4S32A

Crystal structure of erk2 amp-pnp complex
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
351
structure length
346
Chain Sequence
AAAAGPQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of ERK2 AMP-PNP complex
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 111
structure length 346
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4s32A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4s32A01
5IQBA 3CPCA 4C34A 2YAAA 1XH6A 3MJ2A 3GI3A 3BYVA 4BWKA 4GVAA 3JVRA 3E3BX 4YPSA 4D4VA 3GU4A 4JVGA 3GU6A 2ZM3A 4A4LA 3MH2A 4HYUA 3A8WA 1JKLA 4CTBA 5E8SA 4ANLA 4OTHA 3ZSHA 5KX8A 3S00A 3E63A 4FZDB 3DA6A 3LPBA 4FZ6A 2VTMA 4NW5A 3BWJA 3ULIA 2A1AB 4G5PA 4DFLA 3JVSA 4Y73A 5HD4A 4XRJA 4WKQA 2CKPA 5J95A 5DFPA 3MVHA 2VO7A 2PU8A 2W1DA 1R0PA 1YI3A 3KKVA 2H8HA 3FDNA 3L8SA 3Q04A 1HOWA 2X8IA 2EXMA 3KVWA 3L9NA 3WE8A 3UNKA 5IQCA 4ZLYA 3HUCA 4D4RA 5LMKA 2UUEA 3KMWA 4I5HA 2IJMA 1K9AA 2X9EA 4YTCA 4B7TA 4HJOA 5LWNA 3Q4ZA 2UZDA 4BIBA 3R9RA 4LGDA 4XBRA 3TNWA 2BFYA 1OKZA 1M7NA 3MVLA 4FV8A 4K33A 4TL0A 5AP5A 4GJ3A 3FMKA 4IX5A 4PDOA 3DGKA 1M2RA 2VNWA 3EYGA 1ZZ2A 3V04A 5GIPE 3ACJA 3G6GA 2UW6A 3DXNA 4QTCA 3WZEA 3QGYA 2J0LA 3MGYA 4EKKA 2LGCA 3O7LB 3CTHA 3V5WA 4CCBA 3FMEA 2F2UA 4G1WA 4A06A 3DT1A 5D12A 4YTFA 2HW6A 4KIQA 2XJ2A 3BU5A 5AUZA 3OTUA 5HG7A 1YWRA 5K4JA 1GAGA 2RSVA 4DA5A 5IMXA 2XIYA 4XUFA 3ORKA 3FZSA 2ERKA 3I81A 3I1AA 3ZUUA 2OWBA 3D15A 3B8QA 3QD2B 4K1BA 4KBAA 4PMPA 4FKSA 3R7VA 4U7ZA 3TDVA 3ZXTA 3ATTA 1MQ4A 4L7FA 3KULB 5CAPA 1OPKA 3EKNA 5CX9A 3II5A 2HXLA 4FGBA 4AZFA 1SNUA 4RIXB 3NUAA 4QMVA 3NNVA 3WI6A 5BVWA 5M56A 3LXLA 1VJYA 3KXGA 4RA5A 5CVGA 3PYYA 3O23A 4GK3A 4X2NA 4FK6A 2RFSA 4WIHA 4XLVA 3WIGA 4DEHA 3QFVA 4FKTA 3FHRA 4FX3A 4PPCA 4U45A 3QLFA 3VBXA 3VUTA 4YLLA 3FJQE 3CY3A 3UG1A 4OTIA 3PP1A 2R9SA 3HV7A 3PG1A 3EQHA 4FC0A 4IVAA 2GHLA 3QRKA 2VWBA 2C69A 2V7OA 2FA2A 3BLHA 3TT0A 3MIYA 5AA9A 3E7OA 3R28A 2WMXA 2XKEA 1W98A 4DFBA 3CC6A 3FMJA 4M7IA 5ACBC 3SDJA 5FUTA 