4NFNA

Human tau tubulin kinase 1 (ttbk1) complexed with 3-({5-[(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)methyl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-yl}amino)-5-bromophenol
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
DILPANYVVKDRWKVLKKIGGGGFGEIYEAMDLLTRENVALKVESAQQPKQVLKMEVAVLKKLQGKDHVCRFIGCGRNEKFNYVVMQLQGRNLADLRRSQPRGTFTLSTTLRLGKQILESIEAIHSVGFLHRDIKPSNFAMGRLPSTYRKCYMLDFGLARQYTNTTGDVRPPRNVAGFRGTVRYASVNAHKNREMGRHDDLWSLFYMLVEFAVGQLPWRKIKDKEQVGMIKEKYEHRMLLKHMPSEFHLFLDHIASLDYFTKPDYQLIMSVFENSMKERGIAENEAFDWEKAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of human tau-tubulin kinase 1 both in the apo form and in complex with an inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tau-tubulin kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4nfnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4nfnA01
3GC8A 5BVOA 3GBZA 2YAAA 4YBJA 4A7CA 2XRWA 1NVRA 3VS4A 3VBYA 3WILA 4DFXE 3U9NA 3QRTA 4Q5HA 4RJ6A 4BBMA 5L6OA 5FP5A 2CGXA 5TT7A 1YKRA 4GIHA 4PRJA 4EKLA 1YWNA 3D5XA 4GFOA 4AZVA 5JQ8A 4QMPA 4MXYA 5JT2A 4QOXA 4L6QA 3ZDIA 4PV0A 4E8AA 4LMNA 4M7IA 3F3WA 3CJFA 3R1YA 3V8WA 3IECA 5H8GA 3F2AA 2V7AA 4E4MA 2C69A 3Q9YA 4I4FA 4NT4A 1FPUA 4JR3A 2I0EA 3PTGA 4KBKA 1ZWSA 4BWKA 1JVPP 3C4FA 4TNDA 4W4XA 4XLIA 2RKUA 4PWNA 4RQVA 4FTJA 3MFSA 1OL7A 5DT4A 4QMZA 2IVSA 2W96B 3IW7A 2I6LA 2RFSA 5FGKA 1MUOA 4MXCA 5C9CA 3REPA 4Z16A 5HU9A 3TJCA 2O64A 4UYNA 4ZZMA 3V5LA 3DKCA 1WBPA 3LPBA 4GYGA 1H0WA 3NUSA 3RM6A 2WTKB 5M4CA 4FTNA 3MVJA 3FMKA 5TOZA 5J9ZA 3TM0A 1J1CA 3FY0A 3FZOA 4FYNA 3UIBA 5KX8A 4FV6A 2JITA 3MSSA 4BTMA 3R9DA 4EZ7A 2X9EA 3V6RA 1H24A 1XO2B 4WRSA 1Q99A 3H0ZA 3EQRA 4TY1A 4WT6A 3BEGA 1YRPA 2CCIA 4H05A 3DJ6A 3FXZA 3MIAA 5E1SA 5A3XA 1VEBA 2VWUA 5IQBA 4G9RA 4FICA 2Y8OA 3MY1A 1NY3A 3ELJA 3UVRA 1NVQA 3PA3A 4USFA 2B9IA 2WTCA 5I9ZA 2F49A 2ITNA 3FZRA 5DA3A 3V8TA 1OKYA 2AC3A 2C3LA 4AOTA 5AAGA 1JKSA 4AAAA 3NPCA 2UZVA 4NKSA 4BGQA 5CAUA 5L6WL 3QTIA 3TKIA 3NW7A 2JAMA 3VS5A 3TDWA 4GG5A 4J8MA 4OTGA 3U6IA 4IX4A 3I79A 3KULB 3O23A 5DR6A 5HLWA 4IX5A 