4MNFA

Crystal structure of braf-v600e bound to gdc0879
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
272
structure length
257
Chain Sequence
DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATESILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the BRAF-MEK Complex Reveals a Kinase Activity Independent Role for BRAF in MAPK Signaling.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 77
structure length 257
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4mnfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4mnfA01
5JK3A 2WEVA 2CPKE 3CD3A 3VULA 1BX6A 3T9IA 2W9FB 3VF8A 3AGLA 4FIHA 5LVLA 4A9UA 4YTCA 5AV0A 2B9JA 3CCNA 4ZSAA 3NW6A 4GU6A 5EQYA 4KRCA 1H1SA 4I1ZA 3LXLA 2X8IA 3BGZA 2QOCA 2YM8A 2Z7SA 4I0SA 4N57A 4JAIA 3VAPA 3W2RA 3GCSA 3LLTA 3R7GA 3F9NA 5CEPA 3LW0A 4OUCA 5J5TA 5K0KA 4CSVA 3G0EA 3DK3A 4QMZA 4JBOA 4EL9A 4RX8A 4JIAA 3AD4A 5EHYA 5HQ0A 5AMNA 2J0JA 2E9NA 2CGUA 3RGFA 4IMYA 3NWWA 5DWRA 5CU6A 1L8TA 4P7EA 4YLKA 2QKWB 3UC3A 2E9OA 3VS0A 4DFYA 2IW9A 3C4XA 2C3LA 2YCSA 4YZNA 3WYYA 2UZUE 3TI1A 4L7SA 4Q5HA 4F0GA 4IFCA 3AMAA 5IH4A 3C0GA 4KNBA 1WBOA 4FZ7A 2NRYA 4BYJA 4ANQA 1J3HA 4RIWB 1OPJA 4QYYA 3T3VA 5CLPA 2E2BA 3KK9A 4FV1A 5J7HA 5HZNA 4FKPA 4FYNA 5JGDA 3LE6A 2XK4A 2WHBA 4QP7A 2E9VA 2JITA 2PVNA 5ANEA 3PVUA 4I6HA 4BWPA 3QTRA 2R3GA 5LMKC 3JR1A 2A4LA 1U54A 3PE2A 4MXXA 4EH5A 5FP5A 1ZZ2A 3DAJA 4JBQA 1J1BA 2W17A 1P5EA 3HLLA 3BQCA 2VX3A 3P79A 4BCKA 3IKAA 4DEIA 1BL7A 4GK3A 4OTHA 3TZ9A 1GZOA 3TJDA 4D4SA 4RSSA 3QFVA 3UPZA 4FSTA 4U42A 2HWOA 4O0TA 5LMKA 4EWQA 2BCJA 3NGAA 2W1CA 1BL6A 4ZTRA 3EFKA 5KMIA 4QMMA 1KOAA 2YCRA 2HXLA 1MRUA 4IE9A 3GU7A 4ZLOA 4EZ3A 5AUVA 1NVSA 1GOLA 4FMQA 4JR3A 3UVQA 3VBWA 4AZVA 4MXOA 2OZAA 3V5PA 4XG7A 4YJSA 5IUIA 3GP0A 3TV7A 4OTDA 3RPSA 4ACCA 5DA3A 3PWDA 4XG6A 2YLFA 1X8BA 4HVSA 3HECA 4FV9A 3Q9WA 4F9BA 5KX8A 4K2RA 3EKKA 4IC7A 5BNJA 1SVGA 3ORPA 4L42A 4EYMA 2ITVA 4BR3A 3VBTA 4U6RA 3ITZA 5AP7A 2QOHA 2VWXA 2WMVA 3DT1A 3PXFA 4FZ6A 4IAIA 3FHRA 4IB0A 