4MQ1A

The crystal structure of dyrk1a with a bound pyrido[2,3-d]pyrimidine inhibitor
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
346
structure length
345
Chain Sequence
VYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Pyrido[2,3-d]pyrimidines: Discovery and preliminary SAR of a novel series of DYRK1B and DYRK1A inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1
total genus 122
structure length 345
sequence length 346
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4mq1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4mq1A01
4APPA 2HW7A 4ONAA 4O0TA 4Q5HA 3NIEA 1FVRA 1SVEA 4FZDB 3QTUA 3DB8A 3QRJA 4I4EA 4GVAA 1T46A 2YERA 3A7IA 4HCVA 4HVGA 1GZOA 5EDQA 3BYSA 3C1XA 3VF8A 3SW7A 3BU3A 3QTSA 1QCFA 2UZBA 3QZHA 3RPOA 3KKVA 4JNWA 4I21A 4YTHA 4DFBA 3BLQA 3LOKA 2HZ4A 3F3TA 1IR3A 3FMHA 3EQDA 2C6OA 4NWMA 3LMHA 1GJOA 1Q24A 5F95A 4HZSA 3E63A 4AX8A 4R77A 2CKEA 4AE9A 1SZMA 3DLSA 4DTAA 4FK3A 2W17A 1ZYSA 4GK2A 1UU8A 5HE2A 5C1QB 3L8XA 4B8MA 2QOBA 2XIKA 2A27A 1YXTA 5FM3A 5FQDC 4CEGA 4HVSA 4J8NA 4AG8A 1GNGA 3CJFA 2VWXA 5JQ8A 2GU8A 4R3PA 3VS2A 4OGRA 3VHEA 4FTKA 5J9LA 2C3JA 3R7OA 3AXWA 5B7VA 2W5HA 2X2LA 2VTJA 2ZMDA 5DG5A 3W18A 5J1WA 4XMOA 1XH5A 3U54A 2XNPA 4D2WA 2B1PA 4ANLA 3ID6C 3AMAA 3FKOA 4CSVA 3LJ2A 5DPVA 3MFTA 4IEBA 1U5QA 4ZSJA 4PP9A 5H8GA 2WTKB 2HZIA 3GEQA 3QQLA 4YNOA 3AOXA 5IQAA 4YSMA 3TDVA 4QYGA 3FQEA 4Z16A 3F2AA 5CS6A 2PYWA 5E8VA 2J51A 4QMYA 3VUDA 4DFUA 2XB7A 3HA6A 2BPMA 4QD6A 1AQ1A 3C5UA 3EOCA 3DCVA 1ZYLA 4MBJA 4FVPA 5F20A 4H1MA 2IJMA 4F99A 3MFRA 3MW1A 4NCTC 4WG4A 4JIAA 3CSVA 4GUBA 4L3PA 4B4LA 4EJNA 3PIXA 1TQMA 3QGWA 4A06A 2UVZA 4FTJA 3UPZA 3Q6WA 4PF4A 5EYDA 2OJGA 4JDJA 1Y8YA 2VD5A 3OWPA 5KBRA 2UVXA 4YP8A 3BLHA 4CLIA 3PRIA 3H30A 4CMUA 4QYEA 1E1XA 5BYYA 2OJIA 2C1AA 3D7TB 1STCE 4GCJA 