4PUZA

Crystal structure of spleen tyrosine kinase (syk) in complex with gs-9973
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
271
structure length
263
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of GS-9973, a Selective and Orally Efficacious Inhibitor of Spleen Tyrosine Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 263
sequence length 271
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4puzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4puzA01
4FG9A 5EDRA 3W8QA 4BN1A 1M7QA 4ITJA 5A9UA 2YWVA 4TPTA 4CTBA 3PXRA 4P7EA 4IAIA 5D9HA 5CEQA 4BCKA 3GNIB 3DS6A 4H1MA 2CLQA 4NTTA 2HXQA 4QP4A 4NH1A 4RFZA 5HGIA 5AR3A 4D4SA 4CLJA 5J5SA 4M15A 4EOQA 2O3PA 5HIBA 5IQIA 4FICA 4ZY6A 5KMLA 2Y8OA 2GNHA 1OKWA 2XS0A 5CU2A 4EHVA 2ZDTA 4ZTNA 3TL8A 2LGCA 4WA9A 1P5EA 4FA2A 5J7HA 4NKAA 3R63A 4C35A 3K3JA 4I6QA 2B54A 4AW2A 2JIIA 2G2IA 3HRCA 4MQ2A 4RIOA 4TWCA 4E6DA 4FV3A 4EOJA 4PDPA 5I9WA 2YCSA 4Z55A 4TYJA 3GQLA 3DAEA 2GPHA 3UYTA 5ACBC 5CNOA 4JJRA 1DI9A 4HOKA 1FOTA 2PVFA 5AR2A 5F95A 3KEXA 4RPVA 3TKIA 3ZDUA 4YHFA 2PE2A 5HG5A 3F82A 1WVXA 3RCJA 3RPSA 2OFVA 5F4NA 4BHZA 4DGOA 1TQIA 2QODA 2Z7RA 3BIZA 5FP6A 3LCTA 3MH3A 5DGZA 4QMOA 1M2QA 2X6EA 3LFNA 2QOIA 2RL5A 3GOPA 2UZBA 4H3PA 2PVKA 5EYKA 4C57A 2JDSA 1FVTA 4FC0A 4X21A 3QCYA 2W0JA 3G6GA 2WQMA 4R7IA 1U54B 4BDGA 4EJ7A 3FLNC 3UZPA 3HLLA 3MGYA 4FSUA 5DT4A 2B0QA 5A46A 3O2MA 4L52A 1WBSA 4HPTE 4F64A 4BDBA 2BKZA 3Q4CA 1XBCA 2JKQA 3ORMA 2WTDA 4U81A 5H8GA 3LFEA 5TT7A 2YIYA 3R9RA 2WIHA 4YO6A 3TKUA 4I0TA 2PUNA 1QPDA 2A27A 3FKOA 4LFIA 4YHJA 2WQNA 2OJFE 5LCJA 3OG7A 2ITTA 1REKA 3PIXA 4FOCA 4M0YA 3AD6A 2YITA 4RVLA 4FKVA 5DR6A 5A6NA 4O82A 4YJTA 3UNJA 4BDHA 4EK3A 3QCSA 4UYAA 3IW4A 4WNKA 2OI4X 2QU6A 5FM2A 2GHLA 5HE1A 4IAYA 3T8OA 4NTSA 2QOHA 5HX8A 4AGWA 4YPDA 5BQ0A 4TWNA 4LV5A 2VN9A 2X2KA 4IEBA 4W4VA 3FI2A 1PXPA 2R5TA 3PVGA 4YLLA 1E1XA 3E88A 1KV1A 2WO6A 2C5NA 4FTCA 4RGJA 3QUPA 3RGFA 1OPLA 3ANRA 4M7IA 4U45A 3QBNA 1H1RA 