4OTIA

Crystal structure of prk1 catalytic domain in complex with tofacitinib
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
335
structure length
303
Chain Sequence
RKSPLTLEDFKFLAVLGRGHFGKVLLSEFRPSGELFAIKALKKGDIVARDEVESLMCEKRILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLMLHIHSDVFSEPRAIFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTEGYVKIADFGLTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSERDAEDVKKQPFFRTLGWEALLARRLPPPFVPTLSGRTDVSNFDEEFTGEAPTLPPRDARPLTAAEQAAFLDFDFVAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structures of PRK1 in Complex with the Clinical Compounds Lestaurtinib and Tofacitinib Reveal Ligand Induced Conformational Changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase N1
total genus 88
structure length 303
sequence length 335
ec nomenclature ec 2.7.11.13: Protein kinase C.
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4otiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4otiA01
2XEZA 1GJOA 5TR6A 3KCKA 2PZIA 2P4IA 4JDJA 4EHVA 3WZEA 2YM5A 3CY2A 4L3PA 4H3QA 3UJGA 5D9HA 3QKKA 2PL0A 3BRBA 5DT4A 1QL6A 4AN9A 3ZH8A 4BDHA 4K2RA 4UMPA 3FXXA 1YOMA 5L2QA 1PMNA 3A8WA 3DLSA 1MRVA 3ATTA 2GNIA 1KV1A 2R3OA 3FZRA 4YU2A 1JAMA 1OPLA 4UYNA 3AD6A 4AF3A 3KL8A 4MNEA 5J9ZA 2ITYA 2R3LA 4PPBA 4XG8A 3LAUA 4IAZA 1H1RA 3LE6A 5DOSA 3GVUA 5FQDC 3QZFA 5M56A 2XS0A 3CD8A 5EKNA 2A27A 3EFWA 4GG7A 4KAOA 4WHZA 4M66A 3CPBA 1YRPA 4U43A 3H0YA 1UKHA 1SNXA 2A0CX 4MEDA 4WUAA 1PRYA 3ZUUA 4BVUA 5GZAA 1AQ1A 4YJUA 4RZVA 3QQHA 5I9VA 3NS9A 2P33A 5JFSA 5HBHA 1G3NA 4U3ZA 3I5ZA 2EU9A 2RIOA 5KHWA 1O6YA 2I40A 4FZFB 2C5YA 2XK8A 5HE0A 4CCBA 2WMAA 3MWUA 3FQSA 3BLHA 4MXXA 4WBBB 1JKKA 2YEXA 3BLRA 3F2RA 3M11A 2VWVA 4X0MA 4EYMA 5TF9A 5CXHA 5FTQA 3FKLA 4X2GA 3BYVA 5K5NA 1CKJA 5ETCA 4PTEA 4TTHB 3QD2B 4ZTSA 4X3FA 5AV0A 4MWHA 3G9LX 4R3CA 2CNQA 1KE5A 5L8JA 4FKGA 3R7EA 3L8VA 5HGIA 5C01A 4L67A 5E8YA 4AQCA 3DBEA 4FNWA 1NY3A 3QC9A 4QTCA 4EOSA 4BKZA 2V5QA 1PHKA 3EN9A 4HZRA 3ZDUA 4RQKA 3WYXA 4A4OA 4C62A 3NCZA 1WVWA 1R3CA 4F9BA 5B2LA 5M4UA 4ZEGA 3EFLA 4FTTA 3OTUA 1QPDA 4U40A 