3P7CA 3U6JA 4GV1A 4CVAA 4B0GA 4CZUA 3FLYA 3NCGA 4OLIA 1FQ1B 3EKNA 4UN0C 2X2KA 4YC6A 4D1ZA 4W4VA 2PZ5A 1XH4A 4I0SA 3TN8A 4DLJA 3G51A 4FV4A 5EH0A 1Y6AA 4A9SA 3UGCA 3G0EA 1PRYA 1FGIA 3ORZA 2VX1A 3OT3A 2IW8A 3BIZA 1HOWA 3T3VA 3D2KA 3ATTA 3D4QA 1JAMA 1DAWA 2YCQA 4LMNA 3CQUA 3G9LX 3ZTXA 2YN8A 4IFCA 4M66A 4BZNA 4U41A 4ZLOA 3ZLXA 1MRVA 4QPMA 2J0IA 4Q9SA 5HCYA 3W10A 4YLKA 4ZJVA 1S9IA 4BDDA 1M14A 2VX3A 5C4LA 2UZVA 3PIZA 3R30A 4M15A 4FIIA 4EOIA 2WAJA 4RVLA 4K18A 1A9UA 3QGYA 1H00A 3NGAA 4ASXA 4KAOA 4RQKA 2BZIB 4AW2A 5A4LA 3C4CA 1XBAA 1BL7A 4ENYA 5M06A 5FTQA 2XIZA 5IQFA 3R8UA 2GNGA 3TKHA 5KMMA 2UZTA 5T3QA 2ITPA 4FT5A 4WA9A 2OLCA 2QOCA 4YLJA 1G3NA 4HVHA 4ZY5A 1YDTE 3ZO3A 4XG9A 2ITZA 3P86A 4EOSA 3R7VA 3SLSA 3TL8A 2C30A 5CVFA 4BTMA 3BQRA 4RQVA 3RAWA 3V6SA 3UYTA 4MAOA 4E93A 1DI8A 5AUUA 3E8DA 5IDNA 3C4WA 1KE8A 5FTGA 3F7WA 3LIJA 3ROYA 5A6NA 2G2FA 4EQMA 1T45A 3HV6A 4AFEA 5IQIA 4RJ3A 4NK9A 3VVHA 2OH0E 2FSMX 2GFCA 2ZJWA 3B2WA 5B2KA 5I9UA 3VS0A 3BV2A 5HNIX 2BDJA 3QD3A 2YAAA 1Y6BA 3ULZA 2CMWA 5E8XA 3RK5A 5I0BA 3HECA 2SRCA 1XWSA 2BRHA 2QU5A 4HCUA 3OFMA 5HE0A 3BRBA 4L45A 2RFNA 4RX5A 5LMBA 3IGGA 4V05A 1NVRA 2BR1A 2FA2A 3HA8A 2WMTA 4FTIA 3WF9A 4PPBA 4AE6A 3AD4A 5LMKC 1KV2A 4BDHA 4RIWB 3TIZA 2CDZA 2C6KA 2UVYA 5L2WA 2QNJA 4LOOA 4DGOA 4GYIA 3KVXA 3TTIA 3DGKA 3UPXA 1NXKA 3PPZA 3PXQA 4UWBA 4C4HA 1OL2A 4EBVA 2WZJA 4BY9E 4BWPA 3OMVA 4C4JA 2QQ7A 2P4IA 5CZIA 4BGQA 3UDBA 2DWBA 1XBBA 2JBOA 4R7HA 4EYMA 4ZY4A 5K5NA 3MH0A 3NUNA 5AA8A 1IG1A 4WUAA 1JLUE 4FYOA 4FG9A 5AUVA 2YAKA 3F2RA 2F7ZE 4YBKA 3DZQA 4BCHA 4AZFA 1ZYCA 5LWNA 3IDPA 4FSWA 1MP8A 2XEYA 2RIOA 4O86A 5HO6A 5CENA 5CF4A 4F9WA 3LLAA 2HY0A 4QQTA 4FKSA 3VC4A 3EQCA 3MB6A 2X2MA 5DWRA 4HGLA 2C47A 3R7EA 3N4UA 3AC1A 5BVEA 3R02A 4KSPA 2RKUA 3EKKA 4CKIA 2R0IA 3BCEA 3F5UA 3PYYA 3TKUA 3G2FA 3TUBA 3TV7A 