4MNEB

Crystal structure of the braf:mek1 complex
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
274
structure length
270
Chain Sequence
DWEIPDGQITVGQRIGGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the BRAF-MEK Complex Reveals a Kinase Activity Independent Role for BRAF in MAPK Signaling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 270
sequence length 274
chains with identical sequence C, F, G
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4mneB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4mneB01
2WKMA 4HJOA 4CFVA 3U87A 1JSUA 3BCEA 1REJA 4E6DA 2ITYA 2GS6A 1TKIA 1M7QA 2W99B 5BVEA 3PRFA 2OZOA 3JS2A 4HVGA 4QP2A 3O7LB 3ZRKA 1U4DA 3RAKA 4DTBA 4TYHA 3PVUA 4LI5A 2B55A 2FSLX 4MVFA 4FV7A 5JZNA 3KRLA 1O6YA 4B99A 2F7ZE 3BU5A 4HYHA 4MXOA 1UU3A 3LFNA 2I7QA 1OECA 4JL9A 5CVFA 3I60A 2UV2A 3W2PA 4ZSJA 4KIPA 3AGMA 5B0XA 4D2SA 4CQEA 4GVJA 4CKIA 2OXYA 3PVWA 3HMNA 5KMOA 3BIZA 5BUJA 4U41A 1LEZA 4J96A 4FEVA 3GOKA 2VV9A 1CKPA 3IS5A 3V01A 4L67A 3QX2A 4P90A 3SG9A 5EH0A 2DS1A 2XM9A 3HL7A 4G3FA 1OBDA 2ITTA 1GNGA 3AC5A 1Q8WA 5C4LA 3QRIA 4XEYA 2F4JA 4CFWA 4PPBA 3MA6A 3MJ2A 2YM5A 2VAGA 2OFVA 3DNEA 4UYNA 3P9JA 2Z7QA 4F9YA 3HUBA 4AWIA 4FKTA 5L8LA 4IX4A 5JRSA 2QHMA 3CBLA 1YHVA 4FKSA 4ITHA 2G9XA 3QXOA 2ITWA 4FTJA 1XBAA 2BPMA 3LMGA 1J7UA 3P0MA 5E8ZA 3UOHA 2VX3A 3T3UA 2PK9A 2HW7A 2ITOA 3FE3A 5HO8A 2IWIA 4EC8A 2ETMA 3E7VA 2R3JA 1VZOA 4J95A 4O0UA 4OBPA 4GUBA 1CTPE 1B38A 1REKA 2ZM3A 3WZDA 3POZA 4YSMA 2R4BA 2WPAA 1B39A 1UNGA 3EL7A 2PUNA 3R28A 4BBEA 4USDA 4K6ZA 2J5FA 4GSBA 1UA2A 2YWPA 4BGHA 5DH3A 2VO0A 1H25A 2CN8A 2QOIA 1PKDA 4ERWA 4OTRA 4IEBA 5KMIA 2WXVA 4KRCA 2X2KA 4NCTA 5IA5A 3R8LA 2R3PA 4DH7A 4U44A 1KE5A 4FTCA 4JXFA 4DT8A 4ITJA 2YN8A 4HGEA 4WHZA 4WG5A 5B2KA 3VS7A 4EOIA 4NH1A 4ZTQA 3WYYA 3GNIB 5AUVA 3QTSA 1IAHA 4L3JA 3HMPA 2GS7A 4C2WA 3BE2A 4R8QA 5HU9A 2GQSA 3IECA 5L6WL 5LVLA 3LM0A 5EYCA 4OTQA 4D4YA 4D9UA 3KXNA 2YA9A 3QZGA 4TNBA 3Q32A 4N6YA 4V0GA 1WVYA 3ZOSA 2OFUA 2CLQA 