4OTGA

Crystal structure of prk1 catalytic domain in complex with lestaurtinib
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
336
structure length
322
Chain Sequence
LRKSPLTLEDFKFLAVLGRGHFGKVLLSEFRPSGELFAIKALKKGDIVARDEVESLMCEKRILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLMLHIHSDVFSEPRAIFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTEGYVKIADFGLCKEGMGYGDRTSFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSERDAEDVKKQPFFRTLGWEALLARRLPPPFVPTLFTGEAPTLPPRDARPLTAAEQAAFLDFDFVAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of PRK1 in Complex with the Clinical Compounds Lestaurtinib and Tofacitinib Reveal Ligand Induced Conformational Changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase N1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 322
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.13: Protein kinase C.
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4otgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4otgA01
4CYJA 3VVHA 4QMLA 4QYFA 4FNZA 3G9LX 3EQPA 2ZV9A 1F0QA 4H39A 3HAVA 4J8NA 5DR9A 4FGRA 1R78A 5IQCA 4O7LA 3QA8A 4FIIA 3RJCA 2XNEA 2PE2A 3D9VA 2UW4A 4G2FA 4M15A 1CM8A 3Q6UA 4RX8A 4FTRA 4TYIA 2BCJA 2R5TA 4W9XA 3VUGA 4C02A 4MQ2A 4D28A 1LPUA 2B7AA 2RF9A 1P2AA 3OUKA 3PSCA 3PWDA 5ANKA 1JSTA 4AN9A 5M51A 3R7IA 4FKUA 3MJ1A 5JFSA 2QNJA 3EFLA 5HE0A 1M7NA 3PWYA 3KMWA 4RIYB 1UU3A 4GW8A 4PPBA 3DBDA 5FBOA 3VW8A 4HZSA 5CEKA 1B39A 3Q4UA 1WVXA 3NUAA 4GL9A 3F7WA 2JBOA 4BCMA 4ENYA 5IH4A 2JEDA 4FSTA 1Q41A 2JKOA 3CR0A 2C1BA 4XG6A 5IA5A 3C0IA 4QMWA 2PUNA 3H0ZA 4M97A 4B8LA 4EH4A 2C0OA 4O38A 3DLZA 2YCFA 3UG1A 2O5KA 4JX7A 1FPUA 4F0IA 3DXPA 4I6HA 2QU6A 3E8NA 4N70A 4K6ZA 5FLFA 1YXVA 4XRLA 5HHWA 4FEWA 4R7BA 1M17A 3IONA 1XH7A 4F0GA 3GP0A 5IQBA 3NVKI 3KULA 3MIYA 4JRVA 4S33A 2O8YA 2X2LA 4BVUA 5A46A 5EH0A 3R8MA 4U3ZA 1DAYA 1PKGA 5CASA 1APME 4U9AA 2UW7A 2OO8X 1SM2A 2XM8A 4IIRA 2R64A 3R1QA 4KIQA 3W33A 1H01A 4UN0C 3OF0A 3QZFA 3U6HA 2X2MA 3WF9A 4MD9E 4NTSA 3PJ2A 3HP5A 3LXKA 2V22A 2YDKA 3TKIA 4DF3A 3EN9A 2YIQA 4DGNA 3F3VA 3DU8A 3DXNA 3QTWA 3R2YA 2P4IA 4RT7A 