4O6LA

Crystal structure of ttk kinase domain with an inhibitor: 401498 (n-[(1r)-1-(2-chlorophenyl)propyl]-3-{4-[(1-methylpiperidin-4-yl)oxy]phenyl}-1h-indazole-5-carboxamide)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
279
structure length
257
Chain Sequence
NECISVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDTVNYMPPEAIKDMSISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of TTK kinase domain with an inhibitor: 401498
rcsb
molecule keywords Dual specificity protein kinase TTK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 257
sequence length 279
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4o6lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4o6lA01
4DC2A 1HOWA 1Y57A 4I20A 4G3EA 5CU4A 3UP2A 3JR1A 4FTNA 1R0PA 2I0HA 1M52A 4RFZA 3T9IA 4PX6A 1WBWA 2CGVA 3HMPA 1RJBA 3FZSA 4ZTQA 5DPVA 3MDYA 5AV4A 4JDIA 4EQUA 3FQHA 4BDHA 3C0IA 4ASXA 2OFVA 4PPAA 1U4DA 5AP1A 4DEHA 2Z7LA 3WZUA 3ULIA 4CT1A 4U97A 3D7ZA 3DBDA 3PJ2A 4ZSAA 4CTBA 3VBXA 1P4FA 3D5UA 5HIEA 3D14A 3Q9ZA 4WRGA 1KE5A 5HI2A 4X6RA 3NAYA 2JIUA 3UQGA 3QKLA 5M44A 4HGEA 3POZA 1J7LA 4O0XA 4IFGA 4DITA 1Q5KA 3AT2A 1PKGA 3OWKA 3UNKA 2ITYA 3CTJA 3U51A 4GUBA 4OTHA 2IZRA 1U5QA 4U43A 2E2BA 5AR4A 3TJCA 3ZH8A 3ZEWA 2C1AA 5AMNA 2J0IA 5HKMA 4MNFA 2VTNA 4TKSA 2C6OA 3PSDA 3QBNA 1H00A 2B54A 2PZYA 3KK8A 3ZSGA 5J7BA 3PXFA 4YUQA 2A1AB 4CCUA 4RFYA 2CN5A 1BL6A 2YERA 3IK3A 4QMYA 3FDNA 1KWPA 2XCHA 3AGLA 3QGYA 5FEDA 4BTMA 5CZIA 3PTGA 4XCUA 5LARA 5HVJA 3KGAA 4MTAA 2G2HA 4PV0A 4UBAA 5BVKA 5FBOA 4NKSA 5T3QA 1M2QA 2BMCA 4R77A 1OKYA 3WARA 3FZ1A 4Z3VA 3AG9A 1FGKA 1GY3A 1PXOA 2UW3A 2J51A 2WMSA 3KC3A 2WU6A 2X8EA 3EHAA 3MJ1A 4PP7A 4EH6A 5GJFA 4GKHA 4A9RA 5HCZA 4IZ5A 4ZTNA 1XH6A 3ZLSA 2VX0A 3LFAA 4DGMA 5FTOA 4O0RA 3EQDA 5IQBA 4Y8DA 5A14A 3W2QA 3EYHA 4XLIA 4BRXA 1OM1A 3CY3A 4YO6A 4U80A 1UKIA 3S00A 2J6MA 3G51A 4O6EA 1PXIA 4BZOA 4HGSA 2WFYA 4KKEA 5HLPA 3PSCA 2WKMA 2QLQA 1UWHA 4IVDA 2FSTX 4LUDA 3NS9A 4G2FA 4NSTA 3PE1A 2R3QA 3SC1A 4CV9A 4FE2A 4JG7A 1RW8A 2UW5A 1WVYA 