5HKMA 4H3PA 4I6QA 4P5ZA 4B7TA 5FWKK 4K33A 4MXOA 4FEUA 3C5IA 3CD3A 4HPUE 3D14A 2H8HA 2X7OA 5AM6A 4Y46A 4ZMEA 4XLIA 4FSUA 5GJFA 4BCMA 2CN8A 5BQ0A 2HZ0A 2X6DA 3OROA 4YZBA 3SV0A 3VNTA 4U0IA 2CCHA 1YXSA 3I6WA 1PXOA 2J5EA 2UZOA 3BQCA 4Z9LA 5CAQA 5J9YA 1LUFA 5M56A 4X6QC 3WYYA 4KWPA 5KMKA 4AP7A 5JK3A 2JFLA 5CTPA 4QMNA 5IQBA 3LXKA 5EQYA 3FUPA 2B55A 4I5PA 4AN3A 4O7RA 1LEZA 3WF5A 2W96B 4BHNA 3KQ7A 4FUYA 3A7GA 5A4CA 5KMLA 3UG1A 5K0KA 3OBGA 3ZM4A 4UWCA 3DS6A 3UG2A 4CRSA 4Q2AA 3OUNB 4S33A 4TYGA 3WI6A 3P5KA 1F0QA 2VTHA 1OKWA 4Y8DA 3PE1A 1P2AA 4U3YA 5LVLA 5ICPA 2JIUA 3FQSA 1YOJA 3LCTA 5AR3A 4IM0A 1YRPA 4QP2A 4U43A 4FNYA 2ITWA 2XJ2A 2HZNA 3FLZA 5E8YA 4F7LA 4O81A 3OWJA 4MH7A 3FL4A 1WBTA 2PUPA 4A4LA 3LCSA 2C4GA 2O63A 1ZXEA 5DH3A 1BLXA 3VUMA 4BI1A 1KV1A 3NUPA 4DINA 3F3VA 5E1SA 2NRUA 3DKOA 4RFZA 1B39A 2XYNA 4M84A 4C4FA 4NW6A 5HGIA 3BHUA 3ZLWA 4IFGA 5EI8A 3DQXA 3NVMB 3IW8A 5ANKA 4G16A 5AR4A 3VUTA 4ID7A 4LV8A 5IISA 1M52A 1U54B 2UZEA 2UW5A 4GSBA 3KULB 5EOBA 5LCJA 5EQEA 1BYGA 4K11A 2ZM1A 3ZONA 5CX9A 5DMZA 3PP0A 2QOHA 4QMSA 4EONA 4DEDA 5JFWA 1BI8A 4JLCA 4FTLA 3L1SA 4HYHA 3L9NA 2VWIA 4AW5A 4F63A 3GGFA 3DDPA 4LL0A 2VO7A 3WIKA 2OFVA 3FC2A 4KS7A 3QX4A 3GCPA 3BZ3A 4V01A 4MNEB 4PWNA 2GSFA 5JRQA 3C4XA 4FKUA 2XKDA 3TZ9A 2W0JA 4YJNA 4EH3A 4XRLA 4AOJA 4MXZA 2Z8CA 3R9HA 3W16A 5JMSA 2Y6OA 3BI6A 4BBEA 3FMNA 1YI4A 5H3QA 5EW8A 1LEWA 3QTXA 2X0GA 4FKTA 2ZV9A 4KS8A 3RWPA 4I0TA 1SMHA 2OSCA 3MFSA 4TW9A 4L44A 4GU6A 3ZSHA 5L8KA 5TKDA 4PMSA 3UZRA 3DFAA 4U9AA 4FT7A 4C37A 2C3IB 3EN9A 3L8PA 4CFVA 4EOKA 2ZDTA 4KRDA 2GHMA 1TQPA 4C59A 5DEWA 5HESA 2B9JA 2R3JA 2QOIA 2JDVA 5CAUA 1O6LA 3UO6A 1YWNA 3F2NA 5ETIA 3T9TA 4IX6A 2C0IA 4O22A 2VNYA 1UWJA 4G9CA 5B0XA 2WTKC 3Q9WA 5HBJA 1K9AA 4RIWA 4QMMA 4FL3A 2JKOA 1H1WA 4O0WA 4D28A 2PMIA 2WB8A 4C7TA 1E1VA 3MBLA 4ZSGA 