4Q5HA

Shigella effector kinase ospg bound to amppnp and e2-ub ubch7-ub conjugate
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
AEPILGKLIGQGSTAEIFEDVNDSSALYKKYDLIGNQYNEILEMAWQESELFNAFYGDEASVVIQYGGDVYLRMLRVPGTPLSDIDTADIPDNIESLYLQLICKLNELSIIHYDLNTGNMLYDKESESLFPIDFRNIYAEYYAATKKDKEIIDRRLQMRTNDFYSLLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Basis for the Inhibition of Host Protein Ubiquitination by Shigella Effector Kinase OspG.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein kinase OspG
molecule tags Unknown function, protein binding
source organism Shigella sonnei
total genus 53
structure length 169
sequence length 169
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4q5hA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4q5hA01
4M0ZA 3DAJA 3WZEA 3QHWA 3UIXA 4TNBA 2G2FA 2CKQA 4DA5A 5IISA 3CE3A 4TWNA 4NJ3A 4PMSA 4DG2E 1NXKA 4UXQA 3ZZEA 4O86A 3TDVA 2UZBA 3FZSA 4EOPA 1Q97A 3SG8A 4IQ6A 5G1XA 3MFRA 3OTUA 2Y8OA 4JQ7A 4YBKA 1XH4A 4FKUA 4D2SA 1S9JA 4YC8A 3QL8A 3W2QA 4G6NA 5FXRA 1ZMUA 4LFIA 2HK5A 2PZIA 4C4JA 3LCKA 2VTJA 4L3PA 1B38A 4IM2A 4DC2A 1YHWA 2CGWA 2VTAA 3AC3A 3O2MA 4J8NA 4PPBA 4DFZE 4AGUA 5L8KA 2IPXA 4JIAA 2JIIA 4IB0A 2OIQA 1ZRZA 2PE0A 2X2KA 1H0VA 3O51A 3HMIA 5DN3A 2R0UA 4JBPA 1OZ1A 1Q62A 4CZUA 3LOKA 2CN8A 3IG7A 2W06A 3GCVA 5EFQA 5B0XA 3ZHPC 1U54A 3OMVA 2QC6A 3V5PA 3QXPA 3IW7A 3R9DA 3TZ7A 2YCFA 1YWNA 5HE0A 3RAWA 3FBVA 4C57A 3W2CA 2JAMA 4FR4A 5CALA 3ITZA 4M8TA 4BI2A 3AD6A 4ANOA 3UO5A 3EYGA 4HCTA 2CPKE 1OKWA 3EMGA 2OBJA 3GP0A 5E8ZA 5JRQA 4F0IA 4FVPA 2CGUA 3U6JA 2OZOA 5D7VA 5KKRB 4FEXA 3WIKA 4O7RA 4WG4A 4ACDA 5D10A 4IVCA 4L3JA 5HU9A 4CT2A 1A9UA 3O0GA 4CG9A 5J5TA 1H25A 3D83A 3PPJA 4FTAA 1OBDA 2YM6A 3QHRA 2JBOA 4EH7A 4XG7A 4RT7A 4HVSA 4LGGA 4JRVA 4MF0A 4QYHA 4I5PA 2FSOX 4JX3A 3JVSA 3D94A 1RE8A 3N4VA 1XKKA 2OG8A 4EKLA 