4AZWA 3AD5A 4K0YA 4ZLZA 3ZLSA 4N70A 2Z60A 2IW9A 2GS7A 3D94A 2GS6A 1OL2A 3W2OA 3QRUA 4G17A 4RLKA 3GCPA 1OIUA 4LGGA 4USFA 2XNOA 1PXNA 2W1HA 3O8TA 2W5HA 4FZ7A 4DGGA 3NUPA 4NTTA 3I6WA 3TG1A 4IM3A 1XBAA 4I3ZA 4TWNA 4R7IA 2WMQA 3QXPA 2ZDTA 3NNXA 2VO6A 3Q4UA 5TO8A 3W8QA 5AUXA 4AFEA 4WNMA 4KSPA 4L52A 2R2PA 5L3AA 2WZJA 2Y6MA 4JJRA 4Z7HA 3HV3A 5EYMA 5CVHA 3BE2A 3TACA 2VX1A 5HKMA 1YXXA 3CJFA 4D0XA 3GQLA 4FOCA 3JS2A 3MH0A 4TN6A 2E9VA 4F4PA 4G2FA 4IADA 2HZIA 4PWNA 4JI9A 1XH4A 1YKRA 3I6UA 3OBGA 4J71A 3BX5A 4R3PA 4FL3A 1ZMUA 2YM8A 3I0OA 3KQ7A 4D4YA 4FUXA 2JITA 3AMAA 5IQEA 3QQJA 4EOLA 4Z55A 3D4QA 2PZRA 3FE3A 4GG5A 3UVQA 3DDQA 4AXAA 4CTCA 4FEWA 3PY3A 2F4JA 4QT1A 4DH8A 4BGHA 4CKRA 4XG6A 1J1CA 4IZAA 3UVPA 4FGRA 1K3AA 1SVGA 5BVDA 1XBCA 5JFXA 3VUKA 1TKIA 1R1WA 3EH9A 4Y8DA 3BHUA 5HBHA 5IEVA 3LCOA 2XUUA 3UP2A 2ITNA 2VTHA 2ESMA 2Y8OA 3A7IA 4RJ8A 3SOCA 3QUPA 4LOOA 4F7NA 1YDRE 3QHWA 5FTQA 1LPUA 1P2AA 3DFCB 5AR7A 4FF8A 2X7GA 4PPBA 5JZNA 4A9YA 1NW1A 2QOBA 3WILA 1H28A 1ZYDA 4O38A 4D9TA 5F94A 2VGPA 2JKKA 3RNYA 2VTQA 3EZVA 3QWJA 3RK7A 3UDBA 3OWLA 3NYNA 4YMJA 3DNEA 4U79A 5DN3A 2Y9QA 3KU2A 4Z16A 2XEZA 1UNLA 2YM6A 2NRUA 1XWSA 4YSJA 4QYGA 2CHLA 2WHBA 2ITUA 2OXDA 2YFXA 4IVDA 3NUSA 3QC4A 2Z02A 5JZJA 5J1VA 3OP5A 3TCPA 4D2PA 5EQPA 4K8AA 4I41A 2OF2A 4G31A 3MYGA 4F7LA 4JG7A 4PP9A 2OU7A 4APCA 3B8RA 4IZ5A 4FIFA 3L8PA 3NDMA 2WMRA 2VO3A 1M52A 4RFMA 2VX0A 4J8MA 4QRCA 3P08A 4MEDA 4JNWA 4E73A 5JT2A 4RJ6A 2X4FA 3TTIA 4F9BA 1ND4A 4J97A 5CT0A 4EC9A 3NX8A 5AMNA 4PL5A 3VO3A 2OJIA 4NKSA 5HVKA 4I4FA 5CSWA 3VS7A 3ORMA 5HTCA 5M06A 1ZMWA 2WTWA 4EQUA 4FTCA 4QPSA 4PUZA 5HGIA 4U44A 2IG7A 2JKMA 3OC1A 5JFVA 1JSTA 2FSMX 2Z7LA 3FZ1A 3F88A 3DKGA 1Q24A 3CS9A 1YWVA 3LVPA 3FLYA 4YURA 2EXEA 1UNHA 3QKMA 3SVVA 5BUJA 4AW1A 2EB2A 4MK0A 5A9UA 2C5NA 4NSTA 3ORIA 1YI4A 4U6RA 4K18A 3SXFA 2WFYA 2QOLA 5GJGA 5HIDA 1OUYA 4I94A 2C0IA 5DVRA 3NUNA 3C50A 3EIDA 4O1PA 4CMOA 5E4HA 2WMAA 3Q32A 4D5HA 3H10A 4ITJA 4BVUA 5GINE 3DJ5A 