3C4CA 4GYGA 2YAKA 4GK2A 1FMOE 4CLIA 4H58A 3O7LD 5KX8A 3KN6A 4GT5A 4FTTA 5I0BA 1MRVA 3NW6A 3V8TA 5L3AA 4V0GA 4LI5A 3IDBA 2O0UA 3OHTA 3R63A 4YR8A 1ND4A 2YZLA 3RK7A 3UPZA 2YM7A 2EB3A 3ELJA 3GOPA 4EOIA 3IO7A 2GDOA 4BI0A 2BVAA 2WPAA 3ENMA 5L2IA 5EI8A 5GINE 2R3LA 2GNLA 3KXNA 3SD0A 4IACA 4FL2A 3DXQA 2XK3A 4DEIA 4QMPA 1RDQE 3ET7A 4QNAA 3EFJA 4LGGA 1WBSA 4OGRA 1Y6AA 2CNVA 2W05A 1YHVA 3SG8A 3FMJA 2OI4X 3OOGA 1Q62A 1XKKA 2B9HA 3JVRA 4IBMA 5BVWA 3E5AA 3A7GA 4MXCA 1SZMA 4ACGA 4MWHA 1XWSA 2JDOA 5M4FA 3NUYA 3QALE 5IQHA 5LCKA 4A9RA 5L8LA 5CANA 3A8WA 3IDPA 4ZP5A 3Q04A 2PHKA 1YW2A 4EYJA 4IAYA 3VF8A 4ENXA 3PXKA 4H1MA 3Q2MA 4G17A 3RK9A 3VUDA 3CC6A 3V6SA 2C3JA 3IDCA 4L7SA 4O91A 3WZKA 1S9JA 3OWKA 2VNWA 3SVVA 4G9CA 1YDTE 2PZYA 2UZEA 4X2JA 4JG7A 2WQEA 3BKBA 3VHKA 3FKLA 4TW9A 2WOUA 4ZLYA 5A14A 1YWVA 4OTFA 3KA0A 4X21A 4C33A 4F9AA 4XRJA 4FSUA 1WVYA 4BGGA 4U79A 1YRPA 3RI1A 1K9AA 2ZJWA 3FQEA 2YWPA 3F88A 5HE1A 5A6NA 2XCKA 3QZGA 4OT5A 4RIOA 4B99A 3ORXA 4QO9A 3GVUA 3QQLA 4TYEA 4AT4A 3C4WA 3QC9A 3IKAA 5ETFA 3A99A 4FIJA 3U4UA 4F9BA 3D2KA 3NYXA 3RPRA 1PW2A 4BHZA 4AOIA 4DYMA 3RPOA 3AMYA 4FV5A 5I9YA 2JFLA 2FYSA 4IWOA 2J0JA 4U0IA 4C4IA 4RWIA 5BX0A 3G90X 5JN2A 4BL1A 4GK3A 1P14A 2AUHA 1A48A 5EKOA 2W99B 3FBVA 5I9UA 2GSFA 4AZEA 4C35A 4BY9E 2VV9A 4CMOA 2C6TA 2C3IB 4UWYA 3QGWA 4FKOA 2CKOA 4RWKA 3MH1A 4I6FA 4MHAA 5DVRA 5AP1A 2PU8A 4EQCA 4E4MA 3NNXA 4F63A 3TDVA 3MPTA 2C6MA 2RIOA 4JG8A 3W55A 3BV2A 4M7IA 3DKGA 1WMKA 4E6AA 4IB0A 2YZAA 4WNOA 2GCDA 3GQLA 2Y9QA 2RFSA 2W7XA 4YHTA 4DG0E 5JT2A 4X2KA 3VS1A 3QUPA 3UZTA 2WIHA 2OU7A 4RIWB 4R3CA 1ZYDA 4IJ9A 2GNJA 2ITUA 5HX8A 2BDJA 1DI8A 2P2HA 4ITJA 4FK3A 2WNTA 4BIEA 2R3RA 4FSWA 4XV3A 5D12A 2OLCA 3FZPA 4BKYA 1HOWA 4ZZNA 2ITOA 2PZ5A 5T3QA 5I9WA 4QMQA 5CTPA 4BCKA 4EOQA 2BR1A 2CJMA 3DA6A 4I6BA 4LV5A 5AP0A 4AU8A 2IZUA 4FKJA 3V3VA 4BWKA 5AUYA 3HV5A 3UVQA 4YZMA 5AAEA 2CN8A 5CI7A 4EH5A 3V8SA 2W9ZB 4EHVA 3WF8A 1XO2B 5HCYA 4C4EA 5C26A 3VS4A 1XJDA 4AT3A 4TY1A 2RG5A 3D7ZA 4B9DA 4E4LA 2VWZA 5A9UA 5IMXA 5C03A 2UV2A 2W9FB 3A7FA 5KMMA 1UNLA 4O0TA 2BRHA 3VBVA 4D1SA 3ATTA 4IB3A 2BKZA 3SHEA 2F2UA 3CLYA 4I24A 