2H9VA 5CEOA 4FSNA 3P86A 1XH8A 4C62A 4PMPA 1A9UA 4GYIA 2CGVA 5AP4A 4DITA 2ZOQA 3LPBA 2W4JA 4O0SA 2JKMA 4YO4A 4DCAA 1H28A 5CZHA 3H9OA 3PPZA 3ZLWA 3DZQA 3BQRA 3N9XA 3N51A 2WTCA 3EJ1A 4PNIA 3L8PA 5M07A 2WTIA 2JKKA 2OZAB 3DZOA 3JY9A 4HJOA 3PVBA 4IBMA 5FQDC 2CJMA 4AN9A 2EUFB 1FMOE 3OBGA 1J3HA 3HP2A 5DR9A 4AT5A 4U0IA 3W18A 1J1BA 2ITOA 2BDJA 5D7VA 1XQZA 2PPQA 2X7OA 1UU3A 3MY5A 2G2FA 3FLSA 4ZSEA 3RBWA 3VJOA 3HMNA 4BCPA 1FGKA 1PXOA 2C4GA 4I24A 3QFVA 5KBRA 1YOLA 4FZFB 4NIFA 2C1AA 3W33A 5JGDA 5K4JA 1GZOA 3BKBA 5ANEA 1IG1A 2PZIA 1WBPA 4PTCA 1UVRA 4FV7A 3FMJA 5C4LA 2R3QA 3LJ2A 1Q8TA 4X2NA 4NSTA 5IMEA 3QGYA 3RWQA 4EOKA 4QYFA 3MPMA 3BYVA 1WBOA 4YJSA 3OT8A 3WZJA 5KUPA 2BUJA 4TWOA 4Z7HA 3OP5A 2J50A 3QGWA 3FLYA 4CLIA 2Z8CA 2C6DA 2NPQA 4QP7A 5L8LA 3R7UA 4TTHB 5DG5A 2RFDA 4AOIA 4FKRA 3A7FA 5F9EA 1U4DA 3DDPA 3LXPA 3KULA 3PVUA 3FBVA 4JNWA 4I0RA 4OTIA 3A60A 3D9VA 4F70A 4FV0A 4BTJA 1NY3A 4Q5EA 3NNVA 4E4LA 4EYJA 4UN0C 1Q8YA 2HELA 2P0CA 5CZIA 5IA2A 3H0ZA 4I20A 3L9PA 3FE3A 3SG8A 1YXSA 3H4JA 4UYNA 3P7AA 3AG9A 4FKLA 1U46A 5HBJA 4L8MA 4A9TA 4ACDA 3ID6C 4GJ2A 3LCSA 3F61A 4RSSA 5HNGA 4AZEA 4TY1A 2E9VA 4IX6A 3HAVA 4ANNA 3LQ3A 3QD2B 3KXXA 4K11A 1OIRA 3ORIA 5M09A 1STCE 4E3CA 3C5IA 3SG9A 1FVVA 3DFAA 3OEFX 2C3KA 3F2RA 3C4ZA 2XJ1A 1ZMWA 4G6OA 3NUSA 5EFQA 5GJGA 3KRRA 1OGUA 2XA4A 2I6LA 4M84A 4HCVA 1O9UA 3ZRMA 3GCVA 1CMKE 1H1SA 3C0GA 5IDPA 1ND4A 2I7QA 5M4IA 4JAJA 2EXEA 5BMSA 3PWDA 5KKRC 2VX3A 4UMQA 3NW6A 4IB0A 3CSVA 2JAVA 4APPA 1OIQA 3CGFA 4MK0A 4ZTMA 3U51A 5IDNA 4QQTA 5AP1A 3SQQA 4MD9E 2R7BA 4YLKA 2QI8A 4AX8A 4GMYA 3U4UA 3OWPA 4AN3A 4D4YA 2KTYA 4Y5HA 4II5A 3RJCA 3DV3A 3F2AA 5LCKA 3VC4A 3DQXA 2PUPA 2QO7A 4ZSJA 5CF4A 4FSMA 4UY9A 5JGBA 5CSXA 2QG7A 3O8TA 2JFLA 2ITXA 4X7QA 4BKYA 1APME 1PKGA 4F6WA 3BGPA 5JN2A 3AMYA 5HKMA 4DC2A 3CIKA 3LQ8A 2CKEA 2W1DA 1OMWA 1YHVA 2YN8A 4FT0A 5FXQA 5IKWA 3RTPA 3VF9A 3CJFA 5C4KA 4JX3A 4X2KA 4O7NA 2B55A 1PY5A 1PMVA 4FKGA 3A7GA 3HL7A 3NW7A 4GT3A 3G9LX 3R7EA 3IW7A 