4E26A 3GQIA 4BL1A 4AA5A 4DGNA 4XYFA 4NTSA 3W33A 3LFDA 3ELJA 3QA8A 4YJOA 2G01A 3Q9XA 4HPUE 4AF3A 4BYJA 3TJDA 4E8AA 2JKMA 5E8SA 2HZIA 2XS0A 3BHHA 5E92A 4V0GA 2VTIA 2XK4A 4ARKA 5B2LA 3AGMA 4FG7A 2C6DA 2IJMA 2WQEA 2XUUA 3BU3A 4K9YA 4UYNA 4V01A 5EHOA 3BBWA 3C13A 5HVKA 3NVMB 2OXDA 5CI6A 5C8NA 1IASA 5IA3A 3GC7A 3NR9A 2C6MA 4ANQA 2PHKA 4EZ7A 4RZWA 2IVUA 5JKGA 2C5VA 5KMMA 3KL8A 4BGQA 2CDZA 2WTKC 4FUXA 4ACHA 4RX9A 4YLLA 4ZXTA 4DH8A 2QO7A 5DLSA 4DEDA 3ANQA 4OT6A 5CXHA 4RWIA 2IG7A 4IAKA 3M11A 4KS8A 4FEQA 3Q52A 2X39A 3MFUA 4GK3A 3ORMA 4AZWA 5L2IA 5FXQA 4RVTA 4DF3A 3FMNA 4JIKA 3UMWA 2CN8A 5AA8A 3TT0A 4O27B 2ZV8A 3R1YA 4GS6A 4Y83A 5FM2A 2GS2A 3N4UA 4FSWA 1HCKA 2VUWA 3KFAA 2RF9A 4LI5A 4TL0A 1IAHA 2H96A 5EOBA 3D0EA 1UNLA 3AC2A 3PLSA 1ZARA 3C0GA 4WSYA 3TNWA 3KXMA 4XG7A 3ZTXA 3FY0A 2GS6A 4M69A 5I9ZA 3MTFA 2CNUA 2I1MA 5B0XA 4UWCA 5AR7A 2JEDA 3OY1A 4MXXA 3I5ZA 2JDVA 3HMMA 4OTPA 3THBA 4RC3A 3UIMA 3NGAA 4IJ9A 3FL4A 4RMZA 3HDMA 5D7VA 5H9BA 3SRVA 4D0XA 2YA9A 5DHJA 4X6QC 4OTDA 3RWPA 4E7WA 2R4BA 2AUHA 2UUEA 2JAVA 2F49A 2XIKA 1FVTA 4I21A 2B9IA 3R2YA 4O0YA 4JBVA 5EYMA 3CE3A 3AC8A 4YJNA 1U54A 4N6ZA 2W1DA 2PWLA 3ALNA 3QA0A 4O0WA 4UV0A 4RJ3A 1ATPE 2O5KA 3QUDA 4C35A 2VGOA 3KA0A 1YI6A 3OG7A 3P7AA 3ACJA 4IVBA 4KIPA 3MVJA 3ZSHA 4V0GB 4BI2A 2O65A 4FF8A 4TYIA 3COKA 3ROYA 5HE1A 3FMLA 4C61A 4NCTA 5CVFA 3E5AA 2V22A 3ZONA 5C4LA 4RLKA 3TZ7A 2PMNX 3E3BX 3LVPA 2R3JA 4BDAA 3EN6A 3QTIA 3ORXA 3QRJA 2ITNA 3ENMA 5DT0A 3V5QA 4KBKA 2GHMA 2JITA 4ZTMA 3OWPA 2J4ZA 2Z2WA 3OMVA 2VU3A 1PMUA 3NNXA 3EQFA 1ZZ2A 3WZJA 4RJ6A 5M07A 3QRTA 3LQ5A 3SG9A 1KE8A 2W9FB 4ACDA 2CCIA 4QT1A 1FQ1B 5KCVA 4BVUA 1Q8YA 4C4HA 3UOKA 5IEVA 4FKGA 3FI3A 3MESA 3PXKA 2GHGA 4BDJA 4OAUC 1JSVA 4A7CA 2HZ4A 5LMAA 5DYJA 3IOPA 3E64A 5KMJA 3TDWA 5B2KA 2E9NA 2GPHA 1UA2A 2V5QA 4Y46A 3HVCA 2IW8A 4B7TA 5FRIA 4WG4A 4PUZA 4BHNA 2VWUA 2YHVA 4Z55A 4LM5A 4NIFB 4AA4A 2JBOA 4YZCA 1PXMA 4FKJA 2QKWB 4J71A 5E8VA 2Z7SA 4ZP5A 4UYAA 3PP1A 3W8QA 3LXPA 4R7IA 2YJSA 4ALUA 4I0SA 3F6XA 5BVDA 3KF4A 5AEPA 1IR3A 1O6LA 1S9IA 2OH4A 