1CKIA 1DS5A 3QAME 4NKAA 4YC8A 3LQ8A 2UW8A 5A6OA 3ZZEA 3DKFA 4UYAA 2I6LA 2QHNA 3II5A 3QUDA 2RG6A 4ZOGA 3CKWA 3AC8A 4WNKA 3W2PA 4BCNA 4K1BA 2XK9A 4I6QA 4R3RA 3MV5A 4XV9A 3TNQB 4AGDA 5IEYA 4G6LA 4W4VA 5JQ5A 1S9IA 3CSVA 5C8NA 5I9VA 4CFNA 5JGAA 2HAKA 3ZSGA 3R02A 4M13A 3W2SA 5JRSA 3C4EA 3QZIA 5M56A 4YTIA 3OBGA 4D58A 2VWXA 3LFNA 3C7QA 4L45A 3RP9A 3L8XA 4O6EA 1Q24A 4D4VA 4YTCA 1Y57A 5EK7A 3D7TB 3HAMA 3K3JA 3UC4A 4HZRA 4XOZA 1QPEA 1WVWA 4IC7A 3LE6A 4RC3A 4J98A 4DLJA 4EH7A 3HRCA 4QNYA 4RWJA 3TJDA 5LVLA 5AR2A 3PE1A 3PZEA 2XYUA 4QMXA 4TWPA 5E1EA 4ALVA 5J1WA 3QKMA 2BZJA 2JDTA 2QODA 4W4XA 5IDNA 2J0MB 3FI3A 3E63A 3F82A 2XS0A 4BTJA 4JBPA 1NVRA 3CQWA 3R7EA 3NUPA 4ITHA 3RPYA 5A4QA 2GNIA 2RKUA 4DH5A 3FLZA 3GT8A 3QQJA 4IX3A 4U7ZA 4RC2A 3KVWA 4FZDB 2XK8A 4FSZA 1UU8A 1GZOA 2X4FA 1ZYJA 4FT3A 2ERZE 1TQIA 4F7LA 3ZC5A 4FIHA 1BI8A 3I60A 2X7GA 4O0YA 2FUMA 4Z7HA 3CQUA 3P1AA 5DT3A 2YCQA 3BYUA 3AG9A 1A9UA 4I20A 4I5MA 1ZLTA 5AP5A 5C8KA 2HIWA 4RLKA 5CU0A 5EKNA 4DH3A 4KS7A 4USDA 3LQ3A 5J95A 3DBCA 3NR9A 2ITPA 4FX3A 3SX9A 1Q3WA 3T9IA 2IJMA 5K0XA 4ALUA 4RJ4A 2BHEA 5EYCA 4XG2A 3NUSA 4PRJA 2A27A 3KXHA 3QU0A 5FEQA 5TF9A 3WZEA 2XCHA 3H9OA 5L6PA 4C36A 3WARA 4C7TA 4NM3A 3GBZA 4Y72A 4PX6A 3O2MA 4PTCA 3BHTA 2ITWA 2X0GA 1T45A 3R8UA 4FR4A 4EONA 1OUYA 1U54B 2X4ZA 3MFTA 2IW8A 4G16A 3BLQA 5FTOA 4BN1A 2GNGA 4B8MA 4FKSA 4ASXA 2E9NA 2QKWB 3BBTB 4MXOA 3ID6C 4E5BA 3ZSHA 5FM2A 2CCIA 1STCE 4O82A 3FE3A 4LGDA 4BR3A 4G5PA 5AEPA 4IX4A 5CF4A 5K5NA 2YITA 4LOQA 4QP1A 1H1RA 3EQCA 3LJ2A 4RVLA 3MPMA 4B7TA 4EK8A 3AC3A 4TWNA 2ZDTA 3OTVA 4FZ7A 4Q2AA 5AA9A 4KA3A 5HX6A 4ZSLA 5M44A 4DT9A 1JQHA 2PVHA 2R3OA 5IA0A 3DNEA 4YJUA 4EH9A 4B4LA 1NXKA 2BROA 4E26A 4UEUA 4EYMA 4JDHA 2XP2A 4FG9A 2Z7SA 4QMNA 4M69B 4XYFA 4R78A 2VZ6A 2BIKB 2YCSA 3OG7A 5TE0A 3R83A 3RINA 1KE8A 4RJ5A 4EKLA 4YP8A 1J3HA 2E9OA 3PUPA 4RA4A 4E5WA 4OAVB 5EQYA 3ORNA 4C2VA 3G6GA 4BRXA 4G6OA 3HL7A 4XP2A 3VHEA 3CY3A 3FHRA 3ORKA 2A4LA 3FUPA 2J9MA 3R7GA 5HEZA 4U5JA 3G51A 4O84A 3FWQA 4QQJA 4FTOA 4XG4A 3RCJA 4YSJA 1U5QA 2Q0NA 4QYEA 4AUAA 4D0XA 5HORA 5HG7A 5IISA 1JWHA 3OEFX 3PXRA 4PDSA 4RJ6A 2EXMA 