2BPMA 2ACXA 3RCJA 1UA2A 4C02A 5ETCA 2Z7SA 2VRXA 4XNEA 3EMGA 4I0TA 3E87A 4FKQA 3UE4A 1E1XA 4LV8A 4CGAA 3CBLA 4KIKB 2BCJA 2QVSE 3QHRA 5CSXA 3CQEA 3QKKA 3N4VA 2OBJA 3LFFA 1VZOA 2UZBA 4I0SA 2PE0A 4G5JA 3W2QA 3O8UA 4PV0A 3IPHA 3W2RA 4CLJA 2PVLA 2W9ZB 4L6QA 4JQ8A 4IJ9A 4MWIA 4L46A 2R3PA 3G51A 4FKOA 4KIOA 5AP0A 4JQEA 3BELA 3CGFA 3E7VA 1JAMA 3UIBA 5FBNC 2HY81 3A8XA 3LE6A 4OW8A 2UZNA 3D2IA 1H0WA 4ZSAA 4IDTA 2NNWB 3AG9A 1STCE 4D2VA 2Z2WA 2CN5A 5JRQA 2PUPA 3OW3A 3TKUA 4RIYA 3CD3A 2C5OA 3AT3A 5I5ZA 5HO7A 3IW5A 3FLQA 3MW1A 5IH6A 4XG9A 3PWYA 4X3FC 5AM6A 2UW8A 3IW4A 4QQJA 5KE0A 3AD4A 4BDJA 4M97A 1Q8WA 4ZK5A 5E8YA 3HV6A 2DQ7X 3OBJA 4FTLA 4NYEA 1IG1A 5FEDA 4ZS4A 3GUBA 4DINA 5AAGA 3NIEA 2ZMDA 3W33A 4LMUA 3UNJA 3OT3A 4BCFA 3U9CA 3C7QA 3PSBA 2GTMA 2GQSA 1JWHA 1ZMVA 2GNHA 3NS9A 3ROCA 4D4SA 4XMOA 4PDPA 2O5KA 4FT7A 2IN6A 4PRJA 2WAJA 5FBOA 5AR4A 3CD8A 1U54B 3T3UA 1J1BA 3G9NA 2XNGA 3R7GA 4PTEA 4V0GB 3EWHA 2JKQA 4IWOA 5LCKA 3EKKA 2W17A 3IGGA 3P0MA 3U55A 4GIHA 4M13A 4TYJA 4MF1A 1FBNA 3PIYA 5DR2A 3SXSA 3POZA 3QQUA 3Q53A 3KEXA 4KA3A 5FXSA 3C0IA 1FMOE 4LQMA 3RPVA 2O2UA 2WQNA 2WMTA 4K11A 4IAYA 4LRJA 5CZIA 4X2JA 2EU9A 3R8MA 2OXYA 3ZBXA 5EYDA 4CYJA 4MXCA 4E6AA 2C6KA 5HVYA 3GEQA 4WUNA 4QMNA 3Q6UA 1UU3A 4EOSA 4MNEB 5AP7A 3R2BA 3C0HA 4Z7GA 3P9JA 4BCKA 2YCFA 2BRGA 5M4CA 5CNNA 5M44A 3NEWA 3PY0A 2QO7A 2PHKA 1ZYLA 4NJ3A 5HE0A 2QKRA 4HNIA 3NYXA 1U59A 4L44A 4C4EA 2XF0A 3R9DA 3MY1A 3MJ1A 4ANNA 2XIKA 5FTOA 4BWXA 4QQTA 4ZMEA 3R7EA 1ZOHA 3FI4A 3NAXA 3VUIA 3KRXA 2FSOX 2E9OA 1YHVA 2QOCA 4J95A 2G1TA 3MY0A 3QRIA 2X2LA 3PDTA 3VF9A 3RPSA 3LHJA 3C0GA 4JQ7A 5FD2A 2X7FA 3F3VA 2GNIA 4W8EA 3FQSA 5HG9A 4ERKA 3DS6A 3TWJA 1XH5A 3B2WA 4BF2A 4U80A 2B9IA 3DK3A 1KUTA 1YXTA 3HA8A 4G9CA 5HX6A 2JIUA 3FLSA 4BHZA 4Q2AA 4BCMA 3GOPA 4JLCA 5I9UA 3V8WA 3BGZA 4DITA 3H0ZA 2RL5A 3IDPA 3IW7A 4ENXA 3SRVB 5AP4A 4BCHA 4IDVA 3AT2A 1KE9A 2CJMA 2X2KA 3FXXA 4ALVA 1AQ1A 2WTJA 4FT9A 4KRDA 2CNQA 5JEBA 1V0PA 2OO8X 2YIYA 2B55A 2VX3A 