2GCDA 3GU5A 3FXXA 4MD7E 4D4RA 3T8OA 3NVKI 3KVXA 3ORKA 4CZYB 4FKLA 4QTAA 2YIYA 4GJ2A 4GVJA 3BU6A 4H1MA 4CFFA 3UQFA 3FY2A 5AFVA 2FUMA 4C3PA 4I93A 3SRVB 3F2AA 2QLUA 4CKJA 4XX9A 3TWJA 2XJ1A 4AS0A 5M06A 1XQZA 3LFBA 3VNTA 5C8MA 3DLZA 4EQMA 3TDVA 3CKWA 5H3QA 2WPAA 3DBQA 4PNIA 4F70A 3AMYA 4IX6A 1U54B 4QD6A 4C4JA 2V55A 1DI9A 3SW7A 4MBJA 2OIQA 4GFMA 4F9BA 2X4ZA 4KSQA 2JKKA 2X2KA 5JZJA 4OW8A 1K2PA 2FSLX 5CSPA 2B9FA 4W4VA 3CGFA 4LQMA 3COMA 1HCLA 5DRDA 4RJ4A 4F9WA 4M14A 4RWKA 4XH6A 4DEGA 3E93A 3FQEA 1H27A 3L9PA 4L46A 5I9XA 2EB2A 4ANBA 4BIDA 2X2LA 3MA3A 2BRHA 1FOTA 4FK3A 1QPJA 2YDJA 2XIRA 3BYSA 4RJ8A 4UXQA 5CF4A 2A2AA 3RAKA 4M15A 3FKLA 1ZY5A 1ZXEA 4QMSA 4RJ7A 2A0CX 5FWKK 2ZV2A 1JNKA 4AACA 3D94A 4UN0C 3H30A 4QMZA 4XG2A 5JFWA 4QTBA 2C0TA 2CPKE 2WOUA 4MQ2A 4AGCA 3MVMA 4RA4A 3P08A 4XG8A 2J5EA 4HZSA 5K4JA 4HVDA 1WBOA 2VTRA 3CC6A 5AV2A 2UVXA 3CP9A 5LVLA 4JOAA 1OUYA 3FAAA 2BRGA 4WT6A 4AGDA 4XHKB 3SQQA 4DINA 4OTRA 3NW6A 2VV9A 5IH4A 3CPCA 2ZM4A 4XBRA 4LOQA 3DJ7A 5DA3A 5BMMA 2CKPA 5IQFA 1JQHA 4GL9A 2VTQA 4RLLA 3IECA 4CFUA 4BZNA 2UZTA 3FZOA 3E88A 3ZM4A 2C6TA 3NSZA 3BLRA 3QRKA 3U8WA 3F9NA 4HZRA 4FZ6A 3SOAA 3V8WA 4U3YA 2CGXA 4R78A 4I5MA 3DGKA 3ZXTA 3V04A 2C47A 4HCVA 3MPAA 3FMJA 5TKDA 4DFLA 3Q9YA 5CSHA 3VW8A 3ZXZA 5IDNA 5J5TA 4IDVA 2PVJA 4DFBA 4R6VA 4O91A 3DKFA 3V6SA 3GU6A 2OH0E 3I7BA 5EQEA 4FGRA 1W84A 2XK8A 4QQCA 4I0TA 4QP2A 3KRJA 2LAVA 3VBYA 5LVPA 5LVOA 4NFMA 2KULA 2PVKA 2PVFA 2ZM3A 3K5VA 4U6RA 4X2GA 5AP4A 4A9YA 3HDNA 3H0YA 3HV4A 2W1HA 2JGZA 4FK6A 4FT9A 4J8MA 4FKOA 1E9HA 4U3ZA 4S30A 4Y73A 4BWPA 1WBTA 3PVWA 5KX8A 1YHWA 3II5A 2W9ZB 4ZLOA 1MRUA 4PQNA 1NVRA 2FVDA 1F3MC 1JVPP 3OW4A 3O7LD 3ZUVA 4O83A 4QMLA 2HCKA 2HWOA 3BCEA 3Q4CA 3CKXA 4LV5A 4AP7A 4C33A 3ID6C 3UIBA 4J97A 4O7YA 5DT4A 5EKOA 4YZMA 1F5QA 4O0SA 2YIXA 4UALA 3ZYAA 3DT1A 4FVQA 1S9JA 5D7AA 4ALWA 5IA2A 2GU8A 4D0WA 3TNPC 3W18A 4IWPA 2VO0A 3CXWA 3QKKA 4DBNA 2QQ7A 2UZOA 1JWHA 1YXVA 4RIXA 4CMUA 3E87A 2PE0A 2R3LA 3KQ7A 2G15A 4RX8A 2X4FA 5AUWA 2PMOX 4D58A 2P0CA 4K8AA 3GNIB 3Q96A 3L1SA 5LWMA 