5E8YA 2PVRA 3UNZA 4WIHA 4FNWA 2GS2A 2A1AB 2EXEA 4AE6A 4CV8A 4A07A 1J7UA 4ZS4A 5FDPA 2JAMA 1SYKA 3Q53A 4DEHA 3I7BA 4V04A 5EM7A 5FQDC 4HVSA 3TIZA 2VTIA 5FP6A 1P4FA 1JPAA 4DG3E 5HZNA 5J1VA 3FLYA 3KY2A 4U6RA 4XS2A 3HRFA 3JS2A 2IW6A 4RMZA 3PIYA 4D2RA 5J8IA 4EOKA 4F4PA 2YM5A 4YURA 2E9VA 4MQ1A 3EN4A 4BYJA 3VUMA 4KS8A 4IC8A 4MXXA 4FEQA 3VQUA 2R4BA 4DINA 2YM8A 3A7HA 3ZUTA 4L44A 2HK5A 5GNKA 4R7IA 4FZFB 2C0IA 3MW1A 4XV1A 3JYAA 4FSRA 4I0RA 3ZUVA 3ZM4A 4F9WA 5C01A 4BCOA 4EORA 4HJOA 3O51A 4QQTA 5BVFA 3E7VA 3GNIB 5A4TA 1BLXA 3LCSA 4FTKA 2EB2A 3BELA 5CEPA 2R3GA 4AOTA 3IPHA 5BUEA 4CVAA 2B55A 3L8VA 4BFMA 2XIRA 3FI2A 3PSDA 4RVTA 1ZYLA 4AP7A 4EOMA 4KIOA 1MP8A 1VZOA 3IG7A 2YWVA 4APPA 3L1SA 3OW3A 4YJRA 3MJ2A 3MH0A 5IKWA 3U6IA 5J9YA 2NRUA 3MTFA 2AC5A 3BQCA 4PMSA 4S34A 5AADA 4OTRA 4PL5A 4DEDA 3DFAA 3B2TA 3JPVA 3R8VA 3UBDA 4M68A 3EWHA 4HGEA 3VN9A 4BCJA 5KMJA 2XBAA 3DFCB 3RAHA 4YZBA 4EH6A 4FNXA 3HKOA 3Q4TA 4AXAA 2ZAZA 2PTKA 2JC6A 2VWVA 2P55A 3D5VA 3PJ3A 4HCTA 4RJ3A 4TYHA 3ZH8A 4C61A 4F6SA 3AT4A 3NZ0A 1W82A 3HDMA 2OJ9A 4S32A 3RPVA 5IF1A 3NPCA 2A0CX 1K3AA 4MH7A 1OKWA 4QP9A 3ZHPC 4H3BA 4ZTLA 4TNDA 2OSCA 1IA9A 4F1MA 2YCRA 5E8ZA 3AMBA 2QOBA 3IW7A 5DBXA 4ORKA 4FKVA 5LVMA 4JBOA 2J51A 2X1NA 5HTIA 3ZZWA 5LMKA 5CX9A 2ZM3A 3F69A 4MX9A 1AGWA 4OT6A 4AZTA 5ETCA 2I0YA 4IZ5A 4A4XA 2WMUA 2Z60A 3ERKA 4FK6A 4W4WA 4WBOA 4QP4A 2ZM1A 1W7HA 3MFRA 5CU2A 4E6QA 1Z9XA 1Q8YA 1ZY5A 3UG2A 3DK3A 3MSSA 4C58A 3VBYA 4TTHB 2BRGA 3ACKA 5DR6A 4DT8A 4XOYA 2ZM4A 4BCHA 5CSVA 4DFYA 2PK9A 5DE2A 2IVTA 3PZHA 4RWLA 3ORZA 4RSSA 3LCDA 4WNPA 3PYYA 3D0EA 3FZSA 4YPSA 5BUJA 2PVFA 2XMYA 5JRQA 5CNNA 4EI4A 4DN5A 3UE4A 3FI8A 2X7OA 3DDPA 4KSQA 5BVDA 5HBJA 2CGWA 2BFXA 1LUFA 3FXZA 4FSYA 4QMSA 2XIZA 4DC2A 3PRFA 3V6RA 3E64A 4ITIA 4MCVA 5HVYA 2QC6A 2WMBA 3N9XA 4RFYA 3SQQA 1B6CB 3VNTA 4AZFA 4UMUA 3EN5A 3HA8A 4OW8A 5KMKA 2R3JA 2CKPA 1OB3A 2J0LA 3UNJA 2UZVA 4KABA 2A2AA 3GXLA 5IA1A 3PXZA 3ZTXA 4I0SA 4FODA 4EH3A 2UVZA 2UZTA 4FV1A 1NT2A 3NLBA 3ZBXA 2WTKC 3QQGA 4FVRA 2WU7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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