5IEYA 4YJNA 5KMKA 5AV1A 3K5VA 3A62A 3LCKA 4JR7A 3W33A 1H1WA 1YOLA 2XNMA 3MPAA 4O0YA 3RWQA 3UNZA 4AT4A 4D2VA 4DGNA 1OUYA 4A9SA 2P55A 2I0EA 3DBEA 1LPUA 1AGWA 1ZARA 4HGTA 5FEDA 3D94A 4U41A 3RHXA 3D83A 3LVPA 5EDRA 4C58A 4YSJA 3QHWA 4FC0A 3RI1A 3PLAE 2RFNA 3NEWA 4C4FA 2J90A 3FYKX 4Q9ZA 4G3EA 4ZMFA 4DH5A 5FEQA 4BL1A 2R3IA 4X3FC 4C3PA 3DKFA 1YOJA 4GV1A 3SW4A 4JJRA 1J7LA 4DCAA 4RWJA 1K2PA 4NCTC 5AUUA 1OL1A 4TW9A 3F2RA 4BC6A 2JIIA 4P90A 4IB3A 4K6ZA 5ACBC 3DJ7A 1LUFA 3FMMA 4M69B 1OUKA 2WNTA 4DEHA 4EH6A 3QRIA 4ERKA 5FP6A 3DJ5A 4YP8A 3ZEPA 4BZOA 2VWYA 2ZV8A 3UDBA 3UYTA 3QUEA 4S31A 4OTIA 3OD6X 4ALWA 4K8AA 4L67A 4NCTA 4AOTA 1PMVA 4RT7A 4EJNA 5H9BA 1DI9A 3CGFA 5HU3A 4IM2A 5JH6A 3EZVA 4CLIA 4AGCA 3AMYA 3H4JA 4H1JA 1H27A 4ZZNA 4B8MA 2BMCA 4G1WA 1H24A 4XRLA 4EKLA 5JGBA 3FPMA 4EOQA 3H9OA 4AZTA 3DLZA 5I9YA 4AACA 1OBDA 2BHHA 3ZUTA 4G6OA 5CEOA 2X7GA 4FL2A 1ZWSA 3NSZA 2PUIA 3VW8A 1Z5MA 4HZSA 3H0YA 2EXMA 1SYKA 4CCBA 3K2LA 4ZLYA 4WHZA 2X6DA 3RCJA 1W8CA 3B8RA 3R63A 5M4CA 2EB2A 2QG7A 3QKMA 1JKTA 2A2AA 4GT5A 4YZCA 4C62A 2GHMA 4QMNA 1JPAA 3LM0A 3T8OA 4ERWA 5HIEA 4E5WA 3KMMA 4ANNA 2BTRA 3MY1A 5C8NA 1M17A 4WNMA 3Q5IA 2R5TA 3I60A 4O6LA 2HW6A 4YSMA 3NW5A 5CAPA 2XIXA 3E3BX 3O23A 5C8KA 3PY0A 2J7TA 2UVZA 4BHNA 4MWHA 4IM3A 3FPQA 3C0IA 4UMUA 5IUHA 2Z8CA 4CZTA 3FYJX 4IXPA 4JL9A 3VRZA 2I6LA 2NP8A 4RWIA 2C6KA 5CU0A 5M06A 2YEXA 4MK0A 1W83A 2XH5A 3M2WA 3QA8A 3RALA 3MSSA 3ODZX 4C2VA 4DLIA 3LXPA 5K4JA 2H9VA 2R2PA 4FK6A 3MFRA 1H8FA 4FT5A 3FXZA 3NYXA 1UNGA 1YXXA 3QTXA 3AMBA 3TDVA 2XKDA 2B55A 3Q6UA 3BKBA 3UG2A 1ZYLA 5DPVA 4ZLZA 2ETRA 3WZKA 4YNOA 4YZMA 5BPYA 5CSXA 4IJ9A 5JZJA 2GNFA 4HPUE 4EH7A 2V7AA 5AWMA 3UNJA 4QP9A 5CSPA 2R3HA 2WMBA 4R6VA 3KRXA 2X2LA 4OTGA 4RC2A 5JZNA 4C2WA 5IA0A 5LVNA 2VX1A 4JRVA 1OECA 2YJSA 3IECA 3R0TA 1YHWA 2RG5A 3QRJA 2EU9A 2VTSA 4E4LA 3CLYA 1SVHA 2YM5A 3EJ1A 1BI7A 4M14A 4R5SA 4TY1A 4CFMA 3V8SA 2HWPA 4YJUA 1PYXA 2I0HA 4OTPA 2IPXA 4YC6A 4ID7A 3F2AA 4EH4A 3IW7A 1O9UA 5AP4A 3EKNA 3DXPA 3F61A 3V5QA 2IJMA 