8TA 3FZRA 3ORKA 4OUCA 4ANQA 3RKBA 5CEKA 4MWIA 1ERKA 3N9XA 4NCTA 2PZRA 3U55A 3KRLA 3UNJA 4L53A 3L8PA 4D28A 3DZOA 4D55A 4F99A 2RF9A 3DBEA 4A9UA 4F1OA 2EXMA 4J53A 3DFAA 5DLSA 5GHVA 3ANQA 4FEQA 3UIMA 4NIFA 3LFSA 4Y5QA 5TKDA 4YJRA 4R78A 5M4CA 2WB8A 4FX3A 2V7AA 4NZWB 3OWLA 3QRJA 1I09A 5FTQA 3POZA 2QG7A 3L9LA 4L42A 4E4LA 4JQ7A 1YHSA 4QQ5A 3VS7A 2H8HA 3C5UA 2A2AA 1PMNA 3QAME 4HYIA 4K9YA 4QO9A 3VHKA 4O86A 5GINE 2Y6OA 3NAYA 3HAVA 3C0HA 4FV7A 4MVFA 5AUYA 2W1ZA 4JLCA 2UZDA 3OG7A 4IAZA 4IVDA 3W18A 3HECA 2ZMCA 3L9MA 4ANLA 4IVBA 5HIEA 3I7BA 2H34A 4H36A 2DWBA 4C4IA 3CTJA 4EH7A 4ZLZA 3UODA 5CENA 5CAPA 3SOCA 5BVNA 5AUZA 2VWXA 4QP7A 4F0GA 4L7FA 2YLEA 3QTSA 3F5UA 4WNMA 3IW8A 3ZUUA 4AUAA 2OFUA 4BFMA 4XEYA 3VULA 3RK7A 3ORMA 3FLQA 4MX9A 3THBA 5F4NA 4YLLA 4FZAB 4XRLA 5CSWA 3LQ5A 5HLWA 3F3UA 3GCSA 5IDPA 1WVXA 3FSFA 4GKHA 1OECA 1M2PA 1Q8ZA 3GXLA 2BZHB 4EORA 2RGPA 3PXZA 3U6JA 1OIUA 2BZJA 1XH7A 3FKNA 4AFJA 1GNGA 3C4CA 3QXPA 1JNKA 3DNEA 3GQIA 5HU3A 1Q8TA 3O51A 2X8IA 3Q4CA 1ZZLA 3PIXA 2UVYA 3HMIA 4BDEA 2CPKE 2IW6A 5L2WA 5C4KA 5KZ0A 4MAOA 3UMXA 4BCGA 3MFRA 3UTOA 4AXAA 4RFYA 4TN6A 3GC0A 5BUJA 4E8AA 5AA8A 4GV1A 4FMQA 2CNQA 3R7UA 3QCXA 4XG8A 4I3ZA 4L6QA 4ZAUA 3PLAE 2ITVA 4R3PA 3WIKA 3AQVA 2XVDA 3E3PA 4G17A 2WMAA 3R21A 4RBLA 2WOUA 4EK5A 4XCUA 3EFWA 5KCVA 4FOBA 2W4OA 2UZBA 5DVRA 3DU8A 5LARA 5E92A 2PUIA 3LQ8A 3HDMA 5D12A 5FP5A 3FMLA 4GYGA 2GNJA 2X7GA 4IW0A 2PVJA 3I7CA 1L3RE 2OZAA 4I0SA 4PL5A 3AXWA 2G9XA 1JPAA 4M68A 4UZDA 4F7JA 4O91A 3UQCA 3AC8A 1ZY4A 3C0GA 3NNUA 3QA0A 4RA4A 5AV3A 3B8RA 4BBMA 1YWRA 2ZM1A 1KE6A 1NXKA 3QKKA 1UNLA 5CI6A 5KMJA 4FSQA 3U4WA 3G6GA 1U59A 4DBNA 1FGKA 5M53A 5LVMA 4KRDA 3FWQA 4RZVA 2UUEA 2XYNA 5EDQA 4MNEA 4TWOA 5DT4A 4QQJA 3V04A 5CYIA 4ZLYA 2P3GX 1GZNA 1JSVA 3NWWA 2CKPA 1ZLTA 2WMBA 2HZ0A 3F2AA 4KINA 4RVLA 5EKOA 3PTGA 2GMXA 2R3NA 3K54A 3QLGA 3FZTA 3O23A 3BGPA 3NUXA 3ZDUA 3KGAA 5DOSA 3FMHA 5EYCA 4MBIA 3UVRA 1GAGA 1GZOA 3K3IA 4S30A 3TZ9A 2HYYA 5BVFA 3LFEA 3PA4A 3F5PA 2XF0A 4CKIA 3QGWA 4M15A 3FL4A 3I5ZA 5IQCA 3FI4A 3TZ8A 2W1FA 2AYPA 3DK3A 5A4CA 4KIKA 4IX6A 4AP7A 3ZM4A 3MI9A 4RPVA 5FEDA 1UWHA 3R01A 4JR7A 4MHAA 3MY5A 4G2FA 4NJDA 4UWBA 3RALA 4CFFA 3UQFA 2WAJA 3FE3A 4WUAA 4AA5A 4O2PA 5HG7A 4CZUA 1KV2A 1BI8A 3VW8A 3NUAA 3U54A 3MBLA 4V0GA 3CTQA 4DFNA 4EHGA 3R9HA 4YZMA 4M3QA 3RMFA 3FYKX 4YZCA 4C4JA 3LMGA 2XEZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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