4BCPA 2XH5A 4EORA 2UV2A 2I0YA 4KSQA 4O2PA 4X7QA 3QA0A 2A2AA 4JAJA 2RF9A 2VWWA 5A6NA 1YDTE 3TZ9A 4ZZMA 5EM7A 3P86A 2XA4A 4IVDA 2PE0A 5IQEA 2IPXA 4RJ7A 4AW1A 3FLNC 3PJCA 4YTCA 4QP2A 2QR7A 1J7LA 1NT2A 3VS5A 4RBLA 4NJ3A 4DGNA 4BCOA 5I9ZA 4XUFA 3S4QA 5KMJA 3O51A 3PTGA 4V05A 5BVEA 3D9VA 1Y6BA 1ZMUA 4RX8A 4C34A 3SHEA 4OT5A 1PXMA 2PUUA 4QQJA 4XG6A 5AR3A 4CFNA 2WMSA 4ZLOA 1YDRE 5KMNA 5HLWA 3C4WA 5M09A 3BE2A 3KXGA 4ERKA 3V6RA 4PTCA 1P4FA 4IC7A 4D2RA 4DEEA 1MQ4A 2ZM4A 3QKLA 3SV0A 2W4JA 4HYHA 4PDYA 4O91A 4IAAA 2OG8A 3ZXTA 4TWPA 3C5UA 3N4VA 4BR3A 2W05A 4ZOGA 4OW8A 1YI3A 3D14A 4FT5A 4PPCA 4E7WA 3FYJX 2HIWA 4C4GA 2PMIA 2WOUA 4KWPA 4TY1A 3G2FA 2BAKA 4WIHA 4H1JA 2A19B 4KIQA 4RPVA 2JIUA 3HNGA 1GZOA 5BUEA 3VUTA 1OM1A 2E9UA 4MH7A 3ITZA 3ZRMA 3VUMA 4IB3A 2J0LA 4H1MA 3G0EA 5KX8A 3GU6A 2O65A 3QTUA 4U45A 5KHXA 2OH0E 3FZPA 4CKRA 1KSWA 3U4UA 2O63A 5CU2A 3R7IA 2C68A 5FEDA 2CPKE 3MY1A 3PWYA 2BZHB 4RGJA 5IQFA 1EH4A 2Q0NA 2VWXA 4C36A 5AADA 4MXOA 4RC2A 3LCTA 3NVKI 3S0OA 3BV2A 3MY0A 1KOAA 2WTCA 3MH1A 4I0RA 4IVBA 2EB2A 5F1ZA 3OWLA 3E3BX 5M07A 3W55A 1Q61A 5CF5A 2PUIA 5F95A 3PVWA 4IX5A 1L8TA 4G3FA 4MD9E 4L7FA 4LUDA 3SXSA 4GKHA 4PPAA 5GIOE 4NKAA 3FXWA 3FLZA 3PXQA 3LJ0A 2SRCA 1NXKA 3IG7A 4DEBA 1OECA 3M2WA 3IO7A 3JVRA 3EN5A 4D2SA 3CEKA 4FKWA 3E5AA 3C0HA 4I0SA 1XJDA 4QP6A 3TEIA 4QTDA 3R7YA 4CFWA 4I94A 2GSFA 1Y8GA 1NVSA 1P2AA 3I60A 4B99A 4GFGA 2XP2A 5J8IA 2PU8A 4EH3A 4FV0A 2J5FA 2VU3A 5IDPA 4R7BA 5HBEA 5FM2A 4NW5A 4QPMA 1Q3DA 4OBQA 5KMIA 4M14A 3RM6A 3H10A 5HLPA 4R3RA 3NCGA 1VJYA 2JLDA 1XO2B 3D0EA 3BGPA 4ZSGA 4KKGA 2WTIA 2YM3A 4RWIA 2UZUE 2VD5A 5E92A 4XG3A 4DH3A 3MA3A 4FIJA 1BL7A 3FSFA 3TKIA 1FVVA 4HYIA 2WD1A 5JN2A 4OR5A 3MW1A 3EQDA 2X0GA 4I23A 4ZTRA 3QUDA 5B0XA 3UTOA 4ZZOA 5AIKA 4QRCA 3TNQB 4FTIA 2E9NA 4E8AA 2WQBA 3ZYAA 2B54A 3V3VA 2UZOA 2XM8A 3UIXA 4FIIA 1WBWA 1LPUA 3F2AA 3AXWA 4JR3A 4WRSA 3FSKA 3IPHA 3GCUA 4IADA 4YZCA 5FXQA 2OF2A 3FUPA 5AMNA 3I6UA 1YI6A 3LQ5A 4L00A 1DM2A 4JR7A 4KBKA 3JR1A 4FTUA 4FKLA 2VTQA 4FZDB 3I0OA 3NNVA 4D0WA 3TUDA 4B8LA 4HVGA 3QQFA 2VUWA 3IDBA 3Q04A 3FMKA 3VUKA 1Q8TA 4L3LA 3GQLA 3REPA 4O0WA 