3TZ9A 2X6DA 4LOPA 2XM9A 3UG1A 4JAJA 4BYJA 2RIOA 4DCAA 2OJGA 1Q24A 2CHLA 2X4FA 3AGMA 3QA8A 2ERZE 2CJMA 3FXXA 4O2PA 4OTFA 4QT1A 3VUDA 2VWIA 4ENXA 1PXKA 3KXNA 3G15A 4QP6A 5ANGA 5M57A 2P55A 4BCQA 3SW7A 3OCSA 3LW0A 2G9XA 3F5XA 2ZV2A 5JZNA 3U8WA 4QMTA 3UQGA 1OITA 4IWOA 3CGOA 4RJ6A 2FO0A 3NNUA 5BVOA 2W9ZB 4EOKA 3Q9XA 4BKYA 1DS5A 4F65A 3HKOA 3O17A 2YAAA 3K5UA 5EYDA 4JJRA 4CRSA 5EQEA 2B9IA 2XCKA 3ZXTA 3OWPA 4EK4A 2VTMA 3DQXA 3R22A 4JNWA 4NM3A 2OXDA 5AMNA 5AR4A 5LMAA 3JVRA 4UZHA 2J5FA 3UZPA 4L42A 4YC3A 5IPJA 4Y83A 4YO6A 3LXKA 4NKSA 4I0RA 4GT5A 4USFA 5AFVA 4KS7A 2YM4A 3QUPA 4KKHA 4AFJA 3ZEWA 4YZMA 2I0EA 5CU6A 2OK1A 4D4YA 5FDPA 5KBQA 4U79A 2SRCA 4U41A 4YTHA 2YM7A 1JBPE 3EIDA 5DIAA 4BDEA 3LCOA 3NEWA 5DRDA 3EQPA 5FG8A 1PMVA 5DOSA 5KBRA 4D2TA 4Z3VA 4K9YA 4WSYA 4LI5A 1W82A 3NUYA 3PP0A 3QRKA 4YLKA 2C5XA 3E3PA 5BVEA 3REPA 3L8SA 4MQ2A 2PVRA 4W4WA 4O0VA 5M53A 2QR7A 5IDNA 3S0OA 3P7BA 4B8LA 1PW2A 1VYWA 5IQDA 2UUEA 4R1VA 5ANJA 3V51A 4FTIA 4WUAA 2X2MA 3UGCA 1OVEA 3GU4A 1B6CB 5F1ZA 5AP5A 5EM5A 3AOXA 4F64A 5I4NA 5K4JA 4I4FA 4NT4A 4UV0A 2R3OA 3DA6A 4U97A 4O81A 5CAOA 3R8PA 1YXVA 5E90A 3DTWA 2YABA 3QZGA 2ITVA 4IB5A 4FK3A 5KUPA 3ORLA 3E7OA 4QD6A 2WTIA 4IVAA 4AZVA 3NYOA 1YWVA 4E5BA 3TV4A 4C36A 3PE2A 4RLKA 1HCKA 3QUDA 1QMZA 2NO3A 3WF9A 2QG7A 4ZLOA 2ONLC 3ZFXA 1ZY4A 3MW1A 4N57A 2PE2A 3RI1A 1UWHA 4S32A 5DR2A 3W33A 2WIHA 3QCQA 2JDVA 4LOOA 4FGBA 4O0TA 2XIKA 3NLBA 1HCLA 2CCIA 2JC6A 4WIHA 4BKJA 3F5PA 1PKGA 3UVPA 3UQFA 4DH8A 2B9HA 3ZFMA 2W1CA 3ID6C 2WMAA 3L8VA 5FRIA 3TEIA 3BYUA 3V8TA 1YOJA 3OXZA 2YWPA 4IFGA 3QZFA 4AZSA 4EL9A 2FUMA 3VUMA 5CT7A 4NM7A 3ZC5A 3IKAA 3ZUVA 5IEVA 4GT3A 3LFBA 5CVGA 3HMOA 4HYHA 2WMUA 2ZM3A 3IGOA 4I94A 3R9NA 3BBTB 2B4SB 3ODZX 4MWHA 1OUYA 4U81A 1XO2B 2Y4PA 2YDJA 4I93A 3U55A 4FNXA 4KINA 5EHLA 2W96B 1OKZA 3AT3A 3C13A 4XLIA 1IG1A 4ALUA 3R2YA 5AP3A 5LCJA 4LV5A 