3DAKA 3GCQA 3JS2A 4EI4A 1CM8A 3REPA 5CI6A 5FXQA 5C4KA 3ZM4A 4I93A 2VGOA 2YIYA 2FSTX 3LQ8A 4NM0A 4FIJA 3UC4A 5JKGA 4S34A 4DFBA 3TNHA 4GU9A 2WQBA 3LOKA 4CMTA 5H3QA 1KV1A 3EHAA 3VS3A 4QT1A 4KIPA 2EB3A 4KIKA 1Z9XA 3CGOA 3E87A 4MXYA 4E4MA 3IS5A 3ZRKA 4CD0A 1JLUE 3IOPA 4HZRA 4YTHA 2GSFA 3AC8A 3TUCA 2YWVA 4GS6A 1U4DA 4IB5A 5LVPA 5HBJA 5G6VA 2C3IB 3LXNA 3F69A 4LG4A 5HNBA 4A9RA 3FDNA 4E1ZA 3FL5A 5M57A 2IG7A 3FEGA 3MIAA 2VNWA 3P08A 3C50A 1STCE 5HEZA 3KULA 4QYGA 4YZDA 2XNPA 5LCKA 3K5UA 2IW8A 3D2IA 4ITIA 3E92A 3NUXA 1U46A 3DZQA 4AU8A 4EONA 4QTAA 3BX5A 4UN0C 5EQPA 3MW1A 1Q99A 5E91A 3MBLA 3ODYX 1YHVA 3SLSA 3G9NA 3TG1A 2GQRA 1PXIA 2Y4PA 2I1MA 1DS5A 1OIUA 2JEDA 3L8PA 4I0TA 4AQCA 4DGMA 5BVFA 5M4UA 3D5WA 4FSWA 4IAYA 3MTFA 4AGDA 1ATPE 3E93A 4UMRA 3HMOA 2BILB 3LPBA 4WBBB 4CV8A 2OFUA 3QRTA 4F6SA 2XMYA 2WFYA 2C5VA 3QRKA 1H08A 1Z57A 2R64A 4KKGA 3ZDUA 4PMMA 1Q3WA 3TKUA 1H1RA 2FSLX 2ITYA 4BKJA 2B9HA 4J97A 4EWHA 2YACA 2O2UA 4J99A 5ACKA 4D2TA 3H30A 4CGAA 2UZDA 5AIRA 3GU4A 4BB4A 1F3MC 2OFVA 1P4FA 4IEBA 4RC3A 2FUMA 3LM5A 3SXRA 3BV3A 1J7IA 3D5VA 3MY5A 1OM1A 3FLQA 1TQMA 3F5GA 4DLJA 4G17A 3A7HA 2RKUA 4EQMA 2DS1A 2C5YA 3PPKA 4FNXA 4YU2A 1IA8A 3OP5A 4GEOA 5CEIA 3R7VA 4L8MA 2GQGA 2C5NA 3CTJA 4FL1A 2PZIA 4FSUA 5EI8A 5CS6A 5HVKA 1WVXA 4CV9A 4DBXA 1BKXA 2OIDA 4FTLA 3GU8A 4AA5A 2YIQA 1GIHA 4XJ0A 1LEZA 4LRMA 4S32A 5ANKA 4USFA 2AUHA 5CENA 3NCGA 3G90X 4IANA 3AC3A 2BRMA 4PDSA 2XVDA 4Y95A 3MFUA 3RK9A 3V5TA 3DJ6A 4FT3A 4BI0A 3DK6A 3CJFA 3V8WA 4NJDA 3N4TA 3F3ZA 3EYGA 3FMNA 3NNWA 2WTCA 4PMSA 2ITOA 4RX9A 3AC5A 4FKGA 3D14A 2H6DA 2Z02A 3JXWA 5HLNA 4FIIA 1W82A 3Q32A 5EM8A 4FTIA 3NDMA 4YJVA 3TDWA 2ONLC 3UZPA 2R9SA 5I4NA 5JN2A 4CFNA 1CKJA 3L9NA 3HRCA 4ZSLA 1YXVA 4OR5A 1OZ1A 2CGXA 4ACGA 3F7WA 4D1XA 4BTJA 2ESMA 4XCUA 1OL5A 3W8QA 4FE2A 3KXXA 3R8PA 1OPKA 4F4PA 2WQOA 3Q60A 4WD5A 4IHPA 5AP2A 1OIYA 5D1JA 4PDOA 4ASEA 4LMNA 4FNYA 4C8BA 5IH5A 4BDGA 2JLDA 2X4FA 3FY0A 1WBWA 1PXPA 1W98A 2WQMA 3NAXA 5AUXA 5A6OA 5IISA 5B7VA 2BRBA 3TJCA 4O21A 