5JZJA 4ENXA 4K6ZA 4CMTA 4A9RA 4F1MA 3FZOA 3PE1A 5HORA 5M06A 4F1OA 2HYYA 3NUPA 2FSLX 2XB7A 5CENA 4FTRA 3MH3A 3S1HA 5DR6A 5HE1A 4EZ5A 3CQEA 5AR4A 5EM5A 4EK5A 5JGAA 3F66A 3DTCA 4RX9A 5K0KA 3WOWA 4M15A 3ZRLA 4F0GA 3ZS5A 4FTQA 3NGAA 4XYFA 4OUCA 5A4LA 1M52A 3RPOA 3JXWA 4HVSA 2F7XE 4DE4A 5C4KA 4CNHA 1GOLA 1BKXA 4S34A 2W17A 4NIFA 3L9PA 2W9ZB 1GAGA 1TKIA 3NW5A 3TXOA 3SG9A 1UNHA 2IO6A 2PK9A 2VO3A 4V0GA 4Y85A 5LJJA 1MQBA 4U81A 3O71A 5GJFA 3NNUA 1OL6A 3FKOA 5GINE 1XQZA 2OW3A 3EMGA 1YWNA 4DFLA 2X8EA 3HV7A 3QXOA 2OH4A 4U9AA 5I9YA 4QMXA 1ZLTA 2W5HA 3PJ1A 3GXLA 3DY7A 1PW2A 4FODA 1G8SA 2JGZA 1Z57A 1O6LA 4J97A 5BMSA 5CYIA 3WF7A 2ACXA 3AMYA 4OTFA 2YLFA 4S33A 2WTWA 2Y4IC 1M7QA 3QWJA 3OT3A 4TT7A 4U6RA 3GP0A 4DA5A 3MTFA 5A4TA 4C58A 1G8AA 4ANQA 4F6WA 1UV5A 4ZMFA 1OMWA 1XKKA 1KE7A 3BYSA 4PDOA 3OCTA 4QTBA 5CI7A 5EYDA 4NH1A 3F7WA 3NAXA 3SRVA 3UOHA 3EQPA 2XK3A 5IH4A 2C4GA 3OTVA 4QQ5A 2YCSA 3RWPA 5J79A 3AC1A 4U97A 3V6SA 4ZJVA 3JPVA 4KB8A 3ZCLA 2DWBA 5CZHA 4JDKA 3WI6A 4C4FA 4CG8A 2ZAZA 3NIZA 4BDJA 1K2PA 4RA5A 3FI3A 4D2PA 2YCFA 3RWQA 5KMOA 4ZSLA 5AR8A 2WEIA 2ZV9A 4EQMA 2I0EA 4KBCA 4XV3A 3B2TA 3EL8A 4D0XA 4GS6A 3A7GA 5IKWA 1IA9A 2QD9A 1NVRA 3UDBA 4MXCA 5ANEA 4DFUA 2E9OA 1X8BA 2E9VA 2Y0AA 4O84A 4CD0A 4WUNA 3BHTA 2O64A 1BI8A 2IW6A 3HP5A 1FGIA 4GJ2A 4ASXA 1YW2A 3VW6A 4BCGA 4AOTA 4FOBA 3QZHA 2PVMA 3LFBA 5LXMA 1VYWA 2EXEA 5EI6A 3FMHA 4MXAA 4E3CA 3PP1A 4F9AA 5IQGA 3A8XA 1OPJA 2BR1A 4BGHA 4QMLA 4MXZA 3AC5A 3MFUA 4EK6A 2HK5A 2C6TA 3EZRA 4YO4A 2HXQA 1BLXA 2X8DA 5E1SA 4K33A 4BBMA 2VWZA 3O96A 5HX8A 1WBTA 1P4OA 2XNBA 3QCQA 2YZLA 5L6WL 1DAWA 1B39A 4DGOA 4X2JA 5CY3A 5AWMA 2IZUA 3UO6A 2R3QA 1U5QA 2PZ5A 2YISA 4J98A 5KKRB 3Q2JA 4KRCA 3Q5ZA 4R5SA 3VIDA 3K3JA 3OFMA 4GT4A 4RFZA 3UBDA 1MUOA 4FT9A 2HY81 3R9DA 2R3MA 3WF5A 4G34A 4LQMA 5AEPA 3VNTA 4BL1A 2W1ZA 3A60A 1R0PA 2HXLA 4AT4A 4GRBA 4HOKA 3MH2A 2BRGA 4NW6A 3SA0A 5IUHA 4A9UA 5AV2A 1JKTA 2ZMCA 2YACA 3QYZA 2WTJA 2XRWA 3KU2A 4KIOA 5EQPA 5M4CA 1V0PA 2OI4X 1PXJA 2XEYA 5DRBA 2X7OA 2QOBA 4USDA 1HCLA 4L7SA 5BNJA 2UW5A 3JVSA 4XNEA 5BMMA 1UWJA 5HE3A 3HV6A 4O2ZA 2WTKC 2W1DA 4MNEB 5IA2A 