3BCEA 3ZEWA 5AR8A 4E4MA 4PDYA 4Q2AA 4GRBA 3P78A 2B9JA 2JD5A 2DYLA 2X6DA 2YIWA 2ZV9A 3JUHA 5HIDA 4D4VA 5ICPA 3VBTA 2CMWA 3VBWA 3NYXA 5BYLA 3MFSA 2J5FA 5TR6A 4QNAA 2WELA 3LFSA 3UJGA 1HCLA 4DT9A 4AZWA 3GCQA 2XJ0A 3RZFA 4BCIA 3WBLA 1KE6A 3ACJA 3I60A 2CNUA 3GC0A 4MXCA 4O0RA 4TYEA 4QP3A 4XG4A 2ITPA 3FYJX 4FGBA 4YZ9A 4C61A 4EI4A 4GFGA 4LM5A 2EXMA 4F99A 1QPJA 2QD9A 4LMNA 2R64A 3I0OA 5CEMA 1WVWA 4F1OA 1ZY5A 3GB2A 3UMWA 3KXNA 1OBDA 4JOAA 1YHWA 4L01A 4YNOA 4JQ7A 4EBVA 4CEGA 4YZDA 1MQ4A 3PLSA 4FL2A 2FO0A 3PP0A 5J9YA 3MPAA 3ORTA 3DT1A 3FZTA 3F66A 3IKAA 1IAJA 1VEBA 5ANOA 3OS3A 4GFOA 4J97A 3UO4A 4BF2A 4C3FA 2IG7A 1CDKA 4DF3A 2ZB1A 2WOUA 5EW9A 3AT4A 1BL6A 4S30A 4FYOA 4NZWB 3NAYA 5KHXA 4ACGA 2GTMA 3A4OX 4WSQA 5D41A 4OT6A 1U59A 1URWA 4HZSA 3Q96A 3FZSA 4DEBA 4FTNA 2B9FA 3VS4A 1YKRA 2C6OA 4O7VA 2YIQA 4AT4A 3C4CA 3VS1A 2P2HA 2J51A 1A06A 3KF7A 3OOMA 4YC8A 3BV2A 4KKGA 3FKNA 3G0FA 4DEDA 4FV2A 4HPUE 4KIKB 2RG5A 2IW9A 4G16A 3R8LA 3CKWA 4EC9A 1Q8WA 1XHAA 4O86A 3IG7A 4I5CA 4GJ3A 5HIEA 5J95A 4XX9A 4F0FA 5I9YA 1NT2A 3JPVA 2WIPA 5HEZA 4YZMA 5EH0A 3LZBA 2W06A 3WZUA 4D0XA 4BI2A 3AMAA 4WG5A 1SNUA 4L45A 3NUUA 1LPUA 3UYSA 2YWPA 1ZLTA 1Q3WA 2NRUA 4NM0A 2BFYA 2W9FB 3EFKA 5FLFA 5HTBA 2BZKB 1PYEA 4WOVA 3C4EA 5EYCA 3B8RA 4YUQA 4D2VA 5L6PA 3IECA 3U4WA 4CCBA 5JEBA 3AC4A 3ZFYA 4PY1A 4QMMA 2WU6A 2ZM1A 4AF3A 4EH7A 4DFNA 4OW8A 5BUIA 2HW7A 5HE2A 4LGGA 5A4LA 4PQNA 5DOSA 4WRSA 3PFQA 3QXPA 2PMLX 2WTVA 5BVEA 2X8EA 4FI1A 3K2LA 4EH6A 5L6WL 2GFCA 3BGQA 1QPCA 3AD4A 5IQGA 1OKYA 3NSZA 3ITZA 3PSCA 4YC6A 2X8IA 4ACCA 1SVEA 4PDOA 4C59A 2PHKA 5IA3A 5JRQA 4BY9E 2UW6A 3PWYA 3WF8A 3Q2MA 3LJ1A 4AZFA 5LXMA 1REJA 2XP2A 4LRMA 5D12A 3CKXA 5BVKA 4OBQA 2ETKA 3EHAA 4YJNA 4Q5HA 5M4FA 4HNIA 4AQCA 4TNBA 3DDQA 3OROA 3RKBA 3PXYA 5FBOA 3RP9A 2CNVA 4N57A 1Y57A 1Z57A 4ALUA 3MDYA 4EQCA 3H0YA 3SDJA 2VO7A 3V51A 3QQFA 4FMQA 4XRLA 2PK9A 2P33A 3JY0A 4K0YA 4YJOA 4TT7A 4RIYA 4QMQA 4CFWA 3BHTA 3EFWA 3THBA 4CG9A 3PZHA 2UZOA 4WD5A 5ETFA 