4FEXA 3DAJA 4MK0A 3POOA 4IJPA 4JOAA 4NJDA 3S2PA 3PSDA 4QMTA 3ZBFA 5C8NA 3KCKA 4ALWA 3RMFA 4D0XA 2BFYA 2UZBA 2X8IA 1YI6A 1GY3A 4FKVA 2UW8A 4WRSA 1FMKA 5D41A 5K9IA 4AW2A 4BGGA 3DY7A 4RX7A 5C4KA 3OEZA 2X6DA 3R7OA 3UC3A 1M17A 3V8TA 3UNJA 3VULA 3LW0A 5DNRA 4RVMA 3FI8A 3PJCA 4RT7A 4MNEA 1R3CA 4AGWA 4DGOA 1RW8A 2WGJA 4LG4A 5IUHA 5A4LA 2GQRA 1O9UA 3EQDA 4ZSAA 5AUUA 2V55A 1U54B 1MRYA 3FXWA 3TJCA 3UG2A 4GKHA 2ITZA 3NMUF 3GOPA 3CJGA 1R0PA 2JKQA 4DGLC 1R78A 1YDTE 2OH4A 4IAIA 4UXQA 3RPYA 2UW4A 4RJ6A 5HVKA 4EUTA 2JC6A 2HOGA 3MFRA 4YO6A 4DG3E 2O0UA 4L9IA 4Y85A 4E6AA 2GFCA 3S95A 5AP0A 5H9BA 3R8MA 2X81A 1BUHA 3RI1A 1YXUA 3CKXA 4IQ6A 5CAVA 2P4IA 4CLJA 5T68A 5AUYA 4FTOA 1S9JA 2P0CA 1TQIA 2EUFB 4ZJVA 3JPVA 4IAKA 3RWPA 3H10A 4AP7A 3BLRA 4LGDA 3UQGA 4EOKA 3PPKA 4HYSA 1QMZA 2V5QA 5E91A 3UMXA 3FYKX 4KIKA 5BVNA 3LLAA 4EOQA 3A8XA 3EYHA 3K54A 3TTJA 3TNWA 5J9YA 2C5VA 3P86A 5TOZA 3SA0A 2UVXA 2QOBA 4I20A 4QNYA 1U5QA 2I0YA 3ORPA 4PNIA 3OFMA 1J91A 2YIXA 3HP2A 5CT0A 1T45A 2CMWA 1SM2A 3EL8A 3COKA 4NIFA 5HKMA 4XJ0A 4NWMA 4ONAA 2RG5A 3V04A 4FIGA 3FI4A 4ZSLA 3SW7A 3QCYA 4YJSA 3CTHA 3OCTA 3FQSA 2RGPA 4YGAA 4FT5A 2AC3A 2OU7A 4O96A 4GK2A 5IH6A 4FE2A 2KTYA 2FA2A 3MY5A 4P2KA 2IW8A 3RM7A 2B9FA 5DR6A 4I0RA 3EN4A 3UO5A 2OJIA 4M15A 3WE4A 3FMJA 3IW7A 4M67A 3GGFA 4PMMA 5KMNA 2UW9A 3O71A 3PJ8A 3SXSA 3PA3A 4EL9A 4G34A 2PUIA 2C5XA 3FAAA 2UZUE 3ID6C 4BCMA 2WNTA 3A7JA 3AD5A 5H3QA 3QHWA 1BKXA 3VF9A 4AACA 3NEWA 4EH9A 1E1XA 3UVPA 4FKGA 2CN5A 4EHGA 1NVQA 3O8PA 2YEXA 4ZSGA 3UZRA 5CWZA 3UIBA 1Y91A 4RJ5A 2VWIA 4F6SA 3FZSA 2A1AB 3NWWA 3G33A 1DM2A 1H01A 2Z02A 4QT1A 5EYDA 2PYWA 3R0TA 2YCQA 5AUXA 4CKJA 3D2KA 4KKEA 3ZLSA 3ORLA 4BR3A 3QRTA 3TNPC 3QQFA 4NM5A 4EJNA 4JLCA 5BYZA 3I0OA 4MBLA 3TT0A 1ZWSA 1RE8A 3WBLA 4HYIA 1YRPA 4EH3A 3EN6A 4HOKA 5AUTA 2E2BA 1SNUA 4FF8A 4QP1A 2C3IB 4B4LA 3VW6A 1SZMA 3WZUA 4O7SA 5IQIA 4F9AA 3BYUA 2P3GX 2P55A 3QA8A 4RJ3A 2WMVA 5CEPA 4F08A 4C35A 4C4GA 3PY3A 2XBAA 2GNJA 4KKHA 3LXNA 1PXOA 3B2WA 4QP9A 5D9HA 3DAKA 5EHOA 