4UWCA 3O96A 1PMNA 4TWNA 2J4ZA 3PY1A 2GTNA 5ANEA 3LJ2A 3VS6A 5C26A 2C6TA 5GIOE 5AUUA 1V0BA 2PE0A 2ITOA 3EHAA 2WIHA 2V62A 4FX3A 4A9TA 3SXFA 4AS0A 4EOSA 5ACKA 5CASA 3C7QA 4GIIA 2JKMA 4JBVA 5K5XA 3C0IA 4R5YA 3TTJA 2HOGA 4D0XA 2UZUE 4DEEA 2ZOQA 1CM8A 3C0HA 3HV3A 1H25A 3OVVA 4JQ7A 1EH4A 3BHVA 2NPQA 3F5UA 3HV6A 3MTFA 2VTPA 1JSTA 1SNUA 3PJCA 4GCJA 4TYGA 5AMNA 4U80A 5BYLA 4D2SA 4D5KA 2W0JA 2YM7A 3NWWA 4M68A 5AP0A 4ZAUA 2B55A 4QP3A 4EK5A 4XBRA 2PVJA 3QLFA 4O86A 3DTWA 3QAME 4MTAA 2WMWA 4HOKA 5BNJA 4TNBA 1U54B 3I6UA 3DAKA 3ZBFA 4E26A 4E6DA 4RX5A 2E9PA 4DBNA 4YTHA 3TIYA 3HYHA 4ZTQA 2HXQA 4IWOA 4KIKA 4EI4A 2O0UA 3GCUA 4U3YA 3R2YA 2ZM3A 3FQSA 4M67A 4RVLA 3VS0A 3ZZEA 2C68A 2VGPA 4FKUA 4RLLA 4F0GA 5M4IA 4FT3A 4Y85A 3DOGA 5B2KA 4E6CA 3MDYA 2UW5A 4R1YA 4CV8A 3EFKA 3UIXA 1JQHA 4QP9A 3R7OA 5LCJA 4IJ9A 4IMYA 2YCSA 5LOHA 2W1HA 2XM8A 3HMOA 3UC3A 3DKOA 5FEQA 3QKMA 5EFQA 5KHXA 1Q8TA 3MA3A 1ZLTA 3U4UA 3KY2A 4M97A 3QUEA 5M56A 1ZYSA 2X6DA 4IC7A 4KWPA 2B9FA 5E8TA 3I60A 2A1AB 3QQJA 4A9RA 4ANMA 4JI9A 2OIQA 5H9BA 3AGLA 2QR8A 4RZVA 3UIMA 2QLQA 3Q6UA 3ZRKA 2J0MB 5HGIA 4C58A 1G8AA 4DFBA 4YSMA 3AMYA 5HE1A 1PRYA 3Q5ZA 4C4JA 4JVGA 2QKWB 4L00A 3IOPA 2JLDA 1Z9XA 5AA8A 4C4FA 5D7AA 5CF4A 3R73A 4OBOA 2VO6A 3TJDA 3EKNA 4YHTA 4QMLA 2OZAA 1OKZA 4YJRA 4GUEA 1NT2A 4FOCA 5J87A 5CF5A 3PXQA 5FDPA 2PUNA 5HX6A 3BE9A 3BLRA 2W1GA 4I6HA 4OR5A 4HVSA 5AV4A 2GQSA 2C5YA 4WBOA 5IQFA 4QMTA 2W1ZA 1PXNA 4D2PA 2W5AA 4DGOA 3RAWA 4GT4A 4AQCA 1R39A 4DGLC 5HVKA 4YHFA 3LZBA 4U6RA 1XKKA 4WO5A 2G01A 2JDSA 2WMAA 5DHJA 3ZC5A 4DGNA 4BWXA 4CLIA 3SXSA 3UJGA 4CKIA 5ACBC 3P86A 2VTHA 2KTYA 3HV4A 3LCOA 3DTCA 4FEXA 4TW9A 1PXMA 4HGSA 2BRHA 3DJ5A 4N6ZA 2VNYA 4FV8A 4U3ZA 4UWYA 2WMTA 3EQCA 2YM5A 5FP6A 2J0KA 2F7ZE 3EIDA 4IEBA 3P7BA 4PTEA 4RWIA 5FRIA 3L8XA 2C6MA 2YDJA 4HPTE 3JUHA 4LUEA 3LQ5A 2XF0A 2OJJA 3FMLA 4PL3A 3R01A 2VNWA 2GNHA 4GT3A 2V55A 3QUPA 4V0GB 3S0OA 4CQGA 4RMZA 5F9EA 5BVKA 4C62A 4V01A 3CSVA 3ZSGA 3MTLA 4EOOA 5CSXA 4AZEA 1VR2A 4L52A 1CDKA 4GK3A 1K3AA 2QVSE 5AAEA 1H4LA 4YC6A 4FTAA 4IAYA 4FA2A 3IGOA 4K9YA 3GNIB 3BYUA 3II5A 4HVHA 