2UW4A 5LVNA 2PE2A 2W99B 4CQEA 4LGHA 5T68A 3DBCA 1OBDA 4ZY5A 3ZSGA 3CY3A 5H9BA 2J0JA 4BZDA 5CVHA 1CSNA 3DKGA 3VBXA 3VJNA 4IFCA 5EHOA 1PF8A 2VWIA 4LI5A 4I6FA 4DT8A 5CU4A 5E8XA 4QMQA 4HGTA 2BIKB 4EH4A 4G2FA 4BZNA 4FV1A 3LFQA 4V01A 5FBNC 4YC3A 5TE0A 4BN1A 4E6DA 4F08A 2GQSA 2R5TA 5FEQA 4EH5A 2OXDA 4RWJA 3D83A 4F99A 5IA3A 4Q5EA 3QUEA 4FMQA 5CF6A 3QCSA 3ET7A 2IZSA 4OGRA 4FSWA 3IW4A 1Q5KA 3GU7A 3TIYA 4QPSA 3FY0A 4WSQA 3IW8A 5EFQA 3VS1A 3VC4A 4IB0A 5HG7A 4ONAA 3DXPA 5GIPE 4E5WA 2BZJA 4KS8A 5DT0A 5HCZA 4M7IA 2VNWA 4G3CA 3AGLA 4I1ZA 4IZ7A 2IVVA 4GK2A 3FQEA 4UB7A 2CGVA 3FLYA 3O7LB 3AT4A 4GFMA 4K11A 4WOVA 3LQ8A 3W1FA 3P7BA 1UKIA 4X3FB 3T8OA 4FR4A 1SMHA 3PYYA 4NT4A 4ZAUA 4ZLZA 4FV4A 2B1PA 3UVPA 3MFRA 4MVFA 4GG5A 5CEPA 4ANLA 2X6DA 1OKYA 5EW3A 2ITWA 4CRSA 3FHIA 4EOQA 4X6QC 4EH2A 4P5QA 4QMMA 4XP2A 4O0VA 4GT3A 3QXPA 3QTIA 2GDOA 3HKOA 3GCSA 3NUNA 4HZSA 4NUSA 4I93A 4FE2A 4NSTA 1JKLA 2O3PA 4QMWA 4FKJA 2Z02A 5CAQA 3U9CA 4IH8A 4B4LA 3EB0A 4AA4A 4BC6A 2WIHA 3QTQA 4FSQA 4AUAA 4CCUA 5L3AA 4BCNA 4MF0A 3VS7A 1ZYSA 5IQBA 4U80A 1URWA 3ORTA 3ZTXA 2PVKA 3BLQA 4UWBA 5C8MA 4HGLA 3PVUA 3VN9A 3UQFA 3A2CA 5J7BA 4F70A 5FP6A 1OL7A 2UZVA 3Q3BA 4XBRA 1ZY4A 5D1JA 5C9CA 5DN3A 3OY1A 4AG8A 4BIBA 3QTSA 5AUVA 4BDIA 3ZLXA 3MFSA 3DA6A 5AP4A 2ZOQA 3KB7A 1J3HA 3ZEPA 3SOCA 5DYJA 5FDXA 3KRRA 4FKRA 2Z7QA 4FT7A 3C0IA 4BRXA 3HUBA 4D4VA 2QKRA 4XH6A 3ZO3A 5E4HA 5AP2A 3V51A 5I5ZA 3QYWA 2R3NA 3E3PA 4BI2A 2BZIB 2FH9A 2YDKA 1WBSA 3BE9A 1H8FA 2OZAA 3POOA 3R8ZA 4YGAA 5IMEA 1SNUA 5CEOA 4G31A 3A7HA 3NWWA 5HCYA 3W2SA 3FQHA 4IZAA 4GKIA 2VZ6A 1XBBA 3LHJA 5LARA 1CTPE 2EWAA 1H24A 3TTJA 3P23A 2AC3A 3DKOA 4EHEA 5DFPA 4JG8A 3FI8A 2B9IA 2XIRA 1KWPA 3EQFA 2ZMDA 3FMMA 3ENMA 2VO7A 4ZTQA 4O0XA 4CZUA 5AAFA 1K9AA 1WVXA 4CFVA 3MSSA 1R39A 2WMQA 5AIRA 2YCRA 3G6HA 3VAPA 3IDCA 3NIEA 4NKSA 4XOYA 4B0GA 5CQWA 3QX2A 4HCTA 4QP8A 2W4KA 2HOGA 4MBJA 3VBTA 1TQMA 4LRKA 3QQJA 4I6QA 4DFZE 4S32A 2XZSA 4N6ZA 4AT5A 3DK6A 5HHWA 5IPJA 2UW6A 4Y46A 5EI8A 3GB2A 3SDJA 4R8QA 4HNFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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