5E8TA 4E5BA 2C6TA 4F6WA 2J0KA 3N9XA 3DXNA 4XS2A 5IH6A 4PP7A 4ANBA 3R71A 3HA6A 2Z2WA 3AGMA 4F9AA 3R2BA 3W1FA 3LFAA 3PUPA 3ZXTA 2VD5A 2HY0A 4ASXA 3VF9A 1NA7A 4C4EA 3KU2A 3EFWA 1WCCA 3A4OX 3G51A 2QODA 2BKZA 2NRUA 2A0CX 2WZJA 2X9EA 3QQJA 3PTGA 4JQ8A 4MKCA 5AIKA 4Q5EA 3PSDA 4YTIA 5M44A 3KREA 3NVMB 3KRJA 4DGLC 4TN6A 5GINE 2UW0A 2VWIA 1SMHA 2J51A 4M0YA 2VTTA 5AUYA 4RVMA 2UW4A 4IIRA 3ZEWA 5FEEA 2QOFA 2FGIA 3MY0A 4LRKA 3RAIA 3UO6A 4QMYA 4Z7HA 3E8EA 5DLSA 4TKSA 3FI3A 3QQHA 3AXWA 2XK9A 3R9HA 5IA2A 2C5XA 2OGVA 2WQNA 4L3PA 3SXFA 2BRHA 2VTRA 4XP2A 3DBCA 1UU9A 3MYGA 4FSQA 5DR6A 4DFLA 4ZS0A 3T3UA 1DAWA 4HYHA 2PULA 3PVBA 2PZRA 4EK4A 1YDTE 2VTAA 3RVGA 5IEXA 4WA9A 3GVUA 2C6OA 5D7AA 4MD7E 3MA6A 3BEAA 4ZK5A 3FHIA 5L4QA 2C69A 4EOJA 1G8SA 1WBPA 3R8UA 4UWBA 3LFSA 5IUGA 4R1VA 1Q8YA 3M11A 4JDJA 5FTGA 4U81A 2UW5A 3BYOA 4DT8A 2GS2A 3F2NA 3I0QA 3TN8A 3P78A 4X2JA 3VHEA 4UWYA 4C4HA 3UIXA 4TYGA 3W16A 1OL6A 3BPRA 1UU7A 4QPMA 5AP3A 2JDOA 4KABA 5BYLA 2LAVA 3PRIA 5H8BA 2CKOA 4G16A 3QTQA 3RINA 3ZZWA 3ETAA 3OTVA 4ITJA 5BYZA 2R7BA 2XKCA 3LQ3A 3H0ZA 4K9YA 2XCHA 4JDIA 1JSTA 1UKHA 4RGJA 3L8XA 3PJCA 4ZTLA 2P4IA 4DG0E 3VWAA 4EHEA 3QHRA 2X8EA 4GG7A 1JQHA 3BHVA 1U59A 2ITTA 3DBDA 3P7CA 4R3RA 4BTMA 2QNJA 5HG7A 3R9NA 2VO3A 4TPTA 1R3CA 1ZRZA 4A9TA 2CN8A 5BQ0A 2W1EA 3FI8A 5CT7A 4JX7A 3LCSA 4FTQA 3OG7A 4PTEA 3EN6A 4LV5A 4F9WA 1V1KA 4GVAA 3O51A 4RA5A 3OBGA 4AOJA 5L6WL 3PZHA 3KXZA 2CNQA 4XYFA 4CTCA 4CYJA 2PMNX 5BVWA 1BUHA 1RDQE 2PHKA 3QD4A 2PL0A 2ERZE 3BU5A 3PXZA 4OTFA 3QALE 4GSBA 4IC8A 3WF8A 3BZ3A 5CANA 3UIUA 2R3QA 4BCGA 4E6DA 2H96A 3ZO1A 3D4QA 2WTVA 3GCPA 4JS8A 4RZWA 2GHGA 3QC4A 2F2CB 4GJ3A 4KAOA 3OXZA 3SQQA 3KXMA 4R7BA 2VAGA 3G0FA 4FODA 4L53A 5KMJA 4MNEA 3BGQA 4H3PA 1HCKA 3MPTA 4FT9A 1XQZA 2C1BA 4BYIA 3ZO3A 4WSQA 3VS2A 5HTIA 4IW0A 4LOQA 2UW8A 5EM6A 4M8TA 5KZIA 3PIZA 5CI7A 2PVJA 3NX8A 1IASA 3Q4ZA 3NZ0A 2XIRA 4U79A 2YCQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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