3U54A 5HO7A 2QOQA 2ITXA 3HL7A 5DYJA 2OU7A 3QCQA 3T3VA 4BGGA 3WF7A 4UMPA 2GS6A 5I3RA 5M51A 1UNHA 4RA5A 2YCRA 5ETIA 4FIJA 4E5BA 2RFEA 2Z2WA 4EK8A 4U41A 2PVKA 3NW5A 3SW4A 2OF4A 5A4EA 4LL0A 3QU0A 3H9FA 5DEYA 3R7YA 5JZJA 4I22A 5IA4A 2WU7A 3S00A 3Q53A 3LQ3A 4Q9SA 4TPTA 4BDHA 4O7TA 3H30A 1DS5A 5CVGA 3Q9WA 4WG4A 4DLIA 4XLVA 4YSJA 3HMPA 3FI2A 5M06A 1TKIA 3HP5A 4F63A 1GAGA 4NFMA 2ZV2A 4OTWA 2QU6A 2C0OA 2C5VA 4W9XA 5M57A 1M2PA 4XOYA 5AM7A 2VRXA 5HCXA 2GDOA 2PHKA 3OG7A 4F1MA 4B7TA 5CAOA 5ANIA 3A8WA 3Q04A 4ZTSA 2I0VA 1OGUA 4UY9A 1V1KA 5KMKA 2BFYA 2J90A 4WKQA 3Q4ZA 1XH8A 2OK1A 4IANA 4E93A 2W99B 4MNEA 3UOJA 1YI3A 4Z55A 1JLUE 2XBJA 2XK4A 4XHKB 3ZO4A 4NL0A 3R21A 4LRJA 1IAJA 4CTBA 3FKLA 4DH7A 4NIFA 1WBOA 2UZTA 2W06A 1LEWA 5DG5A 3QHRA 3QD0A 3DAEA 2BHEA 3WF5A 1YOLA 5FDXA 3MW1A 2R3JA 3FLZA 2QD9A 3OCBA 4PTGA 4H3BA 4BIDA 2UVXA 1KUTA 2XEZA 2R7IA 2WTJA 2EXCX 2VO7A 1H26A 3BKBA 5EH0A 5M09A 1QL6A 4V05A 2CJMA 1F0QA 4QMWA 4WG3A 5CSVA 4BCHA 4EL9A 4H39A 4QMUA 3W10A 4JX3A 2Z7LA 4NTTA 2BAQA 2R3LA 4NKAA 3LFDA 1G3NA 1PXIA 3QD4A 4UBAA 3NYXA 1H1SA 4FZ6A 4OTHA 3SQQA 5KZ0A 3ULIA 4FODA 2ZDTA 3EZVA 4EH5A 4L3JA 3QQUA 4I0RA 3NUXA 4G31A 2FGIA 3RPSA 2UV2A 5FXQA 5L3AA 4OAVB 1YXSA 2HZ0A 4OT6A 3DBEA 2IWIA 4ZSLA 3PP0A 5FTOA 2CNQA 4FEUA 3RM7A 5GZ8A 5E92A 2VGOA 4YO4A 3FE3A 3MVLA 4TYHA 5IA0A 5ANDA 4JQ8A 3K3IA 2X81A 4FZAB 4UYAA 5JRSA 3UPZA 1SM2A 4D55A 2I1MA 3KRRA 3FBVA 4X0MA 4WSQA 4MF0A 4DG2E 4RLKA 2F4JA 3HA6A 5HNIX 4EK6A 3R9NA 4IZYA 4RVTA 4ZY4A 4IACA 5AUWA 5HBHA 3V01A 2XIZA 2CCHA 3OWJA 3SOCA 1OIRA 5E8UA 3BU6A 5E8YA 2OI4X 2P2IA 3TNIA 4C4IA 3KA0A 3W2OA 3S2PA 1WVXA 2HZIA 4CCUA 1M7QA 5AR5A 5CF8A 4QP1A 2W1CA 4IHPA 1QPCA 4DHFA 3BYSA 1FVRA 2YITA 4QQJA 4O2PA 1PXKA 1XR1A 2BALA 5HORA 4ALWA 1RQQA 2WIPA 1XH5A 4JIAA 4HYIA 2Z02A 4XS2A 2P2HA 3JY9A 2H34A 4QYEA 1B38A 5EYDA 5F20A 4C4EA 4LG4A 3IDBA 4R3CA 4HGTA 1NVSA 3V5TA 4J7BA 4YZCA 4F09A 3OOMA 4FKOA 3BWJA 3IW4A 1Q61A 3O0GA 3V51A 5LVOA 2WD1A 2BZIB 3V5WA 3A62A 2QO7A 3OC1A 3G90X 1XJDA 2ERKA 4C57A 1ZYLA 4YZMA 4R6VA 4O96A 4QYYA 4HW7A 2C1AA 3F3ZA 3KC3A 2ZB1A 4YP8A 4XG6A 4JR7A 