3LQ8A 3IO7A 3KL8A 4D2VA 4Q9ZA 3HV7A 2WQMA 2VD5A 3BLQA 3CY3A 4J98A 5CU2A 3RK9A 3IS5A 2W4KA 3JS2A 3TKIA 2PVNA 2J90A 2PVYA 2PVLA 3ZO1A 3QQHA 3AC5A 1KE8A 4AOJA 3GFWA 5FDXA 3NNXA 3R02A 4J7BA 4IHPA 4KA3A 2JDRA 1PXNA 4IM3A 3EKKA 3MVJA 4GG7A 4MEDA 1S9IA 2XKFA 4XX9A 1OKVA 2VO0A 3G0EA 4U40A 5D11A 5IA5A 4F6UA 3PXRA 1FINA 1GY3A 1BLXA 5HVYA 1H07A 2CKOA 2PSQA 4PMMA 3MJ2A 5L8JA 2VUWA 2IZRA 4YJTA 2PMLX 4EOIA 5HX6A 4WNOA 2VNYA 5E7RA 4JL9A 3MI9A 2W1FA 4MXAA 5FLFA 4PMPA 4TWCA 4QYYA 3RHXA 2XVDA 4FTRA 4FICA 2IWIA 5CSXA 4D4VA 5HI2A 5A4CA 1BL6A 5H2UA 1ZZLA 3EQRA 4KIOA 3NYXA 4LL0A 4BIEA 2I0VA 2EB3A 3D2IA 4OTGA 4BCMA 4F99A 4GT4A 3L1SA 4ERWA 4PUZA 3O96A 3F2NA 3CKWA 3AC1A 3OUKA 4FKSA 4OBQA 2RFEA 3U6HA 4HJOA 3KRXA 4XNEA 5HBEA 3FLYA 4L00A 4CG8A 1M17A 3QBNA 5EG3A 2XNMA 2GNGA 1W8CA 4WRGA 4AE6A 1UVRA 4H3BA 3V01A 3FMJA 3PTGA 3ZU7A 4FKVA 4E5WA 3OOMA 3BEGA 3R0TA 3CJFA 3V3VA 4DFNA 1L8TA 4OGRA 3PY3A 2FH9A 3UBDA 5CU4A 3BQRA 3Q32A 3KRLA 3BE2A 3NW7A 2DUVA 3E88A 3I6UA 3IK3A 2HWOA 4WT6A 1WBTA 2BR1A 4FZDB 5CZIA 3TZMA 4NZWB 3VBWA 3LXNA 2B53A 2J51A 1PY5A 5D9HA 3QQLA 4G9CA 3IOPA 3KXXA 2XBJA 2XH5A 4IJ9A 5FGKA 4IZYA 3ZH8A 5DMZA 4WG3A 2PL0A 2PZ5A 2IN6A 4BTMA 4O83A 4ZXTA 3W10A 5HICA 3VO3A 2IVSA 3BELA 4DGMA 3MN3A 1MP8A 4AT3A 5JMSA 3TUDA 2Z7LA 2XJ2A 3HV4A 1SVEA 3QAME 5E8SA 1QPDA 3RBWA 4D1ZA 1M7NA 2XK7A 5H9BA 4W4YA 4MD7E 2V5QA 3QTXA 5IH4A 1UU9A 2ITZA 2ITWA 3WOWA 2R3FA 3BEAA 3LCSA 2GS7A 3NW6A 4JX7A 4OBPA 4ITIA 4RFMA 4WKQA 4YZCA 2A2AA 3UMWA 5HORA 4NFMA 4DITA 2NP8A 4HGEA 1JNKA 1CTPE 3KXMA 2X1NA 2WGJA 4O1OA 3ZRKA 1P4OA 3ORIA 3C0GA 4JG6A 2RFDA 2OZAA 3QX2A 3VS4A 3L9LA 4MXCA 1YVJA 4RIOA 4UMTA 5HE2A 1GJOA 3GCSA 3ZDIA 3ZSGA 4RFZA 3Q4CA 5FUTA 3P78A 4TXCA 3DXPA 3T9TA 5IDPA 4O82A 3QKMA 4FTOA 4IAIA 2IW8A 5JK3A 3FQSA 2P2IA 2OJFE 4YJOA 4F08A 4GK2A 5C1QB 2AYPA 3BHYA 3KGAA 5IA2A 5H8BA 1IASA 3PYYA 4EK3A 2PULA 