3KRXA 1SVHA 3D5UA 4TWCA 4ANQA 4GRBA 4CKRA 2UZLA 4I6QA 4C33A 5FEDA 1W8CA 2B52A 2PVKA 1OUKA 3VUGA 5A4TA 3GI3A 3TUCA 1J7IA 3D94A 5M4UA 5EDQA 1MRUA 3JVRA 3TZMA 3SGCA 5FEQA 3I7BA 4C02A 3BZ3A 4BIEA 4ENXA 4NW6A 4QP7A 4MBIA 4DEEA 4QMXA 2UZTA 4B8LA 2YABA 3QKKA 4L7SA 4L53A 3F3ZA 4X0MA 4BN1A 4AZEA 4R6VA 5J95A 3G9LX 4BCPA 4DFZE 2YIWA 3KK8A 5E8VA 1UV5A 2PMLX 4EH5A 2R3QA 1S9IA 3Q9ZA 2GHLA 1YWRA 2JD5A 3IDPA 3K3IA 4JR7A 4QMSA 5ANOA 3NVKI 3LKMA 4C0TA 3RJCA 3H9OA 4JNWA 4FKRA 1H0WA 1XWSA 5K0KA 3TXOA 4E5AX 5IA0A 4RWIA 4PWNA 1QPDA 3JYAA 4K1BA 3R9RA 3K5UA 4PMSA 3LCTA 2ESMA 2B9IA 3IW5A 4YZ9A 5IZFA 4ZSEA 1FINA 1WBSA 2VWZA 3CGOA 3O0GA 4IC8A 2R7IA 4RA4A 4XG9A 4AZWA 4CNHA 4BFMA 3V6RA 1Q97A 3KULA 4DCEA 2QQ7A 4RJ8A 1CKJA 1PXKA 2X8DA 2JBPA 1AQ1A 1NVRA 2EXEA 3BHUA 2UVYA 4MF0A 4F1OA 2BZHB 2X39A 4U45A 2UW5A 3NSZA 4H39A 2VTQA 4JQEA 4MTAA 3PSCA 3U8WA 3VBYA 4ZK5A 4R7BA 3C0IA 3LOKA 4IFGA 4MWHA 5K3YA 4LUEA 1GOLA 1TVOA 2GNHA 5CF8A 1R1WA 3DU8A 3FMHA 4EHVA 4W4XA 4FTTA 3DFAA 5IPJA 3G0EA 4O0XA 4CVAA 3EQBA 3P7BA 3R8ZA 5H8EA 3GU5A 5HD7A 4CTBA 5AA9A 4PY1A 3FHRA 3NR9A 4O83A 3G51A 4AA5A 3AC2A 4KNBA 3I81A 5T6KA 3LQ5A 1OL6A 3CKWA 2F9GA 3PJ2A 3QAME 3UO4A 1WBTA 2IVVA 2LGCA 4I6FA 2WMRA 4E26A 5AUZA 1FGIA 5HGIA 4BHZA 4ACCA 2QVSE 1DAYA 3KXXA 1DI8A 3QZFA 5LOHA 4JIKA 4FNZA 5EKNA 4AUAA 2X9FA 4YTCA 4C4HA 3Q4TA 1HOWA 1H27A 4V04A 3CPCA 2R3RA 4UX9A 2HWOA 1O6LA 2XNPA 3A7IA 5B7VA 2FH9A 5A9UA 4RA5A 5DGZA 2ETKA 3ZEWA 5AP1A 4O0WA 3AQVA 1Q99A 5JQ8A 3IW8A 3FY2A 5M4FA 3EYGA 4S31A 4BIDA 4U81A 3E3PA 1NXKA 4BDJA 5KHWA 1I44A 3ACJA 5F9EA 1YW2A 4BCGA 1OL7A 3DZOA 5I9XA 2HELA 5JGAA 3C4XA 3VBVA 3OF0A 3CD8A 4YJQA 5CF4A 4I0SA 3QTQA 4FL3A 2JBOA 2YZLA 3G90X 3UBDA 1ZY4A 2VTPA 4AGCA 4EYJA 3BYMA 1IG1A 2W1IA 4CFXA 3HDNA 4DLJA 4W9WA 5FLFA 2BTSA 2VWBA 3R7IA 2YITA 5I5ZA 3VAPA 2C6LA 3FLQA 4RMZA 2C30A 4EH4A 2W1ZA 2PY3A 2VTIA 3QZIA 4X7QA 5F20A 3UQFA 3R8UA 1WVWA 3BV2A 5J1WA 4PDYA 4RZWA 1XH8A 2O2UA 2XK6A 4XRJA 5DMZA 4I92A 2PMOX 4C38A 4DTKA 5JZJA 5E4HA 1DI9A 3HEGA 