5EHOA 4F64A 2XJ0A 4FE2A 1MQ4A 1U4DA 1ZYJA 3R9OA 4DF3A 2UW4A 2IZRA 4EHZA 4PPCA 2UZEA 4NTSA 4RGJA 3ORKA 4NW5A 4EOPA 4XG7A 4X3FB 3RCJA 2IN6A 3VQHA 4AU8A 5IMXA 1WBVA 3ZMMA 4JG6A 2WHBA 4O2ZA 1JAMA 3AMBA 4H3QA 3E87A 2E9OA 3FZTA 4FKRA 4II5A 3IO7A 4JBOA 4ZTMA 5KMOA 3FI4A 3GQIA 4XP3A 5DBXA 4FT7A 3OT3A 4EH3A 1URWA 4ERKA 2CNUA 2XIRA 3DKFA 4LUDA 5IH5A 3O51A 4DGMA 3QALE 5ITAA 1TVOA 3NVKI 2PY3A 5CWZA 2OJIA 4CEGA 1TQPA 5EQPA 3BIZA 1S9IA 3QD3A 4L45A 2ITWA 4IDVA 3QCYA 1M14A 2LGCA 5HCZA 5CSHA 4CCBA 3ID6C 3DB8A 2KULA 3BEAA 2J7TA 5FTQA 5LMKC 4EUTA 5I9YA 5DNRA 3Q6WA 4E4NA 1BL6A 3B2WA 4RFMA 5EM7A 4TTHB 3LMHA 3NVMB 4LV5A 4DFNA 4JIKA 1UKHA 3HEGA 2OBJA 3Q9ZA 3QTSA 4GRBA 1BL7A 1H1PA 3ZOSA 4F7JA 4GFMA 5K0XA 4FG9A 5AUVA 3UMWA 2EXEA 4M3QA 3ORIA 4RIWB 4AX8A 2OXDA 4QP2A 5CEPA 5IISA 3QA8A 3F69A 3AD6A 2QO2A 5E4HA 3HLLA 2VWVA 3FKOA 1UWHA 4XG8A 4XV2A 4BDFA 3OEZA 4UEUA 2OJ9A 4JDJA 4L68A 3QQFA 5DT3A 2C6DA 5L2TA 3OMVA 3DA6A 1Q8ZA 2XKEA 2YJRA 3N9XA 1Q62A 3R8MA 4O7RA 5D11A 4CNHA 3ZLSA 1UU7A 2JGZA 3WIKA 1QCFA 3PA5A 3OWPA 4K11A 3ZHPC 5M08A 3P4KA 2JBOA 2PMOX 4KIPA 4FKPA 3DKGA 4AW1A 2H8HA 3L8SA 4CSVA 4EOQA 3TIZA 4ANSA 4MNFA 4FKTA 4MEDA 2BROA 3FLQA 5BVWA 4EQUA 4FNYA 3LW0A 4A9SA 5KCVA 4QYHA 1ZRZA 5CU2A 4N0SA 3V5PA 4RIYA 4FSRA 3SD0A 3ORXA 3TT0A 5HESA 5D7VA 5DRDA 3RNIA 3GC9A 3QCXA 2VWYA 3AC2A 2UZOA 4AW2A 2O5KA 4XRJA 5EW3A 1H01A 2X0GA 4FG8A 3BX5A 4BYIA 4PX6A 5FWKK 4BCKA 2F2CB 2CLQA 3HV5A 4ENYA 5CS6A 2R3MA 4RWJA 5E8WA 1Q8UA 2ZV8A 3TN8A 3TTIA 3ZM4A 5J1VA 3IW6A 4QMOA 5BVEA 4ZS4A 3W1FA 4L8MA 4WHZA 4YJQA 1JKTA 1YI6A 2OJFE 3KFAA 3UOKA 3VS3A 3VUTA 5LJJA 5J5SA 3E63A 4K18A 3C5IA 2WQNA 4JNWA 1UWJA 2AYPA 3RK9A 3RZFA 3R9RA 4G5PA 2WOUA 4O83A 3DBCA 3GU7A 3PXYA 4O0YA 3L8VA 4CMOA 4WRGA 2XNPA 3EYHA 2UW3A 4GT5A 4AN3A 3EFJA 3UG2A 4EK4A 4EWHA 1ZAOA 4HZRA 4B99A 1MRVA 2BAJA 3BHTA 5CNNA 4ZTNA 4RIOA 1Q5KA 3RTPA 2PL0A 2H96A 5HKMA 2R3OA 2EWAA 4IADA 3ZBXA 4DH3A 3TUDA 3NNVA 4XX9A 3AMAA 3NNWA 4BY9E 2R3IA 4FTKA 5DR9A 3LIJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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