3DK6A 3R7GA 3LM5A 3FHRA 5E8XA 2ZB0A 4P5ZA 3CXWA 5CQUA 3AMBA 3LVPA 2VWZA 2QHNA 3G6GA 1A48A 3ZLSA 3EN7A 1JLUE 4ZTQA 2PZRA 3EJ1A 4IAAA 3AT2A 3PA5A 3PA3A 3PRIA 4I41A 4ZSEA 1G8AA 3RPRA 4GV1A 5A3XA 3RTPA 4FSRA 4EH4A 3Q53A 4EH3A 2BAQA 4FV4A 4GRBA 2YIRA 3PZHA 5EYCA 4YTFA 4CQGA 4XLVA 4NIFB 2WU7A 2GNHA 4FSYA 2PUNA 1F5QA 3F2AA 2PY3A 3OVVA 5J9LA 4P7EA 2XCHA 3UVQA 3OF0A 5CI7A 3AG9A 3JR1A 4GJ3A 2VTLA 3EL8A 2W1DA 2OFVA 3U54A 4FT0A 4BBEA 5ETFA 1B39A 1TQMA 3DXNA 3ZFYA 3VS6A 2XIXA 4MD8E 5CF6A 4WHZA 2UW7A 2PMNX 1Q3WA 3A4OX 5JFXA 1SNUA 2ZV9A 5KO1A 3BHVA 2BAJA 1XWSA 3RPSA 5CTPA 4YZ9A 3BLHA 5AX9A 1W83A 4O91A 1P4FA 4QMPA 4CFXA 3P86A 1OM1A 4QMYA 4MH7A 4ZTNA 3ATTA 3QC4A 5L2IA 1GAGA 4B99A 5CEQA 4ERKA 1M14A 3QX4A 1ZAOA 4JDJA 2GQRA 2HELA 5KZ0A 3UOHA 3UP7A 3VUKA 5EH0A 3U4UA 1GZNA 4MXYA 2OJIA 3KCKA 1O6YA 4FF8A 4AT5A 1QL6A 4FT5A 4G5JA 3UC3A 4P90A 2O0UA 2VGPA 4W4XA 2B52A 2X7FA 2HZ0A 3TJCA 4QNAA 4H1MA 2ZB1A 3ULIA 5KCVA 4DBXA 2XIYA 2JITA 3OTVA 4L46A 3VBVA 5TKDA 5AIKA 4BR3A 4IC7A 2YLEA 3PSBA 4FTNA 5AUTA 1M2QA 4PL3A 4CLIA 3GQLA 2P4IA 1RDQE 3KFAA 4AN9A 4IX4A 2XK6A 4AW0A 5C03A 4F7SA 1W98A 4RIXB 3SRVB 5GJGA 1MUOA 2QOBA 3EN6A 3FI4A 5AR2A 4GKIA 2P0CA 2WMRA 1U4DA 1BI7A 1UV5A 2YCRA 5ITAA 2HENA 4TYHB 5GJFA 3C50A 4IAKA 4O0YA 3N9XA 3MVMA 1IR3A 2GNIA 3DTCA 3QYWA 4QPMA 3RPYA 1XJDA 3DJ6A 1XH5A 2CDZA 3ALOA 3MIAA 3PLSA 4BDAA 3MPAA 3QCSA 3OC1A 3RMFA 5HCYA 1ZARA 2XYUA 2UZUE 2LAVA 1PXOA 2UW8A 4KSPA 3QKKA 4FEVA 3BYOA 4KIKB 4U42A 3DB6A 3LIJA 5AP7A 2VO6A 4L68A 3DK7A 4C4HA 3CTQA 3S95A 2QVSE 3R6XA 5D12A 3ZXZA 3GC9A 2ZM1A 1KE5A 4ZAUA 2UZEA 3RP9A 5F94A 3MA3A 2ITYA 4O7ZA 2XIRA 4U43A 3EQGA 4YLLA 1H27A 3PG3A 4HPUE 3NZ0A 4XJ0A 2Y9QA 4UB7A 5M51A 4G3CA 4A4OA 4A9TA 3S00A 3WZUA 1FBNA 1WBVA 3UOLA 5GJDA 2ONLA 4QMWA 2HYYA 2WEIA 1YXUA 4JT3A 3PVUA 4YJUA 4A9YA 2QO9A 3DKGA 4E3CA 3Q04A 4EONA 5KMKA 2RKUA 5HLPA 1Q8ZA 