2VTRA 2ZB0A 3EB0A 3UZTA 4HGEA 2QOLA 4F9AA 5DVRA 5AP3A 4CZYB 4ACDA 4E4NA 5I3RA 5CT7A 2YHVA 3BYVA 4TWOA 4K77A 5CNOA 4UXQA 1FPUA 3FL5A 1FBNA 4TT7A 1XBCA 2VRXA 4TZRA 4UYNA 3PJ1A 3A7FA 3E8NA 4X2KA 2CN5A 1JKTA 3QA8A 3B8QA 1KE9A 2A4LA 1H25A 3NVKI 4G6LA 4IDTA 4O7LA 3P9JA 2OF2A 3F3ZA 4JT3A 4TRLA 2ZAZA 5AP7A 4W4YA 3ULIA 4K8AA 3GB2A 2XEZA 3E3PA 3R1SA 4U80A 3V8SA 4G31A 4DH1A 4EHGA 4FTOA 4WD5A 4M68A 3OT8A 5LCKA 3FHIA 3VBXA 3RPVA 2QHNA 3GU5A 2C68A 4FTNA 3CC6A 2OKRA 2WXVA 5DT4A 4UV0A 2WMBA 1WCCA 4OTWA 2R3PA 3H9FA 3FZ1A 4P2KA 4IB5A 2QR7A 3VUHA 4BN1A 2YM7A 3OEZA 4MWIA 1FOTA 3QKLA 5HG7A 5JFXA 2IVUA 4NL0A 2BRBA 4MQ1A 2GNFA 4J95A 3S1HA 2H96A 2VWWA 3FZPA 2VTNA 4ZTMA 2BFYA 2FSLX 4LFIA 2EU9A 5M51A 3IO7A 3TIYA 4F1MA 4E5BA 2EWAA 5J87A 5L4QA 3RWQA 4JIKA 2GNJA 3Q32A 2OIBA 2BROA 4N0SA 4QQJA 4EK8A 2RGPA 4E6DA 5BMMA 3OXZA 4FIEA 3R7GA 4XYFA 3C51A 4FV1A 4BWKA 5FP6A 1UNHA 2IG7A 3GC8A 3QQKA 4XG7A 5IH4A 2VTOA 1YXVA 2ITYA 4JRVA 5JFSA 2WO6A 4RIXB 4H36A 2A19B 4AU8A 3W2QA 5IA0A 3QU0A 3E87A 4V0GB 3FPQA 5TE0A 3DKGA 3GENA 5F1ZA 5FEEA 3HV7A 4TYJA 3I7BA 4GK3A 4ZK5A 3SKCA 5IUHA 4DT9A 4IX3A 5C27A 2GS2A 4YJSA 3DJ5A 2J2IB 4F0FA 2HENA 4UX9A 2JKKA 4BIEA 4RX9A 4BCJA 3UOJA 5TO8A 4AF3A 3OZ6A 3PPKA 2RSVA 4X3FB 4Y5QA 4M0YA 4CCBA 2O64A 4RIYA 1U54A 5AP4A 4RLLA 2WTJA 4DTKA 2XNOA 5G1XA 3F61A 4W8EA 4CKRA 4B6LA 2I0EA 4RVMA 1PXKA 3NNVA 4NUSA 2JDSA 3MS9A 3FZOA 4Y73A 4AOTA 4J97A 5ITAA 2J0JA 2UW6A 4ZY6A 5KMJA 4O0UA 2C6EA 3BWJA 3QZFA 3EQIA 2PULA 4TWCA 4UMUA 4YBJA 1JSTA 2FSOX 1PMNA 3R21A 3MIAA 5I9WA 2GMXA 3OHTA 5J95A 4D2SA 1ZWSA 3RTPA 3MY0A 3S3IA 4BFMA 3TV4A 5M4CA 5B2LA 5E92A 5KCVA 3NNUA 3OP5A 4TN6A 2WQBA 3FSFA 3JS2A 3MTFA 2XA4A 3PG3A 2YDJA 4EK6A 3GQIA 4C2VA 2UW3A 3I60A 4ZOGA 3MH3A 4X2FA 1MUOA 2WFYA 1OBGA 4QMPA 3UNKA 4A07A 5KHXA 4P90A 1OKZA 3KGAA 1PXJA 4FTAA 4B8LA 