2CKEA 5FM3A 4EZ5A 3P79A 4O7LA 5LVNA 2VD5A 3F5PA 2JFLA 2PVJA 3FQEA 4DA5A 2BZKB 2QOFA 5DOSA 3MIYA 4FT0A 2FVDA 4ZZOA 4XMOA 4M12A 4LRMA 3TJDA 5AR3A 4TWOA 3B8RA 1ZZ2A 4BC6A 4O1PA 5ACKA 4AFJA 4QYHA 5FP6A 3VIDA 1BI8A 4KA3A 3RP9A 2JIUA 3W2SA 3KC3A 3EFJA 4I6HA 3OS3A 3R21A 3KXMA 4U79A 2OZAA 4FSQA 3SAYA 1WAKA 4BB4A 2PPQA 4JR3A 4D4SA 4DE4A 3ZLWA 4UZHA 1VYWA 4AW0A 5HIEA 2CNVA 2RFEA 5HOAA 1XH4A 2G2FA 3SKCA 3DXQA 1UU8A 5I9YA 2OBJA 4EBWA 3MV5A 4MXXA 5HLPA 4EH2A 2I0EA 4MEDA 3LFQA 4RQVA 2H96A 2CNUA 4AFEA 3P5KA 4Y73A 5IQAA 2JAVA 3DDQA 3H0ZA 5EG3A 2B1PA 3DCVA 3LCOA 3UG1A 3BGQA 5M53A 4UXLA 3CQWA 5I9UA 4O2PA 5AV3A 4CD0A 2YM4A 4I5PA 4D5HA 1YKRA 4YZDA 2BAJA 5TT7A 2FYSA 4XBUA 4CYIA 4IX5A 2J50A 2YDIA 5HG7A 3U6IA 4PL3A 2J0MB 3EKNA 2NP8A 4MQ2A 4H3QA 4BYJA 4O7WA 1NY3A 4FSRA 2CNQA 3QUEA 2I40A 3H4JA 4IC7A 4FT3A 3C9WA 1UNHA 3FC2A 3W33A 4YURA 4YZNA 3QCSA 2CKOA 2IZRA 1LEWA 3KMMA 3Q04A 3U9NA 3NCZA 4PPCA 4EHZA 4MXCA 3U55A 4BTFA 3TZ8A 4DBXA 1M52A 2QO7A 5FP5A 4OT5A 4IZ5A 2QCSA 3WF7A 2IN6A 4JBOA 4FG7A 5CI7A 4DFUA 3ERKA 1F5QA 1M2QA 5CTPA 4CV8A 2YACA 1BMKA 3IQ7A 4NZWB 5L2IA 4R77A 3DS6A 4TZRA 3FDNA 2BZIB 3LJ2A 5FXRA 1JSVA 3GU6A 3IOKA 3BGPA 3Q9YA 3QUPA 1P4FA 4FSTA 4KS7A 2WB8A 3TCPA 3NVMB 1VR2A 3F2NA 4JG6A 4RG0A 4FTUA 2IZUA 2W5AA 4AF3A 4DFNA 2W5BA 3V6SA 5BVWA 3DXPA 4DEDA 2JLDA 2OH0E 4IB0A 4A9RA 4BWPA 3DJ6A 3OT3A 3KGAA 5AV2A 2ETRA 4RIOA 5CSXA 4NKSA 4U3ZA 4I4EA 3QKMA 4F9CA 3QWKA 4QTCA 5JN2A 2OF4A 2AUHA 2BUJA 4CEGA 3TNHA 5EQEA 2QOQA 1OIRA 3R01A 3P7AA 3R9OA 5IQHA 4U0IA 4U80A 2VTTA 2XNNA 4I1ZA 3KKVA 1U54A 3UE4A 4IB5A 4ZS4A 3LFCA 1Q24A 3ZSHA 3DBFA 4QPSA 4GW8A 1IAJA 2PUUA 2BRBA 5EDRA 5ETAA 3V5WA 2BDFA 5M08A 1YXVA 2CCIA 3DKFA 4ZTMA 3Q3BA 2IG7A 3ORXA 3KN6A 4BDDA 1LR4A 3VHEA 2XH5A 3PA5A 3T9IA 3IDCA 5KNJA 2VGPA 3UMWA 5GZ9A 4A9TA 3PXRA 1Z9XA 3UC4A 5IA1A 3R02A 3MW1A 1E9HA 3TN8A 4FV6A 5KMKA 4D2WA 2Y4PA 1V1KA 4J97A 3TUDA 4FOBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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