2Y6OA 5A46A 3TCPA 2QHMA 2X8DA 3A8WA 2ZJWA 1K2PA 4EUUA 3Q2MA 4LQMA 4EH9A 2ITPA 1M2RA 1KOBA 3HV5A 2QOQA 2B7AA 4K0YA 4MF1A 3R28A 2BCJA 3IDBA 1DAWA 2PVFA 1SMHA 2QLUA 3A7HA 5J1WA 3QD3A 2GFCA 2WTJA 3KC3A 3NSZA 3COHA 5EKOA 3R83A 3FXWA 4ZZNA 1XH6A 4YBJA 5EI8A 3RCDA 3TNPC 3WF5A 2WTVA 3PUPA 3GUBA 3FY2A 3P0MA 4RJ5A 4FTLA 1M7QA 3ZUTA 4D2RA 3BI6A 4C7TA 5DA3A 5E92A 4E6CA 3FLQA 4UWBA 3WF8A 5L8LA 2YDIA 3W2RA 4NTSA 2W9FB 3BWFA 3DDPA 4HYIA 1IRKA 2PTKA 3LFQA 3EFKA 3T9IA 1K9AA 5EHYA 2BZHB 4A07A 3VS7A 3A4PA 3WE4A 1Y6AA 3HP5A 4L6QA 4DYMA 3BWJA 2KULA 3OW4A 4FKRA 3E5AA 1J1BA 2RFNA 3PA4A 3BE9A 4BCOA 1Q99A 4QQ5A 4OLIA 4YU2A 4XG3A 3ZZWA 4OAUC 2R3KA 4QYEA 3BV3A 2CGXA 1E1XA 1GZ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M0Z A;  3DAJ A;  3WZE A;  3QHW A;  3UIX A;  4TNB A;  2G2F A;  2CKQ A;  4DA5 A;  5IIS A;  3CE3 A;  4TWN A;  4NJ3 A;  4PMS A;  4DG2 E;  1NXK A;  4UXQ A;  3ZZE A;  3UDZ A;  4O86 A;  3TDV A;  2UZB A;  3FZS A;  4EOP A;  1Q97 A;  3SG8 A;  4IQ6 A;  5G1X A;  3MFR A;  3OTU A;  2Y8O A;  4JQ7 A;  4YBK A;  1XH4 A;  4FKU A;  4D2S A;  1S9J A;  4YC8 A;  3QL8 A;  3W2Q A;  4G6N A;  5FXR A;  1ZMU A;  4LFI A;  2HK5 A;  2PZI A;  4C4J A;  3LCK A;  2VTJ A;  4L3P A;  1B38 A;  4IM2 A;  4DC2 A;  1YHW A;  2CGW A;  2VTA A;  3AC3 A;  3O2M A;  4J8N A;  4PPB A;  4DFZ E;  4AGU A;  5L8K A;  2IPX A;  4JIA A;  2JII A;  4IB0 A;  2OIQ A;  1ZRZ A;  2PE0 A;  2X2K A;  1H0V A;  3O51 A;  3HMI A;  5DN3 A;  2R0U A;  4JBP A;  1OZ1 A;  1Q62 A;  4CZU A;  3LOK A;  2CN8 A;  3IG7 A;  2W06 A;  3GCV A;  5EFQ A;  5B0X A;  3ZHP C;  1U54 A;  3OMV A;  2QC6 A;  3V5P A;  3QXP A;  3IW7 A;  3R9D A;  3TZ7 A;  2YCF A;  1YWN A;  5HE0 A;  3RAW A;  3FBV A;  4C57 A;  3W2C A;  2JAM A;  4FR4 A;  5CAL A;  3ITZ A;  4M8T A;  4BI2 A;  3AD6 A;  4ANO A;  3UO5 A; 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