2UUEA 5TOZA 2G9XA 4X2GA 2XNOA 2OH0E 3Q9XA 1H26A 4IH8A 5E8SA 4ANBA 3LM0A 4JG6A 5CSPA 3NAXA 3KXMA 3TZ7A 3BWFA 4CRLA 1GZ8A 2QHMA 3COMA 4M69A 1PRYA 4CFMA 3UIMA 2VTSA 2BIKB 3ZM9A 2OJ9A 2R3NA 4ANOA 4HGSA 3ZOSA 2HXLA 1DI8A 2VGPA 3TJDA 4G5PA 3QQGA 4RFYA 4N0SA 1V0PA 2R9SA 3KREA 2KULA 4BI0A 4EHZA 1PMNA 4QQJA 5I9VA 5EDQA 2BRHA 4GVJA 3HEGA 3V04A 3KXHA 2YLFA 4O27B 4QP9A 3ZSIA 4EH8A 4CKRA 4L6QA 3SA0A 5AUVA 3VBYA 4AP7A 2QOQA 2GNFA 3P79A 4MNEB 5A4EA 5DYJA 5EI8A 3P5KA 4NL0A 2QR8A 4KSQA 4CGAA 1FGIA 2E9OA 5H3QA 4CFNA 5IEVA 4R1YA 1YOMA 3UQGA 4E8AA 3CBLA 4GSBA 4IQ6A 4YP8A 5BNJA 2R2PA 2ERZE 3MA6A 4FV5A 4D1ZA 4FVPA 4XH6A 3ALNA 3ZO1A 3IOPA 4ZOGA 4DGGA 4HCUA 4CQEA 4JXFA 1H4LA 3L1SA 2X2LA 3D7TA 1UV5A 3GQIA 4AW1A 2BAKA 4IIRA 2OK1A 4NJ3A 1CKIA 1JNKA 2CCHA 3TI1A 4IM3A 3I6UA 1GJOA 1KE9A 4G34A 4PF4A 4MYGA 4QMYA 3ALOA 3R1SA 2C0IA 2W5HA 2GMXA 3T9TA 4LUDA 3DB8A 3PTGA 5EYDA 1BX6A 4AA5A 3DNDA 4JL9A 3G0EA 3BYMA 4DH8A 2PL0A 3HV4A 3HMPA 4EH4A 4FTTA 3MY0A 4E6AA 4E7WA 2Z60A 2ACXA 4QTBA 5CANA 4QTAA 1W7HA 1B38A 5IA4A 2BZIB 3KVWA 4YBKA 5DNRA 2CKQA 4MQ1A 1YWRA 3DBCA 3BQCA 3CPCA 2XJ2A 5TO8A 3LCDA 5FUTA 1YDRE 4EK5A 2W1ZA 1ZYJA 2I0HA 1YI6A 5ANGA 2NRYA 5HNBA 2IZUA 3VS6A 1MRYA 2YDKA 4RX8A 3G33A 4HYSA 1NA7A 5ANJA 3TUDA 3VHKA 1RE8A 3FEGA 3V8TA 3OD6X 4QMWA 5IUIA 3UOJA 4KABA 3HVCA 4Q9ZA 3NYVA 2QO2A 4JIAA 1GZNA 4HVIA 3R30A 2WTKB 4RLLA 4W4WA 5DHJA 1YXXA 2OXDA 3P08A 2VO3A 3MB7A 4BCJA 3FQHA 2W17A 3E92A 5CY3A 3HKOA 3HMOA 2BKKA 4FIHA 1YQJA 3QCXA 3HUBA 4IB5A 3F3TA 3L8VA 3O8UA 5DI1A 4FKPA 3G5DA 3NWWA 3RAWA 4E6CA 3LIJA 1P4OA 2XCHA 4PP7A 4GK2A 3KVXA 3R22A 2BRMA 5DBXA 2WMRA 3GT8A 3IW5A 2W1EA 3EQPA 1H25A 4H1JA 4I4EA 2C5VA 2X81A 4FKTA 4FT9A 3RPYA 4E1ZA 3E3BX 3FY2A 4L3JA 1PYXA 4E4NA 3R83A 3TNPC 4EZ5A 3NYNA 5IA5A 4BDFA 2C0TA 1XH4A 4RZVA 3JXWA 4NFNA 2I40A 4YGAA 2HWOA 4AA0A 2BVAA 4BDEA 2HK5A 3QTQA 1WVYA 3PPJA 1OITA 3Q9ZA 3MW1A 3VHEA 4DFUA 4FIGA 4KSPA 4YSJA 4L3PA 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