4C3PA 5CU0A 2GQSA 3HAMA 5IH6A 5AMNA 4OTFA 5TT7A 4IIRA 3H0ZA 1R39A 2XMYA 1CDKA 2DQ7X 2W7XA 4FMQA 4F6SA 1P14A 3WARA 2HCKA 4C35A 3KK9A 2YA9A 3IKAA 4WUNA 4O6EA 1G8AA 3T3UA 2W1HA 2WTWA 4R3RA 4ZJJA 4A4XA 3DY7A 4GG5A 3QTRA 1L3RE 4FG7A 5CVGA 4X3JA 5DLSA 2YFXA 3H3CA 3PJ2A 5K5XA 4ZMFA 5KMNA 2BAQA 4W4XA 2O8YA 4XV3A 4DG3E 3RP9A 2EVAA 4RJ8A 3E88A 4ITJA 3AC5A 4GT4A 4IHPA 4ANQA 2C5VA 4MXAA 3BU6A 4F0IA 4O27B 5IPJA 3RM7A 2WMQA 3BLRA 4E8AA 3DK6A 3ORKA 3ZS5A 4U8ZA 4H05A 3BHYA 4OBOA 1OVEA 3HRFA 3OD6X 3OW3A 3QWKA 4KABA 1GIIA 4DCEA 2DS1A 3VHKA 3VS3A 2ACXA 2WMAA 2NP8A 2Y7JA 3GCSA 3OCGA 4HOKA 4EZ3A 4PDSA 2IVTA 4O0YA 4CYJA 2PVLA 3COKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4APP A;  2HW7 A;  4ONA A;  4O0T A;  4Q5H A;  3NIE A;  1FVR A;  1SVE A;  4FZD B;  3QTU A;  3DB8 A;  3QRJ A;  4I4E A;  4GVA A;  1T46 A;  2YER A;  3A7I A;  4HCV A;  4HVG A;  1GZO A;  5EDQ A;  3BYS A;  3C1X A;  3VF8 A;  3SW7 A;  3BU3 A;  3QTS A;  1QCF A;  2UZB A;  3QZH A;  3RPO A;  4AQK A;  3KKV A;  4JNW A;  4I21 A;  4YTH A;  4DFB A;  3BLQ A;  3LOK A;  2HZ4 A;  3F3T A;  1IR3 A;  3FMH A;  3EQD A;  2C6O A;  4NWM A;  3LMH A;  1GJO A;  1Q24 A;  5F95 A;  4HZS A;  3E63 A;  4AX8 A;  4R77 A;  2CKE A;  4AE9 A;  1SZM A;  3DLS A;  4DTA A;  4FK3 A;  2W17 A;  1ZYS A;  4GK2 A;  1UU8 A;  5HE2 A;  5C1Q B;  3L8X A;  4B8M A;  2QOB A;  2XIK A;  2A27 A;  1YXT A;  5FM3 A;  5FQD C;  4CEG A;  4HVS A;  4J8N A;  4AG8 A;  1GNG A;  3CJF A;  2VWX A;  5JQ8 A;  2GU8 A;  4R3P A;  3VS2 A;  4OGR A;  3VHE A;  4FTK A;  5J9L A;  2C3J A;  3R7O A;  3AXW A;  5B7V A;  2W5H A;  2X2L A;  2VTJ A;  2ZMD A;  5DG5 A;  3W18 A;  5J1W A;  1ST4 A;  4XMO A;  1XH5 A;  3U54 A;  2XNP A;  4D2W A;  2B1P A;  4ANL A;  3ID6 C;  3AMA A;  3FKO A;  4CSV A; 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