1OIRA 5I0BA 2VN9A 3LXLA 3AT4A 4FSZA 2CHLA 2NPQA 5LMBA 3MS9A 4O0VA 2OU7A 4BTKA 1JLUE 4RVKA 3PJ8A 5AV0A 5J1WA 5JGAA 4IB3A 3FMHA 5D41A 4EWHA 1BUHA 3E62A 5E90A 4KB8A 1XH8A 1YDSE 2JDRA 5AA9A 3BLHA 3KXGA 4C4EA 5L2WA 4WNMA 1Q41A 3CCNA 4JJRA 4EH2A 5T6KA 4EJNA 5IUHA 2QO2A 2W06A 2BUJA 4DEEA 3PY1A 5HU3A 3QKMA 4PDPA 4ASEA 2HOGA 2JLDA 3EZVA 5ACBC 3KMWA 4FODA 2F7EE 5CEPA 3I79A 5JEBA 2ITVA 5J7HA 3BGPA 3ZBXA 1WVXA 4B9DA 4ANNA 3IW8A 5E8ZA 1Q62A 3PSBA 2YJRA 1J7IA 4ACMA 3VN9A 4FEWA 2ONLA 2YAAA 4QQTA 4CMTA 3NUSA 4KSPA 2PTKA 2BRNA 4USEA 4O0UA 4JX7A 2FGIA 4G5PA 3ZC5A 2HW6A 3F82A 2YZLA 4F9YA 3OOMA 5CQUA 4TPTA 4OGRA 4EL9A 5ETAA 1OL2A 5ANDA 3LMHA 3Q9WA 1L8TA 3ZOSA 3GP0A 2GDOA 4ZS0A 1UNGA 3FZPA 4O22A 5CF6A 3ULZA 4DT9A 1WCCA 5C1QB 2ZAZA 4MAOA 2NRYA 2X6DA 3LAUA 3G90X 5J1VA 4RPVA 4YHJA 4UMRA 3LFSA 4WG3A 2B0QA 5HX8A 3LFCA 1QCFA 3EB0A 5HBEA 4I23A 3D5XA 4ID7A 1FMKA 3UVRA 3TL8A 1P2AA 3TEIA 3U9CA 3HAVA 5EI8A 4PTEA 4RIXB 3VUIA 2YIRA 4YHTA 1ZYLA 4Y85A 4GSBA 2QR7A 5HQ0A 3Q4TA 1O9UA 3F3UA 4E5WA 3N4TA 4M97A 1JSTA 3DJ6A 4JG8A 4R8QA 2H6DA 4RBLA 3NUYA 2PZIA 3VC4A 3GU4A 3MYGA 4DCAA 5DI1A 2ITUA 4U0IA 5I9UA 4PPCA 4KIQA 4TRLA 3ODYX 4R1YA 4DA5A 5DEYA 4ERWA 3O23A 3NIEA 4FTUA 3VRZA 2OJJA 1MRYA 3I6UA 1YDRE 1M2RA 2BCJA 4KWPA 3RBWA 5C03A 3TKIA 4JG6A 4WNKA 2Y4PA 3Q5IA 4OTGA 4AXAA 3SG8A 3HKOA 4AUAA 2HELA 4LL0A 4QMPA 4UMTA 3VVHA 2PUIA 3EQIA 2WQNA 3NEWA 5DFPA 4PDYA 3B8QA 3UYTA 3HUCA 1OECA 2ZYBA 1PRYA 4X3FA 2C5NA 2GNIA 5FEEA 4FZ7A 1NA7A 3UC4A 3ZLWA 2XVDA 4IADA 4MF0A 3EQHA 3VUMA 4I5CA 4CFWA 4C62A 4EOSA 4EYJA 2XNGA 2IZSA 4CFXA 2QOHA 2ITOA 2BIYA 4EH7A 1OKWA 3I4BA 4WOVA 3L8XA 3QFVA 5DR9A 5EW8A 3O51A 4NYEA 4BY9E 4FL2A 4R3CA 4R1VA 4YC8A 2ITXA 3R02A 4IAZA 5HOAA 3QQGA 3R1QA 2QURA 5HO6A 3VW6A 2B1PA 4FG8A 2GNLA 3MFTA 4MX9A 4NM3A 5FP5A 4N70A 4D1ZA 1J1BA 1JKSA 4FKRA 4UWYA 5T68A 4FNXA 5JFVA 1R3CA 2C3IB 4I92A 4RIYA 1IG1A 3DNDA 5LCKA 3DBCA 1W7HA 3L9NA 4PMTA 2WXVA 4F1TA 4D55A 3V8TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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