3TNIA 2I0YA 1M2QA 4IAKA 4DH5A 2O0UA 2YDIA 3EZRA 4YO4A 5CVFA 4BDBA 3CGOA 2WXVA 4RG0A 4DF3A 5KBRA 2X4ZA 2ITQA 4WRGA 1XH7A 3H9OA 3W2SA 3KCFA 4W9WA 1SZMA 3KXMA 4DLIA 3I0QA 4E4NA 2YWVA 4ZIMA 2JC6A 4YHFA 3BE9A 4AE9A 3W1FA 1SYKA 4D2WA 1RJBA 1I09A 5J87A 1VEBA 3UMWA 4TPTA 2PMLX 3QRTA 5A14A 3LFEA 3FI2A 5J9LA 4QD6A 3VNTA 1XJDA 5EW8A 2YLEA 2I0HA 2PVRA 2VTOA 3TV4A 3TV6A 5TT7A 3HMIA 2G01A 2DYLA 1L3RE 4DFYA 3PZEA 4FV4A 3DV3A 3LFSA 4LOPA 4QMOA 5CU3A 3ELJA 4FSQA 3TM0A 4U40A 2UZEA 3MPMA 4CV9A 5BVOA 3UOHA 3ZDUA 2P2IA 2W5BA 4M3QA 2C68A 4W4XA 5DT3A 3BLQA 2VWXA 3BCEA 5AV2A 5EDQA 5HO8A 2J5EA 3WF6A 2WELA 2R3HA 4DC2A 3VS0A 3BU6A 4D2RA 4I6BA 5EHYA 3ZEWA 3A7JA 4F70A 4IW0A 3QF9A 4IWQA 3I79A 4LYNA 1CKJA 2B9JA 2VTNA 2IW8A 4ERWA 1XH8A 1YHSA 3JY9A 3FZTA 4RIWA 4ZTLA 5FXRA 4QMTA 3COMA 1XQZA 3DZOA 1PMEA 2BFXA 4DEGA 2HOGA 1PW2A 3DKCA 3ZM4A 1F5QA 4FVRA 3U6IA 4EBVA 2BZHB 3ZSIA 4F08A 2XJ0A 4CFNA 5A54A 1WVXA 4JG6A 4MQ2A 1YI6A 3QBNA 1TQPA 3GB2A 1RW8A 4RVKA 4C3FA 3E62A 3ORPA 5C9CA 4FNXA 3R2YA 5KMLA 2IVTA 5BVNA 3UIUA 5M4IA 2PL0A 1UWJA 2PMIA 1ZARA 4GS6A 2QODA 5TKDA 1OB3A 3GBZA 3GC8A 4AA4A 1OBDA 3CLYA 3JY0A 3KA0A 3KRWA 3R8PA 4JDIA 4O7NA 4RPVA 1LUFA 1WBPA 1YXSA 2ITXA 4E6QA 5IQIA 1GJOA 3KREA 3ZFYA 3QZHA 1BX6A 1Y6AA 1ZYSA 4D1XA 3SV0A 5JN2A 3MY5A 4XV3A 2YM3A 4MD9E 1CTPE 2XBJA 3SD0A 4EK6A 4HCVA 5A6NA 2R7BA 4L01A 4RQVA 2G2IA 1UU8A 3QTUA 4FK3A 4GJ2A 4X0MA 3LFQA 5K0XA 3ZRMA 3REPA 5M4UA 5DT0A 2A27A 3F2RA 3QA0A 4U5JA 4AGWA 4RVMA 4MXOA 4EZ7A 5LMKC 3TZ7A 1QPCA 4PL3A 4A9UA 4AT3A 1A9UA 4CG8A 3EN6A 2NO3A 3OT8A 3G33A 4G16A 5DR6A 3SW7A 5I3OA 4ID7A 2YIRA 4Q5HA 1O6KA 3F61A 4L68A 5KMOA 3AGMA 5AAFA 3UQCA 3UZRA 4Y95A 3MDYA 4FSMA 2GCDA 3NYOA 2EUFB 1BUHA 4A9RA 4ACHA 3TI1A 2FSTX 1OIYA 3QQKA 1Q62A 4XBUA 2ETMA 1OL1A 4UB7A 3NUUA 4DE4A 4QMQA 1H07A 3FPMA 3WZDA 4ZTMA 3R8UA 5C8KA 4D28